2H90 | Genus

Total Genus 131

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	131
sequence length	359
structure length	359
Chain Sequence	SALFEPYTLKDVTLRNRIAIPPMCQYMAEDGMINDWHHVHLAGLARGGAGLLVVEATAVAPEGRITPGCAGIWSDAHAQAFVPVVQAIKAAGSVPGIQIAHAGRKASANRPWEGDDHIAADDTRGWETIAPSAIAFGAHLPKVPREMTLDDIARVKQDFVDAARRARDAGFEWIELHFAHGYLGQSFFSEHSNKRTDAYGGSFDNRSRFLLETLAAVREVWPENLPLTARFGVLEYDGRDEQTLEESIELARRFKAGGLDLLSVSVGFTIPDTNIPWGPAFMGPIAERVRREAKLPVTSAWGFGTPQLAEAALQANQLDLVSVGRAHLADPHWAYFAAKELGVEKASWTLPAPYAHWLE

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

molecule tags	Oxidoreductase
molecule keywords	Xenobiotic reductase A
publication title	Xenobiotic reductase A in the degradation of quinoline by Pseudomonas putida 86: physiological function, structure and mechanism of 8-hydroxycoumarin reduction. pubmed doi rcsb
source organism	Pseudomonas putida
total genus	131
structure length	359
sequence length	359
ec nomenclature
pdb deposition date	2006-06-08

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF00724	Oxidored_FMN	NADH:flavin oxidoreductase / NADH oxidase family

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.20.20.70	Alpha Beta	Alpha-Beta Barrel	TIM Barrel	Aldolase class I	2h90A00

