The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
14
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sequence length |
56
|
structure length |
56
|
Chain Sequence |
MTYKLILNGKTLKGETTTEAVDAATAEKVFKQYANDNGVDGEWTYDAATKTFTVTE
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Immunoglobulin
|
| molecule keywords |
IMMUNOGLOBULIN G-BINDING PROTEIN G
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| publication title |
Pressure-Induced Changes in the Solution Structure of the Gb1 Domain of Protein G.
pubmed doi rcsb |
| source organism |
Streptococcus sp.
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| total genus |
14
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| structure length |
56
|
| sequence length |
56
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2006-09-11 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF01378 | IgG_binding_B | B domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Alpha Beta | Roll | Ubiquitin-like (UB roll) | Ubiquitin-like (UB roll) |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1FD6 A; 4OZC A; 4KGS A; 2ON8 A; 5BMG A; 2IGG A; 4KGT A; 1IBX B; 5HFY A; 2JSV X; 1PGX A; 3V3X A; 2PLP A; 2I2Y A; 1HZ6 A; 4WH4 A; 1XCQ L; 1MI0 A; 4D2K A; 1HEZ E; 1XF5 L; 2ZW1 A; 2JU6 X; 1K52 A; 1YMH E; 2J53 A; 3UI3 A; 2KN4 A; 1FCL A; 2JZP A; 2LUM A; 1C9F A; 1XCT L; 2RPV A; 1PGB A; 4KGR A; 1F2R C; 2IGH A; 2N7J A; 1MPE A; 1IGC A; 1F2R I; 1UWX A; 1K53 A; 4HKZ E; 2I38 A; 2QSD A; 1QKZ A; 2QMT A; 2EEL A; 5HG2 A; 1IGD A; 2LHD A; 2ZW0 A; 1MHX A; 5JXV A; 4MAC A; 1GB1 A; 2KDM A; 1P7F A; 4OZA A; 1ZXH A; 5BMI A; 1MHH E; 2PW9 A; 2GB1 A; 2RMM A; 1JML A; 2KAC A; 2GI9 A; 1FCC C; 2KWD A; 4IOI E; 5HHD G; 1EM7 A; 1K51 A; 5BMH A; 3GB1 A; 1K50 A; 1GB4 A; 2IGD A; 1P7E A; 4HJG E; 1Q10 A; 1MVK A; 2N9L A; 2NMQ A; 5HI1 A; 3FIL B; 2LHE A; 1HZ5 A; 1IBX A; 2K0P A; 2J52 A; 2ONQ A; 1D4B A; 2LGI A; 2N9K A; 4GLS C; 2JXT A; 2OED A; 3FIL A; 1KH0 A; 2KQ4 X; 1YNT E; 2PTL A; 4IKG A; 3MP9 A; 2JWU A; 4OZB A; 1PGA A; #chains in the Genus database with same CATH topology 2WDQ B; 