2EAWA

Human ump synthase (c-terminal domain- orotidine 5'-monophosphate decarboxylase)
Total Genus 98
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
98
sequence length
256
structure length
256
Chain Sequence
ELSFGARAELPRIHPVASKLLRLMQKKETNLCLSADVSLARELLQLADALGPSICMLKTHVDILNDFTLDVMKELITLAKCHEFLIFEDRKFADIGNTVKKQYEGGIFKIASWADLVNAHVVPGSGVVKGLQEVGLPLHRGCLLIAEMSSTGSLATGDYTRAAVRMAEEHSEFVVGFISGSRVSMKPEFLHLTPGVQLEAGGDNLGQQYNSPQEVIGKRGSDIIIVGRGIISAADRLEAAEMYRKAAWEAYLSRLG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Lyase
molecule keywords Uridine 5'-monophosphate synthase
publication title Human UMP Synthase (C-terminal Domain - Orotidine 5'-Monophosphate Decarboxylase)
rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 98
structure length 256
sequence length 256
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.4.2.10: Orotate phosphoribosyltransferase.
pdb deposition date 2007-02-03

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00215 OMPdecase Orotidine 5'-phosphate decarboxylase / HUMPS family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 2eawA00
3N2MA 4OU1A 2E09A 1K7FA 3SW6A 1NF0A 5EA9A 1JUKA 1OJXA 5HWNA 2DZUA 4XTIA 3NM3A 1TPDA 1ZFJA 3ZS4A 4AF0B 1GG0A 3BG3A 4JTIA 3HGSA 2V2DA 1KW1A 4ORIA 4UTTA 3TCEA 4EF9A 4M6QA 1IXNA 3WFAA 4QJ1A 5F2GA 5K3VA 2QCDB 4O13A 3D0CA 4MUZA 3DFOA 3B0UX 1XBXA 5AYXA 3TW7A 3W7QA 2XN1A 1J4EA 3W23A 3STEA 1TPB1 4W9TA 4CNNA 1QPRA 5LNWA 4S1FA 5BOOA 1SZGA 4NUWA 3P8JA 1G69A 1M5WA 1K02A 4OV9A 1QO5A 3QW3A 1B9BA 4OQVA 2Y7DA 1JQXA 1SQ7A 3NL2A 5CPOA 3T40A 3GAYA 4NNCA 2W0UA 4MLJA 3UWVA 1WOAA 3UY7A 2X2GA 3W7NA 1FXPA 2W6RA 2V5BA 4A2SA 4BFAA 2ZCGA 3FJ6A 4DPPA 1YYAA 4GFSA 1SU5A 1XBZA 5G4EA 2H6RA 3W7KA 4H3DA 5FF3A 2VENA 1VYSX 1PCKA 4JTSA 3GIYA 3KOFA 4JN6A 5A8GA 1AW5A 5DY2A 3R13A 7TIMA 3OVRA 4N4PA 3WJXA 4AMAA 5I3HA 4MOZA 3PB0A 5K4ZA 2NXHA 5AC6A 1H5YA 2NXGA 2NXIA 3W7PA 2QJIA 3UQNA 3NL5A 