The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
188
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sequence length |
477
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structure length |
471
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Chain Sequence |
HPACITLPERTCRHPLTDLEANEQLGRCEDSVKNRFDRVIPFLQVVAGIPLGLDHVTRVQELAQSSLGHTLPEELLKDNWISGHNLKGIFGYATAKALTAATEQFSRDDSASAIGFFLDCGFHAVDISPCADGRLKGLLPYILRLPLTAFTYRKAYAGSMFDIEDDLAQWEKNELRRYREGVPNTADQPTRYLKIAVYHFSTSDPTHSGCAAHGSNDRAALEAALTQLMKFREAVENAHCCGASIDILLIGVDTDTDAIRVHIPDSKGFLNPYRYVDNTVTYAQTLHLAPDEARVIIHEAILNANRSDGWAKGNGVASEGMRRFIGQLLINNLSQIDYVVNRHGGRYPPNDIGHAERYISVGDGFDEVQIRNLAYYAHLDTVEENAIDVDVGITIFTKLNLSRGLPIPIAIHYRYDPNVPGSRERTVVKARRIYNAIKERFSSLDEQNLLQFRLSVQAQDIGSPIEEVASA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Lyase
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| molecule keywords |
carboxysome shell polypeptide
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| publication title |
The Structure of beta-carbonic anhydrase from the carboxysomal shell reveals a distinct subclass with one active site for the price of two.
pubmed doi rcsb |
| source organism |
Halothiobacillus neapolitanus
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| total genus |
188
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| structure length |
471
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| sequence length |
477
|
| chains with identical sequence |
B
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| ec nomenclature |
ec
4.2.1.1: Carbonic anhydrase. |
| pdb deposition date | 2005-12-22 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF08936 | CsoSCA | Carboxysome Shell Carbonic Anhydrase |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Up-down Bundle | Four Helix Bundle (Hemerythrin (Met), subunit A) | Four Helix Bundle (Hemerythrin (Met), subunit A) | ||
| Alpha Beta | 2-Layer Sandwich | 60s Ribosomal Protein L30; Chain: A; | 60s Ribosomal Protein L30; Chain: A; |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2FGY A; #chains in the Genus database with same CATH topology 1ZHY A; 1S72 F; 3L8J A; 1ZW2 A; 2RHL A; 5GIP C; 1H9T A; 2XM0 A; 3LME A; 5C8Y B; 2J7P A; 5HWE A; 3HLZ A; 3KJK A; 2CSL A; 2DB4 A; 4ZLD A; 4C8G A; 