2E6DA

Crystal structure of trypanosoma cruzi dihydroorotate dehydrogenase in complex with fumarate
Total Genus 105
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
105
sequence length
312
structure length
312
Chain Sequence
MCLKLNLLDHVFANPFMNAAGVLCSTEEDLRCMTASSSGALVSKSCTSAPRDGNPEPRYMAFPLGSINSMGLPNLGFDFYLKYASDLHDYSKKPLFLSISGLSVEENVAMVRRLAPVAQEKGVLLELNLSCPNVPGKPQVAYDFEAMRTYLQQVSLAYGLPFGVKMPPYFDIAHFDTAAAVLNEFPLVKFVTCVNSVGNGLVIDAESESVVIKPKQGFGGLGGKYILPTALANVNAFYRRCPDKLVFGCGGVYSGEDAFLHILAGASMVQVGTALQEEGPGIFTRLEDELLEIMARKGYRTLEEFRGRVKTI
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Oxidoreductase
molecule keywords Dihydroorotate dehydrogenase
publication title Structures of Trypanosoma cruzi dihydroorotate dehydrogenase complexed with substrates and products: atomic resolution insights into mechanisms of dihydroorotate oxidation and fumarate reduction
pubmed doi rcsb
source organism Trypanosoma cruzi
total genus 105
structure length 312
sequence length 312
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 1.3.98.1: Dihydroorotate oxidase (fumarate).
pdb deposition date 2006-12-26

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01180 DHO_dh Dihydroorotate dehydrogenase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.30.26.10 Mainly Beta Roll Dihydroorotate Dehydrogenase A; chain A, domain 2 Dihydroorotate Dehydrogenase A, chain A, domain 2 2e6dA02
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 2e6dA01
3TQKA 3HG5A 5LKYA 2FPTA 4IMEA 4OGZA 2G97A 3NQGA 2F7FA 1ML1A 3LDVA 4HIBA 4JTTA 2JBMA 1K8XA 3EKLA 5LGXA 3NL3A 4OV9A 4JR5A 3TC6A 3GNNA 3ABRA 2X16A 3GR8A 4R33A 3TH6A 3QMSA 5C54A 3FS2A 2O7SA 5HULA 4UTKA 3R12A 3DHFA 4JTFA 5I3JA 3I7QA 4Y6GA 5KTLA 3NEVA 3U2OA 3UNDA 1KM0A 4UFHA 3H53A 4LRTA 2CFFA 3LCGA 5CPNA 3QSTA 3TUUA 3BW3A 3HPXA 4JICA 3HMJG 3MJYA 3EXSA 4JEQA 1QFEA 2VENA 3C61A 3R2GA 1XBVA 2PRMA 1LOQA 4JX6A 1KFBA 2GVGA 4WY0F 4FO4A 3W7MA 3O6YX 4C1KA 2W6RA 2VFEA 1G4PA 5AHEA 1M7OA 3LBCA 5CSRA 1YDVA 7TIMA 1H7RA 1F2JA 1MEHA 3W7NA 3UPBA 5C6MA 3W73A 4EOUA 3MP4A 3EX4A 4K7VA 1MEIA 2QDGA 1LRTA 1F73A 3DFTA 4XKYB 4ZQOA 4O1BA 4K39A 2ZBTA 2H3BA 3KVLA 3H54A 1JRBA 4AHPA 3S5YA 3GXNA 3FKKA 1OFPA 