The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
6
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sequence length |
67
|
structure length |
67
|
Chain Sequence |
NLQNGPIYARVIQKRVPNAYDKTALALEVGELVKVTKINVSGQWEGECNGKRGHFPFTHVRLLDQQN
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Signaling protein
|
| molecule keywords |
v-crk sarcoma virus CT10 oncogene homolog isoform a
|
| publication title |
Structural basis for the transforming activity of human cancer-related signaling adaptor protein CRK.
pubmed doi rcsb |
| source organism |
Homo sapiens
|
| total genus |
6
|
| structure length |
67
|
| sequence length |
67
|
| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2005-11-10 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF07653 | SH3_2 | Variant SH3 domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2PZ1 A; 3PVL A; 4OMQ A; 1MV0 B; 2KRS A; 3H0H A; 2KXD A; 1WI7 A; 1H92 A; 2K6D A; 2DBM A; 2K7A A; 2HBW A; 2LMJ A; 2DMO A; 1OOT A; 4Z89 A; 1ZUU A; 1SEM A; 1WXB A; 1ABO A; 4RUG A; 2J06 A; 1LCK A; 1AZG B; 1UGV A; 1UHF A; 2MIO A; 1X6G A; 1K9A A; 4J9F A; 2DX1 A; 2LQN A; 3CQT A; 2H8H A; 2LCS A; 4RTY A; 2KR3 A; 1YP5 A; 2ROT A; 1CSK A; 5EC7 A; 3R6N A; 2AKK A; 4EIK A; 1CKA A; 2EBP A; 2DL5 A; 2RN8 A; 2C0I A; 1AWJ A; 4IIO A; 2KRO A; 3THK A; 1BBZ A; 2O88 A; 3H0F A; 2BZX A; 1JU5 C; 2J6F A; 4JJD A; 1AWO A; 1AZE A; 4AG1 C; 3M0R A; 4OML A; 2AKL A; 2EPD A; 1ZX6 A; 3EGU A; 1RI9 A; 1SHG A; 2DIL A; 2F2V A; 3UAT A; 3JV3 A; 3PE0 A; 1AD5 A; 4Z8A A; 2KYM A; 3UA6 A; 4AFS C; 4ZNX A; 1NEB A; 1E7O A; 3M0Q A; 2O31 A; 2I0N A; 2W10 A; 4J9G A; 2ENM A; 2AZV A; 1XOV A; 1X2Q A; 4J9H A; 2CH4 W; 1PRM C; 1T3L A; 1KFZ A; 4M4Z A; 1SSH A; 2QDL A; 1GFC A; 2LX7 A; 3I5S A; 1T3S A; 2VVK A; 1M30 A; 2YSQ A; 1NYF A; 1W1F A; 2FPF A; 3TSZ A; 2K2M A; 1S1N A; 4AFQ C; 1SRM A; 1JQQ A; 4CC2 A; 4R0K A; 3I9Q