The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
9
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sequence length |
63
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structure length |
63
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Chain Sequence |
GPIYARVIQKRVPNAYDKTALALEVGELVKVTKINVSGQWEGECNGKRGHFPFTHVRLLDQQN
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Protein binding
|
| molecule keywords |
Proto-oncogene C-crk
|
| publication title |
Solution Structure and Folding Characteristics of the C-Terminal SH3 Domain of c-Crk-II
pubmed doi rcsb |
| source organism |
Mus musculus
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| total genus |
9
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| structure length |
63
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| sequence length |
63
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2006-03-24 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF07653 | SH3_2 | Variant SH3 domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 3A98 A; 2D8J A; 1ZUK A; 3U23 A; 4J9H A; 1ABQ A; 1JXO A; 2KRO A; 4F14 A; 1UFF A; 2ROT A; 2L2P A; 4J9C A; 2P4R A; 1VA7 A; 1H92 A; 1PRM C; 2EGE A; 4ORZ A; 4RTZ A; 1NEB A; 4A63 B; 5IXF A; 4JZ4 A; 1TG0 A; 2FPF A; 4JJB A; 4HXJ A; 1K0S A; 4KRT A; 4EIK A; 1X6B A; 2HCK A; 3UA6 A; 1VYU A; 3EG1 A; 2K6D A; 1WYX A; 2GQI A; 1HD3 A; 1Y0M A; 1GL5 A; 2K79 A; 3EG2 A; 1T0J A; 5IHI A; 1SSH A; 2ROL A; 4J9F A; 1NLP C; 1OPL A; 1JQQ A; 1FYN A; 2W10 A; 1K0X A; 2GBQ A; 2LMJ A; 2CT3 A; 3KFV A; 1M3B A; 2RQR A; 3IQL A; 1QLY A; 3I5R A; 2A36 A; 2EGC A; 4QT7 A; 1UE9 A; 1I07 A; 2CSI A; 1N5Z A; 2A28 A; 1U3O A; 2O9V A; 2LQW A; 4AG2 C; 2NUZ A; 2YUO A; 1RUW A; 2DJQ A; 2JW4 A; 2DBM A; 1RLP C; 2RNA A; 3PVQ A; 2RQT A; 5L23 A; 4RTX A; 1TUD A; 3VS1 A; 2ECZ A; 2JS2 A; 5HCK A; 1JU5 C; 1SEM A; 1EFN A; 2LJ0 A; 3O5Z A; 4J9G A; 2LCS