2GVL | Genus

Total Genus 150

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	150
sequence length	476
structure length	464
Chain Sequence	FNILLATDSYKVTHYKQYPPNTSKVYSYFECREYEETVFYGLQYILNKYLKGKVVTKEKIQEAKEVYREHFQDDVFNERGWNYILEKYDGHLPIEVKAVPEGSVIPRGNVLFTVENTDPECYWLTNWIETILVQSWYPITVATNSREQKKILAKYLLETSGNLDGLEYKLHDFGYRGVSSQETAGIGASAHLVNFKGTDTVAGIALIKKYYGTKDPVPGYSVPAAEHSTITAWGKDHEKDAFEHIVTQFSSVPVSVVSDSYDIYNACEKIWGEDLRHLIVSRSTEAPLIIRPDSGNPLDTVLKVLDILGKKFPVTENSKGYKLLPPYLRVIQGDGVDINTLQEIVEGMKQKKWSIENVSFGSGGALLQKLTRDLLNCSFKCSYVVTNGLGVNVFKDPVADPNKRSKKGRLSLHRTPAGNFVTLEEGKGDLEEYGHDLLHTVFKNGKVTKSYSFDEVRKNAQLNI

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

molecule tags	Transferase
molecule keywords	Nicotinamide phosphoribosyltransferase
publication title	Molecular basis for the inhibition of human NMPRTase, a novel target for anticancer agents. pubmed doi rcsb
source organism	Mus musculus
total genus	150
structure length	464
sequence length	476
chains with identical sequence	B
ec nomenclature	ec 2.4.2.12: Nicotinamide phosphoribosyltransferase.
pdb deposition date	2006-05-02

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF04095	NAPRTase	Nicotinate phosphoribosyltransferase (NAPRTase) family
A	PF18127	DUF5598	Domain of unknown function (DUF5598)

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.20.20.70	Alpha Beta	Alpha-Beta Barrel	TIM Barrel	Aldolase class I	2gvlA02

3A22A 3RK8A 4JEQA 3WFAA 1K7EA 1L9WA 3HPXA 4K7YA 3A21A 5A8GA 1W5NA 1W3TA 1A5CA 3PUOA 4JIQA 3BO9A 3GK0A 3TXZA 3A23A 3M7WA 4N6EA 1KTNA 1DORA 1ZY9A 4O57A 1DVJA 3SSJA 1YDVA 3DXIA 4IX2A 3E96A 1B4KA 2C0AA 2V8ZA 3BARA 3T55A 4NJHA 1OFOA 3F03K 1SZGA 1SUXA 1EP1A 3I65A 1F2JA 2D73A 1ZAJA 2G97A 4I9AA 2A7PA 5DXYA 3W07A 5I3HA 3CWOX 2DZXA 