2G4FA

Structure of s.olivaceoviridis xylanase q88a/r275a mutant
Total Genus 130
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
130
sequence length
302
structure length
302
Chain Sequence
AESTLGAAAAQSGRYFGTAIASGKLGDSAYTTIASREFNMVTAENEMKIDATEPQRGQFNFSAGDRVYNWAVQNGKQVRGHTLAWHSAQPGWMQSLSGSTLRQAMIDHINGVMGHYKGKIAQWDVVNEAFSDDGSGGRRDSNLQRTGNDWIEVAFRTARAADPAAKLCYNDYNIENWTWAKTQGVYNMVRDFKQRGVPIDCVGFQSHFNSGSPYNSNFRTTLQNFAALGVDVAITELDIQGASSSTYAAVTNDCLAVSRCLGITVWGVRDTDSWASGDTPLLFNGDGSKKAAYTAVLNALNG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase
molecule keywords Hydrolase
publication title Structure-based engineering of glucose specificity in a family 10 xylanase from Streptomyces olivaceoviridis E-86
doi rcsb
source organism Streptomyces olivaceoviridis
total genus 130
structure length 302
sequence length 302
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.2.1.8: Endo-1,4-beta-xylanase.
pdb deposition date 2006-02-22

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00331 Glyco_hydro_10 Glycosyl hydrolase family 10
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 2g4fA00
2ZXBA 2F2HA 2WK2A 2E8YA 2UY4A 5JBEA 4PTMA 2EPOA 1CWYA 2VRQA 1FH8A 4AEFA 4TX8A 1L8NA 1WKYA 4NZCA 4ZFMA 3CPUA 2CXGA 3CUGA 3MUZ1 1QPKA 1FFRA 2QF8A 2PWFA 2QPUA 4Q22A 2X05A 4AXNA 5LA0A 4PSPA 1QNSA 1KBBA 2ZX9A 1NQ6A 2G3NA 3A3HA 1TG7A 2YL6A 2ZICA 2DT0A 1JG9A 1OWQA 2NT1A 4PMYA 2OSWA 3ZR5A 3GNPA 4AD2A 1GOIA 3GXFA 1OBAA 3ZJ8A 1FHLA 4JL1A 4FLQA 1V03A 5A3HA 3T09A 2CETA 2PI6A 1W3HA 4LGXA 1UOKA 1FHDA 4CN4A 2WVVB 5A6KA 2PB1A 1MQPA 4W89A 4ZENA 2D3NA 3JUGA 3L4YA 3DC0A 4RE3A 4PMRA 1K9TA 4XX6A 2O9OA 4UCFA 3WDPP 1CXEA 2EPKX 1JGIA 1ISVA 1D3CA 5M3WA 2ZWZA 1CXLA 4NF7A 3OBAA 2QMKA 4E2OA 4QDMA 4GXPA 3PZIA 2CPUA 4JKMA 3EYPA 2VZUA 1HP4A 1I1WA 4MNKA 3PHAA 2OSYA 1JF6A 5EFFA 2J47A 3CZGA 4P7LA 3MUY1 3TONA 1DWHM 1MFVA 3SCSA 1VEOA 3UG4A 2D2OA 2PBGA 5EFDA 1UYQA 2CBIA 1E4IA 1NWRA 3F5LA 1J9YA 3WDQA 5I24A 3AI0A 4D6GA 5LYRA 3VD4A 3VDCA 1NOUA 4YPJA 1WNOA 1EIBA 1QI0A 4LPCA 4EE9A 3BMWA 4TVDA 1SMDA 4W5UA 1J01A 1NP2A 1PJ9A 2YLLA 3W38A 3BAWA 1QW8A 2WB5A 3AMCA 1B30A 4HMEA 