1TWH A; 3GOD A; 2EIM C; 1Q86 H; 2VAP A; 5L0F A; 3JCM M; 3IMP A; 3N24 A; 3NYL A; 4F4B A; 1M6T A; 3NK7 A; 1SDS A; 3SXY A; 5KYW B; 1PF5 A; 3DWW A; 4YJ2 B; 3WGM A; 5DQZ A; 4ER9 A; 2X51 A; 3RVZ A; 1PD1 A; 5EB1 B; 2PFD A; 4MW8 A; 3JAR A; 4BW0 B; 1K05 A; 2L9J A; 1ORJ A; 1W2W A; 3I55 F; 1BDJ B; 2HX0 A; 4I1O B; 1Q8R A; 3LEV A; 1A7V A; 2ZXW C; 2Y39 A; 5DLJ A; 2UUI A; 3CCM F; 2HVY D; 2YKZ A; 3MBM A; 3CYQ A; 2XLW A; 3OWT A; 3G6E F; 4U39 A; 1YVI A; 1GQA A; 4M8I A; 3HJW C; 1V4A A; 2WZL A; 3S9O A; 1TFK B; 5CI8 A; 4BJ5 A; 1YA7 O; 4MVO A; 3JCU Q; 3LWP C; 1ONI A; 3V3T A; 3VTI C; 1LIH A; 1VLS A; 1VQK F; 1VQN F; 1TUB B; 3IQC A; 1Q82 H; 1VQ6 F; 5K0I A; 1J8M F; 4DXD A; 3T6J A; 4G0H A; 5L0J A; 5TJ5 E; 5LXT A; 1K04 A; 3S28 A; 3JT1 A; 2VCA A; 2IXM A; 4I50 A; 5B3S C; 5KYN A; 1QD9 A; 2QI2 A; 4N4W A; 1JR8 A; 5GAP K; 3MX3 A; 2OU6 A; 4JIO A; 5BQG A; 5B3I A; 2VGM A; 1W3E X; 4JEA A; 1TWA A; 1C17 M; 1X25 A; 3BYQ A; 2E87 A; 3EQL F; 3NRH A; 3HWU A; 1Z3I X; 2XLV A; 1R1M A; 3EHM A; 4NUT A; 3KMI A; 4ANJ A; 3LEO A; 5JCO A; 2IOQ A; 2XSE A; 5G4U C; 2EPL X; 4FFB A; 3KL4 A; 3ZO8 A; 5KYU A; 1VK5 A; 1LI7 A; 3OBW A; 4EUK B; 1FNT c; 1OKK A; 3FAP B; 4M63 A; 3K14 A; 3CMA F; 4CJO A; 5AC4 A; 2HJ3 A; 3WJP A; 1RKE B; 5G4V C; 4O6Y A; 1NFN A; 3TD5 A; 3FOO A; 3V5Y A; 3V5X A; 4HNA B; 2JD3 A; 1IPA A; 1UI9 A; 3CME F; 2KGO A; 3G4Z A; 4XLN F; 2ZVZ A; 5J2U A; 4B5C A; 1XRG A; 1TKN A; 5BQI A; 1PXW A; 4E6E A; 3HKC B; 4ZOL B; 5KYY B; 4XEK A; 2A6E F; 3FVY A; 2HV6 A; 4IAO A; 3C9S A; 3ERN A; 3C8G B; 5JH7 A; 3RQG A; 3S90 A; 4O4L A; 1SMY F; 2KC3 A; 3VO8 A; 2L7A A; 3OA1 A; 1MNE A; 3WOD F; 1XBI A; 4ULV A; 4PR9 A; 3CB2 A; 5E2Q A; 2MHR A; 1L3P A; 1W58 1; 4JRZ A; 3DJN B; 4Z9J A; 4XEF A; 2ZXP A; 1V54 C; 3J80 M; 1TQG A; 2VCB A; 4DRH B; 4BVT A; 3RKO F; 4CS8 A; 2HZ8 A; 2RHJ A; 3P0Z A; 3CCR F; 3AG1 C; 2R6R 1; 3X2Q C; 1JJ2 F; 2PBE A; 1RXQ A; 2DYR C; 4EI9 A; 2J7P D; 5C8Y A; 2EIJ C; 4PJN A; 2LIG A; 3QW1 A; 5T3T A; 3D01 A; 3IPM O; 2R02 A; 1OXB A; 1CK2 A; 5MN4 A; 1VQ8 F; 3EH1 A; 5L0G A; 4OD4 A; 4I1M A; 2P61 A; 2HQS C; 3V5Z A; 4O2A B; 3HNL A; 3WGL A; 3VF0 A; 3CCE F; 2B0H A; 3LJB A; 3VIU A; 4TV8 A; 3TOL A; 5LA6 B; 4YJ2 A; 3VYU C; 2M64 A; 3GWL A; 4G4V A; 1BR2 A; 5HSW A; 2YLD A; 1LPE A; 2P1A A; 3LLI A; 5COG A; 1V55 C; 1XV2 A; 4HFK B; 1PV3 A; 2W4M A; 5COF A; 3AGT A; 1J8Y F; 1GS9 A; 1QAH A; 2B0J A; 3ZC4 A; 5LP6 B; 1ZHX