The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
11
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sequence length |
57
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structure length |
57
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Chain Sequence |
VDYIVEYDYDAVHDDELTIRVGEIIRNVKKLQEEGWLEGELNGRRGMFPDNFVKEIK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Protein binding
|
| molecule keywords |
CD2-ASSOCIATED PROTEIN
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| publication title |
Atypical Polyproline Recognition by the Cms N- Terminal SH3 Domain.
pubmed doi rcsb |
| source organism |
Homo sapiens
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| total genus |
11
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| structure length |
57
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| sequence length |
57
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| chains with identical sequence |
B, C, D, E, F, G, H, I, J, K, L
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2006-09-29 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF14604 | SH3_9 | Variant SH3 domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2DL7 A; 4CC3 A; 1RLQ C; 1WA7 A; 2SRC A; 1JU5 C; 2CUD A; 1SSH A; 1KSW A; 4JJC A; 2DJQ A; 2DL5 A; 1AWJ A; 4OMO A; 4J9G A; 3VS0 A; 2KT8 A; 1CKB A; 2O88 A; 3I9Q A; 4OMP A; 2OI3 A; 2B86 A; 4OMM A; 2L3Q A; 4OMN A; 5EC7 A; 4DEY A; 1W70 A; 2L0A A; 1PWT A; 1VYT A; 1XOV A; 4RTU A; 2MOX A; 2FPF A; 2CRE A; 4Y92 A; 2RF0 A; 1K1Z A; 2KBT A; 4LUD A; 2J6F A; 2LJ1 A; 4Z89 A; 2LJ3 A; 1S1N A; 1WXT A; 4AG1 C; 4WCI A; 1U3O A; 3M0P A; 4LNP A; 3NGP A; 2F2W A; 2F2X A; 4HCK A; 1JO8 A; 2QDL A; 2YDL A; 1FYN A; 2C0T A; 4DEX A; 1AEY A; 1AWX A; 2ED1 A; 5IH2 A; 1U5S A; 2V1R A; 3UA6 A; 3TVT A; 2HEQ A; 1M8M A; 4AG2 C; 1W6X A; 1IO6 A; 4OML A; 2CSI A; 2KRO A; 2ESW A; 1WX6 A; 4Z88 A; 1BBZ A; 1UJY A; 1PNJ A; 3M0R A; 2KEA A; 2ABL A; 2KYM A; 1QKX A; 1LCK A; 1PHT A; 3I35 A; 3M0U A; 3VS3 A; 1H92 A; 1QWE A; 1GFD A; 1T3S A; 4E6R A; 1K76 A; 1WYX A; 2EGA A; 2KT1 A; 4J9H A; 4J9C A; 2XMF A; 