2GVGA

Crystal structure of human nmprtase and its complex with nmn
Total Genus 157
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
157
sequence length
476
structure length
461
Chain Sequence
FNILLATDSYKVTHYKQYPPNTSKVYSYFECREYEETVFYGLQYILNKYLKGKVVTKEKIQEAKDVYKEHFQDDVFNEKGWNYILEKYDGHLPIEIKAVPEGFVIPRGNVLFTVENTDPECYWLTNWIETILVQSWYPITVATNSREQKKILAKYLLETSGNLDGLEYKLHDFGYRGVSSQETAGIGASAHLVNFKGTDTVAGLALIKKYYGTKDPVPGYSVPAAEHSTITAWGKDHEKDAFEHIVTQFSSVPVSVVSDSYDIYNACEKIWGEDLRHLIVSRSTQAPLIIRPDSGNPLDTVLKVLEILGKKFPVTKGYKLLPPYLRVIQGDGVDINTLQEIVEGMKQKMWSIENIAFGSGGGLLQKLTRDLLNCSFKCSYVVTNGLGINVFKDPVADPNKRSKKGRLSLHRTPAGNFVTLEEGKGDLEEYGQDLLHTVFKNGKVTKSYSFDEIRKNAQLNI
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Transferase
molecule keywords Nicotinamide phosphoribosyltransferase
publication title Molecular basis for the inhibition of human NMPRTase, a novel target for anticancer agents.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 157
structure length 461
sequence length 476
chains with identical sequence B, C, D, E, F
ec nomenclature ec 2.4.2.12: Nicotinamide phosphoribosyltransferase.
pdb deposition date 2006-05-02

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF04095 NAPRTase Nicotinate phosphoribosyltransferase (NAPRTase) family
A PF18127 DUF5598 Domain of unknown function (DUF5598)
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 2gvgA02
2Q8ZA 3W3OA 1GPWA 4UTLA 3RU6A 4UMBA 3FS2A 1EP3A 4HIBA 3WFAA 3F1QA 1OJXA 3QMTA 3B0UX 2A5HA 3C2FA 1JUBA 3ABRA 1TMHA 2QAPA 1AL7A 2AQWA 3A5VA 3NL6A 3W7OA 3LCIA 1OFBA 1DBTA 3OVQA 2X30A 2CLLA 3CWNA 1DV7A 3W2KA 4WXYA 5ABTA 3B8DA 2X1RA 3QEZA 4LVBA 2TMDA 4BK9A 3SECA 3U6WA 3YPIA 1GQNA 5CPOA 1I2PA 5GVJA 1TTPA 1TREA 1JULA 5F1UA 3HPZA 3BLFA 2H3BA 2CWNA 2OJPA 3CC1A 3W22A 5G1TA 4ORMA 3GNNA 1NFBA 4M5PA 3WJWA 3TFXA 4QISA 3HGJA 1ML1A 3TROA 1X1ZA 4PH6A 5KITA 4GFSA 2GQAA 3LTYA 3LXBA 3DI1A 5FF2A 3TR2A 4MKNA 4UIOA 4M19A 5J5RA 1OX4A 3MI2A 4Q4KA 4DO6A 1QR7A 1YPIA 3IGXA 2C16A 2W79A 1GG0A 1LROA 1Y0EA 4MY1A 3PAJA 2Y62A 4RV8A 3T55A 4UTKA 4R33A 3W1RA 3R13A 3FKKA 2WQPA 1A5CA 2OX1A 4QQ3A 3W6YA 1W0MA 3DXIA 1KM3A 2ATMA 5EYWA 4UTMA 3B04A 1W5PA 2CW6A 2NV1A 4UFHA 