2FPTA

Dual binding mode of a novel series of dhodh inhibitors
Total Genus 137
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
137
sequence length
367
structure length
364
Chain Sequence
MATGDERFYAEHLMPTLQGLLDPESAHRLAVRFTSLGLLPFQDSDMLEVRVLGHKFRNPVGIAAGFDKHGEAVDGLYKMGFGFVEIGSVTPKPQEGNPRPRVFRLPEDQAVINRYGFNSHGLSVVEHRLRARQQKQAKLTEDGLPLGVNLGKNKTSVDAAEDYAEGVRVLGPLADYLVVNVSSPNTAGLRSLQGKAELRRLLTKVLQERDGLRRVHRPAVLVKIAPDLTSQDKEDIASVVKELGIDGLIVTNTTVSRPAGLQGALRSETGGLSGKPLRDLSTQTIREMYALTQGRVPIIGVGGVSSGQDALEKIRAGASLVQLYTALTFWGPPVVGKVKRELEALLKEQGFGGVTDAIGADHRR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Oxidoreductase
molecule keywords Dihydroorotate dehydrogenase, mitochondrial
publication title Dual binding mode of a novel series of DHODH inhibitors.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 137
structure length 364
sequence length 367
ec nomenclature ec 1.3.5.2: Dihydroorotate dehydrogenase (quinone).
pdb deposition date 2006-01-17

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01180 DHO_dh Dihydroorotate dehydrogenase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 2fptA00
2CW6A 3FKKA 3UZ5A 3RK8A 1QOQA 2E09A 3AJXA 1FWSA 4EIVA 1YPIA 3B0PA 4IXHA 4CCCA 2H8XA 3EXTA 2A85A 4PTNA 3JR2A 5GVJA 4UTUA 1Z42A 3MBFA 2FTPA 3W6YA 2DU2A 1R47A 5TIMA 4XBKA 2DORA 4AWUA 2E6AA 5LNUA 2WO5A 3IRDA 1B4EA 1F74A 3HPXA 4M7TA 5LNWA 3IIPA 3IIXA 3MMTA 4D2JA 4WD0A 1XC4A 3W1LA 5DXYA 4O1BA 5FF4A 2BTMA 3G0UA 1F76A 1C9DA 3LCIA 5HMSA 3UY8A 4MKNA 5CG7A 2RHGA 3S1UA 3W1QA 3W2KA 2JGQA 1LOLA 1KW1A 2VOMA 3LXCA 3GX9A 4FHAA 5D05A 1MEIA 1W1ZA 2A21A 2BX7A 1K3UA 4OV9A 1KFKA 5LNSA 3NXFA 2PRMA 3CU2A 1MZHA 1JCNA 3BLFA 3PBWA 2WPBA 2Y85A 3ABRA 4IMFA 1F6PA 3HOJA 5IM51 4LUIA 3A22A 2O7SA 3M5ZA 1O60A 2NLIA 2Q3RA 1H7RA 4ZZ9A 1TO3A 3NZRA 1XUZA 1NF0A 3W86A 1JCMP 2O7QA 2E6FA 3WJZA 5J5RA 5A5WA 4P61A 3T78A 4NQ1A 3W85A 1NF7A 4UTTC 2YYUA 4KFOA 3W3OA 4RXFA 