2E6MA

Structure of mouse werner exonuclease domain
Total Genus 61
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
61
sequence length
189
structure length
186
Chain Sequence
NLPFLEFPGSIVYSYEASDCSFLSEDISMRLSDGDVVGFDMEWPPPGKRSRVAVIQLCVSESKCYLFHISSMSVFPQGLKMLLENKSIKKAGVGIEGDQWKLLRDFDVKLESFVELTDVANEKLKCAETWSLNGLVKHVLGKQLLKDKSIRCSNWSNFPLTEDQKLYAATDAYAGLIIYQKLGNLG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Hydrolase
molecule keywords Werner syndrome ATP-dependent helicase homolog
publication title probing the roles of active site residues in 3'-5' exonuclease of werner syndrome protein
rcsb
source organism Mus musculus
total genus 61
structure length 186
sequence length 189
ec nomenclature ec 3.6.4.12: DNA helicase.
pdb deposition date 2006-12-27

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01612 DNA_pol_A_exo1 3'-5' exonuclease
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.10 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Ribonuclease H-like superfamily/Ribonuclease H 2e6mA00
1HYVA 3JSMA 1T05A 3I0SA 1IO2A 1FK9A 3OYBA 1O1WA 4OKEA 4FLUA 1BHLA 1RT5A 1HQUA 4M3UA 2IC3A 1RTJA 2FBXA 3AA3A 3OYGA 2XHBA 3LAMA 1XI1A 4O0IA 4B9SA 4B8AB 3U6FA 1NK0A 3VQCA 3NGZA 4CEDA 1RT6A 1Q9XA 4BWJA 2FBTA 1WSIA 1LWEA 3CM5A 1TVRA 3HP9A 3NF7A 4AHRA 2KW4A 3AVHA 4B08A 4ZHRA 4BDZA 1QHTA 2Q3SA 4CEFA 3HL8A 3UIQA 4CEOA 1U49A 1QSSA 2Z1JA 3NDKA 4DF4A 4HUEA 2HNDA 4I9LA 3TAEA 2OZSA 4FW1A 5J2NA 1D9DA 4E19A 3AO3A 3MEDA 3KK2A 1B9DA 1RDAA 3OYEA 3LPUA 3V1QA 3DLKA 3DOLA 4CF0A 4CEZA 4KTQA 5T7BA 3V9SA 3BGRA 2YV0X 4RW7A 4EP5A 4KTWA 1CLQA 3I0RA 3AVAA 1QSYA 1HMVA 3SPYA 1VSFA 3KJVA 2QKBA 2QK9A 2P5OA 3VQ9A 1KFSA 1ZBFA 3AVJA 5CZ1A 1EP4A 2ZD1A 2IDOA 1VSMA 4LH5A 1WAJA 4Y1DA 3K5LA 3ULDA 1RDCA 3AVMA 3QLHA 1L5UA 1HYSA 1CXUA 3VQEA 4CF8A 1Y97A 3MXMA 1RBRA 4I2PA 