2EPHA

Crystal structure of fructose-bisphosphate aldolase from plasmodium falciparum in complex with trap-tail determined at 2.7 angstrom resolution
Total Genus 125
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
125
sequence length
363
structure length
358
Chain Sequence
TEYMNAPKKLPADVAEELATTAQKLVQAGKGILAADESTQTIKKRFDNIKLENTIENRASYRDLLFGTKGLGKFISGAILFEETLFQKNEAGVPMVNLLHNENIIPGIKVDKGLVNIPCTDEEKSTQGLDGLAERCKEYYKAGARFAKWRTVLVIDTAKGKPTDLSIHETAWGLARYASICQQNRLVPIVEPEILADGPHSIEVCAVVTQKVLSCVFKALQENGVLLEGALLKPNMVTAGYECTAKTTTQDVGFLTVRTLRRTVPPALPGVVFLSGGQSEEEASVNLNSINALGPHPWALTFSYGRALQASVLNTWQGKKENVAKAREVLLQRAEANSLATYGKYKGGAGASLYEKKY
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Lyase
molecule keywords Fructose-bisphosphate aldolase
publication title Aldolase provides an unusual binding site for thrombospondin-related anonymous protein in the invasion machinery of the malaria parasite.
pubmed doi rcsb
source organism Plasmodium falciparum
total genus 125
structure length 358
sequence length 363
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature ec 4.1.2.13: Fructose-bisphosphate aldolase.
pdb deposition date 2007-03-30

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00274 Glycolytic Fructose-bisphosphate aldolase class-I
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 2ephA00
1SO6A 5A8GA 5K7JA 1TPEA 3HG5A 4IXHA 4Q4KA 3VI2A 4POCA 3LTSA 1TRDA 4PCFA 3G8EA 3NM1A 4DO6A 4FXRA 1QO5A 3S9YA 1W54A 1T96A 2NXHA 4I7UA 2YW3A 1K7FA 2ZZ5A 4QM1A 5C54A 3MYPA 1W5OA 3NEVA 4JYEA 4WX2A 3GXPA 2A6NA 4EVZA 4XQ6A 4WOZA 5U7SA 4UMBA 3UNDA 3NQDA 3JR2A 2H6RA 2ZA2A 4NX5A 4NXKA 4UTTC 5U4NA 3NDOA 1JRBA 3OVRA 4GWEA 3TXZA 1IIGA 1VS1A 4KWVA 4O4WA 1FXQA 1HFBA 5DLCA 1JRCA 3T55A 3HGOA 1C9DA 4Q33A 3ZS4A 5I3IA 1FCBA 4TMBA 3W9ZA 2WSRA 3FKRA 4WY0F 1TJRA 3JRKA 4JYFA 5HR6A 3CC1A 4JTTA 1QDSA 3HOJA 3K30A 2I1OA 4FB7A 4O11A 2VEIA 3FFSA 3VE7A 4AHQA 2A4AA 1TPC1 4Z08A 1XUZA 3SECA 3UD6A 2I9EA 4AAJA 1FQ0A 3PC0A 4IPJA 3L67A 2EKCA 5F2GA 4BI7A 3GXTA 4MY1A 3NR0A 1XKYA 5G2WA 2PE4A 4RCXA 4UFJA 4UTJA 3G1DA 4E2BA 4UTWA 2A6LA 2WSYA 3W76A 1TSIA 1YYAA 1FWNA 1SFLA 2Y62A 1BTMA 