2OMAA 3IIOA 3P82A 1H63A 1YADA 5FEXA 1L6YA 4QNWA 2E68A 2B7NA 4NNAA 4FEZA 5D03A 3EX4A 4UTKA 5KTLA 4O1DA 3HBLA 4WJEA 5F4XA 3SW6A 5CKSA 1Q6RA 1T0OA 1P5BA 3UWVA 3NQ8A 4PODA 5HUPA 2ATSA 3LCHA 1YXYA 4NNBA 3HMJG 3BPWA 4NX5A 4GNJA 3NQ2A 1X7FA 4JX4A 4M6VA 2HMCA 1A53A 3IV3A 3PG9A 4DF1A 1H60A 3V75A 1GZGA 3GK0A 3NL5A 3N34A 1LBFA 1IXQA 3SI9A 3TA6A 1SW3A 3GNDA 2VENA 2CLMA 2NZLA 1DJQA 4GXMA 6TIMA 2GVJA 2YSWA 2OZ0A 3LDVA 3W7IA 3QQ0A 2PRHA 4JTEA 3IGSA 3LB0A 1XFBA 3NVTA 2YFOA 4UNKA 3W7GA 3W7KA 1ZHAA 4K38A 5HUOA 4Z0SA 4WXYA 3UWYA 3NO5A 4NXSA 1H1ZA 3G1HA 3A24A 4LVFA 3LHYA 5KZMA 4HKPA 3HG5A 1YTDA 3GZ3A 1EIXA 1EUAA 5AOUA 3LHZA 1P1XA 2AGKA 1HUVA 2A2IA 1TTQA 1SFJA 4S1FA 1S5VA 1I2RA 4JTJA 1GVOA 5FF2A 1TRIA 4U28A 1H7XA 1GT8A 3ZWSA 3NQ7A 4GJ1A 2FPVA 1TMHA 2H8ZA 3P5ZA 5F2LA 1FDYA 4UFMA 3W76A 2QDGA 2TYSA 3P62A 4AHQA 3PSVA 4UC5A 3W22A 1GWJA 1VCVA 4O19A 5FF7A 3F4WA 5LKYA 3BW2A 3OVPA 3P74A 3EEGA 1V5XA 3KVJA 1LLWA 1D9EA 3TW7A 3S5OA 4YCPA 5HWJA 2W0UA 1TB3A 1ME9A 4J9JA 3L9CA 5F1UA 2GOUA 1V7YA 3LLFA 4HNVA 1M5WA 4FNTA 5DY2A 2A4AA 2RH9A 4AHPA 4WY0B 5DBUA 3NPXA 3LHTA 2E5CA 3I7SA 4Q4KA 4UTLA 1BEUA 1SO5A 5KZEA 1LZOA 3ABSA 1F5ZA 3C0JA 1JVNA 3GVGA 3Q58A 4BI7A 2C1HA 1FUYA 4ZQNA 4A29A 3MHFA 1QDSA 2F7FA 4JX5A 1OX5A 1Z48A 3QW4B 4NUWA 4RXGA 4O18A 3NM3A 4IX2A 3BO9A 2AAMA 2QUUA 3OVRA 1XL9A 4NT0A 4IMEA 4CNOA 3W7OA 2Z2UA 1PE1A 4OU1A 2QJIA 3AO0A 1LTDA 1OABA 2G95A 3C56A 1QPQA 1SZGA 4M6PA 3HPSA 1UCWA 3C2FA 3E0IA 3LCLA 2EF9A 2VFDA 1JCYA 1DV7A 1W3IA 5G5IA 3W74A 3HG4A 3EXRA 4N9CA 2VEIA 3LXBA 2YDAA 3A9IA 4KFNA 4Y8FA 1W0MA 3Q2DA 4O11A 3S5ZA 4UFIA 1J5TA 4BI6A 3B06A 5DCBA 3STEA 1EP2A 2ZRZA 1W54A 5CGQA 3HG3A 2BZNA 5D2XA 4MJZA 4L4LA 2DZVA 1PL9A 1TCDA 2ISSA 2JKPA 3WK2A 4UTIA 1DOSA 3GR7A 4N9BA 1SR9A 1N7KA 3YPIA 3ZR4A 2WKJA 1K7XA 3NPWA 1XDMA 3W07A 1OG0A 2QR6A 3SGUA 3LGEA 1ME7A 3CB8A 5DLCA 4X9SA 3W7CA 1VRDA 2CZFA 3RLUA 1I4NA 4EF8A 1KBIA 1A5BA 1FXPA 2J9XA 5D2WA 4LUJA 3LTYA 3EWYA 3DGRA 4C1KA 