The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
17
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sequence length |
48
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structure length |
48
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Chain Sequence |
MISNAKIARINELAAKAKAGVITEEEKAEQQKLRQEYLKGFRSSMKLE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Structural genomics, unknown function
|
| molecule keywords |
UPF0291 protein ynzC
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| publication title |
Solution NMR structure of the SOS response protein YnzC from Bacillus subtilis.
pubmed doi rcsb |
| source organism |
Bacillus subtilis
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| total genus |
17
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| structure length |
48
|
| sequence length |
48
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2007-09-18 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Helix Hairpins | Helix hairpin bin |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2YI9 A; 2YIA A; 2ZIO A; 3VQY A; 3ZED A; 2YIB D; 5K1X A; 4CS2 A; 2RJZ A; 2JVD A; 3DSQ A; 2RQ6 A; 2YI8 A; 2Q7H A; 3BHP A; 3VQX A; 2ZNJ A; 3QTC A; 4BWA A; 2Q7E A; 1G6U A; 2R72 A; 2ZIN A; 2E3C A; 2PGG A; 2YIB A; 4CH4 A; 4CH3 A; 5K1P A; 4CH6 A; 3VQV A; 2Q7G A; 1O9H A; 2HEP A; 2QJ1 A; 4TQD A; 4Q6G A; 4ZIB A; 2PUS A; 4TQF A; 2ZCE A; 4CS4 A; 4CS3 A; 4BW9 A; 2ZNI A; 2ZIM A; 1O9G A; 4CH5 A; 2R70 A; 3VQW A; #chains in the Genus database with same CATH topology 1QHT A; 3ZS8 C; 1SZT A; 1VQ8 V; 4ZI7 B; 4MTX A; 3HKE A; 2X6C A; 5CBF A; 1FYJ A; 3EHB B; 2EUL A; 1J95 A; 2BE3 A; 1XMO O; 4FMT A; 4FLU A; 1QNM A; 5C93 A; 1TUB B; 4JI1 B; 2NNU A; 2XAQ A; 4LFB B; 2IH1 C; 1RSO B; 1US6 A; 4D7T A; 2ATK C; 1Y76 B; 2XHB A; 2ZIM A; 4K8X A; 1Q86 W; 1N34 O; 1EM1 A; 1PM9 A; 1F4M A; 1ZWI C; 2W0X A; 4UVC A; 2Z0A A; 1JVM A; 4K35 A; 4J9Z B; 2EIN C; 2JDI G; 4GCZ A; 4G28 B; 1SQQ H; 4JI7 B; 4YIO A; 1HR0 B; 2DQ3 A; 2LJ2 A; 2Q0O C; 1SC5 B; 3OUS A; 3PN1 A; 1E1R G; 4TT3 G; 2YSU B; 3JAR A; 1PD3 A; 1PP9 H; 1YF2 A; 3A0H Z; 3RYF A; 4EKW A; 3ZMV A; 1L0N H; 5KHI A; 2HLD G; 1XMO B; 2D3O W; 4GKK O; 4HBN A; 2KB1 A; 5GTH Z; 4HAM A; 3CJH B; 4LNU A; 4ZHQ B; 3CB2 A; 3A8T A; 4QPK A; 4JGS A; 5CBH A; 3B8N A; 3H9V A; 3N27 A; 5K1X A; 2HHH O; 1Q43 A; 4YY3 