The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
25
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sequence length |
83
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structure length |
83
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Chain Sequence |
DPKPKFQEGERVLCFHGPLLYEAKCVKVAIKDKQVKYFIHYSGWNKNWDEWVPESRVLKYVDTNLQKQRELQKANQEQYAEGK
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Gene regulation
|
| molecule keywords |
MORF-related gene 15 isoform 1
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| publication title |
Structure of human MRG15 chromo domain and its binding to Lys36-methylated histone H3.
pubmed doi rcsb |
| source organism |
Homo sapiens
|
| total genus |
25
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| structure length |
83
|
| sequence length |
83
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| chains with identical sequence |
B, C, D, E, F
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2005-11-26 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 type barrels. |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 3MEW A; 2B8A A; 3NTI A; 3L2R A; 1OZ2 A; 2RHX A; 3ME9 A; 4BAC A; 3L2U A; 3SD4 A; 3S6W A; 4II1 A; 2RHI A; 4N4H A; 4QVZ A; 2M16 A; 4E7I A; 3EAE A; 3OYJ A; 4BE0 A; 2X4X A; 2RI5 A; 3OS0 A; 2X4W A; 3P8D A; 5KCH A; 2QQR A; 2XDP A; 3FDR A; 3GOX A; 2PQW A; 3OMG A; 3MP1 A; 4OVA A; 3UT1 A; 3OYI A; 4NS5 A; 3PMT A; 3DLM A; 5KH6 A; 4BDZ A; 3LYI A; 2WAC A; 3KUF A; 2M0O A; 2RJF A; 4IUU A; 3MP6 A; 1WJQ A; 1SSF A; 2RHZ A; 4LD6 A; 2HQX A; 2RHY A; 3BDL A; 3LX7 A; 2R5M A; 3PMI A; 2LTO A; 3QII A; 2CKK A; 3QBY A; 2MWP A; 2YRV A; 1WJS A; 3MO8 A; 4QQD A; 3FLG A; 2X4Y A; 3S3N A; 2RJC A; 2HQE A; 2FHD A; 2BKD N; 1OI1 A; 5C0M A; 3QKJ A; 5FRO A; 3O8V A; 2X35 A; 3MEU A; 3OYA A; 1KHC A; 4A4G A; 1N27 A; 2G3R A; 2RJD A; 3UWN A; 4C5G A; 3OYE A; 1WJR A; 2EQM A; 4A4H A; 4Z02 A; 4FU6 A; 5KCO A; 3OS2 A; 5D6X A; 2EFI A; 4N4I A; 2MWO A; 4ZTJ A; 2BIV A; 2LRQ A; 4QW2 A; 4CRI A; 3FC3 A; 4QQ6 A; 4QQG A; 4N4G A; 2RI3 A; 4IUP A; 2LCC A; 3OYL A; 3OA6 A; 