The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
11
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sequence length |
103
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structure length |
103
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Chain Sequence |
GSSGSSGELPSVEELTIILPEDIELKPLGMVSSIIEQLVIIESMTNLPPVNEETVIFKSDRQAAGKIFEIFGPVAHPFYVLRFNSSDHIESKGIKIKETMYFA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Transcription
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| molecule keywords |
Hypothetical protein LOC92345
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| publication title |
Solution structure of the NAF1 domain of Hypothetical protein BC008207 [Homo sapiens]
rcsb |
| source organism |
Homo sapiens
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| total genus |
11
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| structure length |
103
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| sequence length |
103
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2007-03-30 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Beta Barrel | Thrombin, subunit H | Probable tRNA pseudouridine synthase domain |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 3U28 C; 2EQN A; 3UAI C; 2HVY B; 3MQK C; 2V3M A; 2EY4 C; 2RFK C; #chains in the Genus database with same CATH topology 4YOG A; 2GX4 A; 1A5H A; 1TGC A; 2STB E; 3GIC B; 2BQW B; 1GJB B; 1BHX B; 1QRX A; 3EGK H; 3U8R H; 1ZSJ A; 5C1X A; 4KEL A; 3N7E A; 1FPC H; 5K7R A; 3T2N A; 3EAJ A; 2AGG X; 2FX4 A; 2PV9 B; 4I8G A; 1LVY A; 2G51 A; 5BRR E; 2UWL A; 3LH1 A; 1EPT B; 1XVM A; 1DWE H; 3HK6 B; 4B1T A; 3QX5 H; 1PPH E; 3MH6 A; 2RCE A; 5AFY H; 1TRY A; 2G8T A; 4JYV H; 2OTV A; 1ZMN A; 2XWB I; 1NRS H; 1DS2 E; 2BY7 X; 1C1P A; 3QZR A; 1V6D A; 2JDI D; 5EQS A; 4CRA A; 4RT1 A; 2J4I A; 3GCH B; 3MO9 A; 2A31 A; 1CE5 A; 1E1R D; 1O3G A; 2GZ8 A; 1TRM A; 5JBC S; 1HLT H; 1Y3U A; 1SVP A; 1C2F A; 3KQB A; 1WXR A; 1OPH B; 1D3D B; 1ELV A; 2BD3 A; 2VIO A; 1C2E A; 1C2J A; 1O2Q A; 2BX3 A; 2Y5F A; 3OY6 U; 3PMA B; 1O5E H; 3SJK A; 2ZHQ H; 4X0W U; 4D7F A; 