2IQTA

Crystal structure of fructose-bisphosphate aldolase, class i from porphyromonas gingivalis
Total Genus 95
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
95
sequence length
295
structure length
295
Chain Sequence
NAMNKEQLQQMRQAPGFVGALDQSGGSTPKALKAYGIQPDAYQSEEEMFDLIHQMRTRMITSPAFATGKIIGVILFERTMRGKIEGMPTADFLWEKRHIVPFLKVDKGLQDEANGVQLMKPFPELGKLCEEAVGYHVFGTKMRSVIKQANEQGIRDIVEQQFQWGKEILSHGLVPILEPEVDIHCPEKAKAEEILKRELLAQLDKMTEPVMLKITIPTVDNFYKEIIEHPMMLRVVALSGGYSREQANELLSRNHGVIASFSRALVEGLSARQTDAEFNAMLEASIEDVYQASIK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Lyase
molecule keywords Fructose-bisphosphate aldolase class 1
publication title Crystal Structure of Fructose-Bisphosphate Aldolase, Class I from Porphyromonas gingivalis
rcsb
source organism Porphyromonas gingivalis
total genus 95
structure length 295
sequence length 295
ec nomenclature ec 4.1.2.13: Fructose-bisphosphate aldolase.
pdb deposition date 2006-10-14

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00274 Glycolytic Fructose-bisphosphate aldolase class-I
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 2iqtA00
1W8SA 4OGZA 3BVJA 3IIPA 1KFCA 5DY3A 5CZSA 4JY8A 2CLLA 3PUDA 4XUGA 4JNMA 2NXHA 3UYCA 2QEZA 3G1XA 1LTDA 1K02A 1KM2A 3M7WA 1K8XA 1GZGA 1JCXA 3TMQA 2H90A 3IIZA 4MLJA 4DPQA 3S5YA 2WKJA 1UASA 5LGXA 1LOQA 2Y70A 1LBLA 3HB9A 4OE7A 1HUVA 3KRUA 3S6DA 4BI5A 1XI3A 2Y89A 3L0NA 4PA8A 4TO8A 1A50A 1LCOA 5HUOA 3W1UA 1TV7A 1W5MA 2BLEA 3PUOA 4NVTA 3TSDA 2YW3A 2PRMA 3HGRA 5C55A 4UFJA 1LLZA 2V30A 5E93A 2E5DA 3QJAA 1I8JA 5HR6A 3R12A 2FQIA 2RDWA 2ZZ3A 5F4WA 1SZFA 5T26A 1XKYA 3T78A 3O1NA 4N02A 2VFDA 4K8EA 5TBOA 3W7MA 2CZEA 4M6QA 4M7SA 3P67A 2DZUA 3MHGA 4ZQNA 4JYEA 5AHLA 1G6CA 1JQVA 1KLYA 3ZWTA 2PCQA 2QCEA 4J9JA 1Z41A 4PL2A 2R91A 4OU1A 4U4MA 5G4EA 1B57A 3FA5A 5D05A 4UMAA 3IV3A 5G1TA 5H2ZA 3B8DA 1VJIA 1SW0A 2C14A 1VQTA 2QJGA 4N6EA 1CX9A 3G22A 2F84A 3M5YA 