2JBM | Genus

Total Genus 93

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	93
sequence length	289
structure length	289
Chain Sequence	MDAEGLALLLPPVTLAALVDSWLREDCPGLNYAALVSGAGPSQAALWAKSPGVLAGQPFFDAIFTQLNCQVSWFLPEGSKLVPVARVAEVRGPAHCLLLGERVALNTLARCSGIASAAAAAVEAARGAGWTGHVAGTRKTTPGFRLVEKYGLLVGGAASHRYDLGGLVMVKDNHVVAAGGVEKAVRAARQAADFALKVEVECSSLQEAVQAAEAGADLVLLDNFKPEELHPTATVLKAQFPSVAVEASGGITLDNLPQFCGPHIDVISMGMLTQAAPALDFSLKLFAKE

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

molecule tags	Transferase
molecule keywords	NICOTINATE-NUCLEOTIDE PYROPHOSPHORYLASE
publication title	Structural and Kinetic Characterization of Quinolinate Phosphoribosyltransferase (Hqprtase) from Homo Sapiens. pubmed doi rcsb
source organism	Homo sapiens
total genus	93
structure length	289
sequence length	289
chains with identical sequence	B, C, D, E, F, G, H, I, J, K, L
ec nomenclature	ec 2.4.2.19: Nicotinate-nucleotide diphosphorylase (carboxylating).
pdb deposition date	2006-12-08

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF01729	QRPTase_C	Quinolinate phosphoribosyl transferase, C-terminal domain
A	PF02749	QRPTase_N	Quinolinate phosphoribosyl transferase, N-terminal domain

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.20.20.70	Alpha Beta	Alpha-Beta Barrel	TIM Barrel	Aldolase class I	2jbmA02
3.90.1170.20	Alpha Beta	Alpha-Beta Complex	Aldehyde Oxidoreductase; domain 3	Quinolinate phosphoribosyl transferase, N-terminal domain	2jbmA01

