The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
21
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sequence length |
57
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structure length |
57
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Chain Sequence |
SALHWRAAGAATVLLVIVLLAGSYLAVLAERGAPGAQLITYPRALWWACETATTVGY
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Membrane protein
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| molecule keywords |
FAB HEAVY CHAIN
|
| publication title |
Structural and Functional Consequences of an Amide-to-Ester Substitution in the Selectivity Filter of a Potassium Channel.
pubmed doi rcsb |
| total genus |
21
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| structure length |
57
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| sequence length |
57
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2006-06-26 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Helix Hairpins | Helix Hairpins |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 4PA6 A; 4MTO A; 3SPC A; 3RVY A; 3F5W C; 3JYC A; 5EBW C; 4F4L A; 3GB7 C; 3VOU A; 3LNM B; 1ZWI C; 2HVJ C; 2AHY A; 1OCC C; 1R3J C; 2EIM C; 4ZBM A; 5KUK A; 4XDK A; 2WLH A; 3SPI A; 2KB1 A; 3LDC A; 3BEH A; 2IH1 C; 3SPG A; 3E8F A; 1BL8 A; 3E8B A; 1JVM A; 1V55 C; 3E83 A; 3K03 A; 4MVQ A; 5B1B C; 2HFE C; 2X6C A; 2Y69 C; 4GX1 A; 2BOC C; 2A0L A; 2X6B A; 4UUJ C; 4DXW A; 4JTC B; 2EIL C; 4OXS A; 4MSW C; 5IY5 C; 2DWE C; 3SJQ C; 3SYA A; 2WLL A; 1M56 C; 2EIK C; 3OGC C; 4G27 B; 4EKW A; 4WFE A; 4JTA B; 5E1A C; 1J95 A; 3UKM A; 2EIJ C; 2IH3 C; 3PJS K; 2X6A A; 3K0D A; 2Q67 A; 3RBZ A; 2QKS A; 3ASO C; 3T4D A; 3FB8 C; 2A79 B; 3AG1 C; 2W0F C; 3E89 A; 4LP8 A; 4H37 A; 3ZRS A; 4P9O A; 4PA4 A; 2EIN C; 2Q68 A; 4HZ3 A; 4PDV A; 4WFH A; 4XDJ A; 2WLN A; 1M57 C; 2HJF C; 3SYQ A; 3FB7 C; 4QE9 A; 4CBC A; 2JK5 C; 2DYR C; 1LNQ A; 1QLE C; 3STL C; 3F7Y C; 4R6Z A; 3SYP A; 2Q6A A; 2ATK C; 4PA7 A; 3OR6 C; 1G4Y B; 1R3I C; 5KUM A; 3SYO A; 5EK0 A; 4TWK A; 3IGA C; 1OCO C; 4KFM A; 4X88 A; 4GX2 A; 4MVZ A; 3TET A; 4G28 