2F9WA

Structure of the type iii coaa from pseudomonas aeruginosa
Total Genus 70
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
70
sequence length
249
structure length
249
Chain Sequence
SMILELDCGNSLIKWRVIEGAARSVAGGLAESDDALVEQLTSQQALPVRACRLVSVRSEQETSQLVARLEQLFPVSALVASSGKQLAGVRNGYLDYQRLGLDRWLALVAAHHLAKKACLVIDLGTAVTSDLVAADGVHLGGYICPGMTLMRSQLRTHTRRIRYDDAEARRALASLQPGQATAEAVERGCLLMLRGFVREQYAMACELLGPDCEIFLTGGDAELVRDELAGARIMPDLVFVGLALACPIE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Transferase
molecule keywords Pantothenate Kinase
publication title Prokaryotic Type II and Type III Pantothenate Kinases: The Same Monomer Fold Creates Dimers with Distinct Catalytic Properties.
pubmed doi rcsb
source organism Pseudomonas aeruginosa
total genus 70
structure length 249
sequence length 249
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.7.1.33: Pantothenate kinase.
pdb deposition date 2005-12-06

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF03309 Pan_kinase Type III pantothenate kinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2f9wA01
3.30.420.490 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2f9wA02
2P9SA 2P9UB 3CJ1A 3VEXA 3JS6A 4BR9A 3UKUB 1Z6RA 5BPMA 5AQUA 3LDOA 3FZFA 3VENA 1HX1A 3U4LA 2Q2RA 1BUPA 4FWSA 3CIPA 1BOTO 1DEJA 2P9IA 3LDLA 2E2OA 2FSNA 3GE1A 1T6DA 1KAXA 4XEIA 1X3MA 2YHXA 3UB5A 2YJFA 1Z05A 5KPZA 4H0TB 1V4TA 4I6MA 4BRFA 5AQZA 3RSEA 2FLOA 4BREA 3KHYA 1D4XA 2E1YA 3EZWA 5AQKA 1BU6O 4IJAA 3A8YA 3A0IX 3WXKA 1NGHA 2ZWHA 4FWPA 4Y0WA 3DJCA 3MN6A 3A5MC 3G25A 3O1BA 3UKRB 1GLDG 3M6GA 2CGLA 3ZX2A 4BQZA 3SJHA 5KPTA 2DPNA 1KAZA 5FPMA 4ISGA 3QDKA 2GEMA 3IDHA 1K8KA 3CJAA 4BRAA 2CGJA 2CH5A 4KBOA 4LC9B 1NGJA 1C0GA 4BRDA 1GLCG 3WEEB 5JLFA 2P9KB 5AQNA 1E4GT 2YI1A 5AQXA 3VEYA 5ADXH 2IVPA 4IO8A 1IJJA 3O5BA 2Q0RA 4M7XA 4NO7A 1NGIA 4FWQA 4RTFD 2OANA 3ZETB 3UKUA 2ASPA 1NGGA 1P8ZA 1TUUA 2BTFA 4BRMA 4BRLA 2IVOA 4JN4A 5BREA 