1QOA A; 2KOX A; 1WYG A; 4RNA A; 1PYW D; 1JRU A; 2MW5 A; 4II2 B; 3U8Z A; 1XLN A; 2GMI C; 1KOT A; 2JPH A; 1HZ6 A; 3W2D A; 1P3Q U; 3AI5 A; 1XF5 L; 2WDV B; 2KFK B; 2DZK A; 3V61 A; 2W9N A; 2CU3 A; 3SDL C; 2KAN A; 2LGD A; 3PZ7 A; 2JT4 B; 1C9F A; 3A4S C; 2RPV A; 3JW0 X; 1XO3 A; 1WMH B; 1SXT A; 2L0F A; 1JWM D; 2N9X A; 3Q3F A; 4AJW A; 4B9K A; 2LJ5 A; 2WYQ A; 2WHI A; 4JQW C; 3VH3 B; 3AUL A; 1WGD A; 1WWT A; 5JH5 C; 3W1S C; 1RYJ A; 2ZW0 A; 5G2N A; 4UDU C; 1T0R C; 2G9H D; 4OVZ A; 3P63 A; 1ZE3 D; 4DWF A; 2BKR B; 1RAX A; 1V5T A; 3MC8 A; 1N6Z A; 3AU4 A; 3H7S A; 1TJE A; 4W9I A; 1ACC A; 2CU1 A; 3TBL D; 4DXF A; 1I4G A; 2WXQ A; 5IKC M; 3KLS X; 2K8H A; 1C76 A; 2AL3 A; 2XK5 A; 3QHT A; 4REZ A; 2R2Q A; 3PPA A; 2Y5C A; 2CHW A; 3LYY A; 4MGI E; 4TKN A; 1SB3 C; 2J0M A; 3VTV A; 4P7I A; 2L7R A; 1NDD A; 3ZDM C; 4W9D A; 2DZI A; 4RMA A; 1ZXI A; 1KH0 A; 1TS2 A; 2I1K A; 5EE3 A; 2UWQ A; 3R3M A; 1FM0 D; 2IZV B; 2JF5 A; 2NS5 A; 2VH2 A; 5HFY A; 4J3O D; 4AUQ C; 2LD9 A; 4WAF A; 1MI0 A; 3ZYY X; 4II3 B; 2PIA A; 3GE3 C; 3MJ5 A; 3TIX A; 3ENE A; 4GIV A; 2MBQ A; 4S17 A; 3VAW A; 5GXG B; 3A4R A; 4XDC A; 2WU5 B; 2QIL A; 3MHS D; 2ZVN A; 2UU7 A; 2JZP A; 4A55 A; 3M62 B; 4LNF A; 1SJH D; 3UQA A; 2MJ3 A; 3A1Q A; 2BF8 B; 1V1O A; 4P1B C; 4IWP A; 4NJC A; 4XE0 A; 2K5P A; 5EE9 A; 2D2Q A; 2CR5 A; 3DBL I; 3BII D; 4ARC A; 1WZ0 A; 3WAN A; 5GMV A; 4MEM A; 4NZL B; 3RFZ B; 1UEL A; 3A9J B; 4XGA B; 3P4Q B; 2FCM A; 1E6E B; 4LNI A; 5JXV A; 2JYT A; 2PVO D; 5AUI A; 2QC8 A; 3PHX B; 1P7F A; 3VTU A; 4OZA A; 1D5M C; 1MHH E; 3SR6 A; 3CST A; 4WWO A; 2KMA A; 1JW9 D; 4I6L B; 4MM3 B; 3RNF C; 4LNK A; 1WFY A; 3TEX A; 1WXA A; 1GUA B; 4HPP A; 4IDI A; 5LXH A; 5IOI A; 1RFA A; 1U4A A; 3FC4 A; 2Z0D B; 2N9L A; 4MDK E; 2XBB C; 2K39 A; 1CMX B; 2KC1 A; 3JYU A; 4BBN C; 1GC7 A; 3BVG A; 3ZRF A; 1C4C A; 2FCN A; 3EGR A; 3WAP A; 2JXT A; 3GZN I; 3KUC B; 2G3Q B; 4RGM A; 1TYG B; 3T3O A; 2WXI A; 2DYO A; 3NG0 A; 4M8M A; 3KWL A; 4WWN A; 3C0R B; 4KZ0 A; 3DHH C; 1JRO A; 2LVQ A; 4ZHO A; 5G55 A; 4ZRK A; 4BKS A; 3UI3 A; 1FEH A; 2KQS A; 2LWP A; 4I6P A; 1EU4 A; 3Q69 A; 1YN3 A; 3V60 A; 1D6E C; 3QAQ A; 2R2O