2QDGA 3GR8A 2CLOA 1RD5A 2E5CA 3THQA 3DFPA 4JX6A 5FF7A 4GNJA 4MOZA 4FIRA 3TAKA 3BW4A 5F4XA 2TPSA 4CNPA 1ZALA 1BWLA 4IMEA 3ZS4A 3TX9A 3IIXA 3W1PA 3KHJA 3B4UA 3W7OA 3LRLA 3W07A 3W7PA 1RPXA 3SZ8A 2CLEA 3S5ZA 3SY5A 1UUMA 3STFA 4AWTA 1W0MA 4GUIA 1LBFA 3BG3A 4ZQMA 3HO8A 1K03A 1QPNA 1TJPA 2FPVA 3ATZA 1JCLA 3UZ5A 4NU7A 1R2SA 1WBHA 1R46A 5BW6A 3AJXA 3G0XA 3EX6A 1OX5A 5AHFA 2DZVA 3M16A 4NNCA 3M5XA 2OZ0A 3W7KA 2ISVA 5EBUA 1GTHA 1HFBA 4JIPA 3L9CA 2XN2A 5I3KA 3F4WA 2ZRZA 1O95A 3CPRA 1T96A 4IWWA 3L21A 2OMAA 4AVFA 1VC4A 3TK7A 1BKSA 1WDWA 1TTIA 2TSYA 3TU9A 2Q3RA 3L66A 3MYPA 3GDMA 4AEOA 3NQ2A 3S1WA 2R14A 4UC5A 4M7TA 5CPLA 3NQMA 2Z6IA 4NX5A 4HSNA 4BWLC 5BMXA 4UFKA 1SU5A 1TJRA 3DGRA 3QZEA 1OJXA 3UWWA 1NAL1 3W7CA 5FI8A 4I9AA 1VCFA 2ZA2A 5D30A 3LHZA 3INPA 3DI1A 4Z1CA 5CSRA 4DO4A 4WY0F 2Z6JA 4RXFA 4XKYA 3NQ7A 3QSRA 4GXMA 4FX8A 4GUFA 1ICSA 4UTIA 1TRDA 3LCFA 4Q4KA 2C15A 3KVJA 3NO5A 1SW3A 3W2LA 1TV8A 3C4UA 1EWEA 3KXQA 3GXTA 4BWLA 2QCDA 3LHTA 3FYPA 3FYOA 5U7SA 3WK1A 3PB0A 3NAVA 3ANYA 3NPXA 2DJLA 1F74A 1YDVA 3P80A 3P5ZA 3LTPA 3Q2DA 2CFFA 4MJZA 1EUNA 1J2WA 4KWVA 2FB3A 1IGSA 2C3ZA 5AC8A 1VYSX 3OBKA 4JY9A 4BFAA 1PHWA 2J27A 4MFDA 1G4SA 2ZTKA 4H4IA 2GOUA 1TPC1 2BZNA 3MI2A 1SO3A 3MUXA 3LRKA 1OG0A 3HGSA 3UWVA 3W72A 5KSWA 3M44A 3HMJG 4CQ9A 4JYDA 3TXZA 3F4NA 3C3NA 2DU2A 4ONVA 1OX4B 3RLUA 2ATMA 3R5EA 3TAOA 3W7JA 5K9DA 1C8VA 4LV4A 1XM3A 3DAQA 3C2FA 4LNYA 1X6UA 5HWJA 3L5LA 3W2KA 3SI9A 2RKXA 4IX2A 5LNRA 3W1TA 4UTLA 1DQWA 1TQXA 1JCMP 3P60A 3DHDA 4PEKA 4Y90A 5SWUA 1EEPA 1H7WA 1I45A 3W70A 3W75A 2QCMA 4DO6A 1MO0A 2FLIA 1Q45A 4P2VA 4TIMA 2VFEA 1YDOA 5K4ZA 2DZSA 4O17A 2ALDA 4DXVA 5HINA 4O1CA 3HGOA 4CQAA 1RVGA 3P8IA 4NX0A 1OVDA 1W3IA 2QCLA 3W7LA 3TKFA 1TPWA 3V75A 4N9DA 4ZQCA 1KM1A 3TJXA 2ZZ6A 4YCOA 3NR0A 3O6YX 3S1UA 2NUXA 1FCBA 3EXSA 4QITA 4BI6A 4N4PA 4IPIA 8TIMA 3R89A 4QISA 2C6QA 5HMSA 1H7RA 4ZVJA 5AYZA 3NL6A 4NZJA 2ATSA 4H6KA 1S5TA 2FPTA 3RFAA 3PY2A 2X30A 5LNWA 