The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
6
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sequence length |
75
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structure length |
75
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Chain Sequence |
GSSGSSGNLKDVYVSIADYEGDEETAGFQEGVSMEVLERNPNGWWYCQILDGVKPFKGWVPSNYLEKKNSGPSSG
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Signaling protein
|
| molecule keywords |
SH3 and PX domain-containing protein 2A
|
| publication title |
Solution structure of the fifth SH3 domain from human KIAA0418 protein
rcsb |
| source organism |
Homo sapiens
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| total genus |
6
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| structure length |
75
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| sequence length |
75
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2007-02-28 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 3SHW A; 3EGU A; 1NLO C; 2GTO A; 2X3W D; 2RN8 A; 1GL5 A; 4J9F A; 4GLM A; 3THK A; 3M0Q A; 1HSQ A; 2E5K A; 4FSS A; 2A08 A; 1T0J A; 3CQT A; 4OMN A; 4CC3 A; 1M3A A; 2RQW A; 2LMJ A; 2KRN A; 2ED1 A; 4Y92 A; 2YDL A; 1UHC A; 4JJC A; 2M0Y A; 1SHF A; 4RTU A; 1X6G A; 1X6B A; 1BB9 A; 2L3S A; 1UTI A; 2JW4 A; 1ZUK A; 2L3P A; 2ENM A; 1S1N A; 5IXF A; 2DMO A; 3C0C A; 1VYU A; 2FEI A; 1OEB A; 2HDA A; 1TUD A; 4AG2 C; 1KSW A; 1RLQ C; 2EW3 A; 1J3T A; 1MV0 B; 3ULR B; 3VS2 A; 2OJ2 A; 1E7O A; 2EBP A; 2LJ3 A; 3RBB B; 1QWE A; 1PWT A; 1CKB A; 4F14 A; 2DE0 X; 1JO8 A; 5IH2 A; 2B86 A; 1SPK A; 4JJB A; 1A0N B; 2JM9 A; 1YWO A; 4CC7 A; 4QT7 A; 1OOT A; 4IIM A; 4J9D A; 4J9G A; 1JU5 C; 4HCK A; 2FRY A; 2XMF A; 1WXB A; 1HD3 A; 5GJV B; 1AWW A; 2ROL A; 2FPD A; 1M27 C; 2EGC A; 1UFF A; 1WA7 A; 2KRS A; 4LUE A; 3REB B; 1ARK A; 1NLP C; 3PVL A; 2JMC A; 2ECZ A; 1UJY A; 3VS0 A; 2PZ1 A; 1K1Z A; 3TVT