1PIIA 3MMTA 3W74A 3NPWA 3ZR4A 3NL5A 2DORA 2ABBA 4Y90A 4AB4A 2JKPA 1WOAA 1MXSA 3TH6A 1OF6A 3T78A 3GKAA 1FXQA 5D2VA 5G4WA 3UY7A 4O52A 5HJLA 2ZFAA 3LI0A 2CU0A 4QAIA 4HPXA 1YDOA 1MSSA 1XFBA 4NZJA 1TPDA 5FEXA 2GVGA 3OVQA 4XWUA 1GEQA 2TSYA 3BG3A 1SZNA 5HULA 1TCDA 4MFDA 3PSVA 1W54A 3TJXA 1QMLA 3OBKA 4JX6A 4Z1CA 3BPWA 3GB6A 4ZQNA 3L5AA 1KFEA 3MP5A 4UTKA 1UUOA 1QR7A 3Q37A 2CLLA 1SW3A 2QDHA 1GYNA 2JGYA 2FLIA 3CM4A 4UTIA 1RQBA 2QCHA 3W86A 2J9YA 5F2GA 1BKSA 1EIXA 1S5WA 4K36A 3WK0A 4JX4A 4UUIA 5IM51 4QNWA 1GVFA 3EX3A 3IV3A 4KWVA 4X22A 4UTLA 2YXGA 1YTEA 2WV8A 3MBFA 4O1AA 3I7SA 1GWJA 3SR7A 2Z0IA 2QR6A 1VZWA 4O1DA 3TC6A 3BGGA 3BLIA 1I4NA 1SO5A 2YW4A 3SZ8A 1F73A 4MUZA 2H3DA 1G7VA 5EPDA 4A29A 1THFD 3UWWA 1KBIA 3P67A 3M5ZA 3BV4A 5G1YA 2C19A 3CHVA 4M6VA 2W6RA 1T0OA 3W75A 5LNRA 1C8VA 1K8XA 4MJZA 4MY9A 4RV8A 1TB3A 4ALDA 4JICA 5U4NA 4O28A 2QUTA 2ATSA 3IVUA 5GVJA 4WJEA 2FQIA 3GNNA 4ORIA 4UIOA 3QF0A 3M5YA 4WD0A 5D38A 3W1TA 4U28A 1KLZA 4HNUA 3GXNA 3W7EA 3NM3A 4N9DA 3QSRA 4HT3A 4OHQA 3TAOA 1Q45A 2ALDA 5KINA 5IBXC 3OHIA 1OF8A 3T44A 3W7OA 3W1XA 1OHLA 4FNUA 4O4VA 2ZTJA 1OJXA 3HF3A 1SSDA 1SSGA 3C61A 1QPNA 2TMDA 1TPFA 2J9XA 2Y61A 4Q33A 2QCCA 1LCOA 3L5MA 2WPBA 3PG9A 5EA9A 3EKZA 1IIHA 5LKYA 1OX4A 3QYQA 5D33A 3ANYA 2DZVA 4QJ1A 5I3IA 2WKJA 1QCWA 4EVZA 4A22A 3W2UA 1O5KA 2E6YA 2Q3RA 4I7WA 4FEZA 2GQ8A 4FXSA 4TR9A 1X6UA 3PR2A 3PULA 1KW1A 2CLFA 4N4PA 1TRIA 3L67A 3UWYA 4KFPA 4UFHA 3ATYA 4ADTA 4AWSA 1FWRA 3LRLA 2H8XA 1DBTA 5CKSA 5CZTA 5DXXA 5LHEA 2LLEA 3TMLA 1W5MA 1LRTA 4K6AA 5AFDA 1QO2A 3G0XA 3PBYA 3W3OA 2H3BA 5AHEA 5D05A 5AOUA 2ZQ0A 3LHVA 4AXKA 1FY6A 3FJLA 4HSNA 2I14A 1F6PA 3CLMA 2RHGA 4R53A 3W7NA 2PC4A 2QF7A 3S0CA 4WY0A 5EKYA 3C56A 4XBSA 1RZMA 3VE7A 5LSMA 2FJKA 1WV2A 4Q32A 1KFCA 4JR5A 5C5YA 1K8YA 3OA3A 2H90A 1X7FA 2EGZA 2QCEA 1I45A 4JTGA 