1QW9A 3BXWA 4WF7A 3N12A 4UQBA 5A8QA 1LLOA 4MDOA 1H3GA 4W5ZA 5AC4A 4GINA 4PCSA 3CZKA 3PZ9A 3SCUA 4KGLA 4MB3A 3WDJA 1W91A 2VX6A 4JFVA 5A6JA 2WVSA 1UZ1A 4GI6A 3CLWA 1U2YA 5EMYA 3ZJ6A 3M46A 1BQCA 2ZE0A 3AHVA 1QNOA 1W3JA 5IXEA 3O6AA 1AQMA 1VEPA 3VD3A 4OBSA 3ZOAA 5FD0A 3ARVA 2CYGA 4AZHA 1K9FA 5A6BD 5BXTA 2E40A 3WNNA 1QOXA 2D0GA 1GOWA 5A6AA 2JEQA 1IT0A 1UG6A 2WM0A 1JXKA 2W62A 1D7FA 2V3FA 3SUVA 2WAGA 2YA0A 1UR9A 1HKJA 2YKKA 3OLDA 1TCMA 1V0NA 1PEZA 1H09A 2E9LA 1ITCA 2ZX7A 4HA1A 3WF0A 2Z1KA 1ZL1A 1OINA 1JAEA 4IPLA 3II1A 4BQ5A 3AROA 1EQCA 1UKSA 5TD4A 1PZ3A 3ZR6A 4J27A 1XRVA 5E9AA 3PZMA 3VVGA 3WELA 4CVUA 1HVQA 1V08A 1DWFM 5CZKA 1Q6CA 3GH7A 3VIFA 1TFVA 2JALA 3A47A 1VFOA 4QLLA 1JIBA 1GHRA 3AZTA 4MB1A 4PMDA 3UETA 3AZRA 4F66A 4CN1A 1E43A 3WF3A 1BYCA 4AD4A 1B2YA 1J12A 3EMQA 4HZ6A 1NWUA 2WWDA 4CN6A 1E5JA 1OT1A 1WZMA 3OGSA 3GH4A 2XSBA 1H41A 3IJ8A 2X0YA 2JE8A 1V02E 4CD8A 4H04A 5A6MA 2Y5EA 3WMBA 4ACYA 4AEEA 2IXUA 1B3XA 1MWOA 2EPMX 1PX8A 1GNXA 4DUXA 3L4ZA 1CYGA 3KL5A 3VGBA 6TAAA 1LJYA 3WL1A 3DECA 3MMUA 1KWGA 4TTGA 4XZWA 1MW2A 1C8XA 1GJWA 4P8WA 4UQEA 3J7HA 2VURA 3NSNA 3PTKA 4AD0A 5CLWA 1OM0A 4RE2A 2GDUA 2J77A 4WKHA 1DP0A 1NH6A 4JCLA 3WD2A 3WF2A 1C7TA 4UZUA 4IUGA 3HN3A 2GJPA 4UFLA 3K8LA 3WNLA 4S3JA 1RP9A 3WQ8A 7CGTA 3AICA 3PTMA 3WN6A 4ATDA 4UOQA 4MADA 4M81A 3DYOA 4KRTA 3SEPA 2GSJA 3L2LA 1B31A 3OLIA 5GNZA 3WDIA 4W7WA 3IK2A 4WLCA 4Z2LA 4W8AA 1HJXA 3GDBA 1LG1A 1UH3A 5I0DA 3EMZA 1LWJA 5HNNA 1JZ6A 3POHA 1MVYA 2VQUA 1JD7A 1UWSA 2J8GA 4AZCA 1GZJA 2XVKA 2WLZA 3FAXA 3U5UA 3AS2A 3UG3A 3ARXA 2WC4A 3QGVA 2ZUVA 1XC6A 5HPCA 3FW6A 3DHUA 1E55A 2X0HA 4W7VA 1UKPA 3UEQA 3RCNA 4UTFA 2UWFA 2V3DA 3A4XA 4B3LA 3WD1A 5IFPA 4GQRA 3VDAA 1W3LA 4R5EA 2WBKA 4URIA 4QCEA 5CQ1A 1EO7A 1UQZA 1EO5A 3WEMA 2WC3A 3G6MA 2ZUMA 1HKKA 2WZHA 2XM1A 1XD1A 1AQHA 2CBJA 2J79A 1K6AA 2BY3A 4ZXLA 1J18A 3KWXA 2NT0A 3CH9A 2XUCA 4JCMA 4BCEA 4QAWA 2O9PA 1LF1A 2MANA 2ZXAA 2CEQA 4HA4A 3BMVA 1EHAA 4AZ6A 1UWRA 5JBDA 4L4PA 4E4PA 4JHOA 1OCQA 2IXVA 1OIMA 2G8ZA 2YL5A 3L4VA 1NP0A 3AIBA 5D8ZA 4BQ4A 1QHZA 1UWIA 2E8ZA 4JZ5A 1WDPA 2J75A 4RE4A 3RILA 2EPNA 2FDMA 3BH4A 1GVIA 2W5FA 4W93A 3ZO9A 3NDYA 4J3SA 2BS9A 