A; 2KGT A; 3I9Q A; 1Y0M A; 4ORZ A; 2A28 A; 1Z9Z A; 2NWM A; 3NPF A; 1SEM A; 1PRL C; 2DLP A; 1HJD A; 3VRY A; 2MIO A; 3M0R A; 4CC4 B; 2EYW A; 1KIK A; 3NHN A; 3ZL7 C; 2I0N A; 1X2K A; 2AZV A; 2KT1 A; 1JQQ A; 1NEB A; 1SRM A; 2JT4 A; 3EG3 A; 2KT8 A; 5EC7 A; 1WFW A; 1UUE A; 3VS3 A; 3H0I A; 2KYB A; 5I22 A; 2HSP A; 2YUP A; 3EHQ A; 1H8K A; 4Z88 A; 2L0A A; 1AOJ A; 4J9I A; 1UGV A; 2LJ0 A; 1BU1 A; 1PRM C; 2DM1 A; 1NM7 A; 3PE0 A; 2HBW A; 1H3H A; 1RUW A; 3R6N A; 2DRM A; 2D0N A; 2GQI A; 1K76 A; 4DEY A; 1FYN A; 3SEM A; 2DL3 A; 2VKN A; 1VA7 A; 2RPN A; 1WI7 A; 1YCS B; 2C0T A; 1BK2 A; 2K7A A; 2ROT A; 2RQU A; 4RTY A; 4CC2 A; 3I5R A; 3EG2 A; 1CSK A; 1SRL A; 2LNH B; 3VRZ A; 1JEG A; 3EHR A; 2J06 A; 1IO6 A; 3M0T A; 2DIL A; 1AZE A; 4LUD A; 1PNJ A; 4RTW A; 2KRM A; 1OV3 A; 2LX7 A; 2KXC A; 2KEA A; 1YWP A; 2BZX A; 1AEY A; 1MV3 A; 2W0Z A; 2DBM A; 4AFS C; 1QLY A; 4JPB W; 1AWO A; 1NEG A; 3I5S A; 1YNZ A; 4D8K A; 2D8J A; 3O5Z A; 1UDL A; 1FMK A; 4Z8A A; 2LP5 A; 2J7I A; 3PVQ A; 2HCK A; 2JS2 A; 1ZSG A; 2GNC A; 1T0H A; 2EYY A; 1U06 A; 2DA9 A; 1W1F A; 5FW9 A; 2DRK A; 4AFQ C; 2EKH A; 2CT4 A; 3M0U A; 2F2W A; 2AKK A; 1GCP A; 1RLP C; 2K79 A; 3QWY A; 3VS1 A; 1G2B A; 4AG1 C; 4J9H A; 2VVK A; 4RTX A; 2PNI A; 2DYB A; 2BTT A; 2RQV A; 1ZX6 A; 2FPF A; 4AFU C; 1WXU A; 1GRI A; 4HVU A; 2KYM A; 1LCK A; 2RMO A; 1Y57 A; 4J9C A; 1X69 A; 2M51 A; 2O31 A; 3EG0 A; 2F2V A; 4HXJ A; 1WIE A; 4OML A; 1GCQ A; 1UJ0 A; 2J6F A; 2DVJ A; 1SSH A; 2EVR A; 4IIO A; 1QWF A; 1Z9Q A; 2K9G A; 2MCN A; 2CDT A; 1QCF A; 2FRW A; 4OMO A; 4Z89 A; 3JV3 A; 1WX6 A; 5IXB A; 2D1X A; 5IHK A; 1VYV A; 5HCK A; 2HEQ A; 1AD5 A; 2YT6 A; 4RTZ A; 2KNB B; 4J9E A; 1WLP B; 2KXD A; 3VS4 A; 2DBK A; 4OMM A; 3I35 A; 2JMA A; 2ESW A; 2PTK A; 1XOV A; 1AWX A; 3UA6 A; 1UG1 A; 3VS7 A; 1W6X A; 4WCI A; 1JXM A; 1WXT A; 2FO0 A; 1GBR A; 1VYT A; 3UF4 A; 2YUQ A; 4F16 A; 1TUC A; 2SEM A; 1AWJ A; 1I0C A; 2A37 A; 3M0S A; 