2IIRA

Acetate kinase from a hypothermophile thermotoga maritima
Total Genus 132
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
132
sequence length
400
structure length
400
Chain Sequence
MRVLVINSGSSSIKYQLIEMEGEKVLCKGIAERIGIEGSRLVHRVGDEKHVIERELPDHEEALKLILNTLVDEKLGVIKDLKEIDAVGHRVVHGGERFKESVLVDEEVLKAIEEVSPLAPLHNPANLMGIKAAMKLLPGVPNVAVFDTAFHQTIPQKAYLYAIPYEYYEKYKIRRYGFHGTSHRYVSKRAAEILGKKLEELKIITCHIGNGASVAAVKYGKCVDTSMGFTPLEGLVMGTRSGDLDPAIPFFIMEKEGISPQEMYDILNKKSGVYGLSKGFSSDMRDIEEAALKGDEWCKLVLEIYDYRIAKYIGAYAAAMNGVDAIVFTAGVGENSPITREDVCSYLEFLGVKLDKQKNEETIRGKEGIISTPDSRVKVLVVPTNEELMIARDTKEIVEK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Transferase
molecule keywords Acetate kinase
publication title Acetate kinase from a hypothermophile Thermotoga maritima
rcsb
source organism Thermotoga maritima
total genus 132
structure length 400
sequence length 400
chains with identical sequence B, C, D, E, F, G, H, I, J
ec nomenclature ec 2.7.2.1: Acetate kinase.
pdb deposition date 2006-09-28

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00871 Acetate_kinase Acetokinase family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2iirA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2iirA02
1YUWA 4BG8A 3B8AX 4MO4A 1G99A 1NMDA 5AQNA 3H3NO 4CI6A 2IVOA 1BO5O 3O08A 3ATVA 2GUPA 3M6GA 5FPNA 4CBUA 3ENOA 2ASMA 3U8XA 4CJ7A 4BRIA 1GLDG 3CI5A 3FZKA 1XC3A 4BREA 4PKHA 4JHDB 2BTFA 1XQSC 2P9PB 4C23A 1LOTB 4IZ9A 5ADXA 3ID8A 4H5VA 4L3QA 5KPZA 1BUPA 4BQZA 4E1JA 4BRFA 4H5NA 3GL1A 3LM9A 4H0TB 2Q0RA 2A42A 3VGMA 2ZF5O 5AQTA 3HSCA 2FSJA 1NGAA 2YI1A 2IVPA 5E26A 5LJWA 3EKUA 1HLUA 4CZHA 3GG4A 4BR2A 1K8KA 2DPNA 2CGJA 3A5OC 3CIPA 1NGHA 2FF3B 4YDUA 2P9KA 3SJHA 3VENA 5KQ8A 4DCHA 3D2EA 4FPAA 