2G96 | Genus

Total Genus 151

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	151
sequence length	475
structure length	463
Chain Sequence	FNILLATDSYKVTHYKQYPPNTSKVYSYFECREYEETVFYGLQYILNKYLKGKVVTKEKIQEAKEVYREHFQDDVFNERGWNYILEKYDGHLPIEVKAVPEGSVIPRGNVLFTVENTDPECYWLTNWIETILVQSWYPITVATNSREQKKILAKYLLETSGNLDGLEYKLHDFGYRGVSSQETAGIGASAHLVNFKGTDTVAGIALIKKYYGTKDPVPGYSVPAAEHSTITAWGKDHEKDAFEHIVTQFSSVPVSVVSDSYDIYNACEKIWGEDLRHLIVSRSTEAPLIIRPDSGNPLDTVLKVLDILGKKFPVSENSKGYKLLPPYLRVIQGDGVDINTLQEIVEGMKQKKWSIENVSFGSGGALLQKLTRDLLNCSFKCSYVVTNGLGVNVFKDPVADPNKRSKKGRLSLHRTPAGTFVTLEEGKGDLEEYGHDLLHTVFKNGKVTKSYSFDEVRKNAQLN

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

molecule tags	Transferase
molecule keywords	Nicotinamide phosphoribosyltransferase
publication title	Crystal Structure of Visfatin/Pre-B Cell Colony-enhancing Factor 1/Nicotinamide Phosphoribosyltransferase, Free and in Complex with the Anti-cancer Agent FK-866 pubmed doi rcsb
source organism	Rattus norvegicus
total genus	151
structure length	463
sequence length	475
chains with identical sequence	B
ec nomenclature	ec 2.4.2.12: Nicotinamide phosphoribosyltransferase.
pdb deposition date	2006-03-05

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF04095	NAPRTase	Nicotinate phosphoribosyltransferase (NAPRTase) family
A	PF18127	DUF5598	Domain of unknown function (DUF5598)

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.20.20.70	Alpha Beta	Alpha-Beta Barrel	TIM Barrel	Aldolase class I	2g96A02

1XUZA 1BWLA 4Q4KA 2DU2A 2Q3OA 3G22A 3N2MA 3PB2A 1QO5A 4RX0A 2NX1A 1XBVA 3NQEA 4MZ1A 4R34A 4BWLC 3GLCA 2VFHA 4ZMGA 4WQ6A 2ZZ2A 5I3IA 1KFKA 4LW7A 4MLRA 1J4EA 1F5ZA 1VYPX 3NEVA 4RV8A 1VRDA 3CHVA 1OFBA 4IWWA 1W3NA 1XDLA 1LRTA 4HIBA 4UCGA 3BARA 3GR7A 4N9CA 1W54A 4LWWA 