2ESNA

The crystal structure of probable transcriptional regulator pa0477 from pseudomonas aeruginosa
Total Genus 89
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
89
sequence length
301
structure length
299
Chain Sequence
PLLRRLDLNLLLVFDALYRHRNVGTAASELAISASAFSHALGRLRQGLDDELFLRQGNRMQPTQRAEHLAAAVAAALRALGEGLEEWRPFVPGQSQRTFVFAATDYTAFALLPPLMNRLQHSAPGVRLRLVNAERKLSVEALASGRIDFALGYDEEHERLPEGIQAHDWFADRYVVVARRDHPRLAGAPTLEGYLAERHAVVTPWNEDSGVIDRLLARSGLRREVAVQLPTVLAALFLAGSTDFLLTAPRHAARALAEAAGLALYPAPFDIPPYVLRLYSHVQGRDAHAWMIGQLKGLD
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Structural genomics, unknown function
molecule keywords probable transcriptional regulator
publication title The crystal structure of putative transcriptional regulator Pa0477 from Pseudomonas aeruginosa
rcsb
source organism Pseudomonas aeruginosa
total genus 89
structure length 299
sequence length 301
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature
pdb deposition date 2005-10-26

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00126 HTH_1 Bacterial regulatory helix-turn-helix protein, lysR family
A PF03466 LysR_substrate LysR substrate binding domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.10.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Arc Repressor Mutant, subunit A Winged helix-like DNA-binding domain superfamily/Winged helix DNA-binding domain 2esnA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2esnA02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2esnA03
3KJ7A 3AXFA 4R6YA 3E3KA 1R58A 2A07F 1IUDA 4IHSA 3TOBA 1U78A 4UUVA 2X7QA 5K5OA 1WKMA 2HYFA 5IT9Z 3EHUA 1WSUA 4OINF 1B1XA 4TOZA 3WU0A 4Y17A 2HQNA 5KK1A 1NHAA 2RC9A 3O97A 3FMRA 3V89B 3E9XA 2V3UA 1M5EA 4HQEA 3SQNA 4I8CA 4F3BA 2XXWA 1RI7A 3FMSA 4FATA 1O7FA 2GQQA 1D3YA 3EHSA 2XGXA 4I01A 4WXCA 3KEQA 1P1NA 1WWXA 3UK4A 4FHTA 4ZZLA 1FQCA 3C1DA 2KLFA 2ZMEB 3GF2A 1BI0A 1JETA 1J7KA 1FWZA 3ZKLA 2X0LA 4NF5B 4R6KA 4NF8B 1FSHA 4P96A 3WTZA 4EV0A 4GO1A 3ZS6A 1K79A 2F5XA 4BQAA 1HKSA 3TAJA 3KFWX 4GXSB 2FRHA 2Z8EA 4GOTA 5AA4B 2HZKA 1SBPA 2Q88A 1HSJA 4OENA 4Q48A 2HQRA 4ESFA 1AL3A 3JAMZ 3C9HA 4BDMA 1S29A 1LBCA 4I7HA 3WTYC 5J1DA 4NF4A 3T0YA 3DF8A 2H98A 2HR3A 