2FBYA

Wrn exonuclease, eu complex
Total Genus 66
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
66
sequence length
196
structure length
196
Chain Sequence
HHSVFEDDLPFLEFTGSIVYSYDASDCSFLSEDISMSLSDGDVVGFDMEWPPLYNRGKLGKVALIQLCVSESKCYLFHVSSMSVFPQGLKMLLENKAVKKAGVGIEGDQWKLLRDFDIKLKNFVELTDVANKKLKCTETWSLNSLVKHLLGKQLLKDKSIRCSNWSKFPLTEDQKLYAATDAYAGFIIYRNLEILD
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Transferase
molecule keywords Werner syndrome helicase
publication title WRN exonuclease structure and molecular mechanism imply an editing role in DNA end processing.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 66
structure length 196
sequence length 196
ec nomenclature ec 3.6.4.12: DNA helicase.
pdb deposition date 2005-12-10

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01612 DNA_pol_A_exo1 3'-5' exonuclease
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.10 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Ribonuclease H-like superfamily/Ribonuclease H 2fbyA00
1CLQA 5FROA 4B9UA 3ZT4A 3L2RA 3AVAA 1XHZA 1XI1A 4OPKA 1NK6A 3CYMA 4FW2A 4CF9A 1RBTA 4J2DA 1WN7A 2BANA 4OKKA 1WLJA 3VN5A 3EZ5A 3OYBA 1S1VA 1TKTA 1NOYA 4J2BA 5KRTA 3DLRA 1JLQA 3OYFA 3QESA 1S1WA 4Y1CA 3PX6A 1C1CA 3H08A 3VQ4A 4BE0A 1VRTA 3LP3A 2P5GA 4ELVA 3NH2A 3KD1E 4RW8A 3AVCA 1ZBFA 3KIOA 2GUIA 1T03A 1CXUA 5DMRA 2QK9A 5JS1A 1RDCA 2B4JA 3KTQA 3BDPA 3WNEA 2XY8A 5HLFA 1RTIA 2G8VA 4ELTA 3NF7A 4CHOA 4KB1A 1UA0A 2Y1IA 3DOKA 1J5OA 4DSIA 1RDBA 1TKXA 4PWDA 3DOLA 3TABA 3SYZA 4O55A 2P5OA 1TKDA 4NYFA 1HMVA 4FJ7A 2HNZA 4FLWA 4CIGA 1JLFA 4JLHA 4DU4A 4CJRA 4EP4A 1NKEA 3NE6A 3HSTB 1IKWA 3VQDA 3U3YA 1KRPA 2VWKA 2Z1JA 1WNSA 3LWLA 3V1RA 1BIUA 3JSMA 3S3OA 3L2QA 3ZT3A 4Z4IA 4B3OA 2KZZA 1UOCA 1BISA 2XY6A 3WNHA 2IS3A 1YVUA 3KK1A 3NF8A 4DMNA 3O4NA 4OPJA 3K57A 1RT7A 