1I8JA 1A5BA 1MSSA 2NXGA 1D3HA 3DFSA 1ZALA 5D30A 4JTSA 3TA6A 3LXAA 1I2NA 3WJWA 1H7RA 1K8ZA 3CEPA 3G8RA 4OGZA 4QNEA 3UXDA 5FF0A 1FDJA 2ABBA 3GIYA 4IMCA 2AAMA 1UASA 1W3TA 2GQAA 3W1QA 1K02A 1GVOA 4UTLA 4JD4A 4D2JA 3V1PA 3EEGA 3T4CA 3TAOA 1H5YA 1VQTA 2DZWA 4I7UA 4KFNA 5CG7A 5D09A 3HMJG 4N9DA 3ZFHA 1WX0A 3M44A 2YFOA 3NR0A 1GYNA 3W2NA 5D2XA 3UWYA 4ORMA 3C2RA 3T78A 5D02A 3L5AA 1PIIA 2V2HA 2ATMA 3QF0A 4JYDA 4DO6A 3UWWA 1O5KA 4UTWA 3W87A 4LS2A 3FEMA 1YDOA 5KZDA 1JQXA 4M6QA 4UMCA 2CW6A 3PBYA 3W7OA 2ZBTA 3VNDA 4GJ1A 3SJ3A 3H53A 1JQVA 1V5XA 4KFPA 4ZZ9A 1TPWA 4LU0A 3TFXA 5CPOA 1RPXA 3NPUA 1VHNA 1FCQA 5FEPA 3CC1A 5AC8A 2IQTA 3E0IA 3O6YX 4O53A 1A5CA 5HNRA 3G0XA 3B0PA 3QC3A 3BW4A 2I1OA 1ONRA 2BSLA 4I9AA 3Q58A 4M7SA 5AFDA 1HO4A 4JEQA 4ZQOA 5KMYA 5F2IA 1JCXA 5G1TA 3M47A 4UTMA 4Y90A 2BXVA 1TSIA 5BRBA 2R91A 1H7PA 1KA9F 1EUNA 3FYOA 3LERA 4ZVJA 3RU6A 4ADSA 1H63A 1OX6A 3DU0A 3MO7A 1NFBA 3LB0A 4PA8A 1HO1A 3P8JA 2CU0A 2YXGA 5AN7A 4JX4A 4JTHA 1KBIA 1P4CA 2YW3A 1GEQA 2X1SA 4JTTA 1DJQA 4NJGA 3ABRA 3TUUA 2V8ZA 2RHGA 3KVKA 1KTNA 3HPSA 4XBKA 3THAA 4GXMA 3SR7A 1LZOA 1A5AA 1DQXA 3KVMA 2GJNA 1F74A 4ALDA 4DPQA 2E77A 4FNUA 1VCVA 1FDZA 4N02A 1G4PA 3IIVA 1QPRA 1JRBA 2WO5A 3DI0A 3LCLA 1EX5A 2QCMA 1F76A 1TPB1 2A2IA 1FXPA 4U28A 1G4SA 4JTGA 2E09A 3W7EA 3IVUA 2WQPA 3W7LA 3LLFA 3TDFA 2I9EA 1YADA 2DJLA 2CLLA 2VELA 4UXDA 4YL2A 4MLJA 3W7IA 1VH7A 4QNWA 3LCXA 3SW6A 2Y62A 2QUVA 2OJPA 3ANYA 3DGRA 3W3OA 1KTBA 3N9SA 4Z0JA 1OX4A 4DF2A 2AGKA 2QCDA 3I6RA 1KM3A 2ZTJA 3LV6A 5FEXA 1YTEA 2ZYFA 4MYXA 3W1UA 2WNQA 4Y9AA 4O4WA 1XBXA 3DHDA 3W7GA 2E68A 5D04C 3FYPA 3NQ2A 1TREA 4WY0A 4FB7A 4QSHA 3F03K 2B7OA 3M41A 5IBXC 1W1ZA 3IIZA 3HGJA 1MXSA 2Y85A 3QSTA 2J9XA 3EX6A 2BWGA 4Y96A 3QQ1A 2WSYA 1SUXA 3EX2A 1FUYA 1HUVA 1LRQA 1S3HA 5AOUA 4JYFA 4K8HA 5F4WA 3YPIA 4ZQCA 2DP3A 4DEFA 1VYRA 1OYBA 