B; 1XL4 A; 4RUF A; 1XL6 A; 1S5H C; 4P9P A; 1P7B A; 1R3L C; 4XDL A; 3STZ C; 3ZJZ A; 4BW5 A; 4MTF A; 4J9Y B; 3ABM C; 5EBL C; 3F7V C; 4MVU A; 4HYO A; 2DWD C; 5BZB A; 2OCC C; 1KKD A; 3T2M A; 3E8G A; 3FB5 C; 4WFG A; 4J9Z B; 4MW3 A; 2R9R B; 3AG2 C; 3SPH A; 3KG2 A; 2K1E A; 2H8P C; 3OR7 C; 5EC1 C; 1OCZ C; 4LCU C; 3EFF K; 4MVR A; 4PA3 A; 3K0G A; 4I9W A; 4PDL A; 4PDR A; 4R8C A; 1R3K C; 1K4C C; 3RW0 A; 3X2Q C; 3SYC A; 3K04 A; 4LBE C; 2ITD C; 4MVS A; 4MW8 A; 4PDM A; 4JTD B; 2WLK A; 2WLI B; 3AG4 C; 4PA9 A; 4R50 A; 3SPJ A; 4MS2 A; 5CBH A; 4X8A A; 4WFF A; 2NLJ C; 2WLM A; 3TCU A; 3ABL C; 3E8H A; 3LUT B; 4RUE A; 3FB6 C; 3K06 A; 4RO2 A; 3WG7 C; 2AHZ A; 5CBF A; 2ITC C; 4QNH B; 3RVZ A; 5J9P C; 4R7C A; 3ABK C; 4GX0 A; 1ORQ C; 4MVO A; 4RAI A; 2WLL B; 2Q69 A; 4QE7 A; 3E86 A; 2BOB C; 2P7T C; 2QTO A; 2WLI A; 5EC2 C; 4MVM A; 3LDE A; 2DYS C; 2ZD9 A; 3R65 A; 3ASN C; 5CBG A; 4H33 A; 3LDD A; 4MTG A; 3IFX A; 5B3S C; 5B1A C; 1V54 C; 2HVK C; 3T4Z A; 3K08 A; 2WLJ A; 3UM7 A; 2HG5 C; 4X89 A; 1OCR C; 2YEV A; 1K4D C; 4GX5 A; 4P30 A; 3T1C A; 2ZXW C; 4P2Z A; 3OUS A; 5EBM C; 2A9H A; 3OUF A; 3AG3 C; 3HPL C; #chains in the Genus database with same CATH topology 4DK0 A; 4WF9 V; 3GWO A; 1SC5 B; 3KCX A; 1GO3 F; 2QKC A; 2GTS A; 5B1O A; 2AHY A; 1VQ8 V; 1BQZ A; 1Y4M A; 2E74 B; 3RYI B; 1V55 C; 2Y69 C; 4IIJ A; 4CH6 A; 4X9Q A; 1R1B A; 5IT9 N; 3H01 A; 4PD4 F; 2UU9 B; 1OCZ B; 4MSW C; 1VEW A; 3HB3 B; 5B5E Z; 3OGC C; 2QDO A; 1AB3 A; 3CCV V; 3U10 A; 1VF7 A; 2X6A A; 5AG2 A; 4NVP A; 3OAA G; 2FTK A; 4PA4 A; 2BE3 A; 4JV5 O; 1AJP A; 2WLN A; 1M57 C; 3BY6 A; 1QLE C; 3BAA A; 4LC1 A; 3F7Y C; 3B40 A; 2FB5 A; 4TWK A; 1UFI A; 2Q5Z A; 1XL6 A; 1S5H C; 4X1I A; 4MTF A; 1OZ0 A; 4HYO A; 4GKK O; 2F4V O; 2HR3 A; 2ODM A; 4DV0 B; 1AI4 A; 3RW0 A; 3K04 A; 3AEI A; 3HKC A; 4NXN O; 2WLI B; 4R50 A; 1N0N A; 1Q82 W; 5LXT A; 1M4U A; 2X7R B; 1NR7 A; 3B4S A; 4GX0 A; 4DRX A; 2LFR A; 4QE7 A; 3E86 A; 4NXM B; 3D36 C; 4F6R B; 1NVP D; 5KHI A; 5LHI A; 4CS3 A; 2YXL A; 5CA1 A; 3RGB A; 3OFN G; 2HVK C; 2EJR A; 2EIN B; 4JI6 O; 1A32 A; 2LFS A; 4DR3 O; 3T1C A; 4P2Z A; 1VF5 B; 1SA0 B; 