A; 4IUM B; 2LGS A; 1YJJ A; 1BML C; 3ZJV A; 2XNA C; 3DDC B; 3L16 A; 2M0X A; 4RF1 A; 2YLM A; 4HPL B; 1XXG A; 2KC2 A; 3RUL A; 3O65 B; 1VZ7 A; 3PV1 A; 4J6I A; 1V1P B; 4WJP A; 3UQB A; 1N61 A; 4CQN A; 2IY1 B; 5LNK 1; 1F52 A; 2BPS A; 3ZNZ B; 1WM2 A; 2AWT A; 2WXH A; 4XWW A; 2C7N B; 2RD0 A; 2BBC A; 2KXJ A; 3AEA B; 2EKI A; 2FBW B; 2Z59 B; 2N7D A; 2BQQ A; 5BMH A; 3KWV A; 1OTR B; 4BKS D; 3ZNH B; 2BWF A; 4IM2 A; 1HXY D; 1JWA D; 3IVF A; 4AS1 A; 1Q10 A; 2DLB A; 4WQO B; 3NY5 A; 4LDT D; 3WAO A; 1YJI A; 4KSL C; 2KD0 A; 2DBY A; 4W9C A; 5D7G A; 2NTT A; 2W3S A; 1E9M A; 1C77 A; 3B2G A; 1S3S G; 4KKJ A; 2NBW B; 4ACF A; 4FJZ A; 1SGH A; 2KLG A; 3C8Y A; 4MH8 A; 1V5O A; 3L13 A; 4O1N A; 2C7H A; 4D2K A; 2ZW1 A; 3ZUN A; 2O2V B; 3TEZ A; 3VDZ A; 3ZGZ A; 1H8C A; 3H7P B; 4S0R A; 2JRI B; 3Q8F A; 2DAF A; 3DBH B; 1VZ6 A; 2CHZ A; 5EDS A; 2ICI A; 4NJ6 A; 1R4N B; 3OLM D; 4WJQ A; 2WXG A; 4W9J A; 2L52 A; 1ZP0 B; 4USA A; 2IDY A; 4JWS C; 5BO4 B; 1CJE A; 1TS4 A; 1TS3 A; 3UIN B; 3W1S A; 4W9K A; 1L7Y A; 3HM3 A; 4GN1 A; 3AEE B; 1E5W A; 1AW7 A; 3IAS 1; 2N9E B; 1VRA B; 2WU2 B; 3PHW B; 1N62 A; 2Z8L A; 1RM6 C; 1OQY A; 2AX5 A; 5EE0 A; 2M8S A; 1D5X C; 2PEA A; 4DK5 A; 2CKH B; 3BY4 B; 2BS4 B; 1JQ4 A; 2GRI A; 3L08 A; 1FCC C; 4FAD A; 2BB6 A; 1YJ1 A; 2A5U A; 4ZYN A; 1TZO A; 2BKF A; 2CJO A; 2M1M A; 3ZJT A; 2DX5 B; 2IGD A; 4MGZ E; 1P7E A; 3BK2 A; 4FHK A; 3U30 A; 3OJ3 A; 5DPW A; 4QAY A; 2L1A A; 1HZ5 A; 5D3I B; 1JCK B; 5FKA C; 1XT9 B; 4Q2J A; 2OED A; 2KYW A; 1FFV A; 4OZB A; 3VUY A; 3JSV B; 4KGS A; 4A3P A; 1NYQ A; 3DVN V; 2V9H A; 3TMP B; 3VHT C; 2MH7 A; 4ZRJ A; 4A6Q A; 1FNU A; 2NTS A; 4WH4 A; 1ZUD 2; 4G3X B; 5HKH A; 3ZDT A; 4YSY B; 1WGY A; 1V2Y A; 1TKY A; 1ZKH A; 2J53 A; 4TV3 A; 3B2F A; 2W54 A; 4LNO A; 1VD2 A; 4US9 A; 1C79 A; 4DDG D; 1SIF A; 3X23 A; 4N59 A; 1L0Y B; 4E74 A; 1PGB A; 2HTH A; 4WIP A; 4P16 A; 1Z5S B; 2INP E; 1E8X A; 1DOX A; 1E8Y A; 1JWB D; 3AMZ A; 3PT2 B; 5I4D A; 2X8X X; 1UBQ A; 4LCD E; 2KZR A; 1WE7 A; 2G45 B; 5C2T B; 1QOG A; 1AWD A; 3EC8 A; 1HA5 A; 3PLU A; 2B76 B; 3AE7 B; 3AM9 A; 2K1F A; 3OWE B; 1PDX A; 4M0W B; 4N58 A; 1YQB A; 2KJH B; 3AED