2FSNA

Crystal structure of ta0583, an archaeal actin homolog, complex with adp
Total Genus 71
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
71
sequence length
325
structure length
310
Chain Sequence
MVVVGLDVGYGDTKVIGVDGKRIIFPSRWAVTIPVLSTDGGQTKFIYGKYASGNNIRVPQGDGRLASKEAFPLIAAALWESGIHVDLVIGSGTPLGTFDLEVKAAKEALENKVLTVTGPEGEVRQFNITRLIMRPQGVGAALYLLNQGIIEQQPGYGVVIDVGSRTTDVLTINLMDMEPVVELSFSLQIGVGDAISALSRKIAKETGFVVPFDLAQEALSHPVMFRQKQVGGPEVSGPILEDLANRIIENIRLNLRGEVDRVTSLIPVGGGSNLIGDRFEEIAPGTLVKIKPEDLQFANALGYRDAAERS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Structural protein
molecule keywords hypothetical protein Ta0583
publication title Crystal structure of an archaeal actin homolog
pubmed doi rcsb
source organism Thermoplasma acidophilum
total genus 71
structure length 310
sequence length 325
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2006-01-23

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF17989 ALP_N Actin like proteins N terminal domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2fsnA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2fsnA01
3H1VX 1IG8A 3TPQA 2E88A 2CH5A 4CD1A 4JHDA 4YDUC 4BRGA 5BREA 4MO4A 3BEXA 1IJJA 4YDUA 4B1XB 1BOTO 2E1ZA 2V7YA 3VERA 4IXCA 4BRDA 1GLBG 2P9PA 2PBDA 4RWTA 1YAGA 1K8KA 3FE1A 5LJWA 3LM9A 5AFUA 1XQSC 3BP8A 3UKRA 4O5FA 4H0PA 4BQZA 3QMLA 1JCFA 1E4GT 3L0QA 5AQGA 5AQUA 4FOEA 1X9JA 4BVOA 2QWRA 3IMXA 3SMSA 4CZMA 3MCPA 3LDLA 2W41A 2ASMA 2V52B 1SAZA 2ZGZA 3JXUA 1T6DA 1DKGD 3FZHA 3BUZB 4JHDB 2GELA 4QS7A 3EN9A 2P9UA 4F9OA 5FPEA 5F0XA 5E84A 4B1ZA 3U4LA 5AR0A 4CI6A 2DPNA 2YCHA 2P9KA 3UE5A 2IVPA 3ZX0A 1BDGA 3CQXA 4EAHD 4AM7A 4BRKA 2P9LA 2HOEA 1HX1A 2GWJA 4FWNA 3A8YA 4FWSA 2E2QA 1TUUA 3F9MA 1T6CA 3CHWA 2Q0RA 2Q36A 4ISEA 5AQIA 1NMDA 1QHAA 5AQVA 2CH6A 4BVPA 3R9PA 3U9ZA 3CIPA 1GLFO 4BGBA 1BG3A 3MDQA 5EY4A 4BR7A 1ZBSA 2P9IB 2QWPA 4PKGA 5AQQA 4CZGA 3JS6A 1NGFA 2QWQA 1BUPA 4NB4A 2NLXA 1U2VA 1ZXOA 2HMPA 4IZ9A 1MDUB 2I7PA 3J8AA 1QZ5A 2A6AA 4JNEA 1T44A 2P9NB 4K43A 1YUWA 1XC3A 2E2NA 3W0LA 4H0YB 1CZAN 2Q97A 3GL1A 3HSCA 2HF4A 4H03B 4BC3A 2P9LB 2V7ZA 3C0BA 2D4WA 1ATSA 2YHXA 3VGLA 2QWNA 4ISGA 5BPNA 2FF6A 