2GPHA

Docking motif interactions in the map kinase erk2
Total Genus 107
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
107
sequence length
345
structure length
345
Chain Sequence
EMVRGQVFDVGPRYTNLSYIGEGAYGMVCSAYDNLNKVRVAIKKISPFEHQTYCQRTLREIKILLRFRHENIIGINDIIRAPTIEQMKDVYIVQDLMETDLYKLLKCQHLSNDHICYFLYQILRGLKYIHSANVLHRDLKPSNLLLNTTCDLKICDFGLARVADPDHDHTGFLTEYVATRWYRAPEIMLNSKGYTKSIDIWSVGCILAEMLSNRPIFPGKHYLDQLNHILGILGSPSQEDLNCIINLKARNYLLSLPHKNKVPWNRLFPNADSKALDLLDKMLTFNPHKRIEVEQALAHPYLEQYYDPSDEPIAEAPFKFDMELDDLPKEKLKELIFEETARFQP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Transferase
molecule keywords Mitogen-activated protein kinase 1
publication title Docking Interactions Induce Exposure of Activation Loop in the MAP Kinase ERK2.
pubmed doi rcsb
source organism Rattus norvegicus
total genus 107
structure length 345
sequence length 345
ec nomenclature ec 2.7.11.24: Mitogen-activated protein kinase.
pdb deposition date 2006-04-17

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 2gphA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 2gphA01
4L3JA 4RG0A 5A6OA 3FLYA 4FEXA 5KZIA 4FNXA 4ENYA 2W1FA 2DUVA 4ZZNA 4O7NA 3C4FA 3HL7A 2VGOA 3GCSA 2UZWE 4FKUA 3ZFYA 4IVBA 3PIZA 4QMWA 3R8LA 4ZJIA 3TV4A 1CMKE 1J91A 2W1EA 4RRVA 2P55A 3KXNA 4YLKA 3DLSA 5AV0A 5LXMA 3ZEWA 2ETRA 3KFAA 3Q4ZA 4LOOA 4TNBA 3LQ3A 4HCTA 2GCDA 3W8LA 1FMKA 2YWPA 4CZYB 3QCQA 1DI8A 3WF6A 1V0PA 5J9LA 1Y8YA 4F9AA 2KTYA 4IM0A 5FP6A 1YQJA 4CCUA 5IQGA 2WGJA 3RINA 3MH0A 4OAVB 4UY9A 4Y72A 5AUYA 2UZLA 4NYEA 2CMWA 3F6XA 4UWCA 5E8SA 5AUUA 3A7FA 4BDDA 1UU7A 3JS2A 5LARA 5DE2A 3I81A 3F7ZA 3LFQA 3G0EA 4GW8A 4L67A 4LRKA 3OROA 5CT7A 4CV9A 2GSFA 5JFXA 3FXWA 3I6WA 4K11A 5AX3A 3VO3A 3S00A 2WU6A 4I6BA 2GNGA 5CEQA 4E3CA 3NYVA 3FQHA 3OOMA 5CXHA 5IISA 4I24A 2UW5A 3FL5A 2GNLA 4E4NA 1OL6A 3V3VA 4EBWA 4UMPA 3VBQA 1KV1A 2IVUA 2PZ5A 4MCVA 4EC8A 2FUMA 3LIJA 4FV4A 4OW8A 4R1YA 4FUXA 5C4KA 1LEWA 1OL2A 1ZMUA 2BZKB 4R5YA 4E20A 5BMSA 3DJ5A 5AP1A 3GC7A 4M0YA 5KKRB 3UPXA 2RG5A 4YUQA 4RJ6A 2BIYA 3L8XA 1F5QA 5DIAA 4AA0A 1PMVA 5FEEA 3SVVA 2PHKA 4DEEA 3LOKA 4FZAB 4KWPA 4TTHB 