2J7DA

Beta-glucosidase from thermotoga maritima in complex with methoxycarbonyl-substituted glucoimidazole
Total Genus 172
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
172
sequence length
443
structure length
437
Chain Sequence
VKKFPEGFLWGVATASYQIEGSPLADGAGMSIWHTFSHTPGNVKNGDTGDVACDHYNRWKEDIEIIEKLGVKAYRFSISWPRILPEGTGRVNQKGLDFYNRIIDTLLEKGITPFVTIYHWDLPFALQLKGGWANREIADWFAEYSRVLFENFGDRVKNWITLNEPWVVAIVGHLYGVHAPGMRDIYVAFRAVHNLLRAHARAVKVFRETVKDGKIGIVFNNGYFEPASEIRAVRFMHQFNNYPLFLNPIYRGDYPELVLEFAREYLPENYKDDMSEIQEKIDFVGLNYYSGHLVKFDPDAKVSFVERDLPKTAMGWEIVPEGIYWILKKVKEEYNPPEVYITENGAAFDDVVSEDGRVHDQNRIDYLKAHIGQAWKAIQEGVPLKGYFVWSLLDNFEWAEGYSKRFGIVYVDYSTQKRIVKDSGYWYSNVVKNNGLE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Hydrolase
molecule keywords BETA-GLUCOSIDASE A
publication title Glycosidase Inhibition: An Assessment of the Binding of 18 Putative Transition-State Mimics.
pubmed doi rcsb
source organism Thermotoga maritima
total genus 172
structure length 437
sequence length 443
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.2.1.21: Beta-glucosidase.
pdb deposition date 2006-10-06

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00232 Glyco_hydro_1 Glycosyl hydrolase family 1
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 2j7dA00
1UWSA 3SCOA 4BQ5A 4W5ZA 3SCPA 2WBGA 3GNRA 1KCLA 3L4VA 5JIWA 1XSIA 5CQ1A 3DYPA 4UQEA 1JNEA 2YL9A 3ZT6A 1JIBA 2XYLA 1Q6EA 3J7HA 1W1TA 1UA3A 3FNDA 2XM1A 4KMQA 4MB5A 1HL8A 3RM8A 3VGEA 1FP9A 2X1IA 1D3CA 1KQZA 4J3SA 1XH1A 3VGDA 1KBKA 5CSUA 2F8QA 3GDBA 3SUTA 4D6CA 5DT7A 1EOKA 1J0IA 1QHZA 3FAWA 4X9YA 5E0CA 1EOMA 1D2KA 6A3HA 1BAGA 2QPUA 5LYRA 4JIEA 1NP2A 4J7RA 2C7FA 1E71M 2G3MA 3VDAA 2O9OA 1TG7A 4R27A 2XPKA 4N0RA 3PZMA 4UNIA 4ACYA 3MO4A 2FGZA 1VAHA 1JXKA 4OOUA 1B90A 1WZMA 1CGXA 3AJ7A 4LYQA 1W9DM 1EDQA 4HU0A 1TFVA 3MV11 4UFHA 3SCRA 4L4PA 3SCVA 2O9TA 2AMGA 1F4HA 4E8DA 4AZHA 1ODZA 5A2BA 4DM1A 1V0NA 3AISA 1E0WA 1E5NA 