1FWSA 3KRUA 5CGQA 3LM7A 3KVJA 2A21A 5I3FA 2W79A 1M7PA 4QNEA 3LHYA 2VXNA 1LM1A 2E77A 5BW6A 4AMAA 4JY8A 3FIGA 1XCFA 5I3KA 4KWVA 2ZBTA 5DLCA 4LUIA 4O13A 5D2WA 5HULA 4A22A 3ATYA 3QW3A 1QAPA 5HNRA 4AF0B 5KZMA 4MZ1A 1XBYA 3EWXA 4PL1A 3L66A 3W1MA 3G0XA 3W22A 5AB3A 4JTSA 3UWZA 3GDRA 4A29A 4E2BA 3TFCA 3DGRA 2NX1A 4HSNA 1FXPA 2BZNA 2EHHA 3SFKA 3M43A 2EPHA 1WBHA 1W8SA 3O07A 4MY1A 2FJKA 4NT0A 4KFPA 3GDLA 3LTPA 4TIMA 1BWKA 1W54A 1RQEA 4BR1A 3CT7A 4JTUA 3FJLA 1OK4A 4JEQA 1IIHA 2C15A 1W1ZA 3ELFA 4JD4A 2JGQA 3C2EA 4LRSA 4UCGA 5K9CA 3QEZA 2ZTKA 3WJXA 1UUOA 1H61A 3TE9A 4PCFA 3TC7A 1DQWA 5CPLA 5K3VA 1I4NA 1OFAA 3OA3A 1IXNA 4M7TA 3THAA 2J88A 2DZWA 2E68A 5EY5A 2OX1A 4KKXA 3C61A 5KSWA 3PB0A 5AYZA 1I45A 4YLWA 2QUUA 2GJLA 1SU5A 3G1HA 4UR8A 4ZL1A 3P8JA 3LLFA 3CB8A 3M6YA 1SQ7A 1MZHA 3G1DA 1SPQA 3Q37A 2DZXA 2V5LA 4O4VA 1TJPA 4R7JA 3TSBA 1XBXA 3E02A 2A7RA 4O1AA 1C29A 3OVPA 4CNPA 2QEZA 5AHMA 4PL2A 4N02A 1AL8A 5D2TA 3LCXA 3CEPA 3NZRA 2P10A 4P61A 2Y7EA 1IGSA 3EXRA 1OYCA 4G1KA 3D0CA 3OBKA 3VKJA 3GKFA 2E6FA 3LI0A 4CCEA 3W88A 5F4SA 4RLIA 4M19A 3BLFA 3SI9A 3S42A 1H7NA 3IVUA 4AB4A 1Y0EA 4C1KA 3HB9A 2CLOA 2GQAA 2BLEA 1TQJA 5D02A 1EWEA 3A24A 4RZ6A 4UFIA 4MZYA 3KRZA 4UNLA 2ZTJA 1SZNA 4BF9A 2VEKA 3B0UX 3ABOA 4ZQCA 2NV2A 3L65A 2JKAA 1AMKA 3GXNA 2C6QA 3MI6A 3PSVA 1AG1O 2NUYA 4UFJA 3DFNA 3A21A 4QNWA 5D05A 2ZFAA 2WNNA 3W1NA 2VC6A 1FDZA 3PC0A 2PC4A 4LV9A 2WJZA 3NQEA 1LRNA 3IIVA 2Y7GA 1H7OA 2NLIA 1FWNA 4FXSA 1KBIA 1W37A 3L0GA 3W7IA 3NYZA 4MYAA 1OFDA 2ZDRA 2E5BA 1B9BA 3UWWA 1O60A 2C16A 1KA9F 2VFFA 3W74A 2Y7DA 4X22A 1RR2A 2FPVA 4OE7A 5EBUA 4OBTA 4ZQPA 2QCFA 2GVJA 1TREA 4LVGA 3GB6A 2VFIA 1JUKA 4QISA 4M5PA 1XKYA 3GX9A 5AFDA 1GTHA 1VHNA 2DP3A 2XN2A 3PG9A 6ALDA 3S5YA 3PWAA 3UZ5A 3DFTA 3FEMA 4HIBA 3VNDA 2VFHA 2YZRA 3FYPA 5D2VA 5HMSA 2DU2A 4S2CA 2Q8ZA 3T44A 2YW4A 1A5CA 2H3DA 3LV5A 3U2OA 1ALDA 4ICNA 4IOTA 3QYQA 1Q6RA 2GVLA 2HMCA 4UMCA 4JTJA 4N4QA 4DQWA 2X1TA 1SO3A 