2HYXA

Structure of the c-terminal domain of dipz from mycobacterium tuberculosis
Total Genus 92
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
92
sequence length
333
structure length
333
Chain Sequence
GAMEIREQLNLGGIVNAQNAQLSNCSDGAAQLESCGTAPDLKGITGWLNTPGNKPIDLKSLRGKVVLIDFWAYSCINCQRAIPHVVGWYQAYKDSGLAVIGVHTPEYAFEKVPGNVAKGAANLGISYPIALDNNYATWTNYRNRYWPAEYLIDATGTVRHIKFGEGDYNVTETLVRQLLNDAKPGVKLPQPSSTTTPDLTPRAALTPETYFGVGKVVNYGGGGAYDEGSAVFDYPPSLAANSFALRGRWALDYQGATSDGNDAAIKLNYHAKDVYIVVGGTGTLTVVRDGKPATLPISGPPTTHQVVAGYRLASETLEVRPSKGLQVFSFTYG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule tags Unknown function
molecule keywords Protein dipZ
publication title Structure of the C-terminal domain of DipZ from Mycobacterium tuberculosis
rcsb
source organism Mycobacterium tuberculosis
total genus 92
structure length 333
sequence length 333
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature
pdb deposition date 2006-08-08

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00578 AhpC-TSA AhpC/TSA family
A PF17991 Thioredoxin_10 Thioredoxin like C-terminal domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.60.120.260 Mainly Beta Sandwich Jelly Rolls Galactose-binding domain-like 2hyxA02
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 2hyxA01
2FCHA 1LU4A 4MH3A 4BK4A 3D0ZA 1Z6MA 3GKNA 4ECCA 3RPNA 1JZ8A 3ZITA 2O89A 3WT2A 2CVKA 2IJYA 2RV9A 5DJLA 1XOBA 3NZNA 1PRXA 2REMA 5CAXA 3R2QA 2L4QA 2DJ0A 2QQJA 2Y6KA 2RIIA 1PL2A 3VD3A 2PPTA 3GSSA 4X1UA 2WS2A 4V1Ag 2H6YA 2X05A 3WGXA 1OF3A 5HR2A 5ID2A 4GLTA 4AJ7A 1R4WA 4CUCA 3VDAA 1UY1A 1X5DA 1QFNA 3ERWA 3D4MA 5GAPD 4FH8A 5JXJA 4HI7A 4A41A 2FWHA 4HJ2A 2V5DA 4ZY9A 2NDOA 3VK9A 3TOTA 2VCZA 2WQ8A 3GKXA 3EINA 3KGKA 4EF0A 3CZJA 1N8JA 4TR0A 4KSOA 1WMJA 1JZ5A 1T8EB 4O7HA 6GSVA 4QX0A 3CSIA 