The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
14
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sequence length |
93
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structure length |
93
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Chain Sequence |
GSSGSSGYLKLVRIYTKPKGQLPDYTSPVVLPYSRTTVEDFCMKIHKNLIKEFKYALVWGLSVKHNPQKVGKDHTLEDEDVIQIVKKSGPSSG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Signaling protein
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| molecule keywords |
Developmentally-regulated GTP-binding protein 1
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| publication title |
Solution structures of the TGS domain of human developmentally-regulated GTP-binding protein 1
rcsb |
| source organism |
Homo sapiens
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| total genus |
14
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| structure length |
93
|
| sequence length |
93
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2007-03-23 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF02824 | TGS | TGS domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Alpha Beta | Roll | Ubiquitin-like (UB roll) | Ubiquitin-like (UB roll) |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2MJ3 A; 3AE3 B; 1NEK B; 2HTM E; 3AE6 B; 2Y5C A; 1JW9 D; 2L52 A; 2WDQ B; 1N5W A; 1KF6 B; 2W54 A; 3L4P A; 3NVW A; 1UWM A; 4JX1 C; 3FAH A; 2W3S A; 3DWM A; 4ZOH C; 1JWB D; 1XLO A; 1TKY A; 3AE8 B; 1JQ4 A; 1T3Q A; 1WXQ A; 2BT6 A; 1FXA A; 3AEF B; 3DWG C; 1OFF A; 1PFD A; 1YJI A; 3AM9 A; 3W5V B; 4YTM B; 1JRP A; 1SB3 C; 3ABV B; 1FM0 D; 1E6E B; 1L0V B; 1CZP A; 3W5U B; 3NRZ A; 1N63 A; 2WP9 B; 1WRI A; 5EE0 A; 1FO4 A; 3AH7 A; 2M19 A; 4N59 A; 1A70 A; 4C80 A; 2K5P A; 2WLB A; 1VDV A; 1AWD A; 2WU5 B; 1L6U A; 3VR8 B; 2ACZ B; 5G5H A; 1I7H A; 3SR6 A; 3AE9 B; 1TJE A; 2Q5W D; 3NS1 A; 1CJE A; 1V97 A; 1PUT A; 2DWQ A; 1RM6 C; 3AEC B; 4N58 A; 4HRS A; 1OQQ A; 3SFD B; 3B2G A; 1WYG A; 2MJE A; 1QF6 A; 2WDV B; 4P6V F; 1FIQ A; 1FXI A; 2WQY B; 3LB8 C; 1KRH A; 3P4S B; 1JWA D; 3VRB B; 1SIJ A; 4IDI A; 1N62 A; 3W9C B; 1ZUD 