1VSMA 1UWBA 3ZSYA 4W5TA 4DG1A 4F2RA 4FJHA 3CFOA 4CJ3A 3CQ8A 1CZBA 4CHQA 1TAUA 3LPUA 4CHPA 3O3FA 1B9DA 4LY7A 4Z4HA 4HHTA 3KLEA 2G8KA 3HPOA 3TAFA 3OYKA 1J9AA 1JXEA 3ZT0A 3QEXA 2A1RA 1SL1A 2RF2A 1RBSA 4RW9A 1SV5A 1KLNA 4LH4A 4O0IA 3U6FA 3QEWA 4CGGA 2OPQA 3G10A 4FZYA 4FJLA 1HYSA 3D0PA 2D0AA 1TK8A 2R7YA 4CFAA 3MEEA 1GOBA 3QO9A 1JKHA 1BCMA 3CM5A 3PY8A 4DTMA 4CJQA 3AV9A 3CM6A 3PO5A 3HL8A 3C95A 3ZSOA 1TK0A 4NCAA 4BDYA 2BGGA 4OKJA 3AVNA 1S1XA 2ETJA 1T7PA 5C24A 4Z4CA 3LWMA 3HPHA 1LW2A 2PYLA 4Q5VA 1NJYA 4F4KA 1RTHA 1QS4A 4AHVA 2F96A 4KI6A 4DSKA 3I8DA 3SUPA 4EZ9A 2O4IA 2KFNA 4DQIA 2FBXA 4CHZA 3V6DA 1YTUA 1VSFA 4IG3A 4AHSA 3DRRA 3SI6A 3F9KA 1A5VA 3F73A 3RTVA 1HJRA 4CERA 4RW7A 3LP2A 4HCCA 4CEFA 4FM2A 4CIFA 2Y1JA 4KRFA 3M8SA 5C42A 5HRPA 2HHQA 1WAJA 1TV6A 4FXDA 4KTWA 4HVJA 1VK0A 5KTQA 3I0RA 3NDKA 3VQQA 4DLGA 3QERA 4E3SA 2FBYA 4OJRA 4B9LA 3LAKA 3WNFA 3AVFA 5I3UA 3KLHA 3AVLA 4FJXA 3OS2A 1X9MA 2RKIA 4CECA 2RPIA 4CGFA 4W5OA 3JYTA 1D9FA 1VSLA 2W42A 2ZE2A 3OYHA 3UIQA 2VG7A 2IGIA 3NFAA 4FJNA 1LWFA 3OYEA 4YFUA 1ZBLA 3KD5E 3K5LA 4DSJA 4KHSA 1I3AA 4MFBA 4JRQA 1WSIA 1O1WA 4H4OA 2AJQA 2HHTA 2G8UA 1FKOA 4FJJA 5K14A 1ZBIA 1KVBA 2IOCA 1SKWA 3NGIA 3TAGA 1EETA 4DTXA 3CFRA 4DSFA 2GBZA 1EKEA 1C0TA 2OYQA 1QHTA 1NK8A 4CEZA 4DFJA 1ZYQA 2HNDA 3NF9A 4IG0A 3HVTA 3NBPA 3S3MA 3A2FA 4CHNA 4NYNA 3D45A 5CZ1A 3SUOA 1S9EA 3ZT1A 3QIOA 4Z0UA 3L2VA 4M45A 2G8HA 2E6LA 4JRPA 3ZSVA 2YNHA 3AA2A 3P83D 3VQCA 3SQ4A 1L3UA 5HBMA 2Z1HA 4CJUA 4O4GA 4CJKA 3IG1A 5SWMA 2D0BA 1C0MA 3NF6A 4DF4A 2JGUA 1T05A 3ZSQA 3NCIA 2HNYA 2RN2A 1YT3A 3T3FA 3RMBA 4HUEA 4DFPA 3VQ9A 1L5UA 1JXBA 4KO0A 1XHXA 1X9WA 3PUFA 5HRRA 3AO4A 1S6QA 4IFVA 2YHAA 4CGDA 4KFBA 5J2NA 1KSPA 3HYFA 4DF8A 2YNIA 3AA3A 4HUGA 1ASVA 4BDPA 1WAFA 1HNVA 3SV4A 2HW3A 4FLVA 5J2QA 3TARA 4M41A 3LP0A 3SPZA 1JLEA 1S6PA 4I2PA 4QOZB 2HHSA 2YHBA 4CIEA 