3W9ZA 2FFCA 4UNLA 3NYZA 4M7TA 4LVBA 2VEIA 5D03A 4FIRA 2GUUA 2VENA 3LHWA 3L5MA 2ZRXA 3O8AA 5I3HA 3TV8A 5HWMA 4A3UA 5TQLA 2X16A 2YFNA 3O05A 3ABOA 2Q8LA 4K8EA 2GQ9A 1J2WA 5FF3A 1L6WA 1WQ5A 3N14A 2ZZ5A 4I7VA 5G5IA 3B04A 1FWNA 3R2GA 1XKYA 1ZAIA 1S5WA 4JS3A 2C13A 2HTMA 1PHWA 2Z2UA 3L66A 2J9YA 3IGUA 3IRDA 2CLFA 3MP4A 4IXHA 4FXSA 3F1QA 4YWIA 4PCFA 3MYOA 3PS7A 1KV5A 3O16A 5KSWA 3THQA 1LOLA 3C2FA 5AYYA 1DKWA 2FDSA 1ICSA 3R89A 3ATYA 2PRLA 5T26A 2CLOA 3O06A 3W1MA 1XI3A 2JKAA 3G1DA 1IIGA 3HOJA 2C18A 3DFQA 4N6EA 5HR6A 4WXZA 3TCEA 3BLFA 4YLWA 2V82A 3GR8A 3LCFA 1KM6A 4N4PA 1EB3A 2YDAA 5CPMA 3WFAA 1X6UA 3OG3A 3RK8A 2EAWA 2PRHA 4N6FA 4OU1A 1GJPA 1A53A 4UMBA 1WA3A 4IPJA 2YGYA 3QM3A 1R2RA 1VYSX 1T8XA 1XM3A 4AXKA 4JTEA 2V81A 3RNDA 4DBEA 5K3VA 3GDRA 4JDBA 4IJBA 1FDYA 3HGOA 3UWZA 4ZQPA 2DJXA 1NF0A 3E9AA 1G69A 5AC6A 4AWSA 1X1ZA 1C8VA 4NJHA 3TJXA 4AVFA 4DF1A 1KM4A 2G5WA 3DZ1A 3NL3A 1BKSA 3QMTA 5HUOA 3MP5A 3MWAA 3W1LA 4FNPA 3KX6A 2NLIA 3PG9A 3NA8A 4O28A 4K7YA 3F4NA 3PY2A 3TSMA 5FEZA 5DCDA 1DVJA 3HIJA 3MBFA 3OA3A 3WJXA 3W07A 1PL9A 5H91A 3LHUA 1IXOA 1EUAA 3UXAA 2JGQA 3ELFA 5HINA 4IQLA 4M19A 1TIMA 1N7KA 3GNDA 1GVQA 1FY6A 3S5ZA 3S42A 4UMAA 2NUWA 2G95A 3R5EA 3UQNA 1YTKA 5KZEA 5D32A 4JTLA 1LOSA 5CZJA 4LC8A 4JNMA 4OE7A 3L9CA 3UPWA 1RQEA 2ABAA 2C6QA 3HPZA 1TPFA 3NQCA 1TPH1 3KRZA 3KVLA 4LC6A 3W74A 4ZQRA 4XQ6A 3M7WA 1F73A 4NX5A 4O0KA 1K3UA 1Z44A 2DZSA 2FPVA 3PSWA 4L4MA 2C15A 2CZEA 4TIMA 4HSNA 1NF7A 2E6AA 4TMBA 1D3GA 3PM6A 1AL7A 2J24A 2WJZA 2A85A 2A6NA 2V2DA 4B5NA 2RKXA 4J9JA 2ZQ0A 3TQVA 3GB6A 3ABSA 2PC4A 1GT8A 1N8FA 2NV2A 3L0NA 1IXPA 1NEYA 2YZRA 1EWEA 3I65A 3USBA 5FF2A 2TRSA 4ZL1A 1ML1A 2JKEA 2DORA 1TTIA 3HG3A 2CZDA 4RR4A 2YCEA 1BWKA 5FF4A 3NQ8A 5A8GA 1XDMA 5A5WA 1ICQA 2E5DA 4GUFA 1T99A 3W1XA 1PCWA 3W76A 2VEMA 5LGXA 2DZVA 3HG4A 2W6RA 5D2WA 3PAJA 4JTFA 