2J6XA

The crystal structure of lactate oxidase
Total Genus 133
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
133
sequence length
370
structure length
370
Chain Sequence
DIEYNAPSEIKYIDVVNTYDLEEEASKVVPHGGFNYIAGASGDEWTKRANDRAWKHKLLYPRLAQDVEAPDTSTEILGHKIKAPFIMAPIAAHGLAHTTKEAGTARAVSEFGTIMSISAYSGATFEEISEGLNGGPRWFQIYMAKDDQQNRDILDEAKSDGATAIILTADSTVSGNRDRDVKNKFVYPFGMPIVQRYLRGTAEGMSLNNIYGASKQKISPRDIEEIAAHSGLPVFVKGIQHPEDADMAIKAGASGIWVSNHGARQLYEAPGSFDTLPAIAERVNKRVPIVFDSGVRRGEHVAKALASGADVVALGRPVLFGLALGGWQGAYSVLDYFQKDLTRVMQLTGSQNVEDLKGLDLFDNPYGYEY
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Oxidoreductase
molecule keywords LACTATE OXIDASE
publication title The 2.1 A Structure of Aerococcus Viridans L-Lactate Oxidase (Lox).
pubmed doi rcsb
total genus 133
structure length 370
sequence length 370
chains with identical sequence B, C, D, E, F, G, H
ec nomenclature ec 1.1.3.2: Transferred entry: 1.13.12.4.
pdb deposition date 2006-10-05

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01070 FMN_dh FMN-dependent dehydrogenase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 2j6xA00
4QSHA 4GFSA 1KLYA 4LC6A 4OQVA 3N9SA 4HNUA 1ML1A 4BI5A 4FNUA 4A21A 3MUXA 1ME9A 5AHEA 3DFOA 4NVTA 2QF7A 3RNDA 1YTEA 2Q8LA 1TSIA 1XCFA 3QJAA 1O5KA 1VYPX 5FF3A 3KHJA 4RK8A 3P5YA 2NXIA 3PG8A 2OT0A 1HTIA 1RZMA 4XBSA 3TROA 2QCMA 5DCEA 4LVGA 4JX6A 4KWWA 3ZS4A 4JX4A 3CPRA 4LU0A 2ABBA 3UWVA 1QOPA 1W8SA 3BK0A 5AHFA 1Q6LA 1LLZA 4YXGA 2QCGA 4AF0B 1LRTA 1JCMP 2VFDA 5KZDA 5CGQA 4L4LA 2Y70A 1SW0A 5LGZA 2EPHA 2YDAA 1TTJA 4CLMA 2CLEA 3PSVA 1AL7A 5K4ZA 2CLLA 1K8YA 2CU0A 1R2SA 4AAJA 1SR9A 3PR2A 5D33A 1DOSA 2V9DA 3B06A 5AC8A 4BWLA 3AJXA 3QMTA 3W85A 1FDJA 3A5FA 3LRMA 3P62A 4FNQA 4JTUA 4O1DA 2WKJA 4GUIA 2A2IA 1QO2A 1SW7A 4DXVA 3TSDA 4Y6GA 4JTKA 2CWNA 5LHEA 3GX9A 1ME7A 3FIGA 3L9CA 4LC8A 3LRLA 5H2ZA 4U4MA 3W2MA 4KWVA 4JX5A 3MI3A 3P84A 2V81A 3G1HA 2V2HA 3UY8A 4BI6A 1FY6A 4FX7A 3W86A 3UWYA 4AH7A 3IRDA 3N9RA 1Q45A 4Y96A 4IQLA 2QDHA 4WXZA 5I3IA 3SGUA 1HO4A 1QR7A 1UCWA 3NQAA 4O18A 2VENA 1SU5A 3Q58A 1W5NA 3H54A 2QAPA 5D09A 3L5LA 3LV6A 1YTKA 4DBEA 2F7FA 2QUVA 2ZZ7A 1YDOA 