2FBXA

Wrn exonuclease, mg complex
Total Genus 63
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
63
sequence length
195
structure length
195
Chain Sequence
HSVFEDDLPFLEFTGSIVYSYDASDCSFLSEDISMSLSDGDVVGFDMEWPPLYNRGKLGKVALIQLCVSESKCYLFHVSSMSVFPQGLKMLLENKAVKKAGVGIEGDQWKLLRDFDIKLKNFVELTDVANKKLKCTETWSLNSLVKHLLGKQLLKDKSIRCSNWSKFPLTEDQKLYAATDAYAGFIIYRNLEILD
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Transferase
molecule keywords Werner syndrome helicase
publication title WRN exonuclease structure and molecular mechanism imply an editing role in DNA end processing.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 63
structure length 195
sequence length 195
ec nomenclature ec 3.6.4.12: DNA helicase.
pdb deposition date 2005-12-10

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01612 DNA_pol_A_exo1 3'-5' exonuclease
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.10 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Ribonuclease H-like superfamily/Ribonuclease H 2fbxA00
3TAFA 2KZMA 1JL2A 3AVLA 3MAQA 4E0DA 3DLBA 4CEOA 4Z4IA 4J2EA 1Q9XA 1EX4A 4CJQA 4DWIA 1TKXA 4DFKA 1X9SA 3SQ4A 1RTDA 4OVLA 2G8VA 2W42A 4DTXA 4M3UA 3TI0A 4FJGA 1BISA 4TSXA 4DQPA 3PV8A 3SQ0A 1B9DA 1QQCA 2OPQA 3AO2A 2OPPA 4CJWA 1ZYQA 1U47A 1L3SA 4JS5A 1C0UA 4IG3A 4HCCA 4WE1A 1SV5A 4CGDA 4DSFA 2KFNA 2GV9A 3AA5X 3S9HA 1NJXA 4E19A 2GUIA 2EX3A 1IG9A 3RR7A 3UIQA 4YNQA 1XWLA 4EP5A 4PUOA 4LH4A 5J1EA 1KFDA 1DLOA 1TKTA 3C94A 4CF2A 2HNZA 3SV4A 3TAPA 3O4NA 3K5OA 3VQBA 3AO3A 4M3RA 1RDAA 2D0CA 2VWKA 4F3OA 1JXEA 4BDYA 3WNFA 4O44A 3KKSA 3O3FA 1NOZA 4AHCA 2RKIA 4O5BA 4CJ3A 2HHTA 3V1OA 2G8UA 5HLFA 4KFBA 4I7FA 3OYKA 1NOYA 4BDPA 4FJLA 4CHNA 1X9WA 1UWBA 5DK5A 1IKWA 3M8SA 4FLVA 1WSIA 1RBVA 4CCHA 4FJ9A 2BGGA 4GMJB 2IGIA 5SWMA 4Q5VA 3RRHA 3EYZA 1XI1A 5CY4A 5HP1A 1WLJA 