3SN8 A; 2FOB A; 3EDX B; 3EQ0 H; 1C1T A; 3FKS D; 2D2D A; 1OWH A; 1D3P B; 5CE1 A; 1GI5 A; 2XYA A; 4A92 A; 4DUR A; 4UD9 H; 1GBK A; 4THN H; 2G00 A; 1C5S A; 3NXP A; 1O2X A; 2FP7 B; 3UOP A; 4FUC A; 1YM0 A; 1BQY A; 1YPE H; 1C5P A; 1P03 A; 2KM0 A; 4IGD A; 2FOM B; 1EKB B; 1Z8I B; 1IQJ A; 1C1S A; 1MUE B; 1QJ6 B; 2QXI A; 4BAN B; 1O2O A; 2ZKS A; 4Q2K A; 1SG8 B; 3T25 A; 3T28 A; 1ZZZ A; 1HYL A; 4Q4L A; 2Z3C A; 4X1R U; 1AFQ C; 5FCR A; 3Q00 A; 1DXW A; 4TY6 A; 2PLX A; 4IC5 A; 1GI4 A; 1IHT H; 1IQL A; 1NTP A; 3OTJ E; 1C1Q A; 1E37 B; 1TQ7 B; 2J97 A; 4TSF D; 2RA3 A; 1J17 T; 2EA3 A; 4MG3 A; 2C8W B; 3JZ2 B; 5C1Y A; 4JYU H; 2JH5 D; 2WPI S; 3BTH E; 4FUH A; 1E38 B; 2TPI Z; 4FXG H; 1RTF B; 1BTU A; 4B6F A; 4XFQ A; 1PPZ A; 4U32 A; 3RXO A; 1EAX A; 2J92 A; 2HRV A; 2ZI2 H; 2SFA A; 2VIQ A; 4NIX A; 2M5T A; 3L3T A; 4O97 A; 1GBD A; 1TX7 A; 3QO6 A; 4JMY A; 3P92 A; 4LZ4 B; 3PMB B; 2ZEC A; 1TAB E; 1NC6 A; 4IW4 E; 2FPZ A; 3VGC B; 1ORF A; 4MPX A; 2JKH A; 1G2M A; 1V3X A; 4BTU B; 1N8O B; 2XBY A; 1VIT H; 1CA0 B; 1E1Q D; 1GWA A; 3A81 A; 4Q7Z A; 5DN6 D; 1AKS A; 1D3T B; 3PV2 A; 2C8Y B; 3AK5 A; 2SGD E; 2ZQ1 A; 4NIV A; 2PW8 H; 1AB9 C; 2FOD A; 4Y0Z E; 5FPY A; 1TMU H; 4CRC A; 1G36 A; 5LH8 A; 1XKA C; 2WUB A; 1YPH C; 2GDD A; 2F43 B; 4AFU A; 4ASH A; 1FXY A; 3E91 A; 1A3E H; 3VG8 A; 3SU3 A; 3K6Z A; 3RXT A; 1IQG A; 1JRT A; 2Y80 A; 3L33 A; 3RC5 A; 4NSV A; 4QT8 C; 1DAN H; 4XD7 D; 2FMJ A; 2F9U A; 1FON A; 2R0L A; 3K65 B; 1KLT A; 4O3T A; 1S0R A; 3F2H A; 3MQK C; 2ODY B; 1H9I E; 3VB7 A; 2G52 A; 4CRE A; 1L4D A; 4BNR A; 3Q3Y A; 2VIN A; 4ABI A; 1AWH B; 4OS7 A; 2W6J D; 2JET C; 1TBQ H; 5L2Y H; 3CP7 A; 4GCH G; 4FU8 A; 2A1D B; 4CRF A; 2ODQ A; 3DA9 B; 1BTZ A; 1MMJ N; 1RIW C; 1S81 A; 4M7G A; 7KME H; 2GV7 A; 1G3E A; 1RJX B; 2PR3 A; 1SGF A; 3S7K B; 3TJN A; 1KLJ H; 2VGC B; 3A7V A; 1PPC E; 1O5B B; 3LDX H; 1Q3X A; 3A8C A; 5FL7 D; 4RKO B; 1UCY H; 2FO9 A; 5HGG A; 1KXC A; 2AER H; 1VGC C; 4CHA C; 4TPY A; 4MNV A; 4JK5 A; 4HZH A; 3FAO A; 3M5M A; 2VJ1 A; 3TVJ B; 4K8Y A; 1ABI H; 2ULL A; 1OXG A; 2KZ4 A; 8KME 2; 1DIC A; 4IBL H; 1G2L A; 3I77 A; 2NU3 E; 1GHW H; 4E05 H; 3TH4 H; 2VH0 A; 1TNI A; 1BJV A; 2XC0 A; 5FBE