The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
11
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sequence length |
44
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structure length |
44
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Chain Sequence |
LVILLGVVGLSALTGYLDYVLLPALAIFIGLTIYAIQRKRQADA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Membrane protein
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| molecule keywords |
MerF
|
| publication title |
Structure Determination of a Membrane Protein with Two Trans-membrane Helices in Aligned Phospholipid Bicelles by Solid-State NMR Spectroscopy.
pubmed doi rcsb |
| source organism |
Morganella morganii
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| total genus |
11
|
| structure length |
44
|
| sequence length |
44
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2006-05-22 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF11431 | Transport_MerF | Membrane transport protein MerF |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Helix Hairpins | bacterial mercury transporter, merf |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2H3O A; 1WAZ A; 2LJ2 A; #chains in the Genus database with same CATH topology 2NR5 A; 2JEX A; 1S76 D; 2W0X A; 4FLZ A; 4I5S A; 2EIN C; 3KKY A; 1K4D C; 2A79 B; 3L74 H; 1HP8 A; 4PJ0 Z; 3ABM B; 1NKD A; 2FB5 A; 1BT8 A; 3T4D A; 3HPL C; 4DR2 O; 5KHJ A; 2KSD A; 1W2B U; 2BTO A; 1R1B A; 1VMG A; 2AW9 A; 1VQL V; 3D36 C; 3OAA G; 4KFM A; 1XNQ O; 1XBL A; 1XIL A; 2V7Q G; 1D5A A; 4TV8 A; 1YJN V; 1S5J A; 4FPP A; 2GBO A; 3JAW B; 3K5M A; 3SR2 C; 2YXL A; 3HKB A; 2LJ2 A; 3HR0 A; 3HKD A; 5D5P A; 4G2K A; 2Y69 C; 3K08 A; 3G71 V; 1GTO A; 2BOC C; 5BZB A; 3PJS K; 1K4C C; 4OGQ B; 2HLD G; 2CTQ A; 4TUY B; 3F7Y C; 2GTS A; 3DC5 A; 1K9M W; 1ENV A; 3CCM V; 2DJV A; 1D5N A; 5EC1 C; 4GCZ A; 4X1Y B; 2EIK B; 2JGD B; 2UXB O; 1EN5 A; 