A; 3ZL7 C; 1FMK A; 4OMN A; 3I5S A; 2DM1 A; 3SEM A; 3UAT A; 4F16 A; 1U06 A; 2HBW A; 3QWY A; 2ESW A; 2KXD A; 4WCI A; 3M0P A; 4LN2 A; 2EYX A; 4GLM A; 2M51 A; 4JPB W; 5FWB A; 3VRZ A; 4CC4 B; 2K2M A; 5EC7 A; 4AFZ C; 5GJW B; 3QWX X; 2GTO A; 4GBQ A; 2DIL A; 4HCK A; 2KR3 A; 2DL8 A; 1WXT A; 1RI9 A; 2BZ8 A; 3M0R A; 1UUE A; 1AWO A; 2JS0 A; 3EG0 A; 4HVV A; 1AWX A; 2A08 A; 1QCF A; 2ED1 A; 2KYB A; 1OV3 A; 2SEM A; 1I1J A; 1BB9 A; 2J6O A; 3VS5 A; 1CKB A; 3H41 A; 2XMF A; 2LP5 A; 1UJ0 A; 1UJY A; 2JMC A; 3M0Q A; 1AZG B; 2J6K A; 5FW9 A; 1SPK A; 1NYG A; 1WLP B; 2YSQ A; 1WFW A; 2ENM A; 3NPF A; 1AEY A; 1PWT A; 1WXB A; 1MV0 B; 2AZS A; 2W0Z A; 3VS3 A; 2MCN A; 2V1Q A; 1BU1 A; 3UA7 A; 2B86 A; 1K9A A; 3ULR B; 1UTI A; 2KGT A; 1OPK A; 3GBQ A; 2C0O A; 3REA B; 1OEB A; 2OJ2 A; 1JXM A; 4Z8A A; 1E6G A; 2KT8 A; 2DL5 A; 2EQI A; 1WX6 A; 2GGR A; 3RNJ A; 1UHF A; 3VRY A; 4J9B A; 2CUD A; 2BZX A; 1SRM A; 1WIE A; 4CC7 A; 4DEY A; 4HVW A; 3PE0 A; 2IIM A; 2RMO A; 2VVK A; 1SHG A; 2DA9 A; 2KRN A; 2J7I A; 1X2K A; 2EYY A; 1KFZ A; 1QKX A; 1UDL A; 4D8D A; 2ED0 A; 1M30 A; 2O9S A; 4E6R A; 2OI3 A; 2YT6 A; 1Z9Z A; 2RQV A; 2A37 A; 4HVU A; 1UGV A; 3RBB B; 2C0I A; 2O88 A; 2D8H A; 2JM9 A; 2KRM A; 4OMQ A; 2YDL A; 1YN8 A; 3VS6 A; 1GFC A; 1PKT A; 2YUP A; 2DNU A; 3NGP A; 3LH5 A; 3M0T A; 1WI7 A; 1H3H A; 1T0H A; 4RUG A; 2EYZ A; 2MOX A; 1UEC A; 2CUB A; 1PRL C; 2DX1 A; 1MV3 A; 3M0U A; 2GNC A; 1KSW A; 2EGA A; 1E7O A; 2G6F X; 3UF4 A; 1WDX A; 1YNZ A; 2RQW A; 3JV3 A; 2K7A A; 1QWE A; 4AFQ C; 1NYF A; 2DL4 A; 3EGU A; 2C0T A; 3NHN A; 4AG1 C; 1JO8 A; 5FWC A; 3TSW A; 4CC2 A; 1X2Q A; 2J05 A; 4OMP A; 1W70 A; 2I0N A; 1VYV A; 4F17 A; 2FEI A; 1M8M A; 2F2W A; 2LQN A; 1ABO A; 2CDT A; 4RTU A; 1K4U S; 1UG1 A; 1QWF A; 1RLQ C; 4Z88 A; 1PHT A; 2GTJ A; 2OAW A; 5I11 A; 4OMM A; 3VS7 A; 1JEG A; 4LUD A; 1V1C A; 1GRI A; 2CSQ A; 1K1Z A; 5IHK A; 2KNB B; 4J9E A; 2EYW A; 2RQU A; 4LNP A; 2F2X A; 2D1X A; 2BTT