2I9EA

Structure of triosephosphate isomerase of tenebrio molitor
Total Genus 89
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
89
sequence length
246
structure length
246
Chain Sequence
ARKFVVGGNWKMNGDKKQINEIIGFLKSGPLNQDTEVVVGVPAIYLELVRTCVPASIGVAAQNCYKVPKGAFTGEISPAMIKDVGADWVILGHSERRQIFGESDELIAEKVCHALESGLKVIACIGETLEEREAGKTEEVVFRQTKAIAAKVNDWSNVVIAYEPVWAIGTGKTATPQQAQDVHKALRQWICENIDAKVGNSIRIQYGGSVTAANCKELASQPDIDGFLVGGASLKPEFVDIINARQ
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Isomerase
molecule keywords Triosephosphate isomerase
publication title A coleopteran triosephosphate isomerase: X-ray structure and phylogenetic impact of insect sequences.
pubmed doi rcsb
source organism Tenebrio molitor
total genus 89
structure length 246
sequence length 246
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature ec 5.3.1.1: Triose-phosphate isomerase.
pdb deposition date 2006-09-05

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00121 TIM Triosephosphate isomerase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 2i9eA00
3EXRA 2Z0IA 5DY3A 1JUKA 2EGZA 3FS2A 1W3IA 1KTNA 3QQ0A 4N9BA 2VEPA 3MI6A 1QAPA 3TQ0A 1G6CA 3IIPA 3W85A 3EWUA 3C0JA 2QF7A 3W1MA 1XC4A 3HB9A 1I45A 4YCPA 3ABSA 3PAJA 5SWUA 1H51A 2Q8ZA 4HT3A 1MO0A 5C5YA 2DZTA 3A5FA 3TNOA 4HNVA 4EIVA 2BTMA 2FFCA 4NJJA 4O10A 3YPIA 4PL1A 3C3NA 4R7JA 3GKAA 5CZJA 4YCOA 2ALDA 2RH9A 1GYNA 1ZHAA 1QPRA 1K8XA 2TYSA 3GIYA 4UIOA 1NFBA 3SJ3A 5DELA 1TPC1 1BWKA 1NEYA 2A1YA 1R2RA 4MVAA 3SY5A 1JCJA 1TQJA 1H1YA 2P0OA 4DO4A 2WKJA 2G96A 4AEOA 2TRSA 4M6QA 3W2LA 3IIVA 1TPEA 2QKFA 1YTDA 4FX7A 4NXKA 6ALDA 1XXXA 4DXVA 3LHWA 3CWOX 4O54A 3M44A 3UPBA 3HQ1A 5AB3A 3C6CA 4CCCA 4NX0A 3LHUA 4ADSA 2CW6A 5AC7A 5E0KA 5H2ZA 4JTTA 2NUYA 4H3DA 2QJIA 5G1TA 3UZJA 5LNWA 2Q3RA 1JR1A 4Z1DA 2CLMA 5D02A 2GVJA 4JTJA 1AW5A 2YFOA 3W1XA 3QM3A 3BW3A 3TROA 1F6KA 4KWVA 3W1PA 5IBXC 4JDBA 1DVJA 1H63A 3RNDA 1EWEA 3M5XA 2WSRA 4LVFA 1W5OA 2R94A 1ME8A 3M16A 4RZ6A 5AHMA 3LHYA 2HTMA 4XBKA 4MOZA 4N9DA 3IGSA 2QCEA 3C2EA 2ZDRA 5K9DA 1W37A 3JS3A 1V5XA 1ZAHA 5I3IA 3W7JA 2J24A 2Y7FA 3GX9A 1TREA 2H3DA 