A; 3TUL A; 4JTA B; 2CVL A; 2QY9 A; 4E0I A; 3JAW A; 1WAT A; 3Q7L A; 5HV9 A; 4IHJ A; 4XCQ A; 4H4K C; 1OFU A; 1APC A; 3S06 A; 2QTP A; 2QLA A; 4ONS A; 4Q4Z F; 3RA5 A; 1YLM A; 3DM5 A; 1KQS F; 2J46 A; 5L3Q A; 2ZAU A; 1JFF A; 3DAG A; 3ZP7 A; 4DRX A; 2L26 A; 3DD7 A; 3EZH A; 4NC3 A; 1Q7Y H; 4LNU B; 4BT7 A; 4D4X A; 1QVX A; 3NDB B; 5AVM A; 2P7V A; 4YL1 A; 5A6B A; 3VOA A; 1A41 A; 4X1Y B; 5L0D A; 1VLT A; 5MN6 A; 4BEJ A; 4I55 A; 4K0D A; 5CA1 A; 3JRM O; 1OW6 A; 2GWW A; 2Q00 A; 1CLI A; 2VXY A; 2J9B A; 1QQ3 A; 1XHO A; 2ZOV A; 2KK1 A; 3ZIB A; 1Z5Z A; 5AGF A; 2H8E A; 3S0W A; 3Q7G A; 4JJF A; 3HNJ A; 1VB5 A; 4ZHY B; 1M57 C; 3MCA B; 3J06 A; 2VCC A; 3UMH A; 3OW2 F; 5JRA A; 4XTK A; 1OKK D; 3O39 A; 2AU5 A; 3CC4 F; 3AOU A; 1E84 A; 3JYY A; 2Z01 A; 2CNW A; 4B45 A; 1T6U A; 5E3C A; 1N8R H; 1RLG A; 4U9D A; 5LYJ B; 1VQL F; 2CDQ A; 2KSF A; 3KPH A; 1VK3 A; 3O85 A; 5T1D B; 4KC9 A; 2GLZ A; 3HJC A; 3LYB A; 2R9R B; 3HTN A; 3F6M A; 4WBN B; 5B8F A; 4EHP A; 2L81 A; 3ABM C; 3S0Y A; 1UFB A; 4FX5 A; 2I15 A; 5FNV A; 3HKC A; 4ZOL A; 5KYY A; 1VQ5 F; 4YT4 A; 3RYI A; 1COM A; 4WAB A; 3CG6 A; 3C8G A; 3BEH A; 1OXK A; 1VQV A; 4IIJ A; 2D4U A; 4FES A; 3EGX B; 3POV A; 3GOR A; 1I5N A; 4EBK A; 1IV1 A; 1SZI A; 5EZY A; 4C3B A; 3DC2 A; 2UYN A; 3JAS A; 5GON B; 2YQY A; 2XLE A; 1T5O A; 4C7O B; 1OQC A; 2XXA B; 2R05 A; 2R25 A; 2YYE A; 4YJ3 B; 2I6D A; 5F28 E; 5F5H A; 1KNK A; 4U5E E; 2OZB A; 2OJQ A; 2CZW A; 3CAX A; 1SZQ A; 3NG1 A; 4IAR A; 4JCZ A; 2R7V A; 2KTV A; 4CBE A; 2NMU A; 4PJL A; 3L34 A; 3G4S F; 2DYS C; 4JCH A; 1JD1 A; 1M56 C; 1W41 A; 1SYQ A; 5GIN C; 1FTS A; 4P9F A; 4U5G A; 1W5B A; 4DVY P; 3ZOP A; 3ATP A; 4U5F E; 4YN0 B; 2Y3H A; 2YWA A; 5IJ0 A; 3SZR A; 1HW2 A; 1JPN A; 4QI0 A; 3IQ6 A; 3WAQ A; 4BPM A; 3RA6 A; 3CPW F; 1DT9 A; 1H7M A; 4O2A A; 2OEV A; 1K40 A; 4U5D E; 3P10 A; 2ZOD A; 4G88 A; 4BT3 A; 1HMO A; 5LA6 A; 4U5B E; 4PK4 A; 5J2U B; 3C18 A; 3FHD A; 3SP1 A; 4G4X A; 5L0C A; 4F6R A; 1TWC A; 4YT2 A; 1LI5 A; 4EI8 A; 1H7I A; 1D0Y A; 2XLH A; 3IEE A; 2D5R B; 3R0P A; 1RCP A; 4RQO A; 2AP3 A; 2RHO A; 5JH7 B; 3V7E A; 4BG0 A; 4C8I A; 2YHS A; 4O4L B; 3LWV C; 3SIU A; 2F22 A; 2IG8 A; 4YL3 A; 5LP6 A; 1YZC A; 1NQ3 A; 3HKE A; 2IXN A; 3UGO A; 3NVK E; 2IBF A; 4GQH A; 5JCO C; 2CGE A; 1L7C A; 4YK5 A; 4I3M A; 5L3V A; 1CN7 A; 4ZHV A; 3FAJ A; 2YXZ A; 3RYH B; 3LWO C; 3EJN A; 2W45 A; 3SIV A; 2YZS A; 4YT5 A; 2XL6 