The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
5
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sequence length |
80
|
structure length |
80
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Chain Sequence |
GSSGSSGATSYMTCSAYQKVQDSEISFPAGVEVQVLEKQESGWWYVRFGELEGWAPSHYLVLDENEQPDPSGKESGPSSG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Signaling protein
|
| molecule keywords |
SH3 and PX domain-containing protein 2A
|
| publication title |
Solution structures of the SH3 domain of human KIAA0418
rcsb |
| source organism |
Homo sapiens
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| total genus |
5
|
| structure length |
80
|
| sequence length |
80
|
| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2007-03-23 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00018 | SH3_1 | SH3 domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1PNJ A; 2KXC A; 4AFQ C; 2KE9 A; 2RNA A; 2JS0 A; 4CC7 A; 3H0I A; 1UFF A; 4J9C A; 1UEC A; 1MV3 A; 1UHF A; 4AFU C; 3QWX X; 2FRY A; 3NMZ C; 1PRL C; 4IIM A; 3TSW A; 2C0T A; 4HVW A; 1I0C A; 1PKS A; 2RQR A; 2DL3 A; 4LUE A; 1NM7 A; 3VS5 A; 1AOJ A; 3TSZ A; 1H8K A; 1ARK A; 2V1R A; 2A28 A; 2MIO A; 3EG2 A; 2RQT A; 1ZLM A; 3PE0 A; 4CC2 A; 2RN8 A; 2ENM A; 3VS7 A; 3I35 A; 3VS4 A; 3REB B; 2DVJ A; 2VVK A; 1X27 A; 1UTI A; 1WLP B; 2YUP A; 1QLY A; 1S1N A; 2VKN A; 1PKT A; 2K9G A; 1HJD A; 1CKB A; 1NYG A; 2G6F X; 2YUN A; 1AZE A; 2K7A A; 2JS2 A; 3RNJ A; 2CSQ A; 5EC7 A; 1WA7 A; 2KRM A; 2H8H A; 2YUQ A; 4J9F A; 2DNU A; 2W0Z A; 4DEX A; 1SEM A; 5ECA A; 1JO8 A; 2GGR A; 1WFW A; 4LE9 A; 4QT7 A; 1UG1 A; 3UA6 A; 1ABO A; 4M4Z A; 2KGT A; 5I11 A; 1KSW A; 1VYV A; 1HSQ A; 2J7I A; 1ZBJ A; 4J9H A; 1ZUU A; 1UHC A; 4RTX A; 1OEB A; 1AZG B; 2DL8 A; 2FPD A; 2F2W A; 1FMK A; 2EYX A; 2LQN A; 4OMO A; 2JT4 A; 2EGA A; 2DRM A; 1WDX A; 4F14 A; 4Y92 A; 2PZ1 A; 3O5Z A; 2CRE A; 2CH4 W; 3NPF A; 1ZUK A; 1OPK A; 2K79 A; 2RQV A; 4KRT A; 2B86 A; 1EFN A; 3M0R A; 1AWX A; 1T3L A; 1K1Z A; 3M0S A; 1NEB A; 4OMN A; 1GRI A; 1I07 A; 1J3T A; 2JMA A; 2FPF A; 2O2O