4P61A 3G0SA 3LXBA 1G6CA 4O17A 1FXPA 3S1XA 4BWLA 1PE1A 1V5XA 5HNRA 4DEFA 5K9XA 4S1FA 4JTUA 3N19B 3NQGA 4OGZA 3W1AA 4ADSA 2R94A 3GB6A 4LTSA 1GG0A 5CPOA 1NFBA 3IIPA 5TQLA 3O07A 1VYPX 2XFWA 1Y0EA 2NXIA 1L9WA 3GVGA 4FNPA 3DKJA 3KRUA 3SW6A 3TK7A 2QCNA 2ZZ6A 2OZ0A 2H8ZA 3BLIA 3EWZA 5I3HA 3NL6A 4MJMA 4FNTA 1K3UA 3KXQA 3HQ1A 1XBVA 2BXVA 2WQPA 2ZRWA 1S5VA 1G69A 1EUNA 5AC8A 4DELA 1Q6OA 4QAIA 1JCMP 1O60A 4J9JA 4ZQRA 4S2CA 4FNSA 2QCMA 3NQVA 1SZFA 2Y61A 4JTGA 2J9YA 2YYTA 4FIRA 3INPA 3NQFA 4GUJA 5C5YA 1FUYA 3C0JA 1F2JA 3E96A 3TC7A 3DBPA 5LNSA 3GR7A 3OVQA 4QSHA 4ADTA 3TKFA 3L65A 4IX0A 2CZ5A 3UWVA 2AGKA 2J9XA 2DZPA 2V9DA 4HIBA 1OFRA 3C6CA 4JTIA 2W79A 3C61A 3O8AA 2GQ8A 4O19A 5FF4A 4O50A 4RZ5A 1G4TA 4O28A 1D3HA 4A3UA 4E2DA 3O16A 4EWND 3NQ8A 1DORA 2EF9A 1Z42A 2DJLA 3NL5A 2R8WA 5FEXA 3G1SA 3OEXA 4X3ZA 3EX4A 3NNTA 5LNVA 1IXOA 1QPOA 2V82A 1O5XA 3DFPA 4N9BA 4U28A 2V2HA 4AWUA 3YPIA 1TV5A 1NF7A 4AVFA 4MKNA 4NJIA 3SY5A 2NWSA 3DFNA 4JN6A 4OQVA 1HO4A 3I65A 4QIUA 4UFMA 4YLWA 4ORMA 1DVJA 3IRDA 3IIOA 3KOFA 4FHAA 4UFLA 3QQ0A 1XM3A 4HNVA 1MEHA 5T26A 1C29A 1PHWA 2FIQA 2DZVA 2YYUA 2QCLA 1MSSA 2E6DA 3L2IA 5C2XA 3OG3A 3PSWA 5LNUA 4ZMGA 3LCGA 3O6CA 3M1ZA 3HPSA 1Z41A 4FNQA 3B0VC 3CIXA 3G1XA 1L6YA 3LHTA 2E6FA 4O1BA 5FF0A 1DQXA 4K7YA 4AF0B 2NV2A 5HWJA 3DFTA 4LVGA 1L6SA 7TIMA 1WBJA 2NX3A 3FIGA 4RLIA 1S3HA 1L2UA 4LVDA 1F7BA 4ZQNA 4ALDA 1VR6A 5AYZA 2ZZ3A 4HSOA 1J4EA 3KVKA 4RZ6A 2E1DA 2RKXA 3L5MA 1TRIA 3NPUA 2TYSA 3O05A 3PG9A 4W9TA 1M7PA 3W1TA 1QOPA 5K3VA 3H53A 4PC8A 4O0KA 1EWDA 4AXKA 1WQ5A 4XWUA 1KFBA 3P62A 1NVMA 1W5PA 3BK0A 3CT7A 5G4EA 5H91A 3S42A 1ZCOA 3TNOA 2QJHA 3MWAA 4WZHA 1SZEA 4HHPA 3HF3A 4X2RA 1Q6RA 4GUGA 4AH7A 4GRSA 1I45A 4TX9A 3P8JA 2TPSA 3G22A 8TIMA 1JCYA 2ATMA 4QITA 2CLOA 5K9CA 4MYXA 3F1QA 1ZAHA 1XL9A 3BG9A 3SFKA 1EUAA 2C14A 1QPQA 4FX7A 1SU5A 3RLUA 3IVUA 1TIMA 4FO4A 5KITA 2WOQA 4ZZ9A 1JUKA 4LC8A 2NUXA 1F74A 1SR9A 2XN2A 2HS8A 2QCFA 2JKAA 1XUUA 4R33A 3W7DA 2WPBA 3ZFHA 2YZRA 1VHCA 4O13A 3G0XA 1PS9A 4O52A 1BWKA 3NO5A 4NJGA 4K38A 1B4EA 1JUBA 5I3GA 2JK2A 2VENA 1THFD 1F76A 1HL2A 3W1LA 1IXNA 1KTBA 3KVLA 5CPNA 2VFGA 5F2MA 3M5VA 4UTKA 1TPUA 2TRSA 2D73A 2ISVA 3C2OA 3V1PA 5IBXC 