4FNTA 4O52A 1EP3A 2G95A 1GWJA 2ABAA 3G1XA 3TUUA 1LOQA 1ZNNA 5I3HA 1GVSA 3W6YA 1F76A 4Q32A 5C55A 4M7TA 3VE9A 2QCGA 4FNQA 1DKWA 3RMJA 1DQXA 1YPIA 1W54A 1BWLA 3S5YA 2FDSA 3S5ZA 1F73A 1TJRA 4GUHA 2Y62A 4UFKA 4X22A 4LOCA 4QM1A 4PTNA 5HWMA 5F2IA 4FIQA 2ISWA 3FLUA 3FKRA 3LTYA 1T0OA 3LRLA 3MI3A 1M7PA 1LP6A 3RK8A 4RKAA 5EYWA 4OWGA 4LY8A 5I3KA 4IMFA 4H4IA 1TQXA 1I4NA 1MXSA 4JTFA 4ZQPA 4ZMGA 1FX6A 1LLWA 2QEZA 3EWXA 3W2NA 5DXYA 3UXAA 1GPWA 1THFD 3EXSA 3NL6A 4DPQA 1JUEA 3TC7A 1GOXA 2Z1BA 3TC6A 1LTDA 2CFFA 4JYFA 4UTIA 5U7SA 3W7KA 1S5TA 2QR6A 5LHEA 3R13A 3W2MA 3T40A 3VFLA 3KFTA 3IGXA 3F1QA 3G1FA 1QPNA 3W1LA 1MEHA 1VLWA 2OCZA 4R53A 1PCKA 4MPQA 1X1ZA 3QSTA 2B7NA 4KWWA 4Y6GA 1FQ0A 2NV1A 2G5WA 3R8RA 5G4WA 1SZFA 3G18A 4UTJA 1H7NA 3GLCA 4WUIA 3GDKA 2GJNA 1M6JA 3LOTA 5D37A 1BEUA 5K2ZA 3LXBA 3BVJA 4O0ZA 4LUJA 2WSYA 4JTUA 2QAFA 3EKLA 1LDCA 1J2WA 5EMUA 3QZEA 2C14A 1OK6A 3STFA 4FXSA 3ATYA 1FCUA 3GXNA 3OVRA 2E6AA 3CC1A 1YDOA 3G24A 2VFEA 1Z42A 5F1VA 2W6RA 3HGOA 3UWUA 4MYXA 4HIBA 4LS1A 4RCXA 3PB2A 3W76A 1B4EA 1A5SA 2DZSA 2PCQA 5CGQA 1XDLA 3HMJG 1G7VA 4GE8A 1RVGA 4Y96A 3HPXA 3S8HA 3S9YA 4LVDA 1FBAA 2ZBTA 3TE9A 3F4WA 3W22A 4K7YA 5KMYA 1RQHA 4IJBA 3N14A 4K7VA 4O15A 4DPPA 3N73A 3M5ZA 3B06A 3PULA 3C2VA 4AWTA 2E5BA 3N9RA 5D33A 4BWLA 2C15A 2J88A 4JTGA 1TYGA 4CQAA 3HG2A 3N9SA 3EB2A 3M47A 3IV3A 4NT0A 3R89A 5KZMA 4BR1A 7TIMA 3PB0A 1PIIA 1K8ZA 5HR7A 3TH6A 3MP3A 4AH7A 2C19A 2CLLA 4ALDA 1QO2A 4QAIA 3W7PA 5AC8A 5LNVA 5D2YA 3HF3A 4FHAA 1WXJA 2NXIA 3BV4A 4LT9A 4N02A 4M7SA 1OYBA 1WQ5A 1GJPA 2DORA 1IIGA 4JIQA 5I3GA 2FJKA 5FEWA 3STEA 3G1YA 3LCIA 1J4EA 2Y85A 1MSSA 3IIZA 3G1AA 3L66A 4OV4A 1TTJA 5FEZA 4JXCA 3ZR4A 2E5CA 3TW6A 1M5WA 1KBIA 4IPJA 3L21A 3QF0A 3EX4A 3MBFA 3UPWA 1TO3A 3NQ8A 3N3MA 5D2TA 4ADTA 3PBYA 3GXPA 3O15A 3QH2A 3ABQA 3LCXA 4JTKA 1PS9A 4WOQA 3QMRA 1L6YA 1U83A 4UXDA 5CSSA 3RU6A 4FNPA 1S5VA 4GWEA 2NXHA 2UV8G 3GYEA 1FCBA 5DN1A 3QW3A 3W7LA 1EP2A 3HO8A 4UNKA 5KTLA 2GJLA 2PRHA 2EAWA 4O28A 3FIGA 3RLUA 1VJIA 3LBCA 4QJ1A 3WK3A 1WX0A 2YDAA 5KZDA 1EX5A 1KV8A 3DU0A 1YTEA 3LERA 2WJZA 3IGUA 5D09A 2YCEA 3V75A 1K7FA 1O4UA 1X1OA 3AJXA 3NOEA 1H5YA 3NPWA 