1FP8A 1V3IA 2WSKA 4EAMA 2UY2A 1UA7A 4BQ4A 4W86A 2RGLA 3VMNA 5BRPA 5E09A 1E4LA 3TONA 2XG9A 1XC6A 1E72M 3BH4A 4KWUA 1KR1A 1J10A 2WANA 4PSRA 1ZB5A 1H49A 1ZBKA 1HXJA 2J7BA 3BSHA 3M07A 2YA1A 1LG1A 2O92A 2XGBA 4UQAA 3VD7A 2XWEA 4OOZA 3WH5A 2Y8KA 2YDRA 4W87A 3OBAA 3W24A 2QLYA 5DMYA 3AIWA 1KBBA 1PX3A 2Z1SA 1P6WA 3T2QA 1M53A 2MANA 1JZ7A 3BAKA 1O6IA 1V0KA 2ZWYA 2DT0A 2WAGA 2WLYA 3A4WA 1WPCA 1LWJA 5AYIA 3BLKA 1NWRA 1B1YA 5CSYA 4DUWA 3GH4A 1CYGA 3IJ8A 3RJXA 2XJ7A 4TVUA 3WDPP 5CZKA 3AHXA 1LL6A 3WUEA 1MQRA 1QBBA 1KCKA 4V27A 4BZYA 2VI0A 3W29A 2WCSA 1HL9A 2WNWA 5I79A 4YN5A 1FHDA 3W26A 1CPUA 1ZBWA 1BF2A 2QMJA 2VJXA 2YLAA 1PPIA 5ABFA 3WH7A 2DGAA 1CXLA 2FH8A 4CN6A 4TTUA 1X1NA 2F61A 2QHAA 3ZM8A 3II1A 2CBVA 4GZIA 1R86A 1K9FA 2DSVA 1QPKA 3CZEA 2J47A 5A69A 4OBSA 2DIJA 2ZXAA 3KL0A 4AISA 4F9JA 2VX5A 4PMZA 5I6SA 4TTGA 4U5KA 4AIUA 1V6YA 1E4MM 3ZR6A 1H11A 4QP0A 1VEMA 1NP0A 1NWSA 4U3CA 2GVYA 4UFKA 1CWYA 3ZJ7A 3SUVA 2XVGA 1V0MA 1JXJA 5M03A 1UWTA 1JG9A 3UG3A 1GOOA 4L4OA 2F2HA 2ESCA 1HVQA 4TX6A 4PUEA 4BQ2A 1UKOA 5CGTA 1M03A 1RH9A 3NSNA 1G94A 2VX7A 3WF2A 3UERA 2ZXQA 3MUAA 1CBGA 1LWHA 3MMUA 1JYWA 3WENA 3VNYA 1V6UA 5DF0A 4ACZA 1UH2A 4HZ7A 4HMEA 4UZSA 1EDGA 3WNLA 1BG4A 2XVPA 3PTMA 1PZ3A 1BLIA 1VFMA 1CXEA 4JL2A 2OWCA 1VEPA 2GJPA 2J7DA 2BHUA 3K46A 3L4TA 2WCAA 3KEHA 1CECA 3ZMRA 2J8FA 2A3CA 2JALA 3N11A 1EIBA 2EJ1A 2RGMA 4GPNA 1V6VA 2VZOA 2VT0A 4PTMA 1UWRA 1JNDA 2C0HA 2WMGA 2WZHA 4TXEA 1JZ5A 5IHSA 1FHLA 3AHYA 3ARPA 4GO8A 2G8ZA 4KH2A 3CBWA 4LYPA 2PWHA 1AQHA 4MPKA 4JKLA 2CCRA 3AROA 3VM7A 3OZOA 3VIGA 5CGMA 3ARXA 4ATWA 2VQTA 4H8UA 2YL8A 3ARQA 4PMQA 4D6HA 2YBTA 4N42A 2VRKA 3AMCA 1V6WA 1BGAA 1EH9A 3ZO9A 7A3HA 4PMDA 4W7UA 2ZUNA 1WAWA 3AXXA 5JUVA 4E8CA 1UKQA 3UG5A 1OGGA 1XSKA 5EB8A 3UEQA 1UQZA 3PZNA 1W1VA 1H4PA 3FAXA 4ACZB 2DIEA 2JFEX 4QCEA 3F4VA 3GBEA 3CMGA 3VIOA 4WSJA 1VF8A 3AYRA 4P8WA 2CHOA 2E3ZA 3U57A 2GFTA 4M8UA 4WKFA 1D7FA 2W4XA 1ISVA 2WLZA 1OGSA 4UFIA 3BSGA 2CBUA 3HJEA 1MFUA 5M3WA 1M7XA 