2VXNA 5C55A 4CCEA 3NXFA 2V2CA 1GJPA 2A6LA 2Y89A 3C56A 3QC3A 3HOJA 3PBWA 3UY8A 2H3DA 4LS2A 1KTNA 1OK6A 3B8DA 5MHBA 1SUXA 1R2SA 4JXCA 4J9JA 4YLWA 4JTLA 1EUAA 5FF7A 2WJZA 6TIMA 5TQLA 2NWSA 4NNAA 4UTWC 4IGHA 2C6QA 2QDGA 4LV9A 5CGQA 3MI3A 1WA3A 3PB2A 4H4IA 3BGJA 4X22A 1ZHAA 2EKCA 3GNDA 2QCDA 4I7UA 4UFMA 1AL7A 1Y0EA 4GRSA 2VC6A 4DEFA 4C1KA 1R30A 3CQ0A 1VYRA 1YADA 3NVTA 5DLCA 2AAMA 1H62A 2ZFAA 1VLWA 3BARA 3KRSA 1SR9A 4AAJA 2BTMA 3TFCA 3GKAA 2ZYFA 4LRTA 1IF2A 3W2LA 3LRKA 3NQ2A 3QM3A 4IX2A 1U5JA 1F76A 3NPWA 2Z6JA 4PA8A 5HINA 2FTPA 4FNRA 3PSWA 1J5TA 4UFJA 3GVGA 4LT9A 1KV8A 4X2RA 5DN1A 3IEBA 1I2NA 3CC1A 3W84A 4NJHA 3O05A 2GJLA 3DGRA 3PY2A 2J9XA 3M5ZA 1O4UA 3TUUA 5I3IA 3M44A 3N19B 3HB9A 3L5LA 3PG9A 1F6PA 2D73A 3LTYA 3W1RA 3W72A 3K30A 1H7PA 4ORMA 1LYXA 1X6UA 5L9FA 3LCGA 3WJWA 1O5KA 3ABOA 5D37A 3TJXA 3NQ7A 2CLLA 3S0CA 3W1NA 3EKLA 3VFLA 3BK0A 1G4EA 3QPYA 1XDMA 2Z1BA 2Q8LA 3L5AA 1OFDA 1WBHA 2J24A 4LVFA 3DI1A 3GDMA 4UUIA 2J6XA 1HL2A 5ABTA 1XBYA 2C0AA 4UNLA 2CW6A 3H55A 4E0CA 1BKSA 1LRNA 4O1AA 1A5BA 3S9YA 4WJEA 3NQAA 3P61A 3CM4A 1QPOA 5AHIA 3W85A 3RLUA 4P61A 4B5NA 5G2WA 3RU6A 3CHVA 3M5VA 4K8EA 4LY8A 3IIOA 3KRZA 3W1QA 3KX6A 3I7SA 5C5YA 1DJNA 1F74A 4Y96A 2ZRVA 1DV7A 1VS1A 5HR6A 3FS2A 1QR7A 5CPLA 1YPIA 2ZRWA 2CZFA 1FDJA 2DP3A 3HQ1A 3FIGA 4NU7A 4MKNA 3EX6A 1LLZA 1AL8A 1ZAJA 5F2MA 4Y90A 3S6DA 3EXTA 3UXAA 2C18A 4GUJA 3TE9A 4UTTC 3EWYA 3W7LA 2Z2UA 2V82A 4XZ9A 3S8HA 4O57A 3W73A 3TDFA 3WK0A 3W7GA 5HR7A 1B4EA 1W5MA 4BR1A 2VFIA 1XL9A 1QO2A 4RX0A 1XFBA 2VFDA 1ZALA 2NUWA 3W7DA 4HNVA 1W5OA 2GJNA 4POCA 2DZTA 4QISA 5K9XA 2I9EA 2ZZ1A 4ZQCA 3N34A 4MYXA 2VEMA 2GUUA 3NYZA 5CKSA 1YPFA 1ZCOA 5LNUA 1Q6LA 1OFAA 3PS7A 2C3ZA 1EEPA 1UUOA 3OIXA 4PODA 1DVJA 4GUHA 3QRHA 5FEWA 3W7HA 2CZ5A 1QOPA 1T99A 3QMSA 4JY9A 2YDAA 4JD4A 4JEQA 5LSMA 3BLIA 4LUIA 3GK0A 5E1QA 2DZSA 1AW1A 3CPRA 1P0NA 2QCCA 4DF1A 4A3UA 1YTEA 5DXYA 3S5OA 1LOQA 1I8JA 4FEZA 1L6WA 4QSHA 1W31A 4JDBA 