5AQYA 4BRPA 2A5XA 4WQ5A 2CGKA 3D2FB 5AQSA 4RTFD 1NGDA 3ZEUA 2GWJA 2P9SB 4ISGA 1DGKN 3H45C 3VEWA 1NGEA 5LJVA 5BREA 3CQXA 2PAVA 3CJCA 5KQDA 3VEZA 2P9UA 5FPMA 4A61A 3ZX0A 5AQMA 2VWBA 1ATRA 5EOYA 4AM7A 2CH6A 5AQIA 2WUSA 3FFKB 3L6QA 2I7NA 4M63C 4EFHA 5FPDA 2YJEA 3VOVA 3U9DA 1GLLO 3VESA 5EY4A 4BR5A 5AQHA 4PL7A 4CD3A 4XH5A 1U2VB 5JLHA 3AY9A 3JXUA 5BPMA 1DKGD 1WUAA 3SMPA 5AQPA 3CQYA 1S22A 3MDQA 3MN5A 4M7YA 3UKRB 5CE3A 4FOEA 3S41A 2Q1NA 4IJAA 4BG9A 3O4WA 4JHDA 3HM8A 1X3NA 2AA4A 3FZHA 4BRMA 3MMVA 3FLCO 1SQKA 1RDWX 1T44A 4O8KA 1K8KB 1OKJA 3W3DA 3GOIA 3QDKA 3H3OB 1KAYA 2V51B 3BP8A 1MWMA 4BRNA 2CH5A 3D2EB 4I6MB 1BOTO 5AQRA 2Q2RA 5F1XA 1JCFA 3IUCA 1GLAG 3DWLA 4QS9A 3A8YA 1Z6RA 4RCHA 5AQKA 3WQTA 3UKUA 4FWSA 2E2QA 4BC4A 4CZMA 5JLFA 3FZFA 3QB0A 4DQ8A 3D2FA 4EHUA 1SAZA 1BDGA 2D0PA 3R9PA 1IG8A 2P9SA 4FWNA 2P9LA 1GLBG 2QWLA 3VGKA 2FSKA 2A3ZA 3GE1A 1QQNA 4FOIA 2QWPA 5AZJB 3WXJA 3SLCA 1H1VA 1V4SA 2GTDA 3W0LA 4H0XB 5AFUH 3DXKB 1WOQA 4FPBA 4BRHA 4BVOA 2HF4A 3QBXA 3RSEB 4BRQA 5KPRA 1R59O 5AQWA 2P9NB 2NZTA 4IJNA 4IO8A 3IMXA 3HI0A 4WYBA 3SMSA 4O5FA 2W40A 3VEVA 2D1KA 4QS7A 1BA0A 3D7EO 1U6ZA 1BG3A 4EHTA 3O1WA 1GLFO 1U2VA 1GLJO 1ATSA 4MLEA 4BR9A 3LL3A 1J6ZA 3UKRA 4Z94A 4JN4A 3TU5A 4DHYA 4FWOA 2A40A 3A5LC 4B1ZA 4B1VA 2UYTA 2E1YA 5F2RA 1BU6O 1ZXOA 5AQQA 2QWMA 3CHWA 3WXIA 4QS8A 1YVNA 5LY3A 1ATNA 3UKUB 4BRAA 1T6DA 4B9QA 2VYPA 4CZFA 3CETA 4I6MA 4BRLA 1DEJA 3EKSA 2P9LB 1SZ2A 1Q18A 2J4RA 2ZGYA 3IDHA 2QWOA 3CJ7A 4HTLA 2I7PA 4XH4A 4BR7A 5AQXA 3KZBA 3FGUA 3VGLA 3M3ZA 2HF3A 3AAPA 5AR0A 4BC5A 5EXWA 3WEEB 3KHYA 4RWTA 2Q97A 1Z05A 3F9MA 2F9WA 5AZJA 5EVZA 5JMVA 3BF3A 4IWVA 1MDUB 5BRFA 3CJ9A 3EZWA 3U9ZA 3QMLA 2GWKA 2E8AA 5FPEA 5JICA 1JCGA 1XUPO 3WXKA 4B1YB 3CJAA 3DXKA 3LDNA 1X3MA 3I33A 1QQMA 1E4GT 5F0XA 