3CTLA 1DQXA 1M7PA 2Y7DA 4LC8A 3UWUA 1VZWA 3C2EA 4XTDA 3W7NA 5K2ZA 5MHBA 5FF3A 3IGSA 3PULA 3WK2A 3CWOX 3EWWA 3MHUA 3MBFA 5J5DA 4ALDA 3M0ZA 3GKAA 1DKWA 1EPXA 1FCQA 3WJXA 3P61A 1TTPA 5AHNA 2QAPA 2H8XA 5LHEA 3QPYA 3WJSA 5IBXC 1P5BA 4PC8A 1G4PA 2VEKA 3V1PA 1KV5A 1VR6A 3DFNA 2QCGA 2Y63A 1KM5A 2RDUA 3T7VA 1ZENA 4KFPA 1X7FA 1ZFJA 4R34A 4JTTA 4MJMA 2BXVA 2YSWA 3MP4A 1H61A 2V5LA 3GDRA 2CLKA 5IBXA 1PCKA 3NQVA 2ZZ1A 2X1SA 1Q6OA 1F2JA 3GK0A 4AF0B 3W7EA 1L9WA 5D02A 1K3UA 4O0KA 3NM1A 4MVAA 2DJXA 5BMWA 2QJHA 4JS3A 3NQFA 3PS7A 3A22A 4S1FA 4LWWA 4FXSA 2O7QA 1ZNNA 3HBLA 1LOLA 4HIBA 4O28A 4DPPA 3PBUA 3IGXA 4HNTA 1VH7A 4Z0JA 2PRLA 1GT8A 2A2IA 4AWUA 4ADSA 1O4UA 3BARA 5HQEA 3LB0A 2FPYA 4Z0SA 4UTTC 4UR8A 2DORA 4E38A 4P61A 1E51A 1EA0A 3NL5A 3VNDA 2ZA3A 2QJIA 2Q8LA 4ZQOA 4YCPA 3N2MA 3L65A 4RX0A 3MP5A 5DBUA 2OJPA 1VYPX 4IPJA 2PE4A 1BEUA 4FX6M 1KBJA 4ADUA 1TPUA 4H3DA 1NEYA 3PG8A 1O5KA 1J4EA 2FFCA 3KAOA 4K39A 4MIMA 4M19A 2CLMA 4UTTA 2VXNA 4O1BA 4TX9A 3HOJA 4IOTA 1G4EA 3A5FA 4N4QA 3C2OA 3N19B 2GQ9A 1TYGA 3I6RA 4PCFA 2NXGA 1W3TA 4W9TA 3EX3A 1ZAJA 1VHCA 3OEXA 4RKAA 5AHMA 3IVTA 2H3BA 5KITA 3PBWA 1ME8A 1I2OA 2H3DA 1UJPA 4FNSA 4EVZA 3YPIA 3M5VA 3EX1A 4DBEA 3QQ1A 5LSMA 4HKPA 5G2IA 4OBTA 4EOUA 2V8ZA 1TRIA 3CEPA 3FOKA 4OWGA 2ZZ5A 3UY7A 1Z44A 3P5YA 3B05A 3W1RA 3LXBA 2B7PA 3QEZA 4UFIA 4MLRA 2Y7FA 2VENA 1EIXA 1KW1A 3PBVA 3VE7A 2AGKA 1B9BA 1P0KA 5I3HA 2DP3A 4IMDA 4RZ5A 1W3NA 2QUVA 3KVMA 1TPDA 4JGDA 1W54A 3O6CA 4KKXA 2B7NA 2PURA 3NZ1A 5F2LA 3NGJA 3IEBA 1AL7A 4O12A 3S9YA 3C8FA 1Q6RA 2BSLA 1I2NA 1N7KA 3EWZA 2FTPA 4AMAA 5DLCA 1LROA 3LRMA 2I9EA 2V82A 2J9ZA 4UTHA 1DBTA 2C18A 3G3DA 2ZQ0A 3M5ZA 4RJEA 4BR1A 4A2SA 1O5XA 3P62A 3A5VA 3UWZA 1LZOA 3C2RA 4O4WA 5FF2A 4BK9A 4YL2A 5F2MA 2V2CA 3UNDA 2AAMA 5AYXA 4K7YA 3BLIA 4IGHA 1SW7A 3W86A 4POCA 3W7QA 2OX1A 3BW2A 3OVPA 5KZEA 4LT9A 1TO3A 3I7QA 4G1KA 1L6SA 2A5HA 2VKZG 4RCXA 2Q3OA 2ABAA 2ABBA 4FNQA 2VFIA 4JTEA 4IUOA 3SFKA 3TQVA 5EMUA 