4FNTA 4OGZA 1W3TA 1KTBA 3T4CA 4Z0SA 3UNDA 3O8AA 3LOTA 3BW4A 4XBKA 3VCRA 1ONRA 1TQJA 2QCHA 2GVJA 2ISSA 4RK8A 2YCEA 3GAKA 4X3ZA 2AGKA 2A1YA 4RV8A 2NV2A 2QKFA 2C1HA 4CLMA 1WXJA 2ZQ0A 4NT0A 4JIQA 1Q6QA 3LI0A 3SI9A 1JCYA 4BF9A 3R5EA 4MY1A 5D32A 5TIMA 1TO3A 4R34A 1FUYA 1P4CA 4RZ5A 1XC4A 2WPBA 3GLCA 3OBKA 2RH9A 2A4AA 1OABA 3W1XA 1SO3A 3L68A 4HPXA 3ATYA 4LC8A 4O11A 1SO4A 1H7WA 1KM0A 1YDVA 3EX1A 5SWUA 3UWUA 2VEKA 3S5YA 1K7EA 1EWEA 4AVFA 1VPXA 3LHWA 2VKZG 1IIGA 1WYIA 2YW3A 1LORA 1PHQA 4O12A 4UCGA 3R89A 3LXBA 2V9DA 1TTIA 3MJYA 3P8IA 6ALDA 2X16A 1S5WA 3ABRA 3L0GA 1UASA 3TNOA 2C15A 4IX0A 3TU9A 1VHCA 3A21A 3LCHA 1FX6A 1TPC1 3SJ3A 2H8ZA 4K36A 4NX5A 1VJIA 2J27A 2YR1A 3LX9A 5EMUA 2QUTA 3KRUA 4CCDA 2JGQA 4HSOA 4O1CA 1GYNA 1XI3A 3EWUA 1E51A 3HPSA 3IIXA 1GQNA 1JR1A 1W54A 3O06A 1VC4A 1UJPA 4X9SA 3LB0A 4FX7A 1TSIA 5CZ0A 1FWNA 1TV7A 2LLEA 1A5AA 3IVSA 4E2DA 1H51A 4OT7A 3TAOA 2B4GA 1VHNA 1DJQA 3W7IA 3HG4A 3ZFHA 4CQ9A 3MI6A 4GNJA 1I2OA 3Q2DA 4JTEA 3OVQA 1TYGA 2OX1A 1K03A 1TPWA 5LGZA 5EYWA 4ONVA 4XKYA 1LBMA 3JRKA 1OFPA 4P2VA 3BG5A 3NQ6A 3NQVA 2C13A 3TR2A 3N9SA 1W0MA 3ABQA 2DJLA 3MHGA 2XN0A 2OJPA 4LVDA 3P84A 3W7CA 4TMCA 5F2LA 5G1TA 1PCWA 3STGA 1R46A 1GTEA 4N6EA 5G4WA 4JYFA 2QCGA 2FDSA 3HPXA 3C61A 4IJBA 2BWGA 5F4SA 3RMJA 3WK3A 3G1VA 4MZ1A 4IMCA 3QSRA 1KFCA 2H90A 1BWKA 2RKXA 2R8WA 2V81A 1KM3A 1KFKA 2GQ9A 3S1XA 2JBMA 1K8YA 2X1SA 1A53A 1K8XA 2X1RA 5CPMA 3DAQA 3GDLA 3Q37A 4JS3A 4KWWA 3SIZA 3DHFA 2ZRXA 1B3OA 3LTPA 3U8GA 5D05A 4O53A 5U4NA 5D09A 1Q3NA 1YDOA 3I7RA 3QQ1A 2E5BA 4NJGA 1KTCA 4Y8FA 4WZHA 5A5WA 4ADSA 4NQ1A 3C8FA 5CSRA 1ZJIA 4WUIA 4O54A 3LTSA 2PE4A 2DU2A 2QJHA 2VOMA 4EF8A 2CLKA 4K7YA 5D38A 4M6VA 1XXXA 1TPVA 2GQ8A 5AYYA 2WNNA 3W88A 2A7PA 3W6YA 3QFEA 2CLOA 1TPFA 1VH7A 3LBCA 3E02A 1K7XA 4FNUA 1QNVA 2Y88A 3O6CA 3MP3A 1J2WA 4DBEA 2A0NA 4UTLA 3C2FA 2P1FA 1MO0A 3EKZA 4GXMA 5BMXA 3G1DA 4MVAA 2NX3A 4HHPA 1EWDA 3NEVA 4O17A 3S1VA 1YDNA 1QDSA 1C9DA 3GXPA 