1VSHA 3KLEA 3TANA 3CM6A 4JS4A 4CIFA 4M42A 2HVIA 1C1CA 1RTIA 3NE6A 4DU4A 1HQEA 1S1TA 4F2SA 1L3UA 4DQQA 2EHGA 4IFVA 5KGXA 1D9FA 4MQ3A 1HNVA 1RT3A 2B4JA 3L8BA 4DS5A 1QSLA 4F3TA 2IAJA 2KZMA 3QO9A 3WNFA 3C95A 3KLFA 3BDPA 2IS3A 3QERA 1D8YA 1ZBHA 3OVNA 3QIPA 1WSGA 5HROA 1J54A 3DLBA 5HRPA 1VSLA 1ASWA 1X9SA 4AHCA 3HJFA 3L2UA 3V9ZA 3SYZA 1EKEA 1VSKA 4ELVA 1IKXA 1RT1A 3HM9A 4CFCA 1A5WA 2ITGA 3M8QA 5EU7A 4FZZA 2JGUA 5HRSA 2DTUA 3RTVA 1DTTA 4FLWA 3MXJA 4IDKA 2HHXA 3S9HA 1VK0A 3OYKA 4I2QA 1TV6A 3V1RA 4CFBA 4TSXA 4KFBA 4DMNA 1JLEA 4DSJA 3DRPA 4B9MA 2D0CA 1Q9YA 4Z4EA 1NK7A 3EY1A 2D0AA 3VQPA 4N5SA 4FM1A 4AHUA 4OLBA 1SUQA 4CJPA 1U04A 4CHOA 2DFFA 3PV8A 4CJ4A 4M3ZA 4O0JA 4B8CA 2FBVA 4C8MA 1EX4A 4LH4A 2W42A 4GW6A 4KB1A 3QESA 3CG7A 1KTQA 4CJVA 3NFAA 3D0PA 2WOMA 3T3FA 1NK9A 4HTUA 4Y1CA 4QOZB 3NBPA 3MEEA 2PZSA 4FJNA 4CE9A 3HVRA 1A5XA 4KTZA 1SV5A 1YT3A 3G0ZA 1SL0A 4DSIA 4M3XA 4E89A 2HHUA 2XY8A 1KVAA 1T03A 1VRTA 1JKHA 3THVA 4CJFA 4FLZA 1JXBA 3MEGA 4O5BA 3KTQA 5D3GA 3LALA 1SKSA 3KKRA 2HNZA 3OYDA 1KCFA 1TL1A 4H4MA 3LP2A 4Z0UA 4BWMA 3SQ2A 3SUNA 2G8HA 3RR7A 1NJZA 3RR8A 3NH0A 4C8NA 2OPQA 3NH1A 2IOCA 4OGCA 3O3FA 3SCXA 4W5NA 4W5QA 1S1WA 2GUIA 3AVLA 1X9MA 4N47A 2F8TA 1GOAA 3DLGA 1QTMA 1RBTA 3V9UA 1IKYA 4FVMA 2PYJA 3K5OA 4DTUA 5KI6A 1LAWA 3O4QA 1FKPA 1LWCA 3KKSA 4H8KA 5FROA 2VG5A 1WAFA 2X74A 1JLCA 4CF1A 4M3YA 3NF6A 4FJ7A 4JS5A 1J53A 3RWUA 1NK8A 3AVGA 2YNIA 1KSPA 2NUBA 4DTJA 4F2RA 4CHYA 4NCAA 5J2QA 1LV5A 2O4GA 1NOYA 3MXIA 4CECA 4GMJB 1EXQA 4CIGA 4DTPA 3KLIA 4J2AA 3ZSXA 5FDLA 4FJMA 2YNGA 2Y1JA 3RRHA 1WLJA 4M3WA 4FJ8A 3AO4A 4OLAA 3VQQA 4CGIA 1RTDA 4W5TA 4OKKA 4KRFA 4KREA 1RBVA 5HP1A 2P51A 3ZSRA 3D45A 4FLXA 3RRGA 1GOBA 3DI6A 4ELTA 1L3TA 5I42A 4E1MA 4M3TA 2Z1GA 4BDYA 3ALYA 4DLEA 2G8WA 3VQ8A 1WNSA 3M8PA 4CJEA 5C42A 3V9WA 3AVCA 2EX3A 1RT7A 3OJSA 3EZ5A 3QNNA 4BE2A 1RCHA 