3B8AX 1YAGA 1SAZA 4PL7A 4RWTA 4BC2A 2E2QA 3VGKA 5AQVA 5F0XA 4BQLA 2HMPA 3QICA 2VYPA 3LM9A 3MDQA 3H3OB 3R8EA 4BR5A 1XQSC 4BR0A 2P9LB 3QB0A 1GLFO 1GLJO 3DAWA 5AQHA 4ISEA 1EQYA 2V7ZA 1QQNA 1H1VA 3VEVA 1QHAA 1BWFO 4EAHD 3LL3A 3O80A 3ENHA 4H5TA 4BR4A 4H0XB 1MWKA 1DKGD 2Q97A 5AQFA 1MWMA 4HTLA 4BRGA 4EIAA 5AQSA 3D2FB 4FL9A 2H3GX 4JAXA 5JLHA 4FWMA 2IIRA 3A5OC 3VGLA 1NBWA 3L6QA 2QWRA 2P9NB 3EO3A 1E4FT 1S3XA 1LCUA 3A5LC 4CZMA 5BRDA 4PL8A 3SK3A 2A40A 3EKSA 1GLEG 2BUPA 5EY4A 1BG3A 3CJBA 3U9ZA 3HBTA 4XH1A 4JD2B 4BR7A 1U6ZA 2HOEA 2P9KA 4IJNA 3FE1A 2QWLA 4CI6A 4BC5A 2QWOA 4BRQA 1JCFA 5EVZA 2PBDA 4AM6A 5BR9A 3ULEB 1TUYA 4B1XB 4F9OA 3O8MA 2QWPA 4CD3A 2D0PA 2UYTA 3GOIA 4FPBA 4K43A 4FOEA 1R59O 4O5FA 5TKYA 3C7NB 3GL1A 4BRPA 3FZMA 3QFUA 1KXPA 1ATRA 3TU5A 5AQRA 3CJ7A 4PKHA 5F2RA 4BC4A 2D0OA 1IG8A 2P9LA 3ATVA 4A61A 3EKUA 1U2VA 3ENOA 1G99A 3FZLA 5BN9A 5JMVA 1CZAN 2ASOA 2IVNA 3ATUA 4MO5A 3VPZA 4B1YB 2QM1A 3R6MA 2FXUA 3L0QA 3WXJA 3H45C 1HKCA 5F1XA 4A2AA 3AARA 3BEXA 4B1WB 2P9PB 1NWKA 3D2FA 4EFHA 2A3ZA 3BUZB 3DXKB 3FFKB 1NGDA 4BROA 2QWNA 3FR0A 2P9NA 1NLVA 2HF3A 3VGMA 5EOYA 3O1WA 3I8BA 3P4IA 1HJOA 4RCHA 4EHTA 3WQUA 4WQ4C 2ASMA 1RGIA 2FF6A 2CH6A 3D2EB 3IUCA 2E20A 2J4RA 1T6CA 2P9UA 4CBXA 5AQOA 1YVNA 3M3ZA 4BC3A 4K42A 1J6ZA 3M1FA 1BDGA 4WQ5C 4GY2B 3ULEA 1QZ6A 3C0BA 5CE3A 3GBTA 4H0PA 3ID8A 5KQDA 3VEOA 5ELZA 4XH5A 4B9QA 2QWMA 4FWLA 1WUAA 5AQYA 3VF4A 3C7NA 2EWSA 2P9SB 1QQOA 5JICA 3AY9A 3BF1A 4H5WA 3LDPA 3FZHA 5AQWA 4XH4A 4CBUA 2GUPA 2AP1A 4O8KA 4H03B 3VEZA 4CZHA 2AA4A 1YXQA 3QMLA 3GG4A 3H1QA 4L3QA 2P9IB 4JNEA 4BVOA 1ATSA 3SMSA 2YCHA 4WQ4A 2A6AA 1V4SA 3WUHA 5KPRA 4DB3A 4BGAA 4MLHA 5E26A 4C23A 3UKRA 2P9PA 4QS7A 4IXCA 3VETA 2Q36A 4H5VA 2KHOA 3DXKA 4CZEA 1SQKA 2F9TA 4YDUC 1NGAA 3EL2A 4WQ5A 2HF4A 5AQIA 5BN8A 4IWVA 3D7EO 5AFUA 1S22A 2NZTA 2A5XA 3U9DA 3WXIA 3KZBA 3WEEA 1X9JA 1OKJA 3CHWA 4PKIA 5FPNA 3O4WA 3CERA 1ZXOA 3J8AA 3D2EA 4WYBA 3MN9A 4B1UB 4FWOA 4K41A 4M7YA 4BG8A 2A41A 2ZF5O 