2FXUA

X-ray structure of bistramide a- actin complex at 1.35 a resolution.
Total Genus 121
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
121
sequence length
368
structure length
360
Chain Sequence
ETTALVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEGIITNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPTLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNVPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVTHNVPIYEGYALPHAIMRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFVTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFENEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPETLFQPSFIGMESAGIHETTYNSIMKCDIDIRKDLYANNVMSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWITKQEYDEAGPSIVH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Structural protein
molecule keywords Actin, alpha skeletal muscle
publication title Structure of bistramide a-actin complex at a 1.35 A resolution
pubmed doi rcsb
total genus 121
structure length 360
sequence length 368
ec nomenclature
pdb deposition date 2006-02-06

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2fxuA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2fxuA02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 2fxuA03
5AQQA 5F0XA 3CIPA 5AQSA 4XEIA 4CD1A 3CQYA 3VEOA 4BRDA 4XH1A 1NM1A 2F9TA 3EL2A 2GTDA 3ENOA 2D4WA 5F1XA 3VEXA 2UYTA 4IXCA 5BN8A 4EAHD 1HLUA 2VYPA 3BUZB 4H0OA 2CGJA 3U9ZA 3HTVA 3QB0A 3UKRB 5AQXA 5ELZA 4FWKA 4LC9B 5KQDA 5EOYA 3VF4A 3EKUA 5E26A 3MN7A 3CETA 4WQ5A 4A61A 2AP1A 1TYQB 1NGGA 1Z05A 1TUUA 1XC3A 4C23A 4WQ5C 3VPZA 4FOIA 4B1XB 4MO5A 4BC3A 3LM2A 1XUPO 1Y64A 4CBUA 3P4IA 1MWKA 2A42A 2P9IB 5FPEA 2ZGYA 2FF3B 3HZ6A 2ASMA 2Q97A 4L3QA 4AM7A 3A5LC 3HSCA 3LDPA 3FZKA 3O5BA 5BREA 5JMVA 2CH6A 3HI0A 4EFHA 4B9QA 2QWNA 4QS9A 4MLEA 3DXMA 5KPTA 2HOEA 1RGIA 1NWKA 2BTFA 3RSEA 5JLHA 1QZ6A 3LM9A 4CJ7A 1BOTO 4A62A 2FXUA 2W41A 3S41A 4O5FA 4BRFA 2OANA 5JICA 1C0GA 1NGHA 1X3NA 4CZKA 