The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
9
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sequence length |
61
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structure length |
61
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Chain Sequence |
GSLNMPAYVKFNYMAEREDELSLIKGTKVIVMEKCSDGWWRGSYNGQVGWFPSNYVTEEGD
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Signaling protein
|
| molecule keywords |
Cytoplasmic protein NCK1
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| publication title |
Specificity determinants of a novel Nck interaction with the juxtamembrane domain of the epidermal growth factor receptor.
pubmed doi rcsb |
| source organism |
Homo sapiens
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| total genus |
9
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| structure length |
61
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| sequence length |
61
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2007-06-29 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF14604 | SH3_9 | Variant SH3 domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2ESW A; 3H0I A; 3SEM A; 2A37 A; 2RF0 A; 2HDA A; 2DF6 A; 2DRK A; 3SHW A; 1WIE A; 5L23 A; 1VYV A; 1GFC A; 3NGP A; 5IHK A; 2D8J A; 2FO0 A; 1YN8 A; 3PE0 A; 4JPB W; 1AWJ A; 3VS3 A; 3LH5 A; 3QWX X; 4J9F A; 2L3P A; 2SRC A; 1OPL A; 5FWB A; 1SHG A; 4LUD A; 1ABQ A; 4X1V A; 4J9C A; 3EHR A; 2O9S A; 1GRI A; 2I0N A; 2EW3 A; 3M0P A; 3M0R A; 3TSZ A; 1Z9Z A; 2CUD A; 2OAW A; 2X3W D; 4IIM A; 4GLM A; 3JV3 A; 3I35 A; 3KFV A; 1RUW A; 3TSW A; 2ABL A; 2CUB A; 1UFF A; 2LQW A; 2EYZ A; 1E6G A; 2VWF A; 2EBP A; 1K4U S; 1T0H A; 1GBQ A; 4F16 A; 3RNJ A; 1K9A A; 1OPK A; 3VRY A; 1TUC A; 2NWM A; 1NLO C; 2D0N A; 2GGR A; 3M0U A; 4AG2 C; 1JXM A; 2H8H A; 3VRZ A; 1UUE A; 4DEX A; 2JW4 A; 4IIO A; 2CSI A; 1WLP B; 2RQR A; 4LUE A; 2JMC A; 1GCQ A; 4RTT A; 