2QAFA 4NXSA 3G1YA 3GXTA 4CCCA 3G3DA 4HNTA 4JTJA 1RVGA 1H7OA 5I3JA 2WOQA 1TREA 1Q6QA 4E0CA 4UTHA 3W2NA 4DO6A 3P7YA 3G1AA 1I2PA 1SO4A 2WNQA 4I7UA 4GRSA 1LOQA 3ABQA 3S5ZA 2OJPA 4UFKA 4Z08A 1JQXA 2FPTA 1QOPA 2PE4A 1SW7A 1O94A 1ZALA 2Y7FA 2TPSA 4PODA 3W1NA 2DU2A 4N02A 3BG5A 2NWRA 2YGYA 3IGSA 3KFTA 3L65A 1L6YA 3KVJA 5DY2A 3TE9A 4LVAA 2NX9A 8TIMA 2NXGA 2FTPA 2XN1A 3QW4B 4GE8A 3SGZA 1JRCA 1TQJA 4OU1A 3S9YA 2J24A 1GQNA 3M0ZA 3W7QA 3VFLA 2ZRYA 3HPZA 4O19A 3QM3A 2DJXA 3S1VA 4PC8A 4M6PA 3UWQA 1JCNA 1FWNA 1IIGA 3BVJA 2QEZA 1YTKA 4B5NA 1GVOA 2YZRA 1YLVA 3R13A 1PE1A 3PS7A 1KLYA 3W7GA 4JN6A 2R94A 2CLKA 5KZDA 1TMHA 4JTEA 2QCDB 3SECA 2EHHA 4UTUA 3FLUA 4DO4A 1QOQA 3W2MA 1TPWA 1V7YA 2J6XA 5K9XA 2ZRUA 4JDBA 4O17A 3QQ0A 3KRUA 3UNDA 1VGAA 3HG2A 3KRSA 2OZ0A 3N14A 2W79A 5L9FA 2PCQA 5BMWA 1CW2A 4XKYA 3LHTA 3E49A 4NU7A 4O0ZA 1JVNA 1FDYA 4Y96A 3LV5A 4BI6A 1FWSA 1KM1A 1XM3A 5HWMA 4OE7A 5HQEA 1H5YA 3B4UA 4TU1A 2VFIA 5TIMA 4NJGA 1FDZA 2WNZA 1MEWA 1ICQA 2JKAA 2V2HA 3ZWTA 4NJIA 2O7QA 3MHUA 4RCXA 3LHWA 1H7PA 5C55A 1O4UA 4RR4A 3HJZA 4UFIA 2F7FA 3B8DA 1YADA 2A0NA 2DJLA 1VYPX 4JTLA 5MHBA 3TNOA 3O8AA 4I7VA 3QMSA 1RQHA 1W1ZA 3M16A 3L0GA 2ATMA 3W7PA 2YYUA 5HWNA 2QCGA 1VRDA 1AL8A 3M1ZA 4NQ1A 4RLIA 3TSMA 5DCEA 2EKCA 4H6KA 3LGEA 1G6CA 1LRNA 1ZFJA 1H60A 2GJLA 5L6UA 1EA0A 3NOEA 2Y6ZA 2ZYFA 5G2IA 1W8SA 1HTIA 4WY0F 1TTQA 1JUBA 3KVLA 5ABTA 4N9BA 3WK1A 4BWLC 5K4ZA 4IGHA 3STCA 1N55A 3UYCA 1W56A 3C3NA 5C2XA 1TJPA 3TMQA 1KTCA 3W71A 1Z41A 4A21A 3RF9A 3MO7A 4RZ5A 1FDJA 2ZZ6A 3DKJA 3SW6A 4UR7A 5H2ZA 4UFMA 5DELA 4JS3A 3EWYA 3LI1A 3CTLA 3O1NA 4TIMA 1A50A 3DI0A 5KMYA 2EPHA 2WO5A 1CX9A 1Z44A 3KVKA 2NV2A 1ME9A 3SJ3A 3WJYA 3TU9A 2GOUA 1P4CA 1GPWA 3BW3A 2NLIA 3GDKA 1JUKA 2NXHA 1DQXA 1G4TA 2CLIA 5K9DA 4RKAA 4AHPA 2X1RA 3DZ1A 2E6FA 3QSTA 3UD6A 3B03A 5CPNA 5KSWA 1B3OA 