3I68A 2Q8LA 2X1TA 1AMKA 1WX0A 2Y7GA 3A21A 5EA9A 4JIPA 1HO1A 4AEOA 4JTKA 2ZZ2A 2VEPA 3TJLA 1LCOA 1QWGA 1WOBA 4XWUA 3R8RA 4GUFA 2QUVA 1H7PA 4FF7A 3FJLA 2JKAA 5AHNA 1O4UA 5K3VA 4AF0A 3BGJA 5KINA 3S5NA 3EXSA 1GVFA 3WJSA 1VYRA 2OJPA 2W79A 5DY3A 1LRQA 5CPOA 1YDVA 4MVAA 3N73A 2CLHA 4O0ZA 4LWWA 1G7VA 1RVGA 5DN1A 1R46A 4K7VA 1EWDA 4O15A 4AF0B 6ALDA 4EWND 3S9YA 2UV8G 1H1YA 2Y62A 3P60A 2Y7FA 1OYAA 3SY5A 4AWSA 5G2IA 2VFEA 3HO8A 2RFGA 4NNCA 2W6RA 1YTEA 4UUIA 3OHIA 2ZTKA 5F1VA 5G2HA 4WY0F 4UFKA 3RF9A 3TK7A 4CNNA 1O95A 4XTIA 1GTHA 1TJRA 4R33A 2E5BA 1UJPA 4A2RA 3L65A 2G5WA 1XBYA 4QAIA 2QCLA 4OBTA 3I65A 2BWGA 3H54A 1W37A 4Y90A 3O06A 2YGYA 4FXRA 2VXNA 3A5FA 5D02A 2V2CA 4LC8A 4MY9A 3C3NA 1CW2A 4WOZA 1RQHA 3PBUA 2RDTA 1FDJA 3BLEA 4GUHA 3CEPA 3DHFA 1X8FA 3M9YA 3W7LA 4Z0JA 4FNQA 1LLZA 3TSDA 1VR6A 1G67A 4XTDA 3EX1A 3MW7A 1MSSA 4CCDA 3STGA 2QCDA 2DZPA 1KV5A 1G6CA 1L9WA 3DFQA 2J88A 3C6CA 4OE7A 1TPC1 1IXOA 1FBAA 4O8RA 3QSTA 1I2NA 3S5YA 3W88A 1W56A 2IQTA 1EB3A 2Z6JA 4UTWC 5K2ZA 1M6JA 2WSYA 3D0CA 4HNTA 1TPH1 2C3ZA 4CNPA 3EX2A 2HS6A 4UTJA 1ZY9A 3C8FA 3USBA 2GQ8A 5U7SA 1JR1A 2CLLA 3I7QA 4JYEA 1OFPA 4MJMA 2ZRXA 4ONVA 3GYEA 1FDZA 5H2ZA 3PSWA 1FXQA 3I6RA 2FFCA 5K9DA 1KFEA 4EF9A 1MXSA 3EWWA 1DORA 1TPEA 2WSQA 1E51A 4O53A 4S2BA 3W7DA 4Y6GA 1HL2A 3PB2A 1R2RA 2P0OA 1N55A 3INPA 4JTSA 3KXQA 2QCNA 2YR1A 3IVUA 1GQNA 3GXPA 5LSMA 4W9TA 4MLJA 3NQCA 1SUXA 4GRSA 5BRBA 1PVNA 3E96A 3QSRA 3U8GA 5E1QA 3TMLA 2B7QA 1LOQA 1CX9A 3P5YA 3L0GA 3TR2A 1WQ5A 3CWOX 2QJHA 3OIXA 3THQA 2GQAA 4RJEA 2NUWA 4WZHA 3NQAA 4RX0A 1MO0A 5FF3A 1L2UA 1QPNA 2CFFA 1B3OA 4ADTA 1M7PA 4O52A 4UTMA 1EX5A 2NXIA 1BWKA 2DP3A 1G4TA 5LHEA 1F73A 3R12A 2V2HA 1QFEA 2VFFA 3TKFA 3SGZA 3NYZA 3TJXA 1Y0EA 2YFNA 1AL7A 3TX9A 5I3FA 4HNNA 1VCFA 1XXXA 3GB6A 2QCGA 3QQ1A 1ZCOA 4O54A 4DPPA 1TPUA 4NXKA 3ANYA 1OFAA 3OBKA 3F4NA 1SO3A 3NQFA 2QDHA 3LTSA 1JJKA 3CPRA 4GC4A 3NA8A 5BMWA 3MYPA 4IPJA 4OGZA 1TJPA 2B4GA 1RZMA 1TREA 