The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
39
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sequence length |
146
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structure length |
146
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Chain Sequence |
RPRMVDVTEKPETFRTATAEAFVELTEEALSALEKGGVGKGDPLVVAQLAGILAAKKTADLIPLCHPLPLTGVEVRVELLKAEKRVRIEATVKTKAETGVEMEAMTACAVAALTVYDMLKAASKGLVISQVRLLHKAGGKSGEWRR
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Biosynthetic protein
|
| molecule keywords |
Molybdenum cofactor biosynthesis protein C
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| publication title |
Crystal structure of the molybdenum cofactor biosynthesis protein C (TTHA1789) from thermus theromophilus HB8 (H32 form)
rcsb |
| source organism |
Thermus thermophilus
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| total genus |
39
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| structure length |
146
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| sequence length |
146
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2006-09-28 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF01967 | MoaC | MoaC family |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Alpha Beta | 2-Layer Sandwich | Alpha-Beta Plaits | Molybdopterin cofactor biosynthesis C (MoaC) domain |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2IDE A; 2EEY A; 2OHD A; 4PYA A; 1EKR A; 1EKS A; 3JQJ A; 3JQM A; 3JQK A; 4FDF A; 4PYD A; 2IIH A; 2EKN A; #chains in the Genus database with same CATH topology 1YK9 A; 1NDC A; 1N33 F; 5AXL A; 4N47 A; 2DO4 A; 4X4P A; 5KFZ A; 3AA8 A; 1ARO P; 4MYU A; 2V69 A; 1HNZ J; 3DYA B; 5F9L A; 2XMJ A; 4FYW B; 2DNQ A; 1R31 A; 3PYF A; 4QIE A; 2M8H A; 3JQK A; 3KG0 A; 3IN5 A; 1T9U A; 2NUH A; 3QSI A; 2I9S A; 2FQQ B; 2VFR A; 1ICE B; 4EK2 A; 3ZXW A; 4E2F B; 1ELO A; 1H2V Z; 1Y9O A; 5A8K A; 2EC0 A; 1GX6 A; 1MMN A; 