2ZCE A; 2WLL A; 5IJ0 A; 2E5L O; 2H8P C; 2VS0 A; 2XAJ A; 1JCH A; 4Q20 A; 2QWQ B; 4JI4 O; 1M5I A; 2HJD A; 3BY6 A; 1Y74 A; 4TQD A; 2P6J A; 3E22 B; 4X65 O; 4J41 A; 4OPH A; 2VQE O; 1XDC A; 2ZDI A; 3CJH A; 3E8F A; 4P9P A; 1QNM A; 4DR6 O; 1WPX A; 3CP1 A; 2W6I G; 2EZO A; 3T1H B; 2AXT Z; 2F95 B; 3N2G A; 3ZMS A; 3JD2 A; 2R72 A; 1QR8 A; 3I56 V; 2QKA A; 4DW1 A; 2K1E A; 1HNZ O; 1LR1 A; 2VRZ A; 1V54 B; 1UPG A; 3M7M X; 1P49 A; 1CP9 A; 5J2U A; 1SQV H; 2XAG A; 2Z5U A; 4ZHQ A; 5CMU A; 1VAR A; 4JZ2 A; 2X7R B; 1OCC B; 4I0X B; 1YVW A; 1G4Y B; 4PDM A; 5CBF A; 4LF6 B; 1QVF U; 5IY5 C; 2PY5 A; 5LHI A; 3T2M A; 3APO A; 1CEZ A; 4LNU A; 5CA3 A; 3LSQ A; 3R66 A; 4FVM A; 4PDR A; 4DV3 O; 2A9H A; 5LGU A; 1YIJ V; 3F5T A; 4AQY B; 4K8Z A; 5HFM A; 2PI5 A; 5FL7 G; 1NT2 B; 1K5S A; 5JCO A; 1N8R W; 3ABK B; 1Z5V A; 2ARH A; 4YHH O; 2OWO A; 4JI0 B; 2LO1 A; 3BEH A; 3OFN G; 4DV7 O; 3KCY A; 3CXC U; 5BR8 B; 4WFB V; 4TSF G; 3P3P A; 3CCR V; 3RYI B; 1KBH A; 4FM2 A; 1JOY A; 1O9G A; 2Q6A A; 3FYI B; 4U3F H; 4JI2 O; 1MAB G; 4PEL A; 4P9O A; 2UUA B; 3E35 A; 3WG7 B; 1I94 O; 1IBL O; 4DUZ B; 3CCL V; 1UFI A; 1TA8 A; 1VP7 A; 1US6 A; 5KA5 A; 2YI9 A; 2N04 A; 4O2A A; 3J7A U; 3C3T A; 3CRC A; 3CSX A; 2LW7 A; 5FPR A; 4O4I A; 4GKK B; 2ZDI C; 1IXB A; 1FFX A; 2P5O A; 1NI8 A; 1EN6 A; 3RYF B; 4A5U B; 4LWS A; 4CH3 A; 4X66 O; 4DW0 A; 5KHG A; 3SYQ A; 3M8A A; 4FIP C; 4TQF A; 4JZG A; 4U7N A; 3SJB C; 2DN9 A; 4NXM B; 1WP7 A; 1Y76 B; 2ZD9 A; 2EUL A; 4X1I A; 1WN7 A; 4X9Q A; 2YIA A; 3W7S A; 1JVM A; 5CB4 A; 4J11 A; 4LF4 O; 2PYJ A; 2WLI A; 5LP6 A; 3VQY A; 1XQ8 A; 1N32 B; 3DSQ A; 1H8E G; 3U0Z A; 2ZM6 O; 1V55 B; 4IIJ B; 2WLH A; 4MVS A; 2F93 B; 3S3X A; 3UM7 A; 3K5L A; 2E76 B; 3ZX6 A; 3LNN A; 2EIJ B; 1MZE A; 4CH5 A; 1EFR G; 5IYD O; 3B4S A; 3THO A; 1U96 A; 4AHC A; 2QWR B; 1QCE A; 5JCO C; 2OIE A; 3DC6 A; 1IX9 A; 3RYH B; 3P30 A; 2HHH O; 4JI7 B; 3BCC H; 1NTZ H; 3ABT A; 2QA4 V; 2ADQ B; 4QGP A; 3JAK B; 4MTF A; 4YJ2 B; 2WAM