The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
13
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sequence length |
57
|
structure length |
57
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Chain Sequence |
VDYIVEYDYDAVHDDELTIRVGEIIRNVKKLQEEGWLEGELNGRRGMFPDNFVKEIK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Protein binding
|
| molecule keywords |
CD2-ASSOCIATED PROTEIN
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| publication title |
Atypical Polyproline Recognition by the Cms N- Terminal SH3 Domain.
pubmed doi rcsb |
| source organism |
Homo sapiens
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| total genus |
13
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| structure length |
57
|
| sequence length |
57
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2006-09-28 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF14604 | SH3_9 | Variant SH3 domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2BZ8 A; 2DYB A; 2ENM A; 2DL8 A; 2A37 A; 2K6D A; 3I5S A; 4J9H A; 1WA7 A; 3REB B; 3I9Q A; 4JJD A; 4OML A; 4HXJ A; 2M51 A; 2OI3 A; 2B86 A; 1I1J A; 1M3C A; 4JZ3 A; 1QLY A; 2JTE A; 4AFS C; 2CT4 A; 3M0U A; 2L3S A; 2JT4 A; 3VS0 A; 4J9C A; 1SRM A; 1AVZ C; 1UEC A; 1YN8 A; 1I0C A; 4RTZ A; 4LE9 A; 1H3H A; 3M0S A; 3M0Q A; 1E6H A; 1K0S A; 2O2O A; 2KEA A; 2KXD A; 4RTY A; 3SEM A; 1X69 A; 2J6K A; 1Z9Q A; 2O9V A; 1X43 A; 2GGR A; 2IIM A; 1WXT A; 2EYZ A; 3TSW A; 4HVV A; 2HEQ A; 1QKW A; 1GL5 A; 1UJY A; 1IO6 A; 2EQI A; 2FPE A; 1XOV A; 2KR3 A; 4WCI A; 4RTU A; 1GCQ C; 2DBK A; 2VKN A; 1UTI A; 3M0T A; 2FEI A; 1A0N B; 5I22 A; 4OMN A; 4JJB A; 4F17 A; 1KJW A; 4OMO A; 2KGT A; 1KFZ A; 3EHR A; 1VA7 A; 2HSP A; 4J9F A; 1PHT A; 1AZE A; 1JU5 C; 2DVJ A; 2YT6 A; 2FG0 A; 2VVK A; 4D8D A; 1X27 A; 2DF6 A; 5L23 A; 4R0K A; 1TUD A; 1NLP C; 1SEM A; 1ZUY A; 2LP5 A; 4OMQ A; 2L3P A; 1TUC A; 2RQV A; 2ROT A; 2CSQ A; 1OV3 A; 4IIM A; 1VYU A; 1T0H A; 3VS1 A; 1V1C A; 2GTO A; 4JZ4 A; 1PKT A; 5IHN A; 1AWO A; 1NYG A; 2RMO A; 2F2X A; 1NEG A; 2GBQ A; 5IH2 A; 1GFC A; 4J9E A; 