2V0TA 1KW1A 3P61A 5TIMA 3BGJA 2YSWA 1ZFJA 3KVJA 4A2RA 4DBDA 3KAOA 3BK0A 4ZQCA 3USBA 1P4CA 1KFBA 3DENA 4RZ5A 3VKJA 3TIMA 1TPWA 3L68A 3B0PA 1SUXA 2F7FA 2QCDA 2ZZ7A 1GG0A 1KM3A 3DHDA 1HO4A 2ZRUA 5D04C 2VFHA 4QIUA 4GUFA 1Q3NA 2A85A 3G8RA 1NF0A 2NV2A 3VI2A 3CLMA 1XUUA 1SO6A 2VC6A 3L0KA 4UMAA 5D2VA 4I7UA 5CPMA 3LRKA 4MZ1A 1OYCA 3MWAA 4O12A 4DO5A 5TBOA 4FNUA 3DAQA 5FESA 3PR2A 2VENA 4IMGA 3NQFA 2GPTA 2ZZ6A 2A21A 4RR4A 2CU0A 3FKKA 1SZGA 3TV8A 1HO1A 3LCFA 4WOZA 3H54A 2CZ5A 1QR7A 4JY8A 1SO4A 2DU2A 4UTWA 2ZZ1A 1UUMA 4TO8A 1VCFA 2FB3A 3DI0A 4K39A 4ML9A 4LS2A 3O6CA 3EWZA 1JCMP 2OT0A 4LC8A 4JTIA 1KM4A 2Y7EA 3UXDA 3ABRA 2FB2A 4XZ9A 5KZEA 3S1WA 1T99A 4PEKA 4XKYA 2LLEA 3FYPA 1KLZA 3GNDA 3P62A 2NX9A 1V7YA 4BI7A 3TSDA 3WJYA 3UYCA 3B03A 4QQ3A 2E77A 4E38A 3P80A 4LWWA 1F7BA 3KVLA 2PRMA 1VYSX 3I7SA 1KM5A 3B05A 3JR2A 3W72A 3LCLA 3MHGA 3A22A 1JJKA 1IXQA 1A5CA 3KVKA 5AYYA 2BZNA 1I2NA 4O16A 3TMLA 3PWAA 1D9EA 2DJLA 4NJKA 1OX4A 1TMHA 2GVLA 4IMEA 3S6DA 4UTLA 1GG1A 2EF9A 3G1DA 4CCEA 1Z41A 3G8EA 1LRTA 4ONVA 1JCLA 3PSVA 3A24A 5LSMA 4Y8FA 1KM1A 3PUEA 2VEIA 2VFIA 2OMAA 3Q37A 4DF0A 3QRHA 4MLJA 1HFBA 3DI1A 3MYPA 4UR8A 5F4XA 3E49A 1EWDA 4JIPA 5F4SA 1KM6A 5D30A 3EX2A 2WPBA 3TQKA 3NL3A 3TJXA 3P7YA 3L67A 2X1RA 5LZLA 2RKXA 3W7HA 5EA9A 2C3ZA 4R33A 1LBLA 5L6UA 3K30A 3TXZA 1TPUA 2I9EA 1LBFA 4WX2A 3BG5A 2E6DA 2WOQA 3RF9A 3PVFA 3RLVA 2J9ZA 4JX4A 4EWND 4OHQA 5BMWA 4I7WA 1FWRA 2X1TA 4KFNA 4NNBA 5AFDA 3I68A 4AF0B 3NAVA 3N34A 4POCA 1XL9A 2FPYA 2VFDA 4O1AA 2NUXA 1ZJIA 3SFKA 4W9TA 3GDLA 1I2QA 2V5BA 3STGA 3TSBA 3N19B 3TDFA 4FB7A 5T26A 1R47A 1P0KA 2E09A 4K6AA 3WFAA 1EPXA 2P1FA 5TQLA 2Y63A 2RDUA 2DZUA 1W5NA 3IIOA 4E0CA 3M6YA 1OJXA 4K38A 1G67A 3M41A 3LXCA 2Y88A 3NXFA 3BO9A 2O7SA 5DCBA 4UFHA 3OEXA 4NZJA 1F2JA 4X9SA 4HNUA 5I3JA 3QW4B 5AHLA 5CKSA 3GVGA 1TRIA 5AHIA 3W70A 1DORA 4X2RA 1KV5A 3M1ZA 4DQWA 3TJLA 1HTIA 1LRQA 4IPIA 5G2WA 2QJGA 1LBMA 2VEKA 2VFFA 2I1OA 4IQLA 1H61A 4C1LA 1VGAA 1OG0A 3WK0A 5FF4A 3RFAA 1VPXA 1WDWA 5CG7A 3M7WA 1DV7A 5LGZA 2CLIA 2H8XA 2H3BA 4QITA 3M5YA 4RXGA 5K7JA 1IXPA 1JULA 2WO5A 4MY1A 4ZQNA 4WXYA 4IGHA 3LTSA 3E12A 5IM51 3W84A 4YL2A 3W9ZA 