4Z88 A; 1JO8 A; 2J6K A; 5GJV B; 4RTW A; 1U06 A; 1FYN A; 1UJY A; 4R0K A; 1HSQ A; 5FW9 A; 2DE0 X; 1ZUY A; 2A08 A; 2KNB B; 2YUN A; 2O88 A; 4HVV A; 3QWY A; 1KSW A; 2YUO A; 1YNZ A; 1AZE A; 1UG1 A; 2F2X A; 2KYB A; 4F17 A; 2K3B A; 2J7I A; 1ZBJ A; 3RBB B; 2AK5 A; 1X6G A; 2EYW A; 2OJ2 A; 2OI3 A; 2PNI A; 1UGV A; 1OOT A; 1A0N B; 2K7A A; 4J9E A; 4AFU C; 2D1X A; 2GNC A; 2CT3 A; 2NUZ A; 2W10 A; 2KEA A; 2F2W A; 1S1N A; 4CC3 A; 1ABO A; 2DVJ A; 4CC7 A; 2DJQ A; 1PHT A; 2RQW A; 3EHQ A; 3H0F A; 3TVT A; 2DBK A; 3IQL A; 1ZSG A; 2AZS A; 4AFQ C; 1YWP A; 1BBZ A; 2FEI A; 1KJW A; 1SEM A; 1ZX6 A; 2DLP A; 1M27 C; 4Y92 A; 4RTX A; 2CH4 W; 4E6R A; 1QLY A; 2A28 A; 1B3Q A; 1H8K A; 2RQT A; 2EYY A; 2EGE A; 4HXJ A; 3M0T A; 2L3Q A; 2DA9 A; 1SHF A; 2HEQ A; 1I07 A; 2X3X D; 3VS5 A; 4K11 A; 3NHN A; 3FJ5 A; 2DIL A; 1WXU A; 3UA7 A; 1Y57 A; 4HVU A; 1KIK A; 1AOJ A; 1AWX A; 2V1Q A; 4AFZ C; 4J9H A; 3ZL7 C; 1BK2 A; 2LJ0 A; 1ARK A; 1AZG B; 1M30 A; 1PNJ A; 2DL4 A; 3UA6 A; 1QKW A; 3UF4 A; 2SEM A; 5FWC A; 5I22 A; 1OV3 A; 5IHI A; 1W70 A; 2FG0 A; 1QCF A; 4CC4 B; 1YWO A; 3VS6 A; 2G6F X; 1OEB A; 2EKH A; 1V1C A; 2K2M A; 1T3L A; 1SPK A; 2HBW A; 2M0Y A; 4J9B A; 1W6X A; 2E5K A; 1NLP C; 1WXB A; 1J3T A; 4J9I A; 2CRE A; 1JXO A; 2LX7 A; 2W0Z A; 1FMK A; 1VYU A; 4OMP A; 1QWF A; 2DNU A; 2BZX A; 2DL5 A; 1E6H A; 2GTO A; 1GCQ C; 4JJC A; 1I1J A; 1M3B A; 1SSH A; 4LN2 A; 1ZUU A; 2AKK A; 2O9V A; 5HCK A; 2FPD A; 1NEG A; 1LCK A; 4RTU A; 1NYF A; 4OMQ A; 2B86 A; 4RTZ A; 2ROT A; 4A63 B; 2AKL A; 2O31 A; 1BU1 A; 4LNP A; 4D8K A; 2DM1 A; 2LNH B; 2BZ8 A; 5IHN A; 3VS2 A; 1M3A A; 2RPN A; 5I11 A; 1PWT A; 2DL3 A; 1JEG A; 1YP5 A; 2ED0 A; 2EPD A; 2JT4 A; 3M0S A; 2L0A A; 1MV0 B; 4RUG A; 2K9G A; 1RI9 A; 2CDT A; 2ROL A; 2L2P A; 1RLP C; 3GBQ A; 1HJD A; 2DMO A; 2LQN A; 2LMJ A; 2L3S A; 3C0C A; 4RTV A; 3EG1 A; 2GQI A; 1ZUK A; 2KRM A; 3O5Z A; 2YUQ A; 2BZY A; 4J9D A; 4HVW A; 1WI7 A; 2HSP A; 2YT6 A; 2RN8 A; 2CT4 A; 2ECZ A; 