4C7TA 4U41A 3TTIA 4OTIA 2R3MA 4USFA 5FXSA 1OL1A 4JOAA 4NM7A 4WBOA 2XRUA 2AYPA 4PDYA 4BTKA 4ZY6A 3ACKA 4XP2A 2Z8CA 4R6VA 3VUDA 3HV4A 2WKMA 3QQJA 4K77A 4QO9A 3TN8A 5BVNA 2W17A 2C3JA 4HZSA 5BYZA 2G2IA 4O0YA 3RK7A 4DFYA 3QCYA 2FA2A 3QZIA 1K9AA 4NSTA 4A4OA 3HYHA 1I09A 3FUPA 2I0EA 2JKOA 5AR2A 4KBCA 2X2KA 4QMUA 4MX9A 3ZTXA 2CHLA 2XK9A 2XNPA 3HMNA 4RIOA 3C9WA 1SVEA 3C0HA 3DQWA 4Z7GA 3FLWA 2CGVA 3CQUA 3BQRA 3O50A 1H0VA 4IAKA 2QOHA 3RNIA 2J0IA 4DBXA 3F9NA 1UNGA 2VWYA 2WTKC 3PZEA 3WF5A 5EHOA 3RK5A 4B4LA 3UC3A 3BHVA 5C01A 4ACMA 2YLEA 3E3PA 3PVUA 3W18A 4CFMA 2DWBA 3F5GA 4FKLA 2XCHA 5I3OA 1H1SA 2F49A 2UW3A 2IVTA 1FVRA 5K5XA 3FI8A 2REIA 5A9UA 4RWLA 2WIPA 3CKWA 3FYKX 4LV5A 2RF9A 5HOAA 4QPSA 4IE9A 2JFMA 4JRVA 3TUBA 4P4CA 4F1MA 1SZMA 3KRRA 2E9NA 4FKPA 1M52A 5ACKA 5BYLA 2UVYA 5CAUA 4J53A 4EH5A 1P4OA 1VR2A 5ANGA 2A27A 4HCUA 5EW3A 3NUNA 5CWZA 2YDKA 4XV2A 3R7EA 3S0OA 3MI9A 4O0VA 5IQDA 4JR7A 2YAAA 3PIXA 5EOBA 4UX9A 4XBUA 4O7LA 4MXCA 3ZC5A 2ZB0A 2P3GX 3LXKA 3TWJA 3TI1A 2ITUA 4J97A 4EEVA 3DU8A 1JSVA 2UUEA 4AW0A 4DFBA 4JG6A 4QMQA 4CG9A 4BZDA 5FTOA 4CGAA 3GT8A 2BRGA 4RC2A 3S95A 2O65A 2BKZA 2VTJA 2G2HA 3PRIA 4GSBA 1YW2A 3GU5A 3M2WA 3ZSIA 4EOMA 5KUPA 3R8PA 1XH6A 5D7VA 4BDFA 4ZTLA 2OK1A 4PTCA 3H10A 1W84A 3PTGA 4M12A 1ZOGA 2WMVA 5EM7A 4NU1A 2IPXA 4JDKA 2UV2A 3OOGA 4KBKA 5DRBA 3TM0A 4ZSAA 3DBEA 4F7LA 2WZJA 3CQEA 3HUCA 3R71A 2JDRA 3D94A 2UW7A 3VS3A 3HRBA 1XH5A 3BYVA 1CSNA 2VO3A 2H6DA 2R3RA 2XJ2A 4HVGA 5CI6A 3SG8A 5C26A 2WOUA 3BE9A 2BHHA 4MBJA 2A19B 1BI7A 3SX9A 4LUEA 3E88A 3CTHA 1H08A 4W4VA 4FKWA 4FEUA 3SGCA 4GFOA 4D1XA 2P0CA 2XIZA 2LGCA 2X6DA 3OWPA 4FVQA 5DR6A 2XJ0A 5AIKA 2YLFA 4DHFA 4FODA 4WNPA 4BYIA 5E1SA 3O8TA 3Q2JA 4KIOA 1F0QA 5CAOA 5J1WA 3OCTA 3LW0A 2PTKA 4O7YA 4FSZA 4GK4A 2VTRA 3QHWA 3ZUVA 3IDCA 3RZFA 3S2PA 4O91A 3SW7A 1U46A 2XS0A 5M44A 4TY1A 1OKZA 2ITYA 2PY3A 3F3UA 3VHKA 4E73A 3CY2A 3M11A 5D12A 3PSCA 2XKEA 3KREA 5AAFA 4NK9A 5CVHA 1FQ1B 1YI6A 2ITVA 2YIYA 4IVCA 5CSWA 3SXRA 3AGMA 4LGHA 3EQFA 4B8LA 3W2RA 3AC2A 3KMUA 4PDSA 4UWYA 2Q0BA 5LCJA 4LQMA 5KMKA 5B2MA 4AGCA 4D2RA 2UZVA 5HBEA 5M09A 3R1YA 3BWFA 4F7NA 5HORA 1ZYLA 2QLQA 2ACXA 