B; 1P1A A; 1JML A; 4W9E A; 1QZE A; 4NAW B; 4B95 A; 3W5V B; 3Q8E A; 1TKG A; 4K1R B; 4JIO U; 1P98 A; 1V86 A; 1GB4 A; 2Y5P A; 4HJG E; 2NPT A; 1OGW A; 3L10 B; 2WDT B; 2FNJ B; 1DOY A; 1T3Q A; 2RPQ A; 4JGH B; 5KHO A; 4ZRP A; 2MA9 B; 3MP9 A; 2MJE A; 1ENF A; 3GS2 A; 3NVY A; 3M3J A; 2LXC A; 1K8R B; 2JSV X; 4HJK A; 3MJW A; 4YTP B; 3V3X A; 4BAX A; 2YEP F; 1Q1O A; 3WAL A; 1AN8 A; 2UYZ B; 2ACZ B; 2KTF A; 2JRH A; 3P4P B; 2J4X A; 3KW5 B; 4C4V B; 4FHJ A; 2BYT A; 4XDD A; 1Y56 A; 3CWI A; 1WJU A; 4KGR A; 1WX9 A; 1E7P B; 4M02 A; 5G5G A; 2W55 A; 2D07 B; 1N5W A; 4ICU A; 3BWU D; 3VTW A; 3HUI A; 3A9K A; 3Q14 C; 1VCB A; 2WS3 B; 2KJR A; 5L83 A; 2RR9 A; 1FXA A; 4GU2 A; 2MX2 A; 4XC2 A; 1TY2 A; 1WZ3 A; 3O13 A; 1EWC A; 1GJZ A; 2WNM A; 2XK5 B; 3RNC C; 1YQ3 B; 1E7U A; 3AH7 A; 2J0J A; 2MSE D; 4RFB A; 3T3N A; 3ML9 A; 1D3Z A; 3VQI A; 2JWZ A; 3R2I A; 2JY6 A; 2ZPN A; 3VXW A; 4ZDV A; 5AZF A; 2G4D B; 4JPS A; 4RGT A; 3ZTD A; 2FE8 A; 2KDI A; 4KVG B; 4GDK B; 3NJT A; 2TSS A; 3R8B A; 4AWJ A; 2H88 B; 1F77 A; 1RLF A; 3CSF A; 3IHP C; 2KFK A; 1I4H A; 3N30 A; 3ZNI D; 1PGA A; 3E56 A; 3FAH A; 1E8Z A; 4OVU A; 2IO0 B; 2CJN A; 1E0Z A; 2OJR A; 1E8W A; 1WMH A; 2E6X A; 4L1B A; 2WP9 B; 5G5H A; 1OFF A; 5IO9 A; 3AEG B; 4TSS A; 2V0G A; 1WE6 A; 2KVR A; 4NJ7 A; 4PYZ A; 2SAK A; 2DZM A; 3EEC A; 3SD5 A; 2KDE B; 2E3T A; 1N5X A; 4AOF A; 3DVG X; 5E6P A; 4DQO C; 5C23 A; 2HD5 B; 4HCP B; 3VRB B; 1LO5 D; 4TQ0 A; 2L3Z A; 3B08 A; 3MFG A; 4HXD A; 4P1C C; 2I38 A; 1F1H A; 1FNW A; 1WY8 A; 2MEK A; 3W1Y A; 3QA8 A; 1YX5 B; 2KN5 A; 3RD2 A; 1F9J A; 4E3C A; 1LFD A; 1KLG D; 2HDE A; 5MPO A; 2EMS A; 2KO3 A; 4YSZ B; 4TMA B; 2C7M B; 2KNB A; 5IP4 D; 1ZXH A; 4HPM B; 2O6V B; 1HTQ A; 3N1Z C; 1DYQ A; 1R4M B; 2RMM A; 3TUO A; 4MJS A; 2L0T A; 3WIM A; 3NZU A; 1L2N A; 1C78 A; 4AP4 C; 1ZPS A; 1TIF A; 3PRP B; 1HQR D; 1FIQ A; 1MJD A; 1VR9 A; 3DCG A; 3RI7 C; 3HIZ A; 4K3C A; 5JHB A; 1SE3 A; 4R3D A; 5J2R A; 3X0W A; 2FAZ A; 1UWM A; 1P0R A; 4HKQ A; 2N9K A; 2J7Q B; 4WJN A; 4EE2 A; 3APF A; 2V3P A; 2M0A A; 3W9C B; 3NVV A; 4IKG A; 3QCA A; 3PVL A; 4A90 A; 1CQV A; 5D2M B; 4DHJ D; 4KGT A; 1QOF A; 1YN4 A; 