The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
12
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sequence length |
62
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structure length |
62
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Chain Sequence |
MDETGKELVLALYDYQEKSPREVTMKKGDILTLLNSTNKDWWKVEVNDRQGFVPAGYVKKLD
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Signaling protein
|
| molecule keywords |
Spectrin alpha chain, brain
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| publication title |
Cooperative propagation of local stability changes from low-stability and high-stability regions in a SH3 domain
pubmed doi rcsb |
| source organism |
Gallus gallus
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| total genus |
12
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| structure length |
62
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| sequence length |
62
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2005-11-18 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00018 | SH3_1 | SH3 domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1ZX6 A; 2CSI A; 1X2Q A; 1VYU A; 1K1Z A; 2DBK A; 1YN8 A; 2F2V A; 2DLP A; 1X2K A; 2YT6 A; 1SSH A; 4J9F A; 2YUN A; 2KRN A; 4LN2 A; 2EYX A; 2DL3 A; 2DRK A; 2RQT A; 4JJB A; 4J9E A; 1VYV A; 1GFC A; 1BU1 A; 2RF0 A; 1KJW A; 2J6O A; 4RTZ A; 4Z8A A; 4JPB W; 1UHC A; 4DEX A; 1KIK A; 5IHI A; 2CH4 A; 1HD3 A; 2RMO A; 1WDX A; 2KXD A; 2V1R A; 3TSZ A; 5IXF A; 2C0I A; 1OOT A; 1VA7 A; 1AVZ C; 2AZS A; 1I07 A; 1H92 A; 1WX6 A; 2MOX A; 1M3A A; 2J06 A; 2DNU A; 4RUG A; 2KT8 A; 1SRM A; 2H8H A; 3ZL7 C; 1NLO C; 5HCK A; 1YP5 A; 2CH4 W; 1G83 A; 2A36 A; 3VS7 A; 2FG0 A; 1AEY A; 1KSW A; 1A0N B; 2GBQ A; 2PNI A; 2YUP A; 1QKW A; 5GJV B; 2O88 A; 2W10 A; 1T3S A; 2BZX A; 5IHK A; 2O9S A; 1H3H A; 3EG0 A; 2D8H A; 3THK A; 4F14 A; 2RQR A; 3I5R A; 1T3L A; 3C0C A; 2C0T