1BYBA 1HKJA 2UY3A 5I0DA 3K8LA 4JKKA 2J4GA 1QW9A 3OLGA 3AZSA 3NSMA 1JDCA 2J8GA 3WH9A 4LPCA 5HPOA 2WKGA 4HOXA 4CD8A 1UR1A 2ZX8A 3WDRA 4C7GA 4ML4A 5BXTA 2DQXA 5ECUA 2FHFA 4MB3A 2CERA 4PCTA 5GNXA 4ZE4A 3WEMA 1BTCA 3TP4A 4D72A 3OG2A 2BY3A 3ARVA 1UD5A 1E43A 2J77A 3WNMA 5BWFA 3DYMA 4FLQA 4AZ6A 3RIKA 3WQWA 2V5CA 3K8KA 3LPGA 4NZCA 3VTRA 1FOBA 2BVDA 4Q22A 3MUIA 3ARTA 1UKPA 3ARYA 7TAAA 3WF1A 4AD1A 2ZICA 3W81A 3AHVA 1CXFA 1XH0A 1DWIM 3PZQA 3AIBA 2W92A 4GXPA 2EQDA 1EQCA 2ZWZA 1X6NA 3U5UA 3NCOA 4CN4A 1IV8A 4DWSD 3SCSA 2D24A 1ISYA 4NF7A 3SUUA 1B3ZA 2O9RA 3GBDA 1SYTA 3VGFA 4V2XA 4JCMA 5JBDA 3WMBA 4FMVA 2WWCA 3VO0A 2IUZA 1E4NA 3VU2A 1NOUA 1GONA 1CGVA 1EGZA 5GNYA 2B31A 1OB0A 4ZENA 4PMVA 1EA9C 2OYMA 2ZUVA 3KL3A 1BPLB 1E0VA 2WHKA 1E3XA 1J0JA 5M5DA 4YHEA 3ZQ9A 1HJWA 3BCFA 3GH7A 1W3LA 3PN8A 1ZBVA 3WDHA 1I1XA 3A6OA 4P7NA 4HA4A 2J25A 4HA3A 1DP0A 1RP9A 2JE8A 5AC4A 4JCLA 3ZJ6A 3W0KA 1E73M 1UD4A 4CCCA 3OLIA 2XFFA 3B9AA 1R7AA 1UOKA 2PWFA 1SMAA 3GNPA 1CNVA 1J01A 3IANA 1PZ2A 2E8ZA 4ZXOA 5JBFA 2A3BA 1R8LA 3CMJA 3WFZA 1OINA 1L0PA 3W28A 4PTXA 3MMDA 5CPQA 1V3MA 2Y4SA 1GZJA 5I23A 2Y2WA 2IXUA 4NI3A 3FXYA 5A2AA 2VCBA 5D8WA 2X0HA 1JZ6A 4AMCA 1CGUA 1XYZA 2WK2A 2JIEA 1JGIA 1ITCA 3THCA 4PYSA 4TVCA 1K9EA 1NARA 1XH2A 4PTWA 1WP6A 4UZUA 3KL5A 4P7LA 1GJWA 4TUFA 2OSWA 1UZ4A 3CO4A 4AD2A 4J3UA 4P8XA 3T0AA 2NSXA 2X8RA 4AD3A 1UR2A 1J9YA 1HIZA 4JFSA 1N82A 2ZXBA 3GNOA 3QGVA 1Q6GA 5A6BD 3IAPA 1QBAA 1E4IA 1CLXA 2E40A 1OIMA 1MQPA 4DWSB 3WMCA 3AMDA 3RJYA 2XSBA 1PJ9A 5ABEA 2XGIA 1BGGA 3CZ8A 1KGWA 4RE2A 3UETA 4MADA 1XSJA 1PEZA 3ZT7A 5D9PA 3CZGA 1W91A 1L8NA 1DWHM 3AMLA 1OWQA 3FY1A 3QHOA 2VZSA 2WM0A 1PBGA 3VMOA 2CEQA 1XGZA 5GQBA 2YL5A 1VBRA 4ZFMA 4CD5A 1BVZA 1GVYA 3WL0A 4CU8A 3WKZA 5CG0A 1E70M 4HMDA 1V02E 3U7BA 3W27A 2FGLA 1J0ZA 1Q6CA 1GQIA 4Z2LA 3IJ7A 1I1WA 1Q6DA 2D0FA 1GQLA 4W7VA 3RILA 3A3HA 6TAAA 4OZOA 1WZKA 4AZCA 2ZUMA 5A3HA 2V38A 2WPGA 4GO9A 4XZBA 4D1JA 3EMZA 1JI2A 1TA3B 2YDQA 1XD1A 3VIJA 2PI6A 3WDJA 4LGXA 