A; 2PNI A; 1ZSG A; 1GBR A; 2BZ8 A; 2ED0 A; 4JZ3 A; 5IXB A; 1B07 A; 2F2X A; 1X6G A; 2JMC A; 2EYZ A; 2O31 A; 4CC3 A; 1QCF A; 4D8K A; 2J06 A; 2OI3 A; 3EG3 A; 1IO6 A; 1JXM A; 2I0N A; 2LP5 A; 1M3B A; 2KRN A; 2KR3 A; 4RTZ A; 1UGV A; 3H0H A; 4EIK A; 1GFC A; 1GFD A; 4R0K A; 2ROL A; 3I5R A; 3NHN A; 4J9D A; 3QWY A; 4OMP A; 1JQQ A; 3NGP A; 4GBQ A; 1SHG A; 4RTT A; 2LCS A; 1SRM A; 2DL5 A; 2A37 A; 5FWC A; 1QWE A; 3M0Q A; 4DEY A; 2C0I A; 2RQW A; 3RBB B; 1VYU A; 2CT4 A; 1QWF A; 3EG0 A; 2E5K A; 4OMM A; 1NG2 A; 1W70 A; 2BZY A; 2JM9 A; 2K6D A; 1T0J A; 1Z9Z A; 1HD3 A; 1AEY A; 2LQW A; 1GCP A; 3VS0 A; 1FYN A; 4AG1 C; 1Y57 A; 2DJQ A; 5HCK A; 2YDL A; 1UUE A; 1TG0 A; 2KNB B; 3GBQ A; 4ZNX A; 1I1J A; 4RTY A; 2GNC A; 3SHW A; 3VS2 A; 4OML A; 2AZS A; 1YP5 A; 2J05 A; 3VS6 A; 1YCS B; 1B3Q A; 1GBQ A; 2ABL A; 4WCI A; 4JJD A; 1X2K A; 4F17 A; 1AWW A; 2J6K A; 4FSS A; 2DIL A; 2OAW A; 1LCK A; 5FW9 A; 2JM8 A; 2EPD A; 3H41 A; 3I9Q A; 4Z88 A; 1U3O A; 2O88 A; 2JXB A; 3M0T A; 4A63 B; 1H3H A; 4AFZ C; 2D0N A; 1U06 A; 1MV0 B; 3UF4 A; 2DL4 A; 2BZX A; 1CSK A; 2KT8 A; 2L2P A; 2DF6 A; 2RPN A; 3ULR B; 4CC4 B; 2EKH A; 1RLP C; 1U5S A; 1RUW A; 2L0A A; 1WXT A; 5IHN A; 1ZUY A; 2A36 A; 3VRZ A; 5IH2 A; 1KFZ A; 1YN8 A; 1ZX6 A; 2DMO A; 1UJY A; 4J9E A; 2OJ2 A; 1K0S A; 4LN2 A; 3I5S A; 3PVQ A; 2CDT A; 1CKA A; 2ED1 A; 3SEM A; 2KYM A; 2LMJ A; 1M3A A; 2BTT A; 1WXU A; 1K9A A; 2X3W D; 1AD5 A; 2AKL A; 2KBT A; 1W6X A; 3REA B; 2EGC A; 1TUC A; 1TUD A; 1GL5 A; 1RI9 A; 2D1X A; 5GJV B; 1K4U S; 2PTK A; 2FPE A; 2AZV A; 2LNH B; 4GLM A; 1M27 C; 1YWP A; 5IHK A; 1V1C A; 1G2B A; 2ECZ A; 1BB9 A; 4F16 A; 1K76 A; 2DX1 A; 1WI7 A; 2QDL A; 2KYB A; 2KT1 A; 2SEM A; 2DRK A; 1X2Q A; 4RUG A; 2J6O A; 4J9G A; 2DLP A; 2MCN A; 1UJ0 A; 1E7O A; 1Z9Q A; 2DYB A; 3EG1 A; 5I22 A; 3TVT A; 5IXF A; 1VYT A; 3VRY A; 2XMF A; 2CH4 A; 1MUZ A; 2LX7 A; 2FG0 A; 1Y0M A; 3KFV A; 3UA7 A; 2KRS A; 4Z8A A; 2HDA A; 4Z89 A; 1NLP C; 2LZ6 B; 2V1Q A; 2LJ0 A; 2M51 A; 2K3B A; 5IHI A; 3IQL A; 2M0Y A; 3M0P A; 5GJW B; 4RTW A; 2ROT A; 2FEI A; 4HCK A; 1SSH A; 1XOV A; 2DA9 A; 1X69 