4KRT A; 2C0I A; 4JJB A; 1JU5 C; 2EGA A; 2KGT A; 3I5R A; 3VS0 A; 2KYM A; 2P4R A; 2C0T A; 5IH2 A; 2K79 A; 2KRN A; 2D8H A; 2DYB A; 2GTJ A; 4GBQ A; 1U5S A; 2LZ6 B; 1WA7 A; 1G83 A; 2EQI A; 1UEC A; 1PRL C; 2KE9 A; 3NMZ C; 3PVL A; 4OMM A; 1GFD A; 2FRY A; 1WX6 A; 1CKB A; 1K0X A; 1UDL A; 1H3H A; 2LJ3 A; 4FSS A; 1AD5 A; 4LE9 A; 1M8M A; 1MV3 A; 2RMO A; 3VS1 A; 3H0H A; 5IXF A; 1U3O A; 4RTY A; 4OML A; 3NPF A; 1RLQ C; 2EVR A; 3REB B; 2DBM A; 2FPE A; 1N5Z A; 4ESR A; 2JTE A; 4JJD A; 2MOX A; 4F14 A; 2CSQ A; 3REA B; 2YDL A; 1WXT A; 2KXC A; 3EGU A; 2VVK A; 1I0C A; 1UHC A; 2ENM A; 4Z8A A; 3VS7 A; 1Z9Q A; 3I9Q A; 2V1R A; 2EYX A; 4EIK A; 1XOV A; 3M0Q A; 1VA7 A; 2HCK A; 1PKS A; 2KT8 A; 2A36 A; 2RNA A; 1K0S A; 3EG0 A; 1G2B A; 1UHF A; 2JXB A; 2BTT A; 2LJ1 A; 2J05 A; 2JM9 A; 2KR3 A; 1AEY A; 2YUP A; 1X43 A; 2RQU A; 1GL5 A; 1HD3 A; 1GCP A; 4WCI A; 1TG0 A; 1PKT A; 1QKX A; 1NM7 A; 1AVZ C; 1BB9 A; 5GJW B; 5ECA A; 3ULR B; 1W1F A; 4J9G A; 2M51 A; 2JM8 A; 2PZ1 A; 1X27 A; 1TUD A; 1X69 A; 2VKN A; 1IO6 A; 3EG3 A; 1AWO A; 5IXB A; 1T3S A; 1QWE A; 2C0O A; 2GBQ A; 3A98 A; 1VYT A; 3U23 A; 1JQQ A; 4Z89 A; 1NG2 A; 4ORZ A; 1SRL A; 3VS4 A; 2DRM A; 2DL8 A; 1CKA A; 3CQT A; 1UE9 A; 1T0J A; 2FRW A; 1B07 A; 2KT1 A; 3I5S A; 2CH4 A; 2JS2 A; 2LCS A; 2O2O A; 2QDL A; 3H41 A; 2EGC A; 2DL7 A; 4QT7 A; 4ZNX A; 1X2K A; 2K6D A; 4OMO A; 3EG2 A; 1M3C A; 2KRS A; 4DEY A; 1UTI A; 4JZ3 A; 1ZLM A; 2F2V A; 2J6O A; 3THK A; 1PRM C; 2KRO A; 3R6N A; 2FPF A; 2AZV A; 2MCN A; 1CSK A; 1K1Z A; 2ED1 A; 4CC2 A; 1NYG A; 1WFW A; 1X2Q A; 4OMN A; 2PTK A; 5EC7 A; 2LP5 A; 2KBT A; 2DX1 A; 1AWW A; 1EFN A; 1NEB A; 2MIO A; 4D8D A; 2JMA A; 3PVQ A; 2KXD A; 2RQV A; 1WDX A; 1UJ0 A; 2JS0 A; 4HCK A; 1Y0M A; 4JZ4 A; 1KFZ A; 1X6B A; 4AFS C; 2XMF A; 2YSQ A; 1K76 A; 2J06 A; 1GBR A; 4M4Z A; 1H92 A; 1SRM A; 1WYX A; 1E7O A; 3UAT A; 2IIM A; 1YCS B; 2J6F A; 1MUZ A; 4AG1 C; #chains in the Genus database with same CATH topology 3CCV