2JZ2 A; 3FEO A; 3OYH A; 3E9G A; 4X34 A; 5M9O A; 3NTH A; 3OYB A; 3LGF A; 2L3R A; 5KE2 A; 1RI0 A; 2QQS A; 2GFA A; 3H6Z A; 2M1H A; 3MET A; 1OYX A; 3NTK A; 2O4X A; 2E6N A; 2R57 A; 3OS1 A; 3LLR A; 2E5Q A; 1MHN A; 2F5K A; 3OQ5 A; 4GY5 A; 3H8Z A; 4E7H A; 2LVM A; 1G5V A; 3OYD A; 2EQK A; 3DB4 A; 3OB9 A; 3S3O A; 5CIU A; 3L42 A; 4E7J A; 3S3M A; 3PFS A; 4E7K A; 3C4S A; 4C5I A; 3OY9 A; 5J39 A; 3OYG A; 2RJE A; 1XNI A; 2R58 A; 4Q5W A; 3OYC A; 5D6Y A; 3L2Q A; 4IUT A; 2RI2 A; 5C6S A; 5IAY A; 4A4F A; 2IG0 A; 4PL6 A; 2D9T A; 3LGL A; 4E7L A; 2GF7 A; 2VYT A; 3MEA A; 3OYF A; 4BE1 A; 3OYN A; 5IN1 A; 3LH0 A; 4IUV A; 3ASK A; 4C5E A; 3L2V A; 3F70 A; 1WGS A; 1H3Z A; 2K3Y A; 4L59 A; 4BE2 A; 4IUQ A; 3PNW C; 2EQJ A; 3DB3 A; 4RG2 A; 3Q1J A; 3OYM A; 2EQU A; 2DAQ A; 3P8H A; 2GFU A; 3OYK A; 4HCZ A; 5D6W A; 4IKF A; 3OMC A; 5FRN A; 4ZTF A; 2L89 A; 2XK0 A; 2NLU A; 2RO0 A; 2JTF A; 3L2W A; 4IUR A; 4B9W A; 5FRM A; 4C5H A; 3ZEH A; 2DIQ A; 4BD3 A; 2DIG A; 4PLI A; 2O4X B; 4BDY A; 3E9F A; 3M9Q A; 2P0K A; 4PLL A; 2LDM A; 3MP8 A; 2EKO A; 3CEY A; 4A4E A; 5J26 A; 5KE3 A; 2L8D A; 2BUD A; 2K3X A; 4FL6 A; 1OZ3 A; 2R5A A; 3QJ6 A; 4UC4 A; 4EDU A; 2RHU A; 4B9X A; 3MEV A; #chains in the Genus database with same CATH topology 4M77 D; 3CCJ T; 3BFM A; 4KT0 E; 4C92 F; 1YJW T; 2VB6 A; 1AWX A; 1OOT A; 3CQT A; 2M0O A; 4IUU A; 1VQ8 T; 2HMA A; 3X26 B; 4RCB A; 2EJ9 A; 4KH1 B; 2ZPF B; 5CK9 A; 4FYW B; 2FHD A; 3IQL A; 4EPC A; 3AHU A; 1OX8 A; 3M55 A; 4OB3 B; 1U1S A; 2EQM A; 1KFZ A; 2QQB A; 4HKE A; 1UG1 A; 2EYZ A; 2LRQ A; 1T0J A; 2CGH A; 1G2B A; 1BI0 A; 4JUV A; 3CCR T; 3C12 A; 1LOJ A; 3OA6 A; 5FU7 B; 4X34 A; 1FWZ A; 3I56 A; 2NUT A; 2K4Y A; 1FMW A; 3G71 Q; 2O4X A; 5GAN 5; 4F17 A; 4ZN3 A; 1Q86 U; 3HFN A; 3RUX A; 4E7J A; 3PFS A; 3VUB A; 2HNI A; 1AT1 B; 1N8R U; 4DBR A; 1PNJ A; 1EIF A; 2FB7 A; 2DXT A; 1MUZ A; 4M77 G; 2GTO A; 1RAE B; 1WGS A; 1BI3 A; 2KBT A; 2DRK A; 4DEY A; 4VUB A; 5IH2 A; 2AK5 A; 2EQU A; 3TRE A; 3OMC A; 2OTL A; 1VYV A; 3CCV A; 4C5H A; 2RD1 A; 4MDW A; 5DM7 R; 5J26 A; 2GGR A; 1FMK A; 1ARK A; 2PUK B; 3E2U A; 4KGX B; 1PKT A; 1WQ7 A; 1BCO A; 2D8H A; 3SHW A; 3U23 