2HF4A

Crystal structure of monomeric actin in its atp-bound state
Total Genus 123
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
123
sequence length
374
structure length
364
Chain Sequence
DEEVAALVVDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNTPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVSHTVPIYEGYALPHAILRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFTTTEEREIVRDIKEKLCYVALDFEQEMATAASSSSLEKSYELKDGQVITIGNERFRCPEALFQPSFLGMEACGIHETTYNSIMKCDVDIRKDLYANTVLSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWISKQEYDESGPSIVHRKCF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Contractile protein
molecule keywords Actin-5C
publication title Crystal Structures of Expressed Non-polymerizable Monomeric Actin in the ADP and ATP States.
pubmed doi rcsb
source organism Drosophila melanogaster
total genus 123
structure length 364
sequence length 374
ec nomenclature
pdb deposition date 2006-06-22

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2hf4A01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2hf4A02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 2hf4A03
2BTFA 2P9SB 4JAXA 3CJ9A 2J4RA 2EWSA 4H5TA 3ZEUA 3HM8A 1DEJA 1ATNA 2FXUA 1QHAA 2ZWHA 1NGDA 5LJWA 5F1XA 4BRLA 2QWPA 3SLCA 3WUHA 4WYBA 1X9JA 3EN9A 3QICA 3HSCA 2IVPA 3FZHA 1HLUA 3H3NO 3WT0A 3FZKA 4EAHD 1BG3A 1MA9B 2NZTA 1RGIA 3CJ1A 2E1YA 4PKIA 2D1KA 3CJCA 1WUAA 3O80A 4XEIA 3VEXA 5AZJB 4BVPA 3BF3A 3D2FA 1GLDG 1MDUB 2D0PA 3KZBA 4B9QA 4KBOA 5AFUA 5BRFA 2V7ZA 3FR0A 5KPRA 1HUXA 2OANA 2QWLA 3VOVA 3ID8A 2FLOA 1XQSC 3MN7A 1GLJO 4CZFA 3IDHA 4BR9A 3MCPA 1WOQA 4E1JA 1K8KB 5KPZA 3AY9A 1BOTO 2QM1A 4CJ7A 3FE1A 3JXUA 4JD2A 5AQWA 3QBXA 4CZMA 2VWBA 5AR0A 2NLXA 4O5FA 2D0OA 2P9PB 3UKRA 3VEOA 2V52B 2ZF5O 5AQTA 3WXIA 3LL3A 4B1XB 1R59O 3VGLA 2V7YA 1HKGA 1BO5O 4FWPA 3GG4A 5AQHA 2FF3B 4EHUA 1NGCA 2P9IA 4BR4A 3C0BA 2FSJA 2E8AA 4I6MB 5KPTA 3A5OC 1Y64A 3VGKA 5BN8A 2E20A 3MMVA 1BA0A 1TUYA 4A2AA 4BRDA 3C7NA 1OKJA 4BRHA 4FPAA 4K42A 4EHTA 2ZGZA 3M3ZA 4BG8A 5ADXH 3C7NB 4NB4A 5BN9A 4CBXA 5JLHA 1BU6O 3W3DA 4FSVA 4BRFA 5JLFA 2Q2RA 1NGGA 2FSNA 3FZMA 3H1QA 2YI1A 5AQVA 1NM1A 4CBUA 1GLAG 1X3NA 4M7XA 