3F9UA 2H70A 2MBTA 1K3LA 2IPAA 2PWJA 4K8MA 2ZUPA 3KH9A 1UZ0A 2LKUA 3RBTA 3ETPA 1OH4A 2GSRA 5IMCA 2VOTA 1JZ6A 2VL3A 3C7OA 4NV2A 3TKSC 2CZ2A 4FYBA 2R5GA 4IHUA 4ACSA 1SKRB 4MH2A 4GXZA 2QQLA 3HA9A 1Y6EA 5G30A 2W47A 3OR5A 2AAWA 1NSWA 4CHSA 2QBXA 2LUSA 5ECMB 2BERA 3WEZA 5C71A 2VCVA 3GV1A 1UMIA 4P00B 3CTGA 1US3A 4PNFA 3C73A 2H30A 1PA3A 4MJEA 1R5PA 1RQMA 2YG0A 2ZCTA 1MEKA 1XVWA 5F7UA 5JXHA 4K0NA 1GSSA 3GDBA 1XW9A 1Z9HA 1UY2A 1WOUA 3KH7A 2J23A 3T2QA 3Q6OA 3TGZA 1XCCA 4ML1A 3CSJA 4DSSB 1A23A 5KN0A 4D73A 3PINA 4PURA 2PQSA 4POMA 2PVQA 1ZCPA 1EEMA 4DEVA 1CQHA 1OC3A 1W99A 1J84A 5IYYA 5D9XA 3LSZA 4AG4A 1OYJA 1TK5B 2WJUA 1PL1A 3UAPA 1X9WB 5C00A 3UESA 2B5EA 3ERFA 2J1SA 4OO5A 2VCXA 3LPFA 2L6CA 3IA1A 3T0BA 1X5CA 2CV4A 3HVSA 4KH7A 2DSAA 4MZBA 1SK0A 1NM3A 2LTKA 4M4RA 2XONA 3KM6A 5D96A 3KD0A 5ABRA 2EIDA 3GM8A 3CIHA 2VCWA 2ALBA 2YZHA 3FHQA 1FVKA 1ACVA 1GSQA 2V41A 3ZREA 3D3AA 2V72A 1T2XA 4HU7A 3WQBA 4IVFA 4GZ9A 3W8SA 1JZ2A 1DLCA 4ZZ5A 3G7IA 2L57A 4GCIA 3K4AA 2YB7A 2FD3A 3EB7A 2IMIA 2C0EA 3GYKA 5HQPA 2IWTA 1JU3A 5E59A 3FEUA 5CRGA 2N5BA 4TXVA 5DJMA 2OE0A 4EE0A 3KTLA 2WGRA 5KN3A 4RYDA 2OJLA 2DMMA 2J1TA 3IE3A 2E2MA 2EIRA 1W0NA 3KEBA 4POKA 5A4VA 1ZYEA 2O7KA 1XZOA 5ELAA 4GWRA 1GNWA 1SYXA 4MF5A 2LNSA 1O8PA 1U3AA 2NVLA 3CQOA 5EL8A 4ULXA 4GSNA 2H71A 1XW5A 2Y8KA 1TRSA 4PX1A 4K7OA 3CZUA 1HNCA 3M0FA 1YKCA 2YANA 1NHOA 2VUPA 3F3QA 4WF5A 2FLSA 2JZRA 5DAKA 4ARYA 4MMMA 3QAWA 1K0NA 4MDCA 4TN8A 1GULA 1XC6A 2QKEA 1XWGA 4Q5RA 2L9LA 2LEGA 1CX1A 5IPGA 4IJ3A 1A2JA 3OB8A 1UMHA 5CZKA 1I5GA 3WNOA 5J3RA 5ECRB 1ST9A 2PVOC 2A4VA 3ME8A 4BL7A 4LA1A 1Z5YE 1EP7A 3D4TA 1WWJA 3NQHA 3FZ4A 1A8YA 3GTUB 5JXGA 1AXDA 1FHEA 1WCQA 2PN8A 3A21A 2DBCA 2DIZA 4WF4A 2XPDA 3I9V2 5ECPB 1O8XA 2AJQB 3O76A 3H93A 2H1GA 3TJJA 5DALB 3IBHA 1HD2A 1DUGA 4KB3A 2ID4A 5HFKA 1XIYA 4QL9A 2DMLA 3A5WA 1SD8A 4JU5A 3OGSA 4JX0A 