2QCDB 3W72A 1VYRA 4NJKA 2H3DA 2QAPA 1GOXA 1I2OA 3NQEA 5FEZA 3E12A 3D0CA 4UR8A 4CNNA 3W7EA 5KMYA 2YFOA 2RFGA 5HUPA 1GTHA 1OHLA 3P8IA 1SO3A 4CCCA 2J6XA 4G1KA 3RU6A 3GLCA 2GVLA 4ZVJA 3C56A 5AOUA 1R2RA 3PBUA 3TAOA 3BG3A 5IBXA 3G1FA 2E5CA 3C3NA 3T44A 3JS3A 1FDJA 1N7KA 3FLUA 1RQEA 2G97A 2ABBA 2FFCA 1ICPA 4CNPA 1Q6QA 1ZAIA 5SWUA 3W7CA 3L9CA 5DY2A 3UYCA 2V8ZA 1LP6A 3MO7A 1FCUA 3TCEA 1VH7A 4O18A 4BI5A 5J5DA 3L68A 1OYBA 1IXPA 1H7WA 3BVJA 2ABAA 3QYQA 4KKXA 3W73A 4WXZA 5G2HA 2CLLA 4PL1A 5D2WA 5KZDA 5AFDA 2OX1A 2QCEA 1DOSA 3NQ7A 2WNQA 2YGYA 4U4MA 2J27A 3W1NA 4ZQCA 1QPRA 2JGYA 5CPMA 1WOBA 3QFEA 3MI3A 1YTDA 2CZDA 3QZEA 3FYOA 1FWSA 2Y89A 4HKPA 2Z1BA 3C8FA 1SUXA 3UXAA 3TU9A 1QNVA 2CLKA 4NNCA 5I3JA 2GVGA 5D2TA 3R8RA 3G1VA 5AB3A 1PCKA 3W2KA 2DZXA 3M5XA 3WJSA 1OFPA 3M6YA 1P0NA 2JBMA 3F4NA 1QO2A 3UY7A 1QAPA 4PH6A 1TV8A 3DGRA 4A2RA 1GT8A 2VFEA 1OX4B 4Z1CA 4MLRA 4I7VA 4BFAA 1IIHA 3LLFA 1BWLA 3RFAA 3PVFA 3HBLA 3TSMA 1DL3A 3F03K 3BARA 3UWWA 4K8HA 3TFXA 2C3ZA 3TJLA 2ZZ4A 5LZLA 4O8RA 3FA5A 4X22A 3IGSA 3A5VA 4O16A 1KM4A 3DKLA 2V5BA 5DXYA 5GVJA 4CCDA 2YW4A 3S8HA 1LM1A 5CZTA 3TQ0A 3TJXA 3FEMA 3U8GA 2H8XA 3MBFA 1OK6A 4EF8A 3TROA 2O7QA 3CHVA 2NLIA 3GNDA 1VPXA 2QR6A 3GDKA 5D38A 4QJ1A 1ZHAA 5BRBA 4LY8A 1UCWA 4EIVA 4OV4A 2GVJA 3FS2A 4GNJA 3STEA 3QH2A 4IWWA 1SZNA 5FF3A 1GWJA 1RD5A 1KFKA 1YXYA 1O4UA 1ZJIA 5DELA 4MZ8A 1B9BA 3GYEA 4TU1A 3B05A 1WAUA 4E0CA 2R91A 2ZRXA 4KFOA 1HTIA 1UUOA 4IMFA 4R53A 3E02A 5HQEA 1S5WA 4Y96A 4IX2A 3NZRA 1EIXA 3G1YA 2OMAA 3TUUA 3NQCA 1B4KA 4M6VA 2Q8ZA 3U2OA 1F6KA 4O57A 3VKJA 1LRNA 1AL7A 2PRLA 5FEWA 3G0UA 1H7XA 5HMSA 1QMLA 3EWUA 2A7NA 1OX4A 1LORA 4FNRA 3EX2A 2VEMA 2OJPA 1XCFA 3PBVA 1JCLA 4QQ3A 3HG3A 1OFQA 4LW7A 3WK0A 2FB2A 4O10A 4C1KA 2BZNA 4YXGA 1FDZA 4WY0B 1XC4A 4FXSA 3ANYA 2CLIA 2NWRA 4JD4A 1FBAA 1KW1A 3W70A 4CQ9A 3PR2A 3Q58A 5BNKA 5CGQA 1TPFA 3TDFA 3P81A 4OWGA 5AHLA 3UWQA 1I4NA 3HJZA 3WFAA 3SJ3A 3W85A 3TFCA 3IV3A 1K8XA 1YXCA 2DZTA 1SW7A 3QEZA 1TREA 3TC6A 1QR7A 1TMHA 1R2TA 1W56A 1GJPA 4IJBA 3BPWA 3DI1A 4AWSA 4CQ8A 2TMDA 1YTEA 2YR1A 1R47A 4UTTA 4XBKA 4UTLA 3L0KA 3PB2A 3P60A 3PUOA 1N8FA 2F7FA 4XUGA 4UFHA 3UWYA 5DY3A 3W1XA 4FEZA 2A7PA 3M44A 3C52A 