2E6LA

Structure of mouse wrn exonuclease domain
Total Genus 60
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
60
sequence length
189
structure length
186
Chain Sequence
NLPFLEFPGSIVYSYEASDCSFLSEDISMRLSDGDVVGFDMEWPPPGKRSRVAVIQLCVSESKCYLFHISSMSVFPQGLKMLLENKSIKKAGVGIEGDQWKLLRDFDVKLESFVELTDVANEKLKCAETWSLNGLVKHVLGKQLLKDKSIRCSNWSNFPLTEDQKLYAATDAYAGLIIYQKLGNLG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Hydrolase
molecule keywords Werner syndrome ATP-dependent helicase homolog
publication title probing the roles of active site residues in 3'-5' exonuclease of werner syndrome protein
rcsb
source organism Mus musculus
total genus 60
structure length 186
sequence length 189
ec nomenclature ec 3.6.4.12: DNA helicase.
pdb deposition date 2006-12-27

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01612 DNA_pol_A_exo1 3'-5' exonuclease
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.10 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Ribonuclease H-like superfamily/Ribonuclease H 2e6lA00
3AA5X 3I8DA 3VQ5A 1RDCA 1BQNA 5K14A 3M8RA 2QK9A 3TANA 2XHBA 1BCOA 4M3ZA 2Z1JA 3O3FA 3RRHA 2Z1IA 4DFKA 1JKHA 3PV8A 3SPYA 5T7BA 2O4GA 1C1AA 4N41A 1W0HA 2B4JA 2KW4A 1VSLA 3QEIA 3CG7A 4CHPA 3I0RA 5CZ2A 4RG8A 4DSJA 2YNIA 4DS5A 3OYKA 2KFZA 3F9KA 1RT1A 3O4QA 3KKSA 4OKEA 4TSXA 1TV6A 5KRTA 3QETA 3HYFA 3MEEA 3DLRA 3LAMA 4DTXA 1I3AA 4CFBA 3ULDA 4FYDA 3DOKA 3SNNA 3OYLA 4NCGA 4O55A 4RW6A 4DTSA 4KRFA 3HM9A 3NGZA 4BDZA 2VG6A 5HBMA 4ELVA 4DSIA 1VSEA 4H4OA 1LAWA 5JS2A 4CJEA 4Z4HA 2ZE2A 1JLAA 1TGOA 2RN2A 3AA2A 4IG3A 4JRPA 1U48A 2HMIA 4B9LA 4FJHA 1D9FA 1IKWA 4C8OA 4IFYA 3M8SA 2VWJA 2Y1JA 4NCAA 1BI4B 4DSLA 2G8IA 1LWEA 4BE1A 4FJ8A 1TVRA 3BGRA 3F73A 4KI4A 1BCMA 3RWUA 4CJPA 3AVNA 3SV3A 2VG5A 2X78A 3OYCA 3RR7A 2KFNA 3L2UA 3AO2A 1HNIA 4DQSA 4FJ7A 3G0ZA 