1SKWA 2XRIA 1CXQA 4DU3A 4CGDA 1S6PA 3IG1A 5KGWA 3DMJA 3OYMA 4DTXA 1NK5A 3OS1A 4CJSA 4DQIA 2QXFA 2R7YA 3SV4A 3DOKA 5CY4A 3HT3A 4CJ5A 1BQNA 3L3VA 1EETA 4CK2A 4DSFA 3PX4A 1C0MA 3TAPA 3HK2A 1BQMA 3C6TA 1VSDA 1BISA 2YKMA 1Z25A 3S3MA 2I5JA 2HVHA 4B9UA 1L3VA 4DF8A 4DU1A 1DLOA 4ZTJA 4NCGA 4CJTA 4CJRA 2ZQBA 3NH2A 4DTSA 1J5OA 4F8RA 2HW3A 2Z1HA 4IBNA 2G8UA 3AVKA 3CFOA 1RT4A 1X1PA 3LWLA 1NKEA 1TAUA 4J2BA 1TL3A 3JYTA 1XWLA 4CEQA 1BIZA 3AVNA 3C6UA 4BE0A 3ITHA 1JLQA 1JXEA 2X6NA 1VSJA 4LY7A 3V81A 1BCMA 4KI4A 2FC0A 3SQ1A 3WNHA 3OYAA 4CJ3A 1YTUA 3DM2A 4FJJA 3M8SA 3CYMA 3NAEA 1S1XA 1HRHA 4KHSA 2O4IA 2G8VA 4Z4CA 1LWFA 1ZYQA 4KHUA 3OY9A 1NKCA 2HHTA 2YNHA 4CHPA 4FK2A 3SNNA 4DQSA 4PUOA 1BL3A 1DTQA 2VWKA 4I9QA 5J2PA 2FBYA 3FFIA 2HHVA 3ZSVA 1KLMA 4CGGA 4JRQA 4PQUA 4OGEA 4KO0A 1WSJA 3ISNC 1VRUA 4Q5VA 3EYZA 4GVMA 4RG8A 5E41A 3B6OA 3U3YA 1I39A 3ZSYA 3LZJA 2E4LA 3MECA 3VA3A 1S9EA 4DG1A 4Z4IA 4OPJA 3LDSA 5C24A 4B9VA 4HVJA 2BGGA 1NOZA 3SQ0A 1BGXT 2BDPA 3QIOA 2XY5A 4C8OA 3OYFA 4E7HA 1RTHA 1GOCA 1K6YA 1TKXA 3G10A 3LZIA 3QEXA 2QKKA 1X9WA 4DTNA 4EP4A 3ZSQA 3RMCA 2A1SA 4E7LA 1YVUA 3LP3A 3ZT2A 1WN7A 4C8LA 4F4KA 4KHYA 2XY7A 4BACA 4DSLA 1QS4A 4E0DA 4J2EA 1TAQA 2G8KA 4CHZA 3SZ2A 2E6MA 3HP6A 3V6DA 1NKBA 1XHXA 4CEEA 1D5AA 3IS9A 3WNGA 1C6VA 3SJJA 1FKOA 2VG7A 4CHQA 3I8DA 4RW4A 4M41A 4KKOA 1WSEA 4CEAA 3AO1A 3TAGA 4HCBA 3VQ5A 2OZMA 2HHWA 1S6QA 3KLGA 3TAFA 2X78A 4BE1A 4CESA 3AA5X 3IAYA 3VN5A 2RN2A 4KI6A 3OYLA 3NHGA 4CGJA 3ZSOA 1IH7A 3PO4A 3LANA 1BI4B 3L2RA 3RMAA 1N6QA 4AILC 4DFJA 1C0TA 2P1JA 4PY5A 3DYAA 4B9TA 4DSEA 1RILA 1TKTA 4EZ9A 2DY4A 1KLNA 4FLTA 2KTQA 2HNYA 1S1VA 1W0HA 3TWHA 1UA0A 2F96A 3AVBA 4CJKA 3IRXA 4E7JA 4FJXA 3ZT4A 3O3HA 4B3OA 3L2VA 3NGIA 2WONA 3KK1A 2OPPA 3HPGA 5CZ2A 2X6SA 4HUGA 1HNIA 3M8RA 3PY8A 4AHSA 1KFDA 4ZTFA 3LP1A 4ID1A 1FXXA 1NK6A 4KPYA 1WSFA 1RBUA 3SUPA 