2HHWA 3RMDA 1Q9YA 1Z26A 4FJJA 1NK7A 4HTUA 3K5LA 1KVCA 2YNIA 4RW9A 3DM2A 3CG7A 5KI6A 3ZT2A 4CFAA 3KD1E 3SUNA 2I5JA 3QERA 4FK4A 3HL8A 3V9UA 4CGJA 3SUOA 3SI6A 3DOLA 3AVKA 3OYIA 1U48A 2HHXA 3V9WA 1S5JA 2HVIA 2FC0A 4Z4FA 1TGOA 4CEZA 3L8BA 3HT3A 3KLIA 4FXDA 1WSJA 2HHUA 3VQ9A 4IBNA 4CHQA 2B6AA 3LP1A 4F3TA 4E7KA 2XY6A 3ZSYA 4ID5A 1KVAA 1C1AA 1N6QA 3IAYA 4CJUA 4W5NA 3DOKA 3QNOA 2KZZA 2XY5A 1NJZA 1JL1A 3K2PA 5C25A 4DLGA 3HYFA 3D0PA 5J2QA 3SPYA 3BDPA 2D0BA 3LP3A 3HP9A 4ELUA 3HO1A 4FZYA 2QXFA 4CECA 5D3GA 3C6TA 4IG0A 2Z1HA 5HRNA 1HRHA 4OGCA 3OYBA 4E1NA 2X78A 5C24A 3DLRA 1XC9A 4E7IA 4AH9A 2XRIA 4FM0A 3QNNA 1VSIA 2D0AA 1SUQA 4BACA 4KPYA 1HJRA 1YTAA 2RPIA 3DLKA 4I2PA 4CEEA 3AVJA 3TAQA 3S3OA 3V6DA 1DTTA 3DRRA 2GBZA 4CEFA 3PY8A 4UQGA 2Z1JA 3TAMA 3PO5A 1XHZA 2X6NA 1ZBFA 2G8HA 2DFFA 4CEBA 2XHBA 1RT4A 2IOCA 3C95A 3T1AA 1QSSA 1Y97A 3T3FA 4FJXA 1B9FA 5CZ1A 3ITHA 1TK0A 3SUQA 1RT1A 3SJJA 2BDPA 2OA8A 3AVIA 2BANA 4N56A 1S1TA 3LP0A 3KK2A 3AV9A 3NH0A 1NK9A 1QTMA 4FJHA 4FLXA 2KQ2A 1ZBHA 1VSKA 4KHUA 1JLAA 3VA3A 1YT3A 1ZBIA 1W9HA 3OYGA 1RTIA 3OS1A 4DU3A 1KFSA 4FYDA 1TL3A 4FK2A 4QCLA 1D9DA 3BGRA 5HRSA 3F73A 4N76A 1TV6A 3L3UA 5C42A 2IS3A 1QHTA 3KK1A 3SQ2A 4F4KA 3QIPA 1A5XA 3HM9A 1JLQA 4QAGA 3CFOA 1IKXA 1S6PA 1VSFA 3CM5A 3DMJA 4CJPA 1U45A 4KRFA 5CYQA 4RG8A 3HP6A 5K14A 3K59A 4CJLA 3TAGA 4W5TA 4C8NA 4CHOA 3QETA 4B3OA 4FCYA 1EKEA 3DRSA 3ZSQA 1CXUA 4RW4A 4CJSA 2VWJA 3L2VA 4R5PA 1LW2A 1RDBA 3AVCA 4DLEA 3QEWA 1R0AA 4E1MA 4DSJA 4M41A 1JLFA 2PYLA 1JLEA 3V1RA 3CFRA 5FRMA 4ZTJA 2HHVA 3RMAA 4JLHA 1RT6A 4NCBA 3MXMA 1UAXA 4DFMA 3NH2A 1KLNA 4F2SA 1T7PA 4LD0A 3NCIA 1QE1A 1S9EA 3KKRA 3EZ5A 4IKFA 3CYMA 1LWCA 4YFUA 1ZBLA 3FFIA 4W5OA 1C0TA 1LAVA 2IDOA 4J2BA 3DI6A 4DTPA 3S3MA 3NGIA 4O0JA 4CJRA 4B9LA 3D45A 4CESA 3QINA 3ZSXA 1BIUA 2ATQA 2HNYA 1JLCA 3V1QA 4CEDA 3LWMA 3RMBA 2E6LA 3OYFA 