1BIZA 5I3UA 4Q0BA 1U4BA 3AVLA 1DTTA 4CGDA 4GW6A 3ZSZA 4JS5A 4OGEA 4FM2A 4DSKA 1C0MA 3ZT0A 2P1JA 2R7YA 3OYDA 3L2WA 4CJ5A 4Y1CA 1RBUA 1U47A 4CJ4A 3DLBA 2VWKA 4CJRA 1LAVA 3B6OA 3V9UA 2PYJA 1HRHA 2IOCA 3K59A 4FLYA 3SYZA 1EETA 4YFUA 3TWHA 1Z25A 1J5OA 4RW9A 1XWLA 3QNNA 3SUQA 2IDOA 1L3UA 1RTDA 4J2DA 1BGXT 3QINA 4IBNA 4KAZA 3K57A 1L5UA 1KVBA 3IRXA 3SJJA 1U45A 1NJWA 4KPYA 4DQQA 3K5NA 3K2PA 1QSSA 1TAQA 3IS9A 3AVGA 3KD5E 4FJLA 1VSFA 2HNYA 1WNSA 3P83D 4B8AB 3KK1A 4PQUA 3ZSXA 4CEFA 2HB5A 4FLTA 3IAYA 1DLOA 5FRMA 4JLHA 5CY4A 3V1RA 1XHZA 1R0AA 2XY8A 3VQ8A 4CF0A 3ZT1A 1EXQA 4CHNA 1VRTA 3DLHA 3M8QA 4UQGA 3O3GA 3L2RA 3EYZA 1RDAA 3TAGA 3ZSQA 4CJTA 3SQ1A 1UA0A 2A1RA 3AVKA 2OPRA 2HHXA 2RPIA 1KVCA 3O3HA 4E7LA 4Y1DA 3OS2A 3OJSA 4DTJA 2ATQA 1C6VA 2DY4A 4C8MA 4CESA 3C95A 4O5BA 5FROA 1MU2A 1TKZA 4KO0A 2AJQA 3NH1A 4BE0A 2HHVA 1WSJA 2O4IA 5C25A 1XHXA 3A2FA 4E1MA 1JL2A 3V1OA 5CZ1A 3S3MA 4KHSA 3DLEA 1C0UA 4KKOA 4FLVA 3L2QA 3TAQA 4C8LA 4FK4A 4CFCA 4H4MA 5D3GA 4LH5A 2OPPA 4BE2A 2OA8A 1A5WA 2YNGA 1QQCA 4IDKA 4F4KA 3DLGA 4B08A 3MECA 1RTJA 3HVTA 4CGJA 3SQ2A 1CZ9A 1F21A 2IS3A 3AVAA 2IC3A 1KLMA 3T1AA 2BGGA 1HQUA 4I2QA 4AHTA 3LP0A 1S1TA 4IFVA 2G8HA 4DQPA 4C8KA 2RKIA 4FZZA 4OJRA 4XIUA 3KLGA 1SKRA 3V81A 4OKKA 4KTQA 1ZBHA 3QNOA 3E01A 5SZTA 4J2EA 4QAGA 4F2RA 1KCFA 1WAFA 3NFAA 4RW7A 1TK0A 4Z0UA 3OYGA 2PY5A 4J2BA 4CGGA 4ZTJA 1VSMA 3NCIA 3AO3A 4FW1A 4DLEA 1Q9XA 2KZMA 4KB0A 5KGWA 1A5VA 4DU3A 4EP4A 3L2VA 5E41A 1QTMA 5CYMA 1ZYQA 2G8UA 1JL1A 4LSNA 4AHSA 3PUFA 3VQCA 1IKVA 4BDPA 4DMNA 4CJLA 4CHYA 4KI6A 4CIEA 3KJVA 3MEDA 5DMRA 1Q8IA 2Q3SA 4B9SA 3TAFA 1UAXA 1KFSA 4I7FA 3V9ZA 3H08A 2FBVA 5DK5A 1Q9YA 4E7IA 1QE1A 4F2SA 2B6AA 1ASVA 1RILA 4CJ3A 3AVHA 1IG9A 3NE6A 1VSDA 4DFMA 4JRQA 1K6YA 2D0AA 3PX6A 3DOLA 3MXMA 1SL0A 4M41A 2YV0X 3VQ9A 3HXMA 3K5MA 3KK3A 1L3VA 3TAPA 2ZD1A 4ID1A 3OYMA 4HCCA 