1M27 C; 1SPK A; 4F16 A; 1X2K A; 5FWB A; 1YNZ A; 3LH5 A; 3QWY A; 2CDT A; 1ZUY A; 1NEB A; 2YT6 A; 1AVZ C; 2VWF A; 3UF4 A; 1I0C A; 5HCK A; 3H0F A; 3U23 A; 2CT4 A; 2JM9 A; 2J06 A; 2LCS A; 2BZY A; 2JM8 A; 2NWM A; 2F2V A; 1GRI A; 2K7A A; 2YUP A; 1EFN A; 4RTV A; 3PVL A; 2DL4 A; 1W1F A; 2EGC A; 3VRY A; 1KFZ A; 3NHN A; 4JJB A; 2NUZ A; 2H8H A; 2I0N A; 1HD3 A; 4ZNX A; 2DBM A; 2KR3 A; 2L3P A; 3I5S A; 2GTJ A; 2DL8 A; 1PRL C; 1NYF A; 1OOT A; 2JS2 A; 4LE9 A; 3VS4 A; 1VYU A; 1B3Q A; 1YP5 A; 2DA9 A; 4ORZ A; 1PKS A; 2G6F X; 1VA7 A; 2IIM A; 1WLP B; 1M3A A; 1A0N B; 1V1C A; 2AZV A; 1Z9Z A; 2LZ6 B; 2X3X D; 1YWO A; 1WIE A; 5I22 A; 4CC4 B; 2EW3 A; 1WFW A; 1YWP A; 1QLY A; 2W10 A; 1SRM A; 1TUD A; 3M0Q A; 2O9V A; 2AK5 A; 2LX7 A; 4GBQ A; 2EYY A; 3O5Z A; 1RUW A; 2DM1 A; 4LN2 A; 2DYB A; 2J7I A; 5IXF A; 2HDA A; 3EHQ A; 1NLP C; 1NEG A; 4HVU A; 5IXB A; 2ROL A; 2GNC A; 3CQT A; 1YCS B; 3RBB B; 2W0Z A; 1E6G A; 4JPB W; 2A36 A; 3H0H A; 3NMZ C; 4LUE A; 4D8K A; 3PVQ A; 3I5R A; 1CSK A; 5L23 A; 1UJ0 A; 4QT7 A; 3H41 A; 1J3T A; 3REB B; 2D0N A; 2RQW A; 2RQU A; 1T0J A; 3VS1 A; 2YUO A; 2EGE A; 1UGV A; 1UHF A; 1BB9 A; 2GGR A; 3VS5 A; 3M0S A; 1NG2 A; 1ABO A; 2ENM A; 2X3W D; 2LQW A; 5IHI A; 1AWO A; 2ECZ A; 1QCF A; 2RPN A; 3VS2 A; 1M30 A; 1UFF A; 2HBW A; 2EYX A; 2HCK A; 1GFC A; 4F17 A; 3SHW A; 1GCQ A; 3EGU A; 1GCP A; 3UA7 A; 1HSQ A; 2K3B A; 4RTX A; 2MCN A; 1SHG A; 1KIK A; 1PKT A; 1OV3 A; 2K2M A; 4RUG A; 1E7O A; 1GCQ C; 2LJ0 A; 1AWW A; 1B07 A; 4AFQ C; 3EG0 A; 2KXD A; 3M0T A; 2GBQ A; 1UE9 A; 4X1V A; 2CUB A; 3PE0 A; 2FPE A; 1ZUK A; 1ABQ A; 1GL5 A; 1TUC A; 4HVW A; 2FEI A; 4D8D A; 1U06 A; 2RNA A; 1BU1 A; 5GJV B; 1SRL A; 4J9B A; 1H3H A; 1Y57 A; 1JXM A; 1NM7 A; 2BZ8 A; 2DRK A; 2MIO A; 1JEG A; 1JXO A; 2DF6 A; 4AFU C; 3EG3 A; 3UAT A; 2GQI A; 2EPD A; 2DVJ A; 2PNI A; 1AZG B; 2KGT A; 2L2P A; 2EQI A; 2AKL A; 1UG1 A; 2OAW A; 2DIL A; 1FMK A; 2RQT A; 1I07 A; 2FO0 A; 2O9S A; 4JZ3 A; 2KNB B; 1KJW A; 1WI7 A; 2EKH A; 4HVV A; 2VVK A; 4M4Z A; 1QWF A; 1G83 A; 2J6K A; 3RNJ A; 2A37 A; 2ED0 A; 2DE0 X; 4K11 A; 2ROT A; 4AFS C; 4RTW A; 1T0H A; 3VS6 A; 4KRT A; 2KXC A; 1MV0 B; 1K0X A; 3GBQ A; 2EYW