A; 4GBQ A; 1HJD A; 2A37 A; 1HSQ A; 2KRN A; 5I22 A; 2YT6 A; 1PRL C; 3A98 A; 1GCQ A; 1YCS B; 1I0C A; 1G2B A; 5FWC A; 4OMO A; 3VRY A; 2F2X A; 1JO8 A; 2RQT A; 2FRW A; 4K11 A; 4AG2 C; 1X6B A; 3O5Z A; 3TSW A; 1KIK A; 4DEX A; 5FWB A; 2HEQ A; 3M0U A; 1SPK A; 2C0O A; 2RNA A; 2SRC A; 5ECA A; 1RLQ C; 1H8K A; 2L3Q A; 4GLM A; 1ZBJ A; 1I1J A; 1NM7 A; 2D1X A; 1NLP C; 2DA9 A; 4WCI A; 1JXM A; 4DEY A; 2RQR A; 4F17 A; 1BB9 A; 4J9I A; 1WA7 A; 3EG2 A; 2CSI A; 1X69 A; 2FPD A; 2BTT A; 3VS2 A; 2DF6 A; 1E6G A; 1W6X A; 2MCN A; 2KRM A; 4JPB W; 2DL8 A; 4OMN A; 2EW3 A; 1UTI A; 2O9S A; 2ABL A; 2IIM A; 1M27 C; 2ROL A; 4J9B A; 2JS0 A; 5GJW B; 1AEY A; 4D8K A; 2NUZ A; 2X3W D; 2K9G A; 4E6R A; 2GTJ A; 2CT4 A; 3IQL A; 1UDL A; 2BZ8 A; 4J9D A; 2OJ2 A; 2DL4 A; 1UG1 A; 1A0N B; 2EGC A; 1OV3 A; 5GJV B; 1BK2 A; 1PKT A; 2CSQ A; 1I07 A; 3NHN A; 1UJ0 A; 1GCP A; 3LH5 A; 2LP5 A; 4Z88 A; 2L3P A; 2MOX A; 2E5K A; 1ABQ A; 1WLP B; 1B07 A; 3TVT A; 3NMZ C; 4RTT A; 2X3X D; 1PHT A; 2DRK A; 2K3B A; 4RTU A; 3REB B; 2FEI A; 2LJ1 A; 1ARK A; 2JW4 A; 1MUZ A; 2PTK A; 2A08 A; 1SHF A; 1K76 A; 1W70 A; 4LN2 A; 2EYX A; 2CH4 A; 1AWW A; 3VRZ A; 2JMA A; 2JTE A; 1YWP A; 2OI3 A; 1Y57 A; 1PNJ A; 2EYZ A; 4HCK A; 3EG0 A; 2JMC A; 1GCQ C; 2XMF A; 3NGP A; 1GFD A; 1UE9 A; 3VS6 A; 1RLP C; 1X43 A; 1X2K A; 2DM1 A; 1GBR A; 2DNU A; 4D8D A; 1OEB A; 4RTX A; 2AK5 A; 4ESR A; 2KNB B; 2JM8 A; 5IXB A; 2FG0 A; 2LNH B; 3I35 A; 2LJ3 A; 2EVR A; 1BU1 A; 2G6F X; 2CT3 A; 5L23 A; 4AFU C; 1OPK A; 1VYT A; 1WYX A; 2OAW A; 5HCK A; 3UA7 A; 1T0J A; 2L3S A; 2V1Q A; 1K4U S; 2ED1 A; 1UEC A; 1VYV A; 1M3B A; 4HVU A; 4F16 A; 1WIE A; 2D0N A; 2O9V A; 2DYB A; 2RF0 A; 2DL3 A; 4RTZ A; 2GTO A; 1KSW A; 4LNP A; 3EHR A; 1HD3 A; 1QKX A; 2RPN A; 3FJ5 A; 2CUD A; 3PVQ A; 1E6H A; 2AZS A; 3VS3 A; 1YN8 A; 2KE9 A; 2KBT A; 2FRY A; 2EYW A; 1OPL A; 2J6O A; 5IHK A; 1UFF A; 2P4R A; 4FSS A; 4RTV A; 1ZUY A; 2J6K