4LSNA 2G8FA 4CCHA 3CQ8A 3NF9A 4FZXC 2G8IA 2KFZA 4E7KA 4M3RA 1T8EA 4FJ9A 3S3OA 4ICLA 3HPHA 1SKRA 3QEWA 2BANA 2B6AA 3NCIA 4E1NA 4ID5A 4WE1A 4FM0A 5HLFA 3K5MA 1RBSA 4ELUA 1RT2A 1ZBUA 4W5RA 4IKFA 1TKDA 4Z4FA 3PUFA 1TK0A 2XY6A 2E6LA 1T7PA 3KIOA 4XIUA 4KHQA 3AO5A 5K14A 5JS2A 1Q8IA 4W5OA 1CZBA 4N56A 1BCOA 5C25A 4B9LA 2YKNA 3H08A 1REVA 2JLEA 3VQ6A 4KHNA 2IGIA 1IKWA 1C0UA 4CF9A 2DFHA 3OYHA 1UAXA 1YTAA 4OVLA 1N5YA 1C1BA 4K8ZA 4R5PA 4DWIA 3L2QA 3VQBA 4FLYA 2HB5A 1JLFA 1S9GA 3E01A 2XO7A 3DLEA 2OA8A 2B5JA 4CJWA 5JS1A 4RW6A 1UOCA 3OYCA 4DTRA 1JL1A 4DSKA 1G15A 3LWMA 4L8RB 1Z26A 3K58A 3OYJA 4IFYA 4Z4GA 4CFAA 3QINA 3K2PA 3F9KA 2YHBA 2ATQA 2ETJA 4CJLA 3HVTA 1A5VA 5J2MA 2OPSA 3VQ7A 3QEVA 4K8XA 1NJYA 1S5JA 3ZSWA 1NK4A 4QCLA 2OYQA 1HJRA 3VQAA 3TAMA 4OJRA 4E7IA 4O55A 3AVFA 3VA0A 5SWMA 2ZE2A 3O4NA 3P1GA 4CGHA 4OPKA 3P83D 1RDDA 3HXMA 4J2DA 3QNOA 4HCCA 4UQGA 4KHWA 1XC9A 4B9NA 4M45A 4LSLA 1TK5A 1HYZA 3U3GA 3DRSA 3TARA 4PWDA 4DLGA 3SUOA 4KB0A 1LAVA 5SZTA 1JL2A 3KLHA 3SV3A 3OYIA 1KRPA 4O4GA 2AJQA 2RKIA 4FXDA 4FM2A 2LSNA 1IG9A 3L2WA 1SL1A 1L3SA 2RF2A 3PX6A 4AHTA 2HHQA 2KFNA 2YNFA 4EZ6A 1RDBA 3QEIA 1JLAA 2VWJA 1U48A 4KAZA 1CZ9A 3DLHA 1UA1A 1BIUA 1LW2A 3T1AA 1WSHA 4OKJA 4DTOA 4PA1A 1ITGA 1W9HA 5CYQA 1KVBA 3AO2A 3L3UA 3NF8A 3HSTB 1XHZA 1UWBA 5HRNA 3V9XA 1QQCA 4FJLA 2GBZA 4IG3A 4FCYA 4FYDA 4FJ5A 2GV9A 3F73A 3VQDA 4FZYA 5I3UA 5DK5A 2PY5A 1JLGA 4IG0A 2Z1IA 3HPOA 5DMRA 4FK0A 4CIEA 4AH9A 3OJUA 2YHAA 4DFKA 4I7FA 3TAQA 1BI4A 3B6PA 4KV8A 3ZT1A 4CEBA 3OS2A 2P5GA 2OPRA 3SQ4A 1VSEA 4G1QA 4NYFA 1QE1A 1TKZA 2RPIA 3KK3A 4CERA 3ZCMA 3CFRA 4DQRA 4NYNA 4DFPA 3CFPA 3SPZA 3TR8A 1LW0A 3OYNA 3VQ4A 4C8KA 1U47A 4FJKA 4H4OA 4MFBA 3TABA 3A2FA 2D0BA 4JRPA 3SI6A 1MU2A 4RW8A 1ZBLA 4CF2A 3DLRA 3LP0A 4YFUA 1J9AA 4F3OA 2HMIA 3HYFA 3NGYA 1TK8A 5J1EA 2Y1IA 3RMBA 3KD5E 3WNEA 3T19A 3LPTA 3ZT0A 4CHNA 