5TIMA 4AMAA 5KITA 3TMLA 2B7QA 3NAVA 3W1RA 4R53A 3PC0A 3W87A 3EB2A 4NZFA 2W0UA 4MZ1A 4UTTC 1ZALA 2ZRVA 1DJQA 3TA6A 1A50A 3GDTA 4X22A 2VFHA 1EX5A 2HS6A 4RX0A 1I2OA 2Y7EA 3G1XA 1JRBA 5L9FA 2GVGA 3B04A 4JY9A 5EPDA 3W6YA 4TO8A 1KM6A 4CCEA 1LP6A 4WXYA 1KA9F 5D04C 4MJMA 3L66A 3SJ3A 3QW3A 2WOQA 3EX2A 2LLEA 5LSMA 3W76A 2CLMA 3NGJA 1VH7A 2WNQA 3P80A 2H6RA 5K9DA 3FYOA 3USBA 4PH6A 1EP3A 4TU1A 1FUYA 2ZTKA 3TW7A 3ZWTA 4HPJA 3N2XA 1YPFA 3ABRA 2I1OA 4LVAA 3W7LA 4MLRA 3HPZA 4NUWA 3LCGA 1VYRA 3W1NA 1GOXA 1WQ5A 4TIMA 5G2HA 2B7OA 2NXGA 2GPTA 5HUPA 1I2QA 5FF0A 2GQ9A 1KM3A 1W1ZA 1TPWA 3HO8A 1G67A 1X1OA 4K8EA 1G4SA 2PRHA 1IXPA 5SWUA 4O15A 5DBUA 4MY1A 4Y8FA 3CB8A 2JKEA 1ZHAA 3MYPA 1XFBA 3EXSA 1W3IA 2ZZ4A 3LI1A 3CM4A 3DHDA 4UFIA 5D2YA 3W1UA 3BLFA 4B5NA 4KFPA 4UMCA 4UTHA 5G4EA 2C0AA 1RVGA 4MJZA 4ORIA 1ALDA 3E0IA 2NV2A 1QAPA 3MO7A 5DCDA 2C18A 3QW4B 4TR9A 1QPQA 3VFLA 3LLDA 2FTPA 4UFMA 3G8RA 2CLKA 4IXXA 5KSWA 1RQEA 1KV8A 1L6YA 3THAA 2ZZ6A 3NM1A 2RH9A 3HG4A 2X1RA 5DCBA 5LHFA 2ATSA 5HNRA 5EBUA 4JTTA 4Y9AA 3RF9A 2JKAA 3W72A 5E93A 4MOZA 1PHQA 2GQ8A 1EP1A 2JBMA 2DZPA 4N6EA 3C2OA 3M43A 4E2BA 3SIZA 3QMSA 2Z1BA 3T55A 1MO0A 3P60A 3EKZA 1VS1A 3FYPA 2CW6A 3W70A 3TX9A 1ME8A 3NQ2A 5LGXA 3QMRA 1VCGA 1SO6A 4LT9A 1C9DA 7TIMA 1JCJA 1TJRA 4BR1A 4K39A 1RD5A 5IBXC 1D9EA 4K6AA 1IIGA 1M7OA 1C29A 5LNUA 1XM3A 2GJLA 4CNOA 1OFPA 3IIPA 3LCWA 4EIVA 1KLZA 1TREA 3N14A 3P5ZA 5D32A 1XBVA 4PL1A 1EPXA 5KTLA 4MFEA 1ADOA 4FO4A 1BWKA 4M7TA 1T8XA 4EF8A 2DZUA 2I14A 4P2VA 1G4EA 1ZCOA 3TCEA 3ABSA 4FNSA 3BPWA 2ISWA 3KXQA 1QDSA 4OV4A 5CZTA 1S5WA 4IMDA 1F2JA 1C8VA 1VR6A 3IEBA 3O63A 4AWTA 1RV8A 2YW4A 3NVTA 5F4XA 2AAMA 3HG5A 1KFJA 5LNWA 1NF0A 4MYXA 4O4WA 3B8DA 3FEMA 3WK0A 1ICQA 3MW7A 3GAYA 1HFBA 2XN2A 3CQ0A 2RDWA 4O50A 3NL2A 3PBUA 1R2TA 4NNBA 1TQJA 1LCOA 1I4NA 3QF0A 3DXIA 1W56A 2Z6JA 2FPTA 4N02A 1W31A 1HG3A 4RCXA 3UWZA 3L68A 1ZENA 3S1UA 3NQEA 4GBUA 2ISVA 3O8AA 3HJZA 1H51A 2H8ZA 4NQ1A 1P0NA 3LOTA 2VXNA 1R30A 3TQVA 3OBKA 4N4PA 3RK8A 3HG2A 1FXPA 1U83A 3B4UA 2OCZA 4FIRA 2E09A 5C54A 5K3VA 4NXSA 2VEPA 3U8GA 1HUVA 1ZJIA 3VI2A 4FEZA 1Z48A 1QPRA 2ZQ0A 3IVTA 5DY3A 4JXCA 4RZ5A 4FX6M 3M5ZA 1VPXA 2WNZA 4FF7A 6ALDA 