3AG3 C; 1KD1 W; 4TV9 B; 5EBW C; 2IU3 A; 1W2B U; 3OTF A; 3J80 N; 2Q7H A; 5L3D A; 1AI5 A; 1BL8 A; 5GON A; 2LW1 A; 1XMO O; 3H1L H; 5IE9 A; 2V1D A; 3ZHU A; 2UUA O; 4LF7 O; 4QPK A; 3OEH G; 4TV8 B; 4WFE A; 2BSK B; 4JI8 O; 4JZG A; 1NR1 A; 4J10 A; 3FB8 C; 4IYI A; 4OX9 B; 2CH7 B; 5FPR A; 2W0F C; 4NR1 A; 3E89 A; 2UUC O; 3ML0 A; 3ZCC A; 4F6E A; 4JI0 O; 2Y4U A; 1HW7 A; 4LFB B; 4YHH O; 1L1F A; 1HNZ B; 1BMF G; 2DYS B; 2LGW A; 2QWN B; 5KUM A; 1XMQ B; 4FLT A; 3K59 A; 1KEC A; 4J9Y B; 2DN9 A; 4X64 O; 2AXT Z; 5A2Q N; 1NTM H; 1N33 O; 1BS3 A; 2LO1 A; 1NQT A; 4I9W A; 3W7U A; 5B1B B; 4FPP A; 4TSF G; 2ILM A; 2PUS A; 3GVM A; 1FFX A; 2N05 A; 3I55 V; 2F93 B; 4TQF A; 3SJA C; 2JGD A; 4OPH A; 1RSO A; 4I5S A; 2A06 H; 2YEV B; 5IDJ A; 5LMN B; 1RPR A; 4H0L B; 1ENV A; 5CBG A; 1H2G A; 4H33 A; 4BW9 A; 4UVA A; 5CA3 A; 4BIZ A; 1V9P A; 2WLJ A; 4E4E A; 2YI9 A; 4DR5 O; 5KAF Z; 4GX5 A; 2RN9 A; 3CHX A; 2ZR3 A; 4TUY A; 4RWU A; 3OUS A; 1ZL8 B; 2A9H A; 3APQ A; 3HKB B; 4PJ0 Z; 4DV5 O; 2HVJ C; 3SGI A; 2Q73 A; 3RT3 C; 1HNW O; 3OMA B; 3LDC A; 3ZHR A; 3E8B A; 3OEE G; 3K03 A; 4O4J A; 4ICG A; 1AP6 A; 5IY5 C; 2QEX V; 5JCO C; 4O2B A; 1M56 C; 5BMV A; 1BE3 H; 3BAB A; 3X2Q B; 3T1Y O; 2PTM A; 2C2A A; 2VRZ A; 4JI4 O; 4H37 A; 3WB0 A; 5K1P A; 3JAT A; 4DR1 O; 1SQP H; 1VQO V; 2CTR A; 4EB6 B; 2YUA A; 1AP5 A; 4P9P A; 3RYI A; 1DTO A; 1XUQ A; 2GHY A; 3FAV A; 4MW3 A; 2PI4 A; 2CUG A; 4LNU B; 2W0X A; 4PV1 B; 3JSN A; 4N23 A; 1KKC A; 4PEL A; 2VQF B; 1WPB A; 2YS8 A; 5LA6 B; 3O9O A; 1LUV A; 4NKG B; 2XAH A; 1IVS A; 3RYC A; 3W7X A; 4NTY A; 5EYP B; 2UU9 O; 5EIB C; 5IJ9 B; 2ADP A; 1YF2 A; 2UXN A; 1EM1 A; 4KHP B; 2IJK A; 1QR9 A; 5B1A C; 3T4Z A; 3JD3 A; 3UM7 A; 1HDJ A; 1ROP A; 2QTS A; 1W0J G; 3C3S A; 4AQY B; 1G1X B; 4JV5 B; 3WFV A; 3CCQ V; 3RVY A; 2YSU B; 2F66 C; 2KKW A; 3ABT A; 3LSQ A; 3DXR B; 3RYF B; 2OCC B; 4GX1 A; 1B04 A; 2Y0P A; 2ZT9 B; 1DK1 A; 1QCE A; 1RM1 B; 1D2D A; 5KHJ A; 5EIB D; 1P84 F; 4UFZ A; 3JAM N; 1T5E A; 4JI7 B; 1Q6U A; 4K8Z A; 4DV0 O; 1KBH A; 4O4I A; 1K7D A; 5LGN A; 2AW9 A; 4LP8 A; 4EFE A; 2XUM A; 3ABL B; 3ZHS A; 3K9S A; 3B8N A; 1R6K A; 4HAM A; 1SA0 