2; 1N60 A; 2EKI A; 1NVI D; 1E9M A; 1TKG A; 3ETR A; 3B9J A; 3P1M A; 3ZYY X; 4C7Y A; 3HVZ A; 1SF0 A; 1XLN A; 2JQR B; 1FFV A; 2KMM A; 4YXD B; 1QT9 A; 3AEB B; 3AE1 B; 2H89 B; 1N5X A; 4WWM A; 1QLB B; 4JWS C; 2DBY A; 1PDX A; 3CWI A; 2AX5 A; 2CJN A; 2BS3 B; 1FFU A; 2M56 B; 2JX5 A; 2N0S B; 2LEK A; 4N6E B; 3B2F A; 4FXC A; 2W55 A; 4HRO A; 5AUK A; 1XLQ A; 1XO3 A; 3AE5 B; 1YQ4 B; 5EE9 A; 3VRA B; 1QOF A; 4YTP B; 5C2T B; 1AYF A; 2H88 B; 3AE7 B; 1E7P B; 2BS2 B; 2PIA A; 5G5G A; 1E10 A; 1EWY C; 1VJK A; 2WU2 B; 1FMA D; 4ITK A; 1ZOY B; 2PKO A; 2WS3 B; 1R7S A; 2K22 A; 4US8 A; 1KFY B; 2W3R A; 1J7A A; 2BS4 B; 3AED B; 1TYG B; 3NVZ A; 1NI3 A; 1XLP A; 3AEA B; 1J7B A; 3VR9 B; 1OQR A; 2PVG C; 1B9R A; 1FRR A; 1GAQ B; 2K9X A; 4WQM A; 2PVO D; 3RPF C; 1QOG A; 4KX6 B; 2MH7 A; 5C3J B; 1QOA A; 3AMZ A; 1L5P A; 1FRD A; 3AE4 B; 1F0Z A; 5EE3 A; 1N61 A; 1NYR A; 3HUI A; 4YT0 B; 2G1E A; 5H92 C; 1DOY A; 3P4P B; 1RYJ A; 5GXG B; 4YSX B; 1TKE A; 3SFE B; 1VLB A; 1YQ3 B; 2E3T A; 2L83 A; 3AV8 A; 4JWU C; 3AB5 A; 3AN1 A; 1ROE A; 3HRD D; 1RFK A; 3AEE B; 3KWL A; 3P63 A; 4ZHO A; 1WGK A; 3LXF A; 2FBW B; 1DOI A; 1DOX A; 1YJJ A; 3AEG B; 1JAL A; 3BII D; 1ZXI A; 2CJO A; 3FC4 A; 5AUI A; 1IUE A; 4YSZ B; 2QJL A; 1GPX A; 1NYQ A; 1E0Z A; 2CU3 A; 3P4Q B; 1NEN B; 3EUB 2; 1L6V A; 3WCQ A; 1DGJ A; 1WWT A; 4YSY B; 5EE1 A; 2OHF A; 4LTU A; 2WDR B; 4USA A; 4C7Z A; 1QOB A; 3CIR B; 1V8C A; 3NVY A; 2KAJ A; 3P4R B; 1ZP0 B; 1J7C A; 2B76 B; 3AE2 B; 3PO0 A; 4US9 A; 2MJD A; 2QIE B; 4A9A A; 4ZHP A; 1JRO A; 5H8Y E; 4YTN B; 3NVV A; 1RWS A; 5MPO A; #chains in the Genus database with same CATH topology 3NUH B; 4K1R B; 4NQK E; 1UNS A; 2ZVN A; 1HXY D; 4LNI A; 2V3P A; 1BUI C; 3TJP A; 3N9Y C; 3DWG C; 3GP7 A; 3ZRF A; 2V1Y A; 3E56 A; 3MJW A; 1ZPS A; 2WLB A; 2K8H A; 1J19 A; 1AWD A; 2BB6 A; 2NR2 A; 4HWI B; 3N1X C; 2O2V B; 1WGY A; 4L23 A; 3W1S A; 1JWU D; 3GS2 A; 4ZRJ A; 2WDV B; 3KUD B; 3BY4 B; 1SIJ A; 3W9C B; 1TT5 B; 3ENE A; 5BYS A; 3P42 A; 2NBV B; 1WX7 A; 3A9J A; 5HKH A; 4KKI A; 4XZ4 A; 2JX5 A; 2XK5 A; 1IBX B; 4BAX A; 1F9J A; 4FXC A; 1P3Q U; 3TCA A; 1ET6 A; 1XLQ A; 4RM8 A; 2IND C; 2LHD A; 2H88 B; 3TEW A; 2K1F A; 1VJK A; 