1JRCA 3IGXA 4N9EA 1XC4A 3HIJA 4X9SA 1TYGA 1F5ZA 1L2UA 2PE4A 5U4NA 4AHOA 1S3HA 3UWUA 5CSSA 1J2WA 1TPDA 2E5DA 2A4AA 2Y63A 2AGKA 2X1TA 4N9BA 1IIHA 1RPXA 1XKYA 1H7OA 2Y7FA 3C4UA 3NZ1A 5EA9A 4ZQPA 3OHIA 5BMXA 3KVMA 5G1TA 3C0JA 2QJGA 4HHPA 3B0PA 2NUWA 3G0XA 3HBLA 1OYBA 5FEZA 1DQWA 2C15A 1KTBA 3B0VC 3LERA 1JULA 1PE1A 3INPA 1FX6A 5F4WA 1YADA 4A3UA 4O10A 2EF9A 3DI1A 1I2PA 2X1SA 4QIUA 1GVSA 1O95A 2BSLA 2B0MA 1H1YA 4DF2A 3SGZA 2ZRUA 2IQTA 2YFNA 1H63A 4JIQA 5EL1A 3PBVA 1OHLA 3RLVA 4O8RA 3G3MA 3PG9A 5EMUA 3UD6A 2ZFAA 4AWUA 4K37A 1O60A 1AW5A 3O1NA 5LNSA 3MI2A 4O14A 1LROA 1TTQA 1QNVA 2Q8ZA 1OFAA 2E6FA 3S5OA 5AHMA 3W1TA 5HULA 1W3TA 1W0MA 2ZZ3A 4K38A 3VE9A 2WO5A 4XWUA 3TKFA 4GXMA 4MZ8A 4JYDA 5I3JA 1WA3A 4XZ9A 3TK7A 2A7RA 3OVRA 4Z0SA 2YYTA 8TIMA 3HGRA 3PF3A 1EA0A 3EWYA 1FWSA 1D3HA 4DPPA 4ZQOA 1J5TA 1K8XA 1W5OA 3WJSA 5I3FA 4NNAA 3OEXA 2DU2A 1JQXA 3UPWA 5K9CA 3W7HA 1W3NA 4M19A 3DZ1A 4ADSA 3DFNA 4ADTA 1K7FA 4LRTA 4PC8A 1O94A 3EKLA 1JCXA 2Y61A 1KM2A 1OFBA 2DZVA 3A21A 4LNYA 5AN7A 2FPVA 3DHFA 3G0UA 3W23A 4EOUA 1I45A 1KBIA 2R14A 1VYSX 3M6YA 2RHGA 3H53A 3EX4A 4JDYA 1ZY9A 3M44A 2OT1A 4WOQA 4TMCA 3MYOA 4IMFA 3NOEA 2QR6A 2QCDB 2YW3A 4A29A 2OMAA 4GC4A 5AYZA 3TXZA 5IM51 4H4IA 1MZHA 3NL6A 1TMHA 1HO1A 4JTJA 3CTLA 2FLIA 3LRKA 3KRZA 5F2LA 4UUIA 2ZZ1A 4JTLA 3E12A 5BNKA 1ZAHA 4IUOA 1SUXA 3UWQA 2FB2A 2O7QA 5BRBA 2X1UA 2R8WA 2TSYA 3QH2A 1WAUA 1H7PA 4DO4A 1KW1A 4UTUA 2GUUA 2QUUA 3W84A 1OFOA 4PEKA 2WNNA 4OHQA 2E77A 3W1LA 4GUHA 4JTHA 1SFJA 4LS1A 3UNDA 5DBTA 1OYAA 3W74A 3W7QA 2F84A 4QM1A 1LOLA 3WJXA 1PHWA 1KFKA 2VFGA 5FEXA 1SO4A 4YLWA 1LDCA 4IX2A 3LXBA 3NL3A 1LOSA 4PODA 1VJIA 3NQ8A 4LTSA 1OX4A 3PSWA 4JY8A 2C13A 3U2OA 2YSWA 1LRQA 3G1AA 3Q37A 4WZHA 1SFLA 3T40A 2H3DA 3W7RA 1TV8A 1PCWA 3TU9A 1UUMA 4XTDA 1A5SA 2GJNA 5J5RA 1JCNA 1G7UA 2V82A 4GRSA 4FNPA 1LOQA 1OK4A 4FB7A 1SSGA 3DAQA 4E0CA 1YPIA 3NQGA 1F73A 2H90A 4HSNA 3JS3A 3RU6A 1A5CA 4HSOA 4UMBA 3NQCA 3QPYA 2BX7A 2CLFA 5G5IA 1N55A 4ZQCA 3GVGA 2Y89A 3W1PA 4M5PA 4EF9A 1TPEA 3CU2A 5KMYA 4YL2A 2NWRA 1JUEA 2VFFA 2ZCGA 2A7PA 3FJ6A 3W1MA 5C2XA 1T0OA 3UZJA 5CKSA 2A6LA 3GYEA 3S42A 1KFEA 5E1QA 3KVLA 4QISA 3W7PA 4WOZA 4O1CA 3L0NA 