2FF6A

Crystal structure of gelsolin domain 1:ciboulot domain 2 hybrid in complex with actin
Total Genus 122
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
122
sequence length
370
structure length
360
Chain Sequence
TALVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIITNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPTLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNVPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVTHNVPIYEGYALPHAIMRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFVTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFENEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPETLFQPSFIGMESAGIHETTYNSIMKCDIDIRKDLYANNVMSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWITKQEYDEAGPSIVHRKCF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Structural protein/contractile protein
molecule keywords Gelsolin
publication title The Structural Basis of Actin Interaction with Multiple WH2/beta-Thymosin Motif-Containing Proteins
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 122
structure length 360
sequence length 370
ec nomenclature
pdb deposition date 2005-12-19

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2ff6A01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2ff6A02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 2ff6A03
3ATUA 3H46O 5FPDA 5F0XA 3DWLA 1NBWA 4BC4A 5LJWA 1QQOA 1RFQA 4JN4A 2P9NA 3O08A 3QFUA 3O1BA 1NGCA 4H0OA 4H5WA 2E2PA 1J6ZA 1GLAG 3D2FA 3WXLA 1YAGA 1TUYA 3OHRA 3WXKA 3O5BA 2P9IA 3DXMB 4FWSA 3O80A 3GG4A 5I9EB 3W0LA 2WUSA 1ZC6A 4BRNA 5EXWA 2ASPA 5AZJB 4XH5A 3FLCO 1NGBA 3ENOA 4Y0WA 3FR0A 3HZ6A 1C0FA 2IVNA 4BRPA 3MCPA 4O8KA 4B1XB 3A0IX 2GWKA 3AY9A 5JMVA 1V4SA 2FF3B 1BDGA 3ID8A 5LJVA 1CZAN 3VETA 2FXUA 1HUXA 1BA1A 2YHYA 2D4WA 4FPAA 4CBXA 3GDQA 4JD2B 1GLJO 3ZEUB 4IXCA 3UB5A 2W41A 5JLHA 1SZ2A 4B1ZA 2QWMA 4I6MB 4BG8A 2ZGZA 4FOEA 2V51B 2P9KB 5KQ8A 2Q97A 3CERA 2QWRA 4B1YB 4IJAA 1ZXOA 3BF1A 2PBDA 2Q0UA 3FZLA 4BGAA 3D2EA 4HTLA 4ISFA 4BR0A 2AP1A 4BRLA 4MO5A 3HBTA 2F9TA 2IVPA 3CIPA 3RSEB 3CQYA 2GEMA 2V7YA 3WXIA 5ADXA 3UKUA 1HLUA 3TPQA 3DJCA 1JCFA 2CGLA 3P4IA 1Z6RA 3H3NO 4BRFA 2QW9A 4BRQA 1H1VA 3ZETA 5AQXA 5AQZA 1QQMA 4H5RA 4BVOA 