4DQIA 3RMAA 2GV9A 2OYQA 4CF1A 4CERA 4KHWA 1RCHA 4CFAA 3T3FA 2F96A 3MAQA 1T7PA 3ALYA 2P51A 3ITHA 1RNHA 3OYNA 4FLZA 2HVHA 3QEWA 5CYQA 3S9HA 4J2AA 1JXEA 3NGIA 1UA1A 4F3TA 2X6NA 4FJNA 4W5NA 1BQMA 3HPOA 4AHVA 4FJIA 1BISA 1YT3A 3VA0A 2G8KA 1RDDA 1TL3A 2IAJA 4CFDA 4N76A 1ZBIA 1QSLA 3V9SA 2GUIA 3KIOA 3FFIA 3HSTB 3OYEA 1SKWA 3QERA 4ZTFA 1NK9A 4QOZB 4F8RA 3V9WA 1IKYA 4E7KA 3VQ6A 1NK8A 4AHUA 4FVMA 1Y97A 4FJXA 1S1UA 1QS4A 3AVMA 1S1VA 3OS1A 3HJFA 2YHAA 2D0BA 4E1NA 1RDBA 3CM6A 3LPTA 2QKKA 4LY7A 4FJGA 1VSJA 3DYAA 2HHQA 2B5JA 2FC0A 3DRRA 4B9TA 3SI6A 1TKTA 2X6SA 4FZYA 4Z4IA 1CXUA 3LPUA 1EKEA 4B3OA 2BANA 3BDPA 4DF4A 4Z4GA 3M8PA 3NAEA 4HTUA 4W5TA 5KRSA 1EX4A 2DFEA 3S3OA 3C94A 1RT6A 1VSHA 4CECA 3UIQA 2KTQA 1CLQA 3CFRA 4K8ZA 3OVNA 3HO1A 5HRRA 4NYFA 1T03A 3L3VA 3QESA 3AO5A 4MQ3A 1NK7A 2E6MA 1SUQA 4E19A 4W5QA 1S1WA 4AH9A 1NK4A 3QO9A 1SL2A 3PO5A 4DFJA 3RR8A 3NGYA 1KVAA 1S5JA 3DI6A 1SV5A 1J54A 4CIGA 1N6QA 5SWMA 4GMJB 3LP2A 4O4GA 4CF9A 3OS0A 2OPQA 3LZIA 1LWFA 3V1QA 4B9VA 5HRNA 1HMVA 3U3YA 4CGHA 1RT2A 1VRUA 1WSHA 3P1GA 5C42A 3D0PA 4FM0A 4EZ9A 4PY5A 1DTQA 5HP1A 4LH4A 1X9MA 3KKRA 2YKNA 3K5LA 3THVA 4DWIA 1X1PA 4BDYA 3LP3A 4DLGA 3L3UA 3WNGA 4OLAA 5HRPA 4CGIA 1B9DA 4KHQA 4I2PA 2Z1GA 5FDLA 1J9AA 2WOMA 2HHWA 4CJVA 4FLWA 4DFPA 4CEOA 2XY5A 2YNHA 1WSGA 3AV9A 4B9UA 1G15A 4N56A 1HYSA 2OZSA 4N47A 4AHCA 4DTRA 1O1WA 3EZ5A 4DU1A 1ZBUA 4CHOA 3SUNA 2G8FA 1WN7A 4DTNA 1BIUA 1N5YA 1Z26A 1NOZA 1ASUA 2FBYA 4E89A 1ITGA 4FW2A 4ID5A 2F8SA 5I42A 1A5XA 4K8XA 3B6PA 4AHRA 3JSMA 3LZJA 1YTUA 4OPJA 4KHUA 1U04A 3AO4A 1XC9A 3KTQA 5HRSA 3K58A 4FJJA 5J2MA 1C1BA 1RBRA 4RW8A 1LV5A 1JLGA 5J1EA 3V9XA 4CHQA 4EZ6A 4HUGA 3CFPA 4CF8A 2Z1HA 5J2NA 4GVMA 4M45A 2X74A 1D5AA 1RTIA 1EP4A 3SZ2A 1JLBA 1X9WA 1NKEA 3TARA 3SV4A 3G10A 4RW4A 3WNFA 4FXDA 3T19A 4CIFA 3SQ4A 2PYLA 4I9QA 3LWLA 3NF6A 3VN5A 3OYIA 4DF8A 1RBVA 