2KFK A; 1F52 A; 4P1C C; 2K22 A; 1YOV B; 2I1K A; 3NVZ A; 4WIP A; 1YX6 B; 3MTN B; 4YWG G; 4GN1 A; 1SE2 A; 1C78 A; 2J0J A; 4G11 A; 4QAY A; 3UF8 A; 3KUC B; 2LAS A; 5D7G A; 4PS7 A; 2FBW B; 1DOX A; 3SU8 X; 3KWV A; 2CHZ A; 1ZXI A; 5AZH A; 5IKC M; 4OW0 A; 2CU3 A; 3V05 A; 4HDQ A; 3U4E G; 2K0P A; 3RFZ B; 5FK9 C; 1ZGU B; 1EUV B; 4MSQ B; 4W9C A; 3I9V 1; 4O1N A; 2ZNV B; 4II2 B; 4NNJ B; 3TEX A; 2NTT A; 1PQS A; 2O6V B; 2UWQ A; 3L13 A; 1RRB A; 3HK0 A; 2J7Q B; 1TKY A; 1T3Q A; 2TSS A; 2BTE A; 3W5V B; 4JPS A; 3X0W A; 2JYT A; 2IPK D; 3MFG A; 2MHJ A; 5G5H A; 4XX5 A; 4NAM A; 5DPS A; 3UI3 A; 3APC A; 4DHZ B; 2FIF A; 1WMH A; 1ZKH A; 2VH2 A; 2H89 B; 2DBY A; 2NVU I; 4FJV B; 3CWI A; 4J3O D; 3PZD A; 2M56 B; 4PS3 A; 4GLS C; 2N9E B; 4L1B A; 2DYB A; 3HM6 X; 3ZNI D; 2O2V A; 1KFY B; 3DHH C; 2HJ1 A; 3AED B; 2LGS A; 5J18 A; 1WM2 A; 3UIP B; 2ZNV C; 1I4R A; 4MDK E; 2FUH B; 4K7U A; 1C3T A; 1HTQ A; 1QOA A; 2JVC A; 2MLB A; 1YX5 B; 5LLI A; 1UEL A; 4HLE A; 3AUL A; 2RGF A; 3KWL A; 5L95 C; 1WGK A; 2N9L A; 3OAW A; 3AEG B; 4WJP A; 1EF1 A; 3ZJU A; 3H9D A; 2KMC A; 4ANX A; 2AQ2 B; 2KTF A; 1HA5 A; 2AEH A; 2WHI A; 4GU2 A; 4CHK A; 4RF1 A; 3OJ4 B; 5BYR A; 3QK0 A; 3RYT A; 2L8J A; 3AE2 B; 3IT6 B; 1RAX A; 3ZVV A; 2HTM E; 1GB1 A; 3IAS 1; 4IM2 A; 1JCK B; 2KMA A; 3TUO A; 1JWB D; 2Z0E B; 3URY A; 3ZNZ B; 3PVL A; 1JRP A; 1FM0 D; 2PTL A; 2KN4 A; 3MC8 A; 5JH5 C; 3I57 A; 2WP9 B; 1WRI A; 2FID A; 5AZF A; 1FO4 A; 3AH7 A; 2M19 A; 2DAJ A; 2GBR A; 1L6U A; 3B0A A; 1SE4 A; 2JRI B; 4JE3 B; 3FKY A; 1FCC C; 2Q5W D; 4KIK B; 4HPP A; 4IW0 A; 2A4Z A; 1UGM A; 1QZE A; 2MBE A; 3CST A; 2FE8 A; 4HRS A; 4AWJ A; 1UWX A; 2AWT A; 3UGB B; 1FD6 A; 2IZV B; 3ETR A; 3RNB C; 2Y3A A; 3VUY A; 1WJN A; 2Z59 B; 1V6E A; 3UQA A; 1E7V A; 2M0X A; 2J42 A; 4XWT A; 1E8W A; 1HTO A; 3U8Z A; 3ZNH B; 3IXS A; 4RF0 A; 1QOF A; 3KYD D; 1TS4 A; 2BS2 B; 4HEA 1; 4LCD E; 3KVF B; 5D3I B; 3L0W B; 2INP E; 1NI3 A; 1VZ7 A; 1G6J A; 3V6E B; 2JT4 B; 1HEZ E; 5E6O A; 2D07 B; 1R4N I; 5EE3 A; 3PGE A; 4YSX B; 3GE3 C; 1TIF A; 3AV8 A; 5KHQ A; 4REZ A; 4ZHO A; 2PLP A; 1XCT L; 3HIZ A; 5AUI A; 2N1W A; 1WJU A; 4YSZ B; 2MP2 A; 1GPX A; 4LJP B; 3PZ7 A; 5IP4 D; 4FN2 A; 