5BREA 1RGIA 4BR2A 3GL1A 5AQGA 3U9ZA 5KPTA 3ULEA 1NLVA 3G25A 3A8YA 2E8AA 4EHUA 5AQHA 3WEEA 1SAZA 2E2QA 3H1QA 3HSCA 3UKRB 2D1KA 5AQRA 5AQYA 3VPZA 2OANA 5JLFA 5BPMA 4AM7A 4FPBA 4BREA 5AQOA 3VGMA 3JXUA 5AQMA 1D4XA 4ISEA 3VESA 3CJAA 2I7PA 2F9WA 4BG9A 1WUAA 3VEYA 1IJJA 3HI0A 4CI6A 5BRFA 1NGIA 3A5LC 2CH5A 3BP8A 5EOYA 4H0PA 1TYQA 2P9NB 4J8FA 3VERA 3VEXA 2ASOA 1BA0A 2HF3A 1NMDA 4ISGA 2P9PA 4FOIA 4H5TA 4PL8A 2W40A 1QQNA 3SK3A 3D2FB 1X3MA 4FO0A 1LOTB 3C0BA 1NGHA 3EL2A 4IZ9A 5BN9A 4H03B 3ATVA 2QXLA 5AQVA 3FZKA 2P9LA 2A5XA 4B1WB 4BVPA 5B8HA 2D0OA 2HMPA 4HWIA 4EFHA 3QB0A 2VYPA 5EY4A 4WQ4C 1Y64A 1MWKA 1GLEG 4CD3A 1Z05A 3VEZA 1S22A 3IUCA 2Q2RA 1NGFA 3LM9A 1NGEA 2FLOA 5TKYA 3L6QA 3QBXA 3DXKA 4CJ7A 3BUZB 2CGJA 3UE5A 1NGJA 4BR5A 1DGKN 1BG3A 5F1XA 4DCHA 1ESVA 3QFPA 4M7XA 4BR4A 3KHYA 3H45C 3WT0A 5KPRA 1HPMA 1HJOA 2J4RA 5KQDA 4A62A 4Z94A 3JS6A 3AAPA 3CJCA 3O8MA 4BRIA 4BRKA 5AZIA 4QS9A 4B9QA 4MLHA 3QDKA 1KAZA 3D2EB 2P9UA 3LDQA 4EAHD 5AQNA 5EVZA 3LL3A 4A61A 3R8EA 3I33A 3H6EA 2BTFA 1KAYA 4FWLA 1BO5O 2E2NA 3UKUB 2HOEA 2EWSA 2KHOA 4IO8A 5AQQA 1SQKA 5AQIA 3WXJA 2YJEA 3VEOA 4JNEA 5AQLA 1R59O 3MDQA 5BN8A 3CETA 5ADXH 2FSKA 2E20A 3ZETB 3R6MA 3AAQA 2DPNA 2BUPA 4K42A 4YDUA 3DXMA 3ENHA 4BRCA 3M3ZA 2QWQA 5JICA 4CZMA 2ZGYA 3ULEB 5AZJA 4K43A 4H0XB 3QICA 1QHAA 2YCHA 3VF6A 3WEEB 3A5NC 3VGKA 3WQUA 2ASMA 3W3DA 2HF4A 3LDOA 2UYTA 3C7NA 1GLCG 4CZIA 4XEIA 4C23A 3O4WA 4MO4A 1U2VA 1HKGA 2P9SA 4NB4A 1K8KA 3L4IA 3EN9A 1E4FT 3R9PA 3FGUA 4F9OA 1KXPA 4JHDA 4A2AA 5BRHA 2ZWHA 3O6WA 3CJBA 3EO3A 1T44A 1TYQB 2QM1A 4KBOA 3FFKB 1TUUA 3U9DA 3WQTA 4BROA 3FZHA 2P9PB 4CZJA 2CH6A 2PAVA 3MN6A 5FPEA 3CJ1A 2A3ZA 3QBWA 1GLDG 4XH4A 3QMLA 4CD1A 3B8AX 1P8ZA 5BPNA 1GLLO 1BUPA 1DKGD 3VEVA 4LC9B 4DHYA 5AQJA 1ZBSA 2E1YA 2YHXA 5ELZA 2FF6A 4BQZA 4NO7A 3WUHA 1T6CA 2Q0RA 3I8BA 2FSJA 4WQ4A 4XH1A 1RDWX 5AQKA 4RTFD 1BWFO 1X9JA 2P9IB 5BR9A 5FPNA 1NM1A 3DXKB 4WYBA 4M7YA 3VF2A 4BR7A 4BRHA 4FWOA 4M63C 3SMPA 3CI5A 2GUPA 3AARA 1QZ6A 4WQ5C 2AA4A 3UKRA 4FWQA 3U4LA 5AQTA 4BC5A 4BRAA 1MA9B 4K25A 4BC3A 4IJNA 4FWKA 5AR0A 1YUWA 3MN7A 1LCUA 2NRHA 5AFUA 2P9UB 4CBWA 3CJ7A 1ATSA 3A5OC 3F9MA 5F2RA 1DEJA 2NLXA 5E84A 4DB3A 3GBTA 1Q18A 1MWMA 2E2OA 1OKJA 1X3NA 4GNIA 3TU5A 4H5VA 2GELA 3VENA 2IVOA 3VF4A 