4H0TB 5ELZA 4H0PA 2IVOA 4MO4A 3UKUA 5AQGA 5F2RA 2E2OA 4CZIA 5BRDA 3H46O 3ZX2A 4RCHA 3ZETA 4EIAA 1JCEA 3UE5A 1TYQA 1ESVA 2GWJA 2P9KA 4FWMA 3CERA 4JHDA 1BUPA 3VGMA 3AAQA 4BRIA 3P4IA 5AQLA 4H0OA 1NGHA 2P9KB 1GLBG 2ASMA 4PKHA 5AQMA 1NLVA 3WEEA 2A3ZA 2P9SA 4BRCA 3VEWA 2P9NA 3M6GA 3F9MA 2GEMA 2H3GX 4BROA 3WEEB 3DXMA 3L0QA 3SK3A 3GDQA 3B8AX 3KHYA 4Y0WA 3FLCO 4AM7A 2A41A 2P9NB 3WXKA 4CBWA 3DXMB 3ZX0A 2ZGYA 4FO0A 4BQZA 5BPNA 1T6CA 3EKUA 4IXCA 4PKGA 3ATUA 5AZJA 2CGKA 4CZEA 2FSKA 1E4FT 2HMPA 2Q1NA 2WUSA 3HBTA 4BGBA 4K43A 5AQSA 3RSEB 4J8FA 1HJOA 3MN5A 5AQJA 4BRGA 3AAPA 3O1WA 1K8KA 4H5RA 3I33A 2BUPA 1NGAA 3FGUA 4RWTA 2E2NA 4H0YB 1Z6RA 3ULEB 3EO3A 3CIPA 4QS8A 3U9DA 3VERA 2P9PA 2P9UB 3LDNA 5TKYA 4M63C 1GLCG 3VETA 4RTFD 2Q0UA 1IG8A 1NBWA 2YHXA 1U2VB 3H3OB 4ISGA 4BC4A 5B8HA 3JS6A 4H0XB 3WXLA 4IZ9A 4BR0A 4BC2A 4I6MA 4CZLA 1LOTB 1Z05A 2GUPA 4IJAA 4GNIA 4BRAA 5CE3A 3A5MC 3H1VX 1KAZA 3G25A 3A5LC 4B1ZA 5FPDA 2PAVA 3BEXA 3W0LA 1D4XA 1HX1A 5EOYA 4CI6A 5AQUA 4BRQA 4MLEA 2Q97A 4JNEA 2E2PA 2CH6A 1E4GT 1QZ5A 1ZXOA 4CZKA 5BPLA 3EZWA 1XUPO 4XH5A 4BR2A 2YJFA 1BWFO 3CJ7A 4O8KA 4CZGA 5FPEA 5AFUH 3CQYA 4QS9A 4DCHA 4HTLA 4BG9A 3IFRA 3L4IA 2GTDA 4YDUA 1YAGA 4YDUC 5E26A 3DAWA 5BRHA 3CJBA 4FOEA 3LM2A 2Q31A 4IWVA 3DXKA 1H1VA 3TPQA 1SQKA 2ITMA 2A40A 1ZC6A 5EX5A 3VESA 1KXPA 1MWKA 1CZAN 2Q36A 3LM9A 2HF4A 1V4SA 4B1YB 3A5NC 3DXKB 2CGLA 4AM6A 2D4WA 2YHYA 5JMVA 1YXQA 3TU5A 3R8EA 1DGKN 4FWOA 3DWLA 5FPMA 3O6WA 2F9TA 4DB3A 1DKGD 1Q18A 3HTVA 5AQRA 3VPZA 1KAXA 1MWMA 2NRHA 4JN4A 5I9EB 3HZ6A 4PL8A 5AQXA 2A5XA 1LCUA 5AZIB 3MDQA 2IVNA 2A42A 2CGJA 4ISFA 2E88A 3FZFA 3MN9A 5AQQA 4ISEA 3R9PA 3UB5A 2QWRA 3OHRA 4CD3A 3CHWA 2CH5A 2PBDA 1NGFA 1V4TA 5KQ8A 1YVNA 4FWNA 3O08A 3CQXA 4A62A 2Q0RA 4QS7A 1SZ2A 3D2EA 5AQPA 4H0VB 4BGAA 4BVOA 4FWLA 3RSEA 4BR7A 3U4LA 3KVGA 3HI0A 1G99A 1C0FA 3VF2A 2QWMA 1JCFA 1JCGA 3D2EB 1NGEA 4MLHA 4LC9B 4BRNA 4K41A 3MN6A 3GBTA 4FWSA 3LDQA 4XH1A 3GE1A 3DJCA 4H5VA 3ULEA 2YCHA 4BRKA 1QZ6A 1ATSA 3IMXA 3QBWA 4WQ5A 4F9OA 4WQ5C 4FWQA 1J6ZA 2P9UA 3ZEUB 3S41A 3R6MA 3QFUA 3ZX3A 4FL9A 4BREA 1U6ZA 1U2VA 4GY2B 2ASPA 1GLFO 2W40A 4FWRA 3ATVA 4K25A 4EFHA 4C23A 5BPMA 5KQDA 2YHWA 1T44A 3H45C 1BA1A 4BRPA 3M1FA 