2J0S D; 2VUG A; 1TP7 A; 2B6A A; 3QPI A; 1V5I B; 1LW0 B; 2YPY A; 1YJU A; 4CLY A; 3UCZ P; 3KJQ B; 2A3J A; 4W92 B; 1H7X A; 3NGS A; 4O44 A; 4JV5 F; 4F25 A; 1U6Z A; 3NEK A; 1EAR A; 4KB7 A; 2AYM A; 5DDP C; 2X1F A; 3CJ8 A; 2FVC A; 1W2B R; 2HHH F; 2YKN A; 4WIQ A; 4IQM A; 2BR0 A; 4V1A k; 1RT7 B; 4PPD A; 1VRU B; 3M2R A; 1FXL A; 2VFU A; 5LMN F; 3DLE B; 1HI0 P; 2I0X A; 2Y1R I; 2CRL A; 1JJ2 R; 3K5N A; 4LIW A; 4K4Y A; 4W98 A; 1IJF B; 3QGI A; 3Q86 A; 5U47 A; 5H9F J; 3UNY A; 2H65 B; 1RLC L; 3MMA A; 3G87 A; 1GMV A; 2ZOG A; 2DO0 A; 2KHC A; 1G4C A; 2FHK A; 2KXH A; 3AB4 B; 2V2Q A; 5CZX A; 1Q4R A; 1RAD B; 2DD8 S; 4DU7 A; 4YOE A; 3G2X A; 5AE1 A; 4ZJL A; 2F9J A; 5CYQ B; 1UWA A; 1T3O A; 2J7W A; 4ELV A; 3DOL B; 4OJ3 A; 2HVH A; 5C24 A; 4I7F B; 2OAU A; 1CJK B; 4A8Y A; 4C8Y A; 3G4S S; 1EHW A; 3VAG A; 1FFS B; 1U2R A; 4J9Q A; 2UXD F; 4NE9 C; 5HP1 B; 1LFP A; 2E7V A; 3W8P A; 3C2P A; 3E01 B; 1XMO J; 4ECY A; 3RAQ A; 4KTQ A; 3HZG A; 2BOA A; 1WKL A; 3NNC A; 4RL1 A; 3SDE A; 1FVQ A; 4ED5 A; 1QM9 A; 3NGU A; 5E3P A; 1FJC A; 2RD5 C; 1YVF A; 3G8T A; 5JVH Q; 3TEG A; 4KH1 B; 3P6Y C; 1ZTT A; 2DHA A; 3CMQ A; 2IJF A; 4H4K A; 4B3O B; 2RF2 B; 2PC6 A; 1HR0 J; 4GO7 X; 2SXL A; 2I1R A; 2FVR A; 2DNM A; 1EX8 A; 3TR5 A; 4ED6 A; 2WVE A; 3H90 A; 1H38 A; 5B7W A; 1YBT A; 8AT1 B; 4F0K A; 5KFE A; 2P9G A; 5GAG I; 1W7W A; 2G2Z A; 3Q8U A; 3R5A A; 3EGW B; 2RIL A; 3D1Q A; 2M9K A; 2VH7 A; 2V94 A; 2VFV A; 1K73 T; 2FY8 A; 1SH2 A; 2R8I A; 4P75 A; 2UUT A; 2BVZ A; 4ECV A; 2ZH3 A; 1NHV A; 1V3R A; 1YX2 A; 1XNR J; 1HNI A; 1S12 A; 2D74 B; 3HT3 A; 4A48 A; 1G3O A; 2B56 A; 2KRB A; 3DLG A; 2PFF B; 1TUW A; 1AYE A; 2YWK A; 2OEM A; 2QTW A; 5BR8 F; 3R27 A; 5AT1 B; 2FD2 A; 1LWF B; 1BD6 A; 4NCB A; 4FS2 A; 3MOZ A; 2QL7 B; 1WC6 A; 2GW8 A; 1GX5 A; 1B4S A; 5I4M A; 3CB4 A; 1QAX A; 5HLF B; 4IOC Q; 4FF4 A; 3D67 A; 4M5K A; 5HBM A; 3EPI A; 1VYA A; 2L9D A; 4DV6 J; 2CQB A; 4KPC A; 3Q8V A; 2EBE A; 4O3P A; 4WK1 A; 2OMO A; 2HW3 A; 4IO9 Q; 1RTD B; 3CCT A; 