A; 1YNZ A; 4J9I A; 1NEG A; 2L3P A; 2YT6 A; 2ESW A; 2EYY A; 1GCQ C; 2SRC A; 2DBM A; 1M8M A; 1K0X A; 4JJC A; 1OOT A; 2DM1 A; 4LNP A; 4AG2 C; 1PHT A; 1QKW A; 4ESR A; 1UE9 A; 1G83 A; 2K2M A; 1WX6 A; 1WYX A; 2KEA A; 1VA7 A; 4JZ4 A; 3CQT A; 3H0F A; 2AK5 A; 2HEQ A; 2EW3 A; 1M3C A; 2RMO A; 4JPB W; 1OPL A; 2EYW A; 1RLQ C; 3VS1 A; 2FRW A; 2LJ1 A; 1NYF A; 2NWM A; 3PVL A; 2GQI A; 2GTJ A; 2W10 A; 2LJ3 A; 3VS3 A; 4E6R A; 2JW4 A; 4D8D A; 3M0U A; 4IIO A; 2EGE A; 1SRL A; 1X6B A; 5L23 A; 1A0N B; 4AFS C; 2KXD A; 1T3S A; 1W1F A; 1M30 A; 2VWF A; 1E6H A; 1X43 A; 3EHR A; 2CUB A; 1SPK A; 4OMQ A; 2A08 A; 1PRM C; 2MOX A; 2RQU A; 3C0C A; 1JXO A; 1BK2 A; 2O9S A; 1T0H A; 2C0O A; 4K11 A; 3EGU A; 5FWB A; 4ORZ A; 2DE0 X; 3U23 A; 1KIK A; 2DBK A; 2CUD A; 2D8H A; 1SHF A; 2GBQ A; 2HCK A; 3A98 A; 4LUD A; 2DL7 A; 1JU5 C; 1QKX A; 2GTO A; 2L3Q A; 2P4R A; 2JTE A; 1WIE A; 2D8J A; 4JJB A; 4HVU A; 1PWT A; 1KJW A; 4RTU A; 1WXB A; 1JEG A; 3ZL7 C; 1UDL A; 4X1V A; 1ABQ A; 1N5Z A; 4HXJ A; 3EHQ A; 2YSQ A; 2X3X D; 2CSI A; 2FO0 A; 2J6F A; 2EVR A; 3FJ5 A; 4RTV A; 4J9B A; 2NUZ A; 3JV3 A; 2AKK A; 2EQI A; 2O9V A; 1BU1 A; 1E6G A; 2HSP A; 1AVZ C; 1BBZ A; 1OV3 A; 3R6N A; 2YUO A; 2HBW A; 2CT3 A; 3LH5 A; 1YWO A; 3UAT A; 2KRO A; 2L3S A; 2IIM A; 1AWO A; 2F2V A; 1GCQ A; 1NLO C; 1AWJ A; 4HVV A; 2RF0 A; 3THK A; 1H92 A; 2EBP A; #chains in the Genus database with same CATH topology 2DXU A; 4AFQ C; 2RNA A; 2JS0 A; 2DEQ A; 4J6Y A; 3CCR T; 1NBE B; 1UEC A; 4ME7 A; 2DTO A; 4IIM A; 4XK8 E; 4RCB A; 1PKS A; 4LUE A; 2DL3 A; 2RD1 A; 1KQS A; 1RAA B; 2HSE B; 3JB9 G; 1BYM A; 2ZPH B; 5LJ3 j; 4X34 A; 3EG9 A; 1WHK A; 1JB0 E; 4CC2 A; 3L2Z A; 2D9T A; 2ENM A; 5LJ3 d; 3VS7 A; 4GY5 A; 2ZPE B; 3VS4 A; 3ER0 A; 2CP2 A; 3M54 A; 2OAU A; 3X24 B; 1QLY A; 1W2B S; 4EMG A; 4EMK A; 3SWN B; 4ZGE B; 5A0G A; 5GMK i; 4QVD A; 5HKC A; 2K9G A; 3BW1 A; 3QSU A; 1YHQ T; 2G6F X; 1LVK A; 2DIQ A; 2JS2 A; 1D3B A; 1WA7 A; 2KRM A; 4IKF A; 1S72 Q; 5FLX E; 3CME Q; 2IG0 A; 1K9M R; 1SEM A; 1JO8 A; 1WFW A; 4IUU A; 1S72 A; 1N9R A; 2QGG A; 2QAS A; 2L5Q A; 2DZ9 A; 3LLR A; 4QT7 