2GRCA

1.5 a structure of bromodomain from human brg1 protein, a central atpase of swi/snf remodeling complex
Total Genus 47
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
47
sequence length
121
structure length
121
Chain Sequence
EKLSPNPPNLTKKMKKIVDAVIKYKDSSSGRQLSEVFIQLPSRKELPEYYELIRKPVDFKKIKERIRNHKYRSLNDLEKDVMLLCQNAQTFNLEGSLIYEDSIVLQSVFTSVRQKIEKEDD
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule tags Hydrolase
molecule keywords Probable global transcription activator SNF2L4
publication title Structural ramification for acetyl-lysine recognition by the bromodomain of human BRG1 protein, a central ATPase of the SWI/SNF remodeling complex.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 47
structure length 121
sequence length 121
ec nomenclature ec 3.6.1.-:
pdb deposition date 2006-04-24

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00439 Bromodomain Bromodomain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.920.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Histone Acetyltransferase; Chain A Bromodomain-like 2grcA00
4LRGA 3JVKA 5CRMA 5KHMA 3O34A 5F1HA 5IIDA 4O77A 5FE1A 3MULA 5LKXA 5L99A 5TB6A 4MEOA 5E73A 3O35A 1X0JA 4A9MA 4HXSA 4A9KA 3U5JA 5EM3A 4UIVA 4YYGA 3S92A 5KTUA 4TQNA 5FB1A 4CUTA 4O7BA 4WHWA 4UYGA 4DONA 4F3IA 4X2IA 2OUOA 5G4RA 5I29A 5L8UA 5E3GA 2WP1A 4NR4A 4A9OA 3U5NA 5IG6A 5IGNA 5C7NA 4YADA 4UYHA 5EU1A 4MR5A 4MR6A 4IOQA 3IU6A 4N4IA 5EWDA 5ACYA 3JVLA 2R0SA 2D9EA 2DWWA 4YYJA 4NRCA 4HXNA 4Q0OA 5HM0A 4MR4A 5CUAA 4HBYA 4OGJA 4CUSA 5IGLA 4QSSA 4O70A 4A9EA 4Z1QA 5C89A 2YELA 4TZ2A 5FE6A 5BT4A 3MB4A 4HXRA 5HCLA 1WUGA 5II2A 4NR8A 4TT2A 5LKTA 5HRWA 4ALGA 5EQ1A 4HXMA 3HMEA 4CUPA 5D3RA 5D3NA 5AD2A 2G4AA 5E9KA 4YY4A 4O74A 3P5OA 5FH8A 4XYAA 2RNYA 4C67A 4N4FA 5CQTA 3Q2EA 2E7OA 3U5OA 5FG4A 3K2JA 2YW5A 4QSUA 4UIYA 5KTWA 4NR5A 2H60A 5CPEA 4TZ8A 5E9MA 2L5EA 4QSTA 4Z6IA 2LSPB 4AKNA 4HXKA 5KTXA 4UIUA 4FLPA 5I88A 4LDFA 4O7EA 4CURA 5LJ1A 3P1EA 5A5NA 5C87A 1EQFA 5FE5A 5D3SA 5E9VA 3LJWA 2GRCA 4QZSA 4HXLA 4NRBA 4NR9A 4MEPA 4QC1A 4QSXA 5I40A 5DW1A 4NQMA 4C66A 2YQDA 5DKCA 5A5SA 4J1PA 4BW3A 5EWCA 