2K3U A; 3WCQ A; 2OJW A; 1DGJ A; 1WWT A; 2BYF A; 5AEK B; 2DHZ A; 3R8B A; 1XD3 B; 2MBH A; 4DHZ E; 4MEM A; 3EA6 A; 4ZHP A; 4GDL B; 4PYU A; 4M0W B; 3DVN V; 1WFY A; 2NTS A; 3Q14 C; 5E6N A; 2JU6 X; 1OEY A; 4P7I A; 3MHS D; 3VHT C; 2J52 A; 4C80 A; 5D94 A; 4M01 A; 4OVZ A; 3JW0 X; 3R66 C; 4AP4 C; 2G9H D; 2MBB B; 3OG5 A; 3L17 A; 1CJE A; 2ICI A; 1PUT A; 2DWQ A; 2LZ6 A; 3NS8 A; 4GOC A; 3A1Q B; 1IYF A; 3B2G A; 3N32 A; 1QF6 A; 2K8B A; 3RI7 C; 4GGQ A; 2CS4 A; 5DCN A; 3ZDM C; 2AQ3 B; 2BBC A; 2WXH A; 2ZEQ A; 1MHH E; 1LQB A; 4IM0 A; 1P98 A; 3AEB B; 3ZDT A; 1N5X A; 2Y5B B; 1FFU A; 4FBJ B; 4WAF A; 3NG0 A; 4BKS D; 1ISN A; 4A55 A; 4YTP B; 4FA6 A; 4KIK A; 3PLU A; 2J0M A; 1TZ1 A; 3AEA B; 3V61 A; 2PVO D; 5AZG A; 2M17 A; 4GSW A; 4MT5 A; 1TKE A; 3SFE B; 2EMT A; 1ROE A; 1SIF A; 1E5W A; 4LNF A; 2WXM A; 3N30 A; 3Q69 A; 3P4Q B; 4JIO U; 3PT2 B; 1K51 A; 4E3C A; 4UDU C; 2D3A A; 2GBN A; 1D6E C; 2MSE D; 3ZKJ C; 4WUR A; 4K7S A; 1SBB B; 2R61 A; 2KAJ A; 3NVY A; 1HQR D; 3M63 B; 3ZW3 A; 2GBK A; 3DPD A; 4IOI E; 2NBU A; 3IHP C; 3RNG C; 1FCL A; 2W54 A; 1H4R A; 3T9L A; 2EMS A; 1XLO A; 2ASQ A; 4YTM B; 4E74 A; 1CZP A; 1N63 A; 4RGO S; 2QDF A; 2D11 A; 4A8X C; 2WU5 B; 3VR8 B; 3PS6 A; 2QEJ C; 1UZX B; 1HZ6 A; 4GDL A; 3ZNG C; 3DBH I; 1E7U A; 3IVF A; 4LDT D; 2JPH A; 4NAW B; 5L83 A; 2KYW A; 3AU5 A; 3R2I A; 4M8N A; 4RMA A; 3ZYY X; 4EE2 A; 1N6Z A; 5D3D A; 1TZO A; 4DXG A; 3ZJV A; 2ZJD A; 2WXQ A; 2PMV A; 2XNA C; 4AUQ C; 2W55 A; 1RLF A; 1IP9 A; 2RD0 A; 5HG2 A; 2L0T A; 3ZLZ A; 2IY1 B; 1R7S A; 3A1Q A; 3DVG X; 2ONQ A; 2BYT A; 1RFA A; 3JSV B; 2GRI A; 2MH7 A; 2MW5 A; 4AQ7 A; 2OJR A; 2K8C A; 1SE9 A; 2W9N A; 5H92 C; 1QQR A; 2JUO A; 3VTV A; 2E3T A; 4JQW C; 4IKG A; 1E8Y A; 4EEW A; 3LXF A; 1R4N B; 1WGG A; 4RH6 A; 1JAL A; 2N1V A; 4OVV A; 4B95 A; 1MVK A; 3Q8E A; 2KNB A; 4K3B A; 5EE1 A; 1PGB A; 4I6P A; 2VZK D; 2N9X A; 1KLG D; 1XLP A; 2BT6 A; 4TMA B; 4ARI A; 2FAZ A; 4IWP A; 3Q8A A; 5J17 A; 5GMV A; 4JX1 C; 2KQS A; 3LYY A; 4BVU C; 3PHW B; 3NJT A; 1JRU A; 3BVM A; 3AEF B; 1AAR A; 4BFR A; 2LFI A; 5D6J B; 2QIL A; 1I4H A; 1K53 A; 2K5P A; 2CR5 A; 3APD A; 4RNA A; 3VTU A; 3AEC B; 3I63 C; 3MP9 A; 4ZYN A; 1WMH B; 