A; 1M27 C; 2H8H A; 1AVZ C; 5IH2 A; 2EKH A; 4RTY A; 1UHC A; 3VS0 A; 2K9G A; 2CT4 A; 2FRW A; 4FSS A; 2M0Y A; 2YUN A; 1E6H A; 4RTW A; 1M3C A; 2NWM A; 2FPE A; 2KEA A; 4ESR A; 1X43 A; 2RN8 A; 4ZNX A; 2FRY A; 3PVL A; 1KJW A; 2CH4 A; 5ECA A; 3H0I A; 2D0N A; 3REB B; 1K76 A; 1U5S A; 1NLO C; 3M0S A; 1S1N A; 1YWP A; 2CRE A; 1VYT A; 2LJ3 A; 1SHF A; 1AZE A; 4JJC A; 1Z9Q A; 2DYB A; 2FPD A; 1NM7 A; 2BZY A; 1Y57 A; 2E5K A; 2JXB A; 3NMZ C; 2LNH B; 4LUE A; 2MIO A; 2L3P A; 3FJ5 A; 2DMO A; 4JZ3 A; 5GJV B; 1M3A A; 5IHN A; 2AK5 A; 2VWF A; 2PNI A; 1HJD A; 1CSK A; 2LJ1 A; 2YUQ A; 4DEX A; 4LE9 A; 2J6F A; 4IIO A; 2DBK A; 1ZUY A; 2RF0 A; 2JMA A; 2DRK A; 1AD5 A; 3I35 A; 1QKW A; 4AFU C; 2KT1 A; 4J9D A; 2KXC A; 1A0N B; 2J06 A; 2FG0 A; 2DF6 A; 1ZUU A; 1T3L A; 1J3T A; 2HSP A; 2DL3 A; 1B3Q A; 1BBZ A; 2V1R A; 1G83 A; 1KIK A; 1ZLM A; 1ZSG A; 1BK2 A; 2EBP A; 1W1F A; 2X3X D; 1X27 A; 2X3W D; 2PTK A; 3CQT A; 3EHR A; 4Z89 A; 2AKK A; 1WA7 A; 2KBT A; 2O2O A; 4D8K A; 4AFS C; 4M4Z A; 3SHW A; 1AWJ A; 2LZ6 B; 2RPN A; 5I22 A; 3H0H A; 2DLP A; 2VKN A; 3R6N A; 2FO0 A; 1NEG A; 2LX7 A; 1CKA A; 1PKS A; 1SRL A; 2JTE A; 2QDL A; 1TUC A; 3EHQ A; 1NG2 A; 4JJD A; 2K3B A; 4IIM A; 1YP5 A; 4J9I A; 4R0K A; 1OOT A; 1XOV A; 2L3S A; 1PNJ A; 1YWO A; 3I9Q A; 4RTT A; 1T3S A; 2JM8 A; 1G2B A; 1WXU A; 1GFD A; 1IO6 A; 2EPD A; 2HEQ A; 2L3Q A; 2DVJ A; 3VS2 A; 1HSQ A; 2AZV A; 1AOJ A; 2CH4 W; 1GCP A; 3C0C A; 4Y92 A; 3H0F A; 4CC3 A; 3TSZ A; 2O31 A; 2KE9 A; 2F2V A; 2SRC A; 2HDA A; 2KRS A; 1GCQ C; 1X6G A; 1YCS B; 4X1V A; 1W6X A; 4OMO A; 2DL7 A; 1B07 A; 2EVR A; 1ZX6 A; 1H8K A; 4RTV A; 1AWW A; 2PZ1 A; 1GCQ A; 2EW3 A; 3THK A; 4OML A; 2JT4 A; 5IXB A; 2KYM A; 1I0C A; 1LCK A; 2ABL A; 4K11 A; 1GBQ A; 1ARK A; 3VS4 A; 1GBR A; 2DRM A; 2AKL A; 3EG3 A; 3TVT A; 1X69 A; 1MUZ A; 2DE0 X; 2L0A A; 1ZBJ A; #chains in the Genus database with same CATH topology 2D8J A; 1UFF A; 3CBP A; 4J9C A; 3M53 A; 2P4R A; 