A; 1ZUK A; 2YUP A; 2LJ0 A; 2ECZ A; 2FPE A; 2HSP A; 2A28 A; 1GBQ A; 4A63 B; 1SRL A; 2GGR A; 1AVZ C; 1CKB A; 2J05 A; 2DVJ A; 2W0Z A; 1NYG A; 2GBQ A; 2DJQ A; 2KT1 A; 3VS7 A; 3QWX X; 2YUN A; 2YDL A; 4LE9 A; 4ORZ A; 1PKS A; 4JZ4 A; 1AOJ A; 2JM9 A; 4OMP A; 2FO0 A; 4HVW A; 1B3Q A; 1YNZ A; 1EFN A; 1QKW A; 1ZSG A; 1WDX A; 4KRT A; 4LUE A; 1PWT A; 2D8J A; 1WFW A; 4X1V A; 1QWE A; 2KT8 A; 2J7I A; 3SEM A; 1TUC A; 2HCK A; 4OMM A; 1NG2 A; 1TG0 A; 2A36 A; 2ED0 A; 2M0Y A; 2EQI A; 3EG1 A; 4J9C A; 3EHQ A; 2YUO A; 2JXB A; 3RBB B; 3SHW A; 2SEM A; 2VKN A; 5IHN A; 2V1R A; 5FW9 A; 5IXF A; 2L0A A; 4QT7 A; 1U06 A; 4Y92 A; 1QCF A; 5I11 A; 2B86 A; 4JJC A; 4HVV A; 1U3O A; 2NWM A; 2YUQ A; 1U5S A; 1TUD A; 2F2W A; 2C0T A; 2K79 A; 3GBQ A; 1UUE A; 2EKH A; 3M0T A; 3NPF A; 1AWX A; 2RQV A; 4HXJ A; 1M3C A; 4CC3 A; 3QWY A; 1T0H A; 1FYN A; 1V1C A; 2JS2 A; 4CC7 A; 1UHC A; 1UJY A; 2HDA A; 2EGE A; 1YWO A; 3UF4 A; 1WXT A; 1N5Z A; 2KEA A; 3RNJ A; 2CUB A; 1FMK A; 2D8H A; 2EGA A; 2GNC A; 3VS5 A; 2PNI A; 3M0S A; 2O2O A; 4JJB A; 3EG3 A; 5IHI A; 2LZ6 B; 2RQU A; 1NLO C; 1K1Z A; 1GRI A; 2KYB A; 3C0C A; 1G83 A; 3M0P A; 4J9E A; 3ZL7 C; 1Y0M A; 2KXC A; 1IO6 A; 1QLY A; 1JEG A; 3REA B; 1WX6 A; 1VYU A; 2DRM A; 3KFV A; 3VS0 A; 2BZY A; 2ESW A; 1J3T A; 3ULR B; 3U23 A; 1M3A A; 2EYY A; 3VS1 A; 2DBK A; 2DL7 A; 2JT4 A; 2VWF A; 3H41 A; 4F14 A; 1ZLM A; 1RUW A; 2RQW A; 1K0S A; 1NEG A; 1KJW A; 1JXO A; 1VA7 A; 2RMO A; 1Z9Z A; 3VS4 A; 4CC4 B; 5IH2 A; 1K0X A; 1Z9Q A; 4JZ3 A; 2M51 A; 3H0I A; 2GQI A; 2L2P A; 4AFZ C; 1GL5 A; 2CRE A; 4LUD A; 1MV3 A; 2CDT A; 2DLP A; 1WXU A; 1M8M A; 2DE0 X; 4IIM A; 1X27 A; 3I5R A; 2KGT A; 4RTW A; 1QWF A; 1H3H A; 2LQW A; #chains in the Genus database with same CATH topology 2DK3 A; 2K5F A; 4OMQ A; 3VKI A; 1MV0 B; 2KRS A; 3H0H A; 4KGX B; 3UT1 A; 1WI7 A; 4C8Q C; 1OOT A; 2PU9 B; 1X6O A; 1ZUU A; 2V26 A; 1OYX A; 1WXB A; 4N4G