A; 3FB7 C; 4JAS A; 3SYP A; 4TV9 A; 4IHJ A; 4NXM O; 3BHP A; 4DR2 B; 1KQS U; 4FVM A; 3ZBH A; 2YC0 A; 3EHB B; 4H44 B; 3CPW U; 3UQ8 A; 4JI6 B; 3KZI Z; 2R9R B; 5LXT B; 4GUN A; 1FFT B; 1SKV A; 3HKE B; 1K5Q A; 4B7E A; 3MD0 A; 2CH7 A; 1V55 B; 3M8A A; 3CCU V; 2WA3 A; 2XND G; 2Y69 B; 2BTO A; 3OMN B; 4D7S A; 4DW0 A; 5C8Y A; 4B3R B; 1IX9 A; 4RUE A; 1KYO F; 1K5S A; 2P06 A; 2E75 B; 1YSC A; 3W7W A; 1GTO A; 1S5J A; 1SQF A; 1AJN A; 3THO A; 1PNL A; 2GSM B; 3HKD B; 4JYA B; 2JS5 A; 2OIE A; 4KXR A; 5KHH A; 2OWO A; 4OX9 O; 1V54 C; 2DMX A; 3OD4 A; 3T1H B; 5GON B; 2UUC B; 1SQV H; 1UJW B; 1NVP B; 4LFB O; 3GB7 C; 1HNZ O; 4ZI7 B; 1XMQ O; 2EIJ B; 3OTO B; 4DV4 B; 1X4T A; 4FIP C; 1XEQ A; 1K33 A; 2MW2 B; 1G6U A; 2XOK G; 3JAR A; 4DXW A; 3CCE V; 2ZE8 A; 3IAY A; 4JI2 B; 2EBO A; 2CK3 G; 4DR4 B; 3OMI B; 5DEC A; 1GN4 A; 3K5N A; 2MK3 A; 2XHB A; 3B77 A; 1D5N A; 1YVW A; 1JJO A; 2P4V A; 1P4R A; 3CXH F; 3G67 A; 4J80 A; 1E1Q G; 1ZL8 A; 1I7F A; 1M93 A; 4CS2 A; 2RJZ A; 3AK1 A; 3HKB A; 2DYR C; 2CTQ A; 4JAV A; 4LH6 A; 3JAW A; 5IYD O; 5LMN O; 5JJJ B; 1B3Q A; 1ARO P; 4I55 A; 4RUF A; 5L3B A; 2WAM A; 5IWA B; 3ABM C; 1WB7 A; 1ZSP A; 1JA8 A; 4DV7 B; 4LF6 O; 2W6I G; 3AG3 B; 4ZKI A; 1FFX B; 5LP6 A; 3OR7 C; 2DQ3 A; 4JYB A; 3EFF K; 4OPA A; 1YJN V; 4MVR A; 4WFA V; 2JGD B; 1RSO B; 3ZN0 A; 3UT5 B; 1E1R G; 1XOU A; 2DJV A; 2WLK A; 1JQ0 A; 4BAY A; 1L0N H; 3NR7 A; 3RVZ A; 4EB6 A; 1YHQ V; 3F5T A; 4QGP A; 4UCS A; 5LBQ A; 2E3C A; 2JJ2 G; 3ASN C; 3MHH C; 3OT7 A; 1XI1 A; 4DW1 A; 4GZR B; 1Y67 A; 3W7T A; 2R9A A; 2HG5 C; 2XAF A; 4GLX A; 2ZIM A; 5H6Q A; 2KG7 B; 2OYQ A; 1I08 A; 4LNU A; 4GYC B; 4O4J B; 5TIS Z; 1PL0 A; 1ZWI C; 2EIK B; 2ZM6 B; 1P49 A; 4O2B B; 5BMV B; 5IYC O; 3BEH A; 1NKD A; 1NI8 A; 2UUB B; 3QF7 A; 1PL4 A; 1VQ4 V; 2YXY A; 2BOC C; 3KCY A; 3NXS A; 3QO5 A; 5EYP A; 3E2E A; 1MZE A; 1YDX A; 4UB8 Z; 3JAT B; 4O4H B; 1CP9 A; 4X65 B; 2IH3 C; 2QWP B; 1XBL A; 5FLX N; 3ASO C; 3CEI A; 2VQF O; 1KU9 A; 1WJZ A; 1SZX A; 4FM0 A; 1F23 A; 1H38 A; 5CA0 A; 4TQD A; 1GRJ A; 2N74 A; 3AG2 B; 2QJ1 A; 3ZHV A; 1XIL A; 3FAV B; 4PHZ A; 5IYZ A; 3IGA C; 4KFM A; 2VWK A; 4KHP O; 