2ZZ2A 1SW7A 1R2SA 1J5TA 3LM7A 3MW7A 2WNNA 1EUNA 1VQTA 2ZCGA 3SIZA 3W73A 1JCNA 1TIMA 4XBSA 2WNQA 4O4WA 4JY9A 2PE4A 3LRMA 3LLFA 3W23A 3LHVA 4M19A 1L6WA 1XKYA 1ZCOA 1I2OA 1MEIA 1TV8A 1X7FA 4IXHA 5FEXA 3PBVA 3B4UA 4GC4A 1GZGA 3LB0A 3NQMA 4WY0F 3THQA 1BKSA 3UNDA 3PUDA 5HWNA 3W1NA 5C54A 2QUVA 5K9CA 4N6EA 1ICSA 4L4LA 3PF3A 1G69A 5K3VA 2B4GA 1C9DA 3MMTA 3B0VC 3R12A 3O06A 3NQAA 1OFEA 3FEMA 4PL2A 4BWLC 3TAKA 3HPZA 3SSJA 1TB3A 2CZDA 4MIMA 3NQVA 2EHHA 4BFAA 3OHIA 1FY6A 1YDVA 3WJWA 1KM2A 3NQ6A 1QPOA 1TV5A 3MYOA 1GT8A 3THAA 4WXZA 1A5BA 4YLWA 4GUJA 1MEWA 1KA9F 1C29A 2A4AA 1SR9A 4UTMA 2TMDA 2NWSA 4WY0A 4O1BA 4P61A 2ZQ0A 1OFAA 5CZTA 3W1UA 1B9BA 2YYUA 4YXGA 1WV2A 3O8AA 2I14A 1JCYA 3NGJA 4TR9A 1QWGA 2B0MA 3P82A 5K4XA 1U5JA 2TPSA 3WJZA 1FWSA 4JICA 3ZS4A 4K8EA 3TFCA 3EX6A 4Z1CA 2YW4A 3OVQA 5HMSA 1K7EA 1QOQA 3MO7A 5D38A 1ZALA 1PCWA 3GK0A 4S1FA 3FOKA 1SU5A 4OBTA 5AHNA 2ZTKA 2ZZ4A 4UFJA 4UTTA 2C1HA 3NQ2A 1CX9A 3P8IA 4RV8A 1BTMA 4ORMA 1NSJA 1KFCA 3GAKA 1G4EA 2PRLA 3W7GA 4HN4A 4K8HA 3TSMA 2V30A 1TPFA 1XBVA 5J5RA 4TMCA 1WYIA 2B7PA 1GVFA 3NNTA 3CTLA 1D3HA 2G97A 3NYZA 3MP4A 3S1VA 4IMCA 1QPQA 1VZWA 4O0KA 4PH6A 2E5DA 5BMXA 3UWVA 1O60A 1VC4A 5HQEA 1TCDA 5D05A 4Q33A 3INPA 2A7NA 1ICQA 3DZ1A 2JK2A 3NDOA 3EX3A 3KVMA 3N2MA 3P5ZA 4CQ8A 1WBHA 2YZRA 2V5LA 4MJZA 5G4EA 4LVGA 1OFOA 3MUXA 3U2OA 4RK8A 5DCDA 4MLRA 1DJQA 1IGSA 1LORA 4NVTA 4HPJA 2VFGA 4X3ZA 3C56A 2FTPA 1L2UA 1YXYA 8TIMA 4RJEA 3I7QA 4OE7A 3DFSA 3GDRA 2DZWA 3QPZA 1W5QA 1WA3A 3CHVA 3R2GA 3HG5A 3FYOA 1LYXA 2QCDB 5BOOA 2WNZA 2R8WA 5D2XA 3HGRA 3EKZA 5F2LA 1SSGA 5CPNA 2ZRYA 1TRDA 2BXVA 1VLIA 2ZYFA 1W1ZA 2EKCA 2QCCA 1LZOA 2BWGA 3P84A 1ALDA 1AW2A 1ICPA 3L5LA 4LVAA 3W1TA 4MJMA 4ZQOA 3EWYA 4PCFA 2EPHA 5FEPA 3Q2DA 1W31A 3LBMA 3S42A 1TSIA 3NZ1A 2YFNA 1AW1A 1SW0A 3P81A 3QYQA 4QNWA 3NQ7A 2V2DA 4S2CA 1X6UA 4JEQA 1OK4A 1S5WA 4UTWC 4NXSA 4LTSA 3NG3A 1OHLA 4L4MA 3E0IA 1N55A 3KRSA 2YXGA 2FPTA 5F2GA 4IX2A 1XM3A 2YR1A 1KFKA 1DQWA 2KZHA 4UNLA 4CNPA 1B4KA 3G0UA 3ELFA 3CIWA 3WK2A 2CLOA 1WOAA 4HKPA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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