A; 4N0A A; 3OY9 A; 1Q86 R; 3EG9 A; 4PJO G; 2LQ8 A; 4FL6 A; 1VQM A; 3CCS T; 1PM3 A; 1YFN A; 3MKD A; 1SF9 A; 5CAI A; 3ASK A; 1B7T A; 1YP5 A; 5A0L A; 4RKU E; 2EBP A; 4M75 F; 2DXB A; 4M7D E; 2DAQ A; 5GAN d; 3CME T; 2NLU A; 1AWO A; 3CCJ T; 4AG1 C; 3FDR A; 3OYN A; 3MPU B; 3CCL Q; 3EGU A; 2P84 A; 5GAN 7; 3A8M B; 2DIL A; 4X34 A; 3HFO A; 3FEO A; 1D1A A; 1QVF S; 4C8Q B; 1KD1 U; 3CCR A; 1YJW Q; 1M1F A; 2QEX T; 2E6Z A; 2RI3 A; 3JB9 D; 4LDX A; 1Q86 C; 3OS2 A; 5KYU A; 4LDW A; 2I0N A; 4CI0 C; 3CBO A; 2W10 A; 4J9G A; 4M7A A; 4A53 A; 2AZV A; 2HKQ B; 4C92 C; 3HHT B; 4QQ6 A; 1XOV A; 3EFR A; 4J9H A; 3PIP A; 2P0K A; 5LJ3 d; 2CH4 W; 1RAF B; 5GAN 2; 4A4E A; 4A4K A; 1KFZ A; 2QI2 A; 5D6X A; 3ZFJ A; 4JRP A; 4M78 A; 1D0Z A; 3L42 A; 3WVE B; 3CCS Q; 4II1 A; 1G5V A; 2H3J A; 3OYK A; 4R0K A; 5KYY A; 1HJD A; 4PKC C; 4O6J A; 4XU3 A; 5I22 A; 1YBY A; 3A98 A; 3LGL A; 2QAZ A; 2FB7 A; 1I0C A; 4F7U G; 4PJL A; 1Y71 A; 2MF2 A; 1G2B A; 3CME Q; 3KXT A; 5FWC A; 1MGQ A; 2QAS A; 3JCM h; 3CCJ Q; 1LVK A; 2EQM A; 4XTZ A; 1KK7 A; 1U1T A; 4J6Y A; 3O5Z A; 2V8I A; 1SPK A; 1X01 A; 1YIJ A; 4LDY A; 1QVG A; 3M5A A; 4GLM A; 3G71 T; 4BE0 A; 5LJ5 j; 1NM7 A; 1JXM A; 4M7A D; 3O8V A; 2VGM A; 4F17 A; 4J9I A; 4PJO C; 2KMT A; 2RHZ A; 2BTT A; 3E19 A; 1PCX A; 1WHH A; 3CC7 T; 2XD0 A; 4M78 D; 4AT1 B; 3JB9 F; 1D0Y A; 1Q82 U; 1HYO A; 2F69 A; 1AT1 B; 2O9S A; 1M27 C; 2ROL A; 4J9B A; 3I56 T; 2NUZ A; 2X3W D; 3OS0 A; 2K9G A; 3J81 E; 2GFA A; 1VQM T; 2XK0 A; 1K73 U; 2QQS A; 2NUP B; 5I21 A; 1UG1 A; 2EGC A; 1N9R A; 1OV3 A; 2DTI A; 4BI3 A; 1N8R C; 2DYI A; 2YLC A; 2HAX A; 2R5M A; 4Z88 A; 2MOX A; 4MDW A; 3TCJ A; 4L6V 5; 3VUB A; 1KQS P; 4KGZ B; 1M2V B; 2PVD B; 1FMW A; 2DRK A; 4M75 B; 4RTU A; 1ARK A; 3QO3 A; 1MUZ A; 3G71 Q; 2PTK A; 3EGX A; 1W70 A; 5AYF A; 1I81 A; 1AWW A; 3VRZ A; 3CCR T; 1YWP A; 2OI3 A; 2X51 A; 4Z02 A; 1PNJ A; 3EG0 A; 2YRC A; 3OS1 A; 4M7D G; 3GNF