T; 4M7A C; 1XQH A; 2RD1 A; 1UB4 A; 3QZ5 B; 2A37 A; 1KQS P; 4PJO F; 2YLC A; 1VQO Q; 2DF6 A; 5A0G A; 2DKG A; 4R56 A; 4OB1 B; 5LJ5 h; 1GFC A; 1VQN Q; 5KCH A; 2D8J A; 2FO0 A; 5GAO m; 4C8Q E; 1AWJ A; 1X01 A; 3QWX X; 4A4F A; 2WSC E; 5KCO A; 4J9F A; 4PJO G; 2SRC A; 4EPC A; 3JB9 G; 3JRZ A; 2BE7 D; 2EJG A; 1R8O B; 2O9S A; 1VQ7 Q; 1RAC B; 3EGD A; 3FB9 A; 1WHL A; 3M0P A; 1YHQ Q; 2CUD A; 1YJW Q; 3JV3 A; 3I35 A; 1EZZ B; 1RUW A; 2CUB A; 1K4U S; 1T0H A; 3VU3 C; 4AMC A; 1GBQ A; 2DPP B; 3RNJ A; 1OPK A; 2XG8 D; 3Q1J A; 4M75 D; 2JTM A; 3MPU B; 3CC2 T; 2OTJ Q; 3CCQ T; 3MP1 A; 3OW2 S; 1KC8 C; 3M0U A; 2R58 A; 1UUE A; 1UGQ B; 2HQX A; 1Q81 U; 3QBY A; 1WLP B; 5CKF A; 1GCQ A; 3SD4 A; 2NLU A; 1JO8 A; 2J6K A; 2RJD A; 4RTW A; 3HRU A; 3JCM V; 2RI2 A; 2COZ A; 4PLI A; 1KD1 U; 5IN1 A; 4PNO A; 1QVF A; 1AZE A; 4BI3 A; 5DM7 R; 4F17 A; 2DEU A; 2EQK A; 2ZPI B; 4JLG A; 5CKD A; 1WNL A; 2J7I A; 3CME T; 3X25 B; 2AK5 A; 2MF2 A; 1NPR A; 1OI1 A; 2EYW A; 4XTY A; 4PKC C; 2FYK A; 2PNI A; 1OOT A; 1GXI E; 2K7A A; 4J9E A; 2ZPE B; 3JB9 I; 1QP3 A; 3EGD B; 2KEA A; 4CC3 A; 1N9S A; 1VQL Q; 4CC7 A; 2DJQ A; 4XU2 A; 3OYB A; 4L6V 5; 1RAD B; 2RJC A; 3DLL A; 1PHT A; 2LRQ A; 2FL7 A; 2RQW A; 3EHQ A; 3TVT A; 4X34 A; 2E1H A; 2FEI A; 2DLP A; 2LVM A; 4E6R A; 4M77 A; 2KQW A; 1M90 U; 1B3Q A; 3QO3 A; 3CMA A; 2G3R A; 4VUB A; 3ZBD A; 4HXJ A; 3M0T A; 3JCM e; 4XTU A; 1UEB A; 2DA9 A; 2L3Q A; 2HEQ A; 4IUV A; 3JCM P; 2X3X D; 2KI7 A; 3FJ5 A; 5LJ3 h; 1AOJ A; 3QG1 A; 4AFZ C; 1BK2 A; 4P5N A; 4A4E A; 5D6X A; 3CCL Q; 3CD6 A; 2SEM A; 5FLX E; 3I56 Q; 4UC4 A; 3SFM A; 3ZEH A; 3H6Z A; 1OV3 A; 1W70 A; 1JRI A; 5FU7 C; 1SF9 A; 3RKY A; 3KUF A; 1K9M R; 2B8A A; 1JJ2 P; 1MND A; 3QHS A; 2QA4 T; 1UGR B; 4PJO C; 3S3O A; 2M0Y A; 4II1 A; 4J9B A; 1NLP C; 3CPW S; 4C5G A; 1YCY A; 4J9I A; 4FYW B; 2X4X A; 1RAH B; 2W0Z A; 4M78 D; 3UWN A; 2DNU A; 2BZX A; 1V76 A; 2DL5 A; 5GAM g; 1SSH A; 2PVO B; 4LN2 A; 5CO7 A; 2AKK A; 2K2V A; 2O9V