2GLRA 2E26A 3FHKA 1UY3A 2X8GA 2X99A 2QC7A 1XWKA 2JSZA 2FNOA 1R64A 2WB9A 3QR6A 4AAXA 1UWWA 3FKFA 3JCML 3G7YA 1OC8A 2B1KA 2VCBA 4J2FA 4KGIA 2KP1A 4WR5A 1H4OA 1V40A 2M72A 4OUEA 2Y6LA 1R26A 4TXOB 1CZVA 2O85A 5LNKe 1PKZA 1X9MB 1T00A 2I1UA 2VAFA 4QX3A 2JSYA 2JDAA 1T4ZA 4YQUA 4ZL8A 2W9XA 3HJOA 2Y6JA 4TRXA 2YPMA 5FWGA 4GQCA 2GT6A 2NTOA 2PUKC 1ERWA 4A4AA 3MUZ1 1EOGA 1CZTA 4PGTA 3UBKA 3WNKA 3LORA 3VWUA 12GSA 3CBUA 5HPOA 4I97A 3HXSA 2VD1A 1K3IA 4PQIA 5ECQB 1B9YC 3J7HA 3K4DA 2AUVA 16GSA 2X8HA 4MLYA 3ZFLA 5AIXA 3EC3A 4AJ6A 2JU5A 1NUKA 1KBNA 3ECQA 4HU9A 2I9HA 1FB0A 5IJRA 3IOSA 1DE2A 2VZ1A 2YN1A 2VZUA 1N2AA 4JRRA 4XS6A 1EV4A 1GMMA 4A3ZA 4Z7XA 2I4AA 1T1VA 5EY6A 2G2QA 1JZ3A 2K9FA 4J56E 3C8EA 2WDBA 3U37A 2C8UA 2XBIA 3VDCA 5B6MA 3F6FA 4XS1A 5JWRB 3I43A 1YDKA 2J7MA 2KLXA 3L9SA 4EUYA 4HG6B 2FGXA 1CQGA 1SD9A 1UY4A 3IAS2 1VF1A 1YF1A 5JCWA 2WDUA 1UYZA 1G7OA 2OACA 1UYXA 3BCKA 3GGLA 3HDCA 4OZOA 4PQ1A 4XHMA 4P08A 3CMIA 5AGYA 2NBSA 2FA4A 4IQAA 3QOUA 2HRFA 3HN3A 4QX1A 2H0HA 3D5JA 3ERGA 2EICA 2IMKA 5EPFA 3CDZB 2X8CA 1TDIA 5HXMA 5EJ1B 4V1Ap 1UVZA 3EYTA 2R6KA 2VCQA 2YWIA 1S3CA 4FI9A 1JFUA 5HR3A 2AB6A 3VI7A 1PN9A 4WBJA 3RHCA 5IMDA 4WKWA 4MGSA 4D73B 2AV4A 2ZEWA 1J08A 3IPZA 1ULPA 4Q5NA 2FWFA 5DQYA 4IS0A 2H1DA 5IMZA 1OVNA 4QQ7A 3P7XA 3VD5A 3FY7A 3WD6A 5IOWA 4MJAA 1JZOA 1V98A 5IOXA 4NHWA 1O85A 3D6IA 4CUBA 2YJHA 4GWIA 2J1UA 6GSWA 1GOGA 5J41A 1XNAA 1ILOA 2W1UA 17GSA 2JE8A 3LG6A 4HOJA 2WN2A 2W94A 1K3YA 1Q98A 3I2FA 4ET7A 1QGVA 5F05A 2L4CA 2LV3A 3K75B 9GSSA 5C70A 13GSA 5D73A 1IYIA 5AISA 1JZDA 4P02B 3THCA 1GTAA 1GTUA 4QL7A 1HNBA 1K12A 1BEDA 3ZMKA 5GSTA 2BBAA 2Z4FA 5GSSA 2B9VA 3UEMA 4XUOA 1F4HA 2I3YA 4WEYA 4L5LA 4EDYA 4ECBA 2C9KA 1DYOA 4X0XA 3WF0A 4JKLA 2DCKA 5JWQB 4IW9A 3P6BA 11GSA 1FO5A 1EZKA 2L5LA 1GSDA 1FW1A 1AC1A 3D22A 2W1QA 3F4RA 1EGOA 3OEAA 4TVEA 1TK0B 4XS4B 3GH6A 