4H39A 3WI6A 5HCYA 2VWZA 4MWIA 1UKIA 4IM3A 5LVNA 5HIDA 3CPBA 4F6UA 5AUXA 3DB6A 4GFGA 4E6QA 2GPHA 4MXXA 3MPTA 5K0KA 5ITAA 2XBAA 2C3LA 4ZS0A 5JT2A 3O23A 5M4FA 1ZYSA 2B4SB 4TNDA 3DT1A 3IS5A 1ZWSA 4L8MA 5LQFA 4KIKB 3NUYA 5AP5A 5DFPA 5H2UA 4CMTA 3F2RA 5A3XA 4HVSA 4FEVA 3KQ7A 3QD4A 4ALWA 4ACHA 4BIDA 2WTJA 2XK4A 2OIBA 3QBNA 4FZ7A 3ZOSA 4GMYA 3D5XA 3F88A 3R7VA 1W82A 4BCFA 4FV5A 3PIYA 3BLHA 1IEPA 4AW2A 1ZRZA 5CYIA 3GI3A 2VWIA 3P0MA 3V6RA 4FTLA 4PMSA 4AT4A 1H07A 4C34A 2W96B 3QTZA 2XM9A 4MBLA 4CFFA 2PUIA 2O2UA 5FTGA 4R5SA 4D1SA 3EZVA 4UXLA 5ETCA 4FNWA 5CNNA 3QTUA 4ONAA 1TKIA 2BZHB 3KGAA 2IZTA 1XWSA 4RJ3A 4XOZA 5AR8A 2HIWA 4AZVA 3R9OA 5IA5A 4AAAA 4FG7A 3FHRA 3G51A 4HGTA 4J99A 4YMJA 4U80A 4AW5A 4USDA 5CU6A 5E4HA 2BAJA 1DAYA 3COIA 3PSBA 3HAMA 3ZBFA 3PLSA 1H24A 2DYLA 3BELA 1J7IA 4DAWA 4AACA 4FTOA 4O2ZA 4O81A 3G15A 4FVPA 2YITA 2I0YA 2JKKA 5ANJA 5CF6A 4EOIA 4TW9A 5IA4A 5KZ0A 4RLKA 1PXOA 2W4JA 3U51A 2VTMA 4C3RA 1QPDA 4C57A 5JN2A 4R77A 5JFVA 4AP7A 2UZDA 3JVRA 4MTAA 3PA3A 3ZSHA 4RC3A 4G34A 2XM8A 3OY1A 3B8QA 4WG5A 5IF1A 4YTHA 4DTBA 2P33A 4I94A 2WELA 4B9DA 3VS5A 3P1AA 1HCKA 5FGKA 4BDGA 1E9HA 3PP1A 1OIQA 3RPOA 1STCE 4MEDA 3I6UA 4PQNA 4AOIA 5M4UA 4A07A 4B7TA 3I0QA 2XBJA 3OZ6A 4YHFA 5JRSA 3BHHA 5A4TA 5HBJA 2CKPA 2QOBA 2X9FA 4TYJA 5TOZA 3ORIA 5FUTA 2ZV8A 4N4SA 4RWJA 2RFDA 4DH8A 5HNBA 5D7AA 3VUGA 4EORA 1WVYA 2JBOA 4O96A 1H1WA 2QQ7A 4TZRA 4M69A 1PMUA 4RX8A 4U42A 1KOBA 3E93A 5GNKA 5I9ZA 3P08A 2PYWA 3NR9A 5JKGA 3AMAA 4AA4A 4FZ6A 4X0MA 2XKCA 3R7UA 4CNHA 4XCUA 4BCNA 4ZAUA 2P2HA 3PJCA 3MPMA 2ZJWA 2RFSA 4D4YA 4O1OA 4TKSA 3RPRA 4BICA 5CALA 5CI7A 3RALA 1VEBA 2VO7A 2WQOA 3VS7A 5HCXA 4I93A 3W33A 4D4SA 2CN5A 4NW5A 2A1AB 4PRJA 5I9WA 4I23A 4AZFA 3EIDA 3VS4A 2B53A 5HG7A 1J7LA 1R3CA 4ERKA 2Z7LA 3HZTA 2XK6A 4GIHA 1KE8A 3N9XA 4E4XA 5HIEA 2RFEA 2ITXA 4LOPA 2CGWA 1SVGA 2CLQA 5LCKA 3U6HA 2HW6A 1O6YA 2VTAA 3PVGA 4O0TA 4RQKA 5DNRA 4ID7A 5L6WL 3TL8A 3L9PA 3OVVA 4ZZMA 2UVXA 5DBXA 3ULZA 4L7SA 3MA3A 3ORPA 4NH1A 4G9CA 3MV5A 2OBJA 3TNQB 2GNIA 3RM6A 4FL1A 4USEA 4DT8A 2ERKA 4Z7HA 1UA2A 2XP2A 2OSCA 5E8UA 5IZFA 1AD5A 4NEUA 4BR3A 1H26A 3L9LA 1XH4A 4FI1A 5A14A 2JDOA 