4LXC A; 2GCX A; 1C0M A; 2V8J A; 2QI2 A; 4ORZ A; 1D09 B; 4A63 B; 2LQ8 A; 3EH2 A; 4A4K A; 2FPF A; 2O01 E; 4XTV A; 1VUB A; 2QEX T; 3CCS T; 3OYA A; 3UA6 A; 3PMT A; 3MPU B; 3QKJ A; 3EG1 A; 2JNG A; 2K6D A; 2QK0 A; 3X26 B; 1T0J A; 1PC0 A; 5IHI A; 4PJM A; 1NLP C; 1FYN A; 1VQ8 T; 1WQ7 A; 3ZBD A; 3VU3 C; 1KQS S; 5GAO r; 4KGV B; 2QA4 T; 2CP0 A; 2M9U A; 1YI2 A; 1NJI C; 3CCQ T; 4C8Q A; 2O4X B; 4E7I A; 4M75 C; 2FZG B; 3IQL A; 2WSF E; 3S3O A; 5KYY A; 2DYI A; 2A36 A; 2CSI A; 3ZFJ A; 1VQP Q; 1KK7 A; 5FRN A; 3M55 A; 1N5Z A; 2A28 A; 2LQW A; 2NUZ A; 4IUT A; 2M0O A; 1EZZ B; 2LNV A; 4ME7 A; 4M78 D; 2JW4 A; 2HD0 A; 3OYC A; 3S3M A; 4BDZ A; 2RQT A; 1Q7Y C; 5FU7 C; 4MDX A; 3NTH A; 3VS1 A; 3OY9 A; 3AHU A; 3PFS A; 1D3B B; 4WF2 A; 2LJ0 A; 4XU1 A; 5AYF A; 1W2B P; 4E7S A; 4DBQ A; 2P0P A; 3JB9 D; 2ZPG B; 1JBM A; 5GAO l; 1V76 A; 4PJO F; 1D1C A; 4C0D B; 1OZ3 A; 3LH0 A; 2DEQ A; 3JCM Q; 2DM1 A; 2MAM A; 1U06 A; 1VQ5 T; 2ESW A; 1TU0 B; 4C5G A; 1YJW Q; 3M0P A; 3OMG A; 4LN2 A; 4XTZ A; 3CC7 A; 1AHJ B; 3A8M B; 2M51 A; 5FWB A; 3OYF A; 4BE0 A; 3I55 T; 4JLG A; 1IRX A; 3QWX X; 4ZN1 A; 3TU4 K; 2A0F B; 1HYO A; 2JVV A; 2KR3 A; 2BZ8 A; 1KQ2 A; 1AWO A; 2EWN A; 4HVV A; 1QCF A; 1H3Z A; 2KSS A; 2KYB A; 3FDR A; 3HHT B; 3J80 E; 1O9S A; 2EQJ A; 1NBE B; 3H41 A; 3P8H A; 1PD0 A; 5LL6 S; 4Y91 A; 1UJY A; 3CPW S; 3M0Q A; 1NYG A; 4BY6 B; 5LJ3 e; 3EGX A; 2YSQ A; 1I8F A; 2KAF A; 4KH0 B; 1YJW T; 4JS4 A; 1PWT A; 9ATC B; 1JJ2 P; 1MV0 B; 3VS3 A; 2W0Z A; 4UC4 A; 1M1F A; 1R0C B; 2KGT A; 3DB3 A; 3REA B; 2QTX A; 1WNL A; 2OJ2 A; 1N8R R; 2M1H A; 1E6G A; 3QZ5 B; 4M78 G; 4PJO B; 3VRY A; 4M7D A; 4J9B A; 2OTJ A; 3MP6 A; 3TEE A; 1D0X A; 1WIE A; 2E3H A; 2EYQ A; 4CRI A; 4C92 G; 3BW1 A; 2YWW A; 3RKW A; 2VVK A; 2DA9 A; 2J7I A; 1X2K A; 4BI8 B; 1NJI U; 4II1 A; 2HSE B; 5LJ5 j; 2RI5 A; 3MEW A; 2CP6 A; 4JRK A; 3EGD A; 3X28 B; 1Y96 B; 2CP2 A; 2O88 A; 1UGV A; 2VAS A; 3OW2 A; 4C8Q E; 3RIR A; 2KRM A; 