4FCYA 2QKKA 1TGOA 1JLCA 3T1AA 1D8YA 2XRIA 1BL3A 1REVA 4DTSA 2B6AA 4KHYA 3M8QA 5CY4A 4C8LA 3C6TA 4CEDA 4K8ZA 3LDSA 3LAMA 2NUBA 4CEBA 3B6OA 1A5WA 2LSNA 4DFKA 4FJ8A 4M3TA 3IS9A 4KTZA 1NK4A 5J2MA 3V9XA 3TAQA 1GOAA 4UQGA 5CYMA 3LZIA 3DI6A 5HRSA 4DQRA 1NK9A 4FJMA 1S1UA 1EP4A 4B9MA 4FJIA 4LSLA 1Q8IA 5J1EA 2BDPA 4CK1A 1TK5A 1KFSA 4FK0A 1GOCA 1J53A 1UAXA 3K5OA 4CESA 1U47A 3SUQA 1Q9YA 4FJ9A 3SQ0A 3QEPA 2E6MA 5KGXA 1VSDA 2VG6A 4LD0A 1RT4A 3I0SA 2YNGA 4E89A 3NGZA 4DU3A 1IG9A 4J2AA 2DTUA 2I5JA 1WSFA 3SPYA 1RTDA 4H4MA 2A1SA 4ELUA 5FRMA 1IKYA 4Z4GA 4DTRA 1N6QA 1LW0A 1EX4A 4N76A 3V1QA 1HQEA 3ZCMA 2YNFA 4CF1A 4NCBA 4Z4FA 1VRUA 4C8NA 4DSEA 1TKZA 1NKCA 3KK2A 1QSLA 3AO3A 2JLEA 3RRGA 4DWIA 2HHWA 2HVHA 1RT6A 1ITGA 2EX3A 4B9NA 5CZ2A 4E1MA 1A5XA 3ITHA 3OYLA 4FJKA 3VQ7A 1KVAA 5KGWA 3HP6A 2DFFA 4DQQA 5FDLA 3PO4A 5E41A 4HUFA 3DLKA 4LH5A 3OJSA 1RCHA 1F21A 4ID5A 4FLZA 4LSNA 1NKBA 1C6VA 4FZZA 4N56A 4FW1A 1BI4B 1N5YA 1BGXT 3AVBA 1WSEA 3E01A 4B9SA 3NGYA 3OYJA 3V9ZA 1QQCA 1I39A 3SQ2A 1KVCA 3AO2A 4ID1A 3KJVA 4R5PA 3ASMA 1LAVA 3QNNA 3TI0A 3DLHA 4DSLA 4PUOA 4MQ3A 3NH0A 3SJJA 4DU1A 3ZSWA 4F3OA 4BE1A 2Q3SA 5KRSA 4CJSA 3K59A 3QETA 2PYJA 1JLAA 2PY5A 1RILA 4FVMA 1LWCA 4CJPA 3NAEA 1QTMA 4FK4A 2XY7A 4Q0BA 4AHRA 4CFDA 4FLYA 1HRHA 1VSEA 4CK2A 3HVRA 3AA4A 4PQUA 4PA1A 2BE2A 3T19A 3O3HA 1IKXA 4CEOA 2IDOA 3OS1A 3OVNA 4C8MA 2WOMA 3MXJA 3RR8A 3QNOA 3V9UA 2X6SA 4OLBA 3SQ1A 1D9DA 3IRXA 3VQBA 3AVGA 1BIZA 2XO7A 5FRNA 3V81A 3M8PA 3KK3A 3SZ2A 3DLGA 1SL2A 1K6YA 2HB5A 5EU7A 4TSXA 2QKBA 2HMIA 4OLAA 2OPRA 4B9VA 1L3VA 3LANA 3VQPA 4CJLA 3IAYA 3ZT2A 4CEAA 3MXMA 4KTQA 1SKSA 1RTJA 3AVKA 1XWLA 3VQ6A 2VG5A 3VA3A 3K5NA 1WSHA 4CJEA 3L3UA 3SUNA 1S9GA 1IKVA 1DTTA 2HVIA 3DRSA 3KKSA 2YKNA 3U3GA 3MEGA 4CK3A 4KAZA 4FLUA 4ZTFA 3OYGA 3ALYA 3HXMA 3V9SA 3DLBA 1JL1A 4HCBA 4DTNA 1RDDA 1HPZA 4O0JA 2VWJA 