1BWKA 1H7NA 2CWNA 1S5TA 1ALDA 4DF1A 3E9AA 1GOXA 3GDLA 1BTMA 5HUOA 3BW4A 4N2YA 2PRMA 1KFJA 2P10A 4CLMA 3EXRA 3LHYA 3GDRA 4G1KA 3NQAA 3RFAA 1AMKA 2V2DA 3LCFA 4MYXA 3MHGA 4YMZA 3PVFA 3STGA 4WUIA 4CNNA 1H7WA 3V1PA 3LCXA 3NPUA 4MOZA 1LDCA 1Q6LA 1NVMA 3DENA 5D02A 3ABOA 1SO3A 5LNVA 3B0VC 4PL2A 3LTPA 3U2OA 2VFEA 1LORA 1YPFA 2P1FA 3QH2A 4DPQA 1PS9A 2VEPA 1T8XA 4M5PA 3LLFA 2BLEA 3M44A 4UNLA 4FF7A 4IX0A 3CEUA 1XDLA 4ZZ9A 2VEMA 3G1SA 2EF9A 4XUGA 4LTSA 5AC7A 3DU0A 3WJWA 2PRHA 1C9DA 1YXYA 1GZGA 3QPYA 1UBSA 3B05A 4DO5A 1JCJA 4QIUA 3W7HA 3N9SA 3JR2A 5LNWA 5BMXA 4RZ4A 4C1KA 1KFBA 2ISWA 2VELA 4UTMA 3GVGA 1K7FA 2YSWA 4WOZA 1EB3A 3Q58A 3N19B 1V5XA 2P0OA 1VPXA 4UXDA 2XFWA 3NO5A 4LS0A 1PHQA 3F1QA 5K2ZA 1OFPA 2RDUA 1GG1A 2E77A 1ME8A 5E93A 3W1UA 1W31A 2VXNA 5AN7A 2VC6A 2HTMA 1TV5A 1UJPA 1TTPA 3UXAA 3ABSA 4LT9A 1D3GA 1ICPA 2ZA3A 1SZEA 2YYTA 1JCLA 3HMJG 4MVAA 1TV8A 2TYSA 3BLEA 3WK2A 3G0UA 5BOOA 3LXAA 3L68A 5CSSA 3UY8A 3S5OA 3OG3A 4OGZA 5K9CA 3NQEA 5LNUA 2VEIA 1N7KA 5CPOA 3S6DA 3G24A 3GYEA 4BI5A 2CLMA 4RX0A 3EEGA 2E6DA 2CLEA 5LGXA 2RKXA 4BK9A 2YCEA 1VYRA 3NAVA 5FF7A 3TXVA 1FUYA 2VENA 3DKLA 4O10A 3W1AA 1WXJA 1NAL1 3NVTA 1X1ZA 1UB3A 2YW3A 3W7LA 5LNSA 3R12A 1VQTA 4PEKA 3WJZA 3LCGA 2J9ZA 3G1DA 3DHDA 1FBAA 1VLWA 3PBVA 3W1QA 3P60A 3PAJA 2V81A 3I7RA 3NZRA 4N6FA 3O6DA 2CFFA 3WJXA 3WK3A 3HB9A 3QMTA 2B7QA 1OX6A 1GVSA 3UWVA 1YYAA 5F4WA 2VFGA 3W1LA 1D9EA 3LBMA 3TV8A 4RK8A 3VKJA 4XQ6A 1TIMA 4O14A 2YDAA 3NXFA 1FWTA 1P5BA 4LC6A 2QCMA 3FFSA 2W0UA 3C2VA 2FB2A 5HR6A 1O60A 4UNKA 3FKRA 3PC0A 1NFBA 4YWIA 5LHFA 1H62A 1VHNA 5J5DA 3LLDA 1UUMA 3ABRA 1H50A 1OX5A 3W7KA 4AEOA 3GDTA 4A3UA 2NUWA 2ABAA 3W87A 3C6CA 3GNDA 3W1RA 4DQWA 1OABA 1W3IA 3W1PA 5LZLA 3KVMA 3NQ6A 3W23A 1DL3A 4O12A 1I2OA 1QWGA 5BNKA 1C29A 1YTDA 3JS3A 4GUFA 1XUZA 3A24A 3VCRA 2VOMA 1EX5A 