2FSK | Genus

Total Genus 90

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	90
sequence length	326
structure length	321
Chain Sequence	MVVVGLDVGYGDTKVIGVDGKRIIFPSRWAVTETESWGIGGKIPVLSTDGGQTKFIYGKYASGNNIRVPQGDGRLASKEAFPLIAAALWESGIPVDLVIGSGTPLGTFDLEVKAAKEALENKVLTVTGPEGEVRQFNITRLIMRPQGVGAALYLLNQGIIEQQPGYGVVIDVGSRTTDVLTINLMDMEPVVELSFSLQIGVGDAISALSRKIAKETGFVVPFDLAQEALSHPVMFRQKQVGGPEVSGPILEDLANRIIENIRLNLRGEVDRVTSLIPVGGGSNLIGDRFEEIAPGTLVKIKPEDLQFANALGYRDAAERSM

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

molecule tags	Structural protein
molecule keywords	hypothetical protein Ta0583
publication title	Crystal structure of an archaeal actin homolog pubmed doi rcsb
source organism	Thermoplasma acidophilum
total genus	90
structure length	321
sequence length	326
chains with identical sequence	B
ec nomenclature
pdb deposition date	2006-01-23

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF17989	ALP_N	Actin like proteins N terminal domain

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.30.420.40	Alpha Beta	2-Layer Sandwich	Nucleotidyltransferase; domain 5	Nucleotidyltransferase; domain 5	2fskA02
3.30.420.40	Alpha Beta	2-Layer Sandwich	Nucleotidyltransferase; domain 5	Nucleotidyltransferase; domain 5	2fskA01

4K41A 4BRNA 1DKGD 3SMSA 2P9NA 4WQ5A 3CJCA 2PAVA 5BPNA 1X9JA 3VETA 4BGAA 3ULEA 2P9NB 4XEIA 3MCPA 3VEWA 2D4WA 4BC2A 4CJ7A 4H5TA 4CZJA 3QBXA 4BG9A 4BR4A 4BC4A 4BC5A 3ULEB 4H5WA 5JLHA 4BRAA 1HLUA 3IFRA 5AQRA 2P9PA 3UKUA 1YUWA 4BQZA 4H5NA 3VEZA 5AQWA 2IVNA 3VESA 3UKRB 4IXCA 3AAPA 4MO4A 4IJNA 1X3NA 3HSCA 1NLVA 1OKJA 4FWOA 1QQNA 2F9TA 1BA0A 2YHXA 1HX1A 3EN9A 2Q0UA 1QZ5A 4FWKA 5FPDA 2FLOA 3JXUA 4BRQA 1E4FT 1GLBG 2HOEA 4B1VA 4BRLA 2CH5A 3CIPA 3RSEA 3SLCA 4HTLA 5ADXA 2QXLA 3SK3A 1WOQA 3LM9A 1U2VB 4BVOA 3RSEB 4CBXA 3MN7A 4MLHA 1GLDG 5TKYA 3VGMA 2YI1A 1TYQA 1DEJA 1P8ZA 3O1BA 4PL8A 5EY4A 3S41A 5BRFA 2KHOA 3VEXA 3LDNA 1X3MA 4H0TB 5ADXH 4CZIA 4CZKA 4BROA 4BRDA 1Q18A 4PKGA 4IJAA 3BP8A 2E2NA 