1SZNA 3MP5A 3KVKA 3L67A 3DH7A 1Q3NA 3KRSA 2A0NA 2ZRYA 2A7PA 2X1RA 3FJ6A 4LVAA 1KTBA 1L6SA 1EPXA 1B9BA 4R34A 2V0TA 1TTPA 4KWVA 2JBMA 3DFNA 5KSWA 5HR7A 2E6YA 3GDRA 1KM6A 5CZJA 4E38A 4NJHA 4Y96A 1HTIA 2YYTA 3G1VA 4X3ZA 4DQWA 3JS3A 1RPXA 3WJWA 3UD6A 3KOFA 2WNQA 3NAVA 5K9CA 3DFTA 1S3HA 3TROA 1VGAA 4RLIA 3P80A 5D2TA 3MP4A 3W70A 3NQEA 4OV4A 3W2NA 1VYPX 3M5VA 1TPVA 5LHFA 5CZSA 1QOPA 3C2VA 4MIMA 1FWWA 2I14A 4JDYA 2V5BA 4ZQOA 4XZ9A 4GUGA 4MY1A 5CSSA 4BFAA 1W3NA 2GJNA 2JKEA 1GYLA 1Q45A 4Z1CA 1H7NA 4DXVA 1PIIA 4LTSA 3O63A 1VYSX 3KVLA 2QCCA 4O17A 3QMRA 1JCLA 3UY7A 1IF2A 4LS2A 1AW5A 1VHCA 2NV2A 4LVDA 4BWLA 3W73A 3L2IA 3LRKA 2QAFA 4LT9A 2EAWA 3RNDA 3U6WA 1WAUA 2NWRA 3TQKA 4O12A 4CLMA 3BGGA 3IGUA 3LI1A 5HJLA 4K8HA 4MLRA 4QITA 4NX0A 4JYDA 3FS2A 2C15A 3NQ6A 2ALDA 1GTEA 1OFBA 4E0CA 3ELFA 4CQAA 4O4WA 3CIXA 5AYXA 3G18A 3WJYA 2DZWA 1RR2A 3LRMA 4O0KA 1W5OA 3VFLA 1XBXA 1FCVA 3KRUA 3MBDA 2B7OA 5D33A 1TQJA 1KFLA 2ZA3A 1P0NA 3L5MA 4UMCA 1G7UA 4Q33A 3W1MA 2VEMA 4O50A 1YPFA 3MYOA 2X1UA 3FIGA 4BF9A 1DQWA 4C1LA 4M19A 3M41A 4ZQPA 3DI0A 4GE8A 2Y70A 3EWZA 3OEXA 4Z1AA 3IGXA 3DZ1A 1U5JA 5DXXA 1RV8A 3W1RA 3GAYA 5CPLA 3GXTA 3G8RA 2ZCGA 2J9YA 2D73A 4BI5A 4ML9A 1ADOA 1CI1A 3NL3A 3WK0A 2YW4A 3N14A 1ZAIA 1OHLA 3TAKA 4OWGA 4H3DA 3PBVA 4POCA 1KM1A 1KBJA 1WXJA 3LV5A 3P61A 4MY8A 5HULA 2DJXA 5FEPA 3S1XA 4H6KA 1DL3A 3RFAA 3GLCA 4HPJA 3N3MA 5AFDA 2NXGA 4FIQA 3WK1A 1HG3A 4EVZA 4LS0A 4UTTA 3DXIA 3FKRA 4JTGA 1UUOA 1YTKA 5CPMA 4QM1A 4ADSA 3E02A 3KVMA 4IOTA 5FEWA 5C5YA 3LCGA 4FIRA 1NFBA 4PL1A 3PS7A 1J4EA 3IVTA 3UWQA 5D37A 3ZFHA 3C52A 2CLFA 2QF7A 4JTIA 1BWLA 1WV2A 4U4MA 5F4SA 1UASA 4JGDA 1ICQA 3UWUA 3HF3A 1QNVA 2NV1A 3QFEA 1GVRA 1TPWA 3U2OA 2H6RA 2ZYFA 3MJYA 5G1TA 4A2SA 3VNDA 1ICSA 3W7HA 5AHLA 4PEKA 3TFCA 1MEWA 3TXVA 5D2YA 1W5QA 3B4UA 3W72A 3G1AA 3LLDA 2V2DA 2ZRVA 3NEVA 3CHVA 5F4WA 1W31A 2DZTA 2FIQA 4CCEA 1QCWA 3KAOA 1VHNA 4Z1DA 2YXGA 3O15A 1I8JA 4JY9A 5KMYA 1GYNA 5FF0A 4JD4A 