2JWKA

Solution structure of the periplasmic domain of tolr from haemophilus influenzae
Total Genus 17
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
17
sequence length
74
structure length
74
Chain Sequence
GSVPVILEVAGIGKYAISIGGERQEGLTEEMVTQLSRQEFDKDNNTLFLVGGAKEVPYEEVIKALNLLHLAGIK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Membrane protein
molecule keywords Protein tolR
publication title The Periplasmic Domain of TolR from Haemophilus influenzae Forms a Dimer with a Large Hydrophobic Groove: NMR Solution Structure and Comparison to SAXS Data.
pubmed doi rcsb
source organism Haemophilus influenzae
total genus 17
structure length 74
sequence length 74
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2007-10-15
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.270 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2jwkA00
2PFUA 2JWKA 2JWLA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3D2FB 3O9QA 4LY7A 1TV6A 4K25A 4Z0UA 5AQRA 3WUHA 1A5VA 3OJSA 2RN2A 2E5LK 4FJMA 4IOXA 4BRGA 1T44A 3S3NA 3RMCA 2XY6A 2V7ZA 4O0JA 4IO8A 4BG8A 2FBVA 1WSHA 4JD2B 3RVCA 4FJ9A 4JKEA 4B8AB 3TAPA 5J1EA 2RKIA 3M5RA 2G8HA 4JKDA 4KHWA 3VQ7A 1VQON 1X1PA 3A2FA 2YHXA 4JKAA 4C1NI 3P31A 3V9UA 4WFAL 3PO5A 1S1WA 4Z4FA 1T3VA 1NGEA 3ZT0A 1WNSA 1HX1A 4RW4A 4CJVA 5BREA 2F8SA 4IDHA 1QE1A 4BR5A 3O3HA 1N33K 4IFYA 2HHSA 3M8SA 1UA1A 1RDDA 3G0ZA 3TANA 3GBTA 5EU7A 2PYLA 3C6TA 1QHTA 3K2PA 2YKMA 2HOEA 4H8KA 4BR2A 3ATVA 2IS3A 3DWLA 4FJKA 3MN7A 5HRNA 3I0SA 3UKRB 4BRMA 4CIEA 1TAUA 3DXMA 4KH5A 5BPMA 2ZJPL 4EZ9A 4KFBA 4DSEA 2E1YA 3OJUA 2E2PA 1HQUA 3LL3A 5AQPA 2KZMA 4LFAK 3NF8A 3QICA 3K57A 4NCGA 4DS5A 4NXNK 4FZZA 2O8BB 4O4GA 2W41A 4NB4A 1SKSA 4BRFA 3FR0A 3NBPA 2Q36A 4CF1A 1VSDA 4PHTX 3A5MC 4FWSA 5AQMA 3QETA 4A61A 4CEZA 4M3WA 1VQ8N 1QQMA 4CF2A 1NGBA 5AQQA 3DRPA 4KH6A 1I39A 5FRNA 3NH0A 3ZSRA 3PX0A 3BEXA 3L2VA 4E0DA 4NYFA 5M1NA 2GWKA 2DY4A 4DKWA 1JLQA 2BANA 3S3MA 4BRNA 4KH4A 5CR4A 1E3MA 3ZEUB 1SAZA 4CI6A 4CZFA 1XQSC 2HHWA 2D1KA 1BIZA 3PLAA 4PA1A 3VEZA 5FLXO 1L3UA 1GLJO 5FPDA 1QSSA 1HKGA 3UB5A 4CJQA 4QOZB 3FGUA 4OPAA 1X9SA 1Q18A 