A; 4OML A; 2VWF A; 1AWJ A; 2YSQ A; 2A28 A; 2EVR A; 4M4Z A; 2FRW A; 1UE9 A; 2XMF A; 3A98 A; 1PWT A; 2FRY A; 4GLM A; 1IO6 A; 2K2M A; 1ZUY A; 3VS5 A; 1QWF A; 4J9H A; 2DL4 A; 1UFF A; 1AWX A; 4AFS C; 3LH5 A; 5FWC A; 1WYX A; 4D8K A; 2CUD A; 4Y92 A; 5I11 A; 1GCQ C; 2C0O A; 2CT4 A; 1QCF A; 3M0T A; 1GCQ A; 1I1J A; 2VVK A; 1JU5 C; 1RLQ C; 1SPK A; 2JT4 A; 2EKH A; 4HVW A; 1UTI A; 4K11 A; 2W0Z A; 1Z9Q A; 1M8M A; 2DE0 X; 2M51 A; 1S1N A; 3PVQ A; 1E6G A; 2JS2 A; 2EBP A; 3H0F A; 1W1F A; 1OEB A; 1PHT A; 2JMA A; 4J9I A; 1HSQ A; 3M0R A; 2D0N A; 3H41 A; 2J05 A; 2CDT A; 4OMQ A; 1WXU A; 2L3Q A; 1NEB A; 2LMJ A; 2J7I A; 4FSS A; 2KRO A; 1G2B A; 2LJ3 A; 1PKS A; 2HSP A; 3ULR B; 2SEM A; 2O9V A; 1ZBJ A; 1WXB A; 2DJQ A; 2GNC A; 3VS1 A; 3EHQ A; 2DVJ A; 2L3P A; 1Y57 A; 1WFW A; 3REB B; 2KEA A; 1SHG A; 4RTX A; 2QDL A; 1PRM C; 2KYB A; 1NM7 A; 3RNJ A; 1ZUU A; 4J9G A; 1AWW A; 2ESW A; 2A08 A; 2ED0 A; 2F2X A; 1N5Z A; 4ORZ A; 5EC7 A; 2FO0 A; 1JQQ A; 2GTO A; 4OMM A; 2DIL A; 3PVL A; 4F16 A; 3SHW A; 2OI3 A; 1LCK A; 2DBM A; 2AK5 A; 3U23 A; 5IH2 A; 2CRE A; 2FPD A; 4LUE A; 2RPN A; 2EYZ A; 1GCP A; 1WLP B; 2KXC A; 2J6F A; 2DL7 A; 2FPE A; 2JXB A; 1AD5 A; 4CC7 A; 5FWB A; 4X1V A; 2RQV A; 3VS2 A; 1WIE A; 2LZ6 B; 2RQW A; 3VS4 A; 5I22 A; 1GFD A; 2FEI A; 1U5S A; 1X6B A; 2LX7 A; 3TVT A; 1KFZ A; 3I5S A; 2AKK A; 1AWO A; 1YWP A; 1UGV A; 3I9Q A; 4J9D A; 1FYN A; 2MIO A; 2KT1 A; 2DMO A; 2KYM A; 1M3C A; 2DYB A; 2I0N A; 2EYW A; 4ZNX A; 2P4R A; 3M0S A; 4QT7 A; 2AZV A; 1ZUK A; 4ESR A; 2DF6 A; 2O31 A; 1E7O A; 3QWY A; 3M0U A; 1B07 A; 1T0J A; 2RNA A; 1K9A A; 4JJC A; 1MV0 B; 1YNZ A; 2O2O A; 2CT3 A; 2EW3 A; 4IIO A; 3M0P A; 1BB9 A; 1BK2 A; 2X3X D; 1I0C A; 3VRZ A; 1CSK A; 3UAT A; 1AZE A; 1NLP C; 4WCI A; 2OJ2 A; 4D8D A; 3PE0 A; 1SRL A; 2JS0 A; 2EPD A; 3I35 A; 1K0S A; 3CQT A; 2LQW A; 4OMP A; 1M30 A; 1OPK A; 1FMK A; 2KNB B; 1AOJ A; 4J9B A; 3M0Q A; 2EGE A; 4Z88 A; 1V1C A; 1TG0 A; 3QWX X; 2KBT A; 