O; 4MS2 A; 3DGE A; 1Z2G A; 4IHJ A; 4DO2 A; 3SPI A; 1NH2 B; 3VBB A; 2YXH A; 2HVK C; 2E5L O; 1QR9 A; 1S77 D; 3SPJ A; 4JZG A; 3L71 H; 1GM8 A; 5EYP B; 3ZJZ A; 3RBZ A; 4UB8 Z; 2A06 H; 3OT7 A; 1M93 A; 3FAV A; 4U3J A; 2ZDI A; 1B06 A; 4IL6 Z; 2PI5 A; 3P32 A; 4UFZ A; 2F23 A; 5ITZ B; 1VF6 A; 4GKK B; 3QTC A; 2N74 A; 4UV8 A; 4QE7 A; 4LF4 O; 2IW5 A; 2ZE6 A; 3ABK B; 4X66 B; 3QO8 A; 3L72 H; 2Q73 A; 4WF9 V; 2PTM A; 2V4D A; 5J2U A; 2LP7 A; 2PF4 E; 4YY3 B; 1XOU A; 4UCS A; 3E2E A; 4Z1V A; 2WLI A; 3TJT A; 4K0K B; 2ITD C; 1Q3E A; 1K7D A; 1FPO A; 1FXV A; 4CH4 A; 4TV8 B; 3AK2 A; 5LXT A; 1FXH A; 2E76 B; 4AQY O; 1Y74 B; 5C8Y A; 4DRX B; 4UCO A; 1GN6 A; 2MW2 B; 4PA6 A; 5JJN B; 2QDO A; 4X65 O; 1I94 B; 5B66 Z; 1M5I A; 2DQ0 A; 2VWK A; 3UQ8 A; 5LOV A; 2DWD C; 1VQ9 V; 1IDS A; 1MOF A; 4FIP C; 5B5E Z; 2WSS G; 3W7X A; 5CB4 A; 4YJ2 A; 3OGC C; 4GX1 A; 3CRM A; 4CZZ A; 4D6T H; 2PUS A; 3SGI A; 1WB7 A; 1XDC A; 5IWA O; 3E22 B; 1SA0 A; 3OEH G; 1IUR A; 1T5E A; 2KSD A; 5LHH A; 4RAI A; 2QM7 A; 1UFI A; 3ZBH A; 1FS0 G; 1Y4M A; 3HKB B; 4MVR A; 1N0J A; 3ZRW A; 3AG4 B; 2CE4 A; 4DV7 O; 2C2A A; 1PNK A; 4X65 B; 2N05 A; 3BRC A; 5GTI Z; 3E8B A; 3M7M X; 1EBO A; 4JI3 O; 1ZUQ A; 1SKV A; 4J7K A; 3CME V; 2QWO B; 1VF5 B; 2CGN A; 4PEL A; 5IYZ A; 2BOB C; 1X4T A; 3ABK C; 2HJD A; 3FB5 C; 4EEQ A; 5IJ9 A; 2ILM A; 2P4V A; 2UXB B; 5DM6 V; 3FYI B; 3F7V C; 4JAV A; 4MVQ A; 3AEI A; 3JSL A; 4B3T O; 1PPJ H; 2YID A; 3T4Z A; 5IWA B; 1R3I C; 5BR8 O; 1R73 A; 4JI8 O; 3OUF A; 4TV9 A; 1WJZ A; 3ZED A; 4NTX A; 3UO3 A; 2JVD A; 1Q8I A; 2WAM A; 3TK1 A; 3D3I A; 1HNZ O; 3SYP A; 4NB5 A; 3OMA B; 5KX5 B; 5BMV A; 4OPH A; 1VIB A; 1OCO B; 4QIW F; 5LMN O; 4FM1 A; 3QO5 A; 1BMF G; 1UPG A; 3CRC A; 1PL0 A; 4I7Z B; 4BAY A; 5DN6 G; 1GN4 A; 2DMX A; 4JI3 B; 4NYK A; 3QF7 A; 4X8A A; 3J80 N; 2IH3 C; 4LBE C; 1M57 B; 5EIB C; 2H94 A; 2JK5 C; 1ZX3 A; 1COW G; 1ZTE A; 2PGG A; 4W4K A; 4PHZ A; 4X89 A; 4CH3 A; 1WA8 A; 1S76 D; 2EJR A; 4PDV A; 1AI7 A; 2EIM B; 3E8H A; 3O9O A; 1H2K A; 3UKM A; 3L74 H; 3N2K B; 4JAU A; 1MZE A; 4LF9 B; 2F43 G; 1NVP D; 2LW1 A; 4OPA A; 4WBN A; 3MHS C; 3U0Z A; 4B3S O; 2IBZ H; 3AG4 C; 2ZR3 A; 1EFR G; 3LSQ A; 1N0N A; 3BA9 A; 4KUM A; 3CD6 V; 1FFX B; 5LP6 B; 3LNN A; 2OTJ V; 1QLE C; 2Q8V A; 1ARO P; 2Q4P A; 2ZQM A; 5KHK A; 3RN4 A; 1IBM O; 3JAK A; 4TUY B; 5EK0 A; 5CA1 B; 3ZN1 A; 4LF6 B; 5IJ0 B; 1BZK A; 2XT9 A; 1AR5 A; 3A0R