2J9XA

Tryptophan synthase in complex with gp, alpha-d,l-glycerol-phosphate, cs, ph6.5 - alpha aminoacrylate form - (gp)e(a-a)
Total Genus 102
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
102
sequence length
266
structure length
263
Chain Sequence
ERYENLFAQLNDRREGAFVPFVTLGDPGIEQSLKIIDTLIDAGADALELGVPFSDPLADGPTIQNANLRAFAAGVTPAQCFEMLALIREKHPTIPIGLLMYANLVFNNGIDAFYARCEQVGVDSVLVADVPVEESAPFRQAALRHNIAPIFICPPNADDDLLRQVASYGRGYTYLLSRSGVTGAENRGLHHLIEKLKEYHAAPALQGFGISSPEQVSAAVRAGAAGAISGSAIVKIIEKNLASPKQMLAELRSFVSAMKAASR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Lyase
molecule keywords TRYPTOPHAN SYNTHASE ALPHA CHAIN
publication title Allosteric Regulation of Substrate Channeling in Tryptophan Synthase: Modulation of the L-Serine Reaction in Stage I of the Beta-Reaction by Alpha-Site Ligands.
pubmed doi rcsb
source organism Salmonella typhimurium
total genus 102
structure length 263
sequence length 266
ec nomenclature ec 4.2.1.20: Tryptophan synthase.
pdb deposition date 2006-11-16

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00290 Trp_syntA Tryptophan synthase alpha chain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 2j9xA00
3LHYA 3W70A 1TPC1 2ISWA 2C0AA 4LW7A 1WOBA 1PHQA 2VEIA 3S1UA 3OA3A 2CLIA 2OZ0A 3DH7A 1S5WA 3W73A 2YZRA 1SW3A 3W7OA 4C1KA 4RJEA 2C19A 1OHLA 4A22A 1BKSA 2DZUA 4FB7A 1XDLA 1QPNA 1TSIA 3VNDA 5G2IA 1NEYA 4ADUA 3B04A 4UFLA 3P62A 4QAIA 3S6DA 3MUXA 4ZQCA 3R13A 1LBMA 1G4EA 2I1OA 3WFAA 4N6FA 4K8EA 3W1QA 1VC4A 3WJXA 3HG2A 1LOQA 3NPVA 2E09A 4WY0A 1JUKA 3KHJA 3FLUA 3EX3A 2X1SA 1JCLA 3NDOA 3MI2A 3FIGA 5DCBA 3MP3A 3PWAA 4K37A 2OT1A 1Z42A 2NLIA 3CEPA 1SPQA 3JS3A 3T4CA 1R46A 4OE7A 3UWQA 2OMAA 2XN1A 4WY0B 2YFOA 2WSYA 3VCRA 1I2NA 4O1BA 1MXSA 5CPMA 2CLFA 1F2JA 5EA9A 2OCZA 3A23A 3M1ZA 3HMJG 2Y88A 3OVPA 1PCKA 4UTHA 5GVJA 1R2SA 1IXQA 2JKEA 3B8DA 1F5ZA 3BW4A 1F6PA 4O1AA 5HWNA 3W7MA 4JYDA 3M47A 4KWVA 1S3HA 3KX6A 4BF9A 3LCLA 1UB3A 3TW6A 4LY8A 2Z1BA 1Q6QA 5AYXA 1HUVA 3PBWA 1H62A 1A5BA 2WNZA 3A5FA 4N9EA 4I7VA 3EXRA 1MEWA 2XFWA 5LGZA 1I2OA 4LV9A 3C2RA 1RQEA 1WOAA 3W3OA 3UXAA 2VEMA 4X9SA 2R94A 2A1YA 1FY6A 4ORMA 