4MJMA 4CQAA 2A0NA 3LXCA 2C1HA 3H54A 5FEWA 1QPQA 5KZMA 5C55A 2X1RA 1FXQA 2WNZA 2QJGA 3UZ5A 3EB2A 3I68A 4NNBA 1KFCA 1PVNA 3W7RA 1F7BA 1SU5A 1T96A 4R33A 2FPTA 4KWWA 3G3DA 3EX3A 1W56A 4OT7A 1EP3A 5HR7A 4O10A 5IBXA 3ZR4A 4OV4A 1WXJA 4NX0A 5U7SA 1W5OA 1G4EA 4H3DA 2Z6IA 4G1KA 4FX7A 3TAKA 4O17A 3BG3A 4LV4A 1GTHA 3U8GA 4LVFA 4CCEA 1M7OA 1R46A 4KFOA 6TIMA 1VCFA 1QR7A 1LLZA 4KWVA 1VZWA 5G4WA 3I7QA 3LDVA 4UIOA 3MHGA 4NXSA 3KHJA 5F4SA 1U5JA 1YPIA 1W8SA 4S2CA 3L67A 2C0AA 1B4EA 3GYEA 3W1TA 4DQWA 1ZCOA 1AL8A 5H2ZA 1ICPA 4DELA 3BO9A 4WUIA 3FA5A 4JGDA 3FIGA 2X30A 4GUIA 3TU9A 4UTTC 3S9YA 1NAL1 4YMZA 4A2RA 5LGZA 5L6UA 1TYGA 2ISSA 5LHFA 3W7QA 2X1UA 1IGSA 5AHIA 2DZTA 1ZHAA 1B57A 3CM4A 3DI1A 3FKRA 3NPXA 3PC0A 5G2IA 5F2LA 1KV8A 4AB4A 3G3MA 4UNKA 4Z0SA 3VI2A 1UB3A 2ZCGA 4O1DA 4FF7A 3WK0A 5CSRA 1KTCA 2H3BA 3B8DA 1FWSA 1Q3NA 5DN1A 4UFHA 3CPRA 3S1XA 3TE9A 4UTHA 3P84A 1F05A 4Z1DA 3TC6A 2NUXA 1FCUA 3M5VA 1ZY9A 3W83A 3LX9A 1I4NA 1SZFA 1PS9A 4Z1AA 1M5WA 5BMXA 3LBMA 1L2UA 4O52A 2E6DA 2F7FA 2X2GA 3VKJA 2QKFA 1Z42A 4RZ6A 2BTMA 1ZENA 1IXQA 4AHOA 3G1XA 1H50A 5EMUA 2GPTA 1Q6LA 3IVSA 4GNJA 3I7RA 1I2RA 3HG2A 4MPQA 4GFSA 4HPJA 2C3ZA 4TR9A 1H62A 2CLHA 3C8FA 3TJLA 3S0CA 2VKZG 4LY8A 4BI7A 3G1AA 3N9RA 3NQ7A 1IIHA 3DH7A 2B0MA 5G2WA 3S1WA 3W88A 3MUXA 1I2QA 2TYSA 2FB3A 3GDLA 4NJJA 3DBPA 4W9TA 1DQWA 1ALDA 5DXXA 3NDOA 3QW4B 4I7WA 4UR8A 1SZEA 4MJZA 3JRKA 5G1YA 3TX9A 4CQ8A 4NUWA 5K2ZA 1TB3A 1UUOA 1YLVA 2ZA1A 1JCJA 5CSSA 1VLIA 2WKJA 3EWZA 3IV3A 2B7QA 1WAUA 3W23A 1V7YA 1TRIA 2FIQA 3LLDA 2E5CA 3FFSA 2HS6A 3MI2A 3TNOA 1P0NA 3TMQA 3B4UA 2I14A 1K7XA 2F84A 1K8XA 1P1XA 5K4XA 3W1RA 4DO5A 3M6YA 3NQDA 3WJZA 3P60A 1VPXA 2Y7DA 4QQ3A 1K03A 3KRUA 5I3FA 1VHCA 4LVAA 4UFLA 1D9EA 4WXYA 6ALDA 4PC8A 1JCYA 5F4XA 4O11A 3PB0A 2ZZ7A 1QPOA 3DFNA 4XUGA 5E0KA 4Y6GA 5HULA 3LXBA 2HSAA 1I2PA 