2DFFA 4EHUA 4BRHA 3E9PA 3R3LA 4B1WB 2Y1JA 4E7JA 2IGIA 2HVHA 1T8EA 3SCXA 1ASVA 1KVCA 1V4SA 4B8CA 3BF1A 3U3GA 1HNWK 1VQ6N 4XH4A 1UOCA 4B08A 3F9MA 3PY8A 4FJJA 1NBWA 5AQHA 4HTUA 4E7KA 2F8TA 5AQXA 3THWB 4XH5A 3VA0A 5EX5A 4IOCL 3QINA 1X3NA 1KXPA 4A5AA 1RT3A 4XIUA 3OYKA 1LW2A 3HPOA 1KAYA 4IJNA 3KLGA 3WNGA 2ASOA 2OPSA 4PKIA 1V4TA 5BRHA 3K5LA 4KTWA 2ITMA 4M3YA 3O9RA 3EE9A 1KCFA 3DYAA 4G9ZA 1WAFA 1KLMA 2NUBA 4OKKA 4C8NA 3TWHA 2O8EB 2E2NA 2OTJN 2JGUA 3O1BA 3KWIA 4E3SA 3TAFA 3RRGA 2RPIA 3LANA 4KTQA 3D0PA 3ZSXA 3ZSYA 5C42A 4H0XB 4CFAA 3T1YK 5LJWA 1TL3A 1NGCA 3LPUA 2Z1JA 5C10A 3CERA 4FZYA 3B6PA 4DTSA 2Q2RA 4MDAA 4NO7A 3VEXA 3UKUB 1OH7A 1XHXA 3CFOA 2OCEA 5C2FA 4IBNA 4FLVA 3D2EB 3DLBA 1EX4A 1KC8O 3OBWA 3RR8A 3VOVA 4DU3A 4BGBA 2G8KA 4DQIA 2R7YA 4CFCA 5AQTA 3BUZB 4OKJA 4JKGB 2D0CA 3J81O 4BQLA 3IAYA 2P9SA 5I3UA 1TK5A 1JCFA 4DSLA 2QWMA 2GELA 3LPTA 5JMVA 5C0YA 1S72N 2O8CA 2QXFA 3CIPA 5EVZA 5KGXA 2BE2A 5GIOA 1Y64A 1BISA 4H4OA 3DMJA 4BDZA 4H03B 3LDPA 2HNDA 2X74A 3AVHA 4DF8A 4GV9A 2V51B 2NRTA 4YNQA 3AV9A 2WONA 4CZLA 2FBYA 4RW6A 1X9WA 1ATSA 1RT6A 3ZT3A 3HBTA 3T7ZA 3OW2M 2GEMA 1KD1O 3V1OA 3T1AA 3CF5L 3FZLA 4PKHA 3SBGA 1X3MA 1JXBA 4C8MA 4JHDA 3M8RA 4N56A 1BCOA 1RDAA 2P9NB 2YCHA 4FK0A 2FLOA 3FFIA 4K42A 5F2RA 5AQKA 1HNVA 3TAEA 4OJRA 4KHPK 1VQ4N 4CESA 2OANA 4DR1K 1IBKK 5SWMA 4Z4CA 5JS1A 2NLXA 1U49A 4CGDA 5BRFA 5AQNA 1NLVA 2P9LB 1ZXOA 1IBMK 3OTOK 4CJRA 3S3OA 3KD5E 5AZIA 4E7HA 2X6NA 1ZBFA 3HVRA 3HJFA 3SV3A 5EY4A 1GOCA 3ALYA 4TSXA 5AZJA 2JLEA 2YNFA 4PUOA 5KQ8A 1RBRA 4XEIA 5AQIA 5BRDA 1M1KO 2QEXN 5EOYA 3K58A 1C1BA 3QBXA 4ZHRA 4ILGB 3CCQN 1BIUA 3CJ1A 4J2EA 4BC2A 4CIGA 2FBXA 3LAKA 3SAGA 2VWKA 2CGLA 2UUBK 3I0RA 1DTTA 4LSNA 4A2BA 4ELTA 4CF8A 2E2OA 4FJNA 2QM1A 2A6AA 3DLLL 1W7AA 3WXKA 4M3ZA 2GUPA 3HM9A 3I33A 4CK2A 1JLEA 5LY3A 3M8PA 4CE9A 3C7NA 1MWKA 3ZLJA 1SS6A 4HUFA 3VTIA 1KAXA 1TUYA 4I7FA 3OYNA 2F96A 3ENBA 4BC4A 4B3OA 4OPKA 1VQ5N 1HYSA 1BWFO 1RFQA 2YHYA 2J4RA 5CYMA 4ELVA 3CHWA 3GOIA 2F7TA 1NOZA 3L4QA 3QB0A 4IO9L 4NLCA 4AM6A 1ZBHA 4DTPA 4DV1K 3SUPA 4FSVA 4M3XA 1R59O 3OYCA 4LF6K 4CGIA 1HUXA 3S9HA 4WF9L 2QWNA 3WXIA 1TL1A 3HSCA 1RBUA 