3UF4 A; 2D8H A; 2K2M A; 4JJC A; 1TG0 A; 2EYW A; 1RUW A; 4ORZ A; 1X2Q A; 2EVR A; 1WX6 A; 2OJ2 A; 2BTT A; 5EC7 A; 2FRW A; 3I35 A; 1KIK A; 2YUP A; 2ED1 A; 1W6X A; 3SHW A; 1WIE A; 1ZUK A; 1PWT A; 2CH4 W; 2OAW A; 2GNC A; 1AD5 A; 1JXO A; 4A63 B; 1ABO A; 1VYT A; 1HD3 A; 2RQT A; 3PVQ A; 3UA7 A; 1BK2 A; 2O9S A; 3R6N A; 2MCN A; 1WI7 A; 2A28 A; 3LH5 A; 5GJV B; 1CKA A; 2V1Q A; 3GBQ A; 2DA9 A; 2A36 A; 3RNJ A; 2M0Y A; 1BBZ A; 1FYN A; 3A98 A; 1K4U S; 1PNJ A; 1G2B A; 2RF0 A; 2FPF A; 2D1X A; 1AWJ A; 2K7A A; 2C0O A; 2KT8 A; 2YDL A; 3QWX X; 4JPB W; 4Z88 A; 1QWE A; 2EKH A; 4CC2 A; 3EG1 A; 2KE9 A; 4J9I A; 2LJ0 A; 1M30 A; 2AZS A; 2LQW A; 1HSQ A; 1K9A A; 1QWF A; 1WYX A; 2L2P A; 4J9D A; 1K76 A; 2DLP A; 2MOX A; 1KSW A; 1NYF A; 2CT3 A; 1YNZ A; 1K1Z A; 2G6F X; 1J3T A; 1LCK A; 2DJQ A; 4RTT A; 2XMF A; 4Z8A A; 2KXC A; 1X6B A; 1NM7 A; 1ZSG A; 3ULR B; 1JQQ A; 2J05 A; 3VS3 A; 2F2V A; 2LNH B; 2DE0 X; 1WLP B; 2H8H A; 2LCS A; 4OMP A; 5IXF A; 5GJW B; 1MUZ A; 4RTV A; 2J7I A; 2LMJ A; 4HVU A; 2LJ1 A; 4K11 A; 2ESW A; 2RN8 A; 5FWC A; 4F16 A; 3VRZ A; 3H0F A; 4LN2 A; 5HCK A; 4KRT A; 1SHG A; 1SPK A; 3NMZ C; 1RLQ C; 1UHC A; 2K3B A; 1MV0 B; 1OOT A; 1UJ0 A; 4RUG A; 3VS4 A; 2EGA A; 1PRM C; 2V1R A; 5FWB A; 1OPL A; 1NG2 A; 1W1F A; 2X3X D; 3KFV A; 2JM9 A; 2CUD A; 2EGE A; 2FRY A; 3EG2 A; 4LNP A; 2JM8 A; 1S1N A; 1U5S A; 2JS2 A; 4AFZ C; 3VS2 A; 4ZNX A; 1BU1 A; 2DRM A; 1AZG B; 4J9B A; 2HDA A; 1MV3 A; 2FO0 A; 2AKK A; 2W10 A; 3ZL7 C; 2DRK A; 2LZ6 B; 5IXB A; 4AFU C; 1GFD A; 2L0A A; 2DM1 A; 1GBQ A; 3VS5 A; 1B3Q A; 2AK5 A; 1GRI A; 4DEX A; 3H0I A; 1CSK A; 1X2K A; 1T3L A; 1Z9Z A; 3REA B; 3EGU A; 2DL4 A; 1EFN A; 1ZUU A; 2E5K A; 3M0P A; 4HCK A; 2GQI A; 2KRS A; 3EG3 A; 2KRM A; 4IIO A; 2CRE A; 3M0R A; 5ECA A; 2KRN A; 3O5Z A; 4D8K A; 2ED0 A; 2X3W D; 2DBM A; 2AKL A; 2EBP A; 2EPD A; 4OMM A; 3EG0 A; 1SRL A; 2SRC A; 3THK A; 2KYB A; 2J6O A; 2D0N A; 4E6R A; 3VS7 A; 2DL3 A; 5IHI A; 1PRL C; 1AWX A; 1HJD A; 1PKS A; 2D8J A; 2RPN A; 2JW4 A; 2EYY A; 1Y0M A; 3U23 A; 4AG2 C; 4RTW A; 3UA6 A; 2RQR A; 2RNA A; 2ECZ A; 3TVT A; 2CSI A; 2KRO A; 4RTX A; 2CDT A; 