3ZTLA 4W4ZA 5D9TA 1UC7A 5JXIA 3CXGA 1GOHA 2L59A 5G04L 1YQ1A 3GL3A 4K0GA 3KCMA 1UY0A 3IAQA 2KUCA 3ZZXA 3T0DA 4TOPA 5DAKB 5LA1A 3IHQA 4DVCA 4F03A 4X43A 2QSIA 2PBJA 1XWBA 3MBWA 1OC9B 4EVMA 1GRXA 3I3DA 4RI7A 1KEBA 1XW6A 2C0GA 2VQUA 4MA9A 3L78A 4QB1A 2V2GA 3KMOA 4IKHA 4DXSA 3C7HA 1DBYA 1MD3A 5D8IA 2LW8A 4G10A 3ZRDA 3VI5A 2HYXA 4WXTA 2C0DA 1KGYA 4HQSA 2H6XA 2WABA 1W8NA 2CX3A 1GUHA 2J1AA 5C7GA 4JZQA 4BVXA 3FW2A 3UBLA 4EDZA 3M9KA 3RDWA 4E8EA 2YZUA 1V57A 2N5AA 2F51A 2OBIA 2H0GA 3GNJA 3EVIA 5G31A 3KP9A 4TKYA 2MMNA 4OFTA 1VF4A 4KW6A 2F3MA 3VLNA 2BGOA 5G05L 1OAZA 1GLPA 1OE8A 4TR1A 3UMAA 4TR4A 2GQKA 3GUSA 1WPIA 1NKGA 2H8LA 1YZXA 2AHEA 4ZB6A 3RPPA 1K0MA 1K0AA 1AUCA 4V2NA 3HVVA 2WO3A 4XUNA 1J9BA 3KMNA 3GX0A 4DXRA 2YNXA 1KNGA 4OD7A 4KX4A 2TRCP 1YKAA 1KEXA 3LEKA 3K46A 2EIEA 1TG7A 2VZPA 3GA4A 3MO4A 3WF2A 2F8FA 1HQOA 3LEFA 5B4NA 2R4VA 3SWLA 2C3TA 3I97A 3TJFA 4N10A 4GQFA 4K2DA 3UETA 2ORXA 2LJRA 2VIMA 4OMDA 1O8SA 2KD7A 3LJRA 1GOFA 3IV4A 5ECNB 2OE3A 2LJKA 4DSQA 5HR0A 4MO3M 3I2IA 3IRAA 5J1XA 2E32A 3EE2A 2JACA 2VD0A 3N5OA 1DE1A 3ABZA 1K0BA 2WUHA 2VO4A 2WULA 3HYPA 2B7JA 2X09A 4YPJA 2LS6A 1BJXA 2E33A 5A4WA 2DC5A 3FL7A 2GTUA 3TJKA 1W89A 2VZQA 3UL3A 3EWLA 3WNNA 1OD3A 1F9MA 1U3IA 1YY7A 4MGQA 4ZXGA 3TRPA 3UVHA 2VO5A 1FAAA 2EIBA 4PUFC 4KI5M 3F63A 2YJ7A 1O81A 4O32A 3M8NA 4QX2A 3LQCA 3DECA 5ECLB 2Y6HA 1EUUA 4GF0A 2BGPA 2IL3A 3DYOA 1M9AA 4K7NA 4GRFA 5IO2A 2OKXA 2VL2C 5G5FA 2WAAA 2RVAA 2YC4A 4QB2A 1H75A 2LQOA 3QFBC 2H0IA 4AGSA 4DSRA 2ZEXA 4EXJA 5GAND 3PH9A 2MYGA 3LEGA 5IM9A 4W50A 2HNLA 2C3NA 4JR4A 2VMCA 1GNYA 3KP8A 3APQA 5CREA 5CRHA 1GUKA 3IR4A 3M9JA 5DQSA 1M2DA 2XBQA 3AC0A 2KP2A 5IQYA 1TI3A 3LPGA 3AY8A 4FYUA 3A3TA 2VLTA 5KN2A 5GZZB 1JHJA 1RK4A 4MABA 4KDYA 3Q74A 3SKVA 3VURA 2J22A 1PGTA 3LGCA 5IMVA 3NRUA 2VLVA 3VPTA 4YAVA 3C1SA 5JWOB 3DYRA 3H8QA 4HQZA 4EO3A 5C04A 3MAKA 