2A1RA 3PX0A 1RNHA 1TGOA 4O44A 1NJWA 4FJHA 4CFDA 4DFMA 3QETA 2HHSA 3AV9A 3ASMA 4HUFA 4Z4HA 4DS4A 3O3GA 3RMDA 1R0AA 1U45A 4Q0BA 2BE2A 1I3AA 2D5RA 3ZSZA 2VG6A 4FLVA 1ASVA 4BDPA 2KZZA 4JLHA 5HRRA 5KRTA 1ASUA 1VSIA 5CYMA 4CJQA 1S1UA 5HBMA 3K57A 5FRMA 1JLBA 4DTMA 1U4BA 4AHVA 3C94A 4FW2A 4CK3A 1B9FA 2PYLA 4CGFA 3DRRA 4CJUA 3SUQA 4YNQA 2F8SA 4RW9A 4HHTA 4N41A 1NJXA 3AA4A 4FJIA 4CK1A 1HPZA 4DQPA 4FK4A 2DFEA 1IKVA 1B92A 1KVCA 4QAGA 5KRSA 4LD0A 1ZBIA 3K5NA 1SL2A 3HO1A 3P5JA 3V4IA 1F21A 1C1AA 3LAKA 4E3SA 3S3NA 4FJGA 3PO5A 3AVIA 3OS0A 3MAQA 3KD1E 3V1OA 4NCBA 2KQ2A 3ZT3A 3TI0A 5KTQA 3QEPA 4N76A 3K59A 3AA2A 5FRNA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1HYVA 4FLUA 4M3UA 1HQUA 4FWRA 2XHBA 2OCEA 3U6FA 2QWLA 3W0LA 3NGZA 4U7BA 4DB3A 3IUCA 1VAZA 1K8AO 4AHRA 4BDZA 4ZHRA 3AVHA 5LY3A 3HL8A 5M1OA 2Q1NA 4CEOA 1U49A 4WF9L 4HTLA 1YXQA 5J2NA 2ASPA 1K73O 1OVQA 3KK2A 4KTQA 3OYEA 2O8FB 3LPUA 3DOLA 4RW7A 1CLQA 5LJWA 3WEEB 5LMNK 1ZBFA 1NGIA 5DM7L 1VSMA 1WAJA 1I94K 1RDCA 3IKMA 3UKRB 3CM6A 1TYQA 3THWB 5IT9O 1RT3A 2B4JA 1QSLA 1VQ7N 4IXCA 3BDPA 1VQ9N 1D8YA 1ZBHA 4XEIA 3L4IA 5HROA 3DLBA 3FZHA 5GAGP 4A61A 1X9SA 4AHCA 3HJFA 3L2UA 5EXWA 1BWFO 4AM7A 4BRAA 1EKEA 3A0IX 3G71N 1IJJA 1A5WA 2ITGA 5EU7A 2DTUA 1DTTA 3B8AX 4IDKA 2HHXA 3V1RA 4TSXA 4KFBA 4DMNA 4JYAK 4DSJA 4B9MA 3VOVA 4N5SA 1W97L 5AQQA 2HBMA 2DFFA 2P9LA 4CJ4A 1NMDA 4M3ZA 3L0QA 3D2EB 2UUAK 4CJVA 3NFAA 5F1XA 4BG9A 3I33A 3BF3A 3HVRA 1SV5A 2HHUA 5AQNA 5FPMA 2ZM6K 4OPHA 5AZIB 4DV3K 1T03A 4JKCA 3CPEA 3I56N 1JXBA 4A62A 1YF5L 3F2KA 1HKCA 3A5LC 4B9QA 5F0XA 1SKSA 2HNZA 1TL1A 4Z0UA 3LP2A 3SQ2A 4DR6K 2UXDK 3CJAA 2OTJN 3O3FA 2IOCA 4H0XB 1KAZA 3SCXA 1S1WA 4PL8A 2UXBK 2P9IB 3H6EA 1Q82O 1QTMA 1ATSA 3V9UA 2YHXA 3DXKA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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