5DXXA 1QPQA 3RF9A 4LS1A 2V0TA 2VXNA 3W7GA 4N2YA 8TIMA 1WQ5A 1FDYA 2WV8A 3W7HA 1I2QA 1HL2A 2VOMA 2G96A 5DY3A 3W7IA 2O7QA 2Z6JA 5AFDA 1VH7A 5G4WA 3W74A 4MIMA 3IGSA 1I2NA 1I8JA 2J9YA 2R94A 2DP3A 1VYPX 3PF3A 4IXXA 3SZ8A 2Y6ZA 4L4LA 2GJLA 1AW2A 3DBPA 4AHOA 3HO8A 4Z1CA 3P61A 1C8VA 3C61A 3GDTA 4I7UA 3L66A 5G2HA 1VYRA 3S5ZA 3C56A 3LHVA 1PHQA 3G22A 4LT9A 1O5XA 4GC4A 3W7MA 1TJRA 3Q37A 5AHIA 4NZFA 3NR0A 4HNUA 1SO6A 3KHJA 5I3HA 2QCEA 4MY9A 4FX8A 4XUGA 3UY8A 4AWUA 4UR8A 4ZQCA 4N4QA 3DENA 4GJ1A 3DKLA 4JIQA 4UTTC 2ZFAA 2A2IA 3INPA 3G1FA 3NG3A 1X8FA 4LVFA 3S1UA 2Y70A 4IGHA 4UFLA 3N19B 5CGQA 3GKAA 1R2RA 3BO9A 2NX1A 4HHPA 3Q58A 2E77A 4ZQNA 5T26A 4NJHA 4O53A 3LI0A 1FCUA 1EX5A 2A4AA 4AAJA 2WNQA 3D0CA 2H6RA 3GX9A 4JYEA 1MXSA 5A5WA 4DEFA 3LRMA 3L9CA 3QJAA 4UTHA 2NUWA 1AK5A 1TQXA 1ZY9A 2O7SA 3W07A 3W7NA 5CSRA 3BG9A 3GXTA 5CZJA 3PULA 1QMLA 3LCXA 1SO4A 2JGYA 5FF7A 3ABOA 4DF1A 1K02A 1HFBA 1S5TA 3HPSA 1WYIA 2W6RA 2WSYA 2BZNA 2ZA2A 4M7SA 2FPTA 3DFSA 5HUOA 1KBJA 4CNNA 2DJXA 2CZFA 2Q8LA 4O16A 3L5LA 3GNDA 1H1YA 5HWMA 4O57A 2YGYA 3DFNA 3STCA 4JX6A 5AYXA 2ZA3A 2IQTA 3TX9A 4FNPA 4RXGA 1O94A 4AWSA 2ZRUA 1OFEA 2X2GA 5EKYA 1TTQA 1LRNA 4JTHA 3NPUA 1EA0A 4DPQA 3L21A 3PSWA 1V5XA 3PY2A 2VFDA 3O6YX 4O14A 3BK0A 4NXKA 3VI2A 4ONVA 3G1SA 2ZRVA 3P74A 2ISVA 1ME9A 1G7UA 3STGA 3NEVA 2NUXA 4GRSA 4Q33A 2G95A 4N9EA 4X3ZA 2NX3A 4EF8A 4JTFA 1ME8A 1FDZA 3G1YA 4CQAA 1SFJA 3W85A 5I3GA 3DFOA 1DQWA 2NWSA 1W1ZA 4O50A 1QOQA 4AWTA 2ZQ0A 3MHUA 1QWGA 1JCYA 3SGUA 3BVJA 4BWLC 4UTUA 1W37A 3GB6A 3MW7A 5AHFA 2Y7GA 3MHFA 2A6LA 1B3OA 4AH7A 5D30A 3KX6A 4HKPA 4E2BA 1B4EA 2YSWA 4YL2A 3BG3A 2E6FA 2E09A 4LTSA 1W3NA 4Z1BA 6ALDA 4XTIA 1K8ZA 3EWBX 4EIVA 1W5QA 3CM4A 2Z1BA 3P8JA 2ATSA 5CPMA 4FF7A 3M44A 1Z44A 3G1XA 4ADUA 4JTTA 3RLUA 1I45A 3FEMA 1YTDA 3G8RA 5DBUA 2ZBTA 2Q3RA 5LNSA 4ZQRA 4JX4A 2GOUA 3W2JA 4BR1A 3A23A 1H7PA 5BNKA 1LORA 5AYZA 4WOZA 2V81A 1T8XA 4O4WA 3B4UA 1OFQA 2JKEA 4IUOA 4BI6A 3TXZA 3L0NA 2WKJA 3NAVA 1TRDA 2R8WA 5LHEA 3C6CA 3LHZA 3LB0A 1VPXA 3UY7A 1CX9A 1DOSA 4AF0B 4HPJA 3EX4A 5G4EA 3N3MA 4AB4A 2QUUA 2QJGA 3GAKA 3PBWA 3UQNA 4JY8A 4K7YA 4FB7A 5D2XA 3O05A 5K4XA 2QR6A 4YXGA 1WDWA 3EWUA 4DBDA 3QMSA 3MI6A 3OA3A 4Y90A 3P82A 5EY5A 1DL3A 1A5SA 3P84A 