2QXLA 4J8FA 1C0FA 4ISFA 1GLBG 1K8KB 2E2NA 2NRHA 3ZETA 1NGBA 5BPLA 2GWJA 1ESVA 1MA9B 4DHYA 2NLXA 4AM7A 2PAVA 4BRKA 3BF3A 3H6EA 4FOIA 4CZFA 1KAYA 5AQTA 3SLCA 4B1ZA 3LDQA 1Y64A 2A42A 4FSVA 4MLEA 2Q31A 2GWKA 2GELA 4CJ7A 1QQMA 3CI5A 1NM1A 4BGBA 2QW9A 4CD1A 3KVGA 1XUPO 4YDUA 5LY3A 3SMPA 1Q18A 1TYQB 3VOVA 5BRHA 3U8XA 3QFPA 1ZC6A 4CZIA 4JHDB 2E88A 2YHWA 3A5NC 5AQQA 4BRIA 4FPAA 5EXWA 3GDQA 3HTVA 3VEWA 3AAPA 3HI0A 3FLCO 4QS8A 3VERA 3F9MA 3W0LA 2ZGZA 3DXMB 5AQPA 3MN5A 4K25A 2FSKA 1HUXA 2F9WA 3FZKA 4FWNA 3CJCA 4BR2A 3MN7A 3FGUA 2D1KA 3MMVA 1RDWX 3DWLA 3CQYA 3ZEUB 3O08A 3ZX0A 4CBWA 1HLUA 3MCPA 3VF2A 2I7PA 3WXLA 4JD2A 5AQGA 1JCEA 2I7NA 1GLLO 1GLAG 2ZGYA 3LDNA 5AZIB 5BPNA 4GNIA 4Z94A 4QS9A 4MO4A 2YJEA 2ITMA 3EN9A 2Q0UA 5EX5A 4H0YB 4IZ9A 1WOQA 4DCHA 2YHYA 4BRHA 5B8HA 5BRFA 3BP8A 5AZJB 3L4IA 1DGKN 1NGCA 1LOTB 2QWQA 4H0OA 3VF6A 5AQJA 4H5NA 5ADXA 2FSJA 3CETA 2E2PA 3MK6A 2VCPA 5FPEA 1ZBSA 3AAQA 2FF3B 4BRNA 1NGFA 1SZ2A 1HKGA 5I9EB 4B1VA 1NGEA 3UE5A 1TYQA 4FWRA 5AQMA 3HM8A 4H5RA 2E8AA 4CZJA 1YUWA 2V51B 3WT0A 3HSCA 1T44A 4FWKA 5LJWA 4JHDA 1XC3A 4I6MB 4CZKA 3H46O 5E84A 3ZX3A 4CZGA 3RSEB 1HPMA 1QZ5A 1HKBA 1U2VB 4DQ8A 3I33A 1MDUB 2WUSA 3TPQA 2W41A 2V7YA 3DXMA 3W3DA 3HZ6A 5AFUH 4E1JA 1JCGA 4BRCA 4PKGA 1ATNA 2Q1NA 2VWBA 3O6WA 3IFRA 4NB4A 1RFQA 3S41A 4A62A 1X3NA 4H0VB 3ZEUA 1BA1A 5KQ8A 2V52B 4CZLA 1BO5O 3CJ9A 5FPDA 3H1VX 3WQTA 2CGKA 3CQXA 5AZIA 3JXUA 1BA0A 3VESA 5LJVA 3OHRA 3H3NO 3QBWA 4BVPA 2E1ZA 3R9PA 4A2BA 2W40A 4EHUA 4FO0A 5AZJA 3QBXA 4BG9A 1NMDA 4M63C 2D4WA 4HWIA 3LM2A 5AR0A 5AQLA 2GTDA 3IMXA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2HBKA 5DM7L 1U45A 3L2UA 3UKUB 1EWRA 1KVCA 4DLGA 1HX1A 3U4LA 1OH7A 3R1XA 1OVQA 3VQ5A 1BOTO 2P9IA 3GE1A 1T6DA 1KAXA 1X3MA 1K8AO 2DFHA 1NK6A 1LW0A 4H0TB 4DR7K 1EXQA 4IEIA 3QNNA 1C0TA 2E1YA 3EZWA 3AVIA 3LZJA 4FW1A 1HNVA 5AQKA 4AHTA 4IJAA 1BGXT 1S1XA 3AVMA 4M3RA 1YIJN 3MECA 4FM0A 3O4NA 4A5AA 2F96A 3F73A 4FWPA 4IOCL 3PO4A 3DJCA 