3MHUA 4FHAA 4IXXA 1ZNNA 3CLMA 4OV9A 2FB2A 5LSMA 3MP5A 2GQ9A 1I2RA 3E49A 3EWBX 4ICNA 4UFJA 4QIUA 4M5PA 1K02A 3ZWTA 1Q45A 1GVQA 3GZ3A 2Z6JA 3LTYA 4DBDA 2DZSA 1B4EA 3DKJA 1N55A 1VQTA 1G7UA 4YMZA 3SI9A 1KBIA 2G5WA 2VFIA 3PF3A 3G1VA 4ADTA 3LXBA 4JGDA 3BK0A 3EB2A 4FNSA 3IGUA 4UTWC 1NVMA 1TRDA 1KM5A 2VFHA 3LHZA 4GJ1A 4L4LA 1H7WA 1KFKA 1ZFJA 2ZZ3A 3BW3A 1YLVA 4N9BA 3HG4A 4X3ZA 3INPA 4PFMA 2ZRYA 3ZWSA 4PC8A 1TYGA 3W22A 3UWWA 2WO5A 1DV7A 3CWOX 4S1FA 1W1ZA 3DFNA 1C9DA 5G1YA 3P8IA 3H55A 3W7PA 1GEQA 1LRNA 4LU0A 1BEUA 1AW2A 8TIMA 1KFEA 2Y7FA 5DY3A 4DQWA 2C14A 2BSLA 4JYFA 1TPEA 4NXSA 2YYUA 1X7FA 1I8JA 3L66A 4GFSA 5FEXA 3LCFA 3EWZA 4CNPA 1I4NA 1LROA 3IEBA 3STCA 3ATYA 3L0NA 3W7QA 1VCGA 3S5OA 1EP2A 4ZQNA 4TU1A 3LGEA 4NVTA 1K3UA 1RZMA 2JBMA 4CNNA 3GDKA 1VRDA 3O05A 1JCNA 3GAYA 2ZZ5A 4O1CA 1IXPA 5BMXA 3UZ5A 1NSJA 3TR2A 3PG8A 1M7PA 5AHEA 1O95A 2ISSA 4EIVA 3TW7A 3FFSA 2C6QA 5TQLA 1WBHA 2RDWA 3E96A 1CW2A 4BI5A 1VZWA 4MUZA 1PIIA 4XKYB 3CWNA 1PL9A 3W84A 1DQWA 1XC4A 3O06A 5D2XA 4GNJA 3CIWA 1NF0A 2J9XA 2E1DA 1RR2A 5CZJA 3HIJA 1GWJA 4P2VA 1T99A 1EEPA 3BLFA 3GB6A 4NJGA 2W6RA 1OX4A 3TSDA 2RHGA 1C8VA 3D0CA 4UTLA 5AB3A 1TQXA 4O15A 3CEUA 3NL6A 3UZJA 1P0KA 2ZZ1A 2ZZ6A 1OX4B 4HN4A 4MOZA 3O8AA 1XI3A 1TRIA 3L21A 4WJEA 3IIZA 4JDBA 1N8FA 3F4NA 4IGHA 4S2BA 4FIQA 2QCDA 3LCGA 3G1YA 3PUEA 1FX6A 1W3NA 3UPWA 4AEOA 3DXIA 4MZ8A 1VHNA 4HSNA 3L5MA 1OYAA 3CT7A 1S5VA 1OG0A 4OT7A 1XBXA 5AOUA 4MZ1A 1KFCA 2ATSA 1O94A 5DXYA 1FXPA 1XBZA 2YYTA 2ZFAA 3PULA 1I45A 2TPSA 1LLWA 2A7NA 3NO5A 2CLHA 3PG9A 3WJZA 3WK3A 5C55A 4RZ4A 5LZLA 4HNTA 2FB3A 4JD4A 5D30A 3UY8A 2J24A 3CM4A 3S5NA 3TH6A 2VOMA 3LHTA 1K03A 3A9IA 3GNDA 4LVAA 2EKCA 3LX9A 3C52A 3BG3A 1WXJA 4K6AA 4UMAA 2A5HA 3PBUA 1TTPA 3OVRA 2Y62A 3WJYA 3TX9A 4M19A 2YDAA 5AHLA 3N2MA 3QSTA 2GJNA 4UFKA 1DJQA 3IIXA 5D2YA 2C3ZA 3FYOA 3M6YA 3W1NA 3SGZA 1G67A 5EYWA 3GXTA 4JXCA 3P5ZA 1OK4A 1WQ5A 3GR8A 4MLRA 5DCDA 3W85A 2QDHA 2NX9A 4R34A 4UFMA 1LRTA 1WAUA 3T40A 4O12A 1KM3A 4IPJA 4Q4KA 2OT0A 4NJIA 3KRZA 4O0ZA 5CZ0A 2PURA 4MKNA 4NJKA 2A85A 3IIVA 1LBFA 5CZTA 1Z48A 5FF7A 3U6WA 4IMDA 3SW6A 2FDSA 3NQ7A 3V75A 2FIQA 2YPIA 4CQ8A 4FNUA 4NJHA 3UYCA 3WK2A 3CC1A 2Q8LA 