3H41 A; 1B07 A; 3REA B; 5ECA A; 1PKT A; 4A63 B; 1UHF A; 2CSI A; 1GCQ C; 2GBQ A; 2L2P A; 2LQN A; 2F2X A; 1GFC A; 2JS0 A; 5IHI A; 3RNJ A; 3NMZ C; 2EQI A; 2JTE A; 1T3S A; 1RI9 A; 2O9S A; 4JZ4 A; 1M30 A; 2JM8 A; 1YP5 A; 2AK5 A; 1B3Q A; 1ZLM A; 5FWB A; 1X43 A; 3H0H A; 5IHN A; 4LE9 A; 1NYG A; 2OI3 A; 1M3B A; 2KE9 A; 2O2O A; 1PKS A; 2H8H A; 2RF0 A; 3M0P A; 1NG2 A; 4K11 A; 2LCS A; 4HVV A; 1E6H A; 1QKX A; 2DL7 A; 1U3O A; 1X2Q A; 1OPK A; 1TG0 A; 2V1Q A; 3KFV A; 4DEX A; 3VS6 A; 2KR3 A; 2BZ8 A; 1GBQ A; 2SRC A; 2GGR A; 2YUO A; 4LNP A; 1PHT A; 1CKA A; 3TSZ A; 3UAT A; 2G6F X; 4GBQ A; 1X27 A; 1NYF A; 2LJ1 A; 2RNA A; 2CUD A; 4LN2 A; 2FPE A; 2L3Q A; 2A36 A; 2EPD A; 3H0F A; 4OMP A; 1V1C A; 4OMQ A; 1W70 A; 1QKW A; 2P4R A; 5I11 A; 1M3C A; 1JXO A; 4D8D A; 1H92 A; 2DL5 A; 2J6O A; 2C0I A; 2DF6 A; 2CT3 A; 1I07 A; 4R0K A; 2O88 A; 2IIM A; 2W10 A; 2DNU A; 2ABL A; 1T3L A; 4X1V A; 2CUB A; 2CH4 A; 4F17 A; 3NGP A; 4JZ3 A; 2YSQ A; 2RQT A; 2LZ6 B; 1BBZ A; 2QDL A; 2MOX A; 1YN8 A; 1GFD A; 2C0O A; 2DJQ A; 2LQW A; 2O9V A; 2AKL A; 1ZUY A; 3VS5 A; 2YUN A; 1UEC A; 1ZUU A; 4HVW A; 4RUG A; 1KJW A; 2ED0 A; 2NUZ A; 3IQL A; 1K4U S; 2CRE A; 2JXB A; 2RQR A; 1MUZ A; 2KBT A; 3A98 A; 3UA7 A; 1KFZ A; 2V1R A; 2AZS A; 1G83 A; 2DX1 A; 2K3B A; 2BZY A; 1I1J A; 1EFN A; 2GTJ A; 1K9A A; 2X3X D; 3EG1 A; 2EGE A; 1E6G A; 2KRO A; 3U23 A; 4ESR A; 5L23 A; 3GBQ A; 4AFZ C; 2J6K A; 3TSW A; 4E6R A; 2DL8 A; 1M8M A; 2CSQ A; 1K0X A; 4ZNX A; 2DL4 A; 4J9B A; 4JJD A; 1ABQ A; 2EYZ A; 4RTT A; 5GJW B; 1AVZ C; 2CH4 W; 2D8H A; 1SHG A; 3QWX X; 2EYX A; 2VWF A; 1OPL A; 1U5S A; 1AZG B; 2EGA A; 1ZBJ A; 2K6D A; 1ABO A; 5FWC A; 1K0S A; 1N5Z A; 2FG0 A; 4M4Z A; 1WYX A; 2OAW A; 2K2M A; 2J05 A; 4RTV A; 1UE9 A; 3LH5 A; 3FJ5 A; 4EIK A; 4KRT A; 1WDX A; #chains in the Genus database with same CATH topology 4AMC A; 1QCN A; 3FEO A; 1B34 A; 4J9F A; 1GL5 A; 1BIB A; 3M0Q A; 1PCX A; 1O9S A; 2E5K A; 