4DS5A 4WFAL 4CEDA 4JYAK 2CGLA 4NXMK 4OKJA 1KAZA 4KREA 2GEMA 3IDHA 3ZT1A 3CJAA 3U3GA 2IS3A 2CH5A 4FZXC 3DLHA 4BRDA 1JLQA 1HJRA 4QOZB 5DMRA 1RT7A 4OJRA 3MX5A 3P38A 4IO8A 4CJFA 1NK4A 1FJGK 4NO7A 1NGIA 4O44A 5LMNK 2OANA 3ZETB 2F7TA 4BRMA 2X6SA 4JN4A 4AHVA 4LY7A 4YNQA 1SKRA 4FJ9A 2E2QA 5F0XA 3LP3A 2OTJN 3ZT4A 3HL8A 1TKTA 3SUOA 3OYKA 4PHTX 4V19S 1HYZA 1XQSC 5AQHA 5EU7A 3PIOL 2HHQA 1QQNA 4M3UA 3VEVA 5FDLA 2Z1IA 1QHAA 1BWFO 1TV6A 3TI0A 3CCLN 1DKGD 3I8DA 5AQFA 1MWMA 4HTLA 4JS5A 1HR0K 3HXMA 5JLHA 1NBWA 3EO3A 3K5MA 1S3XA 3O3HA 3TSUA 4CZMA 3P39A 4DFPA 4PL8A 3CYMA 3EKSA 4JI4K 1X9WA 4BY9C 3HBTA 4XH1A 1RBTA 4BR7A 3UIQA 1HNWK 2HOEA 1Z26A 5SWMA 4OGCA 4FLVA 4B3MK 2QWOA 4BRQA 3CCQN 3CCUN 4C8MA 1ASVA 4AM6A 5BR9A 3QEIA 3P31A 3AA3A 1NJIO 4Z4IA 1ILYA 3D0PA 3E9PA 3ISNC 1XI1A 2QWPA 2HW3A 2HBJA 1DTQA 3WXMB 5GAGP 1IBKK 4FPBA 4CGJA 1EETA 4FOEA 4O5FA 1JKHA 2VG5A 1Q9XA 4OPKA 4CJKA 2IGIA 3H08A 4B9MA 4DTOA 2VWKA 1IG8A 2P9LA 3ATVA 2NRTA 5HRPA 3ENOA 3FZLA 5BN9A 4O8UA 3KTQA 3LDSA 4MO5A 3VPZA 4FJXA 1XHXA 1N33K 4B1YB 3JAMO 3HPHA 3L0QA 4CF9A 2XY6A 3KK1A 1ASUA 3MCAB 4DF8A 3AARA 3BEXA 4B1WB 3D2FA 1YHQN 4CHPA 3DXKB 3VA0A 1NGDA 4BROA 3NAEA 3AGRA 3FR0A 2P9NA 1HNZK 4FK4A 1NLVA 2HF3A 3TAFA 3O1WA 5HROA 3I8BA 3P4IA 2HHUA 4K8ZA 2O8EB 3V1RA 4BDYA 5HP1A 2ASMA 4J2AA 2FF6A 2CH6A 3HM9A 4E7HA 2BE2A 1KRPA 4LF5K 2E20A 3KLEA 4BC3A 4K42A 2YNHA 3J7AP 4PUOA 4CJEA 4CJRA 3C0BA 3CG7A 4W5OA 3GBTA 4X62K 4H0PA 5KQDA 1IKVA 3P1GA 4BDZA 3AVFA 2Z1HA 4OO1J 3S3OA 1RTJA 3LP1A 4OPHA 4OPJA 4N47A 2P9SB 1P90A 5JICA 3LDPA 3NVKA 3V9SA 5AQWA 2WTUA 2GUPA 3AGKA 4JI1K 3TAPA 1BISA 3MWPA 5JS2A 3CFOA 3QMLA 3F2KA 3CM6A 4CHZA 3NGIA 3H1QA 2DTUA 4JNEA 4GKKK 2WFBA 1CZBA 2O8BB 3B6OA 4FVMA 5KPRA 3PY8A 5E26A 3AVKA 3CMEN 1OH5A 3CCSN 4A5BA 4IKFA 1NGAA 3C6TA 2HF4A 3C94A 1S22A 3WNFA 4KHQA 1N32K 5A2QO 3V1QA 3U9DA 1KSPA 4KH4A 1NU0A 3J8AA 4CJPA 3E1YA 3D2EA 4FWOA 4M7YA 4BG8A 3J81O 4FZYA 4OLBA 2QI2A 2NRWA 1GLBG 1K8KB 2E2NA 4DR6K 2GWJA 1RDDA 