A; 1TG0 A; 2D8H A; 1MUZ A; 1WXU A; 5IHK A; 2CT3 A; 2RN8 A; 1SHF A; 1UUE A; 2LP5 A; 2EBP A; 2JT4 A; 4AFZ C; 2PZ1 A; 5IHN A; 1CKA A; 4CC7 A; 4A63 B; 1AOJ A; 3QWX X; 3A98 A; 4RTT A; 5FW9 A; 2DX1 A; 2BTT A; 2JXB A; 2EVR A; 2JTE A; 2O2O A; 2FG0 A; 1X2Q A; 3EG1 A; 4Z8A A; 1OPL A; 2DL3 A; 2RQR A; 1RI9 A; 2JW4 A; 2FPD A; 2D1X A; 3REA B; 4IIM A; 3SEM A; 2CSQ A; 2DRM A; 1X69 A; 3IQL A; 2KRN A; 3C0C A; 1RLP C; 4OMQ A; 2LNH B; 3KFV A; 1QKW A; 2P4R A; 2RQV A; 2HSP A; 1UEC A; 2K79 A; 2FRW A; 2L3S A; 1K9A A; 1AZE A; 4R0K A; 2KRS A; 1PRM C; 1X27 A; 1OPK A; 2FRY A; 4J9I A; 1AD5 A; 3VRZ A; 5ECA A; 2KE9 A; 2JMC A; 2DLP A; 4ESR A; 1JQQ A; 1M3B A; 3FJ5 A; 1MV3 A; 2J05 A; 4J9E A; 2EYZ A; 2VKN A; 1ZSG A; 1HJD A; 1VYV A; 2BZX A; 2C0O A; 1K0S A; 2O31 A; 3NPF A; 1WDX A; 4IIO A; 1X6G A; 4F14 A; 2V1Q A; 2M51 A; 4J9F A; 3TSW A; 2LQN A; 1UDL A; 3H0I A; 1X43 A; 3JV3 A; 1ZBJ A; 4JZ4 A; 3ZL7 C; 2PTK A; 2J6O A; 2E5K A; 3ULR B; 4RTZ A; 2KYB A; 1WXB A; 1ZUU A; 2C0I A; 2CH4 A; 2YSQ A; 4JJD A; 1K4U S; 2GTO A; 1I1J A; 5FWC A; 2M0Y A; 1X6B A; 1Y0M A; 4RTY A; 2D8J A; 2K6D A; 2DBK A; 2K9G A; 1N5Z A; 1Z9Q A; 2JMA A; 4GLM A; 1H8K A; 1NYG A; 1UTI A; 1BK2 A; 3TSZ A; 3VS7 A; 2YUN A; 2SEM A; 2OJ2 A; 2RMO A; 1GBR A; 1G2B A; 1UHC A; 2AKK A; 3EG2 A; 2YUQ A; 5I11 A; 2A08 A; 2LMJ A; 1YN8 A; 2AZS A; 1SEM A; 2A28 A; 5GJW B; 1T3L A; 4CC2 A; 2DMO A; 2DNU A; 1E6H A; 1NLO C; 4HXJ A; 2KRM A; 4FSS A; 3R6N A; 1OEB A; 2CH4 W; 1ARK A; 1M3C A; 1ZX6 A; 3THK A; 1ZLM A; 4J9D A; 2JS0 A; 3EHR A; 4EIK A; 1GBQ A; #chains in the Genus database with same CATH topology 2RHY A; 1WA7 A; 2RI2 A; 4YTL A; 1VQ7 Q; 1KSW A; 1NBE B; 2DJQ A; 4KUI A; 3L2V A; 4LXC A; 2JTF A; 1KC8 R; 3OYD A; 5A0D A; 1KC8 C; 2B86 A; 1VQN Q; 1TTH B; 1Q81 U; 1M1K R; 1LVK A; 1VQ8 T; 1VYT A; 1VQO Q; 4RG2 A; 1M1K C; 1Q7Y U; 2MOX A; 2V8J A; 2RF0 A; 2KBT A; 4LUD A; 1Y96 B; 2LJ3 A; 4XTY A; 3JSC A; 5GAN 8; 3CCM Q; 3M0P A; 4WTO B; 5CQX A; 2MAM A; 1X01 A; 3CMA Q; 2RI3 A; 2ED1 A; 2V1R A; 3UA6 A; 4HKE A; 2MK5 A; 3C4S A; 3HFN A; 2CSI A; 4Y91 A; 2ESW A; 4NS5 A; 4ZTJ A; 3OSV A; 1UJY A; 3G71 T; 1D1A A; 1ZSZ A; 2DXU A; 3PIO A; 2DXB