3VF6A 1YAGA 4BVPA 4BR2A 2D0PA 4H5RA 5BPMA 3DAWA 2Q1NA 2QWQA 3I33A 5EOYA 5F2RA 2FXUA 3P4IA 4RWTA 3H46O 5AZIA 4BR7A 3H6EA 1Z05A 2GTDA 2Q0RA 3GOIA 3D7EO 4FOEA 4CD3A 4WQ4C 3ZETB 3WT0A 4B1UB 2IVOA 3HZ6A 2UYTA 4JNEA 5BRDA 4DHYA 5KPZA 1NGFA 4CZHA 3CI5A 2DPNA 4CZEA 3W3DA 5LJVA 4K42A 2P9IA 2ZF5O 2A42A 3ZEUA 2FSJA 3FZFA 4FWSA 2QWLA 4M7YA 4FPBA 3DWLA 4FPAA 1NGCA 4JHDA 4EHTA 2E1ZA 3DXMA 4H0VB 4GNIA 4K25A 3MK6A 3TU5A 1HKCA 1S3XA 3F9MA 3WQUA 4JHDB 1BG3A 4MO5A 1NGAA 5AQHA 1NWKA 3EL2A 3WQTA 3ATVA 3ID8A 2FSKA 4F9OA 5AQNA 1NGHA 3BF3A 5F0XA 2E2QA 1BUPA 1HKGA 4PKIA 4QS7A 3LDPA 3U8XA 2VYPA 5F1XA 4H0PA 3VEYA 3MN9A 2YJEA 3H3NO 3EO3A 3I8BA 1GLEG 1R59O 4H5VA 2Q31A 5AQOA 5AFUA 3ZX2A 3ENOA 2W41A 4NB4A 1XC3A 3D2EA 3JS6A 5JICA 4ISEA 2IVPA 3MN5A 5ELZA 5KQ8A 1NGBA 2OANA 2Q36A 1XUPO 5AQGA 5AFUH 3WXKA 3WEEA 3C7NA 1WUAA 4XH4A 4BR9A 1KAZA 5BRHA 4M63C 1S22A 3WEEB 4B9QA 4B1YB 4BRFA 4CD1A 1HJOA 2HMPA 2P9PB 3UKUB 1SAZA 4C23A 2ZGZA 1D4XA 4BRHA 1YXQA 2A5XA 1BO5O 4EHUA 3VPZA 3MN6A 4JAXA 3HI0A 4WYBA 5E84A 5AQYA 2ASOA 3IUCA 1SZ2A 4BREA 4DCHA 3B8AX 2E20A 5AQQA 3O1WA 4WQ4A 4A2AA 3GE1A 1H1VA 3GBTA 2P9KA 1NGDA 3KVGA 3EKUA 1E4GT 1SQKA 3CQYA 4XH1A 3FGUA 3FZLA 1HKBA 1QQOA 2NZTA 2A40A 4XH5A 2P9LA 1KXPA 2GWJA 2ZGYA 2YHWA 2J4RA 2A6AA 3A5LC 1NM1A 4L3QA 2CH6A 3GL1A 3H3OB 5CE3A 3TPQA 4FWMA 3WXLA 2IIRA 3H1QA 4BRPA 2V7YA 5FPNA 3BF1A 3VGLA 3DXKA 4JD2A 2GELA 3FFKB 5BR9A 1TYQB 4PL7A 2E88A 4AM6A 2D1KA 4YDUC 4BRCA 4AM7A 4PKHA 5I9EB 1DGKN 5AQFA 3R9PA 1RGIA 3VEVA 3BUZB 3LDQA 1T44A 4K43A 3W0LA 3ATUA 4B1ZA 2E8AA 2CGLA 3CERA 5AQIA 4J8FA 5AQMA 4FWRA 2Q2RA 3H45C 1ZC6A 4IZ9A 5EX5A 1LOTB 3QMLA 2P9SA 1V4TA 4DB3A 2F9WA 2E1YA 5AZIB 1NGJA 5AQVA 4BQLA 4BR0A 3KZBA 1BDGA 1GLLO 1GLJO 3M3ZA 3WUHA 3WXIA 3QDKA 3A8YA 4RTFD 1CZAN 2GWKA 3QBWA 1JCEA 2A3ZA 3FR0A 2FF3B 2P9IB 3LM2A 3ZEUB 3ZX3A 1NMDA 4KBOA 4BRIA 1ZBSA 2QWPA 3DXMB 3FLCO 3KHYA 5BREA 1RFQA 4H03B 2YCHA 5AQZA 2FF6A 5AZJA 2GUPA 4FSVA 3AAQA 1MDUB 1NGGA 1TUYA 4BC3A 3CJ7A 1MWMA 1RDWX 3GDQA 5KQDA 5AZJB 4JN4A 1KAYA 1XQSC 1C0GA 2QM1A 