1NYG A; 2AKL A; 1U06 A; 1QWE A; 1GL5 A; 2K9G A; 2EYY A; 2YDL A; 2X3W D; 2EGA A; 1ABO A; 4JJD A; 3EG2 A; 3UA7 A; 3H0I A; 2HEQ A; 1K76 A; 3NGP A; 3R6N A; 4CC2 A; 1EFN A; 2A37 A; 3EG1 A; 2JMC A; 4J9C A; 2K3B A; 1X43 A; 4LUD A; 4CC4 B; 2LQN A; 2LJ1 A; 1ARK A; 4HVU A; 2OAW A; 2L2P A; 2DRM A; 3O5Z A; 4EIK A; 2MCN A; 3JV3 A; 1SHF A; 4HXJ A; 4DEY A; 2LCS A; 4AFQ C; 1QLY A; 1J3T A; 2BTT A; 2NUZ A; 2YUQ A; 1GBR A; 5FW9 A; 4OMO A; 3TSW A; 1K4U S; 2ABL A; 2YUO A; 2DM1 A; 4AFU C; 2HDA A; 1XOV A; 1OV3 A; 1UJ0 A; 1Y0M A; 2BZY A; 1X27 A; 3UF4 A; 1PKT A; 2JM9 A; 2GGR A; 2JM8 A; 3NHN A; 1ZLM A; 1OPL A; 1Z9Z A; 2V1Q A; 1E6H A; 2M0Y A; 1CKB A; 2LJ0 A; 2ROL A; 3VS6 A; 1ABQ A; 1UEC A; 2KR3 A; 2L0A A; 3RBB B; 2D1X A; 3UA6 A; 1H8K A; 2SRC A; 2L3S A; 4LE9 A; 4F17 A; 2RQU A; 4HCK A; 2G6F X; 5IHN A; 1BBZ A; 4JZ4 A; 4A63 B; 1B3Q A; 4IIM A; 1UG1 A; 2KE9 A; 2K79 A; 2DX1 A; 4AFZ C; 1YCS B; 1M27 C; 3VS0 A; 1RI9 A; 1WI7 A; 1NG2 A; 4HVV A; 2J6K A; 1TUC A; 2ENM A; 1PRL C; 4RTY A; 2RN8 A; 4JZ3 A; 4RTV A; 1JO8 A; 1K0X A; 4CC3 A; 4Z89 A; 3REA B; 2VKN A; 1JXO A; 2CSQ A; 2GTJ A; 3NPF A; 1GRI A; 4RTT A; 1X6G A; 2PTK A; 1W70 A; 2LNH B; 5ECA A; 1HJD A; 1ZSG A; 3EHR A; 4AG2 C; 2FPF A; 1RUW A; 1W6X A; 4OMN A; 1MUZ A; 2KRS A; 5GJW B; 2GQI A; 3VS3 A; 3NMZ C; 2D8J A; 2KGT A; 1JXM A; 1AZG B; 1WXT A; 1CKA A; 1T0H A; 1VYT A; 5IXB A; 1M3B A; 1RLP C; 3SEM A; 1NEG A; 2PZ1 A; 3IQL A; 4R0K A; 4RTU A; 4RTW A; 1U3O A; 3H0H A; 2LP5 A; 1WA7 A; 2IIM A; 3VRY A; 2BZ8 A; 2ED1 A; 1MV3 A; 2JTE A; 2K6D A; 5L23 A; 1UHF A; 1YWO A; 3FJ5 A; 1JEG A; 2HBW A; 3EG3 A; 2KRM A; 2F2W A; 1NYF A; 2DA9 A; 2DL8 A; 3EGU A; 2CUB A; 3KFV A; 1PNJ A; 1QKX A; 1SEM A; 2JW4 A; 4AG1 C; 4E6R A; 1X69 A; 4GBQ A; 4LNP A; 2EQI A; 1GBQ A; 2E5K A; 2ROT A; 1UUE A; 2NWM A; 1UDL A; 2B86 A; 2DL5 A; 3GBQ A; 2ECZ A; 2K7A A; 2HCK A; 1UJY A; 4KRT A; 2EGC A; 1TUD A; #chains in the Genus database with same CATH topology 1ZX6 A; 