5CE3A 3HTVA 3QFUA 4BG9A 1YVNA 2GEMA 2YHYA 5AQFA 1NGDA 2WUSA 3LDOA 4FWLA 3H3NO 5B8HA 4HWIA 4BRPA 1Q18A 3ZETA 1RGIA 1U2VB 4BRLA 2QW9A 1JCEA 5FPDA 5AQTA 3L4IA 2CGLA 3TU5A 3VF4A 5FPMA 1QQNA 3ZX2A 4XH4A 4B9QA 2E2OA 4BRFA 3ZX3A 3D7EO 1HPMA 4H5TA 5EXWA 5AQPA 4M7XA 1G99A 4QS9A 4BRMA 1YXQA 4H5NA 5AQOA 4CZKA 4JD2A 2QM1A 3R6MA 4BG8A 2QWOA 2BUPA 2D0PA 1H1VA 1NGHA 5AQRA 5EX5A 4FL9A 3ZEUA 2NRHA 2NZTA 2UYTA 2YJFA 2ZGYA 3ZETB 4MLHA 1EQYA 1TYQA 3IFRA 4J8FA 4XH5A 1V4TA 3M3ZA 4A61A 2I7NA 5AQXA 4EHUA 3MMVA 3CJAA 1KAYA 5BPLA 3ATVA 3U8XA 3H3OB 4RTFD 3QBXA 3KVGA 3DJCA 3A5LC 5AZIA 2PAVA 3ENHA 2J4RA 2D0OA 5BN9A 1MA9B 3HM8A 4JD2B 4A2AA 2P9IA 1GLLO 3VEZA 3WEEA 3GG4A 3AAQA 4FPAA 4IO8A 3FZMA 4PL7A 4Z94A 3ZEUB 1HKGA 4H5WA 5EVZA 4BR5A 4K41A 4I6MB 4K25A 2P9NA 4B1WB 1TYQB 4DQ8A 1MWMA 2A42A 5BPMA 2QWMA 2AA4A 4LC9B 4M63C 3VOVA 1MWKA 4K42A 3LM2A 1KAXA 4C23A 3O80A 5BR9A 2D1KA 5ADXH 3CJ9A 5AZIB 3O08A 1SQKA 2BTFA 4BR2A 5KPRA 3WT0A 4WQ4A 3QB0A 4L3QA 4E1JA 2ITMA 3VEXA 4BC4A 2E8AA 2P9SA 3WEEB 1V4SA 3HBTA 2IVOA 3U9DA 1TUYA 2OANA 1LCUA 4BRQA 3O4WA 3EZWA 3MN7A 2Q2RA 3MN6A 2A5XA 4O8KA 2ZF5O 3VPZA 3AAPA 1HLUA 3IUCA 3BF3A 3GE1A 3HZ6A 4FSVA 1ATRA 4KBOA 2GUPA 4FWMA 2YJEA 4FO0A 3UB5A 4H0TB 1HUXA 4BC5A 3VEOA 3GOIA 4NO7A 4H0OA 2CGKA 3LDPA 2VWBA 3A5OC 3D2EB 3H1QA 5ELZA 1C0FA 1BA1A 3A5NC 1HJOA 3FGUA 3EO3A 5EOYA 4ISFA 1RDWX 1OKJA 2CGJA 4BQLA 4IJAA 1GLDG 2P9SB 3O5BA 3VENA 3QDKA 3WXLA 1P8ZA 4CZHA 5BRFA 1R59O 3VEYA 4H5VA 4PKHA 4BR4A 2HF3A 1NM1A 1Z6RA 2E2PA 4WYBA 4CZFA 3KZBA 3WQUA 3SJHA 1NGEA 3C7NA 5JMVA 3WQTA 3GDQA 4QS8A 2GWKA 4CJ7A 4Y0WA 3ATUA 1NGIA 4CZJA 1NWKA 5AFUH 4CZIA 4H0XB 1NLVA 3FZKA 2W40A 4EIAA 3ENOA 4FWRA 1E4FT 3LDNA 3MN5A 1WOQA 3SK3A 3O6WA 4CZEA 3CJBA 5AZJB 4A62A 4RCHA 4PL8A 3A0IX 4WQ5A 2YHWA 2Q0UA 4I6MA 5AQLA 5TKYA 3VEWA 4B1YB 3VESA 3MN9A 3EL2A 3QFPA 4BGAA 1NGJA 4FWOA 1QQOA 3CJCA 3H45C 3FFKB 5KQ8A 3QICA 4FWKA 3C7NB 3H6EA 2F9WA 1NGBA 3O8MA 4IJNA 1S3XA 2VYPA 4GY2B 2ASOA 2Q31A 3SLCA 2F9TA 3VGMA 3MK6A 2Q1NA 3S41A 1Y64A 5KQDA 1BA0A 2A40A 5AQKA 5AQZA 1BWFO 5AQSA 5F1XA 1QZ6A 3FZLA 4CBXA 1X3NA 3DXKA 3SMPA 3RSEB 3WUHA 1WUAA 2E1YA 1QQMA 5KPTA 1KAZA 4FPBA 3H46O 2FLOA 3D2FB 3GBTA 3DWLA 3WXKA 3O1WA 4AM6A 