5CQ7A 4O71A 4UYDA 5FBXA 2F6JA 2OO1A 3UVWA 2DVVA 4Y03A 4YY6A 4CUQA 4HBXA 4NYXA 4J0RA 5DLXA 5HQ7A 2F6NA 2DKWA 1F68A 5DYAA 5EPBA 5BT3A 4A9LA 4QSWA 3TLPA 4UIWA 4Z1SA 5LJ0A 3ZYUA 4IR6A 3UW9A 4IOOA 5AD3A 5COIA 2DVRA 4LZRA 4TT6A 4O7CA 5ETBA 3IU5A 4BW1A 5A5QA 5FE4A 4TYLA 3LQIA 4IR5A 4PCEA 3G0JA 3HMFA 5CUCA 5E0RA 3Q2FA 3QZVA 5EP7A 2WP2A 5CY9A 5A81A 2OSSA 5CUBA 2L84A 5EI4A 2DVQA 4NQNA 5FG5A 5KO4A 5EPSA 4NYVA 3LQHA 5D7XA 4NYWA 3U5KA 4CL9A 4LYSA 4IR4A 4TTEA 4YYHA 5FH6A 5CQ8A 4YYNA 5CRZA 5D26A 4OUFA 4XUAA 5L98A 4NR7A 4QEWA 5IGKA 5ENJA 4BHWA 5D3LA 5EWHA 5HELA 5LKZA 5L96A 4XY9A 2I8NA 2RNWA 5A5PA 5FE2A 3S91A 5DFBA 5FFVA 5FDZA 5CFWA 5I86A 3LQJA 5G4SA 3U5MA 5HRVA 5FFYA 5C4QA 5DFDA 3MUKA 4NR6A 4O76A 5HJCA 5EWWA 5EK9A 5CQAA 5DBMA 3O36A 5J0DA 5IBNA 4J0SA 4LC2A 4TT4A 4CFLA 3MXFA 5CUGA 5ENHA 4HXPA 5ENEA 2DVSA 4IR3A 3JVJA 2KTBB 4ZC9A 5HENA 5FE7A 4BW4A 4YABA 4O7AA 3AQAA 5A83A 5CUDA 2R0VA 4QR3A 5EISA 4YYMA 5HQ6A 5L8TA 3AADA 4XY8A 5DY7A 2I7KA 5FE9A 5DX4A 4XUBA 4YH3A 5A5RA 5I7YA 5D3PA 4HXOA 5CUEA 4UYEA 5H1TA 4QBMA 5CQ4A 5F3AA 3P1DA 3UVXA 3O37A 4O78A 4BW2A 2DATA 4LZ2A 3RCWA 4TU4A 2R10A 5DW2A 2N9GA 4QNSA 5EWVA 4YC9A 4NXJA 4QUTA 5I7XA 4A9NA 5A85A 5DYCA 5E7DA 3UVYA 5CZGA 3D7CA 4UITA 5C85A 5JI8A 4QSRA 4NRAA 3UV4A 5EVAA 4N4HA 4ZW1A 5D0CA 4QSPA 3P1CA 5FFWA 4E96A 4O72A 5JWMA 4GPJA 4KCXA 2RO1A 3I3JA 3FKMX 1JSPB 5LVRA 3UV2A 5DLZA 5FE8A 2D82A 4ALHA 4LYWA 4MEQA 4YAXA 5F60A 4Q0NA 4Z6HA 4A9IA 4O7FA 5ETDA 4CLBA 2E3KA 3SVFA 5D3HA 5EICA 5BT5A 4TS8A 5H85A 4UYFA 4A9HA 5F1LA 2RS9B 4YATA 3U5LA 3JVMA 5ENCA 3O33A 4NUEA 3ONIA 5LJ2A 2L85A 2YEMA 4N3WA 5HFRA 4QSVA 3SVGA 4IORA 1ZS5A 4MR3A 5A82A 5I1QA 5EGUA 4HBVA 4YH4A 4WHUA 5E9IA 4YBTA 5DKHA 5ENBA 3MB3A 4TU6A 2MJVB 5FB0A 5C8GA 4NUCA 4ZQLA 5AMEA 4NUDA 5H1VA 4PKLA 2R0YA 5HLSA 5K29A 3GG3A 5D25A 2RNXA 5F25A 5HFQA 4Z93A 5DFCA 5CTLA 5HEMA 4YYDA 4QSQA 5ENIA 2FSAA 4QB3A 5I89A 5CP5A 5IGMA 4QUUA 1JM4B 5FE3A 4CUUA 3DWYA 5CQ5A 5A7CA 4YYKA 3QZTA 5CQ3A 1N72A 4RVRA 4QEUA 5FG6A 4NS5A 5ENGA 5EV9A 4WIVA 5II1A 5A5OA 5CS8A 5F5ZA 4HBWA 2RFJA 3U5PA 5DKDA 5D24A 2YDWA 4QR4A 4UIZA 4YBMA 4QY4A 5CQ6A 3P1FA 5LKUA 4PCIA 4PS5A 4O75A 3LXJA 3MQMA 5AMFA 