1LPL A; 2KSS A; 2MYS A; 2RHX A; 1BCO A; 1MND A; 2DLP A; 5GAO n; 4J9F A; 4J7F A; 2KRN A; 4LN2 A; 2QQ9 A; 2EYX A; 5KYW B; 3VYH B; 4A4H A; 4J9E A; 1GFC A; 3VU3 C; 3CCL T; 1ZSZ B; 1MMN A; 2HQH A; 1QVG S; 5IXF A; 4HT8 A; 1VQK T; 1K73 C; 2VGN A; 2J06 A; 4RUG A; 2Y4X A; 1IGU A; 2NUT B; 3PT9 A; 3OYI A; 3I55 Q; 1VQ7 Q; 1VQO A; 5HCK A; 1YP5 A; 1AEY A; 3OMC A; 3EH2 A; 1A0N B; 2GBQ A; 3MO8 A; 2PNI A; 3G4S A; 2CYZ B; 3M57 A; 2BZX A; 5IHK A; 2O9S A; 1X01 A; 3QO3 A; 4F04 B; 2CP5 A; 3GLX A; 2C0T A; 4OML A; 2X51 A; 4M4Z A; 2A28 A; 1UE9 A; 2XG8 D; 3LW5 E; 2GCX A; 3RKW A; 3PGG A; 4LD9 K; 3CC2 Q; 1WHH A; 2DTH A; 1VQ4 Q; 2L3R A; 5CKD A; 4C8Q E; 1S72 A; 3TU4 K; 2CUD A; 3CCQ Q; 2FB7 A; 3EGD A; 3OW2 S; 2EWN A; 1XTD A; 1I1J A; 4GY5 A; 1DJ7 B; 1JU5 C; 2DET A; 1SPK A; 5GAO m; 4M7A A; 3P8B B; 5I2M A; 5GAM j; 1UTI A; 1Z9Q A; 8AT1 B; 1RL2 A; 1S1N A; 3PVQ A; 4XTY A; 1E6G A; 2JS2 A; 1W1F A; 2MPX C; 3JCM h; 2XHC A; 4ZN3 A; 2MK5 A; 1WXU A; 2MWO A; 2QAS A; 2Y4Y A; 4DBR A; 2J7I A; 3A8L B; 1WHL A; 2RA2 A; 2K2V A; 1N8R U; 2LJ3 A; 5CK9 A; 2EQM A; 1VQ8 A; 1RAF B; 3L1A A; 1G8X A; 2HSP A; 4ATO A; 2JTF A; 2YHT A; 2VYT A; 5LJ5 g; 2GNC A; 2LX9 A; 3AHU A; 1SSF A; 1Y57 A; 4HT9 A; 3REB B; 1SHG A; 2MWP A; 2K4Y A; 4A4E A; 1ZUU A; 2OTJ T; 4J9G A; 1OI1 A; 3CCV A; 2ESW A; 1O75 A; 2A08 A; 5CQY A; 2HAX A; 5EC7 A; 3MKD A; 1XNI A; 2DIL A; 3HFN A; 3QBY A; 4FIB A; 3SHW A; 1BCM A; 4P5N A; 5C0M A; 1VQ9 Q; 5LJ5 e; 4J8O A; 3EFO B; 3G6E A; 3DB4 A; 2AK5 A; 3U23 A; 3H6Z A; 3QDF A; 1FXX A; 1GCP A; 1PCX A; 1ZBX A; 1N8R R; 3GPL A; 2FPE A; 1NPR A; 4E7H A; 1AD5 A; 4PNO A; 1GFD A; 2QDY B; 3M5A A; 1M9S A; 3TVT A; 2QQB A; 3VV0 A; 1N9R A; 1Y7X A; 3OYH A; 4HCZ A; 2COZ A; 2KT1 A; 5HK3 A; 3BDU A; 4MZM A; 2ZAE A; 4M77 F; 3HTR A; 4PJO C; 2HQX A; 2NUP B; 2P4R A; 3CBM A; 4QT7 A; 2DPP B; 4ESR A; 2DF6 A; 2E41 A; 2O31 A; 1E7O A; 2RNA A; 4JJC A; 1MV0 B; 2O2O A; 2F1L A; 5KYU A; 3J80 E; 2JOY A; 3C12 A; 1BB9 A; 