The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
60
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sequence length |
146
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structure length |
146
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Chain Sequence |
SLSAAEADLAGKSWAPVFANKNANGLDFLVALFEKFPDSANFFADFKGKSVADIKASPKLRDVSSRIFTRLNEFVNNAANAGKMSAMLSQFAKEHVGFGVGSAQFENVRSMFPGFVASVAAPPAGADAAWTKLFGLIIDALKAAGA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Oxygen storage
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| molecule keywords |
MYOGLOBIN
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| publication title |
X-ray crystal structure of ferric Aplysia limacina myoglobin in different liganded states.
pubmed doi rcsb |
| source organism |
Aplysia limacina
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| total genus |
60
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| structure length |
146
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| sequence length |
146
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 1993-06-14 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00042 | Globin | Globin |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Globin-like | Globins |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1GZX B; 2VYZ A; 1YGF B; 2G0S A; 1YHE A; 3HHB A; 5AB8 A; 1DXD A; 1MLQ A; 2MGB A; 1IRD A; 3PEL B; 1O1N B; 1FSX B; 2AUQ A; 3CY5 A; 3W4U B; 2HBF A; 3WTG B; 2R4X A; 3O7N A; 2MGG A; 1HBA A; 4F6J A; 2D5X B; 1M9P A; 1RQA A; 4N7O A; 3A5B A; 1OUT B; 3LB2 A; 3E5I A; 1K1K A; 1HBB A; 1X46 A; 3M38 A; 1DTI A; 1QSH A; 1A3O B; 3NML A; 5HY8 A; 2MGM A; 2EKT A; 3HHB B; 1IOP A; 3E55 A; 5D5R A; 1NIH A; 3S1J A; 4N7P A; 3PIA A; 4BJA A; 1CH2 A; 3GYS B; 101M A; 1MNH A; 1IRD B; 3FH9 A; 1HBG A; 4MQJ A; 1G0A A; 1YEN B; 1MBS A; 1HCO B; 4VHB A; 3HYU A; 1VXD A; 1NPF A; 2G11 A; 1Y83 B; 2HBF B; 1ECO A; 5F2A A; 5EYJ A; 3G4Y A; 4UIQ A; 1N9H A; 3HF4 A; 3IC2 B; 1QXE B; 1XY0 B; 2MGF A; 3DHR B; 1M6C A; 1XZ4 A; 111M A; 1ABY B; 4M4A A; 1CIO A; 4NI1 B; 1YCB A; 1M9P B; 1LFY A; 1O1P A; 2VYW A; 2SPN A; 1JEB B; 1Y8W A; 5CN9 A; 5AZR A; 1OJ6 A; 4L2M A; 1Y4R A; 1NS9 B; 1YOH A; 1K1K B; 4JAC A; 2HHD B; 2O5L X; 2MGJ A; 1YMB A; 2ZST A; 3P5Q A; 1DO3 A; 1MYH A; 1LH7 A; 1BZ1 B; 1Y0D A; 3WCV C; 112M A; 1BIN A; 1PMB A; 5CHR A; 3WR1 A; 2ZLW A; 1GJN A; 4OOD A; 3UHE A; 1MLS A; 103M