1HYO A; 3FB9 A; 2XDD A; 4DBF A; 4R55 A; 2KRN A; 1TSF A; 1UHC A; 2QXF A; 4M78 F; 1X6B A; 1BB9 A; 4R56 A; 1IRX A; 2RH2 A; 3RES A; 1YJW A; 4KH1 B; 1ZUK A; 3OYL A; 1S1N A; 5IXF A; 4M7D F; 3VU3 C; 2DMO A; 3BE3 A; 3CCS Q; 2CZ6 B; 3CME T; 4FT4 A; 2EW3 A; 1J3T A; 1G3S A; 3ULR B; 3HPW A; 2LT1 A; 2OJ2 A; 2LJ3 A; 1QWE A; 1PWT A; 1UB4 A; 4NL3 A; 1CKB A; 2MI6 A; 1VQ6 T; 1JO8 A; 4HT9 A; 2LVM A; 2VUB A; 2JJ9 A; 2FZC B; 4FYX B; 1M1K U; 1A0N B; 4J7F A; 1VQL Q; 1X01 A; 1HXD A; 5HY6 A; 2CP2 A; 4JJN K; 4J9D A; 3CMA A; 1JU5 C; 2R5A A; 4PJO C; 2ZPF B; 2KMT A; 3JB9 F; 3X26 B; 2YLB A; 2FHD A; 2DZ9 A; 3OYN A; 1FMW A; 5GJV B; 4OB3 B; 1Q81 R; 1NJI C; 1RAB B; 2FPD A; 3MJX A; 4JS5 A; 4LUE A; 5GAN 6; 2EAY A; 2C06 A; 4LDU A; 1K1Z A; 3TVT A; 4XU0 A; 3I9Q A; 2VAS A; 1C1A A; 1LNX A; 2DJZ A; 2A28 A; 2E70 A; 1SEM A; 2QK0 A; 4PJO E; 2E10 A; 1VQ7 Q; 3VRY A; 2KK4 A; 1VIF A; 2DEQ A; 3ZL7 C; 4EDU A; 2ZAE A; 1JQQ A; 1NEB A; 2RJC A; 1SRM A; 3BFM A; 4EMK C; 5EC7 A; 2HKQ B; 2QG9 B; 4NOY A; 2QYZ A; 2LC4 A; 1M90 C; 1WZO A; 1K9M R; 4F7U F; 1ZSZ B; 3QDF A; 2YUP A; 2KVQ G; 3EHQ A; 1I5O B; 3MPU B; 1D0Y A; 4J9I A; 4CI0 C; 2BE9 B; 3HRU A; 1RAH B; 2HBW A; 1H3H A; 3R6N A; 3CMA T; 4PNO A; 4OGE A; 5M9O A; 2PQW A; 3SEM A; 2VKN A; 1MND A; 1YIJ Q; 1VA7 A; 1ZHI A; 4C0G A; 2C0T A; 1BK2 A; 4M78 A; 1FMV A; 2VXF A; 2R5M A; 3RIR A; 4C8Q G; 2LNH B; 1TTH B; 4M7D A; 3JCM P; 3X28 B; 1Q7Y U; 3MP6 A; 4M7A G; 1AZE A; 2K5F A; 1G3W A; 4LUD A; 4LDV A; 4RTW A; 3G71 A; 1OV3 A; 2CP0 A; 2BZX A; 3ME9 A; 2W0Z A; 2WSF E; 3PNW C; 1QLY A; 3QO3 A; 1QVF A; 2D8J A; 8AT1 B; 1WJR A; 1VQO A; 3HRT A; 3V8J A; 2LP5 A; 1Q82 C; 1LOJ A; 2FVU A; 3E1S A; 2MYS A; 3LLR A; 2ZPH B; 3J7A F; 2EKH A; 4PFO A; 2PU9 B; 4MMK A; 5CVI A; 1GCP A; 4Z02 A; 4E7Z A; 4IUV A; 3QSU A; 1QP3 A; 5L8R E; 4M77 E; 4AFU C; 5GAN 5; 1JRI A; 2XDP A; 5KH6 A; 4OGC A; 2CP5 A; 2JNG A; 4J9C A; 5GAN 4; 3G71 T; 5KCO A; 5GMK l; 2J6F