3ZX0A 4BRHA 2QWOA 1HJOA 5AZIB 2A40A 5KPZA 3ULEB 3JXUA 1GLAG 2E20A 3I33A 4HTLA 3FZFA 4JHDA 3VEYA 5KQ8A 1JCGA 4FWLA 4CZLA 1QHAA 2IVOA 3A5MC 3JS6A 3SK3A 4Y0WA 2YJFA 3BF3A 3M6GA 4BR7A 2V7ZA 3UB5A 5BRFA 3WQUA 2A5XA 3LDLA 4K43A 5AZJB 1GLLO 2P9UB 3O4WA 4BRIA 2Q36A 2NRHA 2P9NA 2P9LB 3M3ZA 2VCPA 3AAPA 3SMPA 3VEZA 3LDOA 5ADXH 2FLOA 4FWQA 1WOQA 3G25A 1ATRA 2P9SB 1ESVA 3UE5A 4BRPA 1KXPA 3HBTA 4K25A 5ADXA 3TPQA 5AQUA 5AQKA 5AQMA 1NGBA 3IDHA 2ITMA 3VESA 4EIAA 3EZWA 4FSVA 4RCHA 1EQYA 3AAQA 2Q0UA 1R59O 2P9PA 2QWRA 1TYQA 3GE1A 4IZ9A 2HMPA 3L6QA 3O80A 2ZGZA 3DAWA 1YXQA 1LCUA 2E8AA 4H0PA 1C0FA 1HKBA 2D0PA 2NLXA 1GLBG 3A8YA 3SMSA 3C7NA 3VF2A 4FPBA 1BO5O 4H0TB 4YDUA 4PL7A 3WXIA 3ZEUB 3KVGA 2Q31A 4YDUC 1NLVA 3FGUA 1K8KB 3O08A 1H1VA 3DXKA 2EWSA 3FE1A 3LDNA 2HF4A 5AQVA 3I8BA 4BR9A 3UKUA 3U8XA 3WXJA 3BF1A 3W3DA 3FZHA 4PL8A 4H5WA 4NB4A 5AQYA 1KAZA 3C0BA 1Z6RA 3O8MA 1BA0A 5AZIA 2FSKA 4BG9A 4F9OA 3D2FB 2D0OA 3ZX3A 5AR0A 2IVNA 3ZETA 5F2RA 4BGAA 4FWSA 4RTFD 4JD2B 4E1JA 2GEMA 2J4RA 4M7XA 1V4SA 1NBWA 4GY2B 5FPDA 4B1ZA 4NO7A 5AQIA 5AQRA 4BVPA 3ENHA 3U4LA 4H0YB 3WUHA 2F9WA 2P9UA 5AQLA 5KPRA 2P9KB 3CJBA 4BQZA 2P9LA 1MDUB 3BEXA 1IJJA 4MLHA 3M1FA 4H5TA 1T6DA 1HKCA 2E2NA 4DCHA 3CJAA 2A6AA 2P9SA 5EVZA 4CZFA 4DHYA 1QQMA 4H03B 1ZC6A 3LL3A 3CJCA 3CJ7A 1ZXOA 5LJVA 3VOVA 3GDQA 3GL1A 4MO4A 3EKSA 4IJAA 2Q0RA 2A3ZA 2ZF5O 4DQ8A 2PAVA 1S3XA 1SZ2A 4K42A 5TKYA 3VGKA 3QMLA 4BRKA 3ZX2A 4JAXA 2YHYA 4FWOA 3MDQA 5I9EB 2KHOA 2IVPA 3A5NC 1YUWA 3VETA 2E2PA 3H45C 1GLCG 1NGFA 2FSJA 3HM8A 4BR5A 2BUPA 2GWKA 3VERA 4BC2A 4BC5A 4CZEA 1X9JA 1KAXA 1P8ZA 4FWPA 4CZIA 2H3GX 1NGIA 3L4IA 4CD3A 2QWQA 1NGDA 3VGMA 3CJ1A 3ZEUA 4I6MB 1ZBSA 1WUAA 2V52B 1CZAN 1NGAA 1RDWX 3VENA 2A41A 4BREA 3WXKA 5AFUA 1QZ5A 4H0XB 4EHUA 4BR0A 2QWLA 4PKIA 3H46O 1SQKA 4PKHA 2CGKA 4RWTA 4BRLA 3UKRA 2E2QA 4CZGA 2GWJA 3GOIA 3AY9A 3RSEB 1E4FT 1TUYA 4WYBA 3WEEB 4FWMA 5AQTA 4FWRA 3D2EB 4BC4A 3EN9A 1DEJA 3OHRA 2ASPA 2GELA 5LJWA 1QQNA 5AQFA 3MCPA 4JD2A 4B1VA 5EX5A 4BRNA 3WQTA 1NGCA 