1TAQA 1ASWA 2DTUA 3OYCA 3MECA 1RBUA 4M42A 3ZT0A 4CF9A 2ZE2A 3WNGA 5JS2A 4H4OA 4IFYA 3ZT3A 4FLZA 4FLUA 1ZBUA 2YKNA 3VQ7A 3OS0A 3QLHA 2OPRA 3HVRA 2QKKA 1VSLA 4L8RB 5HRRA 4PQUA 1D5AA 1W0HA 1LWEA 4Y1DA 4DTOA 1I39A 4FVMA 4CERA 2A1SA 2B5JA 3O3GA 4H4MA 1U4BA 5FROA 3KLEA 1NKBA 4DTSA 3DLHA 4ICLA 1WSHA 3F9KA 3I0RA 1SKSA 1S1WA 4JS4A 1S1UA 3O3HA 2IAJA 3E01A 3TR8A 5KTQA 3ASMA 3K57A 4Z0UA 4DF8A 2OYQA 2AJQA 1J53A 4ZTFA 4DTNA 3M8RA 1X1PA 1HQUA 1FXXA 2XY7A 1B92A 1FKOA 1BI4B 3DLEA 1JLBA 4LSLA 3PO4A 3TANA 4CK1A 1HNIA 2NUBA 4MFBA 4E89A 4M3ZA 3AVBA 4KHWA 1LW0A 4HVJA 5EU7A 3I0SA 3AO1A 2Y1IA 1C1BA 1BQMA 4ELVA 3HXMA 4EZ6A 3AA3A 4C8MA 3MEGA 2YHAA 3HPHA 2G8KA 3LWLA 1RTJA 3SYZA 4Z4GA 3RMCA 3SNNA 4CGHA 4OKKA 4B8CA 4CHYA 4C8KA 1ITGA 3QEIA 3OYMA 3HJFA 1RDCA 3KIOA 4OKJA 3LZIA 1T03A 4ELTA 4FJ5A 1VSEA 4CJEA 4CK3A 3CM6A 3VA0A 2HB5A 1I3AA 2E4LA 3DLGA 4DTRA 2Z1IA 1A5WA 2VG6A 1RCHA 1FK9A 1BQNA 1XHXA 4C8LA 3RWUA 3KLGA 4DU1A 1O1WA 2HW3A 1LV5A 3B6PA 4DQQA 3U3YA 4NYNA 4FJ8A 4M3XA 5CZ2A 3VQ4A 1VRUA 3NF9A 3SCXA 1L3VA 4Z4EA 3NE6A 2VG7A 1RT7A 3OYHA 4B9VA 1A5VA 3P83D 1CZ9A 2P1JA 4FLYA 1J5OA 4B9MA 2G8WA 1ASVA 1J9AA 3LAMA 1NK0A 1YTUA 2PYJA 2KFZA 3L2QA 2O4IA 5HRPA 4OPJA 3V9XA 4Y1CA 2HMIA 1BCOA 2IC3A 1ASUA 4BWMA 2HNDA 3NFAA 3KK3A 2ZD1A 3VQ6A 1REVA 2ZQBA 4DFJA 3SQ1A 1KRPA 3OYJA 5JS1A 1KCFA 1UOCA 3CQ8A 3ISNC 4DS5A 4KTWA 3KJVA 5J2PA 3VQ8A 4ZHRA 3I8DA 3LDSA 1KLMA 3B6OA 3WNHA 4Z4HA 1L3TA 1TAUA 3RRGA 3VQCA 1JXBA 2FBVA 4KB0A 1LAWA 3PX4A 1WAFA 3LPUA 4CHZA 4M3WA 3ZCMA 3DRPA 4KTZA 1Z25A 4CJFA 1RT2A 3HPGA 4AHTA 4CK2A 4OKEA 3SPZA 3DYAA 3A2FA 3IS9A 3OYNA 4PWDA 4H8KA 4KI4A 4F8RA 1KVBA 1VSHA 3VQDA 4DSIA 4BE1A 1HNVA 3OYEA 2G8FA 3MEDA 4OLBA 4O4GA 4DQSA 2OPSA 1TVRA 1QSLA 1HYZA 3L3VA 3QEXA 4JRPA 3QEVA 3V81A 1F21A 1CLQA 4DFPA 3JSMA 2OZMA 1IKVA 2PZSA 4JRQA 4GW6A 2YV0X 4BE2A 3QO9A 3ZSZA 4I2QA 