3HOSA 4FWRA 3DI6A 3BF3A 3MX2A 4KV8A 3ZSWA 3LALA 4CEAA 4DFMA 3PV8A 1BQNA 3SZ2A 4IFEA 4AILC 3K9JA 1DTQA 1YHQN 3THYA 2P9IB 2FXUA 4CK3A 1NOYA 4FK2A 3E9OA 4GV6A 3EZ5A 1X9MA 2Q31A 1J5EK 1C0TA 3M3ZA 2P9KB 3QEPA 4BR7A 2P9PA 3V9XA 1CLQA 1B92A 4DTXA 3SAHA 1E4FT 1VRTA 1JJ2M 4PWDA 5AR0A 3AVLA 4DWIA 5M1FA 2F4VK 4DHYA 1DKGD 4CBUA 5HROA 4LFCK 5J2PA 4YORA 4M3TA 4DS4A 3KWGA 3A5LC 4DR5K 4BE1A 3AA2A 4FO0A 4B3TK 4A62A 1D4XA 2ZQBA 3THXB 3JSMA 2YX6A 3KKRA 3Q7CA 3ZETB 4CF0A 1O1WA 2A3ZA 4F2SA 1H1VA 2UU9K 2YNIA 4FWOA 4CGFA 5AQSA 4B3MK 4BR9A 3OYAA 1JCGA 1QTMA 3VQ6A 5BPLA 1VSIA 1Q82O 3QIPA 3F2KA 4B9QA 3U9DA 1HNZK 4JK9A 1Q9XA 3JS6A 2KFZA 1WBBA 3RR7A 4N47A 3KKSA 3AVBA 3VQCA 1UAXA 1NGAA 4OGEA 1HLUA 5AQGA 3UE5A 1CZ9A 1LAWA 3ULEA 4FLTA 1HMVA 4ISGA 3K59A 3M1FA 3SUQA 4MLEA 1YUWA 2V7YA 1VSKA 1TKTA 1W0HA 3AO3A 1EWRA 5JLHA 2JWLA 1FKOA 1XMQK 5I9EB 3PX4A 2VCPA 3MEDA 2E88A 2O8FA 4EAHD 4QAGA 4BRLA 3IMXA 4MDBA 4DR2K 2OPRA 3S41A 4EP4A 3TSPA 3H6EA 4A2AA 4AHRA 4H0TB 3G4SN 1ZC6A 1C0GA 4E1JA 4KO0A 4L8RB 4FJ7A 3AGKA 3BZCA 3CMAN 4B1VA 2P9UA 4IFVA 3MDQA 1IJJA 3BP8A 4CJPA 3LP1A 2CGJA 4DV0K 1OVYA 1RTHA 3HXMA 3WQUA 1TVRA 4Y0WA 1I94K 1LV5A 4GY2B 4O0IA 4DV4K 3H1QA 1JLGA 1G15A 4N5SA 3NGZA 4W5NA 5JLFA 4CZKA 2G8VA 2OYQA 5T7BA 1C0FA 3C0BA 4CW7B 4U67L 1RTIA 1WUAA 4H5VA 1L3SA 4YOXA 3VQBA 3SPYA 4B9TA 3L3VA 2VYPA 1RNHA 4BC5A 1BDGA 2CH5A 2HW3A 3LP2A 1G99A 3RSEB 4DR3K 3CJCA 3HZ6A 1WBDA 2HSTA 1S3XA 2A1RA 1FKPA 3JAMO 1ASWA 1ZBLA 1K8AO 4UY8O 4LH5A 2VG7A 3SBTA 4JI3K 2VWJA 4CERA 3WNHA 1W2BM 4CEDA 1JL2A 2Z1GA 1VQLN 3DLRA 1L3VA 2NRZA 3EEQA 3VN5A 3WEEB 4CGJA 4QS9A 3SYZA 4CJKA 4BREA 1NK5A 3KJVA 2E8AA 4OPJA 3AAPA 3UIQA 4I6MA 3QFPA 1IKWA 5KI6A 4BWJA 1NKBA 1KQSM 2D0PA 3NH2A 1NGIA 4QS8A 1K8KB 1NGJA 3MN5A 3ZSZA 3SJJA 1IO2A 3F9KA 4Y1CA 3QO9A 5FRMA 1VSFA 3VGKA 3VQ8A 4KB1A 4FL9A 3V81A 3IDHA 2BDPA 4J2AA 2UXBK 1CZAN 3AGRA 4MO5A 4YDUA 4FVMA 2WBNA 4BWMA 3OYBA 1Y97A 4DLEA 1IKVA 2HF3A 1IG8A 3E66A 4B1UB 3DRSA 1BHLA 1IKXA 1NJXA 3D2FA 1ATRA 2HHQA 1S5JA 4JI0K 1IV0A 4PL7A 3O8MA 3HPGA 2A5XA 3L3UA 2GTDA 1TK8A 5FROA 4IDKA 4JD2A 3VESA 4LF8K 4I2QA 1RBTA 3GG4A 4FOEA 1SV5A 3JYTA 2ZF5O 1BGXT 