B; 3NGP A; 1YIT A; 3CC7 Q; 1UGP B; 4M7A F; 2IVW A; 1GFD A; 2DD4 A; 4C5G A; 2P0Q A; 3M59 A; 3RKW A; 4JJN K; 2VC8 A; 1GBR A; 3I56 Q; 2A3L A; 2LCL A; 4D8D A; 4M78 F; 4NS5 A; 3L2Q A; 3M4G A; 2FL7 A; 3VYH B; 2JM8 A; 1TOV A; 1G3W A; 1VQL A; 2YRD A; 2CT3 A; 1OPK A; 1T0J A; 1K4U S; 2V1Q A; 2JJ9 A; 2ED1 A; 3QYG B; 5CR2 A; 4FYV B; 1QCO A; 4OVA A; 3CCM T; 1Q81 R; 2E4H A; 2LQK A; 2O9V A; 1QVP A; 1OI1 A; 4A4H A; 4M77 E; 3J80 E; 1MND A; 3EHR A; 4QVD A; 3QG1 A; 3PVQ A; 1X75 C; 1YIJ T; 1YJN A; 2RB6 A; 4PFP A; 1VIF A; 1OPL A; 2P4R A; 8AT1 B; 4KH1 B; 4Y28 E; 3CCR Q; 1TS9 A; 1ZUK A; 4HT8 A; 2LJ0 A; 2DJZ A; 2XID A; 3QBY A; 2QQB A; 2NUT B; 2V8K A; 1NYG A; 5GAN h; 2GBQ A; 2RD1 A; 3CXC P; 5KYX B; 3JCM f; 2KT1 A; 3VS7 A; 3QWX X; 4CRI A; 3GLX A; 3CCU A; 2LT1 A; 4OMP A; 2ZPI B; 4HVW A; 3LH0 A; 3AT1 B; 4LUE A; 3INZ A; 4RG8 A; 1PWT A; 3LGF A; 2KVQ G; 3M53 A; 1WHL A; 1GXI E; 3CCQ A; 1M4Z A; 2YRV A; 2KT8 A; 5D6W A; 3CCM Q; 2K4Y A; 3CCV A; 3DLL A; 1RAH B; 2M0Y A; 2EQI A; 2LCC A; 2P0P A; 1XNI A; 4J5Y A; 4C8Q A; 2DZC A; 2JXB A; 2SEM A; 2VKN A; 3QDR B; 3RUX A; 4E47 A; 4XTY A; 5IXF A; 5KCO A; 1ACM B; 5HKC A; 5I11 A; 4JJC A; 1U3O A; 2JOY A; 4XK8 E; 1TUD A; 4FYY B; 1AWX A; 1G3S A; 2RQV A; 1M3C A; 4CC3 A; 1V1C A; 2JS2 A; 4RCB A; 4CC7 A; 2RI2 A; 2QXF A; 1VQO T; 1YIT T; 1KQS A; 2EGE A; 1IB8 A; 3UF4 A; 2KEA A; 3RNJ A; 2XG8 D; 3CCE T; 1FMK A; 2PNI A; 3M0S A; 2L3R A; 2O2O A; 3ER0 A; 6AT1 B; 2CP2 A; 5IHI A; 5M9O A; 1ZSZ C; 2MYS A; 1K1Z A; 2E70 A; 3OYC A; 4C0Z A; 1IO6 A; 3TEE A; 3BE3 A; 1EX4 A; 2WAC A; 3KFV A; 3HPW A; 1WJS A; 4C8Q D; 5A0G A; 2DIQ A; 3ULR B; 3NTH A; 4OGC A; 2JT4 A; 4F14 A; 2M0O A; 4C92 A; 4ELZ C; 5IH2 A; 5GMK m; 3CCL A; 4JZ3 A; 2M51 A; 3VYG A; 2GQI A; 2HL3 A; 2ZPF B; 2DPP B; 2RM4 A; 3BDL A; 4AFZ C; 3S3N A; 1GL5 A; 3F70 A; 3OA6 A; 2M1H A; 1YJW A; 1M8M A; 2DE0 X; 1NPR A; 3UWN A; 3I5R A; 1WZO A; 4RTW A; 5GAN