A; 4B3W A; 1CH1 A; 2ZWJ A; 3UHB A; 3PI3 A; 1JW8 A; 1OFJ A; 2D2M A; 1QSI B; 109M A; 3LB4 A; 1TES A; 5CN8 A; 1ECA A; 1YCA A; 1UVY A; 3BJ2 A; 1LH2 A; 3HF4 B; 2SPO A; 1MBC A; 4N7N B; 4F4O B; 1XZ4 B; 5CN6 A; 1FLP A; 1WMU A; 2R80 B; 4M4A B; 3ODQ B; 1CLS A; 2HBC B; 1MGN A; 1LFY B; 2OHA A; 1O1P B; 1YIE B; 1YMC A; 1XZU A; 1NGK A; 1HBH B; 1Y8W B; 3TM9 A; 1COH B; 3LB3 A; 1BIJ B; 3HXN A; 1Y4R B; 3ECL A; 107M A; 1F63 A; 3IC0 B; 3K8B A; 1R1Y B; 1MLN A; 1HBR A; 3DHT B; 2MHB A; 1THB A; 1SDL A; 1YMA A; 2DHB B; 2EKU A; 1UMO A; 1Y0D B; 1MOD A; 1JZL A; 5M3S A; 1ITH A; 2AUO A; 3G52 A; 3S66 B; 1A3N B; 4F6I A; 1LJW B; 1MBO A; 1XQ5 A; 3QM8 A; 3WCT C; 1XCH A; 4MQG B; 4MXK A; 2VRY A; 4SDH A; 2SPM A; 1MLJ A; 4YU3 B; 2MGI A; 1Y5J A; 1J3Z B; 3MVC A; 3PI9 A; 2G0Z A; 3MBA A; 2EF2 A; 3WCW C; 3UHK A; 5EET A; 3BJ1 A; 2ZFB B; 2HZ1 A; 4F6B A; 4HRR B; 2MGC A; 1JZM A; 4ROL A; 1DLW A; 3WCW A; 1DLY A; 3GKV A; 3QM5 A; 1SDL B; 4OF9 A; 2D2N A; 3ARL A; 3S48 C; 4UZV A; 5ILM A; 1EBT A; 3M3A A; 3VRF B; 2D5Z A; 2IN4 A; 4KMV A; 3QZX A; 5E29 A; 4FWZ A; 3ZJI A; 2MGH A; 1JP8 A; 2G12 A; 1AJ9 B; 5HLX A; 3A5G A; 3QJB A; 1Y4Q A; 4YU4 A; 1DXT A; 1Y4G B; 1C7D B; 1Y4B B; 2ZS0 C; 3AT5 A; 2GTL C; 1VXC A; 3WCT B; 3PI9 B; 1GDK A; 1S6A A; 1CH4 A; 1NZ2 A; 4X0L B; 1MTK A; 1MYZ A; 1TU9 A; 1HBI A; 1LHT A; 2GLN A; 1YHU A; 4ROL B; 1HV4 A; 3WCW B; 1FHJ B; 1FN3 A; 1LFZ B; 5EE4 D; 2V1E A; 3AQ6 A; 1T1N A; 1K0Y A; 1J7S A; 3QJD A; 5HU6 B; 2ZT1 A; 1X3K A; 3S1I A; 1VXG A; 1Y0C B; 1YE2 A; 5E29 B; 1Y31 A; 3ARJ A; 1Y4P A; 3QM6 A; 1Y7G B; 4U8U D; 3HEN A; 3MKB A; 3QM9 A; 1Y2Z B; 1GBU B; 1S0H B; 3NG6 A; 4YU4 B; 2W72 C; 3MJU A; 1MNI A; 2V1K A; 1O1K A; 5EOH A; 3ORD A; 4IRO A; 2ZS0 B; 2GTL B; 2NX0 A; 1YHU B; 1Y7C A; 1YE0 B; 1X9F C; 1O1O A; 2HBG A; 1FN3 B; 1JF4 A; 2BMM A; 1ABS A; 3G4W A; 1Y46 B; 1BBB A; 1T1N B; 1GDJ A; 1UC3 A; 1K0Y B; 3BCQ A; 1X9F A; 4HRT B; 1J7S B; 3QJD B; 1V9Q A; 4WCH D; 1YE2 B; 1Y4P B; 5CNC A; 1Y5F A; 4TYX A; 1BJE A; 1CP0 A; 2GDM A; 1C40 A; 2V1G A; 4GZG A; 3PT7 A; 2V1H A; 3NG6 B; 1DTM A; 5EU2 A; 4O2G A; 1XZV B; 3MJU B; 4C44 A; 1O1K B; 3G4Q A; 2ZFO A; 1J3Y A; 4ESA A; 4ZVB A; 2W72 B; 2QMB A; 4IRO B; 3QQQ A; 1Y7D B; 3BOM A; 3E5O A; 1DUK A; 2NRL A; 1JP6 A; 3G46 A; 1UIW A; 3UHT A; 104M A; 4JYQ A; 2OLP A; 1FSL A; 2W6Y A; 3B75 B; 3OZW A; 1C7B A; 2Z6N B; 2OIF A; 1IDR A; 2ZSY A; 4MQI B; 5JDO D; 2E2Y A; 3BCQ B; 2FRJ X; 1X9F B; 1BZR A; 1FDH G; 1AZI A; 1C7C A; 1LTW A; 2HBD B; 