4Z89 A; 4LUE A; 2SEM A; 1YCS B; 1E7O A; 1SHF A; 2KNB B; 4AG1 C; 3PE0 A; 2EGC A; 1G83 A; 2NWM A; 3I5R A; 2KT1 A; 3VS6 A; 3RBB B; 1YWP A; 3C0C A; 1VYV A; 1GCP A; 2JXB A; 4GBQ A; 3PVL A; 2J06 A; 2PTK A; 2K79 A; 3IQL A; 4M4Z A; 4CC4 B; 2O31 A; 2O88 A; 2CH4 A; 5FW9 A; 2DIL A; 1JEG A; 2YUN A; 1JO8 A; 1NLO C; 4GLM A; 1U3O A; 2A08 A; 3H41 A; 2DL7 A; 1H8K A; 1WXU A; 1M27 C; 2KYM A; 2RQU A; 1E6G A; 1OEB A; 2ABL A; 2YUO A; 1NEB A; 2I0N A; 1YP5 A; 2QDL A; 1AWW A; 1RLP C; 2LJ3 A; 1WFW A; 2BZY A; 1ZLM A; 4FSS A; 4AFQ C; 4HVW A; 2BZX A; 1U06 A; 1UFF A; 4Y92 A; 1CKB A; 2DX1 A; 2HBW A; 2AZV A; 2JS0 A; 1Y57 A; 1JXM A; 1T0J A; 3CQT A; 2JMA A; 1QCF A; 1ZX6 A; 2GTJ A; 1UDL A; 1I07 A; 1X6G A; 3VRY A; 1SSH A; 2LX7 A; 1YWO A; 2PNI A; 1UG1 A; 4DEY A; 1UHF A; 2W0Z A; 1RI9 A; 2LQN A; 2DL5 A; 2PZ1 A; 2J6F A; 1FMK A; 4CC3 A; 1M3A A; 1QKX A; 3EHQ A; 4CC7 A; 2C0I A; 2NUZ A; 1WXB A; 2VWF A; 1W70 A; 1WDX A; 1UGV A; 2K9G A; 4EIK A; 4F14 A; 2YSQ A; 2EYX A; 2FPD A; 3QWY A; 2F2W A; 3NGP A; 1T3S A; 2KBT A; 1ZBJ A; 1UUE A; 2MIO A; 3TSZ A; 3H0H A; 3UAT A; 5I11 A; 4X1V A; 2CUB A; 3JV3 A; 1GCQ A; 1ABQ A; 3NPF A; 2DMO A; 4QT7 A; 1BB9 A; 4LUD A; 2L3Q A; 2HCK A; 2P4R A; 5IHK A; 2YUQ A; 1M8M A; 2EW3 A; 1GBR A; 2C0T A; 1UE9 A; 1K0X A; 3NHN A; 1ARK A; 2DNU A; 2RQW A; 1N5Z A; 1M3B A; 1B07 A; 2JMC A; 1AEY A; 3FJ5 A; 2ROL A; 1OPK A; 1AOJ A; 4J9G A; 1H92 A; 4ESR A; #chains in the Genus database with same CATH topology 2BZ8 A; 1B34 A; 3CC4 Q; 3BDU A; 1N8R U; 4JLI A; 2DTO A; 4OML A; 1M1K U; 4NL3 A; 4MMK A; 2HL5 C; 2RJD A; 2P0Q A; 4RCB A; 3JCM f; 1M3C A; 5A0L A; 1BI0 A; 4HCB A; 1MHN A; 4OB3 B; 3JB9 D; 2ZCF B; 4RTZ A; 1ZSZ A; 4RMO A; 3CCJ A; 4JRI A; 3A8G B; 3M0S A; 2RI5 A; 3QHS A; 1PSF A; 1VQL Q; 1NBE B; 4M75 D; 2KXD A; 3TQ7 P; 5KE2 A; 3SEM A; 4M77 D; 2CS7 A; 1IHV A; 1Z9Q A; 2O9V A; 2J6K A; 1FX7 A; 1WXT A; 4J7I A; 3CME Q; 1VQ7 A; 3CXC P; 2OTL T; 4BDY A; 1C0M A; 5DLQ E; 4WCI A; 4IKF A; 2EJF A; 2FEI A; 4CI0 C; 2JUF A; 3V7R A; 1YIJ T; 3OS2 A; 1Q81 R; 3CBM A; 4C5I A; 3QPH A; 1VA7 A; 1IRX A; 3E1S A; 4XQ3 A; 5CKD A; 4DBR A; 3OMG A; 