A; 2E74 B; 5JVD B; 4WFG A; 4UV9 A; 4LF7 B; 4LP8 A; 1FXK B; 3U10 A; 4IYI A; 3T1C A; 5IE9 A; 1N36 O; 2YIC A; 3EVK A; 3D8C A; 5KLV H; 4GZR B; 1OCO C; 3WB1 A; 2A3Q A; 3DXR A; 3RYI A; 3OTO B; 1R6N A; 1L1F A; 3L9D A; 2YS8 A; 3LDE A; 4F6R A; 4UCT A; 3ZHQ A; 1I0H A; 4PI0 A; 4ZBM A; 3G6E V; 1S5J A; 5LA6 A; 1M57 C; 5J2T B; 3OFN G; 3MAQ A; 1IX9 A; 2DYS B; 3IGA C; 2OT5 A; 4WFE A; 4U7O A; 4ABM A; 2IJH A; 4LWS A; 2EIM C; 4LCU C; 2KG7 A; 5KAF Z; 2W0F C; 4LFA B; 4AIL C; 5A9G A; 1V54 B; 4H0L B; 1AP6 A; 1K33 A; 2DW4 A; 1IBK B; 5JQG A; 1YIJ V; 3W7W A; 1YHQ V; 1DGS A; 1AIL A; 1JMK C; 2AZ0 A; 5KHG A; 2UXC O; 2L35 A; 1NT2 B; 3W7U A; 1DLB A; 2JGD B; 3BA8 A; 3LNM B; 1YJW V; 5LP6 C; 4OX9 O; 4GX0 A; 3OTF A; 4FZ1 A; 4DUY B; 2OTL V; 3WFV A; 2WLL B; 1CEZ A; 2DJV A; 2YC0 A; 3K79 A; 3JAL B; 5JCO C; 4DV2 B; 2YIA A; 3CMA V; 5LMU B; 1CP9 A; 3I5D A; 5BZB A; 1P4R A; 1Q5O A; 3W7T A; 3JD1 A; 2ZE8 A; 5FNV A; 1FXK C; 3SR2 C; 4JTD B; 2P7T C; 4JI2 O; 2DN9 A; 2QWN B; 1LR1 A; 4PDR A; 3G6B A; 4FLX A; 3ZMZ A; 5L3E A; 1EZJ A; 1KKD A; 1GM9 A; 3CCM V; 4YJ3 A; 2BSK A; 1JFF B; 3AK3 A; 1YDX A; 4OX9 B; 1BQ0 A; 4O4J B; 3WU2 Z; 5KHH A; 4UVB A; 5CA0 B; 2PY5 A; 3JCU Z; 1YTF D; 1KU9 A; 1OHH G; 2HEP A; 2ADP A; 1G4Y B; 2DYS C; 4RUF A; 4RWU A; 4X62 B; 1B3Q A; 1XNR O; 2QGN A; 1IXM A; 4MTO A; 3DSQ A; 2PZS A; 3ABL B; 5H5N A; 4X20 B; 2CTP A; 2BTQ B; 1V54 C; 1K34 A; 4O2B A; 3R66 A; 2Y4T A; 2N04 A; 3JAM N; 4FLT A; 1XEQ A; 3K5M A; 5JJE B; 2UXD B; 1XUQ A; 2ZT9 B; 2ZNI A; 4MVS A; 1AR1 B; 2FB5 A; 4I55 A; 4B3M B; 1SZX A; 4WFH A; 3SYC A; 2WLM A; 2RN9 A; 2QKA A; 2GTS A; 2XOK G; 4LNU B; 3DC6 A; 3SJB C; 3K57 A; 3UCS C; 1MSW D; 5KUK A; 4GLX A; 2IU3 A; 2F66 C; 3APQ A; 4X1I A; 2X0L A; 3AG3 B; 1XNR B; 2Q7E A; 4O4L A; 1K3E A; 4HYO A; 3T1Y O; 1B04 A; 1ZL8 B; 4R6Z A; 4X1Y B; 5KA6 A; 1SER A; 4J42 A; 4NXM B; 2NR5 A; 2GUZ B; 3SPG A; 1ENV A; 3AG2 B; 4JAA A; 2A79 B; 2ZXW B; 3BEH A; 4JTA B; 3U11 A; 4F6E A; 1ROP A; 3C3T A; 3LSS A; 4XDL A; 3UT5 B; 2NN4 A; 1NTK H; 1IVS A; 1X59 A; 1S72 V; 4JYC A; 1SQB H; 3IFX A; 1I5Y A; 3CCU V; 3CWB H; 4DK0 A; 2XTA A; 3RYH B; 2HR3 A; 2M6Y A; 3Q4H A; 2UUB B; 1WP8 A; 4DR3 B; 1YIT V; 1IZ3 A; 4NTW A; 1KMI Z; 1H8H G; 1AB3 A; 1F51 A; 1Z5W A; 4DR4 O; 3T2M A; 4KL1 A; 1ORQ C; 2UUC B; 3M99 B; 4JYA O; 3APO A; 3ABL C; 3IJ4 A; 1Q6H A; 3T1Y B; 3HKD A; 1H38 A; 3ZMU A; 3CSX A; 5H2F Z; 2V7Q G; 1L8D