3OD7A 3TPAA 1H76A 1P4WA 3D0SA 4M6XA 5FO5A 4M72A 4MHGA 1S7OA 3BFUA 3S9NC 2Z22A 1EH3A 1EH8A 4AD9A 2O7IA 1J5YA 3HOSA 3TUSA 3PUYE 2ADUA 5FHNA 3OEMA 4QFPA 1MRPA 3QP6A 4GIZA 3MZ9A 4RAZA 3PD8A 4YMBA 2QZ8A 4OIRF 4G2ZA 2KIUA 4RAYA 3FJ7A 3DP8A 3BY6A 1GV8A 1Q1KA 4DNCA 4OVJA 2DP8A 5TPAA 3E5UA 4HW8A 4KFQA 2Y48A 3PMXA 3KLNA 3C7JA 3ZMTA 3FATA 4IRIA 4A5MA 2YPNA 2E1NA 2JTVA 5L3FA 4B09A 2B3BA 4WCGA 4RPOA 3FGSA 1ZIUA 4LP2B 4QHQA 4IXAA 2HDCA 1WDNA 2CQKA 3HPIA 2QS4A 2F5CA 3ZMVA 1NNKA 5CI5A 1I27A 1MG1A 3GZ6A 2Z23A 1ZG3A 2EV0A 2XKOA 3SEUA 5HDGA 5FFZA 4KT5C 5AIQA 2RV8A 3I6VA 5AIPA 2CWEA 4IO6A 3GFJA 4WX9A 3PUWE 1NNFA 2DTRA 1OYYA 2OQRA 1C0WA 2QMXA 3QAHA 2EK5A 3L7WA 4ZZAA 1DDNA 5IAIA 5JR3A 3GUDA 1P2FA 1YW7A 1OVTA 2F6GA 1H9TA 3RQTA 1B51A 3OXNA 2HZTA 3ABUA 2P7VB 1R22A 2P6SA 4RGSA 5D8LB 1CF7A 4HF1A 4F1UA 3IX1A 3CUQA 4L9JA 5E1ZB 1T38A 1RUNA 3SEVA 5FLXK 4AWXB 4YFKF 1F4KA 4JWYA 1FQDA 2H4IA 3HRUA 3KG2A 5FFXA 3JYRA 3QAXA 4F3SA 2FNPA 3R61A 5H8FB 4IRHA 1IN8A 3KCCA 4G68A 2VD2A 3VVEA 3C3WA 3BKIB 3F22A 1J2XA 2VC0A 2QWWA 1QO0D 3O66A 2I4CA 2FEZA 1UB9A 1I6BA 3WAEA 1XGSA 1OLAA 4DCYA 4OMYA 2DQRA 3I0TA 3M8UA 3IRRA 5FGMA 2K4JA 4DXCA 1FLIA 4I1DA 2YU3A 2UYFA 3MVZA 3SKPA 2PLYA 3WTTC 1XDUA 4ELOA 4YFNF 4O5VA 2HXWA 5BPDA 4AQ4A 2O3FA 2IEEA 4ESWA 2F5EA 1P1WA 3H6UA 4U1OA 2R6GE 3DP4A 3MWBA 1LAFE 4BNCA 3CIJA 4F29A 2GAUA 4N0BA 2K86A 1IF1A 1SD7A 1OMPA 3KN8A 3VB2A 2MA3A 4K3FA 3FV2A 1FYLA 2F78A 2IP2A 1FTOA 3T66A 4F1VA 1R1VA 1Y4CA 5FD6A 3E5QA 4KUMA 4RA1A 2ZXJA 2D1HA 1IXRC 2DVCA 4BLAA 5I56B 4LZ5A 3ELKA 2AXLA 3L2CA 1Y1ZA 4R74A 1ON1A 1MJ9A 2OU2A 5HDKA 1IXHA 2RC7A 3N94A 4OERA 3RDIA 1YPNA 1QNTA 1MXZA 3HIFA 2HS5A 2AIXA 3V8LA 3B7DA 2ZMEA 2DU9A 2ESHA 3H6VA 3VOEA 4NF5A 1B7HA 1D4NA 4ESBA 3EYIA 3P7NA 3QRFF 2HZLA 1XVYA 3LFKA 1XD7A 2WV0A 5CVUA 2LAOA 5LHIA 3LA7A 3ZP5A 1EZ9A 4OTEA 4LG0A 5AA4A 3CFXA 2FNAA 3VFJA 5IT9K 1LAGE 3NRVA 3RTFB 3CRBA 4EM2A 2AYSA 4U4XA 1H9GA 5I2NA 3RPWA 5JEIA 1Z05A 4MF3A 5ERIA 1TT1A 1LLSA 2QBYB 3MUQA 1I1GA 3J7AO 4HQMA 4PGGA 4BDRA 2QSXA 3TOAA 4OHNA 1KU7A 2VBXA 1I1SA 3DP6A 4GWOA 2IA0A 4WEDA 1QULA 3DXJF 4POWA 5HPQA 3MWMA 1LEBA 3ONMA 4H67A 2KKOA 3DFGA 4G7ZF 4LLGF 3LA3A 3CO7C 4XLNF 4IVNA 3TDUC 1Y3QA 1MD0A 2QL3A 3V8JA 1B5JA 1DSNA 1Y3NA 3VXCA 5ICCA 1BC8C 2A6HF 2V6CA 5JVTA 