1MW3A 1BYCA 4HZ8A 4JFVA 4AD4A 1EXPA 3ARZA 4PMNA 2BV9A 2EXOA 1GPFA 3HN3A 3MMWA 3K4DA 3SCQA 3U7VA 2WHJA 4PTVA 1WDRA 3W53A 1JYNA 3W82A 3B9EA 3PZUA 2G4FA 1JZ4A 3PZGA 3VIPA 1UH3A 3VILA 3WF4A 3ARSA 1E5JA 2J74A 2ZE0A 1JYXA 1MW1A 4WF7A 5I24A 1C92A 1J12A 3WQVA 1W3HA 4LYRA 2FDMA 1GW1A 2EEXA 5EMYA 4UQBA 1JF5A 2OYLA 3T2OA 4OBRA 4CUCA 1BYDA 3WY1A 4TOQA 5FIPA 1CENA 1M04A 8A3HA 2J7GA 1B9ZA 1C8YA 3AZRA 5BXPA 1LL4A 1VFUA 3BXWA 3WNPA 4ATDA 3GYCA 2D22A 5E6YA 1H2JA 3WD2A 5GNZA 3AXHA 4HMCA 1XRVA 1DHKA 4QFUA 3TA9A 3RCNA 1MVYA 1PX4A 3OIHA 5A8OA 3IK2A 1TCMA 3PZ9A 4QDMA 1QI5A 5IFTA 1J18A 2WZEA 2JIWA 1CDGA 1OIFA 3ALFA 4AZCB 2YDSA 1MQQA 4W8AA 3LPFA 2J7EA 1HJXA 3EDEA 2DSWA 2EO7A 1W2PA 3WH8A 1KWKA 3MSGA 4IPNB 2CYGA 2XVLA 2VMFA 3EDJA 1OBAA 4J27A 3EDKA 2IXVA 1E56A 3VD9A 1JYVA 4H8VA 1NM9A 1ZU8A 2ZXDA 4PUDA 1VIWA 1W3KA 4UCFA 2XTKA 4NRSA 3S6TA 2W67A 4EANA 1V0LA 4A3YA 3SIMA 1GHSA 6CGTA 2BHZA 5BYWA 1AVAA 4HA1A 3U5YA 1V3LA 4K68A 2PF0A 1WNOA 3RM9A 4GQRA 1C7TA 3VGBA 1UHVA 4AZBA 4J3XA 1IZJA 1G01A 1NOFA 5HXMA 1MW2A 5F7UA 1QOXA 3UG4A 4HPGA 4M29A 3WF0A 1UQYA 3WNNA 2JEQA 3GXFA 4AZ5A 5BROA 1OT1A 4F9DA 1HKMA 3VDCA 1CGTA 3L4UA 4V28A 1NWUA 1B0IA 3G6LA 3RO8A 1W9XA 1QHPA 4F79A 2D0GA 1QNOA 3CUFA 1FH8A 1QI4A 3AIRA 5AYBA 2E9LA 2XHYA 5A6KA 1GVIA 3VX1A 2VR5A 3AHZA 5A8NA 3OGSA 4BS0A 1BG9A 2VX6A 1B3WA 1GOWA 3VKKA 3N13A 4URIA 4M81A 4A3HA 4C7FA 1CLVA 4Z2IA 2V3EA 2V3FA 1GOKA 3W37A 1NWTA 4MNLA 4B9ZA 3LPOA 3F5JA 1E6ZA 3GXIA 2CXGA 4NRRA 3UESA 2XFRA 4CU7A 2DDXA 2PB1A 2CKRA 3ARUA 2CETA 3RPMA 1ZBCA 4U2YA 3AIEA 1W1YA 4EE9A 2D23A 1C93A 3L4YA 3NSXA 4FF5A 4AY1A 3WQ5A 3QOMA 4X0VA 3SUSA 5DEZA 3MANA 3N15A 4LXFA 1E6QM 1U30A 3D3AA 1RP8A 3FHQA 2UY4A 5BXRA 2E4TA 1VFOA 2PWDA 2J62A 3VGGA 3FN9A 2J7HA 5C70A 2FH6A 5CPSA 5I5RA 2JEPA 3QR3A 2WC4A 4WKHA 3QOKA 3CHCA 2EPKX 4PSPA 5I78A 1H3GA 3IJ9A 1C90A 1GNXA 3KWXA 1OCQA 1MWOA 4FLRA 1KR0A 3L2LA 3DYOA 3ARRA 3PZVA 3PZOA 3PZIA 1VJZA 4J3WA 4JHOA 3BC9A 5A6SA 1MXDA 4ZE5A 3M7SA 4AYSA 3W6LA 