3LPPA 2E9BA 5ECUA 3PZOA 2BV9A 3O9NA 1E4LA 1LG2A 2WXDM 3OGVA 3AIUA 4JL2A 4CCCA 3ZM8A 3NYDA 2J7HA 3HJEA 3THDA 4U33A 2PC8A 1JZ3A 3W53A 4ACZA 2ZIDA 1QI3A 4WSKA 3WUBA 5FKYA 4ZE4A 3ZT7A 4GI8A 4FLSA 2VX5A 3VDBA 5A8MA 3ZSTA 1V3LA 4OIFA 5C8BB 5CXPA 1J0YA 3WNMA 3WL0A 2YL9A 4LXFA 3VX0A 1UD4A 1PIFA 3T08A 1E0WA 8CGTA 1JDCA 3DYMA 1CGWA 4M8UA 1RD6A 2BXYA 4AZIA 3WQWA 1OIFA 3AS3A 1HXJA 4QLJA 3RM8A 5A6LA 3WDHA 1ZBWA 4PCTA 3VUPA 1GCYA 2WCAA 5CLTA 3VIOA 3VMNA 2VCCA 2WYSA 4KRUA 3TOPA 1BYBA 2YL8A 3U5YA 3VM5A 4AW7A 1VAHA 1A47A 7A3HA 3UG5A 1UD3A 3TP4A 3WUFA 2D1ZA 1J10A 3CZJA 1EXPA 1W1YA 3NDZA 1JF5A 1UWUA 3AJ7A 1WO2A 2WVVA 3ZSSA 4AZ7A 1V3KA 4PTXA 3BAIA 2V5CA 1H49A 3KEHA 1KQZA 1K9EA 4TOQA 1DHKA 4TTUA 2CNCA 3VGGA 3S2CA 3VIMA 1XH0A 4HU8A 2RGLA 3GZAA 2XVLA 2W92A 3CUIA 2VNCA 3VTRA 1BLIA 5CG0A 3OG2A 2WKGA 1DWJM 5A1AA 4DWSC 2OWWA 1GONA 1KR0A 2DIJA 2J7FA 4X0NA 2DH2A 2WMHA 3KL0A 3AMGA 3VOCA 2W61A 2Y4SA 5F7UA 1NARA 3G6LA 1OB0A 1G9HA 2J7GA 1XSKA 4WKFA 5GPRA 6CGTA 4PTVA 1QNPA 3K4DA 5EB8A 3KZSA 1E15A 1FH9A 2O92A 4HP5A 1FP9A 1PZ2A 5I6SA 3OGRA 3U7BA 1OSEA 2A3BA 1HL8A 4GIAA 3MMDA 2YBUA 1VFFA 1HJVA 5DT5A 5AC5A 1UD2A 4N42A 3UERA 4X0VA 3OA5A 2BVTA 1MQQA 2GJXB 1KXTA 4YHEA 3VILA 3SCVA 4B16A 2GJRA 4UFJA 2WSPA 2CCRA 4FLRA 1X6LA 3CIVA 6A3HA 5I23A 1C93A 5FCZA 3PZTA 4MAZA 3W37A 5A94A 1VJSA 4NRRA 3AOFA 1OGGA 2J62A 3VIHA 1US3A 5IHRA 1JDAA 2VL4A 4PMOA 3W25A 4LYPA 5E70A 1XCXA 5D4YA 1EDTA 4PMZA 1SYTA 3UCQA 3GNRA 2WZEA 1HX0A 2XVGA 2EEXA 3AMKA 2GDVA 5A8PA 4D6DA 3SUWA 4UOZA 1HKMA 1V6XA 5C70A 1E3XA 2WVUA 5A6BA 5HBFA 4MPKA 3I3EA 3W81A 1KCKA 2WMJA 2WZIA 3WNOA 1LWHA 3CHEA 1E73M 4XZBA 4D1JA 1BHGA 2OWCA 2DSUA 1R87A 1QI5A 2VCBA 3AHYA 3POCA 2X09A 3VX1A 4ZE5A 1EH9A 1J0JA 1A3HA 4EANA 2DT3A 2HISA 3VGHA 2WW5A 2ZX5A 3MV01 3K46A 1TUXA 2G4FA 3CTTA 2Y2WA 3VM7A 4TVUA 1QBBA 3WH6A 1B3VA 4OOZA 4UFKA 1AVAA 1C90A 2PWEA 2QV4A 4F9JA 3BSHA 1VJZA 3IJ9A 1CTNA 3K8KA 3WFLA 1R86A 4LQ1A 1L0PA 4YHGA 1W1PA 1E4MM 4P7RA 3B9DA 1KWKA 3BAYA 3EBVA 1VFMA 4GI9A 4EK7A 4JIEA 3WNPA 1DTUA 1UR2A 2JF6A 3WEOA 2OWXA 4D1IA 4B9ZA 2WHJA 2YOCA 4MDPA 3AHTA 2A3EA 3PTQA 5CPTA 1OD0A 2YDSA 3VIGA 1V6YA 4GO8A 2TAAA 1JI1A 1LQ0A 1P6WA 