5J2P B; 1P6T A; 1TL1 A; 5KG1 A; 3HZE A; 3I0S B; 2MKI A; 1UWB B; 4AQY J; 1TK8 A; 5KG0 A; 5HMX A; 3IWL A; 4WFN Q; 2HFN A; 3B78 A; 4QQB A; 4YR2 A; 4ZPT R; 4IDK A; 3K59 A; 1XN9 A; 2E29 A; 3HJV A; 5HQL A; 2IC3 A; 3A3P B; 1V5V A; 1RAJ A; 3R3T A; 4LF7 J; 1N5Y A; 1QY7 A; 3OLB A; 2HHX A; 2BJE A; 2V50 A; 1QD1 A; 3TZW A; 3OVB A; 2G0C A; 3PZP A; 4PKD B; 5KFL A; 4LFB F; 1O0P A; 3RYL A; 2GML A; 1VQN S; 4C9D A; 3T1Y F; 5DG7 A; 3CED A; 1MWY A; 2CPF A; 2MMY A; 5HRO A; 3KUH A; 2MZR A; 2GV1 A; 4J9O A; 2BX6 A; 1ZH5 A; 2DJW A; 1RHQ B; 3RRK A; 3IGV A; 2Y1J A; 1S1U B; 2MKC A; 3NBP A; 2XZW A; 1RAG B; 1T94 A; 1WDT A; 3QO9 A; 1TEL A; 5CD4 A; 5FD1 A; 1H3D A; 3MMC A; 2LXF A; 1Y0H A; 2CPD A; 3VGU A; 3FZB A; 4PQA A; 4FBT A; 4U7U D; 3I9Z A; 3LGN A; 5D0H A; 3HT0 A; 2MXY A; 2QYC A; 2Y0S D; 1B0V A; 2GIF A; 6FDR A; 1U4B A; 1LNQ A; 8RUC A; 5EWG A; 4K50 A; 4AUK A; 2HHQ A; 4RBV A; 3CCL S; 2AWZ A; 1N48 A; 2VFS A; 1UKU A; 4C8Z A; 4URQ U; 5FDL A; 3TNV A; 1KVK A; 1HWI A; 4JYA J; 3Q8Q B; 5KFX A; 1WEX A; 2JNJ A; 3CWJ A; 4F3O A; 4B9N A; 3EDR B; 4TVA B; 2W2N P; 4K59 A; 4DX5 A; 3KTQ A; 4OX9 J; 5I3U B; 1H2T Z; 5C5J A; 1NZA A; 2YWF A; 2AYB A; 4EBE A; 2E5L F; 5KG6 A; 1YJ9 S; 2N82 B; 3DDI A; 1RAE B; 2HBZ B; 4TNO A; 1PAE X; 4PG4 A; 6FD1 A; 5J2Q B; 3TQ1 A; 1VQP S; 1HI1 A; 5ETK A; 2G1H A; 3F41 A; 2ZBP A; 3ILO A; 2LU2 A; 4CZC A; 3U1N A; 5HJY A; 2MLX A; 1NRK A; 2IIH A; 3QJJ A; 3OTC A; 1W25 A; 3QSY B; 3W2W B; 5CZV A; 2FB0 A; 2Z57 B; 3GR1 A; 5C42 A; 2CPJ A; 4E98 A; 2FHJ A; 2P6T A; 1S6P B; 1UZH A; 1Y7P A; 1RT1 A; 2NS1 B; 2HRU A; 3IWX A; 1F3V A; 3OL6 A; 1P9Q C; 1FD8 A; 3NS6 A; 4N5S A; 2UXC F; 2ZFH A; 4OYZ A; 3K2Y A; 4D3G A; 1SVD A; 3DOM A; 4DX6 A; 2ATL A; 3A1Y G; 2ZBI A; 2EFP A; 1UVN A; 2HS4 A; 3M6X A; 4ANC A; 4CLS A; 4WKR A; 1PIL A; 3PEJ A; 4DG1 B; 3BKF A; 5BJR A; 2ZC3 A; 3J7Z 5; 1HWL A; 3HJF A; 3W62 A; 2Y1L B; 4QWA A; 3GJR B; 2HWT A; 4IRC A; 4J7C A; 4F0M A; 5J1N A; 1VC6 A; 1TK0 A; 4JV0 A; 2EBG A; 3DLL Q; 2BQR A; 9ATC