5BR9A 3PUFA 1J6ZA 2WFBA 3HP9A 3VQQA 5D3GA 3L6QA 4BRDA 3A5NC 5CY4A 1RTDA 3EN9A 3W0LA 2RF2A 3V1RA 1J54A 3AVAA 3VEOA 5TKWA 3MMVA 3GL1A 3KK2A 4DU4A 4EP5A 1RILA 1LCUA 4HWIA 4E19A 4B9UA 1J53A 2GX9A 4Z4IA 3OYEA 3P83D 4IG3A 3VQ4A 2XHBA 3J7ZO 1NM1A 1YF5L 3MAQA 3QBWA 4DCHA 2QK9A 1WSFA 4GMJB 4GNIA 5GAHP 3MCAB 2B6AA 1RBSA 3HVTA 3VF4A 4LF5K 4KHNA 4BGAA 5J2NA 3UKRA 4L3QA 1Q9YA 3CCMN 1LWFA 5CZ1A 3L2UA 4JI5K 4JN4A 3OYJA 3CG7A 1OH5A 4KHUA 1EETA 1NK0A 4KB0A 3J7AP 1BI4B 3K5NA 1Q8IA 2O8BA 4FVUA 1K6YA 1MA9B 2LSNA 4C8KA 3VMFB 4N76A 1DT9A 3QEXA 4ZTFA 4WQ5A 3CMEN 3CCEN 1QZ6A 4BRPA 3PIOL 3C6UA 2O4GA 3PSFA 1NNEA 4WFBL 3G10A 3QNNA 3QEIA 1QVGM 4Y1DA 2NRWA 4FJ5A 3GDQA 4C1NK 1YTUA 2O8CB 1HQEA 1T05A 4AHVA 2HBKA 4JS5A 4BDPA 3BZKA 4I9QA 4H0PA 1BG3A 2OZSA 3TU5A 1N8RO 3ZEUA 1NGFA 2Z1HA 3CQ8A 2VGNA 4ISEA 2FC0A 2QWRA 5B8HA 1GLCG 1N34K 4CJ3A 3ENHA 1MDUB 1CZBA 4YOVA 1SQKA 4A57A 3U9ZA 3ID8A 2BH1A 3BDPA 3TSUA 3HYFA 5JVGL 2G8WA 5CZ2A 3SQ4A 4AQYK 2KFNA 1WLJA 4B1ZA 3NCIA 5AJ3K 2PFUA 1NK7A 3OY9A 4FW2A 1YXQA 3DJCA 4CJTA 4E1NA 4CHYA 3ZT2A 3ULDA 3PSIA 2YNGA 4ICLA 1C6VA 4FXDA 4CEOA 3CCVN 3DXKB 3P39A 1RT5A 2XRIA 3TSQA 3LDLA 4JEPA 4WQ4A 3K5MA 1KVAA 1L3TA 2OTLN 3AVCA 5BR8K 3CCUN 3LWMA 1RT1A 5HRSA 3RTVA 3THWA 2F9WA 2FSKA 3MEEA 2QWLA 5IWAK 3KLIA 1WSIA 4CJ5A 4FM0A 5DM7L 3SQ1A 4Z94A 3SUOA 4CHOA 3W3DA 1RBVA 1XNQK 5AFUA 4M7YA 1YVUA 3EKUA 3M8QA 2XO7A 3M6GA 4FM2A 5E84A 5AQVA 2O8EA 2ASMA 1WOQA 4O8UA 4JI7K 4MFBA 3LAMA 1JL1A 3DLEA 3SI6A 5I42A 2ZJRL 2E6MA 2GWJA 1ASUA 3LDNA 2FBTA 2X78A 4FLWA 3U4LA 2ZWHA 3E9LA 3CJ7A 4OPHA 1P90A 3CJ9A 3O3GA 3WXLA 4DV3K 4DQPA 2ZE2A 1WN7A 5HLFA 3SMSA 4KKOA 4H5TA 2W40A 3UKUA 3OYFA 3LDSA 3T19A 2DTUA 1N5YA 3ASMA 3D2EA 3LZIA 1S9GA 5KTQA 4ZTJA 4K0KK 4JI2K 3VERA 2O8DB 3IFRA 3ITHA 3WQTA 4DSKA 3FZHA 1N32K 4KBOA 4ID5A 3MCPA 3O9UA 1TYQB 2YHWA 1KRPA 1WAJA 1RDUA 4JKGA 4H0YB 2BTFA 4CHNA 3VEWA 4GV3A 1OH8A 4BE2A 4Q0BA 1S6QA 4CJWA 1D9FA 3SK3A 3O4NA 3A8YA 3O4WA 3QIOA 3AVMA 1T03A 2IVPA 3R8EA 5CE3A 4JI6K 3ZX0A 1GLDG 4DB3A 4GKKK 2WC9A 2UUCK 3WT0A 2KHOA 2QWQA 3MECA 1SKRA 1TUUA 2KLAA 2VG5A 4JI1K 5CYQA 4DTOA 1XI1A 4OX9K 4DTMA 5FDLA 4B9VA 1Q81O 1U4BA 