A; 5HCK A; 2OAU A; 1YHQ A; 4BE2 A; 1PC0 A; 4DQ2 A; 1OQK A; 4RTZ A; 5HKC A; 3BE3 A; 2AKL A; 4M77 B; 5GAN 4; 1WZO A; 4ELY C; 2NUP A; 4M75 A; 1M1K C; 3V8J A; 4LNP A; 4BD3 A; 2BZ8 A; 3V8L A; 1M3A A; 2ZZD A; 3E19 A; 3GOX A; 1X6O A; 2DL3 A; 1YP5 A; 3VV0 A; 2JT4 A; 3M0S A; 3QYG B; 3SWN C; 2OTL A; 4RUG A; 2KY9 A; 2L2P A; 3UDC A; 3HP9 A; 1Q86 C; 4BE1 A; 1PSF A; 5DLQ E; 3OMG A; 2DXC A; 2AT1 B; 4RTV A; 3EG1 A; 4PL6 A; 2KRM A; 5GAN 8; 1I81 A; 2QEX Q; 1QMC A; 2YT6 A; 2RN8 A; 1YIT A; 1LJO A; 2HKQ B; 1D1B A; 1RL2 A; 1WJQ A; 1M8V A; 3GLX A; 2RK2 A; 2QAS A; 2YRD A; 2P0Q A; 1YJN A; 2P4R A; 4C8Q C; 2K79 A; 2YRC A; 1BIB A; 1VQ6 Q; 1BI0 A; 4GBQ A; 2GTJ A; 4LDY A; 1HXD A; 2LZ6 B; 5CIU A; 3P8B B; 1JBM A; 1UEC A; 4XU3 A; 2KVQ G; 1VQ4 Q; 5A2Q E; 3NMZ C; 4OMM A; 5CKB A; 5LJ5 f; 1YJ9 Q; 1GFD A; 4FT4 A; 1XTD A; 2COW A; 1ACM B; 4Y28 E; 1TS9 A; 2QQB A; 3CBP A; 4LE9 A; 1MV3 A; 4M7D D; 5IXF A; 3J7A F; 4RTY A; 2NUP B; 3NPF A; 4M75 B; 4N4H A; 3JB9 H; 4FSX A; 1RLQ C; 3X24 B; 3REB B; 1K73 U; 2XD0 A; 1IRE B; 3PTA A; 4LDX A; 2MOX A; 4F14 A; 2YDL A; 3EGU A; 3M55 A; 2VVK A; 4IUP A; 4QVZ A; 2BKD N; 2QDY B; 2DIQ A; 4OGE A; 4EDU A; 7AT1 B; 1UHC A; 4Z8A A; 1U8R A; 2YWW A; 4E7S A; 2RJE A; 2LQ8 A; 4EIK A; 3OBY A; 2FB7 A; 3CC4 A; 2HCK A; 2QI2 A; 3CCS A; 3HFO A; 1PKS A; 3QSU A; 2VC8 A; 1G2B A; 1ZA2 B; 5CK9 A; 2VXF A; 3LH0 A; 3G6E Q; 4YTL A; 1KQS S; 2KR3 A; 1X43 A; 1NJI R; 1VQ9 A; 3TRE A; 4DOV A; 4JRQ A; 4Z02 A; 4V2S A; 4HCB A; 2IPO B; 1AVZ C; 5GMK l; 2CP6 A; 3BDU A; 4FYY B; 4M78 A; 4J9G A; 2QA4 Q; 2PZ1 A; 2DTO A; 1X27 A; 2BE9 B; 3RMQ A; 2GF7 A; 2DVE A; 5IXB A; 3LW5 E; 1QWE A; 5KYY A; 2E41 A; 3A98 A; 2AIR B; 3HKS A; 4QQ6 A; 4Z89 A; 1NG2 A; 2DYI A; 4ORZ A; 1SRL A; 3VS4 A; 2DRM A; 3CCM Q; 3CMA T; 2RHX A; 2YXY A; 1B07 A; 3O8V A; 1TOV A; 2V8K A; 2JS2 A; 2LCS A; 2O2O A; 2QDL A; 5GAO l; 3H41 A; 3CCR Q; 3G7Z A; 2EGC A; 2KK4 A; 2DZC A; 1X2K A; 2MAM A; 3V7C A; 1Q82 U; 3EG2 A; 2CZ0 