3PX6A 3PUFA 1D8YA 2HVHA 4FJMA 4E7JA 1JLGA 4B8AB 1LWFA 4DTMA 4HUEA 2Q3SA 1IKYA 3VN5A 3P5JA 5T7BA 2EHGA 3OJSA 2D5RA 4MQ3A 1QSYA 4K8XA 2F8SA 3LAKA 2ITGA 3AVFA 4CIFA 3OVNA 3K5MA 1RNHA 1VRTA 3HVTA 1SKWA 4KHQA 3TWHA 1IO2A 5KGWA 4AILC 1UA0A 5E41A 3NBPA 2A1RA 1S9GA 3ZSWA 3U6FA 1SKRA 2RF2A 1MU2A 2P5GA 3NH1A 4E7LA 2KW4A 2DFHA 4DS4A 3QIOA 1S1VA 3C6UA 4RW8A 1VSJA 4CJKA 2JGUA 4B9UA 4RW7A 4CJVA 3NHGA 4B9TA 4HCBA 4CHPA 4FM1A 3WNEA 3P1GA 4DTUA 2X6SA 4BE0A 4W5RA 3LALA 4M45A 1UA1A 2F8TA 3MEEA 4DQIA 2FBYA 3AO4A 3MXJA 1GOCA 3ZSRA 4LY7A 4CGIA 4O55A 5SZTA 1RT5A 3TARA 1T05A 3LZJA 4CF1A 4CJ5A 4FJKA 2FBTA 4F2RA 3ZSVA 4CGFA 1WAJA 4GVMA 2R7YA 2QK9A 3K58A 3O4QA 3VQEA 2XY8A 4CFCA 3K5NA 5KRSA 4KTQA 3SUPA 3VQQA 5I3UA 2QKBA 2ETJA 4B9NA 2DFEA 4AHUA 4KV8A 5KGXA 3VQPA 3L2WA 1C1CA 4IFVA 2P5OA 1J54A 3RTVA 1WSEA 2YKMA 4RW6A 1U04A 2B4JA 3LANA 4CEQA 2P51A 4CF8A 4O0IA 4DF4A 1NK5A 2PY5A 2FBXA 4C8OA 4NCGA 1NK6A 4DMNA 1WSGA 4KREA 1WSFA 1SL0A 2VG5A 3AVGA 3V4IA 4FW1A 3ALYA 1VSMA 3NDKA 5HBMA 3AVHA 4DSEA 3AVAA 3TAEA 1G15A 3NF8A 1U49A 4FLWA 4N47A 1RBTA 3QEPA 2XO7A 4BDZA 4XIUA 4FJNA 3NF6A 1BIZA 1RBSA 3ZSOA 1GOAA 4CGGA 4CF0A 4DTJA 2HHQA 4OPKA 5CYMA 3HPOA 4FW2A 4QOZB 4KHSA 4N41A 4G1QA 3NAEA 4B9SA 2Y1JA 4FZZA 1KSPA 2JLEA 2WOMA 3VQAA 4E3SA 3AVMA 4CFBA 4FK0A 3SZ2A 4M3YA 2O4GA 3M8PA 4FLTA 5I42A 4BWJA 4DU4A 1TKDA 4IDKA 1TK5A 1CZBA 3U3GA 3EY1A 4M3TA 3S3NA 3SV3A 3HSTB 3KLFA 1D9FA 3JYTA 3OY9A 1RTHA 1NJYA 1BI4A 2WONA 1JKHA 4DG1A 4KB1A 2F96A 3AA2A 4AHVA 4CIGA 4KI6A 2HHSA 2YNGA 3LPTA 3M8QA 4AHRA 4KKOA 4PY5A 1VK0A 1NKCA 4KHNA 4HUFA 4LH5A 4Z4CA 1N5YA 1HQEA 1HMVA 1TK8A 2YNHA 1FKPA 1EETA 4I9QA 2Z1GA 4KHYA 3IRXA 1BHLA 1YVUA 3NF7A 4CE9A 4E7HA 3ZT1A 4FJ7A 3LP2A 4CJTA 4CJ4A 3V9SA 3H08A 1WN7A 3KTQA 4AHSA 3OYDA 4FM2A 4DSKA 1TL1A 3OYLA 5HROA 4J2AA 3ZT4A 2YNFA 3OYAA 3QESA 3V9ZA 2G8IA 4LSNA 5J2NA 1HPZA 