3GIYA 2I14A 1V7YA 1QPNA 5A5WA 5I3FA 3MW7A 4LV4A 4UNKA 3E0IA 3O06A 5KINA 1M7OA 1PCWA 4KFNA 2BLEA 4JS3A 3A21A 4NQ1A 3CEPA 2C19A 3EWYA 1K7EA 1H51A 3GKFA 3LCIA 5D03A 3B0UX 3E49A 2Y6ZA 1HO1A 3P5YA 3P67A 3VE9A 3W83A 3LCWA 5J5RA 3EX3A 4BI6A 5DCEA 4Z0SA 2GQAA 3GZ3A 1OFBA 4WY0A 1QOQA 5F2IA 3WJYA 3BGGA 3G3MA 1VYSX 2DORA 1H7PA 2E6YA 1WA3A 3IVTA 3TX9A 3VNDA 5D30A 4JICA 4N4QA 3STFA 4HN4A 3W7QA 2F84A 3LXCA 4JY9A 3IIZA 2QF7A 2CZFA 2QCGA 1KA9F 5G5IA 2ZCGA 1LYXA 5DCDA 1VZWA 3TA6A 4HNNA 2E09A 4JTLA 3W1MA 1GG1A 2IQTA 4HNUA 4NVTA 3HPZA 2VEPA 1OVDA 1WV2A 3RNDA 1VHNA 4WJEA 1C8VA 2NXGA 3IIVA 4D2JA 1VCGA 1VRDA 2ISSA 1D3GA 4YCPA 4DO5A 3HO8A 4DXVA 4OHQA 1ICSA 4PEKA 3TSBA 3P7YA 4AMAA 1WBHA 1ME7A 2VEKA 3W84A 1ZY9A 3W7MA 4IMCA 2VFFA 1JUEA 3C4UA 5HWNA 1H61A 1KM5A 2CU0A 4YWIA 2WV8A 1F05A 2HTMA 4K8EA 1GVQA 3QMSA 4Y90A 2VFDA 2G96A 4K39A 3FOKA 2J24A 1OFOA 4KFPA 2A85A 4UFIA 4O12A 3NPWA 3S1WA 2C18A 4OU1A 4JTHA 2C0AA 3UY8A 3M0ZA 2Q8LA 3NM3A 3PUEA 3MI2A 1O95A 3EWWA 5D2YA 3TMLA 5K9DA 4DQWA 1LDCA 3MUXA 4HT3A 3HIJA 5F4SA 1RZMA 2Y70A 1F6PA 1OFAA 2YDAA 3NQ2A 2V81A 3NGJA 3KHJA 4UFKA 1H7OA 2QUTA 2RDTA 4GBUA 3LI0A 1FY6A 3ELFA 5D32A 1OYCA 4IOTA 5DCBA 4JGDA 5EBUA 2QUUA 4GUIA 4N6EA 3RF9A 1Q45A 1MEWA 5E0KA 3UPWA 3WK2A 4GFSA 1O94A 3GDRA 4LU0A 3LGEA 1I2NA 2E68A 3N73A 3MYOA 2FB3A 4JX4A 1KLYA 4FNUA 5KZMA 1MO0A 4DPQA 1SPQA 2R14A 1SQ7A 1DBTA 1P0KA 3TQKA 4NNAA 5CKSA 1TB3A 3W2MA 4LV9A 2QKFA 3LRLA 3SGUA 1OF8A 1LBMA 1PVNA 1LBFA 2X2GA 3R5EA 2FLIA 5F2LA 1GEQA 3LRMA 1P5BA 3RLVA 4I7WA 2O7SA 3NAVA 4O4VA 4K7VA 1PHQA 2OT1A 1DV7A 3OA3A 2FPTA 3W1PA 3BW4A 5LNWA 2V2CA 4LC6A 2RDUA 2DU2A 3C2FA 3G1AA 3W7RA 4JX6A 4AHOA 3W74A 3QJAA 4OT7A 1O5KA 2QUVA 5EKYA 3MJYA 4XKYB 4ZQOA 1GYLA 3G8RA 2NX9A 3GDLA 5KTLA 1SSDA 3BO9A 3W3OA 2E77A 3EWXA 3W75A 2WNZA 1JCNA 3ABRA 1ZNNA 4AHPA 2BX7A 2ATSA 6TIMA 3M16A 1H1YA 1I2QA 1VCVA 3B03A 1A53A 5HR7A 2FQIA 3HPXA 4ML9A 1FDYA 4FF7A 1ALDA 4Y6GA 2J9ZA 4YMZA 2Y88A 3G1HA 1LZOA 1H63A 4TMCA 3T4CA 3Q2DA 4PA8A 3PY2A 1YXDA 1W8SA 2B7QA 1TJPA 3DAQA 3LTYA 4Y9AA 5AHMA 2GOUA 2LLEA 5HWMA 3N34A 3M5ZA 3W1QA 1KM0A 4Z0JA 3B06A 5FF2A 4O1CA 3MI6A 2Y63A 3WK3A 1YPIA 1OX5A 2ZBTA 3P61A 3DENA 2PRMA 3EKLA 5MHBA 