3H6WA 3MQ0A 3N4MA 2GRVA 4O6JA 4ESXA 1KYWA 2FSWA 1A40A 3F21A 3SDFA 3UIFA 2DAOA 3TQWA 3REOA 3F11A 3W9WA 1WODA 4G8NA 4Y13A 1FBQA 2P8TA 3Q27A 1I5ZA 3MQ9A 4PFWA 3V8KA 2I3WA 4BHCA 1O64A 5K5QA 3IR1A 4FAJA 3R0AA 1D8KA 3JAMK 1FYKA 2PMSA 3MZ1A 3MEXA 1A8FA 3Q28A 1ZBMA 5DDGA 3IOVA 5LEKA 1HW2A 4HTGA 1MZBA 3RNNA 3GFLA 2EWNA 2YLNA 4HDVA 2I6EA 2GWRA 5E1XA 4KYWA 1F1ZA 4HDUA 2DQVA 4P5OA 2XXPA 3PUVE 3Q9VA 3VFZA 5FB2A 5DVIA 1BBYA 5J6XA 1MGTA 3O2PE 2XXYA 3TZAA 2R71A 1T39A 1JHHA 3HSTA 1LVAA 2E7XA 3K69A 4ELRA 3SZPA 1O3RA 1T6SA 3KP3A 5DV5A 4YU0A 3PPQA 5AA2B 4HV6A 2CMOA 3O29A 5HVQC 3T8RA 4ZZDA 4XLPF 2R7DA 2ZNYA 4I2OA 4RB2C 4M73A 2M30A 1ZRCA 3F8FA 4OIOF 1ZU0A 5K2YA 5LBQA 2O51A 3FASA 4JB7A 4TLLB 3ERED 2EFNA 1SYHA 1SD5A 1Y0UA 3KETA 5K2XA 2Y84A 3DV8A 1OIBA 3IOTA 2COMA 4CICA 1YS7A 5H8FA 5ILUA 3H4ZA 2K02A 1ULYA 4MNUA 1FC3A 4XSXF 1GR2A 2F35A 4YB5A 1PDAA 4H8IA 2M45A 4M6YA 2IT0A 2G29A 1DPPA 4RGUA 1OVBA 6PAXA 3B6WA 4GD5A 1B4ZA 4NWCA 2E1CA 2HGCA 2LSOA 2DI3A 1QKAA 2NS0A 3IB2A 1DUXC 1LBBA 1FP2A 1SW2A 2H5YA 2Z8FA 3LSLA 1W4MA 1I6AA 5BUUA 2HAVA 1DOTA 3DPTA 1SW4A 5H8NB 5D5WB 3OMBA 2V84A 1N84A 3MC2A 4F3PA 1G3YA 5K5RA 1L3LA 2JPBA 3E3VA 2L02A 4JBAA 2KJBA 3PGFA 3SERA 3RT8A 1I69A 1OYIA 1A7LA 1LAHE 4CZZA 3LAJA 4HLXA 2D21A 4OETA 2LKPA 2XD3A 3RT6B 4U7BA 3M7GA 2ETHA 3UP9A 2KIMA 1A8EA 3MP6A 3E6MA 5I56A 1N7WA 1QUKA 2UVHA 1U2WA 3ECHA 3V4GA 4QRZA 1GHCA 4Q4ZF 4EQ9A 3COAC 1JVYA 2MH2A 2HOEA 2CG4A 1KU9A 2DWJA 1NMUA 1MXYA 3TTKA 5L3DA 2HQ0A 1SFUA 4HS7A 4X9TA 3F3XA 3FIRA 4IO2A 3B6TA 2F97A 3SHFA 4NF4B 4U22A 2TDXA 2MBFA 2XASA 3MZYA 1O3TA 2P0SA 3EDPA 1R1NA 1OYWA 3OV8A 4NB5A 5ILSA 4OU0A 2IVMA 4WXJA 3UORA 1B7ZA 2OJTA 4H8JA 4GYIA 2D5WA 1QKBA 5LRSA 1ELJA 4H1XA 2ZXTA 3L00A 5D4RA 2PFBA 1QZZA 4GCVA 5LGTA 2ACJA 2QBYA 5CVVA 2O6GE 4KD5A 3D4CA 2K7LA 5TP9A 3WE2A 5L8DA 4EQBA 2YX7A 1QUJA 3SESA 3RJPA 3C31A 4NHJA 3EPEA 4QWQA 4EJWA 3O28A 2XUBA 5LLQA 1BM9A 1DPRA 1XVXA 1MKMA 1B52A 5H8SA 3VEPA 1N3XA 5DTBA 4GLIA 1R6ZA 1KGSA 2O6AA 3I3VA 1BI1A 2C6YA 1N3WA 1B46A 2ANJA 5FLXZ 3KFMA 1P99A 4D0PA 1ON2A 4ENJA 2ZNZA 1GVCA 4F19A 2QMWA 2Q2EA 4HYEA 5HLGA 1IIWA 3FZVA 5KDTA 3K1MA 4EJUA 4OQOA 3V8XB 2YSRA 3V7RA 4ASNA 3WODF 2XROA 3F8NA 4MEYF 1MH4A 2XVCA 3RKYA 1VR5A 3IO4A 1FBSA 1WQ2A 2A6EF 3N6TA 2VONA 5L3BA 