2ZRVA 2JK2A 4RR4A 3IEBA 1QOPA 4UTTA 4N6FA 4NT0A 4IWWA 3NPWA 3V75A 5BNKA 5LSMA 3IIVA 1EX5A 3KAOA 1PCWA 3UYCA 1XFBA 1LTDA 2WSYA 3WK3A 4BR1A 3W2NA 3W70A 4UTUA 2OMAA 3PSVA 6TIMA 4DPPA 2E6YA 3OA3A 5E93A 1LOSA 1X8FA 3KVMA 4E2BA 2B4GA 5DN1A 1O95A 4NX5A 3NL5A 3PUOA 3SECA 2V5BA 1FCQA 3FKRA 4EF9A 1I2QA 4BF9A 1O94A 2X1SA 3MBFA 5LHFA 4MVAA 1JUEA 3MO7A 3GXPA 2QCMA 3L66A 3LHVA 1W0MA 2NUWA 1G67A 2V9DA 1EP3A 4AAJA 3TW6A 3YPIA 1N7KA 1KTCA 2Z1BA 5D03A 3WJWA 4OU1A 1VLWA 2PURA 2QAPA 2KZHA 3UWWA 2CU0A 4MFDA 1K8ZA 1OYCA 4RXGA 1VR6A 1DL3A 3MI6A 1YLVA 4QSHA 4BI7A 3C3NA 2HS6A 4FNPA 2C1HA 2A6NA 3IVSA 5EYWA 3P5ZA 1PV8A 3ABQA 3QW3A 1QPNA 1T96A 3STGA 5D05A 3G1AA 4JTGA 3PAJA 1TPWA 4UFIA 4JYDA 2ZTJA 4WXYA 3DKLA 5LNRA 1K3UA 1TPUA 2O7QA 3L5LA 3L0KA 4UNKA 3DI1A 3LV6A 1M7PA 1Q45A 4Z0JA 4MKNA 4O14A 4LVDA 3FIGA 3NQMA 1A5SA 3STFA 1KM4A 1W3NA 2CLKA 1C9DA 6ALDA 1GTEA 1GG0A 5J5DA 1ZHAA 4A22A 3UWQA 3SGZA 1W5MA 4GRSA 4X2RA 2GQ9A 5EA9A 3ZFHA 2ALDA 5KZEA 5TBOA 2FJKA 5AC8A 3THAA 1AK5A 1A50A 3TMQA 3STEA 1VZWA 1WXJA 4FXSA 1OABA 1XI3A 3LRMA 3O6DA 4N2YA 1L6SA 3R8RA 4OHQA 5FEXA 1NAL1 1QO5A 2H6RA 4IPIA 2NX3A 3KOFA 1R2SA 3QM3A 1KLZA 4MUZA 2V2CA 4MY1A 4ZQPA 3RLUA 1QCWA 4I7UA 2ABBA 1PHWA 4QITA 1D3GA 3GB6A 1KFEA 1ZY9A 2VELA 1JQXA 4XWUA 3W3OA 2C3ZA 4LVGA 3W7GA 4UIOA 2QJHA 3GNDA 3CEUA 1FX6A 4TMBA 5D2XA 1KFCA 1DJQA 5CGQA 3LHWA 1FWNA 3W7CA 4ICNA 5EMUA 3NQFA 1KA9F 3TJXA 3DFNA 1UUMA 3LLDA 4R34A 1JJKA 1IF2A 2DZWA 2V5LA 4Z0SA 1OFBA 1GYNA 1VJIA 3FA5A 3P81A 1X1OA 2HMCA 3B06A 1DKWA 4IMCA 3L0NA 3UWVA 3NQCA 4BI6A 3EB2A 3NA8A 5L6UA 3DFQA 2WQPA 3EXTA 1FWTA 2A7RA 3CIWA 4DQWA 4LUIA 5FI8A 3A5VA 1UB3A 3KVJA 4ZZ9A 1FQ0A 4CNPA 1H50A 3ELFA 4N4PA 4QJ1A 3UPWA 3MP3A 4H4IA 1EP2A 5D02A 1P5BA 3E12A 3I6RA 2ISVA 4KKXA 4N9CA 3S42A 2Z6JA 1AL7A 2B7OA 4MYXA 1LP6A 3GZ3A 2V0TA 2HSAA 4GBUA 4MZ1A 4UTHA 1I2PA 1TTIA 3QZEA 2DZSA 5FESA 4CCEA 2J88A 5L9FA 1JVNA 2GQ8A 1SSGA 2Y7FA 1KFLA 5IM51 4M6QA 3P60A 2QAFA 2DJXA 5AHFA 1A5AA 3G1VA 3DFSA 3N19B 1KM1A 1TPB1 3PR2A 1IXNA 1XUZA 4A2RA 1R47A 3USBA 2TSYA 2YR1A 3PBYA 4O17A 4PL2A 3GYEA 4GNJA 2CLMA 3GIYA 5I3GA 4Y96A 3W1TA 3I7RA 3QYQA 4RJEA 5K4XA 3S5NA 1A5BA 3HIJA 1J2WA 5AHLA 1TV7A 3NL2A 3W1QA 3E96A 1FCVA 2FPVA 3EWYA 2AQWA 4W9TA 2V2DA 1OK4A 4RX0A 2JKEA 3M44A 