3PDTA 3NW7A 3OW3A 3HA8A 4UBAA 5CNOA 3R1NA 3R8VA 3SOAA 2QVSE 1UU9A 5D11A 4ZSGA 4EKKA 5CASA 3E7OA 1RE8A 1M17A 3QUEA 4I20A 4IVAA 3OWJA 4IACA 2WFYA 3MTFA 2YDJA 4I4FA 1FINA 3R0TA 3I60A 4RJ8A 1OKYA 4UWBA 4O7ZA 4L53A 3GCVA 3CCNA 2G2FA 5M51A 2I40A 3M1SA 2X0GA 1OB3A 3C4ZA 3Q4TA 5AP2A 2ITNA 5FBOA 4WOVA 4RVKA 3L9NA 5L8LA 4CRSA 2E9UA 2FVDA 2WEVA 4L43A 1PXPA 2VGPA 5I9UA 2R2PA 5EQPA 1UKHA 4YSMA 4IX6A 3W16A 5HESA 4FTJA 2UZUE 3MYGA 3UIMA 3U54A 1XH8A 1MUOA 3HLLA 4I0SA 4NM5A 4FEWA 3FY0A 5CQUA 2PZPA 3PWDA 4Z9LA 2CNQA 2Y6MA 2X9EA 3P78A 1Y91A 2PUUA 5D9HA 5DLSA 4CFXA 3FZRA 5EYCA 4M69B 4XEYA 2C6IA 3UVRA 4CT2A 3SC1A 3OCSA 5J5TA 4IX3A 3Q6WA 5IA3A 2WTKB 2PL0A 1P14A 3GFEA 4IAFA 4Q9SA 5K4JA 3R8UA 3ZM9A 2PZRA 3D2KA 3OEFX 4ZP5A 1BMKA 3NDMA 4UB7A 3SV0A 3TTJA 3LCSA 2PVLA 3T3VA 2XVDA 4FSMA 4XV9A 5I3RA 3FI2A 2G15A 3F7WA 4E4MA 3O8PA 4CKIA 1KOAA 3WZUA 4AG8A 2HELA 5HX8A 5I4NA 2ZOQA 4BVUA 4IAIA 3O7LD 4FTRA 4W4YA 4DLJA 1RQQA 3FC2A 4G3CA 2XKDA 5AP0A 5HD7A 5CAPA 4RA4A 4O2PA 4JNWA 5J79A 3HGKA 2UW9A 4IBMA 5EYDA 5M53A 3O8UA 3LQ8A 2GNFA 4AGUA 3F5PA 4FG8A 5AP6A 4JG7A 1UNHA 3ENHA 4YBJA 5E8WA 3S4QA 2BILB 3PA4A 4HYSA 4MXAA 3LAUA 3C7QA 3ET7A 3RPSA 4EH7A 2VWWA 1OVEA 3BWJA 4C35A 4GKHA 3FLSA 4ZSLA 3FV8A 3D7TA 5DN3A 1JKTA 3QA8A 5JSMA 5IA2A 2JIIA 2RSVA 3LCDA 4RFMA 3CTJA 4C33A 3PJ8A 4C0TA 3QAME 5BYYA 3OXZA 4NW6A 2PVHA 3E92A 1LP4A 3NEWA 4W8DA 1JSTA 1WVWA 4M15A 2IW9A 3DXQA 4RFZA 4AOTA 2A4LA 5CZIA 3ZUUA 3KMWA 1U59A 4BL1A 3CD3A 4YNOA 5J8IA 4OTWA 4S31A 2BFXA 2VD5A 2DQ7X 4BKYA 1SNXA 5AV4A 4DEBA 1JVPP 4GUEA 5HICA 3BHYA 5CZHA 5DGZA 3DKGA 4K1BA 4WRGA 3DXPA 3FQSA 1H27A 3EZRA 3IGGA 4ASXA 5AAGA 1M7NA 3OBJA 2PULA 4P2KA 4DINA 5IEVA 2UZBA 4G31A 4D0WA 1OKWA 2X1NA 4JLCA 3P23A 5AMNA 4RVMA 3HEGA 4YJTA 5H9BA 4FV3A 1OL5A 2VWVA 3NNUA 2Y4PA 3BYUA 4X3FC 5GHVA 2OXDA 2OZOA 3QGYA 3OUKA 1JAMA 4IADA 4TWOA 5AUVA 4RPVA 3RM7A 2W4KA 3OT8A 4V04A 4O0XA 4XOYA 5BUIA 1VZOA 4UV0A 4LRJA 3UODA 3ZUTA 3MA6A 1S9IA 4IWOA 3TKUA 2PVRA 5GIOE 3LMGA 5CX9A 4ZMFA 2YCFA 2R4BA 3UYTA 4EK6A 3FQEA 1ZYCA 4DEHA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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