2E5DA

Crystal structure of human nmprtase complexed with nicotinamide
Total Genus 160
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
160
sequence length
476
structure length
466
Chain Sequence
EFNILLATDSYKVTHYKQYPPNTSKVYSYFECREKKYEETVFYGLQYILNKYLKGKVVTKEKIQEAKDVYKEHFQDDVFNEKGWNYILEKYDGHLPIEIKAVPEGFVIPRGNVLFTVENTDPECYWLTNWIETILVQSWYPITVATNSREQKKILAKYLLETSGNLDGLEYKLHDFGYRGVSSQETAGIGASAHLVNFKGTDTVAGLALIKKYYGTKDPVPGYSVPAAEHSTITAWGKDHEKDAFEHIVTQFSSVPVSVVSDSYDIYNACEKIWGEDLRHLIVSRSTQAPLIIRPDSGNPLDTVLKVLEILGKKFPVTENSKGYKLLPPYLRVIQGDGVDINTLQEIVEGMKQKMWSIENIAFGSGGGLLQKLTRDLLNCSFKCSYVVTNGLGINVFKDPVADPNKRSKKGRLSLHRTPAGNFVTLEEGKGDLEEYGQDLLHTVFKNGKVTKSYSFDEIRKNAQLN
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule tags Transferase
molecule keywords Nicotinamide phosphoribosyltransferase
publication title Structure and reaction mechanism of human nicotinamide phosphoribosyltransferase
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 160
structure length 466
sequence length 476
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.4.2.12: Nicotinamide phosphoribosyltransferase.
pdb deposition date 2006-12-20

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF04095 NAPRTase Nicotinate phosphoribosyltransferase (NAPRTase) family
A PF18127 DUF5598 Domain of unknown function (DUF5598)
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 2e5dA02
3L66A 4LUJA 3E9AA 2NWRA 3GKFA 3H54A 1KFKA 1AMKA 3S9YA 4NXSA 3HBLA 1W5QA 3HO8A 2YZRA 1QO5A 3HGSA 1ICQA 4UFHA 3NVTA 4MVAA 3C61A 2B7QA 3E96A 5HMSA 1ICPA 3E02A 4PH6A 3LXAA 4UTTA 3UNDA 3WK0A 1QR7A 3W7RA 5D38A 2AAMA 5FF4A 3NR0A 5DN1A 1KM3A 2OJPA 1EIXA 5HUPA 1DKWA 4YXGA 3M0ZA 3M44A 2FFCA 3NQ2A 3W7CA 1XBVA 3F1QA 4MUZA 3WJWA 5AYXA 4XKYA 2FLIA 3MI2A 1ME9A 4FNQA 4MFDA 4G1KA 4DXVA 2GJLA 1W54A 2V5LA 4KWVA 1A5CA 3TH6A 2I14A 2A0NA 4IMEA 3PUOA 4HSNA 1JJKA 5L6UA 3A5VA 3QZEA 3L5LA 4MPQA 1S3HA 3UPWA 3FYPA 3OG3A 1G4PA 4EF8A 4UR8A 3JRKA 1N55A 5FF7A 1PS9A 3FJLA 3LCLA 3TFXA 1YXDA 2NV1A 2ZZ3A 4M7SA 4OE7A 4UTTC 3FOKA 3BV4A 3GYEA 5LNWA 1KBJA 3KVLA 2TYSA 3DI1A 4AH7A 1OVDA 1YYAA 2CLLA 3O6YX 3T7VA 1UB3A 2Y6ZA 4O4VA 1TCDA 3DZ1A 5K2ZA 4LRSA 2OZ0A 2QDGA 4ZQCA 