5FF2A 1SO5A 4DF1A 3HOJA 2CZDA 3PBWA 4U4MA 1KTNA 4QSHA 2ABBA 5CGQA 4JY8A 4BFAA 1FDZA 4YMZA 1W56A 1SPQA 2DZUA 4A21A 1KFEA 2Z1BA 3W1QA 2QCDB 3O07A 2YZRA 5A8GA 2FTPA 4NUWA 2OT0A 3QJAA 4QNEA 1SO4A 5DELA 3HJZA 4IJBA 5CG7A 1YPIA 4RLIA 2JKPA 4E2BA 2YSWA 3BLIA 2DJXA 3G1AA 1F7BA 4IOTA 1F74A 4BWLC 1YTKA 3B0VC 4UFKA 2ZA2A 1VQTA 3VNDA 1WQ5A 4GUGA 3QSRA 3RK8A 3LRKA 3G1DA 3GYEA 4JDBA 1KM6A 1QR7A 4Q4KA 5LZLA 3LLFA 3DKJA 2H3BA 5D02A 3R13A 3KVMA 3W7DA 1AW2A 4IQLA 3RNDA 1PCKA 5FF0A 5D2WA 3M5YA 4FO4A 4BK9A 2QEZA 3SFKA 1KFJA 5HWNA 1KW1A 1TYGA 1GPWA 3SECA 4S2BA 1Q45A 4LS0A 1S3HA 3O63A 4MYXA 4XKYA 3VE9A 4UTTA 3NQDA 1V5XA 3GVGA 4WOZA 5HUOA 1OYAA 7TIMA 4X22A 2CZ5A 3FYPA 3P84A 3WK0A 1JRCA 4J9JA 3GZ3A 3NQAA 4HSOA 1LZOA 4YL2A 3NM3A 3GDRA 1K02A 4FNTA 3Q37A 5FEWA 5CKSA 2X2GA 3KRZA 1W5OA 5CPMA 2R91A 3G8RA 4CCDA 2I1OA 3CEUA 2DZSA 4HT3A 5FI8A 3P61A 2C0AA 5CSRA 1RD5A 2DZPA 1WAUA 4GRSA 1YTDA 1GWJA 2QDGA 4M7TA 3NVTA 3IIZA 1G4TA 2ISVA 4LUIA 3W9ZA 2A21A 4FNQA 4Y6GA 4AMAA 5BMXA 3W2JA 4ZQMA 2FJKA 3GKFA 3SY5A 2A85A 3IVTA 3NAVA 2V5BA 5BRBA 2ZZ4A 2EF9A 5BW6A 3PR2A 2Z0IA 1H7XA 4GUJA 3QMSA 1Y0EA 3G24A 4OWGA 3STEA 4JTGA 1RPXA 1VGAA 2R94A 4H4IA 2BTMA 5CZTA 3G1YA 3JS3A 3G0XA 5AHMA 4N6EA 2WSYA 3DXIA 4Y8FA 3W2NA 5I3GA 1P1XA 1LOLA 3L67A 2QCDA 1IF2A 4A3UA 4X2RA 2TMDA 1G7UA 1TJRA 2V81A 3FA5A 4OE7A 3CWNA 3PF3A 4IPIA 3HGOA 3UWWA 2VEIA 3MBFA 3HF3A 4AH7A 4NT0A 3OVQA 1KFCA 3W70A 4XBSA 3TXZA 4UFHA 3PAJA 5FEXA 3HPXA 1BEUA 3L66A 4NZJA 4A29A 3T7VA 3W2UA 1TPC1 5LSMA 2B0MA 4NX0A 4FNUA 3PSWA 2WNNA 2V5LA 2QR6A 1YDOA 4WZHA 4ZMGA 4ADSA 4FX7A 1K03A 1VCFA 3WJSA 5TQLA 3E49A 2QUUA 3TDFA 4JYDA 1DJQA 3NQ7A 3BW3A 4L4LA 2ZCGA 4O17A 4KKXA 4RKAA 1KTBA 4JYEA 3GXPA 1GG0A 1TMHA 3P74A 2DJLA 2G97A 4QJ1A 1HO4A 4UTHA 3PUEA 4MFEA 4OT7A 1IIGA 4LOCA 4ZQNA 1VYSX 2W6RA 4WY0F 1RQEA 4R33A 3W2MA 3QPZA 2OMAA 5EY5A 5J5RA 1JCLA 1QOQA 2V9DA 1LORA 2ZRVA 1EIXA 3GLCA 1QAPA 3MI2A 4HSNA 5HINA 2UV8G 1S5WA 3HBLA 3NQCA 3DGRA 2EAWA 2DORA 3PY2A 2CLOA 3VCRA 3Q58A 4AWSA 4H3DA 1FX6A 4RZ5A 2QCFA 3TX9A 3WK2A 3VI2A 3LRMA 2YXGA 3STCA 3MUXA 3L5AA 4YCOA 1SFJA 3EX3A 1S5TA 1GTEA 1XKYA 3T78A 4UTIA 2OZ0A 4EIVA 4LS1A 1PCWA 2GUUA 4O0ZA 4GWEA 1KM3A 4JX4A 4H6KA 4IMDA 1OYCA 1Q6OA 2A7RA 2GQAA 4N4PA 3N3MA 2WSRA 5DY2A 1JR1A 4PL2A 5CZJA 2WJZA 2FB3A 1TCDA 4P61A 3E12A 1EWDA 1XBXA 3HG4A 3M43A 3M5ZA 1H61A 3QH2A 3BLFA 4TX9A 5D04C 3TR2A 1RQBA 3RLVA 1SUXA 1SW7A 3C6CA 5D37A 1LDCA 1ALDA 4GFSA 2W79A 4BI5A 3RLUA 3PUOA 1JJKA 3G0SA 4MZ1A 1IXPA 5D32A 3U6WA 3LI0A 3GXNA 2VFEA 3NYZA 4NJGA 1ZFJA 