A; 2XAF A; 3QTC A; 5LA6 B; 1EZJ A; 5CA0 B; 2DQ0 A; 4WFH A; 1S0V A; 1XNQ B; 2WLJ A; 3QG5 A; 3ICX A; 3ASO C; 1Y4M A; 2JRI A; 4FFB B; 2PZS A; 1YZB A; 2X6B A; 4DR7 O; 5JH7 B; 4MVO A; 1VQ4 V; 1R6T A; 2EZP A; 1MMM A; 4EB6 A; 1I5X A; 1S5L Z; 3RT3 C; 5J2T B; 1XMQ O; 2Y4T A; 1SQG A; 4B3M O; 3JCU Z; 3LDD A; 2FL4 A; 1NZ6 A; 2EIM B; 2WA3 A; 2JJ1 G; 3L75 H; 1LNQ A; 5KX5 A; 3JSN A; 5L3F A; 3W7T A; 4PA3 A; 3SPC A; 2ITD C; 4PV1 B; 1WAZ A; 4MVU A; 1SKV A; 2IJH A; 3G80 A; 4DV0 B; 4IL6 Z; 4YIO A; 5B1A B; 3MAQ A; 1GKF A; 5LYJ B; 1N33 O; 4CS2 A; 1BGY H; 2EIN B; 2IW5 A; 1R6K A; 1RPR A; 4X20 B; 2BOB C; 2CH7 A; 5EIB D; 3GB7 C; 5LP6 C; 4LFA B; 1IUR A; 3STL C; 3K04 A; 5LMU O; 2JK5 C; 3FB8 C; 3AG2 C; 1VF5 B; 4MTX A; 2H3O A; 1Q6U A; 3K3W A; 5LMN B; 3FAV B; 3IC9 A; 2BTQ B; 5E79 Z; 1JFF B; 4JV5 B; 3WU2 Z; 4L8J A; 1Q6I A; 4YXW G; 5KMG B; 3CCQ V; 4DR6 B; 4F6R A; 4RQE A; 3AG7 A; 4QPK A; 4JI5 B; 3HB3 B; 1RPO A; 2QJ1 A; 1M4U A; 4IHJ A; 5IJ9 A; 4G27 B; 2CTR A; 3APQ A; 5BMV A; 3OGC C; 5JVD B; 1WLE A; 3JAT A; 1QLE B; 5LL6 Y; 1MA1 A; 2Q7G A; 3DXR A; 2Q0A A; 1IBM B; 2Y0I A; 4BIO A; 4LH7 A; 1L8D A; 3ZHT A; 2BCC H; 2HFE C; 1K92 A; 3CS5 A; 1B06 A; 1GM8 A; 1HWY A; 1TGO A; 2KQX A; 3SJC C; 3DGE A; 1AR5 A; 4GLX A; 4HNA B; 3JCZ A; 4K35 A; 4JI8 B; 1AP5 A; 4DV3 B; 5IYZ B; 3IJ4 A; 3IGA C; 5LXT B; 1AI4 A; 3OMI B; 4L87 A; 4JYB A; 2B1G A; 2WPD G; 3WFV A; 4JYY A; 3JAR B; 1CPY A; 2DOS A; 4LF5 O; 2DYR C; 5L3B A; 3BPZ A; 4DR1 O; 3T1Y O; 2P4V A; 2JDI G; 3ZMZ A; 5GON A; 5A9G A; 4WBN B; 4DR5 B; 2KB1 A; 4LF7 O; 3R65 A; 4D7S A; 2A7W A; 2QM4 A; 2JS3 A; 3O65 A; 2D2C B; 3HKC B; 3A2F A; 1N36 B; 1KQS U; 1TVK A; 2EJ7 A; 2UXN A; 1IBL B; 3ZRW B; 4DYL A; 1KEC A; 2LGW A; 3BAB A; 5TIS Z; 1LUV A; 4Z1V A; 1OZ0 A; 5LOV A; 2QGN A; 3OMA B; 5C8Y B; 2A3Q A; 1H2M A; 1P4R A; 5KAF Z; 4O4J B; 4NXN B; 4MVQ A; 3AK3 A; 3KCX A; 3HKB B; 2P90 A; 4U7O A; 3W7U A; 4CC5 A; 3QNE A; 3HKD B; 1URF A; 1W59 A; 2DQ3 A; 1AJQ A; 