4AHQA 1W5PA 3WJZA 1G4TA 4PC8A 1FDJA 5K9CA 3W2NA 3C2RA 3EWZA 3PG8A 3TCEA 1CX9A 3NEVA 3NDOA 5HNRA 4PCFA 1QDSA 3UY7A 4ZL1A 2Q3OA 1L9WA 5AHFA 4OU1A 5AC6A 1OX4B 3L9CA 3EB2A 3HIJA 2VFEA 5L9FA 2QUTA 3Q37A 4AF0B 1F05A 3T55A 4Q32A 4Y9AA 1GYNA 4UTIA 4ZQOA 2Y7FA 1ZAIA 3UQNA 3P5ZA 1P0KA 2C3ZA 4FNTA 4JR5A 1W8SA 3FEMA 4A2RA 1IXOA 3S5YA 4X2RA 1SSGA 3PBWA 5I3JA 1H7NA 1EWEA 5J5RA 1KM2A 3OBKA 5DELA 3GLCA 4O28A 3WK1A 3U6WA 5D05A 4UTHA 2CLFA 1VHCA 1TTPA 5G1TA 4CQ8A 1YXCA 1PE1A 3CLMA 1O60A 2P10A 1TIMA 4EVZA 3BPWA 4WJEA 1VCFA 2UV8G 5U7SA 1K7FA 2NXGA 3BW2A 3TV8A 1RZMA 2DZTA 1SO5A 4RK8A 2VFHA 3LHYA 4FX6M 3PWAA 1DQWA 2VC6A 3STFA 3W22A 3G0XA 4QISA 3W6YA 1LBFA 3ABRA 1MEWA 1WDWA 2YYTA 3W7PA 1EB3A 5IM51 4ZQMA 3W85A 3NZRA 1GPWA 4B5NA 4NXKA 4IJBA 5CG7A 1ONRA 4H4IA 1XCFA 4EF9A 1XDMA 4WOQA 1LLZA 1EUNA 1YLVA 4N6EA 1LRNA 3LB0A 1YPIA 4I9AA 3IIPA 4XUGA 2Z0IA 1XFBA 5K3VA 1W3NA 4KKXA 2ZRXA 4N02A 1LORA 1VH7A 3S6DA 1SO3A 4M7TA 4O1DA 1W5MA 3CM4A 4TMBA 4UNKA 2CLKA 2JKPA 1FCVA 3DXIA 2Y7DA 4WXZA 4PODA 3L2IA 3GXPA 1YDOA 4N9CA 1OFQA 4LVBA 4JYDA 3W70A 3STCA 2WNQA 2X1RA 1QPOA 1H5YA 5G2IA 4R33A 2AQWA 2B0MA 1XC4A 2X1TA 3HB9A 5F4WA 4AHOA 4LVAA 1H1ZA 3DFNA 1KM6A 3S1XA 1X1OA 3LTPA 2GQ8A 3NZ1A 2H3BA 3UPBA 3GAKA 2EHHA 1OYBA 5EPDA 1HO1A 1VYSX 1R47A 3O07A 2WJZA 1F73A 2GQ9A 3TFCA 1NF7A 1HG3A 1JCMP 5EY5A 1WV2A 1EEPA 1W31A 4GFSA 3MBDA 3G18A 1FCQA 3S5OA 2ZFAA 3QYQA 4WZHA 3S0CA 4MYAA 4WY0B 2QAPA 2DJXA 2BZNA 5TIMA 3C52A 3SJ3A 1K02A 2J27A 2VFDA 1RD5A 4E2DA 3PR2A 4ADTA 3UWWA 4UFIA 2J24A 3LX9A 5D02A 4WOZA 2CLMA 3L65A 5LSMA 2C13A 2ZRYA 1X1ZA 3W1PA 2WSQA 5CGQA 1HUVA 1KW1A 1IXQA 4JTUA 3V1PA 5DXYA 1AW2A 4TU1A 3QEZA 3SR7A 4IXHA 3C2VA 1KFLA 2B7NA 4AEOA 2ZQ0A 2V30A 4NJIA 5D30A 2VOMA 1TV7A 3W72A 1I2RA 1LBMA 2QCDA 2QUUA 2ZA2A 4WD0A 4NX0A 4GBUA 1WOAA 4Q33A 2C19A 3W75A 3W86A 1W1ZA 1K7XA 4MKNA 1D3GA 4CQ9A 2A6LA 4NNCA 2P1FA 3E0IA 3DU0A 3USBA 2EKCA 1D9EA 3UXAA 1QNVA 1WA3A 2GVGA 3P74A 3LHVA 4JEQA 5CPLA 3UZ5A 1K8ZA 4R53A 4YMZA 1HTIA 3LI0A 5BNKA 3W73A 3HGOA 1I2PA 2HS6A 3O63A 1W0MA 2A1YA 1S5TA 3NL5A 2XFWA 4OT7A 3W1LA 1CI1A 1WBHA 4AB4A 1HFBA 1F76A 4N2YA 3PG9A 2E6YA 2ISSA 2PRHA 4NJHA 4FX7A 5E93A 2J9YA 1K3UA 1SFLA 1TRDA 1XUZA 1JULA 1PHWA 4K8HA 2B7PA 1X8FA 3MHUA 