2LSNA 4OLAA 4K8ZA 3VQ5A 3NGZA 4J2DA 4CFDA 4NYFA 2DY4A 3CFPA 4KO0A 1SL2A 1C6VA 1HYVA 4DQRA 3ULDA 3THVA 3IG1A 1DTQA 4FJIA 3G10A 1K6YA 1T8EA 1IH7A 5J2MA 1TKZA 1L3UA 3AO5A 1VSDA 1C0MA 2E6MA 3AA4A 4CEAA 4W5QA 1NK4A 2YHBA 1KTQA 1NK8A 1NKEA 4PA1A 2BE2A 1L5UA 4KAZA 4ID1A 4OGEA 3OJUA 4EZ9A 5FRNA 4FZXC 1RBRA 3KLHA 3OS2A 4EP4A 2OZSA 1BL3A 1CXQA 2RN2A 3RR8A 4OJRA 4Q0BA 4I9LA 4HHTA 1BGXT 1RILA 4CIEA 3L2RA 1EP4A 4NCAA 4N5SA 3MXIA 5DMRA 1EXQA 3T19A 3L2UA 1S1XA 3PX0A 2KTQA 1S6QA 2X74A 4HUGA 1BCMA 3AVNA 1NJWA 1WNSA 3G0ZA 1SL1A 1GOBA 5KRTA 5FDLA 3NGYA 3KD5E 3HK2A 1RDDA 1X9MA 4B08A 1RT3A 3TABA 4DSLA 1Q8IA 1QS4A 1HYSA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2KZMA 3DLBA 4DB3A 2KHOA 1X9SA 3SQ4A 2W42A 4JI1K 2ZGYA 4DQPA 1DGKN 1ZYQA 3CMAN 3KWGA 4X66K 4WE1A 4CGDA 3M6GA 5BRDA 5C0YA 4CZGA 2EX3A 3GBTA 4EP5A 3PIPL 4PUOA 1KFDA 1DLOA 2HNZA 3SV4A 3TAPA 2UUCK 1W2BM 4ISGA 1NOZA 4R79A 3VEZA 4BG8A 4CJ3A 3HOTA 5HLFA 1DT9A 3D2FA 4FJLA 5AFUH 1UWBA 2BGGA 3M8SA 2IGIA 4JKGB 4LC9B 3RRHA 5C12A 1U6ZA 2HBMA 4FJJA 3CC7N 1T6DA 2YNIA 3W0LA 3CJ7A 3SUNA 2FSKA 3D7EO 3QERA 3HL8A 3SUOA 3AVKA 2I7PA 3BY5A 2HHXA 2HVIA 2HHHK 4YDUC 3EEQA 1BU6O 1WSJA 3GDQA 3KLIA 4LF6K 2HHUA 3VQ9A 4ILHA 1BA1A 1IG8A 2QWPA 3LP1A 4I6MB 2O8CB 4IOXA 3PSIA 4W5NA 4DR6K 1NJZA 4H0YB 3ZX0A 3D6RA 5C25A 1K8KB 4F9OA 3B8AX 4ELUA 5D3GA 2QXFA 3C6TA 5HRNA 1MWKA 3OYBA 3NVKA 2X78A 3DLRA 4E7IA 4AH9A 2XRIA 3QNNA 1VSIA 3WXMB 2D0AA 1SUQA 4L3QA 2QWOA 3S3OA 2V7ZA 1HNWK 1KQSM 5LJVA 1XHZA 1ESVA 2G8HA 2DFFA 2NRHA 4BQLA 3T1AA 1QSSA 1Y97A 3T3FA 1TYQB 4FJXA 3MN7A 4UY8O 3ITHA 3CJ9A 3E9LA 1GLLO 2KQ2A 1VSKA 3VF4A 4WFAL 1JLAA 4DU3A 1KFSA 4CJ7A 1TL3A 4QCLA 1D9DA 4J8FA 3BGRA 5HRSA 3HOSA 3F73A 4N76A 1BDGA 5C42A 5BPMA 5GADP 4NLCA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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