3EX4A 3N73A 3CPRA 2QCDB 2J24A 5AOUA 3NM1A 4DF1A 3PULA 4ORIA 3SGUA 3ATZA 3R5EA 3YPIA 4N4PA 2JGYA 1JR1A 1QDSA 4WX2A 4ZVJA 3S6DA 3S5OA 1XDMA 3HG5A 3W84A 1BKSA 1JRBA 4K36A 3S1WA 2G97A 2AAMA 3TR2A 1FXQA 2ZRWA 5F2LA 5LHEA 1NF0A 4NXSA 4EF8A 3G1XA 2ZZ4A 2QUTA 1KLZA 3WJWA 3WK1A 4ZMGA 2Y89A 3HJZA 1D3GA 3IV3A 1K02A 4WJEA 5G1TA 3ZR4A 1WQ5A 2NWSA 2FIQA 2YGYA 2YFOA 4PEKA 1P4CA 4OGZA 3UWUA 2HSAA 2QCGA 1YTKA 1FY6A 4WQ6A 1OFBA 3O15A 1LBLA 2GUUA 2QDHA 2WKJA 4CQ9A 5LNSA 5F2IA 4WXYA 1FQ0A 4HN4A 2A7PA 3PBWA 3VE9A 3FKRA 1XBVA 2ZYFA 5CZTA 3TFXA 4UTKA 1AW2A 3W86A 2W0UA 3NL2A 1V5XA 2OMAA 3EX2A 3A5FA 1TTPA 1LBFA 3W1TA 1KV5A 1JVNA 4Y96A 3IGUA 8TIMA 3GK0A 3DU0A 4HNTA 1U83A 2DJXA 3G0SA 3L5LA 1S5TA 1AW1A 2E6DA 4LU0A 4O0ZA 5CKSA 3LCGA 3O1NA 5SWUA 1RQHA 3T40A 5CZSA 3QH2A 4XUGA 4XWUA 3UWYA 1XUUA 4OWGA 3G3MA 2QAFA 1X6UA 4IXXA 3HG4A 2B7QA 1DVJA 3GIYA 3PUOA 5BNKA 3GDTA 2ALDA 3M7WA 1KTNA 3W7PA 3P61A 3S5ZA 1ZAIA 4TMCA 3TC6A 2NV1A 1OFEA 1A5AA 2WSRA 5F4WA 2V30A 2CZ5A 4UTLA 3TIMA 3GNNA 4FX6M 3HMJG 1XXXA 3QPYA 1KM3A 3W7DA 1M5WA 1SW3A 5G2WA 3KOFA 4O17A 5C55A 1KBJA 1MEWA 4O53A 2A6NA 1KM0A 5DXYA 1JCMP 4MY9A 3FOKA 2Y61A 5G4WA 4LWWA 3UWVA 1TPC1 1FX6A 1TPH1 2NUWA 3BG9A 3UYCA 3W2NA 5L9FA 3MHGA 3INPA 1F05A 3GAYA 3AJXA 2D73A 1O4UA 3GNDA 1YXYA 2YFNA 2CLMA 1SZFA 1LCOA 4JNMA 4AHOA 4GC4A 4IWWA 1TPEA 4AWSA 3FJ6A 4FXRA 5AYXA 1EUAA 5CG7A 4LY8A 3ZWSA 4UMBA 3NQDA 1PV8A 1THFD 3UXDA 4FNQA 3S8HA 4UFHA 3W7QA 3DI1A 2OT1A 1GWJA 2ZA2A 2Q3RA 1W5NA 2R94A 2X1UA 2V81A 2F84A 3W2LA 4TO8A 3S5NA 5EPDA 3LHWA 2NZLA 4XTIA 1UB3A 3Q94A 1T0OA 3HO8A 3P80A 3O8AA 5K9DA 1ZHAA 5CZJA 1HTIA 4K7YA 3W83A 5LNUA 1LROA 1O94A 3OEXA 5D09A 3NA8A 1EEPA 4ZQOA 2E6YA 5BRBA 3NPVA 1LP6A 1LTDA 1O95A 3RF9A 3BW3A 4QIUA 2PCQA 3WK2A 3WJSA 3W07A 3W7OA 3G1VA 3SSJA 4IX0A 2DZTA 1XFBA 3MI3A 3Q58A 1M7OA 2O7SA 1TB3A 2BSLA 3WFAA 1DL3A 3EEGA 4R34A 3KFTA 4Y9AA 5DN1A 4BI5A 1K8ZA 2A7NA 4MLRA 5I3JA 3T55A 2I1OA 4MLJA 2R91A 3AO0A 4JX5A 