A; 2DVJ A; 3PIP A; 1QWF A; 4EMH A; 2F5K A; 2YLC A; 4KGX B; 1M1F A; 4F7U A; 1VQM Q; 2E6Z A; 4A54 A; 4C0D C; 3JV3 A; 5IHK A; 1HK9 A; 3M5A A; 1VQO T; 1WHL A; 4E7J A; 2YT6 A; 5GAN g; 3F70 A; 2KXD A; 1K8A U; 2DBK A; 1W2B A; 4C8Q B; 4KUL A; 3HFO A; 1XOV A; 3V8L A; 4RG8 A; 4M78 D; 3UA6 A; 3VS7 A; 4M7A B; 1JXM A; 3UDC A; 2DFU A; 5C0M A; 2HQE A; 3URG A; 1VYT A; 3X25 B; 3UF4 A; 2YUQ A; 3QJ6 A; 1K73 C; 4M7D D; 1AWJ A; 2CKK A; 3JCM e; 3VKI A; 3CCR T; 3ZEH A; 2X9H A; 1UHF A; 3LGL A; 4C5I A; 1UGS B; 2L2P A; 1Y96 B; 5D6Y A; 4RMO A; 1QVF S; 1GFC A; 3RNJ A; 5IHI A; 2DXU A; 2EQI A; 4DA4 A; 2JTE A; 1T3S A; 4C0Z A; 4A4F A; 1TS9 A; 4JRI A; 1ZLM A; 3JCM f; 1X43 A; 3H0H A; 2E5Q A; 4C92 B; 1M3B A; 2CP6 A; 1D3B A; 1PKS A; 2H8H A; 5LJ5 e; 2RF0 A; 3CCM T; 3ZBD A; 4HVV A; 3UWN A; 3JB9 D; 4HCZ A; 1NJI R; 3EFS A; 1OPK A; 4KBM B; 2EFI A; 3CME Q; 1PD1 A; 2GGR A; 1CKA A; 3TSZ A; 1VQP A; 3QG1 A; 1X27 A; 5LJ5 f; 4LN2 A; 1VQ6 Q; 1KHI A; 2A36 A; 2EPD A; 5CKH A; 3CCU A; 1XTD A; 2FZG B; 2P4R A; 4FT2 A; 1YJN T; 1ZQ1 A; 1M3C A; 1JXO A; 4D8D A; 1OYX A; 2DL5 A; 5I2M A; 4XTU A; 1FXX A; 1KG1 A; 4OB2 B; 4OP0 A; 4R0K A; 2O88 A; 1M90 R; 4A4H A; 4X1V A; 4F17 A; 2QAS A; 2PUO B; 2EQK A; 2E3H A; 3DB3 A; 1RAF B; 2AKL A; 1YIJ A; 3PMI A; 2YUN A; 2HL3 A; 2NUZ A; 3IQL A; 3EH2 A; 2FB7 A; 4ZTJ A; 1X6O A; 2BE7 D; 1W2B S; 2RI3 A; 3SWN B; 4E7I A; 3A98 A; 2E1H A; 3V7S A; 1JJ2 A; 2QA4 A; 4OF1 A; 2DX1 A; 2K3B A; 1LVK A; 3L2U A; 1S72 Q; 3M56 A; 2VXE A; 3R6O A; 4D6W A; 3BY7 A; 5IN1 A; 1VQP T; 1EFN A; 2GTJ A; 1D0Z A; 2V8J A; 4OVA A; 1Q86 U; 1OQK A; 1Q81 U; 4ESR A; 2KRO A; 3U23 A; 3JB9 H; 3MEU A; 2J6K A; 3CCU T; 4C92 C; 3OYC A; 4L5G A; 5GAN h; 2KQW A; 1I4K 1; 2CSQ A; 2FL7 A; 3HKS A; 1BYM A; 1QP2 A; 4J9B A; 5GAM g; 4DOW A; 3CMA Q; 1AVZ C; 5LL6 S; 2D8H A; 2V8K A; 2VWF A; 5FU7 B; 3A8H B; 1U5S A; 5D7U A; 1ZBJ A; 4N0A C; 2X4Y A; 1N5Z A; 2FG0 A; 3WVE B; 4M4Z A; 1WYX A; 