A; 1N6A A; 3SWN C; 1WDX A; 3H0F A; 3FDR A; 3TEE A; 2X4J A; 3G4S T; 2ZAE A; 2BZ8 A; 2YUQ A; 1M1K R; 2QAZ A; 1T3S A; 2EYX A; 3HRU A; 1KC8 C; 2RHY A; 4J7F A; 1X75 C; 3CBP A; 1AOJ A; 2CP2 A; 3QII A; 1M3A A; 2J7I A; 1B07 A; 2P0P A; 3A5Z B; 4OMN A; 3CCS A; 1VQ4 A; 2JS2 A; 1N27 A; 4RTV A; 1RAH B; 2GBQ A; 2PVO B; 3UDC A; 4C8Q A; 3UF4 A; 1G3S A; 1RLQ C; 1Y0M A; 2HCK A; 1UTI A; 3PIO A; 1NJI U; 1WPY A; 3RR6 A; 4M75 F; 5I22 A; 3P8B B; 3HSB A; 2C06 A; 1VQL A; 3QG1 A; 2F5K A; 3OQ5 A; 3NMZ C; 2PUO B; 3I9Q A; 4BI3 A; 5FLX E; 3MJX A; 3CC2 T; 4P5N A; 1NEG A; 3V7R A; 4M75 E; 3C4S A; 1X2Q A; 1VQP Q; 3MKD A; 4X9C A; 3CME T; 5FU7 C; 2DD4 A; 4MZP A; 3I56 Q; 1GCP A; 4AMC A; 2O01 E; 4DBF A; 1RUW A; 1ZQ1 A; 3QWX X; 2DTI A; 2DJZ A; 4KUL A; 3JB9 J; 1B7T A; 4ZTF A; 2RO0 A; 2RH2 A; 1FMV A; 3L2Z A; 4C92 C; 2DJQ A; 1WX6 A; 1I07 A; 4BDY A; 3E9F A; 1VQ7 A; 1UFF A; 5CKE A; 1N8R C; 4B6M A; 2QG9 B; 1V1C A; 4J6W A; 2K2V A; 4OP0 A; 1X6G A; 4KGZ B; 1K73 U; 1FXX A; 1MV0 B; 4M75 B; 1Q7Y C; 4XTW A; 3X24 B; 2H3J A; 4ELY C; 4M78 D; 4PKC C; 1M2O A; 4F14 A; 5KCH A; 2OX7 A; 2PQW A; 2M0Y A; 2OTL Q; 1KHI A; 2ATC B; 1JU5 C; 3VS0 A; 3CCV Q; 5KH6 A; 4KGV B; 2YDL A; 2CSI A; 4CI0 C; 2ABL A; 3CMA T; 1VQM T; 3LX7 A; 1MMN A; 2LTO A; 1XJW B; 2QI2 A; 2Y4Y A; 1H8K A; 1QLY A; 1PWT A; 1WHG A; 1Z9Q A; 5KYX B; 4HVV A; 2CH4 A; 3CCJ A; 3C0C A; 1UGR B; 2QAS A; 1XTD A; 1YJW A; 4QQ6 A; 1KC8 R; 1M8V A; 1SSH A; 5GAN 6; 3FEO A; 3NPF A; 5GAN e; 1IRX A; 5GMK l; 1VQ8 A; 3I5S A; 3LH5 A; 1OYX A; 4C8Q F; 3CCS Q; 3JB9 H; 1VQ4 Q; 3OS1 A; 1Y71 A; 4ME7 A; 2LT4 A; 2E6Z A; 2A0F B; 3DB4 A; 1BIA A; 3X20 B; 5A0G A; 4OMQ A; 1SPK A; 2P84 A; 3JV3 A; 1Q82 U; 3MPU B; 2A7Y A; 5HCK A; 2COY A; 4BB7 A; 4C8Q E; 2AHJ B; 4J83 A; 4LXC A; 4HA8 A; 4A53 A; 3D7S B; 4BI8 B; 3L2Q A; 4FT2 A; 1H64 1; 4A4F A; 4PL6 A; 2D9T A; 2QTX A; 3WVD B; 4C0D B; 3JSC A; 4ELZ C; 3CCR A; 5L23 A; 5IN1 A; 3CCQ Q; 3RER A; 1YJN T; 1OX9 A; 2VGM A; 4XTV A; 3HL8 A; 3R6O A; 2EQJ A; 4M78 G; 2V8J A; 5DY9 A; 2CDT A; 4ZN1 A; 2CZ0 B; 5CKB A; 3OYK A; 5D6W A; 3TCJ A; 3V8K A; 1R8O B; 2FG0 A; 2MAM A; 3L2W A; 5GMK e; 4OMO A; 2VKN A; 5IT9 E; 