1WUMA 4N4GA 3UVDA 4LYIA 5I83A 3G0LA 4QC3A 4PTBA 4BJXA 4LZSA 5ENFA 5F36A 5F62A 5HRXA 5FH7A 4YYIA 5E74A 4UYFB 3NXBA 4KV4A 2YEKA 5EPRA 3UV5A 4A9FA 4KV1A 2YYNA 4OGIA 5TCMA 2RI7A 5KU3A 4YBSA 5F2PA 5F61A 4A9JA 5I80A 4QEVA 5EA1A 5DYXA 4QYLA 5D3TA 5H1UA 5D3JA 3QZSA 5FE0A 5LUUA 3HMHA 5HQ5A 5E3DA 5DYUA 4YK0A 5F63A 4UIXA 5E9LA 4MENA 4CFKA 4J3IA 2NXBA 5CGPA 3DAIA 4PY6A 5L97A 5E9YA 4QR5A 4QYDA 5CU8A 5LVQA 2E7NA 3SVHA 4LR6A 1E6IA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4LRGA 3JVKA 5CRMA 5KHMA 3O34A 5F1HA 5IIDA 4O77A 5FE1A 3MULA 5LKXA 5L99A 5TB6A 4MEOA 5E73A 3O35A 1X0JA 4A9MA 4HXSA 4A9KA 3U5JA 5EM3A 4UIVA 4YYGA 3S92A 5KTUA 4TQNA 5FB1A 4CUTA 4O7BA 4WHWA 4UYGA 4DONA 4F3IA 4X2IA 2OUOA 5G4RA 5I29A 5L8UA 5E3GA 2WP1A 4NR4A 4A9OA 3U5NA 5IG6A 5IGNA 5C7NA 4YADA 4UYHA 5EU1A 4MR5A 4MR6A 4IOQA 3IU6A 4N4IA 5EWDA 5ACYA 3JVLA 2R0SA 2D9EA 2DWWA 4YYJA 4NRCA 4HXNA 4Q0OA 5HM0A 4MR4A 5CUAA 4HBYA 4OGJA 4CUSA 5IGLA 4QSSA 4O70A 4A9EA 4Z1QA 5C89A 2YELA 4TZ2A 5FE6A 5BT4A 3MB4A 4HXRA 5HCLA 1WUGA 5II2A 4NR8A 4TT2A 5LKTA 5HRWA 4ALGA 5EQ1A 4HXMA 3HMEA 4CUPA 5D3RA 5D3NA 5AD2A 2G4AA 5E9KA 4YY4A 4O74A 3P5OA 5FH8A 4XYAA 2RNYA 4C67A 4N4FA 5CQTA 3Q2EA 2E7OA 3U5OA 5FG4A 3K2JA 2YW5A 4QSUA 4UIYA 5KTWA 4NR5A 2H60A 5CPEA 4TZ8A 5E9MA 2L5EA 4QSTA 4Z6IA 2LSPB 4AKNA 4HXKA 5KTXA 4UIUA 4FLPA 5I88A 4LDFA 4O7EA 4CURA 5LJ1A 3P1EA 5A5NA 5C87A 1EQFA 5FE5A 5D3SA 5E9VA 3LJWA 2GRCA 4QZSA 4HXLA 4NRBA 4NR9A 4MEPA 4QC1A 4QSXA 5I40A 5DW1A 4NQMA 4C66A 2YQDA 5DKCA 5A5SA 4J1PA 4BW3A 5EWCA 5CQ7A 4O71A 4UYDA 3ERRA 3VKHA 5FBXA 2F6JA 2OO1A 3UVWA 2DVVA 4Y03A 4YY6A 4CUQA 4HBXA 4NYXA 4J0RA 5DLXA 5HQ7A 2F6NA 2DKWA 1F68A 5DYAA 1ZKRA 5EPBA 5BT3A 4A9LA 4QSWA 3TLPA 4UIWA 4Z1SA 5LJ0A 3ZYUA 4IR6A 3UW9A 4IOOA 5AD3A 5COIA 2DVRA 4LZRA 4TT6A 4O7CA 5ETBA 3IU5A 4BW1A 5A5QA 5FE4A 4TYLA 3LQIA 4IR5A 4PCEA 3G0JA 3HMFA 5CUCA 5E0RA 3Q2FA 3QZVA 5EP7A 2WP2A 5CY9A 5A81A 2OSSA 5CUBA 2L84A 5EI4A 2DVQA 4NQNA 5FG5A 5KO4A 5EPSA 4NYVA 3LQHA 5D7XA 4NYWA 3U5KA 4CL9A 4LYSA 4IR4A 4TTEA 4YYHA 5FH6A 5CQ8A 4YYNA 5CRZA 5D26A 4OUFA 4XUAA 5L98A 4NR7A 4QEWA 5IGKA 5ENJA 4BHWA 5D3LA 5EWHA 5HELA 5LKZA 5L96A 4XY9A 2I8NA 2RNWA 