2ASOA 1RFQA 5AQFA 4MO5A 1P8ZA 1HPMA 4IJNA 1XC3A 4BRMA 2GWKA 3D7EO 5ADXA 4B1UB 1GLEG 3D2FB 3J8AA 1RDWX 3U9ZA 3ENOA 1HKCA 5LJVA 3LDOA 4HWIA 3SMSA 2HF3A 4DHYA 3O1BA 5EY4A 3BF1A 3O4WA 3GOIA 3SMPA 3ENHA 3VENA 2AA4A 3QDKA 4FOIA 3BUZB 2QWQA 1ZBSA 1SAZA 4JD2B 5FPNA 3CETA 5AQZA 5E84A 3IUCA 3U8XA 4IO8A 2E1ZA 5BREA 2IIRA 3VEVA 3FZLA 2QXLA 3UKRB 3O8MA 1S3XA 1EQYA 3FFKB 5LY3A 4BQLA 1NGIA 1ATRA 3VF4A 2AP1A 3GL1A 1QQNA 4A2BA 3VEZA 2E2QA 2QW9A 2A6AA 2GELA 2P9IB 2YJEA 1BDGA 3CI5A 1NMDA 5BR9A 2V51B 3H6EA 4FPBA 4XH4A 1YUWA 3EL2A 4CZHA 3WXJA 3AARA 3WQTA 5F0XA 5JICA 3BP8A 1NGBA 4BC5A 2QWOA 3LDLA 3O5BA 5AQKA 5AQIA 4CZJA 3VEYA 3WQUA 4A61A 2F9WA 4DQ8A 5AZIA 2VCPA 3QB0A 1NWKA 2KHOA 1T6DA 5EVZA 3SJHA 2VYPA 3I8BA 2W41A 4PL7A 1X3MA 5EXWA 4M7YA 4H03B 4BC3A 2UYTA 1QQOA 2FF6A 1GLLO 4NO7A 3MK6A 4WQ4A 4WQ4C 3QMLA 5AQNA 4Z94A 4B1VA 4FWKA 3UKUB 1QQMA 4BR5A 3VF6A 3LDPA 3ZETB 3A0IX 4H5NA 2P9LA 5AQYA 1NGJA 4CD1A 1TYQB 3EKSA 5AQOA 3L6QA 4H5WA 1KAYA 4L3QA 4JHDB 3CJAA 1IJJA 3A8YA 2I7PA 3QFPA 2P9LB 4B1WB 2QWNA 1HKBA 1S22A 2I7NA 2HOEA 2DPNA 1TUUA 1C0GA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2BTFA 1QHTA 1SUQA 4AH9A 1YITN 1VSKA 4UQGA 4H5TA 4DQQA 2FXUA 4OPAA 3ZT0A 4G9ZA 4FM2A 4DFKA 3ZT2A 2QWPA 1HNWK 4B9SA 4KTQA 1JLQA 2D0AA 3FZKA 4DS4A 2D1KA 3CJCA 2FC0A 4U67L 3ZYYX 3DYAA 5AZJB 4DF8A 4B9QA 1MDUB 2D0PA 3FR0A 4CW7B 5KPRA 4CJFA 4JI6K 1BISA 3MN7A 1GLJO 4B9UA 3HL8A 5DM6L 1XMOK 1WOQA 5KPZA 4QCLA 3O4QA 5M1KA 4CJ7A 4JRPA 4FLYA 4OO1J 3P5JA 3V6DA 2VWBA 3S5TA 4E72A 4FLWA 4JKGA 4B1XB 1D8YA 1IKWA 3LPUA 3S3MA 1HKGA 3PSFA 4JI0K 1BO5O 3F73A 4BACA 1UA1A 4O0JA 1X9SA 4JKGB 4EHUA 1C6VA 2QA4N 3SQ4A 3RMDA 4KHUA 2YHAA 1W0HA 2VGNA 2E8AA 4FXDA 2UXBK 4I6MB 5KPTA 3VA3A 3NHGA 1ZBLA 1HYSA 1GOCA 5BN8A 2E20A 1VRTA 1TUYA 2D5RA 3M8RA 4EHTA 1SL2A 3VQDA 1J9AA 2E4LA 4HUEA 3OBYA 5BN9A 3TI0A 1VQNN 1DT9A 5JLHA 4CK1A 2BH1A 4BRFA 2Q2RA 1NGGA 3KKRA 3ZSZA 3NF8A 4A5AA 5GAGP 2AJQA 1NM1A 1FK9A 3Q7CA 1BI4A 2WTUA 4OX9K 3MXIA 1HQUA 2NRRA 1TK0A 2VG7A 3UKUA 1J54A 5AQGA 5F2RA 4DWIA 2E2OA 5BRDA 3ZX2A 1BI4B 4EIAA 2XO7A 1TYQA 2GWJA 2P9KA 1VQKN 3C6UA 1BCOA 1VQ7N 1QSSA 1NGHA 2P9KB 3VTIA 1SL0A 3NAEA 5AQMA 4L8RB 1NLVA 5J1EA 3MAQA 5J2NA 2P9SA 