2COZ A; 3M53 A; 1X27 A; 2MK5 A; 4R0K A; 1WHM A; 5CQX A; 2GFA A; 3QZ9 B; 3MJX A; 3UDC A; 4M7D G; 1WZO A; 1PG5 B; 2X9H A; 1M4Z A; 3SWN B; 2NUT B; 1AWO A; 4HT9 A; 2RI3 A; 1NYG A; 1JJ2 A; 3CC7 A; 3OYM A; 2EJG A; 3SDZ A; 3PT9 A; 4XU3 A; 1O75 A; 3UPU A; 1R8O B; 2RHZ A; 3NTK A; 4ORZ A; 4ME7 A; 5EC7 A; 1TSF A; 1WQ7 A; 1SSF A; 1PWT A; 2CH4 W; 2OAW A; 2FHD A; 2P84 A; 1TUG B; 1YI2 Q; 5CAI A; 4N0A A; 4ELY C; 2RQT A; 2K5I A; 2F5T X; 1K9M R; 2MCN A; 1QVF S; 2HZY A; 2A28 A; 3LH5 A; 5GJV B; 1KQS P; 2L8D A; 3GBQ A; 4ZTF A; 2L5Q A; 1WHH A; 3HPW A; 2DET A; 4Q5W A; 3WVD B; 1QVG P; 5FRM A; 4M7D F; 1FYN A; 1YBY A; 1G2B A; 1VQN T; 1N8R C; 4X34 A; 2FL7 A; 3A1P A; 1M1K C; 5LJ5 d; 3EH2 A; 2F5K A; 3HL8 A; 5LJ5 g; 4Z88 A; 3A8L B; 3CC2 T; 2IG0 A; 1VQP A; 3LLR A; 3EG1 A; 5CK9 A; 5IN1 A; 2AZS A; 1HSQ A; 1K9A A; 1QWF A; 2BE7 D; 4J9D A; 1PD1 A; 1YIT T; 2CT3 A; 2RB6 A; 1YNZ A; 2G6F X; 2DJQ A; 4E2F B; 3OBW A; 4LXC A; 1PD0 A; 2XMF A; 4Z8A A; 1X6B A; 3UT1 A; 1I4K 1; 1JQQ A; 5CIU A; 5KYN A; 3S3N A; 1WLP B; 2H8H A; 3DB4 A; 1MUZ A; 3CCM A; 4RTV A; 2J7I A; 3PGG A; 4OF1 A; 3CXC S; 1HYO A; 2A0F B; 5GAN d; 3VRZ A; 3G71 A; 5HCK A; 1SPK A; 2HQX A; 2K3B A; 1MV0 B; 3EFS A; 1MNE A; 1N9R A; 1UJ0 A; 4QQG A; 4M7A B; 5FRN A; 1PRM C; 5GAN j; 3NTI A; 4DBF A; 4M7D E; 2GF7 A; 2QQ9 A; 3ASK A; 4C8Q B; 3OYH A; 2Y90 A; 3KFV A; 1SKU B; 3SB2 A; 3EG2 A; 4LNP A; 1UGP B; 1Q7Y R; 2JM8 A; 4IUP A; 4JRQ A; 4AFZ C; 3EH1 A; 4J7F A; 4ZNX A; 3JB9 G; 1M5Q 1; 1BU1 A; 1AZG B; 1VQ8 A; 4FYW B; 2FO0 A; 3CMA T; 3JRZ A; 3X26 B; 5GAN h; 1M8V A; 5HY6 A; 3BDL A; 2D9T A; 3OYY A; 1GBQ A; 4M75 G; 1B3Q A; 2AK5 A; 2R5M A; 4M77 G; 1CSK A; 1X2K A; 1Z9Z A; 1EFN A; 1LJO A; 1ZUU A; 2GQI A; 3RUX A; 4E7J A; 3CC4 T; 3M0R A; 2FB7 A; 5ECA A; 3O5Z A; 3MP8 A; 5A2Q E; 2DAQ A; 1WHJ A; 3NFC A; 2DD4 A; 3GF5 A; 3I55 A; 3DKM A; 3EGD A; 4C0G A; 4E6R A; 3X24 B; 4E7K A; 1XTD A; 1PRL C; 5J39 A; 1AWX A; 2FZG B; 2WAC A; 2D8J A; 2XI9 A; 2QQR A; 1VQL T; 5GAN e; 1Y0M A; 4AG2 C; 3ME9 A; 3JB9 F; 3UA6 A; 2RNA A; 4ANJ A; 5D6X A; 2CSI A; 1Q82 C; 1QVG S; 1D09 B; 2HD0 A; 4XTX A; 4PJL A; 3PE0 