3LI1A 1R2TA 1IXNA 1T8XA 4EWND 4NJHA 3SIZA 5T26A 3DZ1A 4E0CA 3S0CA 1GT8A 2J6XA 1TV8A 1L9WA 1K8XA 1SSDA 4FXSA 1IGSA 4NXSA 1K3UA 1SW3A 4DXVA 5AYZA 3HMJG 3G22A 4YXGA 3L2IA 3KFTA 2CU0A 2ZZ5A 2QJGA 1OX6A 1DORA 4M6QA 3W2LA 3PG8A 3UY8A 2JGYA 5KTLA 3CHVA 4NX5A 1KM1A 4BWLA 4ZQPA 5E93A 1HG3A 3UY7A 1JUBA 4IX2A 3LBMA 1OF6A 1TQJA 2VKZG 3W2KA 2VOMA 3N14A 4S1FA 2J88A 3G0UA 3P80A 1K7FA 1VYPX 3FKKA 3N19B 3L65A 2Z2UA 1DBTA 1OJXA 2GVJA 4LVGA 1WOBA 2J27A 2YDAA 1W8SA 3MW7A 4AHPA 1WBHA 3C3NA 2A1YA 5EPDA 3FOKA 2B7QA 3WFAA 4Y90A 3TH6A 4ALDA 1AG1O 1IXOA 3G1XA 1I45A 1IIHA 2EGZA 4O18A 8TIMA 3W86A 4RK8A 4DQWA 4UFLA 1WX0A 1G69A 4FX6M 4LU0A 3P62A 4PC8A 3B0UX 2I14A 3G1VA 2VFFA 3HO8A 2NLIA 2Q8ZA 3W7NA 1B4EA 3WK1A 1RZMA 3FIGA 1XBVA 3TQ0A 4GUFA 4UR7A 5HMSA 4MY1A 3ABRA 3R8RA 1ZENA 4FNPA 2ZRUA 3S1UA 3NO5A 3OVPA 3UWYA 3VFLA 3WJZA 3S1VA 3TSDA 4ZQCA 3KAOA 3H54A 4HNNA 5HUPA 1SO6A 4EOUA 4UXDA 5DN1A 4NZFA 4WD0A 3W7GA 4IGHA 3CQ0A 3IIXA 3PWAA 4JYFA 5F2LA 1F6PA 4JTIA 2HS6A 2X1UA 2E6YA 1A5BA 3EX2A 1PVNA 1X6UA 4MJZA 3DHFA 4XQ6A 3NQGA 4LWWA 4DF0A 4OV4A 1PL9A 3NPWA 3EEGA 3NQ8A 4MVAA 1BWLA 1I2PA 4JTHA 2F7FA 3UWQA 3DFQA 1ICSA 1IXQA 4LVDA 4WJEA 3S8HA 5I3KA 2WNZA 1TTJA 3HGSA 1PS9A 1KM0A 1O60A 2E09A 3W1TA 3UWZA 2BLEA 1ZNNA 4N9CA 3DFPA 3F03K 3LRLA 3FJLA 3O8AA 3TSBA 3NQVA 5L9FA 1ONRA 1ME7A 4MY9A 4RXGA 3P81A 4MY8A 1UUOA 3ABOA 2IQTA 2ZTJA 3TQVA 1V7YA 2WNQA 1OFPA 4IMCA 3LCLA 5AHIA 4RXFA 2C14A 2YFOA 1GTHA 3KVLA 4UTJA 4YLWA 1J5TA 3EKZA 4LUJA 2V2DA 3M5XA 2BX7A 1ZCOA 2R8WA 1LTDA 4UTWA 3DBPA 1TTQA 1T99A 3C2VA 1B57A 1L2UA 2J9YA 3NL6A 1FDJA 4AWUA 3P60A 3W85A 3HGJA 3PG9A 5DBTA 4HNTA 5ABTA 1KFKA 4FB7A 1U5JA 1TSIA 3A23A 4POCA 5CZSA 3TK7A 2ZFAA 3G3DA 3S1WA 4Y9AA 1YXCA 2CLKA 3EWBX 1F2JA 3UD6A 1ICPA 5HJLA 4DEFA 1GOXA 2A2IA 3HGRA 3W7LA 3GDKA 5AHLA 1JUEA 1YXYA 4TIMA 3NZ1A 1EWEA 2O7SA 3C2OA 1W3NA 2C13A 1R30A 4IMGA 1SZEA 2TRSA 5F2IA 4CNOA 4P2VA 1YPFA 1P0KA 1AW1A 4PH6A 5AC8A 2H8XA 3TAOA 5D38A 3O6DA 5BMWA 1GJPA 2FPTA 4ADUA 1CX9A 3QZEA 4DBDA 4Q32A 1D9EA 1Q3NA 3LXAA 3S9YA 5H2ZA 3GIYA 3LV6A 2KZHA 1OFAA 2GJNA 1ZALA 4MPQA 2Z6JA 3PB2A 1FXQA 3DFNA 2ZTKA 1N55A 2ZZ1A 2Z6IA 1TO3A 1AW5A 2PRHA 2HMCA 3CWOX 1W5PA 1BKSA 3B05A 1U83A 4OQVA 2B7PA 2DZTA 2X1TA 1SZFA 2TSYA 2YPIA 1W3IA 5EYWA 4CNPA 1A5AA 1ADOA 3W1RA 5CPLA 1KFLA 3CU2A 3PB0A 3L0KA 2ZRZA 1I2QA 3W7OA 2ZDRA 3STFA 4EF8A 3NOEA 4UFIA 3TQKA 4PCFA 4LC6A 1NF7A 2JGQA 1H1ZA 1F73A 5K2ZA 2CLMA 4FXRA 3BPWA 3VE7A 3KX6A 4O15A 5K9DA 3MWAA 2VENA 4CNNA 3PC0A 2H8ZA 3F1QA 1A5SA 3INPA 4Z0JA 5FF7A 1I4NA 2NWRA 