B; 2KRS A; 4OMF B; 2X4W A; 5GAN e; 1ZLM A; 4M75 E; 1PRM C; 3INZ A; 2AZV A; 1K1Z A; 2HQH A; 3J81 E; 1WFW A; 3CCJ Q; 4XTX A; 3FRN A; 1N8R U; 2KBT A; 1WHM A; 2Y4X A; 5GAN j; 8ATC B; 4M7A G; 5LJ3 f; 2QEX A; 2QQS A; 1UJ0 A; 2RM4 A; 4HCK A; 1Y0M A; 1KFZ A; 2ZAE A; 4CI0 C; 4AFS C; 2XMF A; 3CEY A; 4PFP A; 1PD0 A; 2RK1 A; 3MP8 A; 4M78 B; 1Q7Y C; 1OU8 A; 4E7Z A; 5GAO q; 2ESW A; 3C12 A; 2JJ9 A; 1YHQ T; 2YLB A; 1QVF P; 1YJW T; 4DBF A; 3JCM b; 4A4H A; 4C5I A; 5KYY B; 2DRK A; 3OYY A; 2E3I A; 1MMD A; 3HSB A; 1VYV A; 3NGP A; 4J8O A; 2NYS A; 2RI5 A; 5CR2 A; 4LDW A; 3GNG A; 2E3H A; 2FVU A; 2Z0W A; 5KYW A; 3BFM A; 2OTL T; 4HT8 A; 1SHG A; 1VQM A; 1KC8 R; 3HFN A; 4DBR A; 1RAB B; 2GQV A; 2I0N A; 3TSZ A; 4J6Y A; 3GIB A; 1KQ2 A; 1Z9Z A; 3TEE A; 1LPL A; 2EFI A; 4IIM A; 4WTO B; 3PMT A; 3KFV A; 1G3W A; 5GAN 5; 1U1T A; 1MGQ A; 1M2V B; 4NL3 A; 3LGF A; 5D6Y A; 4KGX B; 3OSV A; 2EBP A; 3VRY A; 1TUC A; 2E5Q A; 1NLO C; 3EFS A; 3EGX A; 3G6E A; 1JXM A; 1C1A A; 5LJ5 g; 1D0Z A; 4LUE A; 2AHJ B; 4Z88 A; 1YIJ Q; 1JJ2 S; 2EJ9 A; 1EIF A; 2DXB A; 1HSQ A; 1R0C B; 2DE0 X; 1ZUY A; 2A08 A; 5LL6 S; 4HVV A; 3QWY A; 2YUO A; 2KYB A; 4M78 E; 3JAM E; 2QTV A; 1VQ5 A; 2QQA A; 5KYW B; 2OJ2 A; 3RKW A; 4R55 A; 1K8A R; 4Y91 A; 3DLM A; 1UGV A; 4A4G A; 1JB0 E; 3RIR A; 3CMA Q; 5GAM f; 4AFU C; 2EIF A; 3A1P A; 2D1X A; 2CT3 A; 4F7U E; 2P0P A; 3CCR A; 4M77 D; 2LQK A; 1OYX A; 2HSE B; 3CCS T; 3TCJ A; 3IQL A; 1ZSG A; 1M27 C; 4Y92 A; 4TVR A; 1QLY A; 3I56 T; 1VQ9 T; 3CD6 Q; 5FU6 B; 1QVG A; 3EGX B; 2EGE A; 1RAA B; 1VUB A; 3VS5 A; 3GPL A; 3A5Z B; 5L8R E; 4IUR A; 3X20 B; 3OYJ A; 1WXU A; 3FC3 A; 2H3E B; 2F5K A; 4BY6 B; 4RMO A; 1Q81 C; 1X75 C; 2QAZ A; 4M78 F; 5HY6 A; 1M30 A; 1PNJ A; 3UA6 A; 1KHI A; 3LYI A; 2A7Y A; 5FWC A; 4MZP A; 2JVV A; 3H9N A; 4F7U F; 2FG0 A; 1QCF A; 1O9S A; 1N27 A; 2G6F X; 1M1K R; 2ZCF B; 2K2M A; 1T3L A; 1QCO A; 4JUV A; 4KUI A; 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