3WXJA 1X3MA 2KHOA 1S22A 5KPZA 4JN4A 3D2EA 1BU6O 2AP1A 4XEIA 4WQ4C 1ZC6A 4BROA 4EHTA 4GNIA 5LJVA 1HKCA 5BN8A 4IWVA 3CJ1A 2E20A 3UKUA 1DGKN 5LY3A 4FWQA 3O1BA 3R8EA 2P9PB 3LL3A 2VCPA 3CQYA 2FSJA 3CETA 4DCHA 4EFHA 4BREA 4CBWA 1GLAG 1K8KB 3ULEA 3CJ7A 1GLJO 1NGCA 3DXKB 1GLEG 2IIRA 3UKRB 3EKSA 5AQWA 1BO5O 3VEVA 4DHYA 3VF6A 4BRHA 4BR0A 1GLCG 3P4IA 4MO5A 3DXMA 3W3DA 2IVNA 2FSKA 3QBWA 5E26A 2A3ZA 1NGAA 5JLHA 2QXLA 1DEJA 3ID8A 5I9EB 5BRHA 3AARA 3AY9A 1XUPO 3IDHA 4DB3A 4BRCA 2P9UB 3BF1A 4BRIA 1KXPA 3L6QA 3UKUB 2ZWHA 1J6ZA 2P9KB 3I33A 3I8BA 3WXIA 5AZJA 3KHYA 3LDQA 1C0GA 3VETA 4B1VA 4BRAA 2FSNA 5ADXA 3A5MC 3CERA 1HKBA 3ULEB 1ESVA 5FPNA 1JCGA 4PKIA 3FLCO 3DAWA 2GTDA 2A41A 2QWLA 3G25A 5F2RA 1LOTB 1NBWA 4CZLA 5BRDA 1ATNA 2FXUA 3M1FA 3EKUA 4FWPA 1RFQA 5AQHA 4JAXA 1NGGA 3DXMB 3OHRA 5AQMA 4CD3A 3B8AX 2ASPA 2EWSA 3CI5A 3FZFA 4BRNA 4H0VB 1Z05A 2FF3B 4H5RA 4BC2A 2H3GX 4XH1A 1U6ZA 4M7YA 5AQYA 4HTLA 4A2BA 4WQ5C 4BR9A 2YI1A 5JICA 3RSEA 4MLEA 3HI0A 1D4XA 5AQJA 5AQNA 3VGKA 4B1UB 3FR0A 3M6GA 4FOIA 3D2FA 4CBUA 1SZ2A 5JLFA 2V51B 3VF2A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4ZTJA 4CD1A 4BRGA 1K8AO 4FM2A 4YDUA 1BOTO 4IXCA 4O55A 3U6FA 4CGDA 3R3LA 1K8KA 1LW0A 3QEWA 3P83D 2ZM6K 4ILJA 3LM9A 4DV2K 1XQSC 4O5FA 4H0PA 4BE1A 3OS2A 1NK4A 2DFFA 4AHTA 1BL3A 3PV8A 4FZYA 2YV0X 5CR4A 5AQUA 3NCIA 4H4OA 3VQPA 2QWRA 2NRXA 3TANA 5JS1A 3MCPA 3LDLA 1IBMK 4WE1A 3D45A 2V52B 1WSHA 1T6DA 1DKGD 3FZHA 3LAKA 3MEGA 4ELUA 5FPEA 3U4LA 1B92A 5AR0A 2DPNA 5FDLA 1JLGA 3ZX0A 1BDGA 1BCMA 3CQXA 4AM7A 3L2UA 4OKJA 2HVHA 4CGJA 2E2QA 1UA1A 2Y1IA 3CHWA 3P38A 4DSIA 4E7IA 4CEAA 4ISEA 5C42A 1I94K 3R9PA 4KTQA 1GLFO 1EWQA 1D5AA 1RT6A 4BR7A 2O8FA 2P9IB 4KI6A 1KVAA 1RTHA 1RT2A 4CJUA 2QWQA 1JL2A 1U2VA 3HPGA 2P9NB 1NNEA 3LP2A 4DQQA 3W0LA 3T1YK 2VWKA 3HSCA 3T7ZA 5FLXO 4BC3A 2P5GA 2D4WA 1ATSA 2QWNA 1TKTA 4GV6A 2FF6A 2NNWA 2Z1GA 5CE3A 1JJ2M 1KFDA 4CERA 3AO3A 1O13A 1YVNA 4NYFA 3E66A 3BZCA 1NGDA 2YX6A 4W5QA 2GX9A 3LDOA 4JKDA 3H3NO 5B8HA 1VRUA 4HWIA 4CJPA 1RGIA 2P5OA 1U2VB 4OKKA 4E7LA 1HYZA 4BRLA 2QXFA 2QW9A 4DR2K 3HP9A 4CEQA 3SV3A 2G8FA 3ZX2A 3PX6A 4YOVA 3CCUN 1J5EK 2UUCK 4L8RB 1BHLA 5EXWA 5AQPA 3O9QA 4M7XA 4KHQA 1WLJA 