1WHM A; 2CS7 A; 2YRC A; 5GAM d; 4R56 A; 3F70 A; 1H64 1; 1PKT A; 4M78 F; 3OSS C; 1WI7 A; 4RUG A; 5KCH A; 2GQV A; 1OI1 A; 3E9G A; 5GAM f; 2CUB A; 1N9S A; 1YJN Q; 4C92 F; 2GNC A; 1KSW A; 2EGA A; 4C5H A; 3JCM g; 2EJ9 A; 3J7A F; 3A1P A; 4BI3 A; 3FEO A; 3JV3 A; 1YNZ A; 3EAE A; 3G4S Q; 1QVF P; 1BI0 A; 4AFQ C; 1UGQ B; 3NHN A; 1KQS A; 3JB9 F; 3V8J A; 2K4Y A; 5FWC A; 3OYB A; 4CC2 A; 1VQ7 Q; 1X2Q A; 2I0N A; 1VYV A; 3C95 A; 1FX7 A; 3HFN A; 1D0Z A; 4F17 A; 1WHG A; 2QEX A; 5IAY A; 2LC4 A; 4PKC C; 1K4U S; 1UG1 A; 1QWF A; 2DFU A; 2GTJ A; 2OAW A; 5I11 A; 2QTV A; 5GAN g; 5CIU A; 1QW1 A; 1V1C A; 4L5G A; 2CSQ A; 5IHK A; 4M77 E; 2KNB B; 2I2L A; 2VB6 A; 3JCM b; 2RQU A; 2F2X A; 4XU0 A; 2QA4 A; 2D1X A; 3CCQ A; 2AIR B; 1K8A C; 3V7C A; 2ZPH B; 2A7Y A; 3VS0 A; 2DZC A; 2FRW A; 5GAM h; 3G71 Q; 2GFA A; 1SSF A; 3FLG A; 3SWN C; 3M4Y A; 2QYZ A; 1M3C A; 2NWM A; 2FPE A; 2XD0 A; 2E12 A; 1KHC A; 4M78 B; 1JRI A; 1TSF A; 3OYD A; 3CCL T; 4FM4 B; 3REB B; 4C92 B; 1U5S A; 1NLO C; 3M0S A; 2CRE A; 1XQH A; 3CC2 T; 3ME9 A; 1FMV A; 2FPD A; 2P0Q A; 1QP2 A; 1Y57 A; 4DOV A; 2E5K A; 5FLX E; 4LDW A; 2JXB A; 3OA6 A; 1GXI E; 4PLI A; 2LNH B; 8AT1 B; 3FJ5 A; 2CP3 A; 1KD1 R; 3CCJ Q; 3EFS A; 3QPH A; 1M1G A; 2PNI A; 3CCV Q; 2FHD A; 1HJD A; 1VQ5 A; 5GAN 3; 3CPW A; 4M7D E; 2DBK A; 1ZUY A; 4E7J A; 2RI2 A; 2KDS A; 3I35 A; 2X4X A; 2P84 A; 3I55 A; 2DJZ A; 2J06 A; 2FG0 A; 4C8Q C; 2GFU A; 1OZ2 A; 1G3W A; 2V1R A; 1ZSG A; 1W1F A; 1QCN A; 2LT1 A; 2X3X D; 2F1L A; 2FL7 A; 2X3W D; 1RI0 A; 4PNO A; 3EHR A; 1VQL Q; 4J7I A; 3EH1 A; 4MMK A; 2KBT A; 5GMK l; 3SHW A; 1BI1 A; 4KUL A; 2RPN A; 5I22 A; 1YJN T; 5HKC A; 3RES A; 1YJW A; 1ZQ1 A; 2LX7 A; 3KBG A; 1CKA A; 1PKS A; 3G4S T; 1SRL A; 1U8R A; 1ZHI A; 2CZ7 B; 2K3B A; 1VIE A; 2RHX A; 1P92 A; 4QVZ A; 2H3E B; 4OVA A; 2MWO A; 3MP1 A; 1XOV A; 1ZSZ C; 4Y28 E; 3I9Q A; 2BKD N; 3H9N A; 2V26 A; 4M77 C; 2JM8 A; 1IO6 A; 1N6A A; 2DVJ A; 2QG9 B; 3HP9 A; 1G3Y