B; 4OYI A; 1X60 A; 3MFI A; 3NOC A; 2WSE C; 2EWH A; 3QGP A; 4PXB A; 2W9A A; 3P5B P; 1VC0 A; 3TI0 A; 2I6W A; 1T95 A; 5IM0 A; 2XNQ A; 1TUG B; 4PAA A; 5L9X A; 2Y0B B; 1K9M T; 4HVZ A; 5DM6 Q; 4TU9 A; 2V63 A; 2CQH A; 2F65 A; 3RAX A; 4P74 A; 4LSN A; 3NWG A; 3BGR A; 4K4T A; 1UVL A; 2E7X A; 3VAK A; 1F0X A; 1QE1 A; 4QU7 A; 3VCD A; 2J0Q D; 2NXN A; 5HMY A; 4LRA A; 2CNN B; 5K14 A; 4USH A; 4UOC A; 2GQQ A; 4PUO B; 1U7L A; 2IJR A; 1XER A; 3KJV A; 4DUZ F; 3ENA A; 1T9X A; 1F5A A; 2IMO A; 4X65 J; 4M5D A; 2OSQ A; 5E3C A; 5LL6 d; 3NGK A; 2L9W A; 4YR3 A; 2FPH X; 3IBF B; 1VBK A; 1Z4U A; 2B4V A; 3Q24 A; 3NNA A; 4TQR A; 1NK4 A; 4L74 A; 2DGQ A; 2RU3 A; 2RJZ A; 1E6Y B; 4LVN P; 4ZP6 A; 3ONQ A; 1BMQ B; 3BKU A; 3F56 A; 4O3N A; 1HBO A; 2LQ5 A; 1R6V A; 2WHO A; 1NZ8 A; 4PCQ A; 2YNI B; 2AX1 A; 4ECT A; 3UN5 A; 2Z4P A; 4DCJ B; 2DHH A; 2Z56 B; 1JXL A; 2F7V A; 3M8P B; 2N4D A; 4DQI A; 3MR7 A; 2XSJ A; 2D3Z A; 4U8Y A; 4PWD A; 2N4C A; 1ROF A; 2HVZ A; 4UQG A; 2UUA F; 4BWJ A; 4RNM A; 5AXK A; 1N33 J; 1I6J A; 3B6B A; 1NHU A; 3FUY A; 1L3U A; 4ZPC A; 3CD5 A; 4ZVT B; 3KLH A; 3P45 B; 4UUX A; 3V6K A; 1NKB A; 1HQE A; 2CJQ A; 2FIU A; 1NSQ A; 2OPR B; 2DHS A; 3NG8 A; 4CIO A; 4O4R A; 4GRS A; 4OHY A; 4NPO A; 3MM9 B; 3M30 A; 3C15 A; 1Y00 A; 3QT7 A; 3H4B A; 2BMB A; 2KVQ E; 4KGV B; 3CCZ A; 2KZM A; 1EIY B; 2MB0 B; 2VDI A; 3NY0 A; 2CQ1 A; 2FHO B; 3DRR B; 5F3T A; 3MUT P; 5E7O B; 3V4I A; 5HL7 Q; 3NS7 B; 1DAX A; 3TZZ A; 2XGQ A; 2CG4 A; 3T5K A; 1B7Y B; 4CO1 A; 2VQF F; 2D3O R; 3KXD A; 2VBW A; 3LOU A; 1LOU A; 3K5L A; 3EVW A; 3TX0 A; 4K4S A; 5KOX A; 5LMN J; 4NA3 A; 1OMS A; 4ZIV A; 4UOF A; 3M2V B; 1SUQ A; 2GAG C; 5ETO A; 2DR8 A; 3KG4 A; 2ZZN A; 3ICL A; 4TN2 A; 3ZTO A; 5G0R B; 2Q6C A; 4NLQ A; 1IKW A; 3BV8 A; 1YIT S; 3O5T B; 1QLN A; 3BQ1 A; 3WC2 A; 4CP5 A; 1T9W A; 4P2S A; 4EMD A; 3OR1 B; 3BGU A; 3TZX A; 2OKQ A; 3SV3 A; 2VQE F; 4TYB A; 2BE9 B; 2GNK A; 1YZ6 A; 4Y28 C; 2B9X A; 3OXG A; 1SKW A; 2I8E A; 3IA0 A; 1CJU A; 4AXI A; 1YJV A; 