1R3J C; 2L35 A; 3CC2 V; 1GMG A; 4KP4 A; 1KKC A; 5IWA O; 1ZAU A; 1YDX A; 2QKS A; 2NLJ C; 4XBF A; 2ZE5 A; 2W6J G; 4JAU A; 3E8G A; 4NKG B; 1LUW A; 1IZ3 A; 1YEW A; 4ZI7 B; 2B9Z A; 5IE9 A; 1XHZ A; 2GUZ A; 1VQ7 V; 2IM9 A; 4MW8 A; 2ZR2 A; 1YXB A; 2LGQ A; 2VWK A; 4O2B A; 5KHH A; 1FPO A; 1MSW D; 3ZED A; 2Q8V A; 2GHY A; 3ZHQ A; 2E3C A; 3FB5 C; 3AG4 C; 2ZNJ A; 4JYC A; 1Y74 B; 3BHP A; 1JX9 A; 2Y0P A; 4DUY O; 2HHH B; 3N2K B; 4LF9 B; 1QBZ A; 3UT5 A; 3GWK C; 3CJH B; 2VQF O; 1HNW O; 1BHA A; 1RP3 B; 4NTY A; 2QE7 G; 4LFC O; 2N74 A; 1NU1 H; 1K5Q A; 4RQF A; 5B3S B; 1GM9 A; 1Z5W A; 4FLW A; 5H6R A; 2UUC B; 3OT7 A; 3E86 A; 2HG5 C; 4P2Z A; 5LBQ A; 3SDL A; 2IBZ H; 2UU9 B; 3K59 A; 5B1B B; 4NR1 A; 3VQV A; 2M6Y A; 1XMQ B; 4B3M B; 1KKD A; 3G6B A; 2QM8 A; 1MOF A; 1ZTE A; 3ASN B; 1WP8 A; 2WWW A; 3IC7 A; 4WFA V; 1KD1 W; 1Q82 W; 5J9P C; 5KA6 A; 2KKW A; 3U11 A; 1MSD A; 1XMO B; 2JVD A; 2UXC O; 3ZIA G; 2LP7 A; 5BXZ A; 1WA8 A; 4X8A A; 4D7T A; 1N0N A; 3FYE B; 4FMT A; 1NR1 A; 4DK1 A; 2PGG A; 4I50 B; 2IJK A; 4EFE A; 2BSK B; 1SQB H; 1PM9 A; 2JEU A; 5HFL A; 5B1N A; 4LCU C; 1M9N A; 2YUA A; 2YDE A; 4PA7 A; 5CBH A; 4CBC A; 3SPG A; 5JQG A; 2QR4 A; 4PDV A; 1FJG O; 2ZXW B; 1JQ0 A; 4LF8 O; 4DV4 O; 2AHZ A; 1F23 A; 1OCR C; 5EZY A; 4YY3 O; 5EYP B; 2XOK G; 3CYO A; 3OEH G; 1BZK A; 2ADP A; 1YI2 V; 1MG1 A; 4N21 A; 3LSU A; 2Q7E A; 2HVK C; 4YIP A; 4B08 A; 3W7W A; 5CBG A; 1HR0 O; 4DV2 O; 5ITZ A; 4O4H B; 1VQP V; 1GN6 A; 4BWA A; 4DV5 B; 5FNV A; 5EC2 C; 1ZL8 B; 3VOU A; 3H01 A; 4QNH B; 1XOU A; 5CB4 B; 2WLI B; 1DF4 A; 3SJQ C; 4DV1 O; 4R6Z A; 2F4V O; 3BA8 A; 4K0K O; 3AG3 C; 4CH4 A; 4B3T B; 2CUG A; 3OUF A; 3ABU A; 4KXR A; 4MSW C; 3GVM A; 4X64 B; 1J5E O; 4KUM A; 4NTX A; 4JTA B; 1FKA O; 3OE7 G; 2IH3 C; 1S5H C; 2X0L A; 1KUQ A; 1GRJ A; 4J7J A; 3ZHV A; 1B3Q A; 2ODM A; 2AZ0 A; 3T1Y B; 4KHP O; 4ZBM A; 2QTO A; 3LDC A; 1IBK O; 4LF7 B; 4U3J B; 2Z3Y A; 3UCS C; 2Z0A A; 1SQQ H; 4FM1 A; 3L73 H; 2F23 A; 3MHH