2CWNA 1JCJA 2DJLA 2Y63A 4LC6A 3UNDA 1LRNA 1T99A 4IX0A 3TNOA 2ZQ0A 1A5AA 1F2JA 4JTLA 3G1FA 3WJXA 3W1PA 4GFSA 5D30A 3W2UA 5AHEA 4HHPA 5IBXC 2ISVA 2XN2A 1QPRA 2R94A 3FA5A 5FI8A 1LP6A 2BSLA 4K7YA 2VEKA 1B57A 1G4EA 3P67A 5G2WA 1SU5A 3SFKA 2JK2A 5I3HA 4O4VA 1OVDA 1SZEA 4JTTA 5K9XA 4DEFA 1Z41A 5FEZA 1R30A 3GXNA 1I2OA 3QRHA 3CT7A 4LS1A 3PC0A 1XM3A 4AB4A 5BNKA 4IGHA 3QPYA 3DKLA 1WYIA 1KM5A 2QEZA 5E93A 1GG0A 1RD5A 3G1YA 3W1AA 3GR8A 3HGRA 3KRZA 4Q32A 4N02A 1GJPA 4IJBA 4K6AA 3MI2A 3OVQA 3BLIA 5LZLA 4HNUA 2YPIA 1L6WA 2VKZG 4OQVA 2RDUA 5C55A 3GKFA 1ZAHA 4NVTA 4PFMA 5C6MA 3GDTA 4ZQRA 1YDOA 2ZZ6A 3TXZA 1K8ZA 4MZ8A 2QCMA 3TUUA 3W7NA 3GDMA 4JX6A 2BXVA 2VFGA 3BV4A 3P84A 1YLVA 1OFDA 2A5HA 4O1CA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
 4NKC A;  3SRH A;  5B7Y A;  4EIV A;  1J93 A;  3B0P A;  1XG4 A;  1EGV A;  3WDP P;  2E9B A;  1Z42 A;  8RUC A;  2G37 A;  3V1H A;  3ZJ7 A;  1TX2 A;  4XBK A;  5HAT A;  4IJR A;  4AQL A;  4UNI A;  2OYL A;  3IRD A;  4NZC A;  3MZN A;  4DNM A;  2OX4 A;  5LNW A;  5C2G A;  3IIP A;  5DQP A;  2J7B A;  4WD0 A;  1K9T A;  4O1B A;  1ZJB A;  3FHA A;  3UVA A;  3VIH A;  4JL1 A;  2WZI A;  3BQ6 A;  3CUH A;  5A6B D;  3VGD A;  3GBE A;  2DZB A;  1CEO A;  1XH1 A;  4QJ5 B;  1JPH A;  2D23 A;  3V7P A;  3WUG A;  2VO5 A;  4HTY A;  3GBD A;  1LOL A;  3T1G A;  2VOM A;  2VT0 A;  1DP0 A;  3LXC A;  4FHA A;  1TWW A;  3C2Y A;  3KOW A;  4G2D A;  3LPG A;  1W1Z A;  2A21 A;  4KET A;  2BX7 A;  1VFM A;  1AD4 A;  4JPG A;  4HJF A;  3G2G A;  1IGW A;  3BLF A;  1UD6 A;  5CH9 A;  3E5B A;  2ACQ A;  2R1M A;  3HOJ A;  4AY7 A;  1E71 M;  2C7F A;  5HOS A;  5IM5 1;  3A22 A;  2O7S A;  4DBU A;  3M5Z A;  1O60 A;  3GUW A;  3HV9 A;  5FJI A;  1TO3 A;  1A5K C;  4MTV A;  1MNS A;  3H2C A;  2BXZ A;  3W86 A;  3MV0 1;  1JCM P;  5J5R A;  4KWU A;  2VP8 A;  4NQ1 A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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