5CPNA 3QMTA 1QWGA 5K3VA 4ZL1A 5C6MA 3M44A 3GXPA 1ICQA 1XL9A 3QJAA 3NQ8A 2C13A 4A3UA 3H54A 4NUWA 3MHFA 3TE9A 2DZXA 1KM2A 4EWND 3DFOA 2RFGA 3RU6A 1UASA 3C4UA 3EX6A 4Z08A 2FLIA 3IIOA 3W2MA 3C61A 1EUNA 1F76A 3HPSA 2Z6IA 3PAJA 1NFBA 2RDTA 4Q32A 4WXZA 5CPLA 2CW6A 2NUXA 1B57A 5K7JA 2R91A 1YTKA 1KFLA 3QFEA 4YCOA 4EVZA 1QOPA 3B0PA 3HJZA 2CLOA 1VCVA 1H7XA 5IM51 3GX9A 4DO5A 3NPWA 2GVJA 4NNAA 1XUZA 2I9EA 1FCBA 2QAFA 5D03A 1FQ0A 4AHOA 1LBLA 3C6CA 4O19A 1THFD 4GUJA 4RXGA 4MIMA 1A5CA 1W0MA 1WBJA 4HIBA 3RMJA 1GOXA 2PRMA 1P0NA 1GYLA 5DELA 2EF9A 2QJIA 4E2BA 1YPIA 4IJBA 3PC0A 1FXQA 1ME8A 1ICPA 3W1AA 4OHQA 1PCWA 1T8XA 2J6XA 4OV4A 3ELFA 3L9CA 4H3DA 4ZQMA 2QUVA 1GVOA 2VEKA 4UIOA 3W1XA 2YGYA 4QQ3A 3WJSA 4KFNA 4ZMGA 2B0MA 6TIMA 4KFOA 3M16A 5CGQA 5K9CA 4DBEA 3HQ1A 3W7JA 3M41A 2A2IA 3W7EA 3THAA 4BI7A 4FIRA 2W79A 1OFPA 2QCLA 3B03A 1L9WA 3QZEA 5DLCA 4JTLA 4AF0A 4TMCA 3WK0A 4DF1A 2EPHA 1LP6A 4HT3A 1TJPA 1VYSX 4ZQPA 2C15A 3IRDA 2CLMA 3P81A 3DFTA 1KLZA 1QPQA 4UR7A 2O7SA 1I2PA 1Q6RA 3TDFA 4FO4A 3QC3A 4NZJA 3CPRA 3LXAA 1XUUA 3TXVA 3S42A 3W1PA 2QEZA 1P4CA 2BXVA 3NNTA 1J2WA 1ALDA 1QMLA 4O54A 3TC6A 3M5VA 4IQLA 5G2WA 4CCEA 3L5LA 1ZALA 5F2LA 3E9AA 3HBLA 3TAKA 1ADOA 1TO3A 4ORIA 2Z0IA 4TMBA 4JIQA 1SUXA 3UWVA 1D3GA 1GG1A 2CLEA 2E6FA 4YWIA 5LNWA 1OYCA 4Z1AA 3HO8A 4Y8FA 4DPQA 1TTIA 3KVJA 4O53A 1XBYA 1OFOA 1ZAJA 4O10A 4AMAA 2DZPA 3G1DA 2Y7EA 5CSSA 1KTBA 1D9EA 4AWSA 3ABQA 3W1MA 5EY5A 2Q8ZA 3TJXA 2ZRXA 5SWUA 1JJKA 1H60A 5G4WA 3O16A 1EA0A 1P5BA 1DL3A 3DHDA 1TB3A 5HINA 3UXDA 5D2TA 3WK1A 4LRSA 1KTNA 5HMSA 2FPVA 2PRLA 2IQTA 1K7EA 5LNVA 1KV5A 3F4WA 3G1XA 2VFEA 2X1TA 2J88A 3NQAA 4O4WA 1OK6A 2WNNA 4Z1BA 5LGXA 2DP3A 3NM1A 1W54A 5HWJA 4MYXA 1TPUA 5C2XA 4O1DA 1KV8A 3CB8A 4WY0F 3GXNA 3AJXA 1Y0EA 1VYRA 4POCA 4AWUA 2PCQA 1H7OA 4MY1A 3HPXA 4ML9A 5DCEA 4PL1A 3NL5A 1W37A 4N2YA 4RZ5A 4MY8A 1H1ZA 2V82A 1XDMA 5HR6A 1YTEA 2VXNA 4IPIA 5FEWA 2FFCA 1UBSA 3MYOA 2PE4A 3G1SA 3GLCA 3I7SA 4LS1A 5MHBA 2B7PA 3PS7A 1OFAA 3MMTA 2FQIA 4WUIA 1FWTA 3NQCA 3MO7A 1K8YA 2DZTA 4WOZA 2YSWA 3EEGA 3S5ZA 2ZZ7A 3NGJA 3G3DA 4UXDA 2DJXA 3EXTA 5KTLA 1LORA 1OABA 1LCOA 4XZ9A 3F03K 4NJJA 3THQA 2VEPA 3LRMA 5K9XA 3QPZA 