A; 1C1A A; 1OYX A; 3BDU A; 2O4X A; 1N27 A; 2KE9 A; 2SRC A; 4F7U A; 1RAI B; 4ZGJ B; 2HDA A; 2E3I A; 2KRS A; 4E7Z A; 3BDL A; 1K8A U; 1YCS B; 1VOM A; 3HRS A; 1B07 A; 1KD1 U; 2EQM A; 1AWW A; 1TOV A; 2PZ1 A; 3JCM c; 2EW3 A; 2JT4 A; 3J81 E; 1VQP A; 4JJN K; 1LCK A; 3DB4 A; 1GBQ A; 1ARK A; 3VS4 A; 1G5V A; 1TTH B; 2QQS A; 2AKL A; 4J5Y A; 3JSC A; 3TVT A; 1D3B A; 2RHZ A; 1YIJ Q; 3CMA T; 2HZY A; 3A98 A; 4OF1 A; 1F1B B; 3QJ6 A; 3U23 A; 4J9H A; 1VIF A; 2L2P A; 3QSU A; 1K9M R; 4RTZ A; 2QAS A; 1PSE A; 5IXF A; 1TXQ A; 4JZ4 A; 1JB0 E; 3HRU A; 3MEA A; 3LGL A; 1IGQ A; 4M7D C; 3FB9 A; 1RAA B; 1VYU A; 3QBY A; 4OMF B; 5CKB A; 2K79 A; 3SD4 A; 3EG2 A; 4M75 G; 4BE2 A; 1SSH A; 3CCV T; 3JCM d; 2RHY A; 2W10 A; 3CPF A; 2FZK B; 3QDF A; 2KI7 A; 3OYG A; 4RG8 A; 3JCM f; 4LDY A; 1YHQ Q; 4L59 A; 3CCU Q; 4FIB A; 2DPP B; 3I5R A; 1RAC B; 1WQW A; 2EGC A; 4O5V A; 4QT7 A; 4IUU A; 4A54 A; 3QG1 A; 2ZCF B; 2O9V A; 2DTI A; 4PFO A; 4LD6 A; 3VYH B; 2C06 A; 2YUO A; 2GF7 A; 3C4S A; 1VQL T; 4ZTJ A; 3MP8 A; 3GLX A; 2F69 A; 5GAN d; 2DJQ A; 3M58 A; 3Q1J A; 7AT1 B; 2RNA A; 3OS2 A; 3CC2 A; 2QGF B; 1VQ9 T; 1TUD A; 4NOY A; 3LX7 A; 5KH6 A; 1VQO Q; 5CR2 A; 4PJO A; 3O5Z A; 4QQ6 A; 2LCS A; 1SF9 A; 2Z0W A; 2KQW A; 2EFI A; 3L2R A; 3HKS A; 5CKH A; 2YLC A; 2RD1 A; 3V7S A; 5J3B A; 1BKB A; 3TRE A; 2X4W A; 4WCI A; 3JCM h; 5I2S A; 1Y71 A; 2EYX A; 4QW2 A; 1VQ4 Q; 3LGF A; 1UGS B; 2KK4 A; 3MET A; 4F7U F; 2QGG A; 3VRZ A; 1Y96 A; 3OYE A; 4AFZ C; 1R8O B; 5GJW B; 4HCK A; 2Y90 A; 1PCX A; 1UUE A; 5CKD A; 1BIB A; 3SFM A; 2ZPF B; 5FU6 B; 2SEM A; 2V8I A; 3G6E Q; 1I1J A; 1PG5 B; 5GAN h; 3CXC P; 3OYN A; 2HKQ B; 1M1K R; 1SPK A; 1YJN A; 4HCZ A; 2HAX A; 2OAU A; 2E65 A; 5KCO A; 1YIJ T; 3G4S A; 3OW2 S; 1WXB A; 2AZS A; 5KYN A; 4A4E A; 2XDB A; 3UA7 A; 2B86 A; 4KUI A; 4N4H A; 1OPK A; 1OX8 A; 4QKU A; 1VQ7 A; 1Q95 G; 4Z8A A; 2KT8 A; 3EFO B; 1QQJ A; 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