1E3MA 1MA9B 3M8QA 2UU9K 2RN2A 3BF3A 3H6EA 4O0JA 3KKSA 2DFFA 4DV0K 1D9FA 1RDCA 4OKKA 4MLEA 4JK7A 4ELUA 4CESA 3SJJA 3ZSWA 1OH8A 4OLAA 4BGBA 4Q5VA 3KD1E 3D45A 3ENBA 1HYVA 2O8CA 3KVGA 2OPRA 4CJQA 5C42A 3VQCA 1IKWA 3VOVA 4O5BA 2E6MA 4JHDB 1QE1A 5EXWA 3GDQA 1VQ4N 4NYFA 4B3RK 1FKOA 3VERA 4QS8A 3LANA 3F9MA 2VG6A 4FZZA 2ZGZA 2FSKA 1HUXA 3QETA 2F9WA 3FZKA 5CYQA 3CJCA 1K6YA 4JK9A 1RDWX 4B8CA 3SQ4A 3DWLA 2HHVA 2BGGA 3ZX0A 4CBWA 2QTDA 4JD2A 3WXLA 2UXCK 4CJUA 2OPPA 4B3SK 2ZGYA 3QEPA 1LAWA 1TAUA 4C8KA 4DSLA 1SKSA 4YOVA 3EN9A 5EX5A 4H0YB 1RT1A 1S5JA 4FLYA 4CFAA 3EYZA 2G8VA 2OYQA 1RILA 4KFBA 4DMNA 5BRFA 1QHTA 3SQ0A 1IV0A 1LOTB 3RWUA 4H0OA 4Z0UA 4CEFA 3TAMA 3NFAA 4W5QA 4O55A 3CETA 3MK6A 2VCPA 4BRNA 3G4SN 3OS1A 1DT9A 1NGFA 3QESA 3THXA 3HOTA 3CC4N 4NLCA 1HKGA 5I9EB 4B1VA 3CFPA 4Z4HA 1HPZA 1VSLA 4CZJA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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 4JRP A;  5ADX A;  4B9U A;  2FSJ A;  2E2P A;  3ZSR A;  5HOO A;  5FPE A;  1ZBS A;  3AAQ A;  2RE2 A;  2GV9 A;  2W6K A;  3DLB A;  1SZ2 A;  3L8B A;  1NGE A;  3UE5 A;  3MXJ A;  3DOK A;  4FWR A;  2E8A A;  1YUW A;  2V51 B;  3IS9 A;  5LJW A;  2G8W A;  3NVM A;  4CER A;  1XC3 A;  4CZG A;  1U47 A;  3ZX3 A;  1W2B M;  5KTQ A;  2VGN A;  3OVN A;  3V6D A;  1LWC A;  1HKB A;  1U2V B;  4DQ8 A;  3I33 A;  1MDU B;  4WE1 A;  4CK3 A;  3KK2 A;  3ID6 A;  3DXM A;  4JI7 K;  3W3D A;  4BDP A;  3DLE A;  1SV5 A;  2HNY A;  1NK8 A;  4PKG A;  2QK9 A;  3O6W A;  3CMA N;  3QEV A;  4CHO A;  3IFR A;  4NB4 A;  1RFQ A;  3S41 A;  3ZEU A;  4XIU A;  1BA1 A;  2V52 B;  1F21 A;  1UOC A;  3T69 A;  4FJJ A;  3O3F A;  4BE2 A;  2CGK A;  5AZI A;  3VQ6 A;  2E4L A;  1T7P A;  4M3T A;  3OS0 A;  3R9P A;  4A2B A;  3ZYY X;  2W40 A;  1BI4 B;  4YY3 K;  4BAC A;  1NMD A;  3U3Y A;  2D4W A;  4HWI A;  5AQL A;  2GTD A; 
#chains in the Genus database with same CATH homology
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