3GR8A 1VGAA 2NXHA 1TPWA 1DQXA 3P8IA 3N9SA 1YDOA 1TV7A 2KZHA 4Z08A 3STEA 1S5WA 4MOZA 1TRIA 1YXCA 2X1RA 4WD0A 3NL3A 2FQIA 3MW7A 4IGHA 3LGEA 5E0KA 3HBLA 2RKXA 4MZ8A 3TXZA 2V5BA 3HF3A 4NZJA 1R2RA 5DELA 3LRLA 1J2WA 3LHZA 1QCWA 2DZVA 1Q45A 3G0UA 4JTLA 3PVFA 4MPQA 3M47A 1WAUA 3BV4A 4M6VA 4JYEA 3W1PA 5BMWA 4CNNA 2ZZ5A 1W5QA 4HKPA 2A4AA 2H6RA 1ZCOA 1C8VA 1IXQA 5G5IA 2C18A 1OX4B 3G22A 4M6QA 3IVTA 3NQ6A 4UFLA 3PUDA 1I2QA 4RV8A 3LDVA 1KM6A 4RKAA 2RDTA 4YXGA 1KM1A 1OG0A 1TCDA 1AW5A 3HGSA 1B4KA 2G95A 4AEOA 2WPBA 2YW3A 5FF3A 3TROA 4CCDA 2RH9A 2QDGA 3FFSA 1NF7A 1KFJA 3LCHA 1YTEA 5A8GA 3IIXA 2PRHA 1TYGA 3W7EA 3NNTA 2A0NA 2RDUA 1OYAA 1JCLA 3BGGA 4WOQA 3MYOA 2CZDA 3W6YA 4O19A 5DCDA 1A5BA 5LNRA 3VE7A 4RK8A 4BWLA 3SW6A 5E93A 4LV4A 2C3ZA 4O28A 2A6LA 4IMGA 4YMZA 3GAKA 3NXFA 1LOLA 3O05A 2QKFA 3LX9A 1WXJA 3NM3A 1GEQA 3NQVA 3MO7A 2TRSA 3KX6A 3LHVA 1G67A 3LXCA 4Z0SA 1TO3A 5IBXC 1O5XA 3C2RA 1R46A 3W7LA 1G7VA 1SSDA 3NVTA 4MFEA 1M6JA 3NL5A 1UBSA 1OJXA 3ZFHA 2PRMA 3JS3A 3SZ8A 2ZRVA 2JKPA 4NVTA 1YXDA 3STCA 2Y88A 3NPXA 3SJ3A 3LXBA 4X3ZA 2X1SA 1VJIA 3QMSA 1A50A 1HFBA 4XKYA 4FNRA 4QAIA 4N9EA 4WZHA 2B0MA 5LSMA 5D38A 1H5YA 4CQAA 4Q33A 1F73A 2F7FA 4O1DA 5HWMA 2UV8G 4CNOA 3GXTA 1VLIA 4LOCA 1PL9A 2FPTA 4M6PA 4O8RA 3LTYA 4ZQMA 5LZLA 1KTBA 1ZALA 2V82A 3TKFA 4N6EA 3LOTA 3TCEA 3UXAA 2WSYA 5FEZA 1EPXA 3P5ZA 3GYEA 2WNQA 1H7PA 2PRLA 1W31A 3BLEA 4QQ3A 1KV8A 1PVNA 1SO5A 2FPYA 5HUOA 1HO4A 1FCBA 1XM3A 1F7BA 4FIQA 3BG3A 3E96A 3DFOA 4RX0A 3TSMA 3NO5A 3U6WA 1FCQA 4X9SA 4UIOA 3LERA 3N34A 1ICQA 2NWRA 3G24A 2Z1BA 3SIZA 3CIWA 1L6YA 2YYTA 1WA3A 5HUPA 1GJPA 3L2IA 3O63A 1XUZA 3MHFA 3TH6A 4NNAA 3M16A 2QCMA 3SR7A 4E38A 1GYNA 1MSSA 3W1XA 4OT7A 1JCJA 4JTIA 1C9DA 4PFMA 1JQXA 2ISVA 4UR7A 1PCKA 2TSYA 4JN6A 1TMHA 2ZRYA 2G96A 3C2VA 4XZ9A 4ADTA 3MP4A 3NG3A 3EKLA 4PODA 1J4EA 4JGDA 3STFA 3P60A 4UNKA 3SGZA 3IIOA 1D3HA 3W9ZA 1QPOA 2TYSA 3CU2A 5K9XA 1H50A 3NQMA 4UTTA 4AH7A 3WJZA 1VC4A 