2BUPA 3RSEA 1MA9B 5AQVA 2P9IB 3HTVA 1KAXA 2CGLA 1QZ6A 2P9NA 3TPQA 2ITMA 1S3XA 4K43A 1T6CA 3SK3A 1CZAN 2VCPA 3QFUA 2YHYA 4F9OA 3MN7A 4CZJA 3GBTA 1HKBA 1YXQA 2QW9A 2YHWA 3ENHA 4BR4A 1HX1A 3MN6A 5BN8A 3JS6A 2QWNA 5AQJA 4IXCA 3J8AA 2E2PA 4GY2B 1NLVA 4HWIA 4PKIA 4FWQA 4XEIA 3DXMB 3VEOA 3UE5A 3LDPA 3ZETB 2NLXA 1E4FT 2H3GX 3MN9A 4BRGA 3ULEB 5EX5A 4A62A 4BVPA 2ASOA 1MWKA 5ADXH 3M1FA 4CZKA 1HPMA 4NO7A 5BRDA 4H0VB 1LCUA 2NRHA 3C0BA 4B1WB 2V7ZA 3ZX2A 4BRCA 1Y64A 4FWMA 2E20A 4BC2A 1D4XA 1ZBSA 1GLCG 2QWQA 2D4WA 3WEEA 3H46O 3BF1A 4JD2A 4MLHA 4M7XA 2YJFA 5AZIA 3C7NA 4AM6A 4BR0A 5AQUA 1YAGA 1HKCA 3BEXA 3L0QA 4H5RA 1TUUA 5B8HA 2QM1A 4WQ4C 1RFQA 2FSNA 3VF4A 2A41A 2E2NA 2OANA 2KHOA 2P9IA 4DB3A 2V52B 3EL2A 1ESVA 3AARA 1C0FA 4BGAA 3QBWA 4ISFA 5AQOA 2FF6A 4BQLA 3HBTA 1QZ5A 4JNEA 3VEYA 3AAQA 1KAZA 3A0IX 1NGJA 3EO3A 3LDQA 1NGIA 3QICA 1EQYA 3O8MA 4EIAA 4FSVA 3A5NC 2GEMA 3WXLA 2QWRA 3VEXA 2V7YA 3IFRA 5AQGA 3H6EA 1NWKA 3FZMA 3MCPA 3DXMA 4FWPA 3ZETA 2IIRA 1NGCA 4CZIA 4Y0WA 2HMPA 3VERA 1BA1A 4JAXA 3ULEA 1QQOA 2ZWHA 4J8FA 5AQLA 3A5MC 1X9JA 3DAWA 2E1ZA 4H0YB 5KPTA 2A6AA 1QHAA 5AFUA 3CERA 4CZEA 1RGIA 2ASPA 2HOEA 4FWKA 4JD2B 4ISEA 3LM2A 3P4IA 3C7NB 4FL9A 5AZIB 3EN9A 4K42A 2ZGZA 1BWFO 3O80A 3I8BA 2Q0UA 2D0OA 2F9TA 1NGGA 4FWLA 5AQFA 4H5WA 4H03B 3WT0A 2Q36A 2FLOA 3CJBA 2YHXA 4H0OA 3BUZB 2W41A 4WQ4A 4CZLA 4CBXA 1TYQA 2Q31A 2FXUA 4PL8A 4BGBA 4K41A 1HJOA 2AP1A 4GNIA 4FO0A 5I9EB 3R6MA 3LDLA 4EAHD 3LDOA 4NB4A 1GLEG 2EWSA 4XH1A 4LC9B 2GELA 3O5BA 1P8ZA 3VF2A 3R8EA 2YCHA 4B1UB 4K25A 1NM1A 3CJ1A 2PBDA 2E88A 3O1BA 3ZX3A 3U4LA 5BPLA 4H5TA 3H1QA 3O6WA 4CBWA 1JCEA 1NGBA 1HUXA 3QFPA 4BRDA 4FWRA 1ZC6A 2P9PA 1TUYA 3UB5A 3DJCA 3H1VX 2IVNA 4BC3A 3FE1A 1IJJA 4YDUC 4PKGA 3VETA 3GDQA 2P9KB 4BRKA 4WQ5C 5ELZA 5TKYA 