4A62A 3SMPA 4O8KA 2AP1A 2QWOA 1G99A 4Y0WA 3VERA 5AQPA 3R8EA 3QFPA 1YVNA 3D2EB 3EZWA 1GLAG 3U9DA 4B1XB 2HF3A 4CZLA 4O5FA 4FO0A 5KPRA 4EAHD 1MA9B 4H0YB 2I7PA 4FWPA 4YDUA 1JCFA 1BOTO 2P9UA 3O4WA 3O80A 3C7NB 4MLEA 3HTVA 1T6CA 4IWVA 2P9UB 1C0FA 1NGEA 5BPLA 2W40A 3CETA 1BA1A 5AQUA 3LL3A 5EXWA 1Y64A 3OHRA 5E26A 5AQSA 1IG8A 2QWRA 4GY2B 1IJJA 3J8AA 1U6ZA 3M6GA 2V52B 4RCHA 3CJBA 3UKRA 3IDHA 1JCGA 1QQMA 1HUXA 5LY3A 3L4IA 1ATRA 1ESVA 2P9KB 3A5MC 4BR5A 2QWNA 5B8HA 2GEMA 4ISFA 2QWMA 2EWSA 3A5OC 4NO7A 4CZFA 2P9LB 5FPMA 1MWKA 4DQ8A 3QFUA 5JMVA 3FZMA 5BN9A 2VCPA 1U2VA 3LDLA 3DXKB 4CZMA 4JD2B 4BRKA 1ATNA 3G25A 4BG8A 2Q97A 4CI6A 3CQXA 4WQ5C 3O5BA 3VF2A 1GLFO 3MDQA 1KAXA 4H0OA 3AARA 1ATSA 1Z6RA 1LCUA 1K8KA 4BGBA 4FOIA 3O6WA 3O8MA 5BN8A 2NRHA 3CJ1A 1NGIA 2P9SB 2FSNA 3M1FA 3UE5A 1K8KB 4LC9B 2ITMA 1NBWA 2YHYA 5AQKA 4CBUA 2WUSA 3ZX0A 2NLXA 3FE1A 3DJCA 1QHAA 2ZWHA 1BWFO 5KPTA 4A2BA 3ZETA 2VWBA 3AY9A 3R6MA 2E2OA 1BU6O 2H3GX 3IMXA 2YJFA 2V7ZA 4FWLA 3UB5A 4HWIA 3QICA 4I6MA 3VOVA 3WXJA 3LDOA 2BUPA 3D2FA 4M7XA 2ASMA 2A41A 4EIAA 2HF4A 3ENHA 5FPEA 3SJHA 5JLFA 4I6MB 3U9ZA 1GLCG 1TUUA 4A61A 1ZXOA 3D2FB 4IO8A 3VGKA 1EQYA 3VF4A 1HPMA 2CGJA 3H1VX 4E1JA 4FWQA 4CZGA 4BRGA 2ASPA 3CJAA 3CJ9A 3L6QA 2V51B 3A5NC 1QZ6A 3VENA 2BTFA 4H0XB 4BRMA 2D0OA 1T6DA 3C0BA 5AQTA 2CGKA 2PBDA 3L0QA 4CBWA 2I7NA 4FL9A 2QW9A 4FWNA 3A0IX 5AR0A 3HBTA 4B1WB 4ISGA 3FZHA 1J6ZA 5EVZA 3O08A 3HM8A 3EKSA 5AQJA 3GG4A 2AA4A 1V4SA 3VEOA 5AQXA 5LJWA 3BEXA 3QB0A 4QS9A 3U4LA 5AQLA 4QS8A 2E2PA 3CHWA 3MMVA 4Z94A 4EFHA 3FZKA
chains in the Genus database with same CATH superfamily

3A2FA 3ZLJA 4V19S 3V1QA 3CJCA 4IOAL 5BPNA 4OVLA 3VETA 3ULEA 2P9NB 4DS4A 2D4WA 4BC2A 4CZJA 5GAGP 2RHKA 4BR4A 4KHNA 1W2BM 4BC4A 4BC5A 1HLUA 2RKIA 3IFRA 3UKUA 1RBRA 4BQZA 3MECA 3VTIA 3SAFA 5AQWA 4Z4HA 1QTMA 3AAPA 2F8TA 1X3NA 3QO9A 3PSIA 3NGZA 1QQNA 4CGHA 2YHXA 3BZKA 3EN9A 3T69A 2HBJA 3CC2N 4FWKA 4B3MK 1K73O 1ASUA 4BDZA 3ZT1A 3CCRN 3PIPL 2HOEA 4YOVA 3MEGA 1U48A 4LF8K 3CMAN 3N4PA 2XRIA 4DTUA 1WOQA 3LM9A 