1RV8A 1OFEA 3GB6A 3CLMA 3UWYA 2ZZ7A 3BV4A 1PL9A 1N7KA 3TQ0A 5T26A 3VI2A 3W2MA 2G95A 3BVJA 3T44A 3LV5A 1ZY9A 3DXIA 1FCQA 4Y6GA 1RQEA 3FFSA 1TPEA 1PVNA 3G1HA 2DZWA 3GXTA 1EPXA 1H61A 2OT0A 4GBUA 3QQ0A 4ZQRA 5AHMA 3G3DA 2ZRUA 1OX5A 1GZGA 3RNDA 1WAUA 1NF7A 4WY0B 3L21A 5LNVA 3M5XA 3O16A 3G24A 3P7YA 3I6RA 4IMEA 2ZA2A 3IIVA 2P10A 4GJ1A 3HGJA 1LOSA 3MW7A 1IXPA 4RXGA 2Q3RA 3B0VC 2IQTA 4TMBA 1RD5A 3N9RA 2B7PA 3O1NA 1H7NA 1L6YA 4RR4A 3OEXA 3W1MA 2BZNA 3GDKA 3DFPA 4KKXA 5EY5A 5KINA 1Q45A 1OX4B 2VEIA 2QF7A 2ZTKA 3L67A 3QMRA 5KITA 2FIQA 3M7WA 3P74A 1CW2A 3N2XA 3W83A 4N9CA 1OG0A 3PF3A 5AOUA 1QPQA 4AF0A 1M6JA 1L9WA 2Q3OA 5AB3A 1YXCA 4UMBA 3NA8A 1SSDA 4N9EA 1SO5A 2TSYA 1OYBA 1KBJA 1S5TA 2A7NA 1XCFA 4NVTA 1R2TA 4IXHA 1Q6RA 1UUMA 3AO0A 4K39A 4DPQA 4UFIA 5E93A 4ZL1A 1L6SA 2TYSA 4YXGA 5HWJA 4O1BA 1P1XA 1NFBA 1LROA 2QCMA 4IMDA 3G0UA 4HSNA 2X1TA 5KZMA 3LCWA 3LCFA 1JCLA 3RF9A 1LLWA 4ADTA 3G1XA 4XUGA 5K2ZA 1FWWA 2YFOA 1OVDA 4MZYA 4ZQOA 1OYAA 1SZNA 4MJMA 3VE7A 1SSGA 3VE9A 4FF7A 3ZR4A 2ZA3A 3BGGA 1FWSA 2OCZA 1I4NA 3NPUA 4RLIA 4JX5A 3CU2A 1A50A 3FYPA 3N73A 3P81A 3MBFA 4LOCA 1SW3A 1G4TA 1YXYA 4OE7A 4WY0A 1LRQA 4FNPA 5AHFA 5H91A 5GVJA 2QAFA 3NM1A 2E6YA 4DQWA 1T96A 4LTSA 4MIMA 2E68A 3KFTA 1EUNA 2HS8A 4M5PA 4A22A 1K8ZA 1KFEA 5AYZA 4A2RA 4CNOA 1GT8A 2GOUA 1O5XA 1OX4A 1LM1A 4N02A 1EA0A 4LS1A 2DORA 3DBPA 3BLEA 3PC0A 1KV5A 4WX2A 4RJEA 1OF8A 1OFQA 5CZTA 1VZWA 4R53A 2RHGA 2ZZ5A 2WOQA 4NZJA 3W74A 3N3MA 2WQPA 1W56A 2BX7A 4JTTA 4O19A 1EB3A 4QNEA 2ZZ6A 4Z08A 4MZ8A 1IGSA 1QCWA 2QCEA 3IVUA 4IOTA 1DOSA 5FEPA 2WSRA 2G96A 1SW0A 3THAA 2QUVA 3G22A 1TJPA 2JKEA 1XUUA 3PBVA 3A22A 2ZTJA 2Q8ZA 3UZJA 2FFCA 5U7SA 1FCBA 3L66A 3DKJA 1MSSA 1W37A 2ISWA 4LC6A 3TQVA 2E6DA 3NL6A 4FIQA 3G1AA 2H3BA 3EEGA 5LGXA 5D2TA 5K9DA 1W5PA 3LRMA 3M9YA 1AG1O 1SFJA 4IWWA 1DORA 4RKAA 4DF0A 5FF0A 4R33A 1F5ZA 1WDWA 3W7EA 1MXSA 1FQ0A 2ALDA 4Y9AA 5DXXA 3B03A 1TQXA 3MMTA 4AWUA 5C54A 3C2VA 2E77A 1ICQA 