2GT5A 4N30A 2XQXA 4CW9A 3TKSA 4GSTA 4I6XA 3VWWA 1TTZA 3FZ9A 1AQVA 3RHBA 2H1AA 4ZBBA 1K45A 3HD5A 4BDVB 2PGTA 1F4AA 4E8DA 2VZSA 1T4YA 3IXRA 3BN6A 1BG5A 1FOVA 3TKPA 4BVYA 2E0QA 4IGJA 4CU6A 3HZ4A 2DDUA 3A2XA 2HFDA 2J1RA 3A22A 4POBA 2RLIA 3UJ1A 3ZIVA 2ZEZA 2A2RA 1FG4A 3KTBA 5KEJA 4Q5FA 1WIKA 3OGVA 2ORZA 2XPEA 3W5NA 1TVGA 4MF7A 8GSSA 3DVWA 4RUVA 1Q4JA 3C7GA 1GP1A 3H1NA 2QQOA 1PSQA 2GSQA 2R7EB 5D9VA 4MJBA 1WE0A 3APOA 1Z6NA 1XOAA 2IFQA 3L4NA 4F9ZA 4NXIA 1AIUA 1XBSA 5LCWL 2VMEA 1GSYA 2OBKA 1ERVA 1JLWA 2GSSA 3GHAA 3L9VA 3TJGA 4LPLA 1A8LA 1LBKA 3J7Yk 3MDKA 1JHBA 3V1WA 3ZVJD 3QMXA 3TB2A 2DCJA 4XRDA 1IYHA 2HSHA 2N5FA 3DRNA 1B8XA 2DIYA 3H79A 4QAWA 4UOJA 3I69A 4L5OA 4Q5QA 4IN0A 3WGEA 3ZVJA 3IIIA 3LXZA 5A1AA 1U6TA 1OKDA 4FO5A 1SL0B 5IHRA 5LA0A 1O7UA 1PX6A 3TUEA 2IMEA 3HVXA 3LWAA 2YWNA 5HFGA 2LRTA 4H86A 2B4KA 4CUAA 4MCUA 3VWVA 19GSA 3HPNA 1ULOA 4HJMA 2RM6A 2IN3A 1XWAA 4HZ2A 1LJRA 3ZM8A 4TW5A 4MK3A 4JR6A 2FY6A 1SDDB 3NJVA 4ZILA 2V6KA 3QCPA 2C80A 3DD3A 1B9XC 1VF2A 1LNSA 4LL1B 4WETA 2JZSA 4RQRA 5DBQA 1UX7A 2HLEA 4L0PA 2FWGA 4OCFA 4KWUA 4NPBA 1H6XA 4DUWA 1A0RP 2GSTA 2B5YA 4KCEA 4YQMA 1BHGA 4JBBA 1T7PB 2YWMA 4JE1A 4KDUA 5ID2B 2VZVA 2WZ8A 1X9SB 2GS3A 1TP9A 1F2EA 2CAIA 5KN1A 2V32A 3TRXA 1M7TA 3ZIJA 3C7EA 4HZ4A 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 5IFT A;  4K9Z A;  5B4X A;  4ZBD A;  4KMQ A;  1YEP A;  3VWX A;  3ISO A;  2CX4 A;  3F4T A;  3HNM A;  1GH2 A;  1JU4 A;  2VZT A;  1GSU A;  2O8V B;  2YWO A;  2X10 A;  4JHZ A;  4QDS A;  2HRN A;  4MPG A;  4ISD A;  3S9F A;  1JI6 A;  3TJB A;  3VD9 A;  2MMA A;  2WFC A;  1TW9 A;  3GFK A;  3EU3 A;  2VM9 A;  2H1B A;  4TXO A;  2JAD A;  1THO A;  4NWY A;  5G2Z A;  5ECK B;  4ZZ8 A;  2WZ9 A;  2BJX A;  4I2T A; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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