4IEIA 3KK3A 4YOYA 1R0AA 3ZSVA 3LP3A 2KTQA 2YI1A 3O1BA 5EY4A 1YJ9N 4FLZA 3LDNA 4Z4FA 4QAGA 5H1SQ 4CZIA 1VQKN 3WXMB 1Q18A 3SQ0A 3QEWA 4BVPA 4N5SA 2D0PA 4H5RA 3OBYA 4OKJA 2QWQA 5F2RA 3P4IA 1NJWA 4RWTA 4KH6A 5AZIA 4BE1A 3B6OA 2GTDA 3MXIA 2Z1IA 3D7EO 4YY3K 4WQ4C 1TL3A 3WT0A 3ZETB 4PHTX 2IVOA 4E7LA 3THXB 1JKHA 1Q81O 4JNEA 3CCEN 4M3YA 4FCYA 3CI5A 4JKFA 3W3DA 1QSYA 2ZF5O 5M1NA 3THYB 4A5BA 3FZFA 4FWSA 4W5TA 2QWLA 3R1XA 3K9KA 4FLXA 4KHPK 4FPAA 1KSPA 4EHTA 3TI0A 4GNIA 4KHQA 3MK6A 3WQUA 1BG3A 3DLLL 1LWEA 1RT1A 3WQTA 3ATVA 4F9OA 3K58A 1NGHA 3BF3A 3NH2A 2EX3A 5F0XA 1WB9A 4O0IA 1BUPA 1HKGA 3SUPA 3OYKA 2VYPA 2NRTA 4H0PA 4OPKA 3MN9A 1JLQA 4GV9A 3EO3A 3I8BA 1GLEG 3TAQA 4H5VA 2Q31A 1VHXA 3OVNA 5C12A 1CZ9A 2W41A 3Q7CA 1XC3A 4ISEA 1Q7YO 3O9UA 3AVHA 3P39A 5KQ8A 3CXCM 2R7YA 5BR8K 4HVJA 1XUPO 2JLEA 1UWBA 4LH4A 3WEEA 3SZ2A 1RDBA 4J2EA 4N47A 4FW1A 4CJKA 3EY1A 1KAZA 3ZSYA 3UIQA 3SUNA 1YHQN 4B9QA 2UU9K 3IG1A 1CZBA 2YX6A 4CD1A 1HJOA 1RDAA 4DU1A 1D4XA 4BRHA 4EHUA 5CY4A 4B8AB 4JAXA 4DU3A 3HI0A 1C1CA 3VTHA 5E84A 3IUCA 5J2MA 4DCHA 3B8AX 4B3OA 3O1WA 1LAWA 1H1VA 2OCEA 2VG7A 4DMNA 4KHSA 2P9KA 3EKUA 1E4GT 1SQKA 1HNWK 3FGUA 3FZLA 3S3MA 2QKKA 3F5TA 1CXQA 2A40A 1EWRA 4N41A 1KXPA 2ZGYA 4G9ZA 3IS9A 3AA2A 1OH5A 3AVIA 3OS1A 3GL1A 3H3OB 2Z1GA 3H1QA 1NJXA 3DLBA 3BF1A 1N32K 2GELA 3MWPA 1WAFA 3FFKB 5BR9A 1TYQB 1KLNA 2E88A 2DFFA 4YDUC 4BRCA 5HOOA 5I9EB 3SQ2A 4ILHA 4GV6A 3R9PA 1HNIA 3HK2A 3W0LA 5DM6L 4YOXA 2E8AA 4IO9L 2OA8A 2KLAA 5AQIA 1FK9A 3HO1A 3IRXA 3AV9A 3THWB 4DV3K 3H45C 4IZ9A 2P9SA 3IAYA 3EEQA 4WFBL 3HPHA 3PIOL 3L3UA 2G8VA 1GLLO 2ZJPL 5HBMA 1NNEA 4Q0BA 1XC9A 3SV4A 2XHBA 2A3ZA 3FR0A 2KZZA 1IBMK 2P9IB 4CJ3A 3LM2A 3ZEUB 3NFAA 1DT9A 1NMDA 2HB5A 1MU2A 1ZBSA 2JGUA 3DXMB 3VQ7A 1NK0A 4DQQA 3I8DA 1RFQA 3Q7BA 5AQZA 4KKOA 4E7IA 3T1HK 2G8IA 4A59A 1KQSM 4CESA 1YF5L 2WTUA 4ZTJA 1NGGA 1X9MA 4AF1A 1MWMA 4DTJA 3GDQA 5KQDA 1VK0A 4DR7K 1SKSA 1XQSC 3OYMA 2O4GA 2QWOA 2QA4N 4CJRA 1HYSA 1JLCA 4CHNA 3VERA 1VQMN 1YVNA 3D2EB 1GLAG 4DSKA 1WSHA 1YT3A 2HNYA 3NF7A 