2B0MA 3NVTA 1FWWA 4UCGA 4KFOA 2GJLA 2WOQA 3SSJA 3BLFA 5DELA 3G1HA 4UMBA 3CIWA 3KRZA 1IXNA 3STCA 1ZJIA 3W88A 1EP3A 3AO0A 1QR7A 4ORMA 4JX4A 3OG3A 2A4AA 3VFLA 4E2BA 3L5AA 1TB3A 3P8JA 1W37A 2ZDRA 1AW5A 4LVBA 4GUHA 3PAJA 1K7EA 3GYEA 1H51A 1H7PA 2ZCGA 3W22A 1YADA 3LI0A 3LCGA 1Y0EA 4E0CA 1H7XA 1QOPA 3OVQA 5EKYA 5C5YA 3N34A 4O52A 2V5BA 3TW6A 1WOBA 4UNKA 3IVUA 1KTBA 4O1DA 4WZHA 2DZPA 3LXAA 4OT7A 3PBYA 1JUKA 2HS6A 5I3IA 1LP6A 1QO5A 1YXDA 4CNNA 3KRSA 1H5YA 1ADOA 1A5SA 1XDMA 1AW1A 3TV8A 4DEFA 1SR9A 3DENA 3MYOA 3TW7A 3KFTA 4K6AA 1WXJA 3IGUA 1YTEA 1R2RA 2NXIA 4A21A 2WSYA 3SJ3A 4M6PA 3SR7A 3ATYA 1VCGA 1R2TA 1VHNA 2KZHA 5I3GA 2A6NA 3TCEA 2RFGA 5HULA 3N9RA 3VKJA 3WJWA 3NNTA 4B5NA 3LLDA 1FWSA 1W56A 1TV5A 3B03A 2XN1A 4DBDA 3HG5A 4WY0A 2QUTA 4GUGA 1OK6A 3HGJA 4KWWA 4NNBA 3W1LA 1TPEA 2QKFA 1K7XA 5D04C 2CZ5A 2NX3A 4CQ8A 1LRQA 4FEZA 3DHFA 5FEWA 3R13A 1PE1A 4QIUA 4HNNA 2JKEA 2NX1A 3C6CA 4CNOA 3CC1A 4UNLA 3MJYA 3W85A 1LM1A 3VE9A 3G0UA 3H53A 5CKSA 4C1KA 1EB3A 1XXXA 1IXQA 4M6VA 2A1YA 3RF9A 3BPWA 5D2YA 2V81A 3NOEA 3KX6A 1SZNA 2E6FA 4JTSA 1WQ5A 1G7VA 2QCHA 3OHIA 1VLIA 4DF1A 2V2DA 1YPFA 4HHPA 4WUIA 5K9CA 2Y7EA 2WNZA 3M43A 4ZZ9A 2NUWA 4I7WA 4AWSA 2Y85A 1WA3A 4NJGA 1Q6LA 3DFSA 4TU1A 4IX0A 3IIOA 3S5OA 1ZAHA 2GVLA 1JULA 4PH6A 1AW2A 4JEQA 2I1OA 2QCCA 4K36A 5CPOA 3TJLA 3TDFA 2A6LA 3BG9A 3EXRA 3W84A 4Y8FA 4X9SA 2YFNA 5AYYA 4AAJA 5G2HA 1OF8A 2GQAA 4NJIA 4N2YA 2WQPA 1OYBA 3O8AA 3H55A 4JTHA 4AHPA 1SUXA 3CM4A 3K30A 1TREA 3L67A 4ZQRA 4MPQA 4TR9A 3NPUA 5D2XA 4L4MA 2ZZ7A 3CT7A 1RQEA 1UBSA 3G1YA 4LY8A 1F6PA 1OFRA 1T0OA 4JTGA 5LNSA 3TFCA 1O94A 4NXSA 2J9YA 4XKYB 1LORA 1VLWA 3I65A 3DBPA 1DJQA 4MY8A 2VELA 4NQ1A 2Y7GA 1SFJA 4WQ6A 2IQTA 3D0CA 1OFQA 2QCDB 5LKYA 1QPOA 3LHYA 3W87A 1KBIA 3QFEA 4ORIA 4XTIA 3M6YA 1QWGA 1DJNA 2ZTJA 1G4TA 3N9SA 1R47A 3ABQA 5AOUA 3F1QA 1OFDA 4NZFA 1FWNA 4HPXA 1FY6A 3G1VA 1UCWA 2J9XA 3W7IA 2QAFA 3FJLA 4LS2A 5KINA 3KVKA 1D3HA 4DELA 4I7UA 3PR2A 