4CK1A 3I0SA 2IGIA 1HPZA 3AA3A 3SCXA 4B9MA 4KREA 1TK5A 1RT5A 4O44A 4ZHRA 3DRPA 3WNHA 1QHTA 3S3NA 4CF2A 4YNQA 1HYZA 3ZT4A 4Z4EA 3SUOA 4LSLA 3KLFA 4M3WA 4CEDA 4Z4CA 3ZT2A 4CHZA 1FKOA 3AVIA 1HJRA 4CJFA 2E4LA 2QXFA 4CJKA 5J2QA 1XI1A 3VQDA 3OYFA 4CEQA 3KLEA 3EY1A 4FZXC 2DTUA 1UWBA 5JS1A 1IKXA 1UOCA 4KFBA 1FKPA 1JLFA 1RT7A 4B8CA 4EP5A 2D0CA 1TKXA 1VK0A 3CYMA 3LDSA 4E7HA 3ZCMA 1WLJA 4CEAA 1T05A 3VQ4A 1RT4A 3RRGA 4KTZA 3L8BA 3LANA 4IKFA 2NUBA 4DQRA 1NKCA 2VG7A 1NK6A 1KRPA 3MXJA 2XY7A 2E6LA 1KSPA 2FBXA 3RMDA 3LP1A 3TABA 4WE1A 1IO2A 1D9DA 4AILC 1KLNA 1CZBA 3ZSWA 1VSKA 3AVBA 4FCYA 3IG1A 4ICLA 3PX4A 1JLEA 2ITGA 3AVCA 1U49A 3CQ8A 1LWCA 4W5OA 3NH2A 5EU7A 1IH7A 4CGFA 3OYBA 3V4IA 1HQEA 1KTQA 3QLHA 3P5JA 2I5JA 3K5OA 4KTWA 1WSIA 3ZT3A 1BHLA 4M3UA 3C6TA 3AVFA 4KHNA 4ELUA 2KZZA 1JLCA 2PZSA 3PO4A 2ZQBA 2DFFA 3U6FA 3VQBA 1T8EA 4E0DA 3KLIA 3V6DA 4CEEA 1WAJA 4JS4A 2ETJA 2A1SA 1NK0A 1JXBA 1S1XA 4CEZA 1X9SA 1WSEA 3DM2A 3TI0A 3QIPA 4B9NA 4IG0A 4DG1A 2HVIA 3SPZA 4M3RA 4CJSA 3LAKA 4BACA 4CJWA 4CJUA 4W5RA 5HLFA 4CE9A 1S9GA 3ZSVA 3QIOA 1TAUA 1S6QA 3NDKA 1FXXA 2JGUA 1NJYA 2HW3A 4Q5VA 1WSFA 3U3GA 4DTUA 1D8YA 5C24A 3TAMA 2HNDA 4N5SA 1ZBFA 2LSNA 4G1QA 5J2PA 2EHGA 3NF7A 3SQ0A 1NKBA 2DFHA 4CCHA 3KD1E 4Z4FA 2BE2A 3D45A 4HVJA 3OYHA 3AO1A 2Y1IA 3HPHA 1S9EA 4DSFA 1I39A 4LD0A 3VA3A 3QEXA 3ASMA 4C8NA 3ISNC 3LWMA 1NJXA 2HHTA 1W9HA 2JLEA 4CJQA 3RMBA 1B92A 5KI6A 4KB1A 4KV8A 3VQAA 3RTVA 4DTPA 3DMJA 3OJUA 1BI4A 2FBTA 4M3YA 3AA4A 1L3TA 2KQ2A 3NF9A 1LW2A 4CEBA 4BWJA 1TL1A 2HHSA 5HROA 4PWDA 1C1CA 1REVA 5KTQA 4FM1A 4MFBA 1YVUA 3HL8A 1RTHA 2P5GA 1HYVA 3ZSOA 1B9FA 2BDPA 3ZSYA 1RBTA 4HUFA 3HK2A 3VQPA 4DSEA 4DU4A 2HHUA 3OY9A 3MXIA 4ELTA 3HT3A 3C6UA 3HP6A 4OGCA 3PY8A 2OZMA 1JLQA 1BL3A 2EX3A 4H8KA 1QSYA 4PA1A 4BWMA 3OYJA 3HPGA 2YKMA 2WONA 4DS4A 3QEVA 1S6PA 1VSIA 1ZBLA 3RMCA 3LALA 4HCBA 