4UFIA 1HJQA 1B3YA 2BY1A 3GBEA 1HNYA 1JZ2A 1OD8A 1C7SA 2WCSA 4S3KA 2J7EA 4DWSB 1VEMA 3RO8A 4YN5A 1E6NA 1ZB5A 4Z2GA 4AD5A 1H11A 2AAAA 4IM4A 4FMVA 1WB0A 1ZJAA 4D6JA 1NWSA 2F8QA 4J3VA 3W24A 5JUVA 2QHAA 1ISYA 4DWSD 1WAWA 3EDDA 3QOKA 4PMXA 4Z2JA 3VKKA 2YLAA 5KEZA 2W63A 4B9YA 2CBUA 1UKTA 3ARSA 3KL3A 2FH8A 4U2YA 2IUZA 3LMYA 1R8LA 1X1NA 2XFYA 3PZVA 2FHBA 1PPIA 1EOMA 1HJWA 3OB8A 2EBNA 3EMCA 4MB4A 1UKQA 1JD9A 3BCFA 4JKKA 4TUFA 2XHYA 1J0KA 3L4TA 3GNOA 1MW1A 4M29A 4D6CA 1M53A 4OZOA 4P7NA 1IZKA 3OLEA 4ATWA 1BGGA 1V6WA 5ABFB 4H8VA 1TA3A 2NW0A 3MKKA 3EDEA 2YJQA 3SUTA 2G3JA 3MMWA 3MUIA 4DM1A 3CZEA 1CBGA 3ARRA 1UWTA 4XV0A 5M17A 5JBFA 3MO4A 4P7QA 3ZJKA 3T2QA 2EXOA 1TMQA 1CXHA 3AHXA 3MV11 4FF5A 1GOOA 4H2CA 3VO0A 3QHMA 2OYLA 2PWGA 2C0HA 4WKAA 1ODUA 2GK1B 1I75A 1KBKA 4WSJA 1ISXA 3TA9A 2QMJA 3CMJA 4AD3A 2DSVA 1K9DA 1H4PA 1MW3A 3BCDA 5FIPA 4JKLA 4MJ2A 1H0IA 1MXDA 3I3BA 4PMUA 3AS0A 2BHZA 3M07A 2CHNA 4MNMA 1ECEA 1G94A 4TX6A 4L4OA 3CHFA 4AYSA 3QOMA 1GQLA 1V0LA 4H7VA 1RPKA 1J11A 3APGA 2OYKA 3ZQ9A 1PAMA 3PN8A 1BF2A 2UY3A 4BF7A 3AIQA 1BG9A 1WDRA 3NCOA 1V3HA 3WQVA 1QBAA 4D6EA 1F4AA 4PMNA 5ABEA 1QI2A 3BAKA 3FHAA 5BRQA 2RGMA 2W67A 2VRJA 1JZ8A 1KB3A 3WBEA 5BWFA 3N18A 2DT1A 1KGUA 2CHOA 3N04A 5GQBA 1KXVA 1MXGA 4R27A 1TA3B 4UZSA 1ZBCA 1E6ZA 3IAQA 4AY1A 3L4XA 1UA7A 2ZOXA 1Q6GA 2E4TA 3T2OA 1V3MA 1CLVA 4RL3A 2CKRA 2J7DA 1G5AA 4XB3A 3WH5A 3AIEA 1V0MA 5A69A 4AC1X 1US2A 1C3FA 1QHPA 2XG9A 3AS1A 3ARWA 2D0FA 1XSIA 2F61A 4PEEA 1V3IA 3VDHA 1CECA 3M6DA 4TVCA 1HT6A 1R7AA 1B0IA 1ZJBA 1R7OA 1WZKA 2G3IA 3FN9A 1E70M 3EDFA 3MSDA 1KQYA 4J3WA 3ARPA 2V5DA 1E6PA 2BVYA 4BZYA 2Z1SA 1NOFA 4D6FA 3N11A 3SCWA 1SR0A 3FHQA 4W7UA 1W9PA 4AIOA 1NOWA 4AZ5A 4U2ZA 3VU2A 2VVSA 3CZ8A 1AMYA 2XWDA 1KCLA 1UD6A 2WHKA 9CGTA 1CGTA 2FGZA 4CU8A 3K1DA 2VZTA 2JEPA 3VD9A 1BAGA 2WC7A 2YBTA 1UR0A 1YQ2A 1FP8A 1MYRA 5FL0A 2C7FA 1HIZA 4MTVA 2CITA 3AQUA 2A3AA 2ZUTA 3DHPA 3SURA 4FK9A 2X1IA 3ARTA 4X9YA 4GO9A 2HVMA 3B9AA 1E56A 4QCFA 2JIWA 4JFSA 5CSYA 1M01A 5I78A 3WD4A 3WDRA 3WQ4A 4MNLA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 2ZXB A;  2F2H A;  2WK2 A;  2E8Y A;  2UY4 A;  5JBE A;  4PTM A;  2EPO