1HO1A 1YXCA 4UUIA 2CW6A 4IMGA 3GKFA 1KFBA 1VRDA 3W9ZA 4NJJA 3H54A 3GNDA 2Y61A 3B0PA 3TUUA 1K7FA 4JTFA 3UXAA 2FDSA 2A85A 2TRSA 3IIVA 2EAWA 4DF2A 1J5TA 1DORA 2FIQA 5D37A 5AFDA 4LUJA 4FNRA 3TSMA 4MZ8A 4S2CA 1OHLA 4X22A 1SO6A 3TNOA 3NG3A 4LRSA 2PRHA 1TPH1 2W79A 3LHWA 1Z48A 4NUWA 4LOCA 4UTMA 5TQLA 2R94A 3PUEA 3FKRA 3EWXA 3OA3A 1OX6A 4AXKA 2GQ8A 4EF9A 2NX9A 5E1QA 4PTNA 3C0JA 3GZ3A 1XC4A 1ICQA 4O53A 3RK8A 2X1RA 2EHHA 3DZ1A 5CGQA 1SSDA 2Y62A 2EF9A 4A22A 1KA9F 3UXDA 1D3GA 2ISSA 2P10A 1F05A 3W7HA 1IXOA 3DKLA 3QMSA 4E2DA 2V2HA 3Q37A 2BWGA 3LDVA 1W5QA 3GX9A 1GYLA 2QUUA 3HPXA 2C13A 3W76A 3NQAA 3MBDA 2G97A 2TYSA 1H62A 1EUAA 1ZHAA 4Z1BA 3G24A 4N9BA 2ZA1A 3UZJA 3G8RA 2WO5A 2Y88A 1YLVA 5F2GA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
 3GC5 A;  3AYR A;  4LB4 A;  4JY8 A;  9CGT A;  3G1X A;  4P8X A;  4B2D A;  1LTD A;  1KM2 A;  3M7W A;  2CXE A;  1TFV A;  5LIU X;  3AFB A;  1MZR A;  1EBH A;  3TMQ A;  2H90 A;  3EKG A;  4DYJ A;  4DPQ A;  3GG1 A;  4JN8 A;  4YJ5 A;  1PTG A;  4OE7 A;  3A3W A;  2BHY A;  2AL1 A;  3QV6 A;  3S6D A;  1XI3 A;  2YBU A;  2QGH A;  2OO0 A;  1A50 A;  2BGQ A;  3LM3 A;  1TV7 A;  4US5 D;  1I9C B;  3TSD A;  3F7J A;  2INF A;  3R4I A;  1LLZ A;  2V30 A;  5E93 A;  3TP4 A;  5HR6 A;  4H9Z A;  5HAN A;  2VCB A;  3T78 A;  1OM0 A;  3O1N A;  2W67 A;  4N02 A;  3WEZ A;  2VFD A;  2BXZ A;  4H9V A;  4K8E A;  5TBO A;  1EOK A;  2CZE A;  4GGH A;  1SZR A;  1B90 A;  2DVX A;  3MHG A;  1PZ0 A;  1XYF A;  4JYE A;  3AMG A;  1G6C A;  2PCQ A;  1Z41 A;  4RNJ A;  3OBA A;  5D05 A;  5G1T A;  1F07 A;  1FWE C;  1JGM A;  3B8D A;  4EXB A;  1VJI A;  2CIP A;  1PWM A;  2PWG A;  3G22 A;  3WMB A;  4DM1 A;  4S3C A;  4JX6 A;  1KCZ A;  1Q63 A;  5FF7 A;  3WQC A;  1CXF A;  4MMW A;  1ZAL A;  2Z26 A;  3LMZ A;  4GLE A;  3W1P A;  4F0H A;  4GI9 A;  4C6N A;  3LRL A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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