2AL3 A; 2N7D A; 3P4S B; 3ZGZ A; 1J8C A; 4C7Y A; 2V0G A; 3TSS A; 4KV2 A; 4I6L B; 1WZ0 A; 4WWM A; 1QLB B; 5T8I A; 4MGZ E; 4YL8 A; 4DK5 A; 4GB9 A; 2KXJ A; 4XC2 A; 3R7Q A; 4AS1 A; 1I42 A; 1C4A A; 2Y5P A; 5G55 A; 3U2S C; 1E10 A; 3MJ5 A; 1FMA D; 4G50 A; 4KVG B; 3U30 A; 4NAW A; 1V5O A; 1OQR A; 1S1Q B; 1GAQ B; 2QC8 A; 3N1Z C; 2JF5 A; 5FR6 A; 4TV3 A; 3DCG A; 1F0Z A; 3AE4 B; 1V9J A; 1K8R B; 3NHE B; 4ZRP A; 1T0S C; 2XBB C; 2GB1 A; 3RNF C; 3DDC B; 4D2K A; 3VXW A; 1PYW D; 2WXK A; 3GE8 C; 4DDI D; 1EM7 A; 3BYT B; 2CKH B; 3L08 A; 2QJL A; 3ZRC A; 1NYQ A; 2IO0 B; 3VAW A; 1L4Z B; 3EUB 2; 3QHT A; 4RGM A; 2OHF A; 3JSV A; 2MX2 A; 3Q8C A; 4WQO B; 3O65 B; 1PGX A; 1LGR A; 2KC1 A; 3R3M A; 1NI2 A; 1JW9 D; 2WDQ B; 1LXD A; 1KF6 B; 2PJH A; 4IM3 A; 4B0E A; 5FKA C; 4GIV A; 4MAC A; 4TKN A; 1YJI A; 3RT3 B; 1L0V B; 1FNU A; 3TIX A; 3ZXV A; 2L05 A; 1WR1 A; 5TR5 A; 2I2Y A; 1IPG A; 4MEL A; 1OQQ A; 1JWA D; 3DBH B; 3GZN I; 4OVU A; 2QHO A; 1N60 A; 2EKI A; 3QJZ A; 5HI1 A; 3TMP B; 3IBE A; 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2NS5 A; 1GC7 A; 4S0R A; 2GMI C; 3EEC A; 3VRA B; 3PPA A; 5G5G A; 2IGD A; 4IUM B; 5CHV C; 4TSS A; 3Q3N C; 4LNK A; 1TYG B; 4JLC A; 1CQV A; 4HK2 A; 2M4N A; 2PVG C; 1EU3 A; 3RPF C; 2VH1 A; 3JVZ X; 1NBF C; 4RGT A; 1WGR A; 3H1U A; 2N9P C; 1RYJ A; 3KH0 A; 4XGA B; 2EKE C; 2JZP A; 1YJJ A; 2RPQ A; 3P2B A; 4W9F A; 3U7Z A; 3FC4 A; 2KAN A; 3U52 E; 3NOB A; 2SAK A; 2LWP A; 2R2O A; 2WDR B; 4C7Z A; 1QOB A; 2N9K A; 3P4R B; 4EFO A; 4KSL C; 2MJD A; 4MH8 A; 2Z8L A; 2IYD B; 5I4D A; 4LJO B; 3EHV A; 1P0R A; 3QAQ A; 4KZ0 A; 3AE3 B; 3KYC D; 4XDD A; 1NEK B; 1VR9 A; 3L4P A; 1UWM A; 2BW2 A; 3BZD B; 3T3N A; 3MHZ A; 2QSD A; 4LNN A; 4RM9 A; 4EZK A; 1OFF A; 1PFD A; 3NRZ A; 4WJN A; 5LXH A; 1Z5S B; 4TUU A; 4ANU A; 2KDB A; 2KD0 A; 3Q8F A; 1TJE A; 2KFJ A; 4W9D A; 3RCZ A; 4N58 A; 1FEH A; 1P9D U; 4LLG M; 1WJ4 A; 2J4X A; 2DAF A; 1NVI D; 4ICV A; 2JQR B; 3HM3 A; 3GZN B; 2HD5 B; 2IO3 B; 1YN4 A; 1MJD A; 2WWZ A; 2D3C A; 4WJO A; 3AE5 B; 1YQ4 B; 4BKT A; 1WH3 A; 5D2M B; 2FCM A; 1DYQ A; 5BYQ A; 3VDZ A; 3RZW C; 2IGH A; 5CHW A; 1WIA A; 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