1CW2A 1BWKA 5F4SA 4OBTA 4JDBA 4HT3A 3WK2A 4A21A 2VEPA 1W5NA 4NXSA 2ZZ1A 1TTJA 4D2JA 1TV7A 4UTTA 4C1KA 4WY0F 3GLCA 3G0SA 3PBYA 2YYTA 2VC6A 1YADA 3EKLA 3NXFA 3P81A 3KAOA 3FIGA 3CEUA 1XFBA 2YCEA 2J27A 3A9IA 3SSJA 1UUOA 1UBSA 2OT1A 1XM3A 3E96A 1GYNA 3S5NA 3TK7A 1NAL1 1SUXA 4Z0SA 2WSRA 1GZGA 4X22A 1H62A 4ML9A 1LRTA 3HPXA 2ZDRA 2FQIA 3CU2A 4NUWA 3FJ6A 4DELA 5CZSA 1OFDA 5DXYA 1WOAA 3DAQA 3LBCA 2CLOA 1GT8A 5AC7A 1B9BA 2B4GA 4KFNA 1O60A 1SO3A 1U5JA 1ADOA 4DBEA 1N55A 1X1OA 3PUOA 3IIXA 3HIJA 3W72A 3CT7A 3ATYA 4ZVJA 1ZNNA 1SZNA 2YR1A 5D09A 2JK2A 5K3VA 1P4CA 1XBZA 2J88A 4C1LA 2BWGA 1X7FA 4N9CA 1IXNA 2A85A 3I68A 1GVOA 2WSQA 4A3UA 3TV8A 3F03K 4CQ9A 3R12A 4RZ4A 4WJEA 3O6CA 1WBHA 3T78A 2CLMA 4NJGA 1L6WA 4R7JA 2NXIA 4FIQA 1JUKA 3EWZA 5DLCA 2NLIA 1HO4A 3ABQA 4MZYA 1LBLA 3THQA 4LS2A 2WOQA 3LCGA 1LZOA 1IF2A 1FBAA 2QUVA 3W70A 1BTMA 3M5ZA 4O11A 3CWOX 3TIMA 4DO5A 1KTCA 5KZMA 3EXSA 2OZ0A 5EBUA 1W54A 3TJLA 1TPC1 4BWLA 3BLEA 2EHHA 1JR1A 3LLDA 2C13A 3L0KA 3THAA 2EGZA 2VFGA 3GDLA 2FB2A 3W83A 3BV4A 4Z0JA 3O16A 2ZTKA 4A2SA 4U28A 4LC6A 2NV2A 1OK4A 1SZGA 1TV5A 2XN1A 4EOUA 1R2SA 3T40A 1TSIA 2RDUA 5HMSA 4HNTA 2ZZ4A 2FJKA 3ELFA 3FLUA 1A5AA 4XBSA 4R34A 4X2RA 5G2WA 3UXAA 3HG4A 3SJ3A 3SFKA 1SPQA 4IQLA 5FEXA 1AMKA 3PBUA 1F76A 3MP5A 4UTJA 3WK3A 4N6EA 3EWXA 4JYFA 3RFAA 3MJYA 3NOEA 1QDSA 4LV9A 5AHMA 2Y7DA 3UWQA 4PL2A 3TFCA 3NQEA 4XKYB 3QSTA 2E6AA 1GTEA 5FESA 1W56A 2EPHA 4GWEA 2QCGA 2VKZG 1OHLA 4OGZA 2ZCGA 2A0NA 3OIXA 5J5DA 3DFPA 2G5WA 3FOKA 3UWWA 2Y61A 3W9ZA 3GXNA 1EWDA 3NZRA 1F2JA 2NUYA 1MEHA 2FPVA 1A5BA 4FEZA 1WA3A 4O1BA 5D2VA 1K7XA 1OG0A 3S5YA 4MFDA 5CZTA 1EP2A 1PE1A 4YCPA 4O52A 3M16A 5E1QA 3VFLA 4JY9A 3E9AA 4IMCA 4WD0A 5EA9A 5D37A 2G97A 3T44A 4IMEA 1TPDA 4CNOA 4ZQOA 4LVAA 1XUZA 3DKJA 4FNQA 4NQ1A 1JQXA 4O8RA 4Z08A 1D3HA 2QCDB 3T7VA 3FA5A 4IX2A 2ISWA 4IX0A 3PB2A 3SGZA 3LI1A 1VCGA 2RFGA 2GQ8A 3QW4B 1I4NA 3PSVA 2PC4A 4G1KA 3BGGA 3MMTA 3MHGA 1FQ0A 3IIPA 1XC4A 2JKPA 1V7YA 3QM3A 3OG3A 3GVGA 1QCWA 1YDNA 5FF0A 4JGDA 2B7QA 1FDJA 2ZRYA 3C2EA 3HB9A 5K9XA 5KMYA 5U4NA 3L67A 3MI3A 1ZFJA 4O12A 5EL1A 3BG5A 1YDOA 2E1DA 3MWAA 4KWWA 1LBMA 4RX0A 1VRDA 3HQ1A 5CSSA 2F84A 3TDFA 1YDVA 4UFIA 3PBVA 1MO0A 3CEPA 3LHUA 2P0OA 1KFBA 1GOXA 1F6PA 