A; 3U1J B; 1MKW K; 2QXG A; 1C2D A; 1C5W B; 2AMP A; 2PHB A; 1MTN B; 4WMF A; 2AIQ A; 1O5F H; 1UVS H; 1PQ7 A; 1EPT C; 3W1E A; 3ZZC A; 4AG1 A; 3H7O A; 1P2I A; 1SGT A; 1M9U A; 3D62 A; 1LVB A; 4RT0 A; 3SUF A; 3SV9 A; 4K60 A; 1H9L B; 3TNS A; 3SBK A; 1VCP A; 5HYO A; 2HWL B; 2FI5 E; 1SLV B; 1ZPZ A; 5F8X A; 3GCH C; 9EST A; 3C1K A; 2DE8 A; 1E79 D; 2CHA C; 2YNA A; 1W7X H; 4NGA H; 2PKS B; 1XXF A; 2FIR H; 3BF6 H; 3PV5 A; 3V13 A; 1NM6 A; 5FBI A; 2A4Q A; 2H9E H; 3RXL A; 5DK1 A; 2GCT B; 1ZPB A; 1S83 A; 1GL0 E; 5H4I B; 3KEE A; 4NA9 H; 3M61 U; 2HVY B; 1EJA A; 3E1X B; 1BMA A; 1NFX A; 1H8D H; 4JCN A; 1UTL M; 2Z3E A; 2VH6 A; 5F8T A; 2BY6 X; 5EXN A; 1BTY A; 2FTM A; 3OY5 U; 4ZXY H; 1LHE H; 2GD4 B; 1LHF H; 3U9A H; 1D6R A; 4MNW A; 3QWC H; 6GCH G; 1P2M A; 1TE0 A; 2G4U A; 2YMS D; 1TRN A; 1V2U T; 4CRB A; 3OAA D; 2OBQ A; 2WIN I; 4AFZ A; 4NSY A; 4B74 A; 1YBW A; 1OWE A; 5KGO A; 1CVW H; 1HAO H; 4B73 A; 1Q31 A; 2O9Q A; 4MLF B; 4AX9 H; 1GBA A; 1SI5 H; 3A85 A; 1SGY E; 2NU2 E; 3MH7 A; 1IQN A; 1KTT B; 1P2K A; 3EA7 A; 2A4G A; 3TU7 H; 1GI2 A; 2OC7 A; 1T32 A; 4A1X A; 5DP9 A; 2BDY A; 2ZU5 A; 1E34 B; 3KHV A; 3BTQ E; 1SGE E; 4K8B A; 4GHT A; 1BIT A; 4FUI A; 2OP9 A; 1QL7 A; 1NZQ H; 4ZCN A; 4U01 A; 4ABB A; 2F91 A; 1ABJ H; 1ELC A; 1O2S A; 1QRW A; 3GDS A; 3ZZA A; 5ABW A; 1YPG H; 1WBG B; 4X2W A; 1TA2 A; 3F1S B; 3U69 H; 3ZIA D; 3Q77 A; 3VGC C; 4ZMA H; 3E0P B; 3DT0 H; 1HV7 A; 1AU8 A; 5IDK A; 1VZQ H; 3E8L A; 1N8O C; 2V0B A; 2G5N A; 3PLB A; 2BVR H; 1CA0 C; 5HM2 A; 3RDZ A; 1MKW H; 4X1S U; 5G4B A; 1GHV H; 2FOG A; 1QJ7 B; 3BIU H; 3LJO A; 4LK4 A; 4Q7X A; 1XUG A; 3OX7 U; 2PKA A; 1BRC E; 1ELG A; 2L74 A; 2XBV A; 1FY8 E; 1Z7K A; 1O2G H; 1O3H A; 4OS4 A; 5IYT A; 2CK3 D; 4FUE A; 3NK8 A; 1QA7 A; 4ASU D; 1SHH B; 1Z1J A; 3BTF E; 3MNX A; 3NWU A; 3KYF A; 1O3K A; 1W0Z U; 1V2L T; 4AOQ A; 1YPM H; 1Z71 A; 5TJX A; 2PSY A; 4KGA A; 5EGM A; 3QGN B; 1TGS Z; 1LHD H; 1FN6 A; 1KDQ A; 3F6U H; 5DGJ A; 1QQU A; 1DY9 A; 3HKI B; 2KAI A; 2J98 B; 2EQN A; 2A32 A; 3QTO H; 2ZIQ H; 1O2R A; 2ZGX H; 3OFN D; 1A0H B; 1QY6 A; 1C4V 2; 4ACA A; 5HXF A; 3RXJ A; 3SHC H; 2H2Z A; 4Y8X A; 4K1E A; 2XCN A; 3PTN A; 5DP6 A; 2ILN