A; 2OTL A; 1TSF A; 2KYM A; 3MEV A; 1QKX A; 4N0A C; 2OTJ A; 4DOW A; 2CZ7 B; 4MDW A; 3TQ7 P; 3I35 A; 4C0D B; 1T3S A; 1KK7 A; 5CIU A; 1WYX A; 2JVV A; 3RKY A; 1M1F A; 2L89 A; 3LWI A; 4C92 C; 2QA4 T; 4F16 A; 2XD0 A; 3NTH A; 3LH5 A; 3QWY A; 2L3R A; 5D6X A; 2YT6 A; 3GIB A; 3UF4 A; 2XDD A; 3E19 A; 2VV5 A; 4C92 F; 2DO3 A; 2PQW A; 5LJ5 j; 1KD1 C; 2CT4 A; 1QQJ A; 2J06 A; 4EMG A; 2O4X A; 2JM8 A; 2NWM A; 2F2V A; 2Z0W A; 1VQ6 T; 3L2Q A; 1PD1 A; 3CCR A; 1K9M R; 4M77 G; 3KXT A; 2DBM A; 3CME A; 3I5S A; 4MZP A; 3MP8 A; 5KYW B; 3WVD B; 4EMK B; 4ORZ A; 3EH1 A; 1PKS A; 3LX7 A; 1N9S A; 5KYN A; 1VA7 A; 3SWN A; 1VQO T; 1FMV A; 1VQK Q; 2VB6 A; 2AZV A; 1Z9Z A; 1N8R R; 2LZ6 B; 5GAO m; 1VQL Q; 3OYJ A; 2LDM A; 4IUQ A; 1G5V A; 1N8R C; 2V8I A; 4EDU A; 3A5Z B; 1U1T A; 3HRU A; 1WFW A; 1DJ7 B; 2KMT A; 3CCM T; 3M0Q A; 3JB9 F; 2HQX A; 1JJ2 P; 2EYY A; 3KBG A; 2DYB A; 3CMA T; 2OAU A; 1YHQ A; 3M55 A; 1IRX A; 3MP6 A; 4BI3 A; 2CZ1 B; 1YCS B; 2W0Z A; 1E6G A; 1YJW Q; 2RH2 A; 3OW2 S; 2RA2 A; 3QII A; 2FZC B; 2A36 A; 4D8K A; 2E70 A; 3PVQ A; 2RHU A; 1CSK A; 5L23 A; 4PNO A; 5KYX A; 1O75 A; 3MCA B; 4X9D A; 3QZ9 B; 1K8A R; 1RAH B; 2D0N A; 2RQU A; 2CS7 A; 1T0J A; 4M7A B; 3RKX A; 2DET A; 1VQ5 Q; 1R8O B; 2EGE A; 3PT9 A; 1M2O A; 2RB6 A; 1KC8 U; 1OI1 A; 2ENM A; 2LQW A; 2DK3 A; 1M1K U; 1QW1 A; 3DKM A; 5GAM d; 1QCF A; 1BI2 A; 2XI9 A; 4KUL A; 4HCB A; 4OGE A; 1M2V A; 4FW2 A; 2HCK A; 1SF9 A; 3EGU A; 2DFU A; 3X20 B; 3UA7 A; 1HSQ A; 1VQ8 A; 4QQG A; 1V29 B; 2K3B A; 3BE3 A; 1NPP A; 1XQH A; 1PKT A; 1D0X A; 1U8R A; 2K2M A; 3M59 A; 3EH2 A; 4XK8 E; 1GCQ C; 4EMK C; 2LNV A; 1B07 A; 1OU9 A; 4M78 B; 1RAA B; 4C5H A; 3PMI A; 1NJI C; 2EQJ A; 4HCC A; 2E3I A; 1UE9 A; 1VQK T; 4BAC A; 4X1V A; 5IT9 E; 3OMG A; 2FPE A; 3PE0 A; 1ZUK A; 4M75 E; 1ABQ A; 1FWZ A; 1GL5 A; 2FEI A; 1W4S A; 3LW5 E; 4D8D A; 1BU1 A; 3H6Z A; 3CCQ Q; 1JRI A; 3CCS Q; 1SG5 A; 1SRL A; 4BE2 A; 3A8G B; 3G71 A; 3JCM b; 3G4S T; 1Y57 A; 2E3H A; 2K5L A; 2K5F A; 2BZ8 A; 4F7U B; 1JEG A; 4A4F A; 1I5L A; 1Y96 A; 1ACM B; 2NUP B; 2EPD A; 2DVJ A; 1D0Y A; 2PNI A; 3CC7 Q; 3F70 A; 1AZG B; 1YJW T; 3OYF A; 4PJO B; 2AKL A; 1UG1 A; 2LQ8 A; 4JJN K; 