4MLEA 2QWLA 4CZFA 3HTVA 4FWPA 5LY3A 2D0PA 5FPMA 3BF3A 4CZGA 2YJFA 2A40A 4BRDA 3H3OB 4EHTA 3MMVA 1MDUB 4AM6A 1NGGA 3FZFA 5BPLA 5AQUA 4O5FA 2QWNA 1BOTO 1GLFO 1U6ZA 3CHWA 2FSNA 3C7NB 4H5NA 1T6DA 1V4TA 4CZEA 1QZ5A 1G99A 1U2VB 2P9SB 3J8AA 3ZX3A 1E4GT 1K8KB 4CZHA 1XC3A 4JHDB 2NZTA 2Q1NA 4B1VA 5CE3A 1BU6O 2A41A 3CQXA 2ITMA 1JCEA 3S41A 4RWTA 2Q36A 4L3QA 4PL7A 1YXQA 4FWMA 4A2BA 4GY2B 2VWBA 3GOIA 4PKGA 1NGDA 1NWKA 2E1ZA 2GWJA 3M6GA 4PKIA 3KZBA 4JD2A 3ZEUA 3LM2A 3LDLA 4CZKA 4I6MA 4JAXA 3MN9A 4FWNA 4CBUA 3MK6A 3ZX0A 3U8XA 2P9KA 4BGBA 3SLCA 3L0QA 1JCGA 5AQFA 4YDUC 4BRMA 4CZLA 3A5MC 4FL9A 2IIRA 2A42A 2YHWA 4FSVA 4RCHA 5BRDA 2E88A 3VEWA 4EIAA 1HKCA 2VCPA 2I7NA 2QWOA 5E26A 5AQSA 1KAXA 5AQWA 3RSEA 3VOVA 1YVNA 1HX1A 2P9LB 2QWPA 3O1WA 3KVGA 5AQPA 4H0VB 3DAWA 4BQLA 1IG8A 1NGAA 4IWVA 4H0YB 4WQ5A 3BEXA 1HKBA 1C0GA 3CJ9A 4E1JA 3VGLA 3EZWA 3ZX2A 3SJHA 3IMXA 3HM8A 2H3GX 3EKUA 1XUPO 4BRGA 5EX5A 2A6AA 3D7EO 3IDHA 2CGKA 3LDPA 3EKSA 4H0TB 4FWRA 5KPZA 4B1UB 3FZMA 1GLBG 1ATNA 1WOQA 3GE1A 5AFUH 1XQSC 4PKHA 4BR9A 1S3XA 1EQYA 4K41A 4QS8A 3MN5A 2YI1A 1ATRA 3M1FA 2Q31A 3H1VX 4QS7A 5AZIB 3IFRA 3SMSA 3FE1A 2V52B 2V7ZA 4DQ8A 4BC2A 2ZF5O 3LDNA 2GTDA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3LANA 3ATUA 2Y1IA 5FPDA 3PX0A 3DWLA 4KHYA 2Z1GA 1KSPA 3AVBA 2D0CA 3WXLA 1TUYA 3OHRA 3THYB 1VQPN 1BCMA 3SV4A 1EXQA 4CEZA 2XRIA 4BRNA 5AZJB 1KLNA 4N56A 4G1QA 4KB0A 2G8UA 2HHTA 2P5OA 5HRSA 4CEEA 3V81A 4KAZA 3HZ6A 4BRPA 1YITN 1L3VA 3WNGA 5JMVA 2X78A 1XHZA 1Q7YO 1CZAN 4ID1A 3NVMA 1C0TA 4CJFA 2D4WA 3LP0A 1TK8A 2PFUA 3SQ4A 3NE6A 4DV1K 4DFPA 1JLEA 4O8UA 1IKXA 3T7ZA 4B1YB 3K5OA 2PBDA 4BGAA 3HPOA 3D2EA 4HTLA 4MDBA 1J53A 2HHSA 3LPTA 2F9TA 2IVPA 3RSEB 1EWQA 3RMAA 1REVA 3WXIA 1Q82O 2B4JA 1HLUA 3LP2A 3P4IA 4JKDA 4E3SA 1X9MA 4BRQA 4X65K 1RBVA 4YFUA 5AQZA 2O8CA 3OTOK 1RGIA 2HNDA 2GV9A 4N41A 5KPTA 1TL1A 1TKZA 1T3VA 3LALA 3P38A 3QEPA 1VSIA 2YKMA 4BWJA 4B9VA 3NBPA 3WEEA 4C8KA 1SAZA 2HHUA 4AILC 5AQYA 1RT5A 2G8KA 2IOCA 3VPZA 3OYHA 5JLFA 3LWMA 4FPBA 3T3FA 5AQOA 1XC9A 5AQMA 1MU2A 4JI4K 4NLBA 4JI1K 3HI0A 1ASUA 5BRFA 1NGIA 1WSHA 4DFMA 3DMJA 3ZSWA 3RTVA 2BANA 1L3UA 4NYFA 3QIOA 1SL1A 4DTJA 4NCGA 4FO0A 1N36K 2KTQA 5HROA 4DS4A 1XNQK 1OH7A 2OA8A 1EETA 3AGKA 5BN9A 4B9UA 