4UNKA 3VI2A 3QH2A 2WKJA 5BRBA 1EP3A 4LUJA 1L6SA 4FX8A 4OU1A 4Y6GA 5CG7A 4JY9A 3TC7A 4K7VA 3G22A 3P5YA 3G1FA 4LS2A 2CWNA 5H91A 1YPFA 2TRSA 3NQEA 4LT9A 2P1FA 4JN6A 3E12A 4WQ6A 2D73A 4UTTA 3MJYA 4WXYA 5AYYA 3O15A 4RLIA 5D04C 4FNQA 4PA8A 3NQ2A 3KOFA 4XQ6A 4JTKA 4A21A 3OHIA 4AH7A 5LHFA 1QDSA 2V5LA 5ABTA 3DI0A 3GKAA 1F05A 2B4GA 2QUTA 3W7NA 4ZVJA 1FDYA 3DI1A 1P1XA 4O50A 4Z0JA 2TSYA 2QKFA 3DFSA 2E6DA 5AYZA 3BPWA 4XBKA 2YXGA 4CNOA 1T96A 4LVBA 1W31A 4Z0SA 5U4NA 5LNUA 2ABAA 4O8RA 3MYPA 1WV2A 4WOQA 3LRLA 4JTIA 4JTHA 3BLEA 1QCWA 2WPBA 3B06A 4XUGA 1YXCA 1QPRA 4LUIA 5IBXA 3N3MA 3I6RA 1BWLA 3HGSA 1WX0A 3LRKA 5HJLA 5FEZA 4YL2A 5L9FA 4GUIA 3DENA 4IMCA 1Q6LA 3ZS4A 4EF9A 5DN1A 1CI1A 5F2GA 3MP4A 5EL1A 1EIXA 1XM3A 3LTSA 1LM1A 5C54A 3N73A 1LTDA 3ABOA 2PC4A 3NQGA 3QM3A 1VLWA 3MWAA 4LC8A 1SO3A 2NXIA 2BLEA 3EX1A 1O60A 4GRSA 4BI6A 1AW5A 1YXDA 4E0CA 3C2VA 4K38A 4MJMA 2BWGA 1VHCA 3LLFA 3W7RA 4UTMA 3NQ6A 3OIXA 2V8ZA 3FOKA 3USBA 4QNWA 1HG3A 3CTLA 3FA5A 2Y7GA 3O6YX 3TQVA 2HMCA 4NU7A 1TIMA 1HL2A 2HTMA 4RX0A 1M7OA 2VKZG 3P82A 4A2RA 3G0UA 3O6DA 1MEIA 3G18A 4LVDA 1LOSA 3CQ0A 3PBYA 2B7NA 1YADA 3DAQA 1LDCA 1DORA 4UFHA 3TIMA 3NYZA 1G6CA 1GVSA 2VFDA 2ZTKA 3B4UA 4ZQRA 3EX2A 5D32A 2V2HA 2A4AA 2ZA3A 2Y61A 4ADSA 2ZBTA 3NQVA 2YX0A 3T78A 1L2UA 4NX5A 1WA3A 2RDUA 3T7VA 2Q3RA 1UUOA 1TV7A 4QM1A 3W1UA 5F2IA 1OFBA 1OF6A 1TMHA 3G24A 3QF0A 3M0ZA 5EKYA 3W71A 2Y7DA 2WJZA 1OFQA 4UC5A 3W1RA 4Y9AA 3O07A 3QRHA 3AO0A 3SR7A 2EAWA 2QJHA 4GXMA 3W7KA 3MI3A 2NX3A 3QEZA 2GQAA 3IVTA 1H61A 2QCDB 4HNNA 3LBCA 4LC6A 1ZAHA 5J5DA 4S2CA 1DVJA 4DF0A 3SZ8A 4JTTA 4M6QA 2ZQ0A 3A24A 1DJNA 1H7NA 3EXSA 1KM4A 4M7TA 1J4EA 1W5OA 1VH7A 1SQ7A 2H3DA 1G4SA 1PVNA 2E6YA 1Z41A 4UMCA 3I7RA 3ZR4A 4DPPA 1Z44A 2XN0A 3PY2A 1C29A 5HUOA 4CLMA 1QR7A 4AXKA 1AG1O 3M9YA 3T44A 3OG3A 2LLEA 3O6CA 3TU9A 5G4EA 3NVTA 3OBKA 1E51A 4FXRA 3TV8A 2HS8A 1GG0A 2FPTA 4WZHA 2GPTA 3TXZA 1M5WA 5H2ZA 2AAMA 5AFDA 3M5ZA 3I7QA 2KZHA 5FF3A 4Z1CA 2WV8A 4JICA 4PCFA 4FF7A 3DBPA 3M7WA 3EX4A 2E5DA 2YW4A 3SIZA 1FCQA 5AHMA 1K8ZA 1OFDA 2QAPA 1Q3NA 2NUWA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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