2IIRA 2P9IA 5BPMA 3H3OB 5CE3A 3VGLA 2WUSA 2YJEA 3H1VX 4ISGA 3CERA 4BRGA 1JCFA 3IFRA 4BRAA 3KHYA 1GLFO 4O8KA 4ISEA 1NGJA 5BRDA 4H5VA 4JN4A 4CBXA 5BN9A 3GG4A 2Q2RA 1U6ZA 2W40A 5LY3A 5BR9A 3AARA 3DJCA 3GBTA 4HWIA 3QDKA 4BR4A 1U2VB 4AM6A 2HF3A 2YCHA 1YAGA 4FO0A 5FPMA 4DB3A 1BWFO 1QQOA 1YVNA 3MN9A 3TU5A 4CBWA 1KAYA 3CJ9A 3VEWA 2I7PA 3B8AX 3ULEA 2V51B 3IUCA 3SLCA 4B1UB 2E88A 3CQXA 3DWLA 3EO3A 1BUPA 4J8FA 4QS7A 4BRMA 5AQWA 3CHWA 1BA1A 1DKGD 1T6CA 1BU6O 3MMVA 3R6MA 4BROA 3L0QA 3BP8A 3H1QA 3MK6A 1BG3A 1MA9B 1J6ZA 2NZTA 2E1ZA 3FFKB 2QWMA 5EY4A 5AZJA 3FZMA 4CI6A 1RFQA 2QW9A 1X3MA 3FLCO 3LDQA 1D4XA 4CZMA 1E4GT 1BDGA 3QICA 2P9PB 4H0VB 4KBOA 4M63C 3U9DA 4BQLA 4I6MA 4H5NA 2YHXA 4PKGA 4IO8A 5AQZA 2CGLA 3QFPA 3H3NO 2DPNA 3C7NB 5AQOA 3H6EA 2E1YA 3A5OC 2QXLA 5JLFA 5AQHA 5BPLA 2D1KA 2YHWA 4FPAA 2GUPA 4EHTA 1HX1A 3WEEA 3DXKB 4IWVA 4BGBA 4BRCA 5BPNA 3ATVA 3D2EA 3UKUB 3A0IX 2PBDA 4H5RA 3QBWA 4XH5A 2I7NA 1NGEA 2V7YA 3D7EO 2ZWHA 4QS8A 1SAZA 1JCEA 3ID8A 1GLEG 4Z94A 2YI1A 3WT0A 3O1WA 5AFUH 1LOTB 3ZETB 1NMDA 4CZJA 5B8HA 1GLJO 1IG8A 3KZBA 1K8KA 2ASOA 3J8AA 2CH5A 4BG8A 4IJNA 3VF6A 4WQ4A 5AQGA 4B1WB 1MWMA 2QM1A 4FWNA 3MN6A 4WQ4C 3F9MA 1U2VA 5AQPA 2QWPA 3ATUA 1XQSC 4B1YB 5BRHA 3DXMB 4JNEA 3SJHA 4GNIA 4BR2A 5AQJA 3D2FA 2AA4A 3W0LA 3FR0A 3IMXA 4CZHA 2E2OA 4FL9A 2FSNA 4K41A 3R9PA 3R8EA 3CI5A 4ISFA 3O1BA 1OKJA 1HPMA 4BRQA 3WXLA 1DGKN 1V4TA 5AQNA 4A2AA 4JHDB 2P9KA 5FPNA 1T44A 4M7YA 2FF6A 1HKGA 1G99A 5EXWA 2Q1NA 3QBXA 3VEVA 1GLDG 1HUXA 1ATSA 4FOEA 4A2BA 4BVOA 2VWBA 3MN5A 5E84A 3QFUA 3O6WA 1Q18A 1S22A 4XH4A 2P9NB 1ATNA 3FZLA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3LP2A 3CIPA 1LWEA 2NRWA 1U49A 5I42A 3VEOA 4U7BA 1QSLA 2F9TA 3EL2A 4CEAA 4M3UA 2D4WA 4HCCA 5BN8A 2B4JA 2YNFA 1HLUA 2VYPA 4HUEA 1S6QA 4DLEA 3QB0A 3NFAA 5ELZA 3O3HA 3EKUA 1KQSM 1WSGA 3E9LA 2ATQA 2GBZA 1Z05A 2O4GA 1SV5A 4DSJA 3ZSWA 4B1XB 3WNFA 3E9OA 3SNNA 4CF8A 1XUPO 4A5BA 3AVIA 4CBUA 3L2RA 5FPEA 2HBLA 1IKVA 3RR8A 4HCBA 2ASMA 2IAJA 1TV6A 