3LCWA 3W1NA 3DKLA 1LRNA 1WBHA 2A7NA 2VFIA 3UWVA 1TV7A 1PHQA 2J9ZA 4CLMA 4JIPA 2QCLA 1SW0A 3KXQA 3FJLA 1LDCA 4NJKA 5L9FA 3E12A 3MHFA 4L4LA 2P1FA 2DZXA 5DXYA 4IX0A 4MFDA 5F1UA 1K8YA 5F2MA 4RZ5A 3BGJA 4S1FA 1AMKA 4EF9A 3P80A 2X1TA 1TMHA 1XFBA 4LUIA 1G7UA 3K30A 3P82A 4TU1A 3TROA 3BG9A 4BF9A 1RZMA 3NPVA 1DL3A 1HTIA 1GWJA 1MEWA 3KAOA 1I45A 1QNVA 1ME9A 4X3ZA 3M5XA 2QDGA 1SO6A 3G8EA 5CKSA 2J88A 3NGJA 4OHQA 3B03A 1H7NA 5U4NA 4HNTA 1ADOA 2P0OA 4GE8A 3G1HA 5KITA 2CLKA 3HO8A 3PBVA 1W5PA 4AF0B 3KVJA 1EP1A 2E5BA 3MI3A 1ME7A 4PH6A 1Q45A 1HL2A 3UPBA 1QOPA 1EIXA 1LORA 2D73A 3CIWA 1H51A 3QMRA 1TRDA 3MP3A 1YTDA 2WPBA 3QPZA 1H61A 3C52A 4DF0A 5LZLA 1OFDA 1ZAJA 3LCGA 3IIOA 4FXRA 1WOAA 2VFDA 2OMAA 4FIQA 5K9CA 1MO0A 3UWUA 4JY9A 2H3DA 1NVMA 1DHPA 2OCZA 3DFPA 4LTSA 3S5YA 2XN0A 3BVJA 2QEZA 4NXKA 5FESA 3NVTA 4FNQA 4UUIA 4LNYA 1TPUA 3IIXA 5TBOA 2Y7GA 3CLMA 4HNVA 4UTUA 5LNUA 3DHFA 3KFTA 4X2RA 3G1FA 1PV8A 1SW7A 4GBUA 3W86A 1JUKA 1KFBA 3G1VA 1OG0A 1SW3A 2HMCA 2A7RA 3EKZA 2PURA 4BWLA 1QOQA 3EKLA 2CFFA 3NM3A 3DAQA 4OV9A 4UC5A 1H60A 4FX6M 4NNCA 4MVAA 3L5LA 1P5BA 3IGXA 1ZNNA 3LCHA 4PL2A 1JCLA 4WJEA 4MUZA 4O1BA 4AWTA 1SO3A 1GVRA 1LYXA 3LM7A 1SSGA 1JRCA 3QW3A 4NZFA 1KFLA 1QFEA 1SFJA 1OK4A 1IXNA 4IX2A 3S5NA 1L6YA 5K7JA 4XZ9A 2OX1A 2EHHA 1YXCA 4P2VA 2ZRWA 3S1UA 2CZFA 1R47A 4CQ9A 5HWNA 3PBWA 3CIXA 4BFAA 3LCIA 4KKXA 3M16A 3G1SA 4BR1A 3NG3A 1ZFJA 3TR2A 3MI6A 1XBYA 2BLEA 4OQVA 2FPYA 5CGQA 2FQIA 3LV5A 4MIMA 2Y7EA 3TQ0A 1DJNA 2Y61A 2KZHA 1CX9A 3MBDA 4M5PA 1TPVA 1GQNA 3P74A 3EWYA 2NZLA 2P10A 5AHFA 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chains in the Genus database with same CATH topology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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2G96A

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