3MEEA 3VEWA 1Z25A 2OCEA 4CESA 1REVA 3V9XA 4M3TA 4MQ3A 2GEMA 5SZTA 3T69A 3L0QA 2VWKA 1LWEA 4WCEL 3SK3A 5M1QA 3B8AX 2A41A 3WXKA 4Z4CA 1TKXA 4KHQA 2ZGYA 3NF7A 3TSQA 4FO0A 5BPNA 4OKEA 3IAYA 2Z1HA 1BQNA 3SNNA 3AVJA 3PIOL 2IS3A 3HBTA 1YJ9N 3F2KA 3IKMA 1YHQN 4CJ4A 3LP0A 4EP4A 2XY5A 2DTUA 3DLKA 1HJOA 3QEPA 3O1WA 1K8KA 3SAHA 1WAFA 2C1GA 5C2DA 3RTVA 3VN5A 4H0YB 3TSUA 5GAEP 5AJ3K 1RTDA 1IG8A 2YHXA 4IBNA 2OTLN 4CFBA 3HJFA 3K5MA 5HRPA 5GAHP 1K8AO 4BC2A 4NXNK 1K6YA 3R1XA 4DR7K 1I94K 4GNIA 4BRAA 4KHYA 1HQEA 3WNFA 1VSDA 3BEXA 3W0LA 4X65K 4DQRA 3AGKA 1HX1A 3J7AP 4CI6A 2QKKA 2HHSA 1TKZA 5AQUA 3OTOK 4MLEA 2XY7A 2G8HA 3AVHA 3PIPL 1U45A 4FJ9A 3TTCA 4CJ5A 4FK4A 3CJ7A 4CHQA 3MWTA 5AFUH 2ZD1A 3CQYA 4QS9A 4CF8A 3SUQA 3EE9A 3DLLL 1TL3A 4IOAL 3DLBA 4LH5A 1WAJA 3TAFA 5BRHA 4FOEA 4F3OA 3DXKA 1H1VA 2ITMA 2A40A 3OYFA 5EX5A 4IOCL 3LM9A 5CZ2A 1V4SA 4CFDA 3DXKB 3LANA 3AA5X 4OPJA 4NLBA 1HJRA 2D4WA 2EX3A 2YHYA 3CMEN 4E7JA 2BDPA 2A1RA 4B3TK 5FPMA 3O6WA 4GV3A 3ZSRA 1DLOA 4DV6K 4CGGA 5I9EB 5AQXA 3KJVA 3AVAA 3V81A 3RMAA 4ISFA 2ZJQL 3RMCA 2RKIA 4JKCA 1KVAA 5J2QA 1TV6A 2QWRA 3O9RA 2G8VA 1NGFA 1V4TA 3ISNC 2OPSA 4E7KA 4E7HA 3CQXA 4CEQA 1GOBA 4C8OA 3D2EA 4H0VB 1VQ8N 4DUZK 1S9GA 4FWLA 3RSEA 4BR7A 4GV9A 4H4MA 3SQ1A 5LMUK 4FLTA 2O8FA 3D2EB 1C1AA 3HO1A 1RT5A 3I0SA 4KTZA 4DFMA 2ETJA 4LC9B 4AHVA 4K41A 4BRNA 1ILYA 2HHIA 3PV8A 3LDQA 2O8FB 4WQ5A 3QBWA 4ZTFA 4WQ5C 3O3FA 3L2WA 3ZEUB 4FL9A 1WBBA 1W7AA 1O1WA 1VQPN 4CGIA 2ASPA 2HHHK 1RT2A 3TWHA 1M90O 1SKRA 5KQDA 4CIFA 3H45C 3AV9A 1TAQA 1BA1A 4DKWA 3KKSA 1C1CA 1RFQA 1HPMA 4E0DA 1XC3A 4BRMA 4EZ6A 3CXCM 3D7EO 4H4OA 3I56N 1RDWX 3U9ZA 1Q7YO 3MEGA 3J7YP 4DLGA 3NH1A 4HWIA 3IS9A 4BDPA 5KGXA 3O1BA 3SUOA 5FRMA 4A57A 4CJVA 4IFVA 3ENHA 2Z1JA 4OKKA 4O44A 4YOYA 3DOLA 4JD2B 5HRRA 5E84A 3IUCA 4BWMA 4KPYA 4E1NA 2XY6A 3QEXA 3SQ2A 3MX5A 4NCBA 1KVCA 3ZT4A 4LFBK 4WF9L 4BDYA 4IDKA 4FLZA 1ATRA 3VF4A 2ZQBA 3AA3A 2HBKA 3TSPA 2P1JA 1QQNA 2E2QA 2A6AA 1HMVA 2P9IB 5BR9A 5FROA 3TAQA 4LF4K 1YUWA 3AVLA 3WXJA 3AARA 1RBUA 4ELTA 3BP8A 1DTQA 1IBKK 1NOYA 3V1QA 3O5BA 4RW6A 4M3XA 4K8XA 3WQUA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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