3LBMA 2TYSA 1KM0A 4JR5A 4UTWC 5ABTA 3R2GA 3V1PA 4Z1AA 2Z6IA 5EYWA 4LY8A 1YLVA 3UZ5A 4NNCA 1JR1A 1F6KA 3LI0A 3EWZA 3DFQA 3LGEA 3C61A 1MEWA 3MWAA 3W71A 4POCA 4O16A 2G5WA 4OGZA 4WY0B 1DKWA 2DJXA 4O54A 4AF0A 3STFA 4IOTA 3QPZA 4HNTA 1SPQA 2ALDA 2DJLA 1RR2A 2X16A 3N19B 3S8HA 3NQMA 4UR8A 1JUKA 2DP3A 4JEQA 3SZ8A 1XUUA 3QYQA 2D73A 3ANYA 3KOFA 4N9CA 1XI3A 3S6DA 4RLIA 2A6NA 4QNEA 4UR7A 4UTWA 4ZMGA 1H5YA 2ZA1A 3SECA 1LBMA 2YZRA 1TTIA 2VEIA 2QCHA 3AO0A 3QZEA 3I6RA 3G8EA 3C3NA 3M5VA 3GDMA 3P7YA 3KVJA 3BLEA 4JGDA 2XN1A 1O4UA 2KZHA 4WY0F 4CQ8A 2QCEA 3W88A 3W75A 1P5BA 2C16A 2Q3OA 3O6CA 3C2FA 4UTTA 1YTDA 3KRSA 2PRLA 3C8FA 5TBOA 3SW6A 2ZZ5A 3UY7A 3GIYA 3MBDA 2J9ZA 4IX0A 5BOOA 3L5AA 3G24A 1FWTA 2PCQA 4LVFA 3TSBA 4N9DA 4UFJA 3PS7A 2YPIA 4AHPA 1PL9A 3W7EA 3N73A 2TRSA 2NXHA 3N34A 3GKAA 2E5BA 1VGAA 2WSRA 4I9AA 2WSYA 4PL2A 3PB2A 4MY8A 1BEUA 3LDVA 1OFDA 2E68A 3O16A 4IMCA 1LTDA 1SO3A 4GUFA 3PUEA 4GUGA 4RV8A 4LVBA 1THFD 3TDFA 1MXSA 3LX9A 1B9BA 5F2IA 2CLIA 1TPH1 1DBTA 1OJXA 3IIVA 5T26A 1Q6QA 4LUJA 3IIXA 2E6YA 2ZRYA 5A8GA 2X2GA 3ABQA 5F2GA 1VC4A 2EKCA 1OVDA 5CZ0A 3DFTA 1K03A 5FEPA 2FPYA 2H8XA 4UNLA 4FXRA 4NT0A 4RXGA 1ZAJA 2C1HA 2TPSA 3A22A 4I7WA 4ADUA 4ZQMA 3MBFA 2V2DA 2QJIA 5HWMA 3TJXA 3HB9A 1H7RA 4FHAA 4M6VA 1M7PA 2A7NA 3QSRA 4RZ6A 2VC6A 1KFLA 1FCQA 1OFEA 1T96A 1R46A 2OJPA 3P8IA 3E96A 5HUOA 4ZZ9A 4HN4A 3STGA 1MEIA 2QCNA 5I3KA 1IXOA 4JTGA 4UFLA 3PBWA 1QWGA 5A5WA 2RDUA 1CI1A 2WJZA 2P1FA 1TPFA 2QKFA 1FCUA 4K7VA 5FF2A 1UUOA 1TPB1 2YYUA 1TRDA 3RFAA 5AB3A 1NEYA 1JQVA 2TMDA 1TCDA 3L67A 4BK9A 1V5XA 4JTEA 1LORA 4QITA 1TV7A 3BG9A 1SZEA 2RDTA 1EP2A 4G1KA 3S5YA 2V30A 1OX5A 4FNTA 3PY2A 4TMBA 2XN0A 5F2MA 4O53A 1YYAA 3LHVA 4LV4A 2RFGA 3BVJA 4DEFA 3S9YA 1GG0A 4UTMA 3S1WA 3NDOA 1DL3A 3SR7A 4BF9A 4E38A 1X1ZA 2C19A 3W2JA 1JVNA 2VKZG 1Z44A 1VRDA 4NJHA 3TAOA 1EB3A 3PB0A 5IBXA 1ICPA 3CWOX 3GR8A 2VEKA 2V2CA 3OVQA 1FWRA 5I3GA 3TC6A 1R2RA 3NNTA 4XBKA 2ABAA 3FLUA 4O1AA 3R8RA 3W2KA 3KX6A 1T99A 1X6UA 3EXRA 3GKFA 1GVRA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