4DPQA 4OV9A 3LCXA 2OJPA 1GQNA 5HWJA 2GOUA 1THFD 2I9EA 3D0CA 3NNTA 3LM7A 1KLYA 2Y7GA 5U4NA 3NQ2A 4Z1DA 2DZWA 1VR6A 2QUTA 3MI6A 4JTSA 4UNKA 2Y85A 4HPXA 4N2YA 4MOZA 3S42A 5F4SA 3TKFA 4IXXA 1TIMA 2E77A 1X8FA 5IBXC 4N02A 3NA8A 4CCCA 3N2MA 1G67A 5AHNA 3HG3A 2QJHA 2NZLA 4GNJA 1VLWA 1DQWA 4ORIA 2QCMA 3P5ZA 3QW3A 4BF9A 1MZHA 2WKJA 3WJWA 3LCWA 3P8IA 3DFTA 3C2EA 1H63A 1X1OA 4X3ZA 5LNSA 1NEYA 1SSGA 3UZJA 1DKWA 4QITA 1H62A 4UMBA 1A53A 2YGYA 1BWKA 5C5YA 1KBJA 1W31A 4JTJA 2RHGA 4WOQA 3DU0A 3LHUA 3BG3A 1B9BA 1DL3A 3QSTA 3TJXA 3S5OA 3M0ZA 1DOSA 1JCXA 3QQ0A 1LOSA 1Q6LA 3A5FA 4O11A 2QCGA 2PC4A 3HQ1A 2A0NA 4MLJA 3PUDA 3DFSA 1RQHA 1H7WA 1XDMA 4TO8A 3W7QA 1KTCA 2A4AA 2YYTA 3RF9A 1LM1A 3O6CA 4NU7A 2YCEA 4UTMA 3A5VA 3NZRA 2C19A 1W5QA 3UWVA 5K4XA 4RZ4A 2E5DA 3QC3A 5KZDA 2LLEA 3LV5A 3GAKA 2X1RA 3W83A 3CB8A 2PRLA 3LTYA 4DO6A 1QMLA 2A5HA 3KVKA 4O19A 2VFGA 3C4UA 4O1CA 2QKFA 3LTPA 2V8ZA 1M6JA 1NF0A 4QM1A 4FHAA 3KOFA 4GUHA 1QFEA 2EPHA 1XDLA 2QCLA 4O1AA 4GUIA 2CFFA 3LTSA 2VXNA 3MHFA 2AAMA 3WJYA 1OFBA 3A21A 3ZWTA 2VEKA 4K7YA 5E0KA 4IUOA 2RKXA 3DI0A 3TJLA 1EEPA 4XUGA 1C8VA 4FIRA 1FWWA 3RFAA 1AL8A 2ZZ7A 1JULA 2BXVA 3IGUA 1ME9A 1TREA 4UIOA 3W1XA 1LROA 4N9BA 3HG2A 1SFLA 3N9RA 4JX6A 2ZZ3A 3M41A 3W22A 3KHJA 1FBAA 5L6UA 3W7RA 1TPDA 3CEPA 1X1ZA 4AXKA 4ONVA 4B5NA 3LXCA 3UPBA 5I3HA 1QPQA 3DH7A 3M7WA 4PODA 3BARA 3MYPA 1KA9F 2OT1A 3OHIA 4O52A 4TR9A 2Y70A 3NDOA 4FNRA 4GE8A 3OIXA 1YYAA 1LCOA 1TRIA 2J9XA 3UZ5A 2NX1A 4JN6A 3P7YA 3TCEA 1ZY9A 1FWTA 5D2VA 1GVRA 3E9AA 5G2WA 4O10A 2HSAA 3GDMA 2V2HA 1JCYA 2EKCA 1XFBA 3QMTA 5G2IA 4GBUA 5AB3A 4LVFA 4O1DA 1J4EA 1UUMA 4NNAA 2O7QA 5DCDA 2E6DA 3NM1A 4LV9A 1NVMA 4MJMA 1Z41A 1HO1A 3TMQA 1ZHAA 3G1HA 1JUKA 5TIMA 3NR0A 3I7SA 1EP3A 1DQXA 5D09A 4O4VA 5HR7A 1FWSA 2Y6ZA 2NV2A 2YW4A 2RDWA 3W74A 1JRBA 4UFJA 3IIVA 5H91A 4FF7A 1ME8A 2VEPA 4UUIA 4WQ6A 1W5MA 5BNKA 3CIXA 3NPUA 4O16A 2Y63A 1VJIA 4K38A 3C0JA 4Q33A 3ELFA 3W7IA 2ZA1A 3EX6A 4N4QA 2Y89A 1TPWA 2QCHA 3DI1A 1ZAIA 4RX0A 1FCUA 3CM4A 2WPBA 3K30A 1WA3A 2FB2A 5AHFA 3U8GA 3SJ3A 3A22A 1TRDA 1R47A 3L5LA 1S5VA 1H51A 1EX5A 3EX4A 4O8RA 1DVJA 3E96A 3LCHA 3KRSA 4I7VA 1GVOA 2DZVA 2ZA3A 1L6WA 4IMFA 5LKYA 3KVJA 2W0UA 3E02A 3NPXA 2ZBTA 3FLUA 3ANYA 3HB9A 3GR8A 4IMEA 1O94A 5HR6A 2HTMA 2FQIA 3FKRA 4HIBA 4NJJA 1TPB1 1XUZA 4HN4A 5DLCA 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chains in the Genus database with same CATH topology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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