A; 1XZP A; 4O7G A; 1JPJ A; 2H8A A; 4OIP F; 4BT4 A; 3FFM A; 3NMK A; 3HKB B; 1QSP A; 5J2T A; 3S29 A; 4LNU A; 4AK9 A; 3V7Q A; 2KW3 C; 3VM6 A; 1J7H A; 2HUJ A; 4X1Y A; 1VQP F; 2OTJ F; 2M4E A; 2ASR A; 1NFO A; 4NCQ A; 1CGN A; 2UYJ A; 2IXO A; 4FAP B; 5DS5 A; 4CIP A; 4TV8 B; 1F1M A; 1DBF A; 3UGP A; 2OTL F; 1FFT C; 2L6G A; 5FJ4 C; 4ZHQ A; 1RQ2 A; 1YAU O; 5HY2 A; 4AX2 A; 4C3E A; 1Q81 H; 1YDI A; 2LP4 A; 2KJG A; 1D1A A; 1IV4 A; 2W9Y A; 1T6Q A; 3B71 A; 3M1C B; 3TOM A; 4KI2 A; 4JKV A; 4MVU A; 4DBQ A; 3IKF A; 3KHN A; 1YZA A; 5JLI A; 2Y3G A; 3C8L A; 1X52 A; 3SEO A; 5T3W A; 4ERH A; 5JSL A; 2KG4 A; 3U5S A; 1CGM E; 3JAW B; 4NQ3 A; 2FGY A; 2OCC C; 4IHJ B; 2J9W A; 3M4C A; 3PCV A; 1W2B F; 2J0W A; 4IGG A; 4J7T A; 3EH2 A; 5LYJ A; 4U5H A; 1GGQ A; 2VB6 A; 3JVH A; 1N1C A; 4WBN A; 1CPR A; 1JFF B; 4DRX B; 3MBG A; 4OD5 A; 3S0H A; 2G62 A; 1VYI A; 2Z1E A; 1BR4 A; 3RYL A; 4B46 A; 3C8G D; 4EWC A; 3ELC A; 3I5Q A; 2YEV A; 3Q6N A; 3EGX A; 4BVS A; 4X20 B; 2G3K A; 4I55 B; 1O87 A; 5HP8 A; 1YIT F; 5CA1 B; 1YA9 A; 3DI5 A; 1U43 A; 1Z7Q c; 1DOW A; 3T80 A; 1M2V B; 3FPI A; 1ORY A; 5GON A; 2C03 A; 3ABK C; 3GM3 A; 3U2M A; 4C7O A; 2XXA A; 3B6N A; 3CCQ F; 2AWC A; 3E20 B; 2P6V A; 4BVQ A; 3DXJ F; 4YJ3 A; 4ZHW A; 1KNY A; 1ZYR F; 2I6R A; 1FSZ A; 1OR2 A; 3KKB A; 3KYJ A; 2IM8 A; 4ZK7 A; 4U5C E; 2YL7 A; 3ZSU A; 3I3F A; 5ITZ A; 3TK0 A; 3E1Y A; 3L8I A; 4KBL A; 3HNK A; 3PDM P; 2HS4 A; 5F5F A; 3KE1 A; 2DI3 A; 2ZVY A; 5HXZ A; 3M84 A; 2LBX A; 3Q8H A; 1WWP A; 2Q3T A; 3S0X A; 1O5H A; 3VYT C; 4BJT A; 4DRJ B; 1Y6D A; 2NUP A; 3GHZ A; 1FR0 A; 3FD6 A; 2OTM A; 2IQQ A; 2PHN A; 1H48 A; 4IWB A; 3LWQ C; 3ESJ A; 3G50 A; 2EPM X; 5FNV B; 4BJ6 A; 4GEH A; 3VOB A; 2WB7 A; 3RYI B; 3C9R A; 1Z63 A; 1FNJ A; 3JRT A; 2F9Z C; 4O79 A; 4IIJ B; 1D1B A; 3L1M A; 1ZHZ A; 3AQC A; 5FCL A; 5DCV A; 2G3V A; 2DGJ A; 5EZY B; 5BMV B; 1U6H A; 2G9I A; 4Q5S F; 2UYN B; 3E22 A; 3JAS B; 3C9U A; 3MCQ A; 3W8I A; 1QZX A; 3OBY A; 1NLX A; 3RYH A; 1LE4 A; 3GM2 A; 2R7R A; 1WN0 A; 1DOV A; 1BZ4 A; 2Q9C A; 4P9T A; 5JP7 A; 2KTU A; 2L6F A; 3DZA A; 3U2L A; 5A2Q M; 2GAQ A; 3OEO A; 1NU9 C; 3HKB A; 1ST6 A; 3WXM B; 1E7K A; 4IAQ A; 5HY0 A; 3UR3 C; 3QW0 A; 2HS3 A; 3R7C A; 3F0F A; 3PMR A; 4TZZ A; 2BL2 A; 4NTB A; 5IJ0 B; 1C02 A; 1MMG A; 3LUT B; 2Q1X A; 2AIZ P; 3QZC A; 1R5I D; 3K1H A; 4JTD B; 3RYC A; 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