A; 2EGC A; 4FYY B; 4M75 F; 3ER0 A; 4MML A; 3CCQ T; 2COY A; 4M78 A; 3URG A; 4M77 F; 1RAH B; 1GCP A; 2PTK A; 2MWO A; 2E65 A; 1WHL A; 1R77 A; 1VQ5 T; 1TTH B; 3VUB A; 1D0Z A; 3M56 A; 3OB9 A; 5C0M A; 3H41 A; 1M27 C; 3I56 A; 1OEB A; 4ZN1 A; 5KE3 A; 1NEB A; 1KHI A; 2GCX A; 2I2L A; 1ZLM A; 2HKN A; 1WGS A; 1FWZ A; 2O4X A; 4HVW A; 1U06 A; 4Y92 A; 2HBW A; 2JS0 A; 3MO8 A; 1JXM A; 3CQT A; 2P0P A; 1I5O B; 2GTJ A; 1OUL A; 1M90 U; 1KK7 A; 3VRY A; 2OTL Q; 2LX7 A; 3GPL A; 1UHF A; 4X9D A; 2W0Z A; 1VQO A; 1RI9 A; 2LQN A; 4C92 B; 4A4K A; 1FMK A; 3CPW P; 2DEQ A; 5GAN 6; 3OYG A; 1EIF A; 5LJ3 d; 3MKD A; 1BYM A; 1YIJ Q; 1PM3 A; 4LDX A; 2RJC A; 1LOJ A; 5LJ3 g; 1S72 A; 3HHT B; 4AMC A; 5KYW A; 5LL6 S; 1KD1 U; 2R58 A; 5GAO q; 2F2W A; 3NGP A; 1T3S A; 2KBT A; 3Q1J A; 4JDS A; 5J3B A; 2X51 A; 2ZPG B; 4M75 E; 3L2W A; 4M77 E; 1K8A R; 3VU3 C; 3T9N A; 4X1V A; 3JV3 A; 1GCQ A; 2DMO A; 4QT7 A; 4J6W A; 4L6V 5; 5D7U A; 4GY5 A; 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2EVR A; 3V8J A; 5CKE A; 2FRW A; 1W6X A; 2CP3 A; 1BKB A; 3CMA Q; 3GP8 A; 3CCV A; 1TH7 A; 3CCU A; 1JXO A; 4A63 B; 3OW2 P; 1N27 A; 1HD3 A; 1OZ2 A; 2FZC B; 3PVQ A; 4EMK A; 1BK2 A; 4JS5 A; 3R6N A; 5GAN 4; 1G3W A; 1WI7 A; 4FU6 A; 4XK8 E; 1OQK A; 4GLK A; 2DA9 A; 1VUB A; 1AT1 B; 4DQ2 A; 2A36 A; 2X4J A; 5CR2 A; 3JCM X; 3A98 A; 5KYX B; 1PNJ A; 4M78 E; 2HMA A; 2QDY B; 2FPF A; 5GAO m; 4FIB A; 3HRU A; 3JCM P; 2OTJ A; 3P8H A; 3CCJ Q; 4QW2 A; 4JPB W; 4KBM B; 3VJP A; 1RAF B; 2EKH A; 4CC2 A; 4C92 D; 4J9I A; 3JSC A; 2LQW A; 4BI8 B; 5HK3 A; 2MOX A; 1VQ7 Q; 1NYF A; 2CGH A; 1OZ3 A; 3CEY A; 5AYF A; 2MYS A; 1LCK A; 1HK9 A; 2LVM A; 4O6J A; 1QVG A; 1NM7 A; 3PMT A; 3P8B B; 4PFP A; 5CKB A; 4NS5 A; 3VS3 A; 4C0D C; 2K4Y A; 3CCQ Q; 3JCM J; 4BE0 A; 5GJW B; 1Q86 C; 1Y96 A; 3E9G A; 3RKX A; 4HVU A; 2LJ1 A; 4BDZ A; 1I81 A; 2CYZ B; 1NJI U; 4L5G A; 3PTA A; 1VQ5 Q; 2HL3 A; 3H0F A; 4NOY A; 3CME A; 4C5G A; 1RLQ C; 2VGM A; 3JCM V; 1BI3 A; 3V7S A; 5J26 A; 3RMQ A; 3VS4 A; 2EGA A; 1BIA A; 4FYV B; 5FWB A; 3V7C A; 1W1F A; 2X3X D; 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