A; 3CME A; 1UG1 A; 3UA6 A; 3CC7 Q; 4NL2 A; 1KSW A; 4PJO G; 5I11 A; 1VYV A; 3CXC S; 3A5Z B; 2E10 A; 2K4Y A; 4RTX A; 1V29 B; 2FPD A; 1FMK A; 3A8M B; 2EYX A; 3CC7 A; 3J7A F; 4HCC A; 3M56 A; 3MKD A; 3VV0 A; 3CCE Q; 2QA4 Q; 3E2U A; 3CCU T; 4F14 A; 3M4Y A; 4J83 A; 4FT4 A; 3CCE A; 1YJ9 T; 3NPF A; 4M7A E; 2QA4 A; 5GMK h; 4KRT A; 2RQV A; 1WHM A; 1AWX A; 2OTL Q; 3M0S A; 1NEB A; 5LJ3 f; 1J3T A; 2ZPF B; 5KCO A; 4L6V 5; 4JZ3 A; 1B07 A; 4RCC A; 3RKY A; 3OSS C; 2OTL A; 2F2X A; 1Q7Y U; 3HL8 A; 4M7D A; 3OQ5 A; 2K3Y A; 2JMC A; 2O31 A; 5KYW B; 1YIT Q; 2P84 A; 1NJI R; 2DZC A; 3EG3 A; 4M75 C; 1IO6 A; 1JXM A; 2I0N A; 3MEV A; 4O6J A; 3VYH B; 5LJ3 g; 2ZZD A; 1UGV A; 3H0H A; 1GFC A; 1PD1 A; 4J6W A; 1VQM Q; 4M78 F; 1IZ6 A; 3I5R A; 3NHN A; 4J9D A; 3HFN A; 2DO3 A; 1IXD A; 1D1C A; 3QPH A; 4JJN K; 2PQW A; 2LDM A; 3NGP A; 4GBQ A; 1R77 A; 1SHG A; 4QW2 A; 2CP3 A; 4XTY A; 1VQM A; 2F5T X; 2DEU A; 5L8R E; 4JRQ A; 3NTH A; 3RBB B; 1PCX A; 3EGX B; 3EG0 A; 2LT4 A; 2DAQ A; 2E5K A; 1R0C B; 4PJN A; 1PG5 B; 3CCL A; 1C1A A; 1W70 A; 3AHU A; 3ASK A; 2JM9 A; 2K6D A; 1Z9Z A; 1HD3 A; 4DBH A; 3L42 A; 1VQO Q; 2DJQ A; 4JRI A; 1UUE A; 1TG0 A; 4OB2 B; 5I2S A; 1U1T A; 1VQO A; 2GNC A; 3SHW A; 2GQV A; 4JLI A; 1TOV A; 2J05 A; 1YIJ Q; 1YCS B; 5GAO r; 3D7S B; 1GBQ A; 2ABL A; 1P92 A; 2RK2 A; 4BE0 A; 3EH1 A; 4JRK A; 2E6N A; 3TQ7 P; 3X20 B; 1LCK A; 3E9G A; 2JM8 A; 3MEU A; 3FDR A; 4QQG A; 2MWP A; 2YXY A; 1WNL A; 1K73 R; 2JXB A; 5LL6 S; 2DIG A; 4A63 B; 2LQK A; 1JJ2 P; 4AFZ C; 5CKD A; 1MNE A; 1MV0 B; 2HD0 A; 2KT8 A; 2X4X A; 5GMK m; 1YCY A; 2L3R A; 1RAG B; 2DF6 A; 2XDB A; 4CC4 B; 1U5S A; 2L0A A; 1MMA A; 4F7U E; 4OVA A; 3C95 A; 1OUL A; 2A36 A; 1WHH A; 2KY9 A; 2QGF B; 1MHN A; 2X51 A; 1WGS A; 1ZX6 A; 5IH2 A; 1KFZ A; 4OGC A; 2RI2 A; 2FL7 A; 1K0S A; 3I5S A; 3PVQ A; 1M1K U; 3T9N A; 3MO8 A; 3J80 E; 4PJL A; 4XU0 A; 2BTT A; 2AKL A; 3OYA A; 3PFS A; 1RI9 A; 5GAN 3; 3HRT A; 9ATC B; 4R56 A; 3CCR Q; 5GAN d; 2M1H A; 3VJP A; 2WSF E; 2DPP B; 2PTK A; 3VUZ A; 2R5A A; 1V76 A; 1W4S A; 4GLM A; 2CP7 A; 4M7A G; 5IHK A; 3G4S Q; 3CCR A; 1OZ3 A; 