A; 4NXN B; 1HNX B; 3ZCC A; 1VAR A; 3B40 A; 2EBO A; 3R65 A; 3CCL V; 1XNQ O; 2KQX A; 4B7K A; 4UVA A; 3JAT A; 1U96 A; 4UCR A; 4CS3 A; 1VMG A; 4UCU A; 4JV5 O; 3BAA A; 1W2B U; 3JCZ A; 3P3N A; 1AP5 A; 4N23 A; 3P30 A; 1SS3 A; 4DR2 O; 3K9S A; 1N8R W; 2CK3 G; 3SYA A; 5HFM A; 4U7N A; 1HWY A; 5IT9 N; 3AG3 C; 5GON A; 4O4H A; 4JYA B; 4DW0 A; 3JAS A; 4IT5 A; 4JI6 O; 1K5Q A; 4X1K B; 3TXQ A; 4PA3 A; 3L70 H; 2HJF C; 4QNH B; 4DV1 O; 4FLW A; 1LUW A; 1N34 B; 3CRA A; 5CN0 A; 3AG2 C; 3BFR A; 2ZXW C; 1NS1 A; 1I5X A; 1W59 A; 3B8M A; 3KCX A; 2WLN A; 3BY6 A; 2HG5 C; 2XAJ A; 2P67 A; 2GV9 A; 2R9R B; 4UCV A; 2OYQ A; 1FJG O; 2Q0A A; 3ABM B; 4DW1 A; 1D5N A; 4Z2W A; 2Z5U A; 4P30 A; 4FPP A; 4FVM A; 4L8J A; 4DUZ O; 3B4S A; 1GTO A; 3CEI A; 3GWK C; 4KXR A; 4RQE A; 5JH7 A; 1YCI A; 4TSF G; 4P9O A; 1MZF A; 2LGQ A; 4ZOL A; 3FB8 C; 4DR6 O; 2WLK A; 4H44 B; 4IIJ B; 4CH5 A; 4LFC O; 4DV1 B; 2Z3Y A; 2HHH B; 2EIK B; 3MHH C; 4L87 A; 1NZ6 A; 4JI0 O; 3RT3 C; 2JEX A; 1YJ9 V; 1NR7 A; 2E5L B; 4QPJ A; 1EZV H; 1OCC B; 1ZAU A; 4ZI7 A; 1VQO V; 1NKD A; 1B6Q A; 2JIZ G; 3SPC A; 1GRJ A; 4DYL A; 3I55 V; 2QJ1 A; 2ZR2 A; 4TWK A; 1H2M A; 5EZY B; 2IM9 A; 2YEV B; 1ZSP A; 3HKC B; 3SPH A; 1TUB A; 2JJ2 G; 3JAW B; 2ZM6 O; 1RSO A; 5KMG B; 5CMU A; 1XHX A; 1Y76 A; 4FLV A; 2D2C B; 2YI8 A; 4DUZ B; 1JCH A; 2W6J G; 4UB6 Z; 4LF4 B; 4I50 B; 2KKW A; 5GW7 A; 1LNQ A; 3D36 C; 2M7W A; 1IBL O; 1M1K W; 3G80 A; 4LH7 A; 4P9P A; 1TAE A; 4LFC B; 1KC8 W; 3F5T A; 4ZKI A; 4NVP A; 4JI0 B; 4JYY A; 2P4K A; 3N2G B; 1TA8 A; 2ZE7 A; 5JJJ B; 3RVZ A; 4J9Y B; 1Z5V A; 1PNL A; 1GM7 A; 3F5W C; 1XIL A; 5IYD O; 4DV5 O; 2IJJ A; 2OCC B; 3WG7 B; 3ABM C; 4O2A B; 4DV4 O; 4AQY B; 2WWW A; 3CE2 A; 4IYH A; 2Q67 A; 4YIP A; 4X64 O; 3IC9 A; 3CJH A; 4ZHQ A; 1P7B A; 4PD4 F; 1QLE B; 3LSU A; 2CDY A; 4DR5 O; 3OD4 A; 2GHY A; 3OR7 C; 3MD0 A; 1SET A; 4C7U A; 1DTO A; 1D2D A; 5EC2 C; 3W7S A; 4DR1 O; 2EIK C; 3M8A A; 2EZO A; 4JZ2 A; 5EYP A; 1D5A A; 2QTS A; 5EBM C; 4MVM A; 1OCC C; 2K1E A; 2EZP A; 2RQ6 A; 4WFF A; 3IAY A; 3UM7 A; 3THO A; 1DF5 A; 2LQT A; 1RFY A; 3K06 A; 2DE0 X; 4DV4 B; 1TVK B; 5ITZ A; 4DV7 B; 3S3X A; 1NBM G; 2X6B A; 1FFT B; 3DTU B; 3G4S V; 1R6K A; 5AG2 A; 3E83 A; 3QVN A; 1M90 W; 4PI2 A; 3ZHS A; 1H8E G; 2UXX A; 4Z1M G; 4J7J A; 2K9P A; 3E35 A; 1U97 A; 4PV1 B; 4JYB A; 4DR1 B; 2PYJ A; 3ASN B; 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