3KTQA 4JI8K 4JLHA 4BRMA 4H5NA 5AQOA 4CZKA 1RCHA 4B3MK 3HYFA 4B8CA 5CZ1A 4BG8A 3SUQA 1SS6A 4FM0A 2D0PA 3LWLA 1NGHA 3QNNA 3M8QA 5EX5A 2NRHA 4R79A 1VQKN 4K0KK 1FXXA 4MLHA 1TYQA 3RTVA 3CJAA 2YHBA 4GW6A 3H3OB 4YOUA 4YOWA 3I0RA 1A5XA 1VQPN 3KVGA 1NKEA 1S9GA 3A5LC 2J4RA 3K2PA 3C94A 5BN9A 4FJJA 1MA9B 3AVLA 4A2AA 1T05A 4CCHA 3V9ZA 3OTOK 3KLHA 1TK5A 1LWCA 2XY7A 4K8XA 4B3OA 2BANA 4K25A 4B1WB 1TYQB 4DQ8A 1MWMA 2IOCA 2QWMA 4DV6K 3MWPA 3B6OA 4K42A 1ZBUA 4DUYK 3P5JA 1ZBHA 1NOZA 4MQ3A 4LSLA 5ADXH 5IWAK 4OKEA 3ZT1A 1SQKA 1L3SA 2BTFA 4FJNA 3MWTA 1SV5A 3QB0A 2DY4A 4DTUA 1BQNA 4BC4A 1B9DA 2E8AA 4DTXA 3NVMA 5M1KA 2IVOA 3MXJA 3MN7A 3ZSZA 5J2QA 4F2RA 1HLUA 3BF3A 4V19S 2GUPA 2YJEA 4FO0A 1TL3A 3OA9A 2X78A 3GOIA 4DG1A 4CIGA 5CY4A 2QTDA 3VMFB 1S1TA 3H1QA 2OPQA 1HYVA 3MX5A 3E9LA 3KK1A 4A57A 1Q8IA 1RDWX 1SL2A 1RNHA 3AO5A 4IEEA 3DRPA 2CGJA 3QDKA 4M3RA 3WXLA 1D9FA 1R59O 4PKHA 4BR4A 4DFMA 4CGFA 4F4KA 4KO0A 1QSLA 3KWGA 4GV9A 1C1AA 2YNFA 3CFRA 3CMEN 3V9UA 5JMVA 4BE2A 2HVIA 1LAVA 4ZHRA 4X62K 1D9DA 1NGIA 3DLGA 3OY9A 4CHQA 1EO1A 2W40A 1X9MA 4FW1A 2DFHA 4FWRA 3LDNA 3MN5A 4KHPK 4CK1A 2HBJA 3V9XA 3CJBA 4DR5K 4KPYA 4A62A 4OPHA 4RCHA 4PL8A 4FJXA 5AQLA 3LDSA 1NKBA 3V1QA 1CZBA 1N6QA 4B1YB 4BGAA 1NGJA 1QQOA 3ID6A 1OH8A 1QVGM 2OTJN 1J54A 3QICA 3QINA 4FWKA 4B3SK 4NLCA 4DWIA 1S1WA 4KHSA 4Y1CA 1NGBA 1S3XA 2VYPA 4IG3A 1JLQA 3G6EN 3J7AP 2ASOA 1CXQA 3SZ2A 4AHVA 1SKRA 1HRHA 1HQUA 2QI2A 4HUFA 4KV8A 1Z26A 5AQSA 3N4QA 4PQUA 4RW4A 3RSEB 2XY8A 1WBBA 4Z4GA 2DFEA 4JI6K 1I39A 1S1UA 4CFDA 1KAZA 4CJSA 4JS5A 1R0AA 2QKKA 1IKXA 1RT4A 2YNHA 4HTUA 3PO4A 4MDBA 1X3MA 2KHOA 3D2EA 4M41A 4GNIA 1CLQA 3AA5X 1HKCA 1VQLN 3CJ1A 3AVKA 4GVMA 2D0AA 3UKUA 5LY3A 4FWQA 3V9WA 4E1MA 1KTQA 1HNVA 3O1BA 2X74A 4E89A 3QEPA 2FSJA 1EX4A 4KHWA 4CBWA 4CIEA 1BQMA 3CFOA 3CJ7A 2O8BB 1NGCA 3V1OA 2BGGA 3KK2A 5GAHP 3UKRB 4DHYA 5JS2A 4HHTA 1JL1A 5HLFA 1GLCG 3P4IA 1JKHA 1W0HA 1EXQA 4MO5A 3NGZA 1RDCA 3DXMA 2A3ZA 1NGAA 2WFBA 1DEJA 1VSEA 3DM2A 1VQ4N 3AARA 3AY9A 3O3HA 3L2WA 4JI3K 1ZBIA 2P9UB 1KC8O 1TAUA 4CF1A 4ELTA 3UKUB 2XRIA 5AZJA 3BZKA 3I8BA 3WXIA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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