2D3A A; 1TGZ B; 3NZ3 A; 5AZG A; 1EU3 A; 3LJ3 A; 1CZP A; 3VRA B; 2C60 A; 4LDT B; 2KWU B; 5AEK B; 5FR3 A; 2JQR B; 4B0M A; 2MLB A; 3QJZ A; 3LDZ E; 3DBS A; 3IAM 1; 1M94 A; 4L2Y A; 5CHV C; 1GG3 A; 1TKE A; 2D10 A; 2V4I B; 3A9J A; 3HVZ A; 4F8C B; 1RRB A; 2GOW A; 3E9S A; 2W82 A; 4GMV A; 2HJ1 A; 4ANX A; 1L0X B; 1KLU D; 2L32 A; 2X38 A; 3R66 C; 5H92 C; 3AE4 B; 3RT3 B; 1T0Y A; 3OAW A; 4KV2 A; 4ZYS A; 2GLS A; 1ROE A; 1YOV B; 2AQ3 B; 1YX6 B; 2MBE A; 1EO6 A; 3RZW C; 4KSK C; 4HVB A; 1E7V A; 4MH0 E; 4MSM B; 2INN E; 4HDO A; 1WXM A; 2EEL A; 1NBF C; 4EUT A; 1EF5 A; 1T5X D; 2K8C A; 3W5U B; 4EOY A; 1LGR A; 3L0W B; 1M4V A; 2N1V A; 2ZNV B; 2C5L C; 1NVI D; 1FMA D; 4C7Y A; 1PQS A; 2RGF A; 4FJY A; 1WGG A; 3M63 B; 3HK0 A; 4XZ4 A; 2BYF A; 2YEP B; 3VR9 B; 1EWY C; 2VZK B; 1XLQ A; 3TEW A; 3VUX A; 5TSS A; 4HDQ A; 4OHJ A; 2FID A; 2IJ0 A; 2LRU A; 1L4D B; 2EKE C; 1IP9 A; 1SF0 A; 2WX0 A; 3Q8B A; 4DXG A; 3QX1 A; 4KDL B; 4NPN A; 2QHO A; 2PJH A; 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2QDF A; 3H7P A; 4WUR A; 4ZHP A; 2KK8 A; 2SEB D; 1IBX B; 2Q5W D; 2D3B A; 2JVC A; 2PLP A; 1V9J A; 2I2Y A; 1YD8 U; 2B3A A; 3S2A A; 1WGR A; 4FXC A; 1K52 A; 4GSW A; 3H1U A; 4E71 A; 4FA6 A; 4B6W A; 1V97 A; 1WF9 A; 3LXF A; 3DPD A; 3V05 A; 3DHG C; 2IO2 B; 4ARI A; 2FIF A; 2ZCC A; 2L83 A; 4RCO A; 3P1M A; 1K53 A; 4US8 A; 1T0S C; 1E90 A; 1XQQ A; 4PS7 A; 3A33 B; 3DWM A; 4IWO A; 1QKZ A; 2MWS B; 3DBH I; 4P6V F; 1XLP A; 3CIR B; 1R4N I; 1P9D U; 2RSU A; 2JYE A; 2MP2 B; 3J9C A; 1D5Z C; 5LLI A; 4XX5 A; 4RGN A; 3DVN U; 3DBR B; 5C1Z A; 2GB1 A; 2LAS A; 3RZF A; 4K7U A; 5E6N A; 2LFI A; 4HCN B; 2NPT B; 1K51 A; 3AEB B; 2K6Q A; 1FO4 A; 2MBO A; 3UIO B; 1STE A; 2NVU I; 4EFO A; 2OJW A; 2ZEQ A; 3JSV A; 3IG3 A; 3PRM B; 1UGJ A; 3EFU A; 1TZ1 A; 2J52 A; 2ONQ A; 2ASQ A; 1ZDX A; 2LGI A; 2BS2 B; 3N32 A; 2LRW A; 3AU5 A; 4IC7 B; 4JE3 B; 3RN9 C; 1QF6 A; 5J17 A; 3PGE A; 5AUK A; 1UGM A; 3AE1 B; 4HRS A; 4NNJ B; 2KTR A; 1I4Q A; 3RMK C; 1EUV B; 3P42 A; 1PGX A; 2LI5 A; 4GDL B; 1H4R A; 1WI0 A; 3L17 A; 3NS8 A; 1NEN B; 5C3J B; 3MC0 B; 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