3WCU D; 1IRC A; 2PGH A; 2O5O X; 4MQK A; 1G08 A; 4LPI A; 3MOU A; 2Z6T A; 1I3E A; 1JP9 A; 1Y4F A; 1A4F A; 3PT7 B; 3ZJN A; 3DR9 A; 5C6E B; 3LQD A; 1HDA A; 1Y8H A; 4ILZ A; 4H2L A; 1GBV A; 1O1J A; 1D8U A; 2GKN A; 3UI0 A; 1CH7 A; 3A59 A; 1J3Y B; 3VRG A; 4ESA B; 3IA3 B; 2LHB A; 2MYE A; 3OO5 B; 1JF3 A; 4WJG 1; 1UIW B; 4WJG A; 4G1V A; 2QFN A; 4MPM A; 1C7C B; 3ECX A; 1Y8K B; 4HHB B; 1YZI A; 4MBA A; 1LFQ A; 1YG5 A; 1O1L A; 1YIH A; 2ZLV B; 1YDZ B; 1IWH A; 1LUE A; 1LFT B; 2RI4 B; 2EB8 A; 1J40 B; 5KER A; 1A4F B; 3KMF C; 1V75 A; 4F6F A; 2PEG A; 1YEV B; 1HDA B; 1Y8H B; 3TM3 A; 2HZ3 A; 4H2L B; 3D1K A; 4NZI A; 1PBX B; 1CQ2 A; 1MTI A; 1HRM A; 3A59 B; 3H58 A; 3VRG B; 2ZT2 A; 3FS4 B; 3E4N A; 3LHB A; 1MKO A; 4MAX A; 5ILR A; 2GL3 A; 1RPS B; 1NXF A; 5EQM A; 4MXL A; 1V4W A; 1O1L B; 1HLM A; 3CIU A; 3GDJ A; 1HDS A; 1XZ7 B; 3GQP B; 1KD2 B; 2HCO A; 3PI8 B; 4FWX A; 1JL7 A; 1XYE A; 3O89 A; 1VWT B; 1Y0W A; 3WFT A; 1G9V A; 3D1K B; 3QJE B; 1HDB B; 1N9F A; 3D1A B; 2NRM A; 3EOK B; 2QSP B; 1DO4 A; 1CH3 A; 1XZ2 A; 1J7Y B; 3AQ9 A; 2HBE B; 1OR4 A; 1H1X A; 2OHB A; 3UHN A; 2R50 A; 3UHD A; 1HGB A; 1MBA A; 4N8T A; 4B4Y A; 2G10 A; 1YEU A; 2H8F A; 3WHM A; 4FH6 A; 2QSS A; 1N9I A; 1OBM A; 3PT8 B; 3ZJR A; 3CIU B; 1GCV A; 1MWD A; 1A01 B; 3QJC A; 1GCW A; 2HCO B; 1MNK A; 1O1I B; 3G4V A; 1Y0W B; 5MBN A; 1DXV A; 3MYN A; 3ZJO A; 1UT0 A; 1S5X A; 3G53 A; 3V2Z A; 3WFX A; 1L2K A; 3AT6 A; 4PQC A; 1OR6 A; 1YHE B; 5HBI A; 2VYY A; 2ZSX A; 1DO7 A; 4N8T B; 2VM0 A; 1MOH A; 3CY5 B; 1IBE A; 1J41 A; 1MBN A; 5F0B A; 3VHB A; 1MDN A; 3GKT A; 3A0G A; 2EVK A; 5HLQ A; 1GCV B; 1HBA B; 1GCW B; 1RQA B; 1CO8 A; 1J52 A; 5AZQ A; 3AQ5 A; 4N7O B; 2GRH A; 1JL6 A; 5B85 A; 3UHG A; 5ILP A; 1B86 A; 1Y22 A; 2ZSO A; 4HSX A; 1HBB B; 1Y0T A; 4G51 A; 1QSH B; 3AT6 B; 3UHR A; 3ZJM A; 5HY8 B; 1Y4V A; 1MNO A; 1YEO A; 2DN2 A; 1NIH B; 4N7P B; 2GNV A; 1O1M A; 3PIA B; 2D2M C; 2VLX A; 3D17 A; 3A9M A; 3FH9 B; 1HAC A; 1G0A B; 4MQJ B; 1WVP A; 3HYU B; 3UH3 A; 1NWI A; 1IBE B; 2BW9 M; 2QLS A; 3K3U A; 108M A; 3VRE A; 3OK5 A; 1HLB A; 3WFW A; 4O4T A; 1O16 A; 4KJT A; 2FAM A; 4KMW A; 1W92 A; 1YEQ A; 3NFE A; 1Y22 B; 3HEO A; 2W6W A; 1V4X A; 1Y0T B; 2SPL A; 2BKM A; 3V2V A; 1BUW A; 3P5Q B; 3GLN A; 3WR1 B; 2ZLW B; 3D4X A; 1BZ6 A; 1Y35 A; 1A6G A; 2W31 A; 3R5I A; 1HAC B; 4FWY A; 1VXA A; 2D2M B; 4O35 A; 1CO9 A; 3GQG A; 1DWT A; 3BJ2 B; 1YHR A; 1MLL A; 1CP5 A; 2D6C A; 1WMU B; 1YFF A; 1MYT A; 1Y85 A; 2FRI X; 2G14 A; 