1T7PA 3ZX2A 4IEIA 3CPWM 4K43A 1HNXK 4ILHA 1TK0A 3VPZA 2D0BA 1FJGK 3KD1E 1KVBA 1HPMA 3EO3A 3ENOA 1VSEA 2ZM6K 4B1YB 2B5JA 2P9NA 5DK5A 5J2QA 4E89A 4FLYA 4OKEA 1S1XA 4OLBA 3V9WA 3DAWA 1YITN 1GLBG 4AM7A 4BC3A 2QA4N 4CFBA 2QW9A 1OKJA 4NCBA 1S1UA 1HJRA 4DQQA 3H45C 4FWNA 4LSLA 1QQCA 1TKDA 3RWUA 3A5OC 3VEYA 3CQYA 1HKCA 1NK8A 2P9LA 1RDWX 1R0AA 5AFUH 1WSGA 4AHUA 1BO5O 4FM1A 4W5OA 2AJQA 3L4IA 2VG6A 2I7NA 3OA9A 4MLHA 4DV7K 3JXUA 4B9SA 3C6HA 5FPEA 4ID1A 2QKKA 3CETA 4FLZA 2HBJA 2ATQA 4BR4A 2HBMA 5E26A 1SL1A 3I8DA 3HOTA 1U2VB 3N4PA 3TAMA 4CVNE 3NF7A 1VQ7N 1B9DA 1GLLO 1C1AA 4OGCA 4EIAA 4HCCA 1WSJA 1VQKN 3H46O 3OYMA 2D0AA 4AHCA 3CCJN 3H3NO 2H3GX 3Q7BA 5LJVA 2PY5A 4CJ4A 5F1XA 3HO1A 1GLEG 1RT2A 2ZD1A 3O08A 4M63C 5KQDA 4FLUA 2BUPA 2D5RA 5AQOA 3E01A 4RG8A 1BOTO 3SLCA 3IUCA 4DF4A 1YI2N 5HBMA 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 2PFU A;  2JWK A;  2JWL A; 
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 3D2F B;  3O9Q A;  4LY7 A;  1TV6 A;  4K25 A;  4Z0U A;  5AQR A;  3WUH A;  1A5V A;  3OJS A;  2RN2 A;  2E5L K;  4FJM A;  4IOX A;  4BRG A;  1T44 A;  3S3N A;  3RMC A;  2XY6 A;  2V7Z A;  4O0J A;  4IO8 A;  4BG8 A;  2FBV A;  1WSH A;  4JD2 B;  3RVC A;  4FJ9 A;  4JKE A;  4B8A B;  3TAP A;  5J1E A;  2RKI A;  3M5R A;  2G8H A;  4JKD A;  4KHW A;  3VQ7 A;  1VQO N;  1X1P A;  3A2F A;  2YHX A;  4JKA A;  4C1N I;  3P31 A;  3V9U A;  4WFA L;  3PO5 A;  1S1W A;  4Z4F A;  1T3V A;  1NGE A;  3ZT0 A;  1WNS A;  1HX1 A;  4RW4 A;  4CJV A;  5BRE A;  2F8S A;  4IDH A;  1QE1 A;  4BR5 A;  3O3H A;  1N33 K;  4IFY A;  2HHS A;  3M8S A;  1UA1 A;  1RDD A;  3G0Z A;  3TAN A;  3GBT A;  5EU7 A;  2PYL A;  3C6T A;  1QHT A;  3K2P A;  2YKM A;  2HOE A;  4H8K A;  4BR2 A;  3ATV A;  2IS3 A;  3DWL A;  4FJK A;  3MN7 A;  5HRN A;  3I0S A;  3UKR B;  4BRM A;  4CIE A;  1TAU A;  3DXM A;  4KH5 A;  5BPM A;  2ZJP L;  4EZ9 A;  4KFB A;  4DSE A;  2E1Y A;  3OJU A;  2E2P A;  1HQU A;  3LL3 A;  5AQP A;  2KZM A;  4LFA K;  3NF8 A;  3QIC A;  3K57 A;  4NCG A;  4DS5 A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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