3DRPA 3EY1A 1B92A 2Z1IA 4DTOA 4KHQA 4FZXC 4M3UA 5C25A 2FC0A 1U49A 4CFCA 2PZSA 4M3ZA 1NK7A 4O44A 4FJ5A 1SKRA 4M3WA 4I9LA 3DM2A 1R0AA 3RMCA 1IO2A 4YNQA 4KHWA 1FKPA 4BACA 3O3GA 1FK9A 2FBVA 4BWMA 1DLOA 3O4QA 3OY9A 4AHTA 1BHLA 1JLBA 4N41A 3TAPA 3K2PA 4N5SA 1NK5A 1TL1A 1L3TA 4KREA 1RBVA 1NJWA 1NJXA 4BE2A 1UA1A 4RW6A 4DQPA 1TL3A 4IDKA 3L3VA 4IBNA 2KTQA 3AVJA 3OJUA 4N47A 4CE9A 2QXFA 4ZHRA 3C6UA 4E7HA 3B6PA 1D5AA 4W5RA 3SV3A 4B8AB 2ZD1A 1U04A 3ZSZA 4FM0A 4DTPA 3LZJA 3S3NA 1X9SA 1J54A 5CYQA 1U45A 1Z25A 1L3SA 4CFBA 1IH7A 3PV8A 3FFIA 4B9TA 4DLEA 4QCLA 4H8KA 4IKFA 1HQUA 1EXQA 4CJWA 3QINA 3HM9A 2ATQA 5HP1A 5I42A 2YV0X 4W5QA 4AHCA 1KTQA 3KLIA 4E7KA 3LP1A 4CF2A 3SNNA 4M3YA 2OZSA 3RMAA 4EP5A 1ZBHA 4O5BA 4KV8A 4QAGA 3QEVA 3C94A 3ISNC 4CJFA 5DK5A 3OYMA 4B8CA 4RG8A 1TVRA 2P1JA 3MXIA 4RW4A 3HP9A 3VQ8A 1VSIA 2OPSA 3MECA 1VSJA 3K58A 1QE1A 4JS5A 2KQ2A 5HROA 2DY4A 2X78A 2XHBA 4CJ4A 4E7JA 5T7BA 1NK0A 2XY5A 4L8RB 2Z1GA 4W5NA 4Y1DA 3P5JA 4F2SA 2ZQBA 4CJTA 1Z26A 4DS5A 1JLGA 4CJVA 2D5RA 4GW6A 3OYNA 3V1OA 4FLXA 2HHXA 1CZ9A 3P1GA 4E1NA 1CXQA 3AVIA 4KKOA 4I2QA 3RRHA 4AH9A 4DQSA 5KI6A 3L8BA 3V4IA 1LWEA 4F3TA 4E7IA 4M42A 3HPGA 3LALA 4ICLA 1HNIA 1WSJA 2DFEA 4CF0A 4CGHA 4E19A 3K5MA 3CG7A 1Q9XA 2E4LA 3G0ZA 1FXXA 4CEQA 2P51A 4ZTJA 1BQNA 1XC9A 1JL2A 4C8OA 4K8XA 4BWJA 1U48A 4CHYA 3QEIA 2B5JA 4HTUA 2KZMA 4CEEA 4PY5A 2DFHA 4Z4EA 4FM1A 2G8WA 1RT3A 4M3RA 3DMJA 3THVA 3S9HA 4EZ6A 1SUQA 3VQAA 3AVHA 3LPTA 1RT1A 4C8KA 3M8RA 4OVLA 3VA0A 2HHVA 2G8FA 2GV9A 2KW4A 2OZMA 4G1QA 3TAEA 1LAWA 2O4GA 2ITGA 2EHGA 1U4BA 2YKMA 3RR7A 2X6NA 5J2PA 3TANA 1BI4A 4CGJA 3L2WA 3ULDA 1LV5A 4DTJA 1C1BA 4XIUA 4IFYA 4CCHA 3PX4A 1RNHA 3OYAA 4I9QA 3TR8A 3SCXA 3KLGA 1HYZA 1NOZA 4FJGA 3TWHA 2G8IA 5HRNA 3AO1A 1VSHA 1ASWA 3VQ5A 3OS0A 4OGCA 3L2UA 3DYAA 3NH1A 3EYZA 1QSSA 1ASUA 1T8EA 4KI4A 2D0CA 4DTUA 3HT3A 1ZBUA 