4MO5A 3ZEUB 4CD1A 3ATUA 3KVGA 4A2AA 4CZGA 3HZ6A 5E84A 1NBWA 1KXPA 4A2BA 3FZLA 4B1XB 3OHRA 3G25A 5BRHA 3L4IA 2E2OA 3VF6A 3WQUA 1C0GA 2P9UB 2QXLA 3WUHA 5BN9A 4KBOA 1V4TA 3FR0A 3VPZA 5BPNA 1TYQB 3MK6A 1NGFA 5BR9A 1HKGA 5AQZA 4H0PA 4BROA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4BG8A 1RT7A 2XRIA 3THVA 4CI6A 1BO5O 3CG7A 3S3NA 3ULDA 5FPNA 2UUBK 2ASMA 2ITGA 3U8XA 4B3SK 1QVFM 4DSIA 4BREA 4JHDB 4C23A 1LOTB 5MLCQ 3ID8A 3CCQN 3DI6A 3G71N 1VSLA 1VSIA 5GAGP 3LDSA 1OH5A 3ZT0A 4C8KA 4B9UA 3SAFA 3KK1A 2IVPA 3RMCA 1UA1A 4FJJA 2HHQA 4EZ9A 1HLUA 1YJWN 4OX9K 4BR2A 3ZSRA 1K8KA 2CGJA 2XY8A 1CXUA 5JS2A 3PY8A 2HHXA 1NGHA 2FF3B 1FW6A 4YDUA 1RT4A 3SJHA 4DKWA 2Z1HA 3SUNA 2A5XA 4WQ5A 2CGKA 1HQEA 4RTFD 1NGDA 1YVUA 1TKDA 4I9QA 3K9JA 3BGRA 1DGKN 3QIOA 3H45C 2VQEK 2NUBA 3OYAA 4F4KA 3CQXA 1KFSA 3CJCA 3O9UA 3HP6A 4CGGA 2KLAA 4N47A 1QSLA 1D5AA 5AQMA 4PUOA 4DTPA 5KGWA 2O8DA 3D45A 1D9DA 4AM7A 1HNZK 3L6QA 3R3LA 4KRFA 1HYZA 4M63C 1VQLN 2YNHA 2HVHA 1TL3A 5FPDA 2YJEA 4FVMA 3HL8A 4LSNA 1ILYA 4OPJA 1JJ2M 1DTQA 3OA9A 4XH5A 5JLHA 2XHBA 3JXUA 1WUAA 1S5JA 4IFYA 3CQYA 5CE3A 2UU9K 1Q86O 4IJAA 1YJNN 4JHDA 3HM8A 5HRSA 3HPOA 4CE9A 4JKHA 3TSUA 2YHBA 1VQNN 2OPPA 1OKJA 4CJFA 5M1FA 3QDKA 1KAYA 2V51B 1VQ5N 1Z25A 3D2EB 5AQRA 2Q2RA 1JCFA 3DWLA 1JLEA 3UKUA 1T05A 1KVCA 4FWSA 2G8KA 4B9MA 3CF5L 3FZFA 3EE8A 4JS4A 2O4GA 5CYQA 4F3OA 1BDGA 1N33K 4B3TK 4FWNA 2WC9A 3J80O 5A2QO 3Q7BA 4J2DA 5LMUK 1RNHA 2BH1A 5AZJB 5M1OA 1UAXA 1V4SA 1VRUA 2GTDA 1NK9A 4CJPA 1GOAA 1T03A 1WOQA 4FPBA 1X9WA 3ZSOA 1UA0A 3I55N 4DV3K 4PWDA 1JXBA 5KPRA 5M1PA 3QO9A 2IGIA 4O5FA 2UXCK 1RBTA 1Q8IA 4FXDA 1D8YA 1S9EA 1KVBA 2ETJA 4YORA 2ZJQL 2QEXN 3OYMA 1GLJO 4XIUA 4MLEA 2YKNA 4FJXA 4BDYA 1GOCA 3HSTB 4FJ9A 4CHZA 4Z94A 5KTQA 4CF9A 4DHYA 4N5SA 4Z4FA 1J5EK 