2K2M A; 1UE9 A; 4B6M A; 5LJ5 j; 4J7I A; 4PJO G; 1AHJ B; 2Y4Y A; 3OQ5 A; 2L3R A; 2MPX C; 5D6W A; 1ACM B; 4BAC A; 2A7Y A; 3JB9 J; 1WHH A; 3KXT A; 2QA4 T; 2A08 A; 1T0J A; 4OMN A; 1D1C A; 1M3A A; 2RQW A; 2LMJ A; 1QQJ A; 4NS5 A; 5I2S A; 5IAY A; 4ZN3 A; 4JJC A; 3RKX A; 1ZSZ A; 3A1P A; 5GAN d; 1OZ2 A; 1P92 A; 1X6G A; 3EG9 B; 1KC8 C; 2L3S A; 4B9W A; 1KQS A; 2HAX A; 2YRD A; 1N8R C; 5LJ3 g; 4LDW A; 4BUG A; 4A4E A; 2K5L A; 3JCM J; 2KY9 A; 2DTI A; 2X4W A; 3C0C A; 2KAF A; 1Y07 A; 1NPR A; 2FEI A; 3SWN C; 5GAO q; 1KSW A; 2ZPG B; 4FYY B; 1PG5 B; 4C8Q F; 3VS2 A; 2A0F B; 2DXC A; 1OI1 A; 5EG2 A; 4M7A F; 2CZ0 B; 1V29 B; 3A8G B; 4J83 A; 4F14 A; 2B86 A; 1NZ9 A; 4XTX A; 2O4X A; 2NUP B; 4JJB A; 1EX4 A; 5GAN 8; 1YWO A; 4CC7 A; 1JJ2 S; 3OYD A; 5AT1 B; 4MZP A; 3L2W A; 3OS2 A; 4GLK A; 1MGQ A; 1BI1 A; 1G8X A; 3OYM A; 1WXB A; 1K73 R; 1HD3 A; 5C6S A; 2EGC A; 2RI2 A; 5GAO p; 5FU7 C; 2KRS A; 1TOV A; 2E41 A; 2JMC A; 4JRK A; 2PVD B; 1VQO Q; 4J6X A; 1I8F A; 3PT9 A; 3E9G A; 3QZ5 B; 1VOM A; 1HJD A; 3RR6 A; 3M4G A; 1BIA A; 1M1G A; 2EYW A; 1MMG A; 3C95 A; 2I0N A; 5IT9 E; 4PJO B; 5HK3 A; 2GF7 A; 1WFW A; 1UUE A; 3VS3 A; 3CME A; 2XU8 A; 2KYB A; 2M9U A; 3JCM Q; 1U1S A; 3CCR Q; 4Z88 A; 1MMA A; 5FRN A; 1UGV A; 2X35 A; 4FYV B; 2GQI A; 3CC4 A; 4DEY A; 4C5H A; 1TWB A; 4BD3 A; 4PJM A; 2AHJ B; 1KQS S; 1YCS B; 4XAX B; 3OA6 A; 4B9X A; 2K7A A; 2EJF A; 4RTY A; 2ZPB B; 1KQ2 A; 3EG2 A; 2P4T A; 1SRL A; 3CCM Q; 2V26 A; 4A4G A; 4EMK B; 1PD0 A; 2J06 A; 2DO3 A; 1R0C B; 2XID A; 5KYU B; 3FRN A; 2BUD A; 3P8D A; 3V7C A; 1BCM A; 4EMG A; 4C8Q A; 2CS7 A; 3MP1 A; 1AEY A; 4E7H A; 4M7A A; 5HKC A; 3UT1 A; 1NEG A; 3OW2 P; 3I5S A; 1YNZ A; 4HCB A; 5GAM d; 4N4I A; 1QW1 A; 4BY6 C; 1S72 A; 5LJ3 h; 1YJN Q; 2BIV A; 2J7I A; 4UC4 A; 2HD0 A; 2MAM A; 4M75 A; 4BI4 A; 3EGD B; 1QVG P; 2RJF A; 1V76 A; 2EYY A; 3C12 A; 3L1A A; 1NJI U; 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