3OUY B; 3M2U B; 1VQ9 S; 4J5O A; 4RW6 B; 3WX8 A; 1DFD A; 1TR0 A; 1C1B B; 4M5N A; 4X84 A; 1KQK A; 4DXL A; 2HNY B; 1X9S A; 1QSS A; 2KYZ A; 3DDK A; 1JLQ B; 1RA6 A; 3H7H B; 4DLE A; 1U26 A; 2YNG A; 2V8P A; 3VV2 B; 3BPS P; 1D9F A; 4OZ5 A; 4PZV A; 1KR4 A; 4AL6 A; 2GO8 A; 1RI7 A; 1R43 A; 3BBB A; 1QAI A; 5L9N A; 1SC3 B; 4BC7 A; 3VAM A; 3BQ0 A; 1N0V C; 1BE4 A; 1FX4 A; 1TFY A; 4G6V B; 3JYT A; 5ETS A; 2F63 A; 2CZ9 A; 1Q7L B; 2GVD B; 2XI3 A; 3ZTP A; 3G6E S; 2F3J A; 2R7W A; 3AJ1 A; 5GME A; 3G82 B; 1YLX A; 1JB0 C; 2OH2 A; 4LF6 J; 2P8I A; 2VFT A; 2QL5 B; 3DLK A; 2W25 A; 2DY1 A; 2IYG A; 2VIH A; 1JJ4 A; 3HHE A; 3EVO A; 4UT4 A; 4DS4 A; 4QBU A; 5B0D A; 5DQH A; 1TV6 A; 5L1I A; 3VHQ A; 5J2M A; 1CG2 A; 2YNF A; 5EX3 A; 3ELH A; 4IH5 A; 2ZZT A; 1VQO S; 2ZH8 A; 2UXB F; 3I6P A; 3OHA A; 2FY1 A; 3FZ2 A; 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3EGZ A; 2V9W A; 5B0F A; 1IQZ A; 4GC7 A; 1YJ7 A; 3EE3 A; 3F44 A; 5GAH U; 4LBI A; 4CYU A; 3RBE A; 3RR8 A; 5GAE I; 2XEX A; 4NML A; 4WBF A; 2HFO A; 4N76 A; 3OT9 A; 2DNK A; 3TX8 A; 1RCX B; 2ATC B; 5HK4 A; 3CDU A; 3SZ2 A; 3MOJ B; 2DNG A; 4LF1 A; 4A8X A; 3IBW A; 3OTO J; 4C7Q A; 1TQL A; 1K1S A; 2MQP A; 2JLF A; 2HBQ B; 1VRT B; 2EI5 A; 2M0G B; 3TUZ C; 3LA0 A; 3ULH A; 5KT4 A; 1BWE A; 2MKS A; 3EVM A; 4AD6 A; 3CCS S; 2L3M A; 1FVS A; 3MCN A; 2BYC A; 1S1V B; 5K9F A; 4OHZ A; 1Y10 A; 1RHR B; 3GJT B; 4JI0 J; 2VB6 A; 4DF8 A; 3FEY B; 3NCQ A; 1RAB B; 2E5L J; 2BRK A; 4CWB A; 1NM2 A; 5DZ7 A; 4WYW A; 5J2N B; 2NYI A; 3I55 S; 3QBC A; 4N56 A; 1KHW A; 1UVM A; 3UVJ A; 3HXM A; 2LA6 A; 3EM1 A; 5HVH A; 1Y5L B; 2IRX A; 3H5S A; 1IVZ A; 4J9N A; 1YZ7 A; 1DZ5 A; 3ZZU A; 4QIW D; 2GO9 A; 2VG5 B; 5IQ6 A; 4X62 J; 1SJ1 A; 1UJ6 A; 3UDC A; 3D9B A; 1WC1 A; 1XR6 A; 3DHW C; 4J90 A; 2OUG A; 3M9O B; 1B0P A; 3CC7 S; 2PI4 A; 3BDE A; 1EKS A; 1NPP A; 3IS9 A; 5KG7 A; 5ETL A; 4Q44 A; 5ETP A; 4H54 A; 3QAE A; 1TKD A; 3DLH A; 2UXC J; 3NGR A; 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