 1JD9 A;  1MQQ A;  1XF0 A;  3PTD A;  4GFS A;  1JAK A;  1TZZ A;  3CMF A;  3VOH A;  4BI5 A;  5DMM A;  4C6L A;  4DYJ A;  1I9C B;  1U1U A;  5JH1 A;  3CB3 A;  5FSD C;  2EG8 A;  5FF3 A;  3ZT6 A;  1ZUA X;  4LVG A;  3PZU A;  1DJH A;  1KWG A;  2BFG A;  3MCO A;  3GW0 A;  4LUT A;  3ZS4 A;  2GGH A;  2PGW A;  3QTG A;  2ABB A;  1QOP A;  3BK0 A;  3LMZ A;  4S3C A;  3VU2 A;  4YXG A;  2VFD A;  2MAN A;  1MI3 A;  4HPH A;  1FOB A;  3APY A;  1LT7 A;  4L6D A;  5TF0 A;  3SRD A;  5AZ0 A;  2O9P A;  2WPG A;  1K8Y A;  5GNX A;  3PR2 A;  1TV4 A;  1DOS A;  2PFH A;  4BWL A;  1NQ6 A;  1KNW A;  4Z2K A;  3RJY A;  3TSD A;  5HMD A;  4JTK A;  1BPL B;  2YCK X;  3FIG A;  4OJY A;  3A13 A;  4U4M A;  4ACZ A;  4PUW A;  3W86 A;  3IS4 A;  1H2J A;  4IZG A;  1H09 A;  3W01 A;  3IRD A;  5CAK A;  3QTP A;  4HA1 A;  1CWY A;  1L0P A;  1L2Q A;  4GQQ A;  3CAQ A;  2WVV B;  5CH9 A;  2VEN A;  3R0U A;  4UQ9 A;  1SU5 A;  1RP8 A;  4GAB A;  3S5S A;  2OGY A;  4YTR A;  1YTK A;  4Z2G A;  3WD4 A;  4GZI A;  4IG2 B;  3WEO A;  2QUV A;  5TIM A;  4AMA A;  1HW6 A; 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 1KCX A;  2DT0 A;  2GGI A;  2ALR A;  2GDV A;  3TC3 A;  1DWJ M;  5KSW A;  2NVD A;  3THA A;  3AC0 A;  2X1R A;  1J12 A;  3OO2 A;  5HNR A;  1QI3 A;  4R9O A;  4AXN A;  2JKA A;  5PTD A;  3N6H A;  3LY0 A;  1XLG A;  4DHG A;  3UYI A;  3UR8 A;  4Q8W A;  3EAU A;  4PMD A;  2F8Q A;  1HJS A;  3T55 A;  3DER A;  4HTB A;  3P60 A;  3EKZ A;  3N15 A;  1VS1 A;  3AXM A;  3FYP A;  3IJQ A;  3DC0 A;  3GS6 A;  1ZBK A;  4WDX A;  4I9J A;  3KWS A;  1IEW A;  2PD9 A;  1KBB A;  1RD5 A;  3TYU A;  3AU6 A;  5A1A A;  1FP8 A;  3PK7 A;  1C29 A;  2CBV A;  3AIS A;  3GQY A;  1OFP A;  1TUX A;  3WH6 A;  3OLI A;  1YQ2 A;  4IPN B;  4MDP A;  4L5Z A;  1DJW A;  1VBR A;  3N14 A;  4JL2 A;  4PRW A;  3OHM B;  1RJQ A;  1Q8J A;  4ZB2 A;  3UG3 A;  1ADO A;  4EF8 A;  3TN3 A;  1IT8 A;  4B92 A;  3DYP A;  1PX8 A;  1KXV A;  2WZM A;  1QI0 A;  4IMD A;  4AWT A;  1WXZ A;  3O63 A;  1QW9 A;  4DJD D;  3GBE A;  3HG5 A;  1KFJ A;  1UWR A;  1WDR A;  1UPP A;  1V77 A;  3WK0 A;  3GAY A;  1HFB A;  3UGR A;  5AC4 A;  4NNB A;  1TQJ A;  2DY3 A;  3WDH A;  1I4N A;  1MRQ A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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