4BF9A 3I7RA 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 1EPX A;  1KFJ A;  4GXM A;  2J88 A;  3GKA A;  3MHF A;  1UUM A;  2A7R A;  3F4W A;  1EX5 A;  3BW2 A;  3GR8 A;  1M6J A;  2EAW A;  4EOU A;  2DZW A;  3LB0 A;  2C15 A;  3LI1 A;  3A22 A;  5CPL A;  1I2P A;  3ABQ A;  3NA8 A;  4UUI A;  1VC4 A;  1FCQ A;  1EP2 A;  2CFF A;  1X7F A;  5L6U A;  3U6W A;  4JDB A;  1IF2 A;  3N2X A;  5D09 A;  2RDW A;  4NXS A;  3DHF A;  5D2V A;  2ZYF A;  2VXN A;  3TSD A;  4FX8 A;  3NYZ A;  2ZTJ A;  3PBW A;  4RX0 A;  3UQN A;  3LOT A;  4UR7 A;  1H62 A;  1NF0 A;  1AW2 A;  1KBJ A;  3N9S A;  4JYD A;  4NZJ A;  3CWO X;  4K36 A;  3HG2 A;  4ORI A;  5DXX A;  3WJW A;  3BG5 A;  2AQW A;  3LV6 A;  3HGS A;  3N2M A;  1RR2 A;  2A5H A;  4M7T A;  1LTD A;  2B7P A;  1SO4 A;  4RZ4 A;  5CG7 A;  3CTL A;  3N9R A;  3OBK A;  4IME A;  3S1V A;  3PS7 A;  1TQJ A;  1JCJ A;  3ZWT A;  2JGQ A;  4B5N A;  3A9I A;  3B04 A;  3QM3 A;  2W6R A;  4QNW A;  3L0N A;  1Q6L A;  2ISW A;  2QCH A;  3HG4 A;  2E5D A; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
 1SO6 A;  2YOC A;  4OUE A;  3HG5 A;  2R6O A;  3BE7 A;  4HBK A;  5ENL A;  4B4F A;  1XC6 A;  4M51 A;  4PBG A;  2XIO A;  1MW0 A;  1TRD A;  2J7C A;  4PCF A;  3ARZ A;  5FAJ A;  3ZT6 A;  3A6O A;  4FXR A;  2IXV A;  1TJ1 A;  1X6L A;  3P0X A;  1E56 A;  2ISD A;  1HJS A;  3MTW A;  6A3H A;  5C54 A;  3MYP A;  1W5O A;  3RLH A;  3GXP A;  2QPX A;  2WMG A;  2A6N A;  3GQY A;  3NSX A;  4PRW A;  3NQD A;  3GU2 A;  4UTT C;  5U4N A;  1I1W A;  3NDO A;  4DNM A;  4O4W A;  4UQE A;  1JRC A;  4C6K A;  3M0K A;  2PMQ A;  1FCB A;  3I3E A;  1MQR A;  1TJR A;  3JRK A;  3ZO9 A;  3CC1 A;  3AYR A;  1BYC A;  1QDS A;  3K30 A;  3CL8 A;  4FB7 A;  4P7Q A;  4I9M A;  1X38 A;  1U1H A;  3UD6 A;  1N8W A;  2I9E A;  4LAL A;  4AZ6 A;  1BHG A;  4RL3 A;  5HAO A;  2EPM X;  3PAN A;  4BI7 A;  4MY1 A;  1NIU A;  3NR0 A;  4BHY A;  3WQ5 A;  4RCX A;  4UTW A;  3W76 A;  1FWN A;  2Y62 A;  1LQ2 A;  2DSV A;  4O17 A;  2O9O A;  3S1X A;  2ZUT A;  3ARP A;  1XWY A;  7ENL A;  3ZMR A;  3N4F A;  4S1F A;  4JTU A;  2UWF A;  3E2Q A;  4ADS A;  1F4A A;  3E5P A;  1LT7 A; 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