3TSDA 2YX0A 1W31A 4UFMA 4JX5A 5KZDA 1KFKA 1OYBA 5KTLA 4N9DA 4AXKA 4B5NA 1DHPA 1SW3A 2VELA 2J9XA 2CZEA 3IIOA 3KOFA 4FNRA 4JDYA 1K3UA 1JUEA 1VYSX 3ZFHA 2YW3A 1H5YA 1ZAHA 5DCEA 5D2TA 3NQVA 3SW6A 4UXDA 1EWEA 1OX4B 3I6RA 4MPQA 1VLIA 3NVTA 2QDHA 1O4UA 1LTDA 1TQJA 1Z41A 4OWGA 1KTNA 4Y9AA 4MJZA 3EXRA 3W73A 1GVSA 1TPH1 3IGUA 4MLJA 5FF4A 4PL1A 2GVLA 1R2TA 3HJZA 1ZHAA 1M7PA 5HJLA 3UPWA 2LLEA 3N9SA 1GTHA 1N7KA 4QIUA 3M9YA 1JJKA 3LCFA 3F4WA 2ZRZA 3RK8A 1R46A 5LKYA 2X1UA 2VEMA 3DI0A 3HG5A 1QO5A 3SR7A 3VNDA 4WOQA 3M6YA 2TYSA 1AW1A 4LC8A 1SSDA 5DBTA 5KSWA 2RKXA 1JCJA 1ZAJA 1UJPA 2WNNA 1ALDA 5LSMA 4MUZA 3UNDA 4OV9A 1KV5A 3HF3A 1DORA 3HGOA 3KRZA 3W7JA 3G3DA 3NL2A 3N34A 5K9DA 3I7RA 4FX7A 3C3NA 1Q45A 3NQDA 5D32A 3GZ3A 4AHPA 2FIQA 4IWWA 1JCMP 4ICNA 3OBKA 1KLYA 4HSNA 1IXPA 3PVFA 2YPIA 2QCCA 4XQ6A 2E68A 1H7RA 1FCBA 2QCFA 2ZZ6A 1M6JA 2NXHA 2OCZA 3OVPA 3S8HA 4XBKA 3BARA 5E0KA 1DJQA 2GUUA 1AW5A 3S5OA 4UNLA 3M0ZA 4ZMGA 3TXVA 4MZ1A 3TSBA 1I2OA 2C18A 4JTIA 4TMCA 1EB3A 1SFLA 1NF0A 1PHWA 3FJLA 2QUTA 3IIVA 1G69A 3LV5A 4HNVA 3GR8A 1S3HA 3MBDA 1T0OA 1H60A 1KTBA 3NPVA 2JKAA 3NQFA 3TW6A 5HUPA 3MBFA 3LXCA 2F7FA 3QPZA 1TPB1 3TUUA 1Z48A 3GDRA 3LERA 1TTIA 1VZWA 1ME7A 4K37A 1JVNA 1FXQA 4ZQMA 4TR9A 1TPUA 3W1AA 3H54A 1I2RA 2E5CA 4JTSA 5F1VA 4PTNA 3W1XA 3VE9A 2DZTA 2A1YA 1RQHA 5LHFA 2RDWA 1TCDA 5AOUA 1H1ZA 1T99A 1FWTA 3GIYA 3W2LA 1HUVA 1TYGA 5AN7A 4Y6GA 4FXRA 1W3TA 2I14A 5F2IA 4QM1A 3UZJA 1LDCA 2J6XA 1G4TA 2CLEA 1ICPA 1NF7A 3CIWA 3PUDA 2VFEA 4JXCA 2TRSA 2XFWA 1L2UA 3UWVA 3VCRA 5I3JA 3LGEA 3PM6A 3U8GA 3W1UA 4JTJA 2Y89A 1XDLA 1GVRA 4I7VA 1LYXA 3NQ6A 4ZQPA 3C4UA 4LWWA 1VCVA 3G18A 5K2ZA 3TU9A 4UCGA 5G5IA 3EXTA 3QC3A 4CLMA 2DZXA 2A21A 3I65A 3PG9A 3S1WA 3OHIA 3MYOA 3QQ0A 1BKSA 3N14A 1SW7A 3W7KA 1OVDA 2C6QA 4RK8A 3LV6A 4WQ6A 4O18A 5D2WA 4GXMA 2OMAA 5EMUA 3HMJG 2DJLA 3AO0A 2PCQA 3NL5A 4PEKA 2P1FA 3TNOA 1OFRA 3NPXA 3ZR4A 4NX0A 4EF9A 1TIMA 3GK0A 1VGAA 1O95A 1OYAA 2FB3A 3LHWA 1OFAA 3UWZA 4GUHA 2DZUA 4LW7A 5DELA 1YXYA 4DF2A 4LUIA 2Q3OA 3NQMA 1ICSA 2CZDA 2H8ZA 4A22A 1XBVA 1AL8A 3A22A 3C52A 4NNBA 4S2BA 2E6YA 3M1ZA 5F4XA 1D3GA 3HOJA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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