4KCDA 4MH5A 2PYYA 2MLKA 3FWEA 5HS9A 4DZ1A 1CE2A 4QFLA 1LFGA 4U21A 3LQQA 1B40A 1B6HA 5ED4A 3S4UA 3IRQA 1E2XA 1G4DA 3J80K 2A5YB 4LD5A 3OEKA 1FPQA 1LB2A 1TQPA 2VODA 1G3WA 4IRGA 4I0AA 1VFDA 2QRYA 3IWFA 5DUKA 5E20A 3C36A 1MXWA 5JK4A 4HOBA 2M8EA 2XD2A 3KN3A 4R1HA 1J9IA 2L4MA 1UTHB 5FTIA 3H92A 4L5IA 1REPC 3G3IA 2RQPA 4DDDA 1FT9A 2OZUA 2VBWA 1B0LA 1AWCA 1KQ0A 3BP8A 3CUQB 2XHDA 5A2QZ 1JVXA 1Z7NE 1EZPA 2Z33A 2QPQA 2XIGA 2HFBA 4X1BA 3R7XA 3V7CA 5AA2A 4NMYA 4KIFA 2EFWA 3ZMUA 3DP7A 2G7HA 3IAZA 2RINA 2L3DA 4M1VA 3MP1A 3E6BA 2V93A 2XAFA 3R60A 1B3GA 2CZLA 4GQOA 3L09A 5I58B 4N07A 1LNWA 2P4WA 5KCJA 1SI0A 3L6GA 2QS1A 3Q5FA 3GZ5A 2DXYA 4EJOA 4AB5A 3I71A 2IPQX 2PBIA 4M74A 4Q5SF 4HX7A 2RVCA 4XKNA 4MQ9F 2XAGA 4FX0A 1ZRDA 2HWVA 2H9BA 1ZMGA 1SW1A 4WXHA 2CW0F 1M5FA 4G8HA 2MH9A 1U3EM 3S9MC 5H8NA 4ELPA 2RDPA 1U5TB 4ZDMA 3IL2A 2HEUA 5E1WA 1DMBA 3K01A 2F2EA 3VXBA 3U1OA 3MZBA 3TTNA 4EMSA 4M9XA 3LSXA 5L9OA 4ZYEA 2DVZA 5HLIA 5ICFA 2RC4A 4G68C 3DEUA 4IO7A 4KYDA 3CG1A 3TYHA 3BDDA 1A54A 4R72A 4RPNA 2XRNA 5BS6A 3JTGA 1YFHA 1LQ1A 5DVFA 3ILTB 2QS2A 3FD3A 3IKVA 1PC3A 4N9HA 2ISYA 3U94A 4Z0IA 1B3LA 2W24A 1P1OA 4LG0B 3TQNA 3CFLA 1US5A 4YB6A 3FV1A 2ABHA 5ICEA 4ZYDA 3BROA 5I2NB 3ODBA 4NWDA 1D9VA 1R5GA 3O9PA 1JGSA 2O8XA 1MY1A 2Z5UA 1URDA 3GLBA 5DT6A 3TKDA 1T98A 5JI6A 1KQ9A 3K2DA 2ZBKA 2W7YA 1JE8A 1IXCA 3BJ6A 1UCRA 3RKXA 3VVFA 2VBYA 4GXOA 4FECA 3GW2A 3VE1B 3RUMA 4OFLA 1ZLQA 5ICTA 1UIVA 3CVGA 4LMYA 1POY1 1TBXA 1GXQA 4L9VA 1Y1MA 3Q29A 1MXXA 3G3ZA 4ZE9A 3BWGA 4GYGA 3ILUB 1FTMA 5DUIA 1XMAA 4OFOA 1L5TA 3T1BA 3C18A 4PCQA 4LGWA 2Y7RA 4P0IA 1B3HA 4HCWA 2CYYA 2PJPA 3RGYA 4HAMA 3LBSA 3PPOA 4NF6A 2DE2A 3LWFA 4HZFA 3IC7A 3TTRA 4QSCA 1QVSA 2WC2A 1USSA 4YIIA 1IXSB 4EJTA 2O68A 3N5LA 4KIBA 1LDJA 3O2AA 3PPPA 3T96B 3LSTA 5IT3A 4HX8A 3UN6A 4I09A 5CMKA 1JW5A 1SD4A 4FJPA 5E17F 2Q8KA 2P6TA 5HOOA 5J8CA 5FHMA 3GFMA 2GIVA 2PG4A 3TO9A 2L54A 5H20A 4G7HF 3CSGA 2FXAA 4GXAA 5AA1A 2QJEA 3SEWA 1F9NA 4LFUA 5JTYA 2QQBA 1NL5A 3MPLA 1YO5C 1B5IA 4H6DA 2M5WA 4IB2A 2JZYA 4IO5A 1JQFA 1P4AA 1HSTA 1S8NA 3JW4A 4XSZF 1LB9A 2A5TA 2V3QA 3H3GA 2I0CA 2GZWA 3OOAA 2IJLA 1BI2A 2RCAA 1J75A 4GGGA 5LHHA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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