A; 1Z8G A; 1AVW A; 2IPQ X; 4OS1 A; 1IQK A; 2K1Q A; 1GBL A; 4KTC A; 2AGI X; 1THP B; 3OSY A; 4DVA U; 2O8W A; 2B0F A; 2FS9 A; 1MCV A; 5EXL A; 1FX0 B; 4ZKR U; 2I6Q A; 1V2K T; 2BD7 A; 3GS9 A; 1VIT F; 5GPI B; 4BTI B; 1MKX K; 1IQH A; 3M3T A; 2XRC A; 4CR9 A; 1F5L A; 1HAV A; 4BTT B; 1GHY H; 1F0T A; 3OEE D; 1S0Q A; 3ZZ4 A; 2BD5 A; 3ITI A; 4BOH A; 1P2J A; 3AAS A; 3RMN H; 1RTK A; 4ZKN U; 3E0N B; 2F3C E; 3MNB A; 3KF2 A; 5E0J A; 1BTX A; 1O38 A; 2LNC A; 1GI9 B; 3F9G A; 2OUA A; 4MDS A; 4TY7 A; 1GGD C; 1W3C A; 2J2U A; 2GCH G; 1IAU A; 1W11 U; 3Q76 A; 1CT0 E; 1ZHR A; 1Z8J B; 3S9B A; 1F5R A; 1MTN C; 1O3N A; 2R2W U; 4Z6A H; 3TK5 A; 1CHO G; 3TGI E; 1UK4 A; 1WV7 H; 1TQ0 B; 5HMA A; 4X6O A; 4RKJ B; 3SHA H; 4NA7 A; 1NFU A; 3ZVF A; 2ZU4 A; 1QUR H; 2A7C A; 1LVO A; 1RD3 B; 1G3B A; 4JZF H; 4INL A; 2GT7 A; 1C2M A; 1GJ8 B; 4CBO A; 3GCO A; 3A7T A; 3UIR A; 1YY3 A; 2SGQ E; 1AMH A; 1L1G A; 2PKS C; 3SQH E; 3EA9 A; 1JIM A; 2AS9 A; 2R3U A; 2L6O A; 3EE0 B; 5GCH G; 4K1S A; 3BEU A; 4DOQ A; 1SLU B; 3LJJ A; 3S0N A; 3GY8 A; 4GCH F; 3RXH A; 1EXF A; 2ZU2 A; 3GIS B; 2GCT C; 4X6M A; 4BAM B; 1YP9 A; 1C1N A; 1FIW A; 5ETX A; 2GTB A; 1DUE A; 5AVD A; 3UAI C; 4MQA A; 4AG2 A; 4F48 B; 2BB4 A; 2Z9L A; 1QIX B; 2BQ7 B; 1GBC A; 3A7W A; 1UVO A; 1ARB A; 1FY4 A; 3LGW A; 1QHR B; 5C5O A; 1J8A A; 2WZQ A; 2FLB H; 2OIN A; 1WTG H; 1SFQ B; 5HM9 A; 1L1N A; 4AYY B; 4ZKO U; 2OC8 A; 4PRO A; 1O34 A; 3NPS A; 4XDE A; 1LTO A; 6LPR A; 1OOK B; 1QA0 A; 2ZGB H; 1RFN A; 1XXD A; 1EZU C; 1CSO E; 1THS H; 2SGE E; 5JYI A; 3M5O A; 5EQR A; 1HAX B; 2BX4 A; 2R0K A; 1PQ5 A; 1Y59 T; 2PTC E; 1WSS H; 3FVF B; 4BAQ B; 1G30 B; 4J1Y A; 3F9F A; 2Z9K A; 3TK9 A; 5DP7 A; 1MKX H; 2DUC A; 3UR9 A; 2EST E; 1NU9 A; 4F4O C; 1HIA B; 1C2G A; 1LO6 A; 1HNE E; 2AIP A; 4ISO A; 4ISL A; 3I29 A; 1V2J T; 2EI6 A; 4WMD A; 1GHB G; 1BTH H; 3FP7 E; 1PPF E; 5I46 H; 3GCN A; 3SJ9 A; 5LPE A; 3LIW A; 3KCG H; 4UDW H; 1GVL A; 1N6X A; 2VU8 E; 1SHY A; 2ZHD A; 4NZQ A; 3SU1 A; 2BY5 X; 4A1V A; 1NFW A; 2BDC A; 5C0T A; 1A46 H; 4WXI A; 2WPM S; 2GJG A; 1O2N A; 3OYP A; 3LGT A; 5EJL A; 1MZD A; 1ZR0 A; 2ZDN A; 5C3N A; 1AUJ A; 1DM4 B; 1KXF A; 2BDA A; 4NG9 H; 3U98 H; 