1OUL A; 2QA4 A; 2LT4 A; 1D1C A; 2FO0 A; 2E64 A; 2QG9 B; 4JZ3 A; 3WXM B; 3CCU Q; 2XG8 D; 2FL7 A; 1ZQ1 A; 1UGQ B; 1EX4 A; 2J6K A; 5CAI A; 4M7A C; 2E65 A; 1VQ5 T; 1WHM A; 2YLC A; 3JB9 D; 4K11 A; 1VQ6 A; 4AFS C; 3OYE A; 4JRK A; 4M7A F; 2QYZ A; 3UWN A; 2RN8 A; 1N9R A; 2LP5 A; 5FU6 B; 1B34 B; 1LJO A; 1I5O B; 3N5B B; 2DTI A; 5GAN 3; 1N8R U; 2VXE A; 5LJ3 j; 1BI1 A; 4A4K A; 1I4K 1; 1MMA A; 4JRI A; 4EMH A; 2MMP A; 4A63 B; 1AOJ A; 1Q82 R; 2D0Q B; 5I2M A; 1Q82 C; 4ZGD B; 3QHS A; 1VQO A; 2O2O A; 2FG0 A; 4CI0 C; 4XU2 A; 2JW4 A; 2LCC A; 4J83 A; 3ZFJ A; 3REA B; 4IIM A; 1EIF A; 2CSQ A; 3OMC A; 1X69 A; 3IQL A; 2LCL A; 2LNH B; 3CCM A; 2CP6 A; 4M75 A; 1FX7 A; 1NE8 A; 2WAC A; 2XU8 A; 1M90 R; 3QG1 A; 5KYW A; 3CCJ Q; 2L3S A; 3CMA A; 1AZE A; 2XK0 A; 2KRS A; 3JB9 I; 1X27 A; 3OYL A; 2KQW A; 4FM4 B; 1FMW A; 1OPK A; 3EFO B; 4IUU A; 4GY5 A; 1PG5 B; 2FHD A; 2R5A A; 2RHI A; 1C1A A; 5GAN h; 1D1B A; 3CCQ T; 4M78 E; 2HNI A; 4KGV B; 3VU3 C; 3MO8 A; 3JCM X; 3CXC P; 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2D6F A; 1IHV A; 4XU0 A; 5CO7 A; 5I2S A; 1VQ5 A; 2J6F A; 2LJ1 A; 1WJS A; 2JJ9 A; 1D09 B; 4P5N A; 4F7U A; 1U3O A; 4LNP A; 3NGP A; 4M78 D; 4HCK A; 1Q82 U; 2CP5 A; 2K4Y A; 2NUP A; 2HL3 A; 1FYN A; 1AEY A; 2XID A; 1AWX A; 4NL2 A; 3CCV Q; 2HEQ A; 2I2L A; 1M8M A; 1W6X A; 4OML A; 2KRO A; 1KG1 A; 3CPF A; 3CME T; 3M0R A; 1P92 A; 4PLI A; 2KEA A; 2ABL A; 4M77 E; 3UDC A; 3CD6 Q; 3BY7 A; 3VS3 A; 1H92 A; 2RHZ A; 1M90 U; 1QP3 A; 1QWE A; 2QQS A; 4DBH A; 2KT1 A; 2YWW A; 1ZHI A; 4J9C A; 2DPP B; 4J7F A; 1RAG B; 1SPK A; 1ZSZ C; 3UPU A; 3OW2 P; 4PJO D; 1YNZ A; 1B34 A; 2CDT A; 3I56 Q; 1NEB A; 5KYX B; 2DD4 A; 3FIF A; 3HHT B; 4PFO A; 5KE2 A; 2HSE B; 1X6O A; 3U23 A; 4XTW A; 2LCS A; 2QQA A; 2YUP A; 1GRI A; 1EFN A; 4E7H A; 3OA6 A; 3NTI A; 3NFC A; 1W1F A; 3SDZ A; 1KFZ A; 3G6E Q; 3CCQ A; 3CCS A; 2NUZ A; 3GF5 A; 3HTR A; 2CYZ B; 1HD3 A; 1IZ6 A; 5CKE A; 2L3P A; 2DL8 A; 1PRL C; 1NYF A; 1OOT A; 1VIE A; 2YRD A; 2DKG A; 4L6V 5; 4LE9 A; 1VYU A; 1KQS S; 3QXE B; 1M2V B; 3CC7 A; 3HL8 A; 1BCM A; 1MHN A; 4QQ6 A; 3RDV A; 1B7T A; 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