4OX9K 1S9GA 5KI6A 3AVFA 4DUYK 4MLEA 3AVKA 2QKBA 4DWIA 1G15A 1RGIA 3A2FA 4NXMK 4IDHA 2UXBK 4DR3K 1QZ6A 4X64K 5C12A 3M8QA 1A5WA 3HP6A 2W41A 4J2DA 1N36K 3CXCM 3KK1A 1C0GA 1LAWA 1KSPA 4LFCK 1N6QA 2A40A 2E6MA 3CFRA 4YOXA 4FJHA 3ZSQA 3ZT1A 3THWA 3EZ5A 2G8VA 3MXIA 5KQ8A 2KW4A 4ICLA 4JV5K 4FWLA 3MXMA 1REVA 5HRNA 3SK3A 3LPUA 2YJFA 3UB5A 4OKEA 3LDLA 3N4QA 4K43A 1GLLO 3O4WA 4PHTX 2Q36A 3NDKA 3AVCA 2P9NA 1SL0A 5M1NA 3M3ZA 4E7LA 2PYJA 1KCFA 4JI7K 3Q7CA 4E19A 5ADXH 4RW7A 4DTUA 3NH1A 1D9FA 3T3FA 3TSPA 4CEOA 3UE5A 1ILYA 3P38A 3HBTA 4K25A 4E1NA 1VHXA 3SUOA 5ADXA 5AQUA 3T1YK 4DSIA 4OGCA 4EP4A 3OYKA 3VESA 3NGYA 2UXDK 4FSVA 1VQON 4MQ3A 3OYDA 1R59O 2P9PA 2QWRA 3SPZA 1BGXT 3EY1A 1N33K 4ILGB 3PX0A 3MWTA 4FW2A 4DU4A 1EO1A 1YXQA 1LCUA 3JAMO 1NK5A 2O8BA 4I2QA 4JLHA 3C7NA 1RBUA 3TTDA 3O4NA 4DV6K 3ZSRA 1W7AA 1C0UA 4CJPA 4CIFA 1NLVA 4M3TA 5H1SQ 3DXKA 3LDNA 3SZ2A 4B9TA 3FFIA 2HF4A 4DF4A 3AVBA 3C6UA 1XWLA 2UXCK 3BF1A 4CJKA 3KLHA 4QCLA 3IRXA 2R7YA 5AQYA 4CJEA 2XRIA 3PX6A 1Z6RA 3D2FB 4FLYA 5AR0A 1S1XA 4C1NK 4E1JA 3TSUA 5KRSA 1DT9A 1NJWA 4M7XA 3O3GA 4AHCA 5FPDA 4B1ZA 4CW7B 3MCAB 1UA1A 4H0YB 2KLAA 2X6NA 1N5YA 2F9WA 3OTOK 1EWRA 4MLHA 3O9SA 3U6FA 1HKCA 2W6KA 3S9HA 1J53A 3LDSA 3V9XA 3CJAA 1HJRA 5EVZA 4LSNA 4DHYA 1RBVA 1DTQA 1QQMA 3KKRA 4CHZA 3TAFA 1ZC6A 3AA5X 1EKEA 4Z4FA 4KTZA 4IKFA 1KFSA 3EKSA 4Q0BA 2A3ZA 3THXB 1L5UA 4IBNA 3KK2A 4OO1J 1S3XA 1SZ2A 2P5GA 3DI6A 1UWBA 3ZX2A 5I9EB 3K5MA 4DV7K 1CXUA 3PSIA 4DFPA 2IVPA 5T7BA 1YUWA 4FM2A 2D0CA 1VQ8N 4AF1A 1QVFM 4BC2A 1KRPA 4BC5A 1NU0A 2VG6A 1HNIA 4CHNA 1FJGK 1KAXA 4FWPA 4RW9A 4CZIA 3VGMA 3CJ1A 4CEFA 2V52B 4PY5A 2A41A 1VQKN 2F96A 3VA3A 1C6VA 4H0XB 3LALA 4OLBA 4V19S 1XI1A 4DFMA 1M90O 4C8OA 2HMIA 4PKHA 2CGKA 1NOZA 3SQ1A 3M8SA 1E4FT 2QI2A 1TUYA 4FWMA 4CHQA 3CC2N 1SKWA 3NF7A 4OGEA 1KD1O 4BC4A 3EN9A 2RHKA 2ASPA 3OHRA 4B1VA 3LP1A 2O8DB 2E5LK 2IIRA 3E9PA 5BPMA 3RRHA 3VGLA 3AVNA 1ZBUA 3ZT0A 5DM7L 3L2QA 2YKMA 4BDPA 1JCFA 3IFRA 1ZBHA 4DTSA 4CIGA 3D0PA 4ISEA 5JVGL 4DSLA 5BRDA 