2ZTX A; 3DFJ A; 4GSO A; 2UUY A; 4GHQ A; 4ABG A; 3GCT F; 4TPI Z; 5FX5 A; 3TGK E; 1LHC H; 4X6P A; 2GGV B; 4SGA E; 5GDS H; 4Y71 A; 2V3H H; 3SNE A; 5T1V A; 3KQ5 A; 1BHX F; 3RXG A; 1N6Y A; 3ZVA A; 3FP8 E; 2TGT A; 1Z6E A; 1VJA U; 4CH8 B; 1OP8 A; 2CHA B; 3PV4 A; 4VGC B; 2BMG B; 3F3B A; 3SGB E; 1O3E A; 5C5N A; 2RDL A; 2J94 A; 1MTW A; 6GCH F; 2KCY A; 1AIX H; 1SOZ A; 1TON A; 2GMT B; 2UUF B; 1E0F D; 1UTO A; 2ZFQ H; 1NY2 2; 1O3F A; 1OX1 A; 3SJO A; 1CGH A; 1ETT H; 1A3B H; 4X8U H; 3VB4 A; 1KXE A; 3M5N A; 3ZZ7 A; 1NU7 B; 1C1W H; 1DSU A; 1YPH E; 1C2H A; 5C0U A; 2NU1 E; 3MMG A; 1SL3 A; 4YT6 H; 4ABH A; 2NWN A; 1O2L A; 1PPB H; 2EC9 H; 5T6G A; 5LPR A; 1H4W A; 2KCP A; 1D4P B; 2TBS A; 2QA9 E; 2ZFR H; 1RXP A; 2Z94 A; 4K1T A; 4NIW A; 2PFE A; 2FM2 A; 3Q3X A; 4WH6 A; 5DP8 A; 3RXS A; 2BZ6 H; 1MTV A; 4U2W A; 4ISN A; 1K28 D; 1UCY K; 1ZJD A; 3AW0 A; 1MCT A; 5HKK D; 5EQQ A; 3P8N A; 1O2Z A; 2A4O A; 2W3K A; 4JZD H; 4CRD A; 1W14 U; 1TB6 H; 1V2P T; 3DSP A; 2THF B; 4DT7 B; 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2W26 A; 2ZC9 H; 1FDP A; 3A83 A; 2FLR H; 3PMH B; 2Q6G A; 1TBR H; 3RXU A; 3T62 A; 1HB0 B; 2ALP A; 1LPK B; 4Q63 A; 4H4F A; 1BML A; 3CS0 A; 4AYV B; 1P2O A; 1O3I A; 2PGB B; 1JBU H; 3BTE E; 3EA8 A; 2ZHW H; 4FUD A; 5FPS A; 1CHG A; 1TMT H; 5A0B A; 4GPG A; 1C5N H; 1Y5A T; 2H9T H; 2QXJ A; 3KNX A; 2ZU3 A; 3STJ A; 3HK3 B; 2ZF0 H; 3DSG A; 2GCH F; 3GY7 A; 2O8U A; 5EST E; 3ZVD A; 1A0L A; 2GDE H; 2ZTY A; 3SI3 H; 1F0R A; 6CHA B; 1SMF E; 1HAY B; 3SNB A; 1NRP H; 4X2V A; 4B2C A; 1GG6 B; 3KID U; 2KCA A; 1EFR D; 1TPP A; 1CHO F; 1K1M A; 4FVB A; 2IOT A; 4XE4 A; 1CU1 A; 2C4F H; 4Y79 A; 4ABJ A; 1AVG H; 1JMO H; 2VVU A; 3E90 B; 1O2U A; 4RSP A; 1AGJ A; 1O2M A; 1W2K H; 1CO7 E; 1Q2W A; 1GGD B; 1O3P B; 3URD A; 2VWM A; 1JRS A; 3UQO A; 2ZFP H; 4D8N A; 1DX5 M; 2FEQ H; 1EJM A; 1C5R A; 1TX8 A; 5FXL A; 1BOQ A; 1VKY A; 4R0I A; 5EW2 H; 3P6Z B; 5GCH F; 1GDQ A; 2NU4 E; 1WDI A; 1BBR K; 3MU0 A; 5GXP A; 1LKB A; 1HXF H; 3AW1 A; 5CDF E; 1U6Q A; 2FYR A; 1WU1 A; 2CXV A; 2A5A A; 3RXR A; 4AFS A; 1G3C A; 2ODP A; 3VEQ B; 4AB9 A; 1K1J A; 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