4DKWA 4FJJA 3HK2A 4CHOA 2D0OA 4GKJK 3G10A 2YX6A 2VGNA 1JKHA 4EFHA 3QB0A 2C1IA 2VYPA 2VG6A 3MX2A 2OCEA 3ULDA 3L2WA 1FXXA 3LWLA 4IDHA 4ZTFA 3LDSA 4CJ7A 3DXKA 3KTQA 3UE5A 4GW6A 1BG3A 2F96A 3D45A 5F1XA 1RTJA 3QFPA 2W6LA 1VQ8N 3N4PA 1S1UA 3CCEN 1K73O 3OYFA 3CC2N 1RBUA 3VQ8A 1CXUA 2QK9A 1EX4A 2RHKA 1U4BA 3CYGA 4KKOA 4BRIA 4BRKA 3E9PA 4X66K 3SUOA 4A5AA 1KAZA 3D2EB 3B6PA 3CF5L 4FJKA 4I7FA 5EVZA 4ILGB 4A61A 3R8EA 3QLHA 3H6EA 1KAYA 4C8MA 1B9FA 4CIGA 2HOEA 3F5TA 3VEOA 5AQLA 3SYZA 1R59O 4OLBA 2OPRA 5ADXH 2E20A 2X6NA 2O8CB 4YOWA 3DXMA 1E3MA 1U49A 3OVNA 1ZBIA 5BR8K 3DLRA 3QICA 1QHAA 2OTJN 3VF6A 4DU4A 3WEEB 3A5NC 1VSFA 3WQUA 2HB5A 1S1WA 5GIPA 1BQNA 3W3DA 4Z4HA 4OKEA 2UYTA 3CCVN 4XEIA 3WNFA 1KFDA 3VTIA 4X64K 1S1XA 3SQ0A 4CJEA 1D8YA 3QNNA 2ZM6K 3IG1A 1E4FT 1KXPA 4YOXA 3O6WA 4CEDA 4K0KK 3NF7A 1KFSA 3HXMA 3ZT0A 1OVQA 3RWUA 3U9DA 4FK0A 2CH6A 1SUQA 3MN6A 4V19S 1RILA 2A3ZA 3RRHA 3L8BA 2EHGA 3OYJA 3CFOA 1VSHA 4F3OA 3EE9A 1VQKN 1GLLO 1DKGD 4DHYA 2RN2A 5AQJA 3VQDA 1KVBA 1NK8A 1WB9A 2KW4A 2FF6A 1WBBA 4KO0A 3DI6A 5IT9O 1RDWX 4DTMA 4RG8A 1N33K 3K5LA 2B6AA 1X9JA 5BR9A 1NM1A 3DXKB 4M7YA 3HP6A 4FK4A 4KHPK 4BRHA 2JLEA 4AF1A 2O8EA 1QZ6A 5HL7L 3U4LA 3OJUA 4OKJA 4FK2A 4FWKA 5AR0A 1ZBLA 3RRGA 1YUWA 3MN7A 1LCUA 4LF5K 4CBWA 2GX9A 3CJ7A 5FDLA 1YJ9N 4YOUA 5E84A 4CJSA 2GBZA 2E2OA 3CFPA 1OKJA 4DF4A 4DUZK 2GELA 3VENA 5HOOA 3VF4A 4YOTA 1CZ9A 1Q81O 3DLLL 3ID6A 5A2QO 1EO1A 1VSJA 3ZT1A 3DRRA 4ILJA 5K14A 2UXCK 1HQUA 1O1WA 1NGGA 1RDAA 5BPLA 2WFBA 1NJYA 1S9GA 4HTUA 1FK9A 1HMVA 4PWDA 1BCOA 1V4TA 5GINA 4CZEA 1QZ5A 3G0ZA 4CGJA 3ZX3A 3SBTA 2VQFK 1X9SA 4M3UA 1S6PA 2NZTA 3CYMA 2Q1NA 4HVJA 3C95A 4J2EA 3S41A 2OTLN 4A2BA 3KLHA 2VWBA 3GOIA 1NGDA 3THWB 1NWKA 2E1ZA 1ZYQA 3U6FA 2GWJA 1VAZA 1W2BM 3ZT2A 2QI2A 4PKIA 4JS4A 4JD2A 3AO3A 3ZT3A 3LM2A 4DMNA 2UUCK 4LFAK 4I6MA 4FWNA 1NKCA 4CBUA 4UY8O 4KH5A 2P9KA 2YKNA 4DV2K 1VQON 4BGBA 3L0QA 1L5UA 3CCQN 3SJJA 4FL9A 2YHWA 5BRDA 2BH1A 4FLUA 2VCPA 5AQWA 4FM1A 4ZHRA 2P9LB 3O1WA 1YF5L 3KVGA 4B9NA 4M3ZA 2O8EB 1QSYA 4KHQA 4M45A 4IFVA 3O9RA 3VMFB 3VQ4A 1G15A 3ALYA 1S1TA 4ICLA 2C1GA 3KK7A 5CYMA 5JVGL 3IDHA 3D7EO 3I0RA 3LDPA 4H0TB 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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