3G6E V; 4G28 B; 1P7B A; 4XDL A; 3DXR A; 3RYF A; 3ETE A; 1NTK H; 1YZB A; 1KB9 F; 4BR6 A; 3SPH A; 4RQE A; 4AQY O; 5J2U A; 2AZ0 A; 3RYC B; 4D6T H; 4CH4 A; 4U3J A; 1XHZ A; 3CCJ V; 1WAZ A; 4ZOL B; 2JEU A; 2QKA A; 4MVS A; 1XHX A; 3CRC A; 3TJT A; 2QSA A; 2Q8V A; 2AZ2 A; 1VQP V; 4PI2 A; 2RMK B; 1VIB A; 2B9Z A; 3K06 A; 2CGO A; 3WG7 C; 4GT1 A; 5IY5 B; 3AK2 A; 1M56 B; 2PZS A; 5J9P C; 3ABK C; 4FK5 C; 5EC2 C; 2PGG A; 4I7Z B; 4D7T A; 4JI7 O; 1QLN A; 1CEZ A; 4YXW G; 2Y0I A; 3AK3 A; 1Q43 A; 2WPD G; 1D5A A; 2FKX A; 3D8C A; 2HHH B; 1CXZ B; 3L70 H; 4J7J A; 3JD0 A; 5GTI Z; 5C93 A; 1YXB A; 3N2K A; 3LNM B; 3H1I H; 3HKE A; 1IBL O; 2QM7 A; 4X1K A; 1FXK C; 4DR2 O; 1AIL A; 2ZIO A; 4O4I B; 1Z5W A; 4OXS A; 1QU7 A; 1XDC A; 4JI3 B; 3ZED A; 1HNX B; 2WSS G; 1VQ5 V; 3RBZ A; 3HKD A; 2GTA A; 2F43 G; 3AG1 C; 4IHJ B; 1OCO B; 1KP2 A; 2N04 A; 4B3R O; 4WFH A; 2HJF C; 2ZNI A; 3QG5 A; 2YXH A; 1K97 A; 1LNQ A; 4B3M B; 2P6J A; 1M9N A; 4Q20 A; 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2KG7 A; 2P67 A; 2JK5 C; 3ETQ A; 4LF4 B; 2ATK C; 2QA4 V; 1F51 A; 5LP6 B; 1V54 B; 1NH2 D; 1IBK B; 3BVO A; 1S77 D; 5EBL C; 4MVU A; 3E22 A; 5BZB A; 4J7Z A; 5LHG A; 3T2M A; 1LR1 A; 3ICX A; 4QIW F; 1VF6 A; 4K0K O; 5EC1 C; 4O4H A; 3TK1 A; 4JGS A; 1KMI Z; 4PA3 A; 4R8C A; 1SZT A; 3I5D A; 3L9D A; 3SYC A; 3L73 H; 2ZM6 O; 1N34 B; 3H1H H; 1VAR A; 2ETN A; 3MAQ A; 2UUB O; 4LFA B; 2GBO A; 5KHG A; 2QTO A; 4X65 O; 3GWK C; 2JEX A; 1SQQ H; 5L3F A; 5GTH Z; 3WB2 A; 4KUM A; 2DE0 X; 5KAI Z; 4I0X B; 1DF4 A; 1QHT A; 2OT5 A; 5FNV B; 1R6T A; 5LGT A; 3JD4 A; 1I94 B; 5H5N A; 2YIC A; 4ZOL A; 3SJB C; 3SPI A; 3BPZ A; 3ABM B; 2Q0A A; 5E79 Z; 5JCO A; 2DOS A; 3TGU H; 5JH7 B; 4A5U B; 4EKW A; 3KKY A; 5CA0 B; 4DV2 B; 2IM9 A; 2OTJ V; 5IYZ B; 1GMG A; 3W7S A; 2Q9L A; 1QBZ A; 4B7K A; 2LJ2 A; 5IJ0 B; 3SYQ A; 4R6Z A; 1PNM A; 3ZMV A; 1U97 A; 5EK0 A; 5J2U B; 3WB1 A; 1Q7Y W; 1Z2G A; 2ZR2 A; 5LOV A; 1XL4 A; 4U3J B; 1RP3 B; 3CX5 F; 5D5Q A; 4FLZ A; 4WFG A; 4GKJ B; 2GUZ B; 3P30 A; 2HHH O; 1I5Y A; 1SQX H; 4DR7 B; 1THZ A; 1YI2 V; 2LQT A; 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