C; 2JJ2 G; 4BIU A; 2E74 B; 4HBN A; 4MT8 A; 4R7C A; 4UCR A; 4QIW F; 1Q81 W; 1M56 C; 3BAA A; 3EFF K; 4W4L A; 2D3O W; 2RJZ A; 1SS3 A; 5GTI Z; 4J42 A; 3JAW A; 4H44 B; 4UV9 A; 1H2G A; 5DED A; 4FM0 A; 1S72 V; 3IAY A; 1F4N A; 1H8H G; 4ICG A; 5KLV H; 1XL6 A; 3OTF A; 4YJ3 B; 1NR7 A; 3FB7 C; 2CTW A; 4UCV A; 2ZE7 A; 4EEQ A; 3CMA V; 4OX9 B; 2DYR B; 4I9W A; 1XNR O; 2Q9L A; 3JAL A; 4J10 A; 3WB1 A; 3CHX A; 1MNG A; 1RM1 B; 4E2L A; 1KU9 A; 2OCH A; 4PI0 A; 4MVR A; 1EZV H; 5IYC O; 4DR4 B; 3P3N A; 3CCU V; 2PI4 A; 2RNB A; 2WLN A; 4X1Y A; 4DRX B; 5B1O A; 2JGD A; 3CC4 V; 1AB3 A; 4DO2 A; 3ZMT A; 2MW2 B; 2PUS A; 2FKX A; 2GSM B; 1GAX A; 3K5O A; 4B7E A; 3E22 A; 4B3S B; 4DR3 B; 4JI1 O; 4FZ0 A; 1NVP B; 1M90 W; 4LFC B; 2X6A A; 1Q7Y W; 4FLU A; 3AG1 C; 1E1R G; 2OT5 A; 1AVM A; 4EKW A; 5IJ9 B; 3E2E A; 1FXK B; 2DMX A; 3JAT B; 2P4K A; 2ZR3 A; 4JI6 O; 5CN0 A; 2R9I A; 1G1X B; 1JA8 A; 3DXR B; 3NR7 A; 1SA0 B; 1BHB A; 1Y6X A; 4I55 B; 4WFF A; 1R3L C; 2UUB O; 4DR2 B; 4DK0 A; 2ZKO A; 1VIB A; 2IJJ A; 3SYP A; 2ETN A; 1VQ8 V; 1X4T A; 3JD1 A; 2WSS G; 1H2L A; 3SGI A; 4I0X A; 2YSU B; 5KHI A; 3HKE A; 4GT1 A; 2ZE6 A; 4I4T B; 1WNS A; 2CTP A; 5CA1 B; 3MD0 A; 4F4L A; 2EIL B; 2Q73 A; 4NB5 A; 2HKO A; 3S3W A; 2DE0 X; 4LH6 A; 1S3J A; 3FFQ A; 1K3E A; 4O4L B; 4I9Q A; 3TCU A; 1I08 A; 3FD9 A; 3K79 A; 3ABL C; 5GON B; 4FK5 C; 5FPO A; 2G38 A; 4D6T H; 1XL4 A; 3K0D A; 2UXX A; 1K8A W; 3RYI A; 2IU0 A; 1VQN V; 1ARO P; 1KP3 A; 1AI7 A; 3ML0 A; 4JPR A; 1VF6 A; 1KMI Z; 5LOV B; 4HZ3 A; 5H9C A; 4BW9 A; 4NYK A; 2XND G; 1N34 O; 3C90 A; 1FYJ A; 1QHT A; 2UXB B; 2JS5 A; 4DV4 B; 1RSO B; 2K9P A; 2E5L B; 3ZN0 A; 5EIB C; 1VQ9 V; 4JI4 B; 4RO2 A; 4WCE V; 3RYF A; 3SPJ A; 1XEQ A; 4X65 B; 5KHK A; 4Z2W A; 3RW0 A; 4GYC B; 2VQE B; 4DV2 B; 1BE3 H; 3JAS B; 1S77 D; 3K57 A; 2HVJ C; 4UCS A; 1EBO A; 3ZRX A; 1I0H A; 4CC6 A; 4R8C A; 4CS4 A; 2YEV B; 1E79 G; 2P7T C; 2XT9 A; 3E8H A; 4DV1 B; 4H0L B; 2LQT A; 3QO5 A; 3T4Z A; 4O2B B; 