4E7J A; 3LWH A; 1K76 A; 1FXX A; 2KT1 A; 2SEM A; 2XKO C; 3G4S A; 5DLQ E; 3SFM A; 3JCM V; 3CC2 Q; 2J6O A; 4J9G A; 4PL6 A; 2EQJ A; 1VQL T; 2DKG A; 2MCN A; 1WJR A; 5KYX A; 2XD0 A; 5DLO A; 2P0K A; 3EFO B; 3CC2 A; 1EIF A; 1MUZ A; 2EAY A; 2VXE A; 2KRS A; 3VKI A; 4C8Q A; 1RAF B; 4Z89 A; 2QEX T; 4PJO B; 2LJ0 A; 1Q82 C; 2K3B A; 1N9S A; 4N4G A; 3M0P A; 1KD1 U; 2QG9 B; 2A3L A; 2ROT A; 1SSH A; 1XQH A; 2HMA A; 4HA8 A; 4R55 A; 3OW2 A; 2XU8 A; 4II1 A; 2HQX A; 5KE2 A; 4KUD K; 4FM4 B; 1KQS S; 2SRC A; 2DBM A; 1M8M A; 2LRQ A; 4KH0 B; 4OB1 B; 5CVI A; 1TXQ A; 2DM1 A; 4ESR A; 1UE9 A; 2K3X A; 3OS1 A; 3GF5 A; 1WYX A; 3CCU Q; 3FEO A; 4XQ3 A; 5GAN f; 3MET A; 2XHC A; 2K5I A; 2ZCF B; 3H8Z A; 2EYW A; 3CCU A; 2NWM A; 3PVL A; 4M7D F; 4BUG A; 3BDU A; 1TS9 A; 3VS3 A; 4PJO C; 2VV5 A; 5GAN g; 1XTD A; 1FMV A; 2JW4 A; 3TCJ A; 2NUP A; 3NTK A; 5L23 A; 2KXD A; 3QBY A; 1O9S A; 2BUD A; 2OX7 A; 4E7K A; 2CUB A; 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3CCL T; 4M7A B; 1EZZ B; 5D6X A; 3F70 A; 3J81 E; 3QYH B; 3WVE B; 2ZGW A; 1AZE A; 3RNJ A; 2CSQ A; 5EC7 A; 2H8H A; 1NE8 A; 2NUT B; 2V26 A; 4FSX A; 4DEX A; 1VQO T; 5FU7 B; 5CKB A; 1OU9 A; 5ECA A; 1BI0 A; 5LJ5 h; 2KMT A; 4OMF B; 1MND A; 2KGT A; 1AHJ B; 3PGG A; 2M0O A; 4C8Q F; 3SWN A; 1ZBJ A; 4D6W A; 1UB4 A; 1ZUU A; 4BDZ A; 1VQL Q; 2DL8 A; 2F2W A; 2EGA A; 4RG8 A; 5HY6 A; 1KD1 R; 4LDY A; 4E7I A; 2DRM A; 4CI0 C; 3JCM d; 4Y92 A; 4M7A C; 2QEX Q; 2CRE A; 2DTI A; 1VQ9 A; 1Q81 C; 3MHX A; 3M0R A; 3V7R A; 1Y71 A; 2QEX A; 2XID A; 2COW A; 4A4G A; 1NPP A; 2PVO B; 2BZ8 A; 3OYH A; 2FYK A; 3GNF B; 3P8H A; 5FU7 C; 5GAN h; 4NL3 A; 2ATC B; 1K73 U; 2QQB A; 2RJE A; 3ZFJ A; 2EYZ A; 3WVD B; 4JS5 A; 4CC3 A; 2R5M A; 2EIF A; 1FMW A; 1M3B A; 2KR3 A; 3CCQ A; 3OY9 A; 1TTH B; 1VQK A; 3EGD B; 2ROL A; 4C0D C; 3RMQ A; 2H3E B; 2JNG A; 2QTV A; 1Y96 B; 2L8D A; 4C92 E; 3OS2 A; 5FWC A; 2QDY B; 5GAN 8; 1VQ8 A; 3M0Q A; 4DEY A; 5A0L A; 2RQW A; 4ATO A; 3OSV A; 5KYW A; 5CR2 A; 4ZN3 A; 2QYZ A; 3G4S T; 4OMM A; 4QQ6 A; 4FU6 A; 4F7U B; 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