1BI4A 1J53A 1RBVA 3T1AA 4NCAA 3M8SA 1Q9YA 1ATNA 3DLHA 5C2DA 3DM2A 1DEJA 1W9HA 3TSPA 4Q5VA 4KHPK 2YNIA 4U67L 2J4RA 1LAVA 2QWOA 4XH4A 1TKXA 4BE0A 3VGLA 1WBBA 2HF3A 3AAPA 3R1XA 2Z1GA 4BC5A 5EXWA 1J5OA 4KREA 3KHYA 2Q97A 3F9MA 1QTMA 3ZSWA 3AV9A 4LH5A 1VSFA 2KTQA 5AZJA 2RKIA 1WSHA 5BRFA 1ZBLA 1MDUB 2GWKA 1KSPA 1JCGA 1XUPO 1F21A 3CJAA 3LDNA 1IV0A 1X3MA 3OYBA 3L2VA 3KLIA 4F2SA 2CGLA 4BWJA 5GAHP 1TK0A 1RTDA 2HHWA 3RTVA 4YY3K 4KHNA 3JSMA 3M8PA 4DQIA 1HKBA 1YXQA 3V9UA 2QW9A 4AHTA 1U04A 3MN6A 5AQJA 3VQ4A 3RMBA 2GV9A 1C0TA 4HCCA 4KAZA 4HWIA 3G0ZA 4Y1CA 2BDPA 1U4BA 3VEOA 4CERA 4B8CA 4BRGA 3MX5A 1NOYA 3VMFB 3CFOA 3ZSQA 2OPQA 3MEEA 2ASOA 5ADXH 4FJLA 4JI8K 1SUQA 3IAYA 4N76A 1RT3A 3OYNA 3VQPA 3LWMA 1LCUA 2NRHA 3C0BA 4CIEA 1L5UA 4B1WB 3ZX2A 3AVAA 1VSJA 4BWMA 4KHQA 4IFVA 4FWMA 4FLVA 1BIUA 1D4XA 3PIOL 2D0AA 4CJUA 3PIPL 4MLHA 4M7XA 3OYEA 3V9XA 3OYFA 1NJZA 2QKKA 1ASVA 3A2FA 1KQSM 1Q9XA 5B8HA 1HYVA 2E6LA 2VQFK 3ZT3A 4K8XA 3LZIA 3THWB 1IKXA 4AHCA 1REVA 2G8HA 3EL2A 4FW1A 1ITGA 2O8BB 1HMVA 4BGAA 3NBPA 2FF6A 4DR5K 4JNEA 4DR1K 1WSJA 3AA4A 1NGJA 3QICA 1NGIA 3AVCA 3O8MA 3KLHA 5FROA 1CXQA 3I0RA 1NKEA 2QWRA 1X9MA 2V7YA 3BZKA 5AQGA 1JKHA 3LANA 1ASWA 1S72N 3C6UA 3FZMA 3L2UA 5HL7L 4CJTA 4FYDA 1EX4A 3C94A 4DSFA 2UXDK 5LMNK 1NGCA 1A5VA 3VQEA 1IH7A 1VQ8N 2HMPA 4OKJA 5GADP 5AQLA 3A5MC 1X9JA 4NCBA 2DFFA 3F2KA 1NKCA 4CZEA 1KRPA 3TTFA 4YOXA 3EYZA 4CEAA 3CCUN 3SUPA 3KJVA 4CJKA 3LM2A 2B5JA 5AZIB 4DUYK 5T7BA 4FJKA 1RILA 3M5RA 4A5BA 3G6EN 3VA0A 2ZGZA 1BWFO 3RR7A 2ZE2A 2X6SA 2D0OA 4B9SA 1NGGA 4LF8K 2G8IA 1ZBIA 3T7ZA 1L3VA 1FKPA 4CJ5A 4I2QA 3O9SA 3IG1A 3NF6A 1C1CA 4H0OA 3BUZB 2W41A 4WQ4A 4CBXA 3I8DA 2Q31A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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