2X3X D; 2KY9 A; 3EFR A; 3VRZ A; 1CSK A; 1YI2 T; 3UAT A; 1AZE A; 3OS1 A; 4XTV A; 4WCI A; 4D8D A; 2E5Q A; 3PE0 A; 1Q81 C; 3OS0 A; 2EPD A; 1K0S A; 3LLR A; 3G4S T; 4M75 C; 3HSB A; 3MHX A; 2LT4 A; 2OTJ Q; 5GAO q; 4V2S A; 3MEA A; 4A4K A; 1WPY A; 2KNB B; 1AOJ A; 1WQW A; 4BDY A; 4MML A; 4EMH A; 1I81 A; 3MEW A; 1KQS P; 1QP3 A; 2B8A A; 3FLG A; 3OS5 A; 4RKU E; 4C0F A; 2M1H A; 2VUB A; 4EMK B; 1NYG A; 2AKL A; 3MP6 A; 3BY7 A; 1VQ5 A; 2EYY A; 1I5O B; 2DO3 A; 1H64 1; 4NL2 A; 4JJD A; 3TEE A; 2P0K A; 1K76 A; 2LT1 A; 7AT1 B; 4F7U E; 2JMC A; 2ZPB B; 4JLI A; 4XTU A; 2K3B A; 1M1F A; 4FYX B; 4CC4 B; 2LQN A; 3QKJ A; 4QQG A; 2L2P A; 4FT4 A; 3LGL A; 1OU8 A; 3L2Q A; 4JRQ A; 4DEY A; 2LCS A; 4C92 A; 5IAY A; 5GMK e; 1GBR A; 3JSC A; 2QI2 A; 4FW2 A; 2HDA A; 1VIF A; 3QDR B; 1UGQ B; 2QGG A; 4EDU A; 3UF4 A; 1PKT A; 4IUT A; 1YIT A; 2KMT A; 1QVF P; 3PFS A; 3WVD B; 4BE0 A; 1G3T A; 5LJ5 j; 4C0Z A; 2V1Q A; 1VQO Q; 2LJ0 A; 3VKI A; 3G71 T; 1UEC A; 1YJ9 T; 2KR3 A; 3L2V A; 3RBB B; 3UA6 A; 3CCS A; 1H8K A; 2SRC A; 3G4S Q; 4HCK A; 1BBZ A; 4IIM A; 1FMV A; 1UG1 A; 2XDB A; 2DX1 A; 4AFZ C; 2LCC A; 3LYI A; 4M7A F; 3M54 A; 4HA8 A; 1NG2 A; 2K5I A; 4HVV A; 3E9F A; 2COW A; 5LL6 S; 2RN8 A; 4JZ3 A; 4F7U G; 3J81 E; 2AHJ B; 3SB2 A; 3MET A; 3REA B; 3X24 B; 4KBM B; 2GTJ A; 3NPF A; 2Z0W A; 4A53 A; 1BI3 A; 2K5F A; 4RTT A; 1X6G A; 1YJW A; 2LNH B; 2V8K A; 1ZSG A; 1S72 Q; 1TSF A; 1W6X A; 2HBP A; 1NJI C; 2RHY A; 2OX7 A; 1MUZ A; 3VS3 A; 2D8J A; 3CPW P; 1WXT A; 3OMG A; 1CKA A; 1BIB A; 3JRZ A; 2XID A; 5DY9 A; 1M3B A; 3IQL A; 2PZ1 A; 3EAE A; 4R55 A; 4LDV A; 4RTU A; 2IIM A; 2ED1 A; 2JTE A; 5GAM h; 3RUX A; 1VOM A; 1KC8 C; 3OYL A; 3FJ5 A; 3M4G A; 1JEG A; 2HBW A; 4C0D B; 2DA9 A; 5A0G A; 3CCL A; 4B9X A; 1TS9 A; 3HKS A; 3UT1 A; 3KFV A; 3SWN B; 1WQ7 A; 4II1 A; 4E6R A; 2XI9 A; 1X69 A; 3OS2 A; 4GBQ A; 2PQW A; 3JCM V; 4LNP A; 3VYG A; 2EQI A; 1VQK A; 1WHM A; 2ROT A; 2DL5 A; 4ANJ A; 3M9Q A; 2K7A A; 4EPC A; 