1CLS B; 1JY7 A; 1AJG A; 3A2G A; 105M A; 1XZU B; 5D1V A; 1BAB A; 2AA1 A; 3EDB A; 2HHB A; 3WCV D; 2DXM A; 3NFE B; 1G09 A; 3HXN B; 5SW7 A; 2D2N C; 3ECZ A; 3K8B B; 2QU0 A; 1HBR B; 2MHB B; 1BUW B; 1THB B; 1GDI A; 2MGK A; 1FDH A; 3GQR A; 3UHY A; 3DUT A; 2NSR A; 5KDQ A; 1NEJ A; 2O58 X; 1J3F A; 5ILE A; 2O5S X; 4M4B A; 5CNE A; 2WY4 A; 2BK9 A; 1XQ5 B; 3QZZ A; 1DXU A; 1MWC A; 2XKH A; 4FH7 A; 1MBI A; 1Y85 B; 3KUN A; 1JY7 B; 1Y5J B; 2ZS1 C; 1YHU C; 1CG5 A; 3HEP A; 1LH1 A; 3BJ1 B; 2AA1 B; 2HHB B; 3AQ7 A; 1G09 B; 1HBS A; 2ZS1 A; 3SZK A; 2XYK A; 1YVQ A; 1BZ0 A; 1XZ5 A; 3GKV B; 1S56 A; 1HGC A; 2D2N B; 3NL7 A; 3UH5 A; 5JGG A; 1HSY A; 1DO1 A; 2W6V A; 1CH5 A; 1NEJ B; 1SHR A; 3UHI A; 2D5Z B; 3WCT D; 2B7H A; 3BA2 A; 4M4B B; 1Y09 A; 5CN7 A; 2MB5 A; 3ZH0 A; 1IT2 A; 1Y8I A; 3WCW D; 3QJB B; 4O1T A; 1Y4Q B; 1J7W A; 3UGZ A; 1DXT B; 3AT5 B; 3LR7 A; 6HBW A; 1QXD A; 2V1I A; 1CG5 B; 3EU1 A; 2ZS1 B; 1HV4 B; 1BZ0 B; 2D60 A; 2O5T X; 3WCU A; 1V4U A; 1KR7 A; 2DN3 A; 1UVX A; 3RJN B; 2HHE A; 2B7H B; 1BVD A; 1Y31 B; 1Y7Z A; 2O5M X; 2GRF A; 3MKB B; 1A00 A; 2ZS0 D; 2MGA A; 2HZ2 A; 1LFL A; 2C0K A; 2GTL D; 3UHC A; 2G0X A; 2M6Z A; 5JOM A; 2ZFO C; 2AV0 A; 5HAV A; 1RQ4 A; 2Z85 A; 4HBI A; 1Q1F A; 2H8D A; 1Y7C B; 5CHQ A; 1MCY A; 1S5Y A; 1O1O B; 3KUO A; 3QM7 A; 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2EVP A; 2PEG B; 3W4U A; 1S69 A; 2FAL A; 3WTG A; 5IKS A; 3OZU A; 4XS0 B; 1VXH A; 5E83 A; 2OH8 A; 3U3E A; 102M A; 1RVW A; 3ZJL A; 1I3D A; 1MKO B; 1A9W A; 1HJT A; 1OUT A; 2ZT3 A; 1A3O A; 3VAU A; 1V4W B; 1MLF A; 1A6N A; 4DC7 A; 2LH7 A; 4MQC A; 3GYS A; 3GDJ B; 1HDS B; 2AUP A; 1U7S A; 1UX9 A; 1YEN A; 1HCO A; 1XYE B; 4AVE A; 1Y83 A; 5JDO E; 7HBI A; 2FRK X; 1G9V B; 1KFR A; 3IC2 A; 2LH2 A; 1QXE A; 1XY0 A; 3DHR A; 106M A; 5E83 B; 1ABY A; 4NI1 A; 1UFJ A; 1RVW B; 1XZ2 B; 3R0G A; 4PNJ A; 4DWT A; 1A6M A; 1CH9 A; 1JEB A; 3NMM A; 3WI8 A; 1NS9 A; 1VXB A; 2HHD A; 1BVC A; 1HGB B; 4NXC A; 3OO4 A; 1YEU B; 4MBN A; 2H8F B; 3BJ3 A; 3WHM B; 2QSS B; 1MLG A; 1H97 A; 1BZ1 A; 1MYJ A; 4MQC B; 3QJC B; 1SWM A; 1VHB A; 3ZHW A; 1DXV B; 1QSI A; 1S5X B; 3LR9 A; 4N7N A; 4F4O A; 110M A; 1BZZ A; 3UBC A; 2R80 A; 3LB1 A; 3ODQ A; 2HBC A; 1JWN A; 1YIE A; 2WTG A; 1MOC A; 3NMM B; 1HBH A; 1COH A; 2O5Q X; 1BIJ A; 1CIK A; 3ED9 A; 3IC0 A; 3OO4 B; 1R1Y A; 3BJ3 B; 4ROM A; 1J41 B; 3DHT A; 2DHB A; 3OJ1 A; 3ZOL A; 1FAW A; 5C6Y A; 5KKK A; 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