1HNZ B; 2E75 B; 3H1I H; 2Y69 B; 1NH2 B; 2CK3 G; 1DTO A; 1FXV A; 3ZN1 A; 3Q4H B; 3CB2 A; 4NVP A; 5H5N A; 4TV9 B; 2YID A; 3LDE A; 4DV6 O; 4ZOL B; 3T1C A; 1JJO A; 5KUK A; 4XDJ A; 4QJF B; 4KHP B; 5EBM C; 2A06 H; 1WPB A; 4H13 B; 4UVA A; 2YIB D; 1QLN A; 1M57 C; 2CGO A; 2IU3 A; 1DLB A; 1OCR B; 2IJI A; 3TGU H; 3RYC B; 2KG7 B; 3JAK A; 2W0F C; 3ZRS A; 3T1H O; 1JPX A; 2JGU A; 5LA6 A; 3CCE V; 5CA0 A; 2N05 A; 3MDS A; 1WB7 A; 4YHH B; 2PF4 E; 2JIZ G; 3M99 B; 4DV7 B; 1SQP H; 4FFB A; 3L71 H; 2WA4 A; 5JH7 A; 5B66 Z; 4JI2 B; 1RFY A; 1XUQ A; 1SQF A; 3ETD A; 1I94 B; 1SER A; 1P7B A; 1TAE A; 5J2T A; 4JAS A; 1Z2G A; 3H1H H; 1XRE A; 3TXS A; 3CC7 V; 3RN4 A; 4TV8 B; 5DEC A; 3ZRV A; 1YJ9 V; 3P32 A; 4AQY O; 4XDL A; 4UVC A; 3QVN A; 3W7X A; 1ORQ C; 5IY5 B; 2LFR A; 1XNR B; 4B3R O; 4PDL A; 4X66 B; 1NVP D; 2NNU A; 4X20 A; 2QDO A; 2WLK A; 3B09 A; 4JI0 O; 3U10 A; 1W0K G; 1FS0 G; 1A32 A; 3FKS G; 1CXZ B; 3CRA A; 1V55 C; 4GUN A; 5C93 A; 5H2F Z; 2EJR A; 4HYO A; 1ZLZ A; 2QWN B; 1BL8 A; 1Q86 W; 4PD4 F; 2UUA O; 1L0L H; 4GKJ O; 2EIJ C; 2FML A; 4BIZ A; 4DUZ O; 4LF4 B; 2QTS A; 1BMF G; 1M56 B; 3FAV A; 2BTQ A; 1R73 A; 1JFF A; 1GK9 A; 2ZM6 B; 4MS2 A; 3UQ8 A; 1G6U A; 3I55 V; 1B6Q A; 1VQ5 V; 2Q7H A; 2WLL B; 5IJ0 B; 5KMG A; 4UUJ C; 3WB0 A; 3ZHU A; 1Q6H A; 4WFE A; 4CZZ A; 2OYQ A; 4UCO A; 2CDY A; 2O57 A; 2UXD O; 1JMK C; 3LNM B; 3CX5 F; 5JVD A; 3OD4 A; 3CCV V; 4NXM O; 2AZ2 A; 4EFB A; 1VQ6 V; 4LC1 A; 4LR3 A; 2UUB B; 2DWD C; 3N2G B; 2DYS C; 4MTO A; 3C3S A; 4H37 A; 3SPH A; 2B5U A; 2DW4 A; 4J7K A; 2ZQM A; 2Q67 A; 4QE7 A; 2IH1 C; 3ETG A; 5J2U B; 2QEX V; 2EIM C; 3KZI Z; 3ZBH A; 1THZ A; 4ZHQ B; 4DR7 B; 5K1X A; 1SRY A; 5LXT A; 2GDS A; 1TUB A; 1SZT A; 3NXS A; 5B1A C; 1AR1 B; 1PNL A; 3JAR A; 1NQT A; 4LNU B; 2YI8 A; 1U97 A; 4JI7 O; 1R3I C; 2OCC C; 3FX7 A; 1K73 W; 4WBN A; 3AG1 B; 5L3G A; 3CWB H; 4X1K A; 3G6E V; 3D3Q A; 1HNX O; 3IFX A; 2Q5Z A; 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