4FO0A 1XI1A 5JS1A 4H0YB 3DRPA 3O4WA 3O80A 4JI0K 1GOCA 2D0AA 3HTVA 3HYFA 4NCAA 2BANA 5FLXO 2IOCA 4BWMA 4JI8K 1M90O 3I55N 5BPLA 1N8RO 2W40A 5AQUA 1TKDA 3QLHA 4AHUA 5E26A 1LV5A 1IG8A 2QWRA 3D45A 2HHSA 4GY2B 3SJJA 1K9MO 1U6ZA 3SUQA 4DTOA 1QQMA 4DWIA 3T1YK 4Z4CA 1ATRA 2D0BA 4BR5A 4YOWA 2QWNA 5B8HA 1S1VA 2VQEK 3G4SN 4Z4EA 4ISFA 4NO7A 4E7JA 4X62K 3VQ4A 3S9HA 4B3TK 3DM2A 1O13A 1L3UA 5JMVA 4FJKA 3FZMA 2OPRA 4RW6A 5HRRA 3KIOA 3DXKB 4CZMA 4BRKA 4Y1CA 4WQ5C 4GW6A 1KC8O 1GLFO 2HHTA 4WCEL 5I3UA 5KI6A 2QKBA 4FM0A 1Q86O 1S72N 4B3SK 3QIOA 4JKHA 3CCQN 3ZSZA 1LCUA 4BGBA 3O6WA 1HMVA 1I94K 2NRHA 1GOAA 2NRZA 2VG6A 4I2QA 4ELTA 1TK8A 2ITMA 1NBWA 3SAGA 1BGXT 3J80O 2NLXA 4WF9L 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chains in the Genus database with same CATH homology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 4K41 A;  4BRN A;  1DKG D;  3SMS A;  2P9N A;  4WQ5 A;  3CJC A;  2PAV A;  5BPN A;  1X9J A;  3VET A;  4BGA A;  3ULE A;  2P9N B;  4XEI A;  3MCP A;  3VEW A;  2D4W A;  4BC2 A;  4CJ7 A;  4H5T A;  4CZJ A;  3QBX A;  4BG9 A;  4BR4 A;  4BC4 A;  4BC5 A;  3ULE B;  4H5W A;  5JLH A;  4BRA A;  1HLU A;  3IFR A;  5AQR A;  2P9P A;  3UKU A;  1YUW A;  4BQZ A;  4H5N A;  3VEZ A;  5AQW A;  2IVN A;  3VES A;  3UKR B;  4IXC A;  3AAP A;  4MO4 A;  4IJN A;  1X3N A;  3HSC A;  1NLV A;  1OKJ A;  4FWO A;  1QQN A;  2F9T A;  1BA0 A;  2YHX A;  1HX1 A;  3EN9 A;  2Q0U A;  1QZ5 A;  4FWK A;  5FPD A;  2FLO A;  3JXU A;  4BRQ A;  1E4F T;  1GLB G;  2HOE A;  4B1V A;  4BRL A;  2CH5 A;  3CIP A;  3RSE A;  3SLC A;  4HTL A;  5ADX A;  2QXL A;  3SK3 A;  1WOQ A;  3LM9 A;  1U2V B;  4BVO A;  3RSE B;  4CBX A;  3MN7 A;  4MLH A;  1GLD G;  5TKY A;  3VGM A;  2YI1 A;  1TYQ A;  1DEJ A;  1P8Z A;  3O1B A;  4PL8 A;  5EY4 A;  3S41 A;  5BRF A;  2KHO A;  3VEX A;  3LDN A;  1X3M A;  4H0T B;  5ADX H;  4CZI A;  4CZK A;  4BRO A;  4BRD A;  1Q18 A;  4PKG A;  4IJA A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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