2EIF A; 4BI4 A; 1G83 A; 3EFO A; 2J06 A; 1H3H A; 4FM4 B; 2CS7 A; 4K11 A; 1WZO A; 2ECZ A; 2D0N A; 1D3B A; 2HKN A; 4FSS A; 2YRD A; 4QVZ A; 4AT1 B; 2DO3 A; 2NYS A; 1VQ5 T; 4C8Q B; 1YHQ T; 3MHX A; 2RI5 A; 3EH2 A; 2M9U A; 3G7Z A; 4WTO B; 4BDZ A; 4JS5 A; 5J3B A; 2JW4 A; 3CBO A; 1N8R R; 1VQ7 Q; 1X01 A; 1PHT A; 2EGC A; 1HXD A; 2X3W D; 1K9M U; 1M1F A; 2DZ9 A; 3FLG A; 2FRY A; 3RNJ A; 2RN8 A; 5C0M A; 4A54 A; 1C0M A; 1Q7Y R; 2X35 A; 1KQS S; 3A8M B; 4D8K A; 1JXO A; 2A28 A; 4ZTJ A; 1RAI B; 4ZGE B; 5GAO n; 4M77 E; 3RKY A; 1K0S A; 4CRI A; 2ZPI B; 3JCM f; 3G4S A; 2RI3 A; 3REA B; 3CXC S; 2KRO A; 5DLQ E; 2JZ2 A; 3CCM T; 2XIC A; 1OU8 A; 2L3R A; 1Y96 A; 1EZZ B; 5IHN A; 2MIO A; 4RMO A; 1ZBX A; 1QP3 A; 1TXQ A; 2QTV A; 2BZY A; 2PNI A; 2LVM A; 3VKI A; 3INZ A; 4Z89 A; 3VV0 A; 2KEA A; 2OJ2 A; 3CCJ Q; 3QJY A; 3OY9 A; 1GCQ A; 3EG3 A; 1YJW Q; 1C1A A; 2GCX A; 3M0T A; 2IG0 A; 4X1V A; 1VQ8 Q; 2GF7 A; 2BTT A; 3QPH A; 1KIK A; 4C5E A; 2RF0 A; 4MZT A; 4J8O A; 4QVD A; 2K3Y A; 4M7D D; 2NUP B; 2QGF B; 1HSQ A; 4M77 B; 2QYZ A; 2DBK A; 2L89 A; 2XK0 A; 3CC2 A; 4AG2 C; 2VV5 A; 1PCX A; 1GFC A; 1VQK T; 2KNB B; 2ZPE B; 4E47 A; 3TSZ A; 3CME A; 1X69 A; 3CCR Q; 4E7I A; 1YWP A; 4OGE A; 4M7A C; 2MYS A; 3ZFJ A; 2EJG A; 3S6W A; 2DK3 A; 2YSQ A; 4Z88 A; 2SRC A; 1TOV A; 2VGN A; 1NPR A; 2BE7 D; 4OMM A; 2WSE E; 1LVK A; 3OBY A; 3HRS A; 1CSK A; 3OYI A; 1JEG A; 1SG5 A; 2CUB A; 4PJM A; 1IRE B; 3JB9 F; 2WAC A; 1Q81 U; 3EG2 A; 1I5L A; 3MP6 A; 3LW5 E; 4R55 A; 3BDL A; 2O31 A; 3VYH B; 3QBY A; 3TQ7 P; 4N0A A; 1RAB B; 2KDS A; 4FW1 A; 3JCM V; 1PRM C; 4JJC A; 4C8Q C; 2E1H A; 5GMK m; 2K5L A; 3X25 B; 4NL2 A; 2VAS A; 1AHJ B; 5GAM f; 1TU0 B; 1UGQ B; 4M7A D; 3E9G A; 1VIE A; 3NHN A; 3CMA A; 1VQM A; 3CC7 T; 2JTM A; 3OW2 S; 2GFA A; 8AT1 B; 1K9M C; 1VQL T; 3PT9 A; 4M7D G; 2R57 A; 3RBB B; 5CO7 A; 1UJ0 A; 4ANJ A; 1YWO A; 3QDR B; 2AZS A; 2EQK A; 4L6V 5; 3GF5 A; 2LQW A; 4C5I A; 4QVC A; 3OYG A; 1QMC A; 3G4S Q; 2DM1 A; 1VQ9 Q; 4PFZ A; 1WLP B; 1NG2 A; 2EWN A; 5HKC A; 1S72 T; 4RG8 A; 4FT4 A; 4E7L A; 2E5K A; 1N9R A; 4PJJ A; 4A63 B; 4LDV A; 3HTR A; 1YCY A; 4J5Y A; 3Q1J A; 3KFV A; 4HCZ A; 