1W0HA 1S1TA 2IC3A 3QLHA 2OPPA 1TAQA 2IAJA 4FK2A 5SZTA 3OYCA 1C0UA 4CF8A 1RBUA 4CGIA 4NCGA 1QSYA 2F8TA 1W9HA 4JS4A 2KFZA 3DLEA 1NJZA 3KKRA 3TAMA 3OYIA 4DFMA 4FYDA 4J2EA 3MEDA 1KFDA 1KLMA 3AVMA 4OGEA 2FBTA 3ZSXA 1C1AA 1YTAA 3RWUA 1RT5A 2X74A 4WE1A 3HO1A 1RBRA 1VSKA 4BDZA 5JS2A 4E0DA 3OYDA 4FLTA 3VQEA 4I7FA 2OA8A 1RDAA 3BGRA 4KB0A 1WSGA 3AO5A 2WONA 4DS4A 4KPYA 4GVMA 4M3XA 1BCOA 3NHGA 3RMDA 4GMJB 1Y97A 3ZSRA 4E7LA 3KLFA 1DTQA 1KCFA 3QIPA 3WNGA 4KHNA 4KHUA 3HK2A 1SL0A 4AHUA 1RT2A 3MAQA 1MU2A 4CJ5A 4B08A 3AA5X 4AILC 2F8SA 1BQMA 1S5JA 1B9FA 3PX0A 3V9WA 4F8RA 3HJFA 1G15A 5D3GA 2HHUA 3CFPA 1HYVA 1X1PA 4OKEA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1BA1A 2HBLA 4WYBA 4A61A 1IBLK 3L2RA 1NK6A 2FLOA 3CYMA 1QHAA 4BR7A 1IG8A 3VN5A 4Y0WA 3KHYA 2A40A 3QESA 3PX6A 1C1CA 4ELVA 2P5GA 4LFCK 3RVCA 2QK9A 2W6LA 4H0VB 3WNEA 2G8VA 5BPNA 5TKYA 2O8BB 4B3TK 3DOKA 1QVGM 3DOLA 2GWKA 4O55A 1DT9A 4NYFA 3AGKA 3VGLA 1JLFA 4DV1K 3I33A 1YJWN 3VQDA 2Z1JA 4DR3K 3LWLA 4H5WA 3L2QA 2P9LB 2O8FB 1BISA 3JXUA 4JKGB 5E26A 3J7AP 4OPJA 5FPMA 1VSMA 1UWBA 4DG1A 3FZKA 4CJ3A 1CZBA 2KHOA 3LPUA 3O3FA 4DUZK 4LY7A 3CCRN 3KLEA 3HPOA 4FJLA 2A1RA 1JXEA 2RF2A 1RBSA 3L4IA 2IIRA 1S3XA 2Q31A 3QEWA 3P4IA 3VESA 3D0PA 1WBBA 2R7YA 5AQMA 3MEEA 1GOBA 4GY2B 4CJQA 3AV9A 4DV6K 3PO5A 5AFUH 3AVNA 1S1XA 2PYLA 4B1YB 5BRHA 1QS4A 2F96A 3CJBA 4DHYA 4BQZA 1YTUA 4IG3A 4RTFD 3DRRA 1A5VA 3F73A 3GL1A 4BRHA 3RSEA 4CEFA 3TSPA 1TV6A 5I9EB 1VK0A 3I0RA 4JI0K 4CW7B 3QERA 4FWMA 5KQDA 3AVLA 1X9MA 1NNEA 4JK8A 1XQSC 3ULEA 4CECA 2RPIA 3JYTA 4BVPA 3FZLA 2W42A 1ZC6A 2IGIA 4FJNA 3OYEA 4KHSA 4DSJA 2A3ZA 2F4VK 2AJQA 5F0XA 3GE1A 2G8UA 1FKOA 4FJJA 5K14A 1ZBIA 3ENHA 1SKWA 4DTXA 1EKEA 1NK8A 2HNDA 3NF9A 4M7YA 3HVTA 5C2DA 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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