1VQ7N 3J7AP 5CZ1A 1SKRA 4CBXA 1HNZK 2W40A 3SJJA 3I0RA 4HWIA 1RDUA 2HF3A 3MECA 1YAGA 4CJUA 4FO0A 4DB3A 1YVNA 1Q7YO 1VSJA 1NKCA 4CBWA 1NK4A 3CJ9A 3VEWA 4IO9L 4B1UB 3EO3A 3E66A 1GOBA 1T6CA 4BROA 3L0QA 3M5RA 5HRRA 3DYAA 3KK7A 3DLHA 2RE2A 3B6OA 1I39A 4DU3A 2NZTA 4YOTA 3FFKB 2IGIA 3G71N 1RFQA 3C65A 1BQNA 1D4XA 5HP1A 1NMNA 3KLEA 1JLCA 4M63C 1TK8A 4JYAK 2OCEA 2Q3SA 4H5NA 1YTAA 4PKGA 1CLQA 3H3NO 2VQFK 2OZMA 1XHZA 4KB0A 5TKWA 1HQEA 4WFAL 1RT5A 5FLXO 2VGNA 5BPLA 2D1KA 1X9SA 4KHWA 2YHWA 3WEEA 3ID6A 3ZLJA 4Y1CA 5M1PA 3UKUB 1S1VA 4DV5K 4O4GA 4GV9A 2I7NA 5J2PA 3HYFA 1JCEA 4Z94A 4Z4IA 1VSDA 1LOTB 2O8EA 4DSFA 4FJJA 1TKXA 1XHXA 3K9KA 1XNRK 1RTJA 2O8FA 3I0SA 1JLBA 3J8AA 4C8KA 4WQ4A 5KTQA 5DK5A 3VTIA 3PV8A 4PQUA 4CFDA 1MWMA 3ASMA 2QWPA 3K58A 3CCVN 4BR2A 1D8YA 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4KKOA 1QQCA 2FLOA 4DV1K 4A59A 2NRTA 3NCIA 3LWLA 4TSXA 1RBTA 3MXJA 3AVMA 4CGHA 4JS4A 3P31A 3SQ2A 2ITMA 4E7KA 1VQLN 4EIAA 4O8UA 3SUQA 4E3SA 3AO4A 1TYQA 3GE1A 3CMAN 2A1SA 4ILJA 3KK3A 1JXBA 3DAWA 4JKAA 1HKBA 3DLKA 1S1UA 1GLBG 3N4PA 3SMSA 3VF2A 1TAUA 3OY9A 4H0TB 4CF2A 1M1KO 2ZQBA 4GVMA 4YDUA 3ZT3A 2X74A 3EEQA 1WSJA 4CEDA 4K8XA 2HBKA 1C1BA 3FGUA 3VTHA 4GW6A 1H1VA 4FLVA 2EWSA 2YNGA 4HTUA 3I8BA 1X9MA 4FJMA 2UUCK 3UKUA 4DTRA 1BQMA 4OVLA 2WC9A 4PL8A 5C25A 3L8BA 4G9ZA 3QEVA 2X6SA 4NB4A 1KAZA 3O8MA 4F9OA 3TTFA 3ZSVA 2NUBA 2D0OA 4KHNA 1NJYA 1K73O 5F2RA 3CCEN 4FW1A 4FWSA 4IFEA 1YI2N 3J81O 4LF5K 2DTUA 3MEEA 3SAFA 1S5JA 2J4RA 1RT4A 4GY2B 3ZCMA 5HL7L 4JS5A 2B5JA 5AQIA 4BVPA 3U4LA 3WUHA 3JSMA 3NBPA 5A2QO 2P9KB 3F9KA 4I2PA 2P9LA 4NXNK 3BEXA 3AVHA 4H4OA 1IKYA 4H5TA 4MDAA 1T6DA 4CEZA 4R5PA 3OS0A 4KO0A 4M3XA 3KTQA 4DV4K 2A6AA 1NK6A 2P9SA 4IG3A 5M1KA 4CZFA 4M3WA 1VQMN 2OPQA 3CJ7A 1VSLA 3VOVA 4DR1K 3WNEA 4X66K 4Z4GA 1Q9XA 3PY8A 2VGMA 4K42A 4KHSA 3VGKA 4CJ5A 2NNWA 3G4SN 4BRKA 3CCLN 4FWOA 3MDQA 3HP9A 5J2QA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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