4DTMA 3NH0A 3CFOA 3NHGA 3VQQA 2YNFA 4FK2A 2GBZA 2XRIA 1NOYA 4FJKA 4OLBA 2RF2A 3ZSRA 2QKBA 3KLHA 1NK5A 4OVLA 3NF8A 3AVJA 4CK2A 3KK2A 3PX0A 4HUEA 1HNVA 4F3OA 4E7JA 3HVRA 4FJ5A 4KHYA 3HP9A 1TKDA 3SUPA 4M3TA 1L3SA 3TR8A 3VQEA 4M42A 1J53A 3MEGA 2P5OA 3CM5A 4O0IA 4L8RB 4FK0A 4OKJA 3JYTA 4OPKA 1GOBA 3WNEA 2F8TA 3O4NA 3QEPA 3DRSA 4M3XA 4I9LA 3OYAA 1SL1A 2W42A 2HNZA 1RT3A 2YHBA 1ASWA 3DLKA 1CXQA 4NYNA 4CK3A 4DTOA 2D5RA 2OPSA 1SKSA 4R5PA 1NJZA 4NCBA 3NBPA 2XO7A 1C0TA 3TAEA 1RBSA 1GOAA 1LW0A 2G8WA 4FLUA 1YTAA 5FRNA 4PUOA 4FJMA 4E3SA 1KFDA 4FLXA 2G8VA 2XY6A 1FK9A 4O0JA 1TK8A 3VQ7A 4FJ9A 1GOCA 4HHTA 4QCLA 5KGXA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1U2VA 3HOSA 1NM1A 2VCPA 2WFBA 1NU0A 4M3ZA 3O3FA 3RRHA 2Z1IA 3FZMA 5FPMA 4L3QA 4DHYA 3SPYA 5T7BA 5EY4A 4BGBA 1C1AA 4N41A 3D2EA 2KW4A 1VSLA 3CG7A 3F9KA 4TSXA 1TV6A 1I3AA 4CFBA 3DOKA 3SNNA 3U8XA 5TKWA 4FWSA 2QWNA 3HTVA 4DSIA 1VSEA 1ZC6A 3ID8A 1LAWA 5JS2A 1IG8A 1IKWA 4IFYA 5M1PA 3RSEB 2Y1JA 4DSLA 4FJ8A 1TVRA 3F73A 3GE1A 3RWUA 3SV3A 2VG5A 3RR7A 1GLDG 5C15A 4O5FA 3AO2A 4DQSA 2YJEA 1BIZA 5I3UA 2P9KB 4PL8A 1T6CA 3VEXA 4CGDA 4DSKA 4FM2A 4JS5A 4WF9L 3WQTA 3ZT0A 2HHHK 3BY5A 4WQ5A 3BF1A 4CJ5A 4BRPA 2PYJA 3OTOK 2NRRA 1VQ6N 4YOTA 1JCEA 2P9PB 3ENHA 2PAVA 1RTDA 1BGXT 4IBNA 2FF3B 4KAZA 3K57A 4JI8K 3TSUA 4EIAA 3CXCM 1GLBG 1VSFA 2E2QA 4EAHD 1WNSA 3P83D 1NGJA 4B8AB 5ELZA 4FWOA 4FLTA 3IAYA 5FRMA 5BREA 3CCEN 5CY4A 5M1KA 5FPDA 2XY8A 4MO4A 3VQ8A 1EXQA 1VRTA 3SQ1A 3O3GA 4LF6K 1J6ZA 3AVKA 1VQPN 1KVCA 1G99A 3O3HA 4Y1DA 3OJSA 4C8MA 4CESA 3AAQA 2UU9K 2HHVA 1WSJA 3HRGA 3S3MA 5TKYA 3DLEA 4C8LA 4NXNK 5D3GA 3W0LA 4FK4A 4CFCA 3P31A 4LH5A 2W6KA 4V19S 4BE2A 2E20A 5JMVA 3P38A 3LDLA 4Z94A 3DLGA 1RTJA 4CGJA 3T1AA 2IS3A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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