e; 1VQO Q; 4E7S A; 1M8V A; 1MHN A; 4M75 E; 4M77 G; 5EG2 A; 1ZSZ B; 2X4J A; 3DLM A; 3CCE Q; 2FVU A; 2K7A A; 2VB6 A; 2OTJ A; 2NUP A; 2QK0 A; 3J7A F; 3EFS A; 3T9N A; 3GOX A; 1JJ2 A; 4RUG A; 2J06 A; 2ZPB B; 1VQ8 A; 1UHF A; 4HCB A; 4B9W A; 5IN1 A; 5CCA A; 1K9A A; 3HFN A; 3MEU A; 1MMG A; 3RR6 A; 3CXC A; 5A2Q E; 2MI6 A; 2LQN A; 3H6Z A; 3GP8 A; 3BDU A; 4LXC A; 3CCV T; 2ROT A; 3R6N A; 4C92 D; 2AKK A; 4PJO A; 3L2U A; 4NL3 A; 2DL5 A; 5GAN f; 2C0I A; 3CME A; 3CCJ A; 4C8Q F; 4JUV A; 5CO7 A; 2BZX A; 1FMV A; 4JJD A; 3MET A; 3A5Z B; 3GNG A; 2ATC B; 3OSS C; 3G7Z A; 1OX8 A; 1SHG A; 4ZGD B; 5DM7 R; 3UPU A; 3S3O A; 2VYT A; 2JTF A; 5IT9 E; 3C94 A; 3EH2 A; 3JV3 A; 2K3X A; 1AD5 A; 2CP7 A; 5J26 A; 4XTX A; 1Q7Y U; 2Y90 A; 4LDU A; 4ZNX A; 3QSU A; 1NEB A; 1E7O A; 2CP0 A; 3M0Q A; 5CQY A; 5LJ3 f; 5LJ5 h; 2GFU A; 2MAM A; 5HK3 A; 3C4S A; 1SSH A; 1NJI R; 1GFC A; 2DTO A; 1NYF A; 1W1F A; 2FPF A; 5GAO m; 3JAM E; 3RER A; 1BIB A; 2DO3 A; 2LNV A; 3EAE A; 4PJO D; 1SRM A; 1JQQ A; 4CC2 A; 2NYS A; 2FZG B; 4GBQ A; 2A37 A; 1HSQ A; 5A0D A; 2VGN A; 2YT6 A; 4X9C A; 1NBE B; 2A7Y A; 3G1J A; 2QA4 A; 1YCS B; 3OYI A; 2E3H A; 1JRI A; 4E7K A; 4BB7 A; 2FZK B; 1IZ6 A; 1M1K R; 4C92 F; 7AT1 B; 4AG2 C; 1JO8 A; 4K11 A; 2FRW A; 1BI0 A; 1WPY A; 2NUT A; 3M0U A; 2RK2 A; 2C0O A; 1BKB A; 2SRC A; 3PNW C; 5DY9 A; 5ECA A; 3M9Q A; 1VQP A; 2D6F A; 1WJR A; 2XHC A; 5KYX A; 2L3Q A; 1TXQ A; 1ZBJ A; 5GAN 3; 2D1X A; 2DA9 A; 1TSF A; 2RO0 A; 4XQ3 A; 1O75 A; 2XKO C; 5LJ5 g; 4KBM B; 4C0D C; 2I2L A; 3CC7 A; 4GY5 A; 1U8R A; 4KT0 E; 2JZ2 A; 4KGV B; 1NJI C; 4HT9 A; 8ATC B; 2MCN A; 2LRQ A; 2KRM A; 2XDD A; 2OTJ T; 3I56 A; 1K8A R; 2DL8 A; 2QQ9 A; 2PUO B; 1W2B P; 4XTW A; 1VQ8 T; 3P8D A; 4OB1 B; 4D8K A; 3GF5 A; 4E6R A; 4KUD K; 2CT4 A; 3IQL A; 2CP3 A; 1M1K C; 4J9D A; 1IGQ A; 1BK2 A; 1PKT A; 3TQ7 P; 2ZGW A; 4PJO F; 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