3W76A 1HUVA 4AWSA 2YZRA 3WK1A 4YCPA 2E6FA 1A5CA 2F7FA 4JY8A 2Y70A 2R14A 4NX0A 1D3GA 1KFBA 4RZ4A 3UD6A 4O28A 4OBTA 1GVQA 5CZJA 2RFGA 3IRDA 4LW7A 3TAKA 2ABBA 3KVKA 1LP6A 4ML9A 2JKAA 3HG5A 3M0ZA 5D03A 5DCEA 1TJRA 5E0KA 5AC7A 2J9ZA 4IUOA 4BWLA 2XFWA 3PBUA 1SZEA 1U83A 3LCXA 5H2ZA 5CPNA 3SSJA 1JRCA 3PUEA 2A21A 2B7OA 2GVLA 1FXQA 1RVGA 1HFBA 4KFOA 1CX9A 4DO6A 3THQA 4E38A 3A24A 1NEYA 3LLDA 3NQMA 3E9AA 5KZEA 4JIPA 3S5ZA 1RQBA 2RDTA 3C2RA 3LI1A 3E49A 2HMCA 2PCQA 2ATSA 1S3HA 5LKYA 3ABSA 3W1TA 3O6YX 1TPH1 4HNTA 4WQ6A 3STCA 4UFLA 4DO5A 3EX2A 1GYLA 2YW4A 4TR9A 3ELFA 3NR0A 2WO5A 2TRSA 3WJYA 4AWTA 2OT1A 3G3MA 4K37A 1PIIA 2O7SA 3O63A 3E96A 1WOBA 3MUXA 1T8XA 1F05A 4EIVA 3NQDA 3LHZA 3E12A 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#chains in the Genus database with same CATH topology
 4H2C A;  4OU1 A;  1V3I A;  3AZR A;  4O0Q A;  3IUH A;  2VR2 A;  2DZU A;  3NM3 A;  4AST A;  1ZFJ A;  3AHZ A;  1GG0 A;  1U1H A;  1EF3 A;  3BG3 A;  1GYM A;  3COT A;  4JTI A;  3HGS A;  3WEL A;  1PZ0 A;  2V2D A;  4JAW A;  3WF3 A;  1KW1 A;  4UTT A;  4ATD A;  3NSM A;  1IXN A;  4GVH A;  2F2H A;  3P3B A;  1BQC A;  1QI3 A;  4TOQ A;  3A13 A;  3DFO A;  3OBE A;  5A3H A;  2YB4 A;  1PTG A;  2GVY A;  1G94 A;  1QPR A;  3RUB L;  1G69 A;  1Y65 A;  1ZL1 A;  1R7O A;  3SUT A;  2QJN A;  1N2V A;  1SQ7 A;  3GXI A;  3NL2 A;  5CPO A;  3EPO A;  1FXP A;  3MZN A;  4A2S A;  4DZH A;  4UZU A;  2VGB A;  1JYN A;  2H6R A;  3AAM A;  3RAO A;  4A3H A;  2VEN A;  3RXZ A;  2EG8 A;  1VYS X;  1PCK A;  1U1U A;  1YDY A;  5A8G A;  1AW5 A;  1S2V A;  1SVD A;  3Q65 A;  4Q6J A;  3PTQ A;  2E28 A;  1WDD A;  3W7P A;  3UQN A;  1E0V A;  4OOU A;  3NL5 A;  5FOO A;  3WLS A;  4H83 A;  1F4A A;  1NEL A;  3A64 A;  2HRW A;  1UR0 A;  4GYJ A;  1SYT A;  3HOJ A;  4UQ9 A;  3MUA A;  1KTN A;  2OKT A;  4FXF A;  1G5A A;  3G2G A;  3V0T A;  3B8D A;  4G5D A;  1KO0 A; 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