5A5PA 5FE2A 3D1BA 3S91A 5DFBA 5FFVA 5FDZA 5CFWA 5I86A 3LQJA 5G4SA 4AI6A 3U5MA 5HRVA 5FFYA 5C4QA 5DFDA 3MUKA 4NR6A 4O76A 5HJCA 5EWWA 5EK9A 5CQAA 5DBMA 3O36A 5J0DA 5IBNA 4J0SA 4LC2A 4TT4A 4CFLA 3MXFA 5CUGA 5ENHA 4HXPA 3D1DA 5ENEA 2DVSA 4IR3A 3JVJA 2KTBB 4ZC9A 5HENA 5FE7A 2EJNA 4BW4A 4YABA 4O7AA 3AQAA 5A83A 5CUDA 2R0VA 4QR3A 5EISA 4YYMA 5HQ6A 5L8TA 3AADA 4XY8A 5DY7A 2I7KA 5FE9A 5DX4A 4XUBA 4YH3A 5A5RA 5I7YA 5D3PA 4HXOA 5CUEA 4UYEA 5H1TA 4QBMA 5CQ4A 5F3AA 3P1DA 3UVXA 3O37A 4O78A 4BW2A 2DATA 4LZ2A 3RCWA 4TU4A 2R10A 5DW2A 2N9GA 4QNSA 5EWVA 4YC9A 4NXJA 4QUTA 5I7XA 4A9NA 5A85A 5DYCA 5E7DA 3UVYA 5CZGA 3D7CA 4UITA 5C85A 5JI8A 4QSRA 4NRAA 3UV4A 5EVAA 4N4HA 4ZW1A 5D0CA 4QSPA 3P1CA 5FFWA 4E96A 4O72A 5JWMA 4GPJA 4KCXA 2RO1A 3I3JA 3FKMX 1JSPB 5LVRA 3UV2A 5DLZA 3VKGA 5FE8A 2D82A 4ALHA 4LYWA 4MEQA 4YAXA 5F60A 4Q0NA 4Z6HA 4A9IA 4O7FA 5ETDA 4CLBA 2E3KA 3SVFA 5D3HA 5EICA 5BT5A 4TS8A 5H85A 4UYFA 4A9HA 5F1LA 2RS9B 4YATA 3U5LA 3JVMA 5ENCA 3O33A 4NUEA 3ONIA 5LJ2A 2L85A 2YEMA 4N3WA 5HFRA 4QSVA 3SVGA 4IORA 1ZS5A 4MR3A 5A82A 5I1QA 5EGUA 4HBVA 4YH4A 4WHUA 5E9IA 4YBTA 5DKHA 5ENBA 3MB3A 4TU6A 2MJVB 5FB0A 5C8GA 4NUCA 4ZQLA 5AMEA 4NUDA 5H1VA 4PKLA 2R0YA 5HLSA 5K29A 3GG3A 5D25A 2RNXA 5F25A 5HFQA 4Z93A 5DFCA 5CTLA 5HEMA 4YYDA 1PUOA 4QSQA 5ENIA 2FSAA 4QB3A 5I89A 5CP5A 5IGMA 4QUUA 1JM4B 5FE3A 4CUUA 3DWYA 5CQ5A 5A7CA 4YYKA 3QZTA 5CQ3A 1N72A 4RVRA 4QEUA 5FG6A 4NS5A 5ENGA 5EV9A 4WIVA 5II1A 5A5OA 5CS8A 5F5ZA 4HBWA 4AKIA 2RFJA 3U5PA 5DKDA 5D24A 2YDWA 4QR4A 4UIZA 4YBMA 4QY4A 5CQ6A 3P1FA 5LKUA 4PCIA 4PS5A 4O75A 3LXJA 3MQMA 5AMFA 1WUMA 4N4GA 3UVDA 4LYIA 5I83A 3G0LA 4QC3A 4PTBA 4BJXA 4LZSA 5ENFA 5F36A 5F62A 5HRXA 5FH7A 4YYIA 5E74A 4UYFB 3NXBA 4KV4A 2YEKA 5EPRA 3UV5A 4A9FA 4KV1A 2YYNA 4OGIA 5TCMA 2RI7A 5KU3A 4YBSA 5F2PA 5F61A 4A9JA 5I80A 4QEVA 5EA1A 5DYXA 4QYLA 5D3TA 5H1UA 5D3JA 3QZSA 5FE0A 5LUUA 4AKGA 3HMHA 4AKHA 5HQ5A 5E3DA 5DYUA 4YK0A 5F63A 4UIXA 5E9LA 4MENA 4CFKA 4J3IA 2NXBA 5CGPA 3DAIA 4PY6A 5L97A 5E9YA 4QR5A 4QYDA 5CU8A 5LVQA 2E7NA 3SVHA 4LR6A 1E6IA
chains in the Genus database with same CATH topology
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