2ATC B; 4PJO E; 1WZO A; 3S6W A; 2CSI A; 4M7D B; 1OU9 A; 1VYU A; 1YN8 A; 2V8I A; 3CCV Q; 3R6O A; 4HCB A; 2ZPI B; 3PTA A; 3FRN A; 4M78 B; 3OYY A; 5GMK j; 2HKN A; 3EG9 A; 5GAN h; 2DRK A; 2DIQ A; 1B7T A; 2RF0 A; 1KJW A; 4LXC A; 3G6E Q; 2J6O A; 4Z8A A; 4JPB W; 1KIK A; 4OVA A; 1ZA1 B; 5IHI A; 1HD3 A; 2RMO A; 1NZ9 A; 3F70 A; 4M75 E; 1Y96 B; 2C0I A; 3JB9 F; 1HYO A; 5CO7 A; 3SFM A; 1OOT A; 1VA7 A; 2CP0 A; 3PIP A; 2AZS A; 1I07 A; 1H92 A; 1WX6 A; 2MOX A; 1M3A A; 2DNU A; 4BUG A; 4L6V 5; 1K9M U; 2K57 A; 3CPF A; 4OB2 B; 5IN1 A; 4XAX B; 2CH4 W; 1G83 A; 3VS7 A; 5KYW A; 1U8R A; 2FG0 A; 3M53 A; 1QKW A; 5A0D A; 2W10 A; 1Q86 U; 4OMF B; 1YJN T; 2IVW A; 2O01 E; 3QUI A; 2LDM A; 1XJW B; 1ZSZ A; 3A8H B; 1WHG A; 4VUB A; 2D8H A; 1M1G A; 4PJO G; 1T3L A; 1YIT T; 2RK2 A; 3C0C A; 4GLK A; 1AWJ A; 5FU7 B; 1UGS B; 2FRW A; 3CCJ T; 3A98 A; 3AT1 B; 4IUQ A; 2FRY A; 3QSU A; 1TTH B; 2E6N A; 2XU8 A; 4Z02 A; 3CCS T; 3VS5 A; 3GP8 A; 3HP9 A; 2NUT A; 2QGF B; 4J9H A; 2QG9 B; 4BD3 A; 4AFS C; 5FWC A; 5GAN 8; 4D8K A; 2PUO B; 1K9M R; 4Y92 A; 4M7D D; 2C0O A; 4O5V A; 2RJF A; 4DBQ A; 2EJF A; 5KYX B; 2VVK A; 2R5M A; 1RLQ C; 2JT4 A; 4C92 F; 3X25 B; 3CCM T; 3UWN A; 2VGM A; 4M78 D; 2W0Z A; 1Q86 R; 1VQ5 Q; 4M77 C; 2DE0 X; 2M51 A; 3V8J A; 4M77 A; 3V8K A; 2KAF A; 1OEB A; 1KD1 U; 4J9I A; 3ZFJ A; 2BE7 D; 3RMS A; 4DOW A; 1ACM B; 4OMQ A; 4FSX A; 2DER A; 4C8Q B; 1NEB A; 4PLL A; 2K3X A; 2D6F A; 3E19 A; 3VJP A; 3E1S A; 3ULR B; 1AHJ B; 2O9V A; 1ZBJ A; 2EKO A; 2HL3 A; 5D6W A; 2E6Z A; 4MZT A; 5LJ3 d; 2DD4 A; 1WJQ A; 1YIT Q; 3FEO A; 3EH1 A; 1D3B B; 1WFW A; 2LRQ A; 1N9S A; 5AYF A; 2KQW A; 3OW2 P; 4IUP A; 1PRM C; 3RNJ A; 4M7D G; 1IZ6 A; 1KD1 R; 3SD4 A; 4ZN1 A; 3CCS Q; 1D1C A; 2CZ7 B; 2F2X A; 1N5Z A; 5LJ5 h; 3HFO A; 3LGF A; 2FO0 A; 3EGX A; 4M78 G; 4OMM A; 3JCM d; 3PVL A; 2OI3 A; 3LWH A; 1YI2 A; 3M58 A; 2O4X B; 2RJC A; 4LUE A; 1BI0 A; 1ZHI A; 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