4LVGA 4FB7A 4WQ6A 3FJ6A 1NF7A 3L5LA 4U4MA 4MPQA 3EX4A 2RDTA 4UTWC 1A5SA 1RV8A 2X30A 4UTTA 5A5WA 1W0MA 3AO0A 1FXPA 1EUAA 4HSOA 4LS2A 2TRSA 3M43A 4AF0B 3CB8A 5DY3A 3W7IA 1HUVA 1KFKA 4Y6GA 3W84A 3LM7A 4JNMA 5EY5A 1M6JA 1VH7A 4OV9A 4GFSA 4IMFA 3EX6A 3L0KA 1PHWA 3R5EA 4UTJA 3OVRA 1LRQA 3TQVA 3MP3A 3THQA 2V82A 4GUHA 4NJKA 4NT0A 4R34A 4DXVA 3IIVA 3GX9A 4HNVA 1F5ZA 3TJLA 2WJZA 3W22A 3YPIA 1JCXA 4FNSA 1G7UA 4YCPA 1I2NA 3W2JA 1VCGA 4NNBA 1FCUA 5DCBA 4KFNA 4H3DA 4JYFA 1R2SA 1OVDA 1H7RA 4O1BA 5DN1A 3HIJA 3H53A 4LS1A 4MLJA 2FIQA 4ADUA 1F6KA 1MEHA 3QFEA 2ZA1A 1O5XA 3P84A 3A9IA 1GVRA 3MI2A 4ICNA 3KXQA 3FIGA 3MJYA 1HL2A 2ZCGA 4XTDA 1VYSX 1KM4A 3LCIA 5J5RA 4X2RA 1B9BA 3S1UA 3HGRA 1QAPA 3W72A 1DJNA 2ZZ2A 5D2WA 5AHFA 2A6LA 3UQNA 3UPBA 3LCLA 3O16A 2Q3OA 1F05A 3ZFHA 4POCA 4JD4A 2UV8G 4MZ8A 4A2RA 3G8EA 4S2BA 1UASA 1WQ5A 2X1SA 2Q8ZA 4JIPA 1Y0EA 3L66A 3IIZA 4JYDA 3HPSA 5F4SA 4GC4A 4UCGA 1DQWA 2OX1A 2RH9A 4FX6M 3S1XA 2I9EA 1H1YA 4O13A 3NZ1A 2A7NA 4OV4A 4YCOA 3IIOA 5F1VA 3MI3A 4IMEA 3MW7A 3O07A 1SU5A 4TX9A 1ONRA 1GJPA 4J9JA 3G18A 2OMAA 3RLUA 1TTIA 5AC6A 1JUEA 2Y88A 2GUUA 3D0CA 2QJGA 4NXKA 3O06A 4LV9A 1YXCA 2QDGA 4D2JA 4QSHA 2B7NA 1P1XA 3NL3A 4NJJA 3LRMA 3G1XA 1K03A 6ALDA 4S1FA 3NR0A 5E1QA 5FF3A 3STEA 4O53A 3DH7A 2F84A 3TSDA 1OFQA 5EYWA 3DFSA 2XN0A 4M7TA 2VKZG 3MBDA 2HS6A 3W2KA 2QUVA 2NWSA 3VE9A 2Y7DA 2GVJA 2QUUA 3O6YX 3LHZA 3LRKA 1KM0A 1F74A 1P0NA 1QPQA 5AYZA 3QRHA 1RQEA 4LV4A 3T7VA 4DPPA 5K3VA 3OEXA 2R91A 3M47A 3KHJA 1KBJA 4HNNA 1W3NA 2WSQA 3VNDA 4HIBA 1R2TA 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chains in the Genus database with same CATH topology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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2GVLA

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