4O12A 1G4SA 3LB0A 2ZA3A 3G1SA 4NX5A 1YDNA 4NJGA 1EP2A 3GDMA 4GJ1A 4JTFA 2E1DA 1CW2A 2V2DA 3MUXA 1CX9A 4NNBA 2B7NA 3EKZA 1GYLA 2OT0A 4UTWC 4ALDA 2ZZ3A 3QM3A 3W2UA 4MFDA 2Y70A 4H4IA 2YSWA 3QC3A 3RNDA 4CQ8A 3IGXA 1KFLA 3IVSA 4NNCA 1BWLA 3LCFA 4IXHA 4WY0A 1AL7A 4L4LA 5DCBA 1H7WA 1GQNA 3G1YA 2CLLA 4RZ4A 2GQ9A 2GOUA 4OHQA 3DFSA 2QCCA 1LORA 1H1YA 1RQBA 1VCGA 1OFOA 3G1AA 1TPB1 2ABAA 4QM1A 1SW0A 1WOAA 2Y7FA 4LVFA 4Q32A 3JR2A 5C2XA 3W7NA 3C0JA 3DFPA 3HPZA 3N2MA 5FF4A 3MHUA 1FWTA 3NOEA 1R30A 2H8ZA 2NXIA 5CSRA 4JS3A 1YADA 2V9DA 2YX0A 3PBUA 4LNYA 5DY3A 1EUNA 3TQ0A 3HQ1A 4IX2A 2CLIA 4PA8A 1N55A 3WK3A 4O15A 1Z42A 4EF9A 1MXSA 4N9CA 5HWJA 1JCNA 1LDCA 3QMRA 4IMFA 1W0MA 1SZEA 1KFBA 1B57A 3DI0A 3UPWA 4MVAA 5K4XA 3BARA 1GVSA 4Z1BA 3DZ1A 4GUIA 3V1PA 1NSJA 2DORA 3N2XA 3LCWA 3BK0A 5I3GA 2C1HA 5D33A 2WV8A 4KFNA 1R2SA 4FF7A 2FFCA 2A5HA 1WYIA 1QPQA 3UY8A 2QF7A 1Q3NA 2GJNA 6TIMA 2J6XA 3G1FA 3QMTA 5ABTA 2I14A 3L21A 1VCFA 5H91A 2CFFA 4PTNA 4O52A 1Z44A 3I7QA 5F1UA 3TDFA 4O14A 2ZQ0A 4GUJA 2CZFA 2AQWA 1L9WA 4GBUA 3THQA 4RJEA 4OQVA 4CLMA 2XFWA 1RZMA 4U28A 3BG5A 4QSHA 5EL1A 5TBOA 3RLUA 4JXCA 4UMAA 4YWIA 2YYUA 5D2XA 3I7SA 5AC6A 3CHVA 1T8XA 1Z41A 3W7GA 1FWRA 3DENA 2VFGA 4JTTA 3MMTA 2DZPA 3TJXA 4S1FA 4E2DA 4UUIA 1VYSX 4LC6A 4K8EA 3NL6A 2X16A 4FHAA 1L2UA 1PE1A 4YCOA 4DELA 5TQLA 5HR6A 3GLCA 4EOUA 2NXGA 1NFBA 3KXQA 4O0KA 4TX9A 4ZZ9A 3W1UA 2JK2A 1WDWA 3R89A 4YL2A 3TMLA 3UNDA 4FNSA 3P74A 5KZEA 1LRQA 3LI1A 1OK6A 3VCRA 1FDJA 1KTCA 1W3IA 3I6RA 4XBKA 1KM4A 4XKYB 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chains in the Genus database with same CATH topology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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2JBMA

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Chain Sequence

Structure visualization

Chord Diagram

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pfam database annotations