5D33A 3LCHA 3TW7A 4JNMA 3LLDA 3A23A 4NZJA 4ZQPA 5I3HA 3W3OA 3IIOA 4BR1A 4RJEA 3IVSA 3NQEA 4XBKA 3M5VA 4M6VA 3MWAA 5FEZA 4TMCA 2GUUA 1L6SA 1SSDA 3C4UA 4QIUA 3NG3A 2NXHA 2E5DA 3OHIA 1JUKA 3UWUA 1ALDA 2WNNA 1GVQA 3Q94A 3BGGA 1R30A 3ZWTA 2CFFA 3PM6A 2C0AA 1Q6RA 1N8FA 5DCBA 1VHNA 1H61A 1Q6LA 3NQDA 5FEPA 1VCVA 3IV3A 1TV8A 3TQ0A 3MHFA 3JR2A 4EOUA 2X1SA 4U4MA 3LTSA 4JYEA 4XKYB 2VFFA 5DY3A 3BVJA 2QCGA 1LYXA 4QITA 3KRSA 1H1YA 3RK8A 1DJNA 1TJRA 3QSRA 4JTHA 4X9SA 1H51A 4LS2A 2FB3A 2PC4A 3BG3A 2A5HA 3LCFA 3MI6A 5GVJA 1QPNA 3UY8A 1W5OA 2A4AA 3N2XA 1MEHA 4UNLA 3G8EA 3W7HA 4L4MA 3W7JA 3TK7A 3IIZA 4IMGA 2YW4A 5D2XA 3EKLA 3M43A 3FLUA 3H55A 1SZGA 4O0KA 4O8RA 3L67A 3S5NA 3LGEA 3P7YA 5G2HA 5G4WA 1O5KA 2ZZ1A 1Z48A 4UTMA 5DLCA 4K8EA 4FNSA 4GUJA 1QOPA 1OFRA 3PBVA 1H7XA 3TQVA 3C56A 4NZFA 5CPOA 1UBSA 3TA6A 2H8ZA 4XQ6A 4Z1BA 3MI3A 1YPFA 3OVQA 3C6CA 3W1AA 1A5BA 4JY8A 4K36A 3QQ1A 4MJMA 3GR7A 3GAYA 3GX9A 3NQMA 2VXNA 3CWOX 3VCRA 4MYXA 1JQXA 4NT0A 2A6NA 4ALDA 1R2SA 1VPXA 4Z0SA 1OFEA 2VEMA 2H90A 3PS7A 5AN7A 5HUOA 4JIQA 3M41A 1J4EA 5A8GA 1RVGA 5F1UA 3C2FA 4NUWA 3ABSA 4HPXA 3KHJA 4Y90A 3WFAA 1F5ZA 1SZNA 1JUBA 1GZGA 4PL2A 1DJQA 1YDNA 4CNPA 3K30A 2A7PA 4UFKA 2BSLA 2Y7GA 3GXTA 1IIGA 3IRDA 3TUUA 2DZPA 1G69A 3NQVA 1LRQA 3G1SA 1NAL1 1JCYA 4O16A 2J6XA 2HSAA 1W37A 4YLWA 2A7NA 5D03A 2Y61A 4NJGA 4KFPA 3VKJA 3DI0A 3NL3A 2A21A 4JDBA 4RLIA 5AHNA 3KAOA 4GXMA 3W2KA 3EXSA 3VI2A 1VS1A 3W7LA 3I68A 1EA0A 3L5MA 3EWUA 3S5ZA 3QC3A 3NM3A 2B4GA 2PCQA 3HPXA 3B0VC 3TXZA 2E68A 3B4UA 3W2LA 1H50A 4IGHA 3N73A 4DO5A 5C54A 1Q45A 4UFLA 3NOEA 5AHMA 4M6PA 4GWEA 1AW1A 5D2YA 4JTKA 3RU6A 3S8HA 1F6PA 2IQTA 3LXBA 4UTLA 1AL7A 1OF8A 1TYGA 2DZXA 5SWUA 1FWRA 3B0PA 1XBXA 5G2WA 3NQ8A 4CLMA 1RQHA 1OYCA 1UASA 4IUOA 5IBXC 1XDLA 5HR7A 3B05A 4HNTA 2C15A 3TQKA 1JCLA 2NXIA 3QM3A 1BKSA 2LLEA 2VELA 2QCHA 3A24A 3HF3A 4QNWA 4NX5A 5AC7A 2YGYA 1VCGA 2EGZA 5AHIA 2D73A 2NV2A 3OIXA 2QKFA 3BLFA 4FNUA 4LVFA 1Q3NA 1ZNNA 2YYUA 1DBTA 1ZALA 3P5YA 1I8JA 4EIVA 4O50A 1TQXA 2G5WA 1NVMA 4Y96A 1T0OA 1KFJA 2WSYA 2C6QA 1KM1A 1OX6A 4JXCA 1B9BA 1LBLA 3W7IA 1GYLA 3TSBA 4AMAA 2C18A 3QPYA 5EL1A 4HN4A 1FUYA 1YXYA 1QWGA 3EXTA 3ATYA 2H3DA 1IXNA 3O1NA 3TSDA 1S5VA 3O6DA 1L6YA 1GTHA 3IVUA 5K4ZA 