2I14A 2E6DA 1VRDA 5AHIA 3BK0A 4BFAA 4HT3A 4FNUA 4IUOA 5DCEA 2ZRYA 4KFOA 4MFEA 1ZAJA 5F2MA 3QEZA 4UUIA 5F4SA 5MHBA 5KITA 4QNEA 5D2WA 2CLLA 4EVZA 3NQAA 2W79A 4Y9AA 2ZZ4A 2ZZ5A 3OIXA 1W3IA 4LRSA 4OWGA 5SWUA 3G8RA 4I7WA 4O1AA 4GE8A 4B5NA 1RR2A 5F2GA 2EHHA 1PCKA 4YCOA 3OG3A 2Y70A 1ZNNA 3ZWSA 1JCMP 1QNVA 3TFXA 3PSWA 1NSJA 4O19A 1JQVA 1GWJA 3G0XA 1NF7A 3N3MA 2C16A 3W7DA 1H62A 2R94A 4PEKA 5HWMA 4CLMA 1H7OA 3DGRA 3GKAA 3M5ZA 3W1NA 3M5VA 4ZL1A 1UASA 2PC4A 5HINA 2ZDRA 5KZMA 1LRQA 2WO5A 1SO4A 4BK9A 3W7LA 3O05A 2QCHA 1GT8A 1G69A 2GVLA 4UTLA 5CSSA 2QJIA 4JDBA 4NJKA 4IOTA 3W23A 3KFTA 4DO4A 4MJZA 1DHPA 3L67A 2X1UA 3W1MA 3LI1A 1VYPX 3T44A 1YXCA 3FYOA 2P10A 4EF8A 1XDMA 3QPZA 4IX0A 2V2HA 4MJMA 1K8YA 4FX8A 2RHGA 3GK0A 5FF2A 1KV5A 3EX6A 4R7JA 3NQ2A 3W71A 3W74A 4OE7A 3V1PA 2CZEA 2ZYFA 4QIUA 1HFBA 4XBKA 4TR9A 3L21A 2DP3A 1DV7A 1OX4B 2OZ0A 4XQ6A 4IMFA 1R46A 2AGKA 1GTHA 3EWWA 3HG2A 3SFKA 1W56A 5LNVA 1WA3A 1EUAA 5DXYA 1ICPA 2FB2A 2NZLA 4DF2A 3NQDA 1DORA 3NO5A 2Y62A 4NVTA 4POCA 1D3HA 2EGZA 4JTUA 4LC8A 1RQBA 1A5CA 3IIXA 4TO8A 3DFPA 1OX6A 3JS3A 1SZFA 4AH7A 4Q33A 3F03K 3IIOA 2ZZ2A 3INPA 4ORMA 4X9SA 3W7RA 3W7HA 1TCDA 2I1OA 3MI2A 3BO9A 1IIGA 1AG1O 1TPH1 3HGJA 2NV1A 5TIMA 4O1CA 1KM3A 1YTEA 1YDNA 1EWEA 4J9JA 4AF0A 1TRDA 4DEFA 2BLEA 3P5YA 4A29A 2Z0IA 4E38A 2V82A 2ZCGA 1IXPA 3NZRA 5FF4A 1I2OA 3IV3A 1RV8A 3BG3A 4QISA 4WOQA 1CW2A 4DBDA 3O15A 3WJZA 3DAQA 1NFBA 3SR7A 3EWXA 4JIQA 1PS9A 1WOAA 3HO8A 5KMYA 2ZRUA 1DVJA 1OYBA 2LLEA 3PG9A 1L6YA 5H91A 4LC6A 3MP5A 1SFJA 2QUTA 5HWNA 2VKZG 5AHMA 4HPXA 4JIPA 3FJ6A 1OX4A 3M1ZA 4MLJA 1A53A 1QMLA 3CB8A 1YXYA 4MY9A 3W83A 3M0ZA 1WQ5A 1LOLA 5HNRA 1VCGA 1JCYA 3NQVA 3I68A 5C2XA 1WX0A 4EWND 4UR8A 4FEZA 2NUXA 2XN1A 4YCPA 3GXTA 5DXXA 2RKXA 4S1FA 5U4NA 2QCGA 1VQTA 3VFLA 3G8EA 2J24A 4WJEA 3DI0A 3NPXA 4AWSA 4QNWA 4BI5A 3N2MA 1AW2A 2V8ZA 5K2ZA 4ZMGA 4LT9A 1OYAA 3I65A 2J9XA 3IIZA 3LCHA 2DU2A 3CQ0A 2Y85A 4IXXA 1G7VA 3ZS4A 5F2IA 1EEPA 1LZOA 4R53A 1K03A 1RPXA 1GQNA 1CI1A 1I8JA 1Q6LA 3W7OA 4CCCA 2CLFA 2CLOA 4YMZA 3OVRA 3WK1A 5AC6A 4WOZA 1JRCA 1H61A 4K36A 3WJXA 4NJGA 3TV8A 3ATZA 4LS0A 4N4QA 4XTDA 4E0CA 2JKPA 2Y89A 3TCEA 1PE1A 1L2UA 1JCNA 3HBLA 3A9IA 1VYSX 3C2FA 1F76A 1WOBA 4HNVA 2Z2UA 3BLIA 4RZ6A 5LZLA 4MYAA 1BEUA 