5FRN A; 1BB9 A; 4J9I A; 4IUR A; 3HHT B; 3GP8 A; 2X51 A; 4MZM A; 2KT1 A; 2CYZ B; 1D1A A; 1J3T A; 4RUG A; 3QJ6 A; 4EDU A; 5IXB A; 2EW3 A; 1ABQ A; 3OBW A; 3A98 A; 1RAC B; 2ZPB B; 3L2U A; 3FJ5 A; 4F16 A; 1W1F A; 3OYY A; 1YJN A; 2DER A; 5A0D A; 4AFQ C; 3UT1 A; 4M7A G; 2K79 A; 1QVF A; 3H0I A; 1BIB A; 3M5A A; 1MNE A; 2MCN A; 1WJQ A; 3I5R A; 3JCM X; 2L0A A; 2P4R A; 3CME Q; 2YRV A; 4E7Z A; 1KG1 A; 1VA7 A; 3VUZ A; 1K8A U; 2YLC A; 2G6F X; 2G3R A; 4A4H A; 2MMP A; 2A08 A; 3VS7 A; 1VQ5 A; 1MND A; 2HKQ B; 1YHQ A; 1QCO A; 4WF2 A; 5EG2 A; 5DLO A; 3EHR A; 4N4G A; 1M90 U; 1Q81 C; 4M78 E; 2ROT A; 2DEQ A; 2DA9 A; 1RAF B; 1NEB A; 2QQS A; 4AFZ C; 1TWB A; 4OMF B; 5GJW B; 4PJO A; 2QDL A; 2KGT A; 2CH4 W; 2XDD A; 4C0G A; 4PJN A; 4NL3 A; 2XHC A; 4JRI A; 2DLP A; 4M75 A; 2KYB A; 1UE9 A; 2OAU A; 5IAY A; 3CMA Q; 2HQH A; 3EG1 A; 3H0H A; 1K9M R; 1E6H A; 3FIF A; 2YUN A; 3MEA A; 2JUF A; 2HAX A; 3CCM A; 3JB9 I; 4IUV A; 1QVG P; 2DXU A; 3DKM A; 1KD1 U; 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2CZ6 B; 4IKF A; 4ESR A; 3ZL7 C; 3JCM h; 3VYG A; 4HCC A; 1IGU A; 4PLI A; 3GNF B; 2HDA A; 5I2M A; 4A4E A; 1WHM A; 2FZC B; 1OZ3 A; 1YN8 A; 4A4K A; 1RI9 A; 3MEV A; 3CCM Q; 3NTI A; 1S72 A; 2DYI A; 3GLX A; 2X9H A; 2FZK B; 4HVW A; 5KYU B; 1YI2 T; 2M16 A; 5GAN 4; 1Q86 C; 1D1C A; 4E6R A; 4JJN K; 4JZ3 A; 2KMT A; 1NPP A; 4TVR A; 1TUC A; 4NS5 A; 1ZUK A; 5GJV B; 2L3P A; 1RAG B; 2DFU A; 4N0A C; 3KUF A; 3JCM P; 4LD6 A; 1QWE A; 2E70 A; 1YCS B; 4O5V A; 4JLG A; 1YIJ T; 4PJO B; 2LJ3 A; 2DTO A; 2V26 A; 4XTZ A; 4HT8 A; 2X4Y A; 1Y57 A; 3URG A; 2JM9 A; 3M4G A; 3AT1 B; 2FPF A; 4JJD A; 2MWO A; 2RA2 A; 4RTT A; 3RDV A; 5GAN 3; 3CCE T; 4FYX B; 2NUP A; 3FC3 A; 4QW2 A; 4M77 A; 3CPW S; 2QQ9 A; 3G6E T; 3SDZ A; 1VQK Q; 4PNO A; 2J6O A; 4J9D A; 3L1A A; 3RMS A; 5GAN 7; 5L8R E; 5CKD A; 1PG5 B; 1JB0 E; 1M30 A; 2KI7 A; 1XQH A; 1Q95 G; 4C92 D; 5CIU A; 2DD5 A; 1R0C B; 2DL4 A; 4MDX A; 1WQW A; 3OYC A; 5CR2 A; 1NM7 A; 1LCK A; 1QVF P; 1U06 A; 2DL8 A; 3OYF A; 3I35 A; 3OYN A; 5FWB A; 2V8K A; 4EMK B; 4KRT A; 2QXF A; 2DVE A; 5GAM h; 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