2QCCA 4JX4A 4KWWA 3Q2DA 3RMJA 2BLEA 3THAA 3LHUA 3SW6A 1GG1A 3IIVA 2GVJA 1ZENA 5G5IA 1YADA 5DCDA 1H7PA 5J5DA 4RXGA 2QUVA 3NNTA 1X6UA 2C14A 2X2GA 2YX0A 1GVOA 5FI8A 5EBUA 3CPRA 4X3ZA 3IGSA 3QFEA 2V9DA 1S5WA 3O05A 4I7UA 4XWUA 2ZBTA 2DJLA 3FS2A 4LY8A 4JICA 4E38A 1RR2A 1UCWA 1EP2A 2B7OA 1G67A 4NVTA 1TPH1 3PBUA 4IOTA 3PY2A 1DVJA 4S2BA 2QCDB 1SO6A 4O52A 4HNUA 2RDUA 1DQXA 1M7PA 5F2LA 3IEBA 5KITA 3QMSA 5FEXA 2Y85A 3S1WA 1YTEA 3AO0A 3B03A 3BK0A 1DHPA 4UTUA 2E6DA 1A5AA 2RKXA 2ZA1A 4H6KA 2VFIA 4A3UA 4RZ6A 2R8WA 4HSOA 5TBOA 4LWWA 4LV9A 1Z44A 3O06A 4FF7A 1G6CA 3NAVA 3VFLA 2FTPA 4JY9A 1G4SA 4GJ1A 1DL3A 1ME8A 4XTIA 5BMXA 5FESA 1FXQA 2TMDA 2Y88A 3LDVA 1XI3A 2VFGA 4LS1A 1LOLA 1VYPX 4CCEA 2FDSA 1C29A 1K7EA 2RDWA 2ISVA 4C1LA 3W7EA 4UR7A 2F84A 4LNYA 3S1UA 3W7GA 3W7KA 4ONVA 2XN1A 1TQJA 4AWSA 4YWIA 4OWGA 4YCPA 2ZRZA 3W7OA 4O1BA 3IVTA 1KTCA 1J5TA 1GVSA 5D37A 3NXFA 4NJJA 4DQWA 1KM5A 2C1HA 1RV8A 4AVFA 2QCMA 1IF2A 2ZZ7A 4OBTA 4A2SA 3MJYA 4TX9A 5DBTA 3W7DA 2Y7EA 4W9TA 2Y63A 2QDHA 4MY9A 2DZSA 3W1TA 4YCOA 3PC0A 4FHAA 2ZRUA 3HJZA 3P84A 3MP4A 4X22A 3NPXA 1U5JA 3EX2A 2OT0A 1VLWA 4RR4A 2E6AA 2QCLA 3N14A 3BG5A 1SQ7A 1GG0A 3BARA 2A2IA 2QJHA 3L68A 3UWVA 5K9DA 2RFGA 1OFAA 3NQAA 4I7WA 4QM1A 4JTIA 4O0ZA 2V2HA 5HWNA 4BWLC 4RZ4A 5BW6A 3OVPA 5K4XA 3PBYA 3INPA 4HNNA 3R12A 2GOUA 1BWKA 3P82A 2NUXA 3SIZA 1MXSA 3PULA 5F2MA 3O16A 2A85A 3ZWSA 2CZDA 1LCOA 4D2JA 1KLYA 3TX9A 1M5WA 2O7QA 3W71A 4O15A 4RX0A 5LGXA 5MHBA 2Y70A 5K9XA 3P81A 2W79A 1A53A 5H2ZA 5LKYA 3FJ6A 6ALDA 3ELFA 2VEPA 3SGZA 3A9IA 1R2TA 4UTJA 3MYPA 2ZYFA 1IXPA 4FEZA 3RNDA 4NJKA 3PB0A 1LLWA 5AC8A 1V5XA 4O53A 4I7VA 2AGKA 3M6YA 4O13A 3GDTA 1Q6QA 4LVDA 3KXQA 3N34A 3TKFA 1TMHA 2DZUA 3DFSA 1F6KA 2ATSA 4BI5A 2E09A 2YPIA 1JRBA 1PVNA 2VENA 3W7NA 4C1KA 4MFEA 4BI6A 5F1VA 3S42A 1LOSA 2EF9A 7TIMA 3C2OA 1O95A 4IMFA 1ADOA 3NM1A 1X7FA 1TTQA 1TSIA 3WK3A 4BI7A 3EWBX 5DY2A 1ZFJA 4N9BA 2W0UA 5AYYA 3EX1A 2CZEA 4UXDA 1GT8A 2CLOA 4MZ1A 1QOQA 2TRSA 3W76A 1J2WA 1FCBA 5BMWA 3GDMA 5CZJA 4FIRA 1NFBA 1H60A 1W3IA 2C16A 1RPXA 1KTNA 3L0NA 5HQEA 2WPBA 1LDCA 3M9YA 1MSSA 1N7KA 4ZQNA 1TPC1 1BWLA 3W2UA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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