A;  1CWY A;  2VRQ A;  1FH8 A;  4AEF A;  4TX8 A;  1L8N A;  1WKY A;  4NZC A;  4ZFM A;  3CPU A;  2CXG A;  3CUG A;  3MUZ 1;  1QPK A;  1FFR A;  2QF8 A;  2PWF A;  2QPU A;  4Q22 A;  2X05 A;  4AXN A;  5LA0 A;  4PSP A;  1QNS A;  1KBB A;  2ZX9 A;  1NQ6 A;  2G3N A;  3A3H A;  1TG7 A;  2YL6 A;  2ZIC A;  2DT0 A;  1JG9 A;  1OWQ A;  2NT1 A;  4PMY A;  2OSW A;  3ZR5 A;  3GNP A;  4AD2 A;  1GOI A;  3GXF A;  1OBA A;  3ZJ8 A;  1FHL A;  4JL1 A;  4FLQ A;  1V03 A;  5A3H A;  3T09 A;  2CET A;  2PI6 A;  1W3H A;  4LGX A;  1UOK A;  1FHD A;  4CN4 A;  2WVV B;  5A6K A;  2PB1 A;  1MQP A;  4W89 A;  4ZEN A;  2D3N A;  3JUG A;  3L4Y A;  3DC0 A;  4RE3 A;  4PMR A;  1K9T A;  4XX6 A;  2O9O A;  4UCF A;  3WDP P;  1CXE A;  2EPK X;  1JGI A;  1ISV A;  1D3C A;  5M3W A;  2ZWZ A;  1CXL A;  4NF7 A;  3OBA A;  2QMK A;  4E2O A;  4QDM A;  4GXP A;  3PZI A;  2CPU A;  4JKM A;  3EYP A;  2VZU A;  1HP4 A;  1I1W A;  4MNK A;  3PHA A;  2OSY A;  1JF6 A;  5EFF A;  2J47 A;  3CZG A;  4P7L A;  3MUY 1;  3TON A;  1DWH M;  1MFV A;  3SCS A;  1VEO A;  3UG4 A;  2D2O A;  2PBG A;  5EFD A;  1UYQ A;  2CBI A;  1E4I A;  1NWR A;  3F5L A;  1J9Y A;  3WDQ A;  5I24 A;  3AI0 A;  4D6G A;  5LYR A;  3VD4 A;  3VDC A;  1NOU A;  4YPJ A;  1WNO A;  1EIB A;  1QI0 A;  4LPC A;  4EE9 A;  3BMW A;  4TVD A;  1SMD A;  4W5U A;  1J01 A;  1NP2 A;  1PJ9 A;  2YLL A;  3W38 A;  3BAW A;  1QW8 A;  2WB5 A;  3AMC A;  1B30 A;  4HME A;  1QW9 A;  3BXW A;  4WF7 A;  3N12 A;  4UQB A;  5A8Q A;  1LLO A;  4MDO A;  1H3G A;  4W5Z A;  5AC4 A;  4GIN A;  4PCS A;  3CZK A;  3PZ9 A;  3SCU A;  4KGL A;  4MB3 A;  3WDJ A;  1W91 A;  2VX6 A;  4JFV A;  5A6J A;  2WVS A;  1UZ1 A;  4GI6 A;  3CLW A;  1U2Y A;  5EMY A;  3ZJ6 A;  3M46 A;  1BQC A;  2ZE0 A;  3AHV A;  1QNO A;  1W3J A;  5IXE A;  3O6A A;  1AQM A;  1VEP A;  3VD3 A;  4OBS A;  3ZOA A;  5FD0 A;  3ARV A;  2CYG A;  4AZH A;  1K9F A;  5A6B D;  5BXT A;  2E40 A;  3WNN A;  1QOX A;  2D0G A;  1GOW A;  5A6A A;  2JEQ A;  1IT0 A;  1UG6 A;  2WM0 A;  1JXK A;  2W62 A;  1D7F A;  2V3F A;  3SUV A;  2WAG A;  2YA0 A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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