4AWTA 3W84A 5CZSA 4Y8FA 1KBIA 1JCJA 1SU5A 2DORA 4EIVA 1LBMA 3RLVA 2A21A 5K9DA 3A23A 3UXDA 5DCBA 2FQIA 4IPJA 3C2OA 1XDLA 1SO3A 2XN2A 2CZDA 1OVDA 3GAKA 4Z08A 1TJPA 3P82A 1FWSA 1R2RA 4TU1A 3UWYA 1TPEA 4S2BA 1F7BA 1OFQA 3TIMA 3UZJA 5LGZA 1KM6A 4UXDA 3EX2A 1B4KA 4MPQA 4DPQA 4LW7A 2RDTA 1DQWA 1SQ7A 4OBTA 4XZ9A 3QF0A 1KV8A 1H51A 1I2NA 3L5MA 2BZNA 2OJPA 1TTPA 4XKYA 4RZ4A 3B8DA 3TW7A 4LOCA 3QC3A 4ADUA 3C8FA 3DZ1A 3GDKA 3LM7A 3M16A 2YCEA 1UUOA 1LYXA 2BXVA 5GVJA 1W8SA 2A7PA 2GQAA 4PA8A 2XFWA 1LORA 4LU0A 3PM6A 3IGSA 4O13A 3C2EA 3G1HA 3LOTA 3DH7A 5HJLA 4JN6A 1Q6QA 2NWSA 3FLUA 3UD6A 3GLCA 1JUBA 3G1DA 5KSWA 2RDWA 4N6EA 1L6WA 3W1UA 3TDFA 1FDJA 3LCFA 1Z48A 4NJHA 3PBWA 4JS3A 2WNZA 3PF3A 5CG7A 3QFEA 2C18A 1HL2A 3CWOX 4XTIA 4JNMA 2A85A 2WSQA 5FF3A 1TO3A 1QPQA 2X1TA 3KRUA 5AC7A 2YPIA 2C14A 4CQ9A 3SIZA 3N34A 3C56A 1W5OA 3HGRA 4FNRA 3LCIA 3NG3A 2C19A 1T0OA 1LROA 2DZUA 3PB2A 4N9BA 1QDSA 3KX6A 1OHLA 4IX2A 1B9BA 4ORIA 3NYZA 4JYEA 3QSRA 3L9CA 3SW6A 4DBEA 1LCOA 2ISSA 1VHCA 4MY8A 1YADA 1KM2A 2JGQA 4NNAA 3CU2A 4FB7A 4FXRA 3C4UA 1GYLA 5D2VA 4AWUA 1AW5A 1OFRA 2J6XA 4MLRA 3TC7A 1FY6A 4A3UA 1AL8A 1TPVA 2J9ZA 3MWAA 3TQVA 3GDLA 1EUNA 1LBLA 1Q6RA 2TRSA 4LV9A 1Q3NA 4JDYA 3C0JA 3Q94A 2ZFAA 1H5YA 3ATYA 3GAYA 3MW7A 1GPWA 2RH9A 1T8XA 5CZ0A 5HR7A 4LTSA 1ZFJA 3W87A 2ISWA 2YW4A 4JTHA 3R5EA 1E51A 3TX9A 1GOXA 5CPLA 4E2DA 4K8HA 2E77A 1QPOA 1TQXA 2WV8A 3FEMA 1EA0A 3HGSA 3LCLA 3P8IA 1HTIA 3P84A 3W7QA 5G4EA 4DO5A 3C2RA 1VC4A 4UFLA 4KFNA 4HPJA 4NNBA 2C6QA 4JYFA 2G5WA 1H7NA 1NF0A 3PUEA 3W1LA 3O16A 5U7SA 3MYPA 4HNTA 3IIPA 3UWUA 5DELA 3CM4A 1S3HA 3M47A 4GUIA 4GUGA 5D2TA 3RK8A 2EF9A 3W1AA 1YYAA 4RZ5A 4OQVA 4M7TA 4AVFA 2NLIA 1IXQA 4U4MA 4A2SA 2WJZA 3LERA 1ME9A 2HTMA 2ZA2A 4NJJA 3T7VA 1MZHA 2AAMA 1YPFA 2DZVA 3TMLA 2CLEA 1VCFA 4O16A 3NQ6A 4JY8A 5D04C 1S5VA 1TTQA 2WNQA 4JTKA 4P61A 3DENA 4NZJA 4BWLC 4UFMA 3TQ0A 1QR7A 4O1DA 1SPQA 3G0SA 1OFEA 2NUYA 4MZ8A 2A6LA 1B3OA 5DY3A 1Z44A 4AHOA 1N8FA 1ICQA 1SW7A 3O8AA 3L5AA 1G4SA 1FDYA 4AXKA 3TK7A 4OT7A 1B57A 2ZZ3A 2WPBA 5CPOA 2E5DA 1R2TA 3TSMA 5K7JA 2QUUA 2NX9A 1I4NA 4WY0B 3EXRA 1BKSA 5HR6A 1SZNA 1KLYA 5EBUA 2WOQA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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