1LF1A 3SURA 1KGXA 1S46A 4M56A 1HKIA 4UQDA 1DWJM 2BHYA 3PBGA 5HOSA 2VR4A 5E6ZA 3WBEA 2XFYA 1V3HA 4D6EA 1B3XA 1SFSA 1VJSA 1GJUA 4CCEA 3AS0A 3DECA 2VCAA 3WQ4A 3WNKA 1Z32X 3WFLA 3B9DA 1WO2A 2G3IA 5GPRA 2W63A 4J3TA 2D3LA 3OA5A 4D6DA 1E3ZA 5IFPA 2WYSA 5CLTA 4Z2KA 1FFQA 1J0KA 1HVXA 4W85A 1K9DA 1AQ0A 4JFTA 2CKSA 3SCUA 4GKLA 5JIPA 3CTTA 3VGHA 3SCWA 1QVBA 3ZJKA 4HOZA 2A3AA 2WW5A 2GJRA 4XB3A 4JL1A 3CLWA 1JL8A 5M17A 1OD0A 2QPSA 4MNJA 2WMKA 3O6AA 3BAWA 4AW7A 1XYFA 4M1RA 2OWXA 4KGJA 3L4XA 3EYPA 2WCGA 1DWAM 3A4AA 1JZ2A 5DFAA 1XV8A 3F5KA 1W32A 1VEOA 3TTYA 3W25A 5KZ6A 2D3NA 4W93A 5E0FA 1TE1A 2WMIA 3NJ3A 4MJ2A 1UD3A 3VIFA 4JFUA 2J75A 3AS2A 1UUQA 1PX8A 2AAAA 1UD2A 3N04A 4W8LA 5DT5A 1E9LA 2DPEA 3AIUA 3VD3A 2JF7A 3APGA 2X05A 1RPKA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 1UWS A;  3SCO A;  4BQ5 A;  4W5Z A;  3SCP A;  2WBG A;  3GNR A;  1KCL A;  3L4V A;  5JIW A;  1XSI A;  5CQ1 A;  3DYP A;  4UQE A;  1JNE A;  2YL9 A;  3ZT6 A;  1JIB A;  2XYL A;  1Q6E A;  3J7H A;  1W1T A;  1UA3 A;  3FND A;  2XM1 A;  4KMQ A;  4MB5 A;  1HL8 A;  3RM8 A;  3VGE A;  1FP9 A;  2X1I A;  1D3C A;  1KQZ A;  4J3S A;  1XH1 A;  3VGD A;  1KBK A;  5CSU A;  2F8Q A;  3GDB A;  3SUT A;  4D6C A;  5DT7 A;  1EOK A;  1J0I A;  1QHZ A;  3FAW A;  4X9Y A;  5E0C A;  1EOM A;  1D2K A;  6A3H A;  1BAG A;  2QPU A;  5LYR A;  4JIE A;  1NP2 A;  4J7R A;  2C7F A;  1E71 M;  2G3M A;  3VDA A;  2O9O A;  1TG7 A;  4R27 A;  2XPK A;  4N0R A;  3PZM A;  4UNI A;  4ACY A;  3MO4 A;  2FGZ A;  1VAH A;  1JXK A;  4OOU A;  1B90 A;  1WZM A;  1CGX A;  3AJ7 A;  4LYQ A;  1W9D M;  1EDQ A;  4HU0 A;  1TFV A;  3MV1 1;